ArrayTrack
એરે ટ્રેક એ બહુહેતુક બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ સાધન છે જેનો ઉપયોગ મુખ્યત્વે માઇક્રોએરે ડેટા મેનેજમેન્ટ, વિશ્લેષણ અને અર્થઘટન માટે થાય છે. એરે ટ્રેક 2001 માં યુ. એસ. ફૂડ એન્ડ ડ્રગ એડમિનિસ્ટ્રેશન માટે ઇન-હાઉસ ફિલ્ટર એરે સંશોધનને ટેકો આપવા માટે વિકસાવવામાં આવ્યું હતું, અને 2003 માં માઇક્રોએરે માટે સંકલિત સંશોધન સાધન તરીકે જાહેર જનતા માટે મુક્તપણે ઉપલબ્ધ કરાવવામાં આવ્યું હતું. ત્યારથી, એરેટ્રેક દર વર્ષે સરેરાશ 5,000 વપરાશકર્તાઓ ધરાવે છે. તે નેશનલ સેન્ટર ફોર ટોક્સિકોલોજિકલ રિસર્ચ દ્વારા નિયમિતપણે અપડેટ કરવામાં આવે છે. લક્ષણો એરેટ્રેક ત્રણ મુખ્ય ઘટકોથી બનેલું છેઃ અભ્યાસ ડેટાબેઝ, સાધનો અને પુસ્તકાલયો, જે મુખ્યત્વે અનુક્રમે માહિતી વ્યવસ્થાપન, વિશ્લેષણ અને અર્થઘટનનું સંચાલન કરે છે. આમાંના દરેક ઘટકોને અન્ય બે ઘટકોમાંથી સીધા જ મેળવી શકાય છે, દા. ત., વિશ્લેષણ સાધનોનો ઉપયોગ અભ્યાસ ડેટાબેઝમાં સંગ્રહિત પ્રાયોગિક ડેટા પર સીધો થઈ શકે છે, અને પરિણામોમાંથી મળી આવેલા નોંધપાત્ર જનીનોને પુસ્તકાલયોમાં વધારાની ટિપ્પણીઓ અને સંકળાયેલ પ્રોટીન, માર્ગો, જનીન ઓન્ટોલોજી શરતો વગેરે જોવા માટે પૂછી શકાય છે. અભ્યાસ ડેટાબેઝઃ અભ્યાસ ડેટાબેઝમાં વપરાશકર્તા દ્વારા આયાત કરાયેલ પ્રયોગ ડેટા છે, જેમાં કાચા ડેટા અને એનોટેશન ડેટા બંનેનો સમાવેશ થાય છે. તેનો ઉપયોગ મુખ્યત્વે માઇક્રોએરે ડેટાનું સંચાલન કરવા માટે થાય છે, પરંતુ તે પ્રોટિઓમિક્સ અને મેટાબોલોમિક્સ ડેટાને પણ ટેકો આપે છે. આયાત કરેલો ડેટા શરૂઆતમાં માલિક માટે ખાનગી હોય છે પરંતુ અન્ય વપરાશકર્તાઓ માટે ઉપલબ્ધ કરાવી શકાય છે. અભ્યાસ ડેટાબેઝ નોંધપાત્ર જનીન યાદીઓ પણ સંગ્રહિત કરે છે, જે એરેટ્રેકમાં ડેટા વિશ્લેષણ પરિણામોમાંથી સીધા જ બનાવી શકાય છે. સાધનોઃ એરે ટ્રેકમાં વિવિધ પ્રકારના વિશ્લેષણ અને વિઝ્યુલાઇઝેશન સાધનો ઉપલબ્ધ છે, જેમાં નીચેનાનો સમાવેશ થાય છે પરંતુ તે મર્યાદિત નથીઃ ટી-ટેસ્ટ, એનોવા અને એસએએમ-ટેસ્ટ સહિત આંકડાકીય વિશ્લેષણ સાધનો; શ્રેણીબદ્ધ ક્લસ્ટરિંગ વિશ્લેષણ અને મુખ્ય ઘટક વિશ્લેષણ સહિત અનસુપરવાઇઝ્ડ પેટર્ન ડિસ્કવરી ટૂલ્સ; અને કે-નજીકના પડોશીઓ અને રેખીય ભેદભાવપૂર્ણ વિશ્લેષણ સહિત મોડેલ આગાહી સાધનો. જો કે એરેટ્રેકના સાધનો આયાત કરેલા ડેટાને સમાવવા માટે રચાયેલ છે, તેઓ બાહ્ય ડેટા સાથે પણ સુસંગત છે. પુસ્તકાલયોઃ એરેટ્રેક પુસ્તકાલયોના સંગ્રહને હોસ્ટ કરે છે જે ચોક્કસ એનોટેશન ડેટાને સંગ્રહિત કરે છે, જે ગતિશીલ સ્પ્રેડશીટ ફોર્મેટમાં જોઈ શકાય છે. જનીનો, પ્રોટીન, માર્ગો, જનીન ઓન્ટોલોજી શરતો, રાસાયણિક સંયોજનો, એસ. એન. પી., ક્યુ. ટી. એલ., ચિપ પ્રકારો અને વધુ માટે વિશિષ્ટ પુસ્તકાલય છે. દરેક લાઈબ્રેરી બહુ-ઇનપુટ શોધ, સૉર્ટિંગ, ફિલ્ટરિંગ, કોપી-પેસ્ટિંગ અને નિકાસને ટેકો આપે છે. સંગ્રહિત જનીન યાદીઓ, વિશ્લેષણ પરિણામો અને અન્ય પુસ્તકાલયોની ઇચ્છિત સામગ્રી માટે પુસ્તકાલયોની સીધી પૂછપરછ કરી શકાય છે. કોઈપણ પુસ્તકાલયમાં ચોક્કસ પ્રવેશને માહિતીના મૂળ સ્રોતો સહિત ઘણા લોકપ્રિય જાહેર જ્ઞાન પાયાઓમાં સમકક્ષ પ્રવેશ સાથે જોડી શકાય છે. એરેટ્રેક અન્ય વિવિધ બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ સોફ્ટવેર સાથે સીધા સંકલિત છે, જેમ કે પાથવે એનાલિસિસ ટૂલ્સ જેનેગો મેટાકોર અને ઇન્જેનિટી પાથવે એનાલિસિસ. સુલભતા એરે ટ્રેક જાહેર જનતા માટે મુક્તપણે ઉપલબ્ધ છે અને તેને ઑનલાઇન એક્સેસ કરી શકાય છે. તે ક્લાયન્ટના કમ્પ્યુટર પર જાવા-આધારિત ઇન્ટરફેસનો ઉપયોગ કરીને ચલાવવામાં આવે છે જે એફડીએ દ્વારા હોસ્ટ કરેલા ઓરેકલ ડેટાબેઝ સાથે જોડાય છે. જાવા-આધારિત એપ્લિકેશન તરીકે, એરેટ્રેક વિન્ડોઝ, મેક અને લિનક્સ મશીનો સાથે સુસંગત છે. સંદર્ભો બાહ્ય કડીઓ એરે ટ્રેક મુખ્ય પાનું બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ સોફ્ટવેર માઇક્રોએરેઝ