TMEM131
ट्रांसमेम्ब्रेन प्रोटीन 131 (टी. एम. ई. एम. 131) एक प्रोटीन है जिसे मनुष्यों में टी. एम. ई. एम. 131 जीन द्वारा कूटबद्ध किया जाता है। टी. एम. ई. एम. 131 प्रोटीन में अज्ञात कार्य 3651 (डी. यू. एफ. 3651) के तीन डोमेन और दो ट्रांसमेम्ब्रेन डोमेन होते हैं। इस प्रोटीन को टी कोशिका के कार्य और विकास में एक भूमिका के रूप में चित्रित किया गया है। टी. एम. ई. एम. 131 एक लोकस (2q11.1) में भी रहता है जो हटाए जाने पर नीवरजेल्ट सिंड्रोम से जुड़ा होता है। टी सेल फंक्शन में भूमिका टी. एम. ई. एम. 131 को डाउन सिंड्रोम के रोगियों में हाइपरमेथाइलेशन प्रदर्शित करने के लिए दिखाया गया है। इस अध्ययन के लेखकों ने प्रस्ताव दिया कि टी कोशिका के विकास और कार्य में टी. एम. ई. एम. 131 के कथित कार्य को देखते हुए, यह हाइपरमेथाइलेशन डाउन सिंड्रोम के रोगियों में दबाए गए प्रतिरक्षा कार्य में भूमिका निभा सकता है। टी. एम. ई. एम. 131 को टी कोशिकाओं के विकास और विभेदन के दौरान भी विनियमित दिखाया गया है, और अन्य ऊतक प्रकारों के सापेक्ष टी कोशिकाओं में अभिव्यक्ति का अपेक्षाकृत उच्च स्तर दिखाया गया है। जीन अवलोकन TMEM131 98,372,799-98,612,354 से गुणसूत्र 2 के नकारात्मक DNA स्ट्रैंड (सेंस देखें) पर स्थित है। जीन उत्पाद मानव जीन में 41 अनुमानित एक्सोन के साथ 6,657 आधार जोड़ी एमआरएनए है। एन्सेम्बल दस वैकल्पिक स्प्लाइस रूपों की भविष्यवाणी करता है, जिनमें से चार प्रोटीन कोडिंग हैं। जेनोमैटिक्स सॉफ्टवेयर पेज के माध्यम से एल डोराडो का उपयोग करके प्रमोटर भविष्यवाणी और विश्लेषण किया गया था। अनुमानित प्रवर्तक क्षेत्र गुणसूत्र 2 के माइनस स्ट्रैंड पर 98,611,892 से 98,612,893 तक 1002 आधार जोड़े में फैला हुआ है। कार्यक्रम ने दो संभावित प्रतिलेखन प्रारंभ स्थानों की भविष्यवाणी की। पहला 98,612,501 से 98,612,716 तक 216 आधार जोड़ों में फैला हुआ है। दूसरा 182 आधार जोड़े 98,612,262 से 98,612,443 तक फैला हुआ है। जीन नेबरहुड टी. एम. ई. एम. 131 सकारात्मक डी. एन. ए. स्ट्रैंड पर जेड. ए. पी. 70 जीन (98,330,331-98,356,323) के साथ-साथ 2q11.2 लोकस पर कई छद्मजनों के सीधे निकट स्थित है। वॉन विलेब्रांड कारक जिसमें जीन (वी. डब्ल्यू. ए. 3. बी.) होता है, टी. एम. ई. एम. 131 से ऊपर की ओर सकारात्मक स्ट्रैंड (98,703,595-98,929,410) पर स्थित होता है। जीन एक्सप्रेशन टी. एम. ई. एम. 131 पूरे शरीर में निम्न से मध्यम स्तरों में व्यक्त किया जाता है, जिसमें लिम्फ नोड्स, गर्भाशय और टी कोशिकाओं में थोड़ा बढ़ा हुआ स्तर होता है। फल मक्खी भ्रूण के विकास में अभिव्यक्ति डेटा बी. डी. जी. पी. इन सीटू होमपेज से उपलब्ध है। प्रोटीन गुण/विशेषताएँ टी. एम. ई. एम. 131 प्रोटीन का प्राथमिक कार्य अच्छी तरह से समझा नहीं गया है। मानव रूप में 1883 एमिनो एसिड अवशेष हैं, जिनमें 8.74 का सम-विद्युत बिंदु और 205,100 डाल्टन का आणविक द्रव्यमान है। इसे अवशेष 1,091-1,111 और 1,118-1,138 पर दो ट्रांसमेम्ब्रेन डोमेन होते हुए दिखाया गया है। तीन DUF3651 क्षेत्र दो आसन्न ट्रांसमेम्ब्रेन डोमेन के N-टर्मिनल पक्ष पर स्थित हैं। ये अवशेष 173-245,502-582, और 639-708 पर स्थित हैं। प्रोटीन का अंतरकोशिकीय स्थान प्रयोगात्मक रूप से निर्धारित नहीं किया गया है, लेकिन यह माना जाता है कि यह या तो प्लाज्मा झिल्ली या एंडोप्लाज्मिक रेटिकुलम में रहता है, जिसमें ट्रांसमेम्ब्रेन क्षेत्रों के एन-टर्मिनल और सी-टर्मिनल दोनों तरफ प्रत्येक क्षेत्र साइटोसोलिक होता है। इसमें कई फॉस्फोराइलेशन स्थल हैं जिन्हें प्रयोगात्मक और जैव-सूचनात्मक उपकरण दोनों के साथ दिखाया गया है। नेटफॉस उपकरण का उपयोग करके प्रोटीन के जैव-सूचनात्मक विश्लेषण ने प्रोटीन की पूरी लंबाई में 145 संभावित फॉस्फोराइलेशन स्थलों की भविष्यवाणी की। टी. एम. ई. एम. 131 के लिए प्रोटीन अंतःक्रिया प्रोटीन अंतःक्रिया विश्लेषण कम्प्यूटेशनल उपकरणों का उपयोग करके किया गया है। एम. आई. एन. टी. डाटाबेस के माध्यम से किसी भी अंतःक्रिया की पहचान नहीं की गई थी। एक स्ट्रिंंग खोज ने पाठ खनन के माध्यम से दस संभावित प्रोटीन अंतःक्रियाओं का पता लगाया, हालांकि इनमें से किसी को भी वास्तविक प्रोटीन-प्रोटीन अंतःक्रिया नहीं माना जाना चाहिए। परिणामों का निकट विश्लेषण इन भविष्यवाणियों के वास्तविक होने की बहुत कम संभावना दिखाता है। इंटएक्ट उपकरण का भी उपयोग किया गया था, और इससे पता चला कि सुपरऑक्साइड डिसम्यूटेज 2 (एस. ओ. डी. 2) के साथ एक संभावित अंतःक्रिया पाई गई थी, जिसकी पहचान खमीर टू-हाइब्रिड स्क्रीनिंग अध्ययन में की गई थी। संरक्षण ऑर्थोलॉग टी. एम. ई. एम. 131 अपने सभी ऑर्थोलॉग में संरक्षित है। पूरा प्रोटीन प्राइमेट ऑर्थोलॉग में अत्यधिक संरक्षित है, जबकि अधिक दूर के होमोलॉग में DUF3651 और ट्रांसमेम्ब्रेन क्षेत्रों के भीतर संरक्षण अधिक है। सैन डिएगो सुपर कंप्यूटर बायोलॉजी वर्कबेंच के माध्यम से ब्लास्ट और ए. एल. आई. जी. एन. उपकरण का उपयोग करके चोनोफ्लागेलेट मोनोसिगा ब्रेविकोलिस के रूप में मनुष्यों से दूर से संबंधित प्रजातियों में ऑर्थोलॉग पाए गए थे। निम्नलिखित तालिका टी. एम. ई. एम. 131 के समरूपों के बारे में जानकारी देती है। पैरालॉग TMEM131 में एक एकल पैरालॉग है, TMEM131L या KIAA0922। यह जीन TMEM131 के समान है, लेकिन इसमें तीन DUF3651 क्षेत्रों में से दूसरे दो शामिल नहीं हैं। संदर्भ