Domain of unknown function
एक डोमेन ऑफ अननोन फंक्शन (डी. यू. एफ.) एक प्रोटीन डोमेन है जिसका कोई विशिष्ट कार्य नहीं है। इन परिवारों को पी. एफ. ए. एम. डेटाबेस में उपसर्ग डी. यू. एफ. के बाद एक संख्या का उपयोग करके एकत्र किया गया है, जिसके उदाहरण डी. यू. एफ. 2992 और डी. यू. एफ. 1220 हैं। 2019 तक, पी. एफ. ए. एम. डेटाबेस के भीतर लगभग 4,000 डी. यू. एफ. परिवार हैं जो 22 प्रतिशत से अधिक ज्ञात परिवारों का प्रतिनिधित्व करते हैं। कुछ डीयूएफ को लोकप्रिय उपयोग के कारण नामकरण का उपयोग करके नाम नहीं दिया गया है, लेकिन फिर भी डीयूएफ हैं। डीयूएफ पदनाम अस्थायी है, और ऐसे परिवारों को एक कार्य की पहचान के बाद एक अधिक विशिष्ट नाम (या एक मौजूदा डोमेन में विलय) में बदल दिया जाता है। डीयूएफ नामकरण योजना क्रिस पोंटिंग द्वारा स्मार्ट डेटाबेस में डीयूएफ1 और डीयूएफ2 को जोड़ने के माध्यम से शुरू की गई थी। ये दोनों क्षेत्र बैक्टीरियल सिग्नलिंग प्रोटीन में व्यापक रूप से वितरित पाए गए। इसके बाद, इन डोमेन के कार्यों की पहचान की गई और उनका नाम बदलकर क्रमशः जी. जी. डी. ई. एफ. डोमेन और ई. ए. एल. डोमेन कर दिया गया। संरचनात्मक जीनोमिक्स कार्यक्रमों ने संरचना निर्धारण के माध्यम से डीयूएफ के कार्य को समझने का प्रयास किया है। 250 से अधिक डीयूएफ परिवारों की संरचनाओं को हल किया गया है। इस (2009) काम से पता चला कि लगभग दो तिहाई डीयूएफ परिवारों की संरचना पहले हल किए गए परिवार के समान थी और इसलिए मौजूदा प्रोटीन सुपर फैमिली के अलग-अलग सदस्य होने की संभावना थी, जबकि लगभग एक तिहाई में एक नया प्रोटीन तह था। कुछ डी. यू. एफ. परिवार दूरस्थ अनुक्रम समरूपता को उन क्षेत्रों के साथ साझा करते हैं जिनमें कार्य की विशेषता होती है। कम्प्यूटेशनल कार्य का उपयोग इन संबंधों को जोड़ने के लिए किया जा सकता है। 2015 का एक कार्य विशिष्ट संरचनात्मक सुपर फैमिली को 20 प्रतिशत डी. यू. एफ. निर्धारित करने में सक्षम था। पी. एफ. ए. एम. लगातार "कबीले" सुपरफ़ैमिली प्रविष्टियों में (हाथ से सत्यापित) कार्य भी करता है। आवृत्ति और संरक्षण 2013 में सभी प्रोटीन डोमेन के 20 प्रतिशत से अधिक को डी. यू. एफ. के रूप में चिह्नित किया गया था। यूकेरियोट्स में 1,500 से अधिक की तुलना में बैक्टीरिया में लगभग 2,700 डीयूएफ पाए जाते हैं। 800 से अधिक डीयूएफ बैक्टीरिया और यूकेरियोट्स के बीच साझा किए जाते हैं, और इनमें से लगभग 300 आर्किया में भी मौजूद होते हैं। कुल 2,786 जीवाणु पी. एफ. ए. एम. क्षेत्र जानवरों में भी पाए जाते हैं, जिनमें 320 डी. यू. एफ. शामिल हैं। जीव विज्ञान में भूमिका कई डीयूएफ अत्यधिक संरक्षित हैं, जो जीव विज्ञान में एक महत्वपूर्ण भूमिका का संकेत देते हैं। हालाँकि, ऐसे कई डी. यू. एफ. आवश्यक नहीं हैं, इसलिए उनकी जैविक भूमिका अक्सर अज्ञात रहती है। उदाहरण के लिए, DUF143 अधिकांश बैक्टीरिया और यूकेरियोटिक जीनोम में मौजूद होता है। हालाँकि, जब इसे एस्चेरिचिया कोलाई में हटा दिया गया था तो कोई स्पष्ट फेनोटाइप का पता नहीं चला था। बाद में यह दिखाया गया कि जिन प्रोटीनों में DUF143 होता है, वे राइबोसोमल साइलेन्सिंग कारक हैं जो दो राइबोसोमल उप-इकाइयों की असेंबली को अवरुद्ध करते हैं। हालांकि यह कार्य आवश्यक नहीं है, यह प्रोटीन जैव संश्लेषण को बंद करके कोशिकाओं को कम पोषक तत्वों की स्थिति के अनुकूल होने में मदद करता है। नतीजतन, ये प्रोटीन और डीयूएफ केवल तभी प्रासंगिक हो जाते हैं जब कोशिकाएं भूख से मर जाती हैं। इस प्रकार यह माना जाता है कि कई डी. यू. एफ. (या अज्ञात कार्य के प्रोटीन, पी. यू. एफ.) केवल कुछ स्थितियों में आवश्यक होते हैं। आवश्यक डी. यू. एफ. गुडएकर आदि। 355 आवश्यक प्रोटीन (16 मॉडल जीवाणु प्रजातियों में) में 238 डीयूएफ की पहचान की गई, जिनमें से अधिकांश एकल-क्षेत्र प्रोटीन का प्रतिनिधित्व करते हैं, जो स्पष्ट रूप से डीयूएफ की जैविक अनिवार्यता को स्थापित करते हैं। इन डीयूएफ को "आवश्यक डीयूएफ" या ईडीयूएफ कहा जाता है। बाहरी लिंक डी अक्षर से शुरू होने वाले पी. एफ. ए. एम. परिवारों की सूची, जिसमें डी. यू. एफ. परिवार संदर्भ प्रोटीन डोमेन शामिल हैं