Glutamine riboswitch
ग्लूटामाइन राइबोस्विच (पूर्व में जी. एल. एन. ए. आर. एन. ए. मोटिफ) एक संरक्षित आर. एन. ए. संरचना है जिसकी भविष्यवाणी जैव सूचना विज्ञान द्वारा की गई थी। यह साइनोबैक्टीरिया के विभिन्न वंशों में मौजूद है, साथ ही कुछ फेज जो साइनोबैक्टीरिया को संक्रमित करते हैं। यह समुद्र में रहने वाले असिंचित बैक्टीरिया से निकाले गए डीएनए में भी पाया जाता है जो संभवतः साइनोबैक्टीरिया की प्रजातियां हैं। जी. एल. एन. ए. आर. एन. ए. नाइट्रोजन चयापचय में शामिल प्रोटीन के कई वर्गों को कूटबद्ध करने वाले जीन के अनुमानित 5 'अनुवादित क्षेत्रों में पाए जाते हैं। इन प्रोटीन वर्गों में से सबसे प्रमुख अमोनियम ट्रांसपोर्टर, एंजाइम ग्लूटामाइन सिंथेटेज और ग्लूटामेट सिंथेज और पी. आई. आई. प्रोटीन हैं, जो स्वयं नाइट्रोजन चयापचय को नियंत्रित करते हैं। नाइट्रोजन चयापचय के नियंत्रण में एक सीआईएस-नियामक तत्व के रूप में एक संभावित भूमिका का समर्थन करते हुए, पीएमटी1479 के रूप में डिज़ाइन किया गया प्रोक्लोरोकोकस मैरिनस जीन इस जीव में एक अन्य जीन की तुलना में अधिक दबा हुआ था जब यह नाइट्रोजन की पर्याप्त आपूर्ति के बिना बढ़ रहा था। यह प्रदर्शित किया गया कि जी. एल. एन. ए. आर. एन. ए. ग्लूटामाइन-बाइंडिंग राइबोस्विच के अनुरूप हैं, यानी वे समग्र नाइट्रोजन उपलब्धता को मापने के लिए ग्लूटामाइन सांद्रता को महसूस करते हैं, और डाउनस्ट्रीम जीन को उचित रूप से नियंत्रित करते हैं। राइबोस्विच फ़ंक्शन का मूल प्रस्ताव उपरोक्त साक्ष्य पर आधारित था कि जी. एल. एन. ए. आर. एन. ए. सी. आई. एस.-नियामक हैं, साथ ही जी. एल. एन. ए. आर. एन. ए. मोटिफ के तीन-स्टेम जंक्शन में मध्यम संरचनात्मक जटिलता जो अन्य ज्ञात राइबोस्विच की संरचनाओं के साथ तुलनीय है। कुछ जी. एल. एन. ए. आर. एन. ए. अन्य जी. एल. एन. ए. आर. एन. ए. के निकट स्थित होते हैं। ये "टेंडम व्यवस्थाएँ" ग्लाइसिन राइबोस्विच और टी. पी. पी. राइबोस्विच द्वारा भी प्रदर्शित की जाती हैं जहाँ वे राइबोस्विच लिगैंड की सांद्रता के एक छोटे से परिवर्तन के भीतर कोशिका को जीन को बंद या चालू करने की अनुमति देते हैं। दूसरे शब्दों में, राइबोस्विच की प्रतिक्रिया वक्र एक डिजिटल कार्य से बेहतर मिलती-जुलती है। हालांकि, इस तरह के सहकारी बंधन का पालन नहीं किया गया था। इन विवो साक्ष्य में पहला कि आर. एन. ए. ग्लूटामाइन राइबोस्विच के रूप में कार्य करते हैं, से पता चला है कि ये राइबोस्विच सिनेकोसिस्टिस एसपी में ग्लूटामाइन सिंथेटेज अवरोधक प्रोटीन आई. एफ. 17 की अभिव्यक्ति को नियंत्रित करते हैं। पी. सी. सी. 6803 इस प्रकार साइनोबैक्टीरिया में जी. एस. गतिविधि के लिए एक महत्वपूर्ण नियंत्रण तत्व का प्रतिनिधित्व करता है। जी. एल. एन. ए. आर. एन. ए. रूपांकन और डाउनस्ट्रीम-पेप्टाइड रूपांकन के बीच एक संभावित संरचनात्मक समानता देखी गई। सबसे स्पष्ट समानता प्रत्येक रूपांकन में "पी1" लेबल वाले तनों के बीच है, लेकिन अन्य समानताएं देखी गईं। यह प्रस्तावित किया गया था कि दोनों रूपांकनों नाइट्रोजन चयापचय में शामिल राइबोस्विच का प्रतिनिधित्व करते हैं। यह तथ्य कि दोनों रूपांकनों से आर. एन. ए. चुनिंदा रूप से ग्लूटामाइन को बांधते हैं, इस परिकल्पना का समर्थन करते हैं, लेकिन विस्तृत संरचनात्मक डेटा अभी तक उपलब्ध नहीं है। जी. एल. एन. ए. मोटिफ में एक ई-लूप संरचना होती है (जिसे उभरा हुआ-जी मॉड्यूल भी कहा जाता है)। संदर्भ बाहरी लिंक सिस-नियामक आर. एन. ए. तत्व राइबोस्विच