ORF10
ओ. आर. एफ. 10 एक ओपन रीडिंग फ्रेम (ओ. आर. एफ.) है जो सार्स-कोव-2 कोरोनावायरस के जीनोम में पाया जाता है। यह 38 कोडोन लंबा है। यह सभी सारबेकोवायरस (सार्स-कोव सहित) में संरक्षित नहीं है। कोविड-19 महामारी द्वारा प्रेरित अध्ययनों में, ओ. आर. एफ. 10 ने दो वायरल सहायक प्रोटीन जीनों में से एक के रूप में अनुसंधान रुचि को आकर्षित किया जो सार्स-कोव और सार्स-कोव-2 के बीच संरक्षित नहीं थे और शुरू में सकारात्मक चयन के तहत प्रोटीन-कोडिंग जीन के रूप में वर्णित किया गया था। हालाँकि, हालाँकि इसे कभी-कभी SARS-CoV-2 सहायक जीन की सूचियों में शामिल किया जाता है, प्रयोगात्मक और जैव सूचना विज्ञान साक्ष्य बताते हैं कि ORF10 संभवतः एक कार्यात्मक प्रोटीन-कोडिंग जीन नहीं है। ओ. आर. एफ. 10 गुण एन जीन के नीचे की ओर स्थित है, जो कोरोनावायरस न्यूक्लियोकैप्सिड प्रोटीन को कूटबद्ध करता है। यह जीनोम के 3 'छोर से सबसे दूर एनोटेटेड ओपन रीडिंग फ्रेम है। यह एक 38-एमिनो एसिड काल्पनिक प्रोटीन को कूटबद्ध करता है। अभिव्यक्ति और कार्य यह संभावना नहीं है कि ओ. आर. एफ. 10 का प्राकृतिक परिस्थितियों में अनुवाद किया गया है, क्योंकि ओ. आर. एफ. 10 क्षेत्र वाले उप-जीनोमिक आर. एन. ए. का पता नहीं चला है, हालांकि कुछ राइबोसोम फुटप्रिंटिंग संकेत हैं। जब प्रयोगात्मक रूप से अत्यधिक अभिव्यक्त किया जाता है, तो ORF10 प्रोटीन को ZYG11B और इसके कलिन-रिंग लाइगेज प्रोटीन कॉम्प्लेक्स के साथ बातचीत करने के लिए बताया गया है। हालांकि, इस अंतःक्रिया को वायरल जीवन चक्र के इन विट्रो अध्ययनों में डिस्पेंसेबल दिखाया गया है। SARS-CoV-2 जीनोम के कुछ अध्ययनों ने ORF10 को कार्यात्मक और सकारात्मक चयन के तहत होने की संभावना के रूप में वर्णित किया है। हालाँकि, SARS-CoV-2 प्रकारों और कई सरबेकोवायरस अनुक्रमों में समय से पहले रुकने वाले कोडन की पहचान की गई है, जिससे पता चलता है कि अनुमानित प्रोटीन उत्पाद वायरल प्रतिकृति के लिए आवश्यक नहीं है। ओ. आर. एफ. 10 के नुकसान ने भी इन विट्रो में प्रयोगात्मक परिस्थितियों में प्रतिकृति पर कोई प्रभाव नहीं दिखाया है। जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण के माध्यम से यह सुझाव दिया गया है कि सार्स-कोव-2 ओ. आर. एफ. 10 में स्पष्ट अनुक्रम संरक्षण प्रोटीन-कोडिंग कार्य के कारण नहीं हो सकता है, बल्कि इस क्षेत्र में संरक्षित आर. एन. ए. द्वितीयक संरचना के कारण हो सकता है। संरक्षित क्षेत्र, जो ओ. आर. एफ. 10 से परे फैला हुआ है, कोरोनावायरस 3 'यू. टी. आर. सूडोकनॉट क्षेत्र के साथ ओवरलैप करता है, एक माध्यमिक संरचना जिसे जीनोम प्रतिकृति में शामिल होने के लिए जाना जाता है। संदर्भ कोरोनावायरस प्रोटीन