TMEM212
ट्रांसमेम्ब्रेन प्रोटीन 212 एक प्रोटीन है जिसे मनुष्यों में टी. एम. ई. एम. 212 जीन द्वारा कूटबद्ध किया जाता है। प्रोटीन में 5 ट्रांसमेम्ब्रेन डोमेन होते हैं और प्लाज्मा झिल्ली और एंडोप्लाज्मिक रेटिकुलम में स्थानीयकृत होते हैं। टी. एम. ई. एम. 212 में कशेरुकी जीवों में ऑर्थोलॉग हैं लेकिन अकशेरुकी नहीं हैं। टी. एम. ई. एम. 212 अफ्रीकी अमेरिकियों में छिटपुट पार्किंसंस रोग, चेहरे की प्रक्रिया और मोटापे से जुड़ा हुआ है। टी. एम. ई. एम. 212 जीन गुणसूत्र 3 पर स्थिति 3q26.3 पर होता है और प्लस स्ट्रैंड पर स्थित होता है। जीन को स्थिति 171,561,140 से 171,577,108 तक कूटबद्ध किया जाता है। इसके सबसे लंबे समरूप में 4 एक्सॉन, 1881 न्यूक्लियोटाइड्स का एक कोडिंग अनुक्रम और एक अपस्ट्रीम इन-फ्रेम स्टॉप कोडन शामिल हैं। कोडिंग अनुक्रम जीन TMEM212 का 36-660 आधार है। जीन पड़ोस में अन्य जीनों में शामिल हैंः पी. एल. डी. 1, आर. एन. यू. 6-348 पी और एफ. एन. डी. सी. 3बी। प्रतिलेखन जीन टी. एम. ई. एम. 212 में 2 समरूप होते हैं। टी. एम. ई. एम. 212 के एम. आर. एन. ए. स्प्लाइस रूप अंतिम एक्सॉन पर भिन्न होते हैं। वैरिएंट में से एक ने अंतिम एक्सॉन के हिस्से को विभाजित कर दिया है-जिससे यह 537 न्यूक्लियोटाइड्स छोटा हो गया है। इस आइसोफ्रॉम में 1343 न्यूक्लियोटाइड्स का एम. आर. एन. ए. अनुक्रम है। बाद के संस्करण को एन. सी. बी. आई. में स्वीकार नहीं किया गया है। प्रोटीन टी. एम. ई. एम. 212 में 5 ट्रांसमेम्ब्रेन क्षेत्र होते हैं, जो इसे एक ट्रांसमेम्ब्रेन प्रोटीन बनाते हैं। 5 पार-झिल्ली क्षेत्र मुख्य रूप से गैर-ध्रुवीय अमीनो एसिड हैं। हालांकि, 2 ट्रांसमेम्ब्रेन क्षेत्रों में एक ध्रुवीय, आवेशित अमीनो एसिड होता है। प्रोटीन 194 एमिनो एसिड लंबा होता है और इसका अनुमानित आणविक वजन 21kDa होता है। आइसोइलेक्ट्रिक बिंदु लगभग 8 के पी. एच. पर है। टी. एम. ई. एम. 212 के अमीनो अम्ल अनुक्रम में कोई आंतरिक पुनरावृत्ति नहीं होती है। इसके अलावा, सभी अमीनो एसिड सामान्य प्रचुरता में होते हैं। मानव टी. एम. ई. एम. 212 अपने ऑर्थोलॉग के समान आणविक भार और आइसोइलेक्ट्रिक बिंदु प्रदर्शित करता है जैसा कि तालिका 1 में प्रदर्शित किया गया है। तालिका 1: मनुष्यों और ऑर्थोलॉग्स में टी. एम. ई. एम. 212 प्रोटीन विशेषताएँ माध्यमिक और तृतीयक संरचना फेयर 2 और अली2डी भविष्यवाणी करते हैं कि टी. एम. ई. एम. 212 में अल्फा हेलिक्स से समृद्ध एक द्वितीयक संरचना है, विशेष रूप से ट्रांसमेम्ब्रेन क्षेत्रों में। अल्फा हेलिक्स को स्तनधारियों से लेकर सरीसृपों तक ऑर्थोलॉग में संरक्षित किया गया था। इसके अतिरिक्त, डी. ए. एन. ए. ने भविष्यवाणी की है कि टी. एम. ई. एम. 212 में 6 सिस्टीन एमिनो एसिडः सी46-सी88, सी105-सी154, और सी135-सी16 के बीच 3 डाइसल्फ़ाइड बंधन शामिल हैं। तृतीयक संरचना में झिल्ली के भीतर 5 क्षेत्र होते हैं। जीन स्तर विनियमन प्रवर्तक जीनोमैटिक्स के अनुसार, टी. एम. ई. एम. 212 में 3 संभावित प्रवर्तक हैं। हालाँकि, टी. एम. ई. एम. 212 के लिए सबसे अधिक संभावित प्रवर्तक सीधे टी. एम. ई. एम. 212 के जीन के ऊपर की ओर है और यह 1654 आधार जोड़े (जी. एक्स. पी. 277729) है। अभिव्यक्ति टी. एम. ई. एम. 212 आर. एन. ए. अधिकांश ऊतक प्रकारों (जी. डी. एस. 1096) में निम्न और सर्वव्यापी रूप से व्यक्त किया जाता है। टी. एम. ई. एम. 212 अंडाशय, मस्तिष्क, फेफड़े, हृदय, गुर्दे, वृषण में थोड़े उच्च स्तर पर व्यक्त किया जाता है। टी. एम. ई. एम. 212 मस्तिष्क के विशिष्ट भागों में व्यक्त किया गया था जिसमें पोंस और ट्राइजेमिनल गैंग्लियन शामिल थे। मध्यम अभिव्यक्ति वाले अन्य ऊतकों में अधिवृक्क प्रांतस्था और अपेंडिक्स शामिल थे। सभी उपलब्ध आर. एन. ए.-अनुक्रमण आंकड़ों से पता चलता है कि टी. एम. ई. एम. 212 फेफड़ों में पाया जाता है। प्रतिलेखन स्तर विनियमन 5 'अनुवादित क्षेत्र 35 आधार जोड़े लंबा है। 3 'अनुवादित क्षेत्र की लंबाई 1221 आधार जोड़े हैं और यह आधार 661 से 1881 तक स्थित है। 5 'यू. टी. आर. और 3' यू. टी. आर. के लिए सबसे कम ऊर्जा संरचना की भविष्यवाणी की गई थी। कम लंबाई के कारण, 5 'यू. टी. आर. में 1 स्टेम-लूप होने की भविष्यवाणी की गई थी। 3 'यू. टी. आर. में 17 स्टेम-लूप होने का अनुमान है। प्रोटीन स्तर विनियमन संशोधन यह भविष्यवाणी की गई है कि टी. एम. ई. एम. 212 में दो सल्फिकेशन साइट और एक फॉस्फोराइलेशन साइट है। अमीनो एसिड 23 और 24 के बीच एक संभावित दरार संकेत पेप्टाइड है। फॉस्फोराइलेशन साइट और क्लीवेज सिग्नल पेप्टाइड की उपस्थिति ऑर्थोलॉग्स के बीच आम है। उपकोशिकीय स्थानीयकरण प्राथमिक उपकोशिकीय स्थानों में प्लाज्मा झिल्ली और एंडोप्लाज्मिक रेटिकुलम शामिल हैं। टी. एम. ई. एम. 212 का उपकोशिकीय स्थान ऑर्थोलॉग में संरक्षित है। टी. एम. ई. एम. 212 एंटीबॉडी के इम्यूनोफ्लोरेसेंट धुंधलापन से पता चलता है कि टी. एम. ई. एम. 212 नाभिक में मौजूद है, लेकिन कारण अज्ञात है। मनुष्यों में अधिकांश प्रोटीन की तुलना में टी. एम. ई. एम. 212 कम प्रचुर मात्रा में होता है। इवोल्यूशन पैरालॉग TMEM212 में एक ज्ञात पैरालॉग हैः झिल्ली-फैले 4 डोमेन A7 (MS4A7)। जीन गुणसूत्र 11 पर 11q12.2 पर स्थित है। MS4A7 संभवतः दस लाख वर्ष पहले TMEM212 435-475 से विकसित हुआ था। यह दाईं ओर दिखाया गया है जहाँ विभिन्न प्रोटीनों की विचलन दर की तुलना की गई है। होमो सेपियन्स में ऑर्थोलॉग टी. एम. ई. एम. 212 अत्यधिक संरक्षित है। यह कशेरुकी जीवों में पाया जाता है लेकिन अकशेरुकी जीवों में नहीं और इसमें स्तनधारियों, पक्षियों, सरीसृपों, उभयचरों और मछलियों सहित कई ऑर्थोलॉग हैं। नीचे दी गई तालिका 2 स्तनधारियों, सरीसृपों, पक्षियों, उभयचरों और मछलियों में टी. एम. ई. एम. 212 के ऑर्थोलॉग दिखाती है। जैसा कि दाईं ओर कई अनुक्रम संरेखण में प्रदर्शित किया गया है, स्तनधारियों और सरीसृपों जैसे सख्त ऑर्थोलॉग में अत्यधिक संरक्षित क्षेत्र हैं। अधिकांश संरक्षित क्षेत्र वहाँ गिर गए जहाँ ट्रांसमेम्ब्रेन क्षेत्र स्थानीयकृत हैं। टी. एम. ई. एम. 212 संदर्भ अनुक्रम साइटोक्रोम सी और फाइब्रिनोजेन अल्फा की तुलना में मध्यम रूप से तेजी से विकसित हो रहा है। टी. एम. ई. एम. 212, एम. एस. 4ए7, साइटोक्रोम सी और फाइब्रिनोजेन अल्फा की विचलन दरों की तुलना करते समय इसे दाईं ओर दिखाया गया है। एम. वाई. ए. = लाखों साल पहले परस्पर क्रिया करने वाले प्रोटीन तीन प्रोटीन टी. एम. ई. एम. 212 के साथ संभावित रूप से परस्पर क्रिया करने के लिए प्रकट किए गए थेः टी. एम. ई. एम. 45ए, जी. पी. आर. 137सी, और एच. एन. आर. एन. पी. एल। इन प्रोटीनों की पहचान प्रायोगिक रूप से सह-अभिव्यक्ति या आत्मीयता ग्रहण-आर. एन. ए. के माध्यम से की गई थी। उन्हें टेक्स्ट माइनिंग का उपयोग करके भी पहचाना गया था। टी. एम. ई. एम. 212 के समान टी. एम. ई. एम. 45ए और जी. पी. आर. 137 भी प्लाज्मा झिल्ली में पाए जाते हैं, जिससे इस अंतःक्रिया की संभावना होती है। तालिका 3: टी. एम. ई. एम. 212 नैदानिक महत्व टी. एम. ई. एम. 212 के साथ अंतःक्रिया करने वाले प्रोटीन अफ्रीकी अमेरिकियों में वसा, चेहरे की प्रक्रिया और छिटपुट पार्किंसंस रोग से जुड़े हो सकते हैं। अफ्रीकी अमेरिकियों में टी. एम. ई. एम. 212 (एम. आर. एन. ए. या प्रोटीन) और उच्च बी. एम. आई. में वृद्धि ने एक कड़ी दिखाई है क्योंकि टी. एम. ई. एम. 212 के पास एक स्थान पर एस. एन. पी. को बढ़ी हुई वसा से जोड़ा गया है। इसके अलावा, जीन टी. एम. ई. एम. 212 चेहरे के प्रसंस्करण में भी शामिल हो सकता है। चेहरे की प्रक्रिया आनुवंशिक रूप से नियंत्रित होती है, और चेहरे के भावों की प्रतिक्रिया में, टी. एम. ई. एम. 212 में पाए जाने वाले एक सामान्य एस. एन. पी. ने मस्तिष्क के दाहिने फ्यूसिफॉर्म गायरस क्षेत्र को सक्रिय किया, जो चेहरे की प्रक्रिया के लिए महत्वपूर्ण है। यह विशेष रूप से 3q26.31 पर हुआ। एसएनपी की संख्या आरएस12485367 है। जी एल्ले वाले लोगों में सी होमोजाइगोट्स की तुलना में अधिक सक्रियता थी। टी. एम. ई. एम. 212 पार्किंसंस रोग से भी जुड़ा हो सकता है। टी. एम. ई. एम. 212 जीन में एस. एन. पी. आर. एस. 2270568 (गुणसूत्र 3 स्थिति 172048861) में परिवर्तन आधार टी को सी में बदलने और छिटपुट पार्किंसंस रोग की बढ़ती घटनाओं से जुड़ा था। संदर्भ