RNA motif
आर. एन. ए. मोटिफ आर. एन. ए. के एक समूह का वर्णन है जिसकी एक संबंधित संरचना होती है। आर. एन. ए. रूपांकनों में प्राथमिक अनुक्रम और संबंधित आर. एन. ए. की द्वितीयक संरचना के भीतर विशेषताओं का एक पैटर्न होता है। इस प्रकार, यह आर. एन. ए. द्वितीयक संरचना को शामिल करने के लिए एक अनुक्रम रूपांकन की अवधारणा का विस्तार करता है। "आर. एन. ए. मोटिफ" शब्द पैटर्न और उससे मेल खाने वाले आर. एन. ए. अनुक्रमों दोनों को संदर्भित कर सकता है। आर. एन. ए. के रूपांकनों के विवरण आर. एन. ए. रूपांकनों को दो मुख्य रूपों में वर्णित किया जा सकता हैः एक बहु अनुक्रम संरेखण या एक स्पष्ट खोज पैटर्न। एक संरेखण को आमतौर पर एक सर्वसम्मत माध्यमिक संरचना के साथ संवर्धित किया जाता है, अर्थात। संरचना जो सभी या अधिकांश आर. एन. ए. के लिए सामान्य है। संरेखण में अनुक्रम तब संरक्षण के एक पैटर्न को स्पष्ट रूप से परिभाषित करते हैं जिसका उपयोग, उदाहरण के लिए, आर. एन. ए. के अतिरिक्त उदाहरण खोजने के लिए किया जा सकता है। यह खोज रणनीति, अन्य बातों के अलावा, इन्फर्नल सॉफ्टवेयर पैकेज द्वारा लागू की जाती है। आर. एफ. ए. एम. डेटाबेस कई अनुक्रम संरेखणों का एक संग्रह है जो विश्वसनीय रूप से ज्ञात आर. एन. ए. रूपांकनों और संबंधित जानकारी के एक बड़े उपसमुच्चय को परिभाषित करता है। इसके डेटा का उपयोग इन्फर्नल सॉफ्टवेयर के साथ अनुक्रम डेटाबेस में ऐसे आरएनए के उदाहरण खोजने के लिए किया जा सकता है, जैसे। जीनोम अनुक्रम। वैकल्पिक रूप से, आर. एन. ए. रूपांकनों को स्पष्ट खोज पैटर्न का उपयोग करके भी वर्णित किया जा सकता है, जो विशिष्ट प्राथमिक अनुक्रम पैटर्न को परिभाषित करते हैं और इस बात की बाधाओं के साथ कि हेलिक्स को कहाँ बनना चाहिए। इस तरह के पैटर्न का उपयोग एक बड़े अनुक्रम डेटाबेस में मिलान करने वाले अनुक्रमों को खोजने के लिए किया जा सकता है। कई सॉफ्टवेयर पैकेज इस तरह की खोज को लागू करते हैं, जैसे। आर. एन. ए. रोबो और आर. एन. ए. मोटिफ। नवीन आर. एन. ए. रूपांकनों की खोज नवीन आर. एन. ए. की खोज करने के कई तरीके एक तुलनात्मक दृष्टिकोण का उपयोग करते हैं, जिसमें एक संरक्षित आर. एन. ए. के विशिष्ट संकेतों का पता लगाने के लिए विभिन्न अनुक्रमों का एक साथ विश्लेषण किया जाता है। जब इस तरह के तरीके सफल होते हैं, तो परिणामी नए संरक्षित आर. एन. ए. को आर. एन. ए. रूपांकन के रूप में देखा जा सकता है, जिसे संरेखण या एक पैटर्न का उपयोग करके व्यक्त किया जाता है। एक प्रारंभिक उदाहरण टी-बॉक्स के आसपास आधारित आर. एन. ए. रूपांकन है, जिसे 1993 में एमिनोसेल-टी. आर. एन. ए. सिंथेटेज जीन के साथ जोड़ा जाना निर्धारित किया गया था। जिस तंत्र द्वारा यह आर. एन. ए. रूपांकन जीन को नियंत्रित करता है, उसे बाद में प्रदर्शित किया गया, इस प्रकार आर. एन. ए. रूपांकन के कार्यात्मक महत्व को स्थापित किया गया। बाद में, 1997 में, बी12 चयापचय से संबंधित जीन के ऊपर की ओर बी12-बॉक्स नामक एक संरक्षित आर. एन. ए. रूपांकन का पता चला। यह आर. एन. ए. रूपांकन बाद में एक राइबोस्विच के एक हिस्से के अनुरूप पाया गया जो सह-कारक एडेनोसिलकोबालामिन को बांधता है, जिसे अक्सर कोबालामिन राइबोस्विच कहा जाता है। (बाद के रूपों को अन्य कोबालामिन व्युत्पन्नों को बांधते हुए दिखाया गया।) आर. एन. ए. रूपांकनों के कई अन्य उदाहरण जिनके कार्यों को बाद में निर्धारित किया गया था, विशेष रूप से राइबोस्विच के संदर्भ में ज्ञात हैं। हालाँकि, अन्य प्रकार के आर. एन. ए. रूपांकनों को कार्यात्मक रूप से चिह्नित किया गया है, जैसे कि 6 सी. आर. एन. ए. जैसे जीवाणु एस. आर. एन. ए., जिसे 2007 में एक रूपांक के रूप में खोजा गया था और 2016 में कार्यात्मक रूप से चिह्नित किया गया था, या ट्विस्टर राइबोज़ाइम जैसे राइबोज़ाइम, जिसे आर. एन. ए. रूपांकनों के रूप में पाया गया था और उसी प्रकाशन में कार्यात्मक रूप से चिह्नित किया गया था। संदर्भ आर. एन. ए.