Nidoviral papain-like protease
निडोवायरल पपैन जैसे प्रोटीज (पीएलप्रो या पीएलपी) निडोवायरस के जीनोम में कूटबद्ध एक पपैन जैसे प्रोटीज प्रोटीन डोमेन है। यह ओ. आर. एफ. 1ए जीन से एक बड़े पॉलीप्रोटीन के हिस्से के रूप में व्यक्त किया जाता है और इसमें सिस्टीन प्रोटीज एंजाइमेटिक गतिविधि होती है जो पॉलीप्रोटीन के भीतर कुछ एन-टर्मिनल वायरल गैर-संरचनात्मक प्रोटीन के प्रोटीयोलिटिक दरार के लिए जिम्मेदार होती है। ओ. आर. एफ. 1ए. द्वारा कूटबद्ध एक दूसरा प्रोटीज, जिसे 3सी-जैसे प्रोटीज या मुख्य प्रोटीज कहा जाता है, आगे के अधिकांश दरारों के लिए जिम्मेदार है। कोरोनावायरस में एक या दो पपैन जैसे प्रोटीज डोमेन होते हैं; SARS-CoV और SARS-CoV-2 में, एक PLPro डोमेन कोरोनावायरस गैर-संरचनात्मक प्रोटीन 3 (nsp3) में स्थित होता है। आर्टेरिवायरस में दो से तीन पी. एल. पी. डोमेन होते हैं। उनकी प्रोटीज गतिविधि के अलावा, पी. एल. पी. डोमेन ड्यूबिक्विटिनेटिंग एंजाइम (डी. यू. बी.) के रूप में कार्य करते हैं जो यूबिक्विटिन श्रृंखलाओं में पाए जाने वाले आइसोपेप्टाइड बंधन को तोड़ सकते हैं। वे "डीआईएसजीलाइटिंग" एंजाइम भी हैं जो सेलुलर प्रोटीन से यूबीक्विटिन जैसे डोमेन इंटरफेरॉन-उत्तेजित जीन 15 (आई. एस. जी. 15) को हटा देते हैं। ये गतिविधियाँ संभवतः मेजबान जन्मजात प्रतिरक्षा प्रणाली की गतिविधि का विरोध करने के लिए जिम्मेदार हैं। क्योंकि वे वायरल प्रतिकृति के लिए आवश्यक हैं, पपैन जैसे प्रोटीज डोमेन को मानव रोगजनकों जैसे MERS-CoV, SARS-CoV और SARS-CoV-2 के खिलाफ एंटीवायरल दवाओं के विकास के लिए दवा लक्ष्य माना जाता है। वर्गीकरण और नामकरण एम. ई. आर. ओ. पी. एस. प्रोटीज वर्गीकरण प्रणाली के अनुसार, निडोवायरल पापेन जैसे प्रोटीज कबीले सी. ए. के सदस्य हैं, पापेन जैसे प्रोटीज, जिनकी संरचना और उत्प्रेरक तंत्र पापेन के समान हैं। इस समूह में कई वायरल पॉलीप्रोटीन-प्रसंस्करण प्रोटीज होते हैं। इस समूह में प्रोटीज जीवन के सभी क्षेत्रों में पाए जाते हैं। कोरोनावायरस में, एकल पपैन जैसे प्रोटीज डोमेन को आमतौर पर पीएलप्रो के रूप में जाना जाता है, उदाहरण के लिए सार्स-कोव और सार्स-कोव-2 में। जब ऐसे दो डोमेन को जीनोम में कूटबद्ध किया जाता है, तो उन्हें पीएलपी1 और पीएलपी2 या पीएलप्रो1 और पीएलप्रो2 के रूप में जाना जाता है, जहां एकल-डोमेन वायरस का पीएलप्रो पीएलपी2 के समान होता है। आर्टरिवायरस में, तीन पी. एल. पी. डोमेन पी. एल. पी. 1α, पी. एल. पी. 1β और पी. एल. पी. 2 के रूप में जाने जाते हैं। फंक्शन पीएलप्रो एक बहुक्रियाशील एंजाइम है जिसकी वायरल जीवन चक्र में कई भूमिकाएँ हैं, जिसमें प्रोटीज, ड्यूबिक्विटिनेज और डीआईएसजीलाइटिंग गतिविधियाँ शामिल हैं। कोरोना वायरस में, यह बड़े, बहु-क्षेत्र गैर-संरचनात्मक प्रोटीन 3 (एन. एस. पी. 3) प्रोटीन के भीतर एक प्रोटीन क्षेत्र के रूप में होता है। वायरल प्रतिकृति के लिए पीएलप्रो गतिविधि आवश्यक है। मेजबान जन्मजात प्रतिरक्षा प्रणाली प्रतिक्रिया को प्रभावित करने के लिए तंत्र के रूप में ड्यूबिक्विटिनेशन और डीआईएसजीलेशन के लिए वायरल प्रोटीज का विकासवादी पुनर्प्रयोजन कई वायरल परिवारों के लिए जाना जाता है। प्रोटियोलिटिक प्रसंस्करण निडोवायरल पीएलप्रो डोमेन ओआरएफ1एबी जीन द्वारा कूटबद्ध बड़े पॉलीप्रोटीन के हिस्से के रूप में व्यक्त किए जाते हैं। वे परिपक्व वायरल गैर-संरचनात्मक प्रोटीन (एन. एस. पी. एस.) उत्पन्न करने के लिए पॉलीप्रोटीन के प्रोटीयोलिटिक प्रसंस्करण के लिए जिम्मेदार हैं, जिनमें से कई प्रतिकृति-प्रतिलेखन परिसर के घटक हैं। कोरोनावायरस में, पीएलप्रो डोमेन एन-टर्मिनल एनएसपीएस1-4 के दरारों को निष्पादित करते हैं, जबकि 3सी जैसे प्रोटीज (मुख्य प्रोटीज) शेष प्रोटीन एनएसपी 5-16 को तोड़ता है। इम्यून मॉड्यूलेशन ड्यूबिक्विटिनेशन सार्स-कोव पीएलप्रो के लिए एक ड्यूबिक्विटिनेस (डीयूबी) गतिविधि की भविष्यवाणी मानव जीनोम में एन्कोडेड सिस्टीन प्रोटीज डीयूबी के समूह में से एक, यूबिक्विटिन-विशिष्ट प्रोटीज 18 की संरचनात्मक तुलना द्वारा की गई थी। इस भविष्यवाणी की पुष्टि बाद में सार्स-कोव-2 सहित कई कोरोनावायरस और आर्टरीवायरस पीएलपी डोमेन के लिए इन विट्रो प्रयोगों द्वारा की गई थी। डी. आई. एस. गाइलेशन आई. एस. जी. 15 एक छोटा यूबीक्विटिन जैसा प्रोटीन है जिसे यूबीक्विटिन के समान तरीके से अनुवाद के बाद के संशोधन के रूप में अन्य प्रोटीनों के साथ संयुग्मित किया जा सकता है। ड्यूबिक्विटिनेटिंग गतिविधि के अलावा, कोरोनावायरस और आर्टरिवायरस पी. एल. पी. डोमेन की पहचान डी. आई. एस. जी. लाइलेज एंजाइम के रूप में की गई है, जो सेलुलर प्रोटीन से आई. एस. जी. 15 को हटाने में सक्षम हैं। सार्स-कोव-2 पीएलप्रो के इन विट्रो अध्ययन यूबीक्विटिन की तुलना में आई. एस. जी. के लिए उच्च आत्मीयता का सुझाव देते हैं। संदर्भ वायरल प्रोटीन की रक्षा करते हैं