ORF9c
ओ. आर. एफ. 9. सी. (जिसे पहले ओ. आर. एफ. 14 भी कहा जाता था) उपजाति सारबेकोवायरस के कोरोनावायरस जीनोम में एक ओपन रीडिंग फ्रेम (ओ. आर. एफ.) है। यह सार्स-कोव-2 जीनोम में 73 कोडॉन लंबा है। हालाँकि इसे अक्सर सरबेकोवायरस वायरल सहायक प्रोटीन जीन की सूचियों में शामिल किया जाता है, प्रयोगात्मक और जैव सूचना विज्ञान साक्ष्य बताते हैं कि ORF9c एक कार्यात्मक प्रोटीन-कोडिंग जीन नहीं हो सकता है। वैज्ञानिक साहित्य में इस जीन के लिए उपयोग किए जाने वाले नामकरण में विसंगति रही है। सार्स-कोव पर कुछ कार्यों में, इसे ओ. आर. एफ. 14 के रूप में संदर्भित किया गया है। इसे कभी-कभी ORF9b के रूप में संदर्भित किया जाता है, जबकि इसके लंबे अपस्ट्रीम पड़ोसी ORF9b को ORF9a नाम दिया गया था। वर्तमान अनुशंसित नामकरण इस जीन को ORF9c के रूप में संदर्भित करता है, और अपस्ट्रीम जीन को ORF9b के रूप में संदर्भित करता है। अभिव्यक्ति और अंतःक्रिया ओ. आर. एफ. 9. सी. दो अतिव्यापी जीनों में से एक है जो पूरी तरह से एन जीन एन्कोडिंग कोरोनावायरस न्यूक्लियोकैप्सिड प्रोटीन के खुले पठन ढांचे के भीतर निहित है, दूसरा ओ. आर. एफ. 9. बी. है। यह स्पष्ट नहीं है कि ORF9c कार्यात्मक रूप से SARS-CoV-2 संक्रमणों के दौरान व्यक्त किया जाता है या नहीं; यह कथित तौर पर प्रयोगात्मक परिस्थितियों में अनुवादित नहीं होता है। जब प्रयोगात्मक रूप से अत्यधिक अभिव्यक्त किया जाता है, तो प्रोटीन सिग्मा रिसेप्टर्स और एन. एफ.-के. बी. मार्ग के साथ अंतःक्रिया करता है। सार्स-कोव प्रोटीन प्रोटीन डाइमर या उच्च-क्रम के ऑलिगोमर गठन का सुझाव देते हुए स्व-अंतःक्रिया बनाता है। इवोल्यूशन ओआरएफ9सी में सार्स-कोव और सार्स-कोव-2 के बीच लगभग 74 प्रतिशत अनुक्रम पहचान है। सार्स-कोव-2 प्रकारों की पहचान की गई है जिसमें समय से पहले रुकने वाले कोडन पेश किए जाते हैं या जहां इसका प्रारंभ कोडन खो गया था, और अमीनो एसिड अनुक्रम खराब रूप से संरक्षित है, इस परिकल्पना का समर्थन करते हुए कि यह एक कार्यात्मक प्रोटीन को कूटबद्ध नहीं करता है। संदर्भ कोरोनावायरस प्रोटीन