Formate-nitrite transporter
फॉर्मेट-नाइट्राइट ट्रांसपोर्टर (एफ. एन. टी.) परिवार प्रमुख आंतरिक प्रोटीन (एम. आई. पी.) सुपर फैमिली से संबंधित है। एफ. एन. टी. परिवार के सदस्यों को ग्राम-नकारात्मक और ग्राम-सकारात्मक बैक्टीरिया, आर्किया, खमीर, पौधों और निचले यूकेरियोट्स से अनुक्रमित किया गया है। एफ. एन. टी. परिवार के प्रोकैरियोटिक प्रोटीन संभवतः संरचनात्मक रूप से संबंधित यौगिकों, फॉर्मेट और नाइट्राइट के परिवहन में कार्य करते हैं। संरचना खमीर प्रोटीन (627 एमिनो एसाइल अवशेष) के अपवाद के साथ, परिवार के सभी विशिष्ट सदस्य लंबाई में 256-285 अवशेषों के होते हैं और 6-8 पुटेटिव ट्रांसमेम्ब्रेन α-हेलिकल स्पैनर्स (TMSs) प्रदर्शित करते हैं। एक मामले में, ई. कोलाई एफ. ओ. सी. ए. (टी. सी. #1.A.16.1.1) प्रोटीन की एक 6 टी. एम. एस. टोपोलॉजी स्थापित की गई है। खमीर प्रोटीन में एक समान स्पष्ट स्थलाकृति होती है लेकिन इसमें लगभग 400 अवशेषों का एक बड़ा सी-टर्मिनल हाइड्रोफिलिक विस्तार होता है। ई. कोलाई का एफ. ओ. सी. ए. एक सममित पेंटामर है, जिसमें प्रत्येक उप-इकाई में छह टी. एम. एस. होते हैं। फाइलोजेनी फाइलोजेनेटिक ट्री कार्य और जैविक फाइलोजेनी के अनुसार क्लस्टर दिखाता है। पायरूवेट-फॉर्मेट लाइज़ (पी. एफ. एल.) से जुड़े बैक्टीरिया के पुटेटिव फॉर्मेट इफ्लक्स ट्रांसपोर्टर (एफ. ओ. सी. ए.; TC#s 1.A.16.1.1 और 1.A.16.1.3) में क्लस्टर I शामिल है; फॉर्मेट डिहाइड्रोजनेज से जुड़े बैक्टीरिया और आर्किया के पुटेटिव फॉर्मेट अपटेक पारगम्यता (एफ. डी. एच. सी.; TC#s 1.A.16.2.1 और 1.A.16.2.3) में क्लस्टर II शामिल है; बैक्टीरिया के नाइट्राइट अपटेक पारगम्यता (एन. आर. सी., TC#s 1.A.16.2.5,1.A.16.3.1, और 1.A.16.3.4) में क्लस्टर III शामिल है, और एक यीस्ट प्रोटीन में क्लस्टर IV शामिल है। कार्य एफ. एन. टी. परिवार के प्रोटीन के लिए ऊर्जा युग्मन तंत्र को व्यापक रूप से चिह्नित नहीं किया गया है। एच. सी. ओ. और एन. ओ. अपटेक को एच + सिम्पोर्ट के साथ जोड़ा जा सकता है। एच. सी. ओ. प्रवाह झिल्ली क्षमता द्वारा एक यूनीपोर्ट तंत्र या एच + एंटीपोर्ट द्वारा संचालित किया जा सकता है। ई. कोलाई का एफ. ओ. सी. ए. द्विदिशात्मक संरचनात्मक परिवहन को उत्प्रेरित करता है और एक चैनल-प्रकार तंत्र द्वारा कार्य कर सकता है। एफ. ओ. सी. ए., लघु-श्रृंखला अम्ल का परिवहन करता है। एफ. ओ. सी. ए. अपने संचालन के तरीके को उच्च बाहरी पी. एच. पर एक निष्क्रिय निर्यात चैनल से कम पी. एच. पर एक द्वितीयक सक्रिय प्रारूप/एच + आयातक में बदलने में सक्षम हो सकता है। पी. एच. 4 पर साल्मोनेला टाइफिम्यूरियम एफ. ओ. सी. ए. की क्रिस्टल संरचना से पता चलता है कि इस स्विच में पेंटामेरिक चैनल में अलग-अलग प्रोटोमरों के एमिनो टर्मिनियों की एक प्रमुख पुनर्व्यवस्था शामिल है। एमिनो-टर्मिनल हेलिक्स एक ठोस, सहकारी कार्रवाई में परिवहन को खोलते या अवरुद्ध करते हैं जो इंगित करता है कि एफ. ओ. सी. ए. को पी. एच.-निर्भर तरीके से कैसे गेट किया जाता है। इलेक्ट्रोफिजियोलॉजिकल अध्ययनों से पता चलता है कि प्रोटीन पी. एच. 7 पर एक विशिष्ट फॉर्मेट चैनल के रूप में कार्य करता है और यह पी. एच. के 5.1 पर स्थानांतरित होने पर बंद हो जाता है। परिवहन प्रतिक्रिया एफ. एन. टी. परिवार के विभिन्न सदस्यों द्वारा उत्प्रेरित संभावित परिवहन प्रतिक्रियाएँ हैंः (1) आर. सी. ओ. या एन. ओ. (आउट) आर. सी. ओ. या एन. ओ. (इन), (2) एच. सी. ओ. (इन) एच. सी. ओ. (आउट), (3) एच. एस.-(आउट) एच. एस.-(इन)। एफ. एन. टी. परिवार से संबंधित वर्तमान में वर्गीकृत सदस्यों की एक प्रतिनिधि सूची ट्रांसपोर्टर वर्गीकरण डेटाबेस में पाई जा सकती है। कुछ विशिष्ट सदस्यों में शामिल हैंः एस्चेरिचिया कोलाई से एफ. ओ. सी. ए. और एफ. ओ. सी. बी. (क्रमशः TC#s 1.A.16.1.1 और 1.A.16.1.2), फॉर्मेट के द्विदिशात्मक परिवहन में शामिल ट्रांसपोर्टर। एफ. डी. एच. सी., मेथेनोबैक्टीरियम मैरिपालुडिस (टी. सी. #1.A.16.2.3) और मेथेनोथर्मोबैक्टर थर्मोफॉर्मिकम (टी. सी. #1.A.16.2.1) से, एक संभावित फॉर्मेट ट्रांसपोर्टर है। एन. आर. सी., ई. कोलाई (टी. सी. #1.A.16.3.1) से, एक संभावित नाइट्राइट परिवहनक। क्लैमाइडोमोनास रीनहार्ड्टी (क्लैमाइडोमोनास स्मिथी) का नार1 (टी. सी. #1.A.16.2.4), 355 एमिनो एसाइल अवशेषों का एक नाइट्राइट अपटेक पोर्टर। बी. सबटिलिस काल्पनिक प्रोटीन वाईडब्ल्यूसीजे (आईपीए-48आर) (टीसी #1.A.16.3.2)। संदर्भ प्रोटीन परिवार झिल्ली प्रोटीन ट्रांसमेम्ब्रेन प्रोटीन ट्रांसमेम्ब्रेन ट्रांसपोर्टर परिवहन प्रोटीन इंटीग्रल झिल्ली प्रोटीन