Liquid–liquid phase separation sequence-based predictors
एल. एल. पी. एस. में अक्सर ऐसे अनुक्रम क्षेत्र शामिल होते हैं जिनमें अद्वितीय कार्यात्मक विशेषताएँ होती हैं, साथ ही साथ प्रियॉन जैसे और आर. एन. ए.-बाध्यकारी क्षेत्रों की उपस्थिति भी होती है। आजकल एल. एल. पी. एस. चलाने के लिए प्रोटीन की प्रवृत्ति का अनुमान लगाने के लिए कुछ ही तरीके हैं। एल. एल. पी. एस. में शामिल जैविक तंत्रों की सीमा, इन तंत्रों के बारे में सीमित ज्ञान और एल. एल. पी. एस. के महत्वपूर्ण संदर्भ-निर्भर घटक इस समस्या को चुनौतीपूर्ण बनाते हैं। पिछले वर्षों में, इस क्षेत्र में प्रगति के बावजूद, एलएलपीएस के लिए विशिष्ट कुछ भविष्यवक्ता विकसित किए गए हैं, जो प्रोटीन अनुक्रम गुणों और एलएलपीएस को चलाने की क्षमता के बीच संबंध को समझने की कोशिश कर रहे हैं। यहाँ हम अत्याधुनिक एल. एल. पी. एस. अनुक्रम-आधारित भविष्यवक्ताओं को संशोधित करेंगे, संक्षेप में उनका परिचय देंगे और बताएंगे कि वे कौन सी व्यक्तिगत प्रोटीन विशेषताएँ हैं जिन्हें वे एल. एल. पी. एस. के संदर्भ में पहचानते हैं। एलएलपीएस सिमुलेशन एलएलपीएस के क्षेत्र में एक अन्य महत्वपूर्ण कम्प्यूटेशनल संसाधन प्रोटीन के सैद्धांतिक सिमुलेशन हैं, विशेष रूप से आंतरिक रूप से अव्यवस्थित प्रोटीन (आईडीपी), जो एलएलपीएस को चलाते हैं। ये अनुकरण प्रयोगों के पूरक हैं और एल. एल. पी. एस. को चलाने वाले व्यक्तिगत प्रोटीन के आणविक तंत्र के बारे में महत्वपूर्ण अंतर्दृष्टि प्रदान करते हैं। डिग्नन एट अल की समीक्षा। चर्चा की गई कि इन अनुकरणों को प्रयोगात्मक परिणामों की व्याख्या करने, चरण व्यवहार की व्याख्या करने और ट्यूनेबल चरण संक्रमण गुणों के साथ प्रोटीन डिजाइन करने के लिए भविष्यसूचक ढांचा प्रदान करने के लिए कैसे लागू किया जा सकता है। चुनौती मॉडल के संकल्प और कम्प्यूटेशनल दक्षता के बीच समझौता है, क्योंकि आई. डी. पी. को शामिल करने वाली बड़ी प्रणालियों के सभी परमाणु अनुकरणों को अभी भी निष्पादित करना मुश्किल है। इसके अलावा, बूंद-अवस्था में आई. डी. पी. के बीच आणविक अंतःक्रियाओं को अभी भी बहुत कम समझा गया है, और प्रयोगात्मक डेटा और सिमुलेशन का संयोजन उन्हें स्पष्ट करने के लिए अपरिहार्य है। इन तंत्रों को प्रबुद्ध करने के लिए अगले कुछ वर्षों में नमूने लेने और अनुकरण विधियों में सुधार हो सकता है। यह भी देखें कि आंतरिक रूप से अव्यवस्थित प्रोटीन डिसप्रोट डेटाबेस मोबीडीबी डेटाबेस संदर्भ प्रोटीन संरचना संरचना प्रोटिओमिक्स न्यूरोडीजेनेरेटिव विकार