MatrixDB
મેટ્રિક્સડીબી એ એક જૈવિક ડેટાબેઝ છે જે બાહ્યકોષીય પ્રોટીન અને પોલિસેકરાઇડ્સ વચ્ચે પરમાણુ ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ પર કેન્દ્રિત છે. મેટ્રિક્સડીબી બાહ્યકોષીય પ્રોટીનની બહુવિધ પ્રકૃતિને ધ્યાનમાં લે છે (ઉદાહરણ તરીકે, કોલેજન, લેમિનિન અને થ્રોમ્બોસ્પોન્ડિન્સ બહુવિધ છે). આ ડેટાબેઝ શરૂઆતમાં 2009માં બહાર પાડવામાં આવ્યો હતો અને તેની જાળવણી યુ. એમ. આર. 5246, ક્લાઉડ બર્નાર્ડ યુનિવર્સિટી લિયોન 1 ખાતે સિલ્વી રિકાર્ડ-બ્લમના સંશોધન જૂથ દ્વારા કરવામાં આવે છે. મેટ્રિક્સડીબી યુનિજીન અને હ્યુમન પ્રોટીન એટલાસ સાથે જોડાયેલ છે. તે વપરાશકર્તાઓને કસ્ટમાઇઝ્ડ પેશી-અને રોગ-વિશિષ્ટ ક્રિયાપ્રતિક્રિયા નેટવર્ક બનાવવાની પણ મંજૂરી આપે છે, જેનું સાયટોસ્કેપ અથવા મેડુસાનો ઉપયોગ કરીને વધુ વિશ્લેષણ અને કલ્પના કરી શકાય છે. મેટ્રિક્સડીબી ઇન્ટરનેશનલ મોલેક્યુલર એક્સચેન્જ કન્સોર્ટિયમ (આઇએમઇક્સ) નું સક્રિય સભ્ય છે, જે ઇન્ટરેક્શન ડેટાના મુખ્ય જાહેર પ્રદાતાઓનું જૂથ છે. અન્ય સહભાગી ડેટાબેઝમાં બાયોમોલેક્યુલર ઇન્ટરેક્શન નેટવર્ક ડેટાબેઝ (બીઆઇએનડી), ઇન્ટએક્ટ, મોલેક્યુલર ઇન્ટરેક્શન ડેટાબેઝ (એમઆઇએનટી), એમઆઇપીએસ, એમપીએક્ટ અને બાયોગ્રીડનો સમાવેશ થાય છે. આઈ. એમ. ઈ. એક્સ. ના ડેટાબેઝ પ્રયાસોના પુનરાવર્તનને રોકવા, બિન-ઓવરલેપિંગ સ્રોતોમાંથી ડેટા એકત્રિત કરવા અને ક્યુરેટેડ ક્રિયાપ્રતિક્રિયા ડેટાને શેર કરવા માટે સાથે મળીને કામ કરે છે. આઇએમએક્સ કન્સોર્ટિયમે એચયુપીઓ-પી. એસ. આઈ.-એમ. આઈ. એક્સ. એમ. એલ. સ્ટાન્ડર્ડ ફોર્મેટ વિકસાવવા માટે પણ કામ કર્યું હતું, જે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા ડેટાની ટિપ્પણી અને વિનિમય માટે હતું. મેટ્રિક્સડીબીમાં મેન્યુઅલ ક્યુરેશન દ્વારા સાહિત્યમાંથી કાઢવામાં આવેલી ક્રિયાપ્રતિક્રિયા માહિતીનો સમાવેશ થાય છે અને તે પી. એસ. આઈ. સી. ક્યુ. યુ. આઈ. સી. વેબ સર્વિસ દ્વારા આઈ. એમ. ઈ. એક્સ. ભાગીદાર ડેટાબેઝ દ્વારા પૂરા પાડવામાં આવેલ બાહ્યકોષીય પ્રોટીન સાથે સંબંધિત માહિતી તેમજ માનવ પ્રોટીન સંદર્ભ ડેટાબેઝમાંથી માહિતીની પહોંચ પ્રદાન કરે છે. સંદર્ભો બાહ્ય કડીઓ http://matrixdb.univ-lyon1.fr http://www.icbms.fr/aspe જૈવિક ડેટાબેસેસ પોલિસેકરાઇડ્સ