Planarian secretory cell nidovirus
प्लेनेरियन स्रावी कोशिका निडोवायरस (पी. एस. सी. एन. वी.) प्रजाति प्लेनिडोवायरस 1 का एक वायरस है, जो एक निडोवायरस है जो अपने अत्यंत बड़े जीनोम के लिए उल्लेखनीय है। 41. 1 किलोबेस पर, यह आर. एन. ए. वायरस का सबसे बड़ा ज्ञात जीनोम है। इसकी खोज प्लानेरियन फ्लैटवर्म श्मिड्टिया मेडिटेरेनिया के ट्रांसक्रिप्टोम का निरीक्षण करके की गई थी और यह पहला ज्ञात आर. एन. ए. वायरस है जो प्लानेरियन को संक्रमित करता है। इसका वर्णन पहली बार 2018 में किया गया था। जीनोम और अभिव्यक्ति पी. एस. सी. एन. वी. जीनोम 41.1 किलोबेस लंबा है, जो आर. एन. ए. वायरस में सबसे बड़ा ज्ञात जीनोम है। यह कोरोनावायरस की तुलना में काफी बड़ा है, निडोवायरस का एक अन्य समूह जो बड़े जीनोम के लिए जाना जाता है, जो आमतौर पर 27-32 kb रेंज में होते हैं। पी. एस. सी. एन. वी. में एक असामान्य जीनोमिक संगठन है जिसमें एक अत्यंत बड़ा ओपन रीडिंग फ्रेम (ओ. आर. एफ.) होता है जो 13,556 एमिनो एसिड के पॉलीप्रोटीन को कूटबद्ध करता है-सबसे बड़ा प्रोटीन जिसे आर. एन. ए. वायरस द्वारा कूटबद्ध किया जाता है। जीनोम के जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण से पता चलता है कि यह कैनॉनिकल निडोवायरस जीनोम के समान व्यवस्थित है, जिसमें ओ. आर. एफ. 1ए और ओ. आर. एफ. 1बी वायरल गैर-संरचनात्मक प्रोटीन को कूटबद्ध करते हैं और जीनोम के 3 'छोर पर अतिरिक्त ओ. आर. एफ. वायरल संरचनात्मक प्रोटीन को कूटबद्ध करते हैं; हालाँकि, पी. एस. सी. एन. वी. में, इन ओ. आर. एफ. को संयोजित किया जाता है और परिणामस्वरूप पॉलीप्रोटीन को प्रोटियोलिटिक रूप से संसाधित किया जाता है। जहाँ अन्य निडोवायरस दो ओ. आर. एफ. द्वारा कूटबद्ध प्रोटीन के स्टोइकिओमेट्री को विनियमित करने के लिए ओ. आर. एफ. 1ए को ओ. आर. एफ. 1बी से अलग करने वाले एक क्रमादेशित राइबोसोमल फ्रेमशिफ्ट का उपयोग करते हैं, पी. एस. सी. एन. वी. जीनोम में सापेक्ष प्रोटीन अभिव्यक्ति को नियंत्रित करने के लिए एक वैकल्पिक फ्रेमशिफ्ट तंत्र होने की भविष्यवाणी की गई है। अन्य निडोवायरस जीनोम की तुलना में, ओ. आर. एफ. 1. बी. से संबंधित क्षेत्र-जो मुख्य वायरल प्रतिकृति घटकों को कूटबद्ध करता है-ने पी. एस. सी. एन. वी. जीनोम में सबसे अधिक विस्तार किया है। प्रोटीन घटक संरक्षित पी. एस. सी. एन. वी. जीनोम पहचान योग्य प्रोटीन डोमेन को कूटबद्ध करता है जो निडोवायरस के बीच संरक्षित होते हैं-अर्थात् मुख्य प्रोटीज (3 सी. एल. जैसे प्रोटीज) जो दोनों छोरों पर ट्रांसमेम्ब्रेन डोमेन द्वारा फ़्लैंक किया जाता है, एक न्यूक्लियोटिडिलट्रांसफ़ेरेस डोमेन जिसे निरान के रूप में जाना जाता है, आर. एन. ए.-निर्भर आर. एन. ए. पोलीमरेज़ (आर. डी. आर. पी.), एक जस्ता-बाध्यकारी डोमेन और एक हेलिकेस। इसमें मिथाइलट्रांसफेरेज भी होते हैं और-बड़े जीनोम वाले अन्य निडोवायरस की तरह-एक प्रूफरीडिंग एक्सोरिबोन्यूक्लीज (एक्सओएन), जो एक बड़े जीनोम को दोहराने के लिए पर्याप्त प्रतिकृति निष्ठा के लिए आवश्यक है। हालांकि, एक्सोएन संरचना और सक्रिय साइट अवशेष अन्य निडोवायरल उदाहरणों से अलग हैं, और 3सीएल जैसे प्रोटीज अन्य निडोवायरस के विशिष्ट सिस्टीन न्यूक्लियोफाइल के विपरीत, एक सेरीन-हिस्टिडीन-एस्पार्टेट उत्प्रेरक त्रिभुज का उपयोग करते हुए दिखाई देते हैं। ज्ञात निडोवायरस के बीच अद्वितीय रूप से, पी. एस. सी. एन. वी. कई अन्य पहचान योग्य प्रोटीन डोमेन को भी कूटबद्ध करता है, जो संभवतः मेजबान से प्राप्त किए गए हैं। पी. एस. सी. एन. वी. रिबोन्यूक्लीज़ टी2, दो फाइब्रोनेक्टिन प्रकार II डोमेन को कूटबद्ध करता है, और तीन एंकिरिन दोहराता है। मेजबान पी. एस. सी. एन. वी. को प्रायोगिक रूप से श्मिड्टिया मेडिटेरेनिया प्रजाति के प्लानेरियन की स्रावी कोशिकाओं को संक्रमित करने के लिए दिखाया गया है, जिसमें अलैंगिक रूप से प्रजनन और यौन उपभेद दोनों शामिल हैं। कोरोनावायरस जीनोम के समान अनुक्रमों के लिए इन जीवों के प्रतिलेखों की खोज करके इसकी खोज की गई थी। यह इस तरह के कई ट्रांसक्रिप्टोम डेटासेट में मौजूद प्रतीत होता है, जिससे पता चलता है कि प्रयोगशाला एस. मेडिटेरेनिया का संक्रमण आम है, विशेष रूप से यौन उपभेदों में। वर्गीकरण पी. एस. सी. एन. वी. जीनोम में सभी निडोवायरस में संरक्षित पांच विशिष्ट प्रोटीन डोमेन होते हैं। अपने जीनोम के जातिजनित विश्लेषण के आधार पर, यह अकशेरुकी मेजबानों को संक्रमित करने के लिए जाने जाने वाले अन्य निडोवायरस के साथ समूह बनाता है। पी. एस. सी. एन. वी. उपवंश डुमेडिवायरस का एकमात्र सदस्य है, जो बदले में जीनस अल्फैमोनोनिवायरस का एकमात्र सदस्य है। आर. एन. ए. वायरस जीनोम के बड़े समूहों के उनके आर. एन. ए.-निर्भर आर. एन. ए. पोलीमरेज़ (आर. डी. आर. पी.) अनुक्रमों के आधार पर आगे के विश्लेषण निडोवायरस को तथाकथित "पिकोर्नावायरस सुपरग्रुप" में रखते हैं, जो जीनोम आकारों की एक बड़ी श्रृंखला में फैले वायरस का एक बहुत ही विविध समूह है-पी. एस. सी. एन. वी., सबसे बड़ा आर. एन. ए. वायरस से लेकर सबसे छोटे आर. एन. ए. वायरसों में से सोबेमोवायरस तक-और आर. डी. आर. पी. के अलावा कोई सामान्य जीन साझा नहीं करते हैं। संदर्भ निडोविरेल्स इन्फ्रास्पेसिफिक वायरस टैक्स