Yeastract
YEASTRACT (યીસ્ટ સર્ચ ફોર ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ રેગ્યુલેટર્સ એન્ડ કન્સેન્સસ ટ્રેકિંગ) એ 1200 થી વધુ ગ્રંથસૂચિ સંદર્ભો પર આધારિત, સેક્રોમાયસીસ સેરેવિસિયામાં ટ્રાન્સક્રિપ્શન પરિબળો (TF) અને લક્ષ્ય જનીનો વચ્ચેના 48000 થી વધુ નિયમનકારી સંગઠનોની ક્યુરેટેડ રીપોઝીટરી છે. તેમાં સોથી વધુ લાક્ષણિકતા ધરાવતા ટીએફ માટે આશરે 300 ચોક્કસ ડીએનએ બંધનકર્તા સ્થળોનું વર્ણન પણ સામેલ છે. દરેક યીસ્ટ જનીન વિશે વધુ માહિતી Saccharomyces જીનોમ ડેટાબેઝ (SGD) માંથી કાઢવામાં આવી છે. દરેક જનીન માટે સંકળાયેલ જનીન ઓન્ટોલોજી (જી. ઓ.) શરતો અને જી. ઓ. માં તેમની પદાનુક્રમ જી. ઓ. સંઘમાંથી મેળવવામાં આવી હતી. હાલમાં, YEASTRACT ગોથી 7100 થી વધુ શરતો જાળવે છે. યીસ્ટ જનીનો માટે પ્રવર્તક અને કોડિંગ પ્રદેશોના ન્યુક્લિયોટાઇડ સિક્વન્સ રેગ્યુલેટરી સિક્વન્સ એનાલિસિસ ટૂલ્સ (આરએસએટી) માંથી મેળવવામાં આવ્યા હતા. YEASTRACT માંની તમામ માહિતી SGD, GO કોન્સોર્ટિયમ, RSA ટૂલ્સ અને યીસ્ટ રેગ્યુલેટરી નેટવર્ક પરના તાજેતરના સાહિત્યના નવીનતમ ડેટાને મેચ કરવા માટે નિયમિતપણે અપડેટ કરવામાં આવે છે. YEASTRACT માં ડિસ્કવરરનો સમાવેશ થાય છે, જે સાધનોનો સમૂહ છે જેનો ઉપયોગ સહ-નિયંત્રિત જનીનોના પ્રવર્તક પ્રદેશોમાં વધુ પ્રતિનિધિત્વ ધરાવતા જોવા મળતા જટિલ રૂપાંકનોને ઓળખવા માટે થઈ શકે છે. ડિસ્કવરર એ એમયુએસએ અલ્ગોરિધમ પર આધારિત છે. આ અલ્ગોરિધમ્સ જનીનોની સૂચિને ઇનપુટ તરીકે લે છે અને વધુ પડતી રજૂ થયેલી રચનાઓને ઓળખે છે, જેની સરખામણી YEASTRACT ડેટાબેઝમાં વર્ણવેલ ટ્રાન્સક્રિપ્શન ફેક્ટર બંધનકર્તા સાઇટ્સ સાથે કરી શકાય છે. ટ્યુટોરિયલમાં ઉદાહરણ તરીકે સંખ્યાબંધ જૈવિક પ્રશ્નો હલ કરતી વખતે એકત્રિત કરેલા ડેટાના ઉપયોગને સક્ષમ કરવા માટે સુવિધાઓ પણ પૂરી પાડવામાં આવે છે. YEASTRACT આપેલ જનીનના દસ્તાવેજીકૃત અથવા સંભવિત અનુલેખન નિયમનકારોની અને દરેક અનુલેખન પરિબળ માટે દસ્તાવેજીકૃત અથવા સંભવિત નિયમનકારોની ઓળખને મંજૂરી આપે છે. તે સાહિત્યમાં વર્ણવેલ ડીએનએ પ્રણાલીઓ અને અનુલેખન પરિબળ બંધનકર્તા સ્થળો વચ્ચેની સરખામણીને પણ શક્ય બનાવે છે. આ પ્રણાલી જાણીતા અનુલેખન પરિબળો સાથેના તેમના નિયમનકારી જોડાણોના આધારે જનીનોની સૂચિને જૂથબદ્ધ કરવા માટે એક ઉપયોગી પદ્ધતિ પણ પ્રદાન કરે છે (દાખલા તરીકે માઇક્રોએરે વિશ્લેષણ દ્વારા જાહેર કરાયેલ સમાન અભિવ્યક્તિ રૂપરેખાઓ સાથે જનીનોનો સમૂહ). YEASTRACT એકત્રિત કરેલા ડેટામાંથી મહત્વપૂર્ણ જૈવિક માહિતી શોધવા અને પુનઃપ્રાપ્ત કરવા અને જનીન-દર-જનીન વિશ્લેષણ અથવા વૈશ્વિક અભિગમોમાંથી બહાર આવતા ડેટામાંથી યીસ્ટમાં ટ્રાન્સક્રિપ્શન રેગ્યુલેશન નેટવર્કની આગાહી કરવા માટે પ્રશ્નોનો સમૂહ પ્રદાન કરે છે. અનુલેખન પરિબળો પણ જુઓ સંદર્ભો બાહ્ય કડીઓ http://www.yeastract.com જૈવિક ડેટાબેસેસ Saccharomycetes જનીન અભિવ્યક્તિ અનુલેખન પરિબળો