DIMPL
डी. आई. एम. पी. एल. (डिस्कवरी ऑफ इंटरजेनिक मोटिफ्स पाइपलाइन) एक जैव-सूचनात्मक पाइपलाइन है जो बैक्टीरियल जी. सी.-समृद्ध इंटरजेनिक क्षेत्रों (आई. जी. आर.) के निष्कर्षण और चयन को सक्षम बनाती है जो संरचित गैर-कोडिंग आर. एन. ए. (एन. सी. आर. एन. ए.) के लिए समृद्ध हैं। एन. सी. आर. एन. ए. मोटिफ खोज के लिए बैक्टीरियल आई. जी. आर. को समृद्ध करने की विधि पहली बार "बैक्टीरिया में संरचित गैर-कोडिंग आर. एन. ए. की जीनोम-व्यापी खोज" में एक अध्ययन के लिए रिपोर्ट की गई थी। डी. आई. एम. पी. एल. पाइपलाइन आई. जी. आर. निकालकर कुल जीनोम विश्लेषण की प्रक्रिया को स्वचालित करती है, उन्हें लंबाई और न्यूक्लिक एसिड संरचना द्वारा फ़िल्टर करती है, और उम्मीदवार रूपांकनों की पहचान करने और उनके संभावित कार्यों को निर्धारित करने के लिए आवश्यक डेटा एकत्र करती है। डी. आई. एम. पी. एल. पाइपलाइन समर्थन वेक्टर मशीन (एस. वी. एम.) वर्गीकरणकों के माध्यम से एन. सी. आर. एन. ए. के लिए समृद्ध जीनोमिक क्षेत्रों की पहचान करने के लिए पुनरुत्पादक तकनीक प्रदान करती है। इसका उपयोग न्यूक्लिक एसिड और प्रोटीन रूपांकनों को देखने के लिए किया जा सकता है, जिसमें राइबोस्विच जैसे तत्व, अपस्ट्रीम ओपन रीडिंग फ्रेम (यूओआरएफ), शॉर्ट ओपन रीडिंग फ्रेम (एसओआरएफ), राइबोसोमल प्रोटीन लीडर अनुक्रम, स्वार्थी आनुवंशिक तत्व और अज्ञात कार्य के अन्य संरचित आरएनए रूपांकनों शामिल हैं। डी. आई. एम. पी. एल. विभिन्न अनुक्रम विश्लेषण संसाधनों का उपयोग करता है, जिनमें शामिल हैंः ज्ञात आर. एन. ए. परिवारों के संदर्भ के रूप में आर. एफ. ए. एम. डेटाबेस, बी. एल. ए. एस. टी. एक्स. खोज उपकरण, अप्रमाणित प्रोटीन कोडिंग क्षेत्रों के इन्फरनल पैकेज को समाप्त करने के लिए, आई. जी. एस. अनुक्रम सी. एम. फाइंडर को खोजने के लिए, संभावित आर. एन. ए. माध्यमिक संरचना सुविधाओं आर-परिदृश्य सॉफ्टवेयर और आर2आर ड्राइंग एल्गोरिथ्म की तलाश करने के लिए, सर्वसम्मति मॉडल आर. एन. ए. कोड उत्पन्न करने के लिए, कोडिंग क्षेत्रों की उपस्थिति की तलाश करने के लिए जीनोमव्यू, डी. आई. एम. पी. एल. का उपयोग करके खोजे गए आर. एन. ए. मोटिफ के आनुवंशिक संदर्भ की कल्पना करने के लिए एच. एम. पी.-पी. राइबोस्विच, आई. सी. डी.-II एन. सी. आर. एन. ए. मोटिफ, कार ए. एन. सी. आर. एन. ए. मोटिफ, एल. डी. एच. 2 एन. सी. आर. एन. ए. मोटिफ, संदर्भ जैव सूचना विज्ञान कम्प्यूटेशनल जीव विज्ञान