Autophagy database
ઓટોફેગી ડેટાબેઝ (ઓ) નો ઉદ્દેશ ઓટોફેગી-સંબંધિત જનીનો અને પ્રોટીનની વ્યાપક સૂચિ પ્રદાન કરવાનો છે, પછી ભલે તે અન્ય, સંભવિત રીતે સંબંધિત, પ્રોટીનના ઓર્થોલોગ્સ અથવા હોમોલોગ્સ તરીકે ઓળખાય. શ્રેણીઓ, કાર્યો અને 3D માળખાઓ સહિત ઘણી પ્રકારની માહિતી સંગ્રહિત કરી શકાય છે, આમ તેમને શોધી શકાય તેવા સ્વરૂપમાં સુલભ બનાવે છે. એક જ સ્રોતમાં ઉપલબ્ધ માહિતી, શોધી શકાય તેવા સ્વરૂપનો ઉપયોગ કરીને, ભવિષ્યના સંશોધકો માટે કામ સરળ બનાવશે. આ સ્રોતો પછી વપરાશકર્તા રેટિંગ્સ, માહિતીપ્રદ સમીક્ષાઓની સૂચિ અને મૂળ વિશ્લેષણના પરિણામો જેવી શ્રેણીઓ સાથે ઓટોફેગી પર તાજેતરમાં પ્રકાશિત થયેલા સંદર્ભો પ્રદાન કરીને આ લક્ષ્યને પૂર્ણ કરવામાં મદદ કરશે. ઓટોફેગી હૃદય, યકૃત અને કિડની જેવા ઘણા માનવીય રોગોમાં ભૂમિકા ભજવી શકે છે, તેથી તેની પદ્ધતિઓને વધુ સમજવી જરૂરી છે. કેટલાક ડેટાબેઝ સાથે સંશોધન પ્રક્રિયાને સરળ બનાવવી એ પછી વૈજ્ઞાનિક વરદાન પૂરું પાડશે. ઓટોફેગી [સંપૂર્ણ પૃષ્ઠભૂમિ માટે, કૃપા કરીને ઓટોફેગીનો સંદર્ભ લો]. ઓટોફેગી એ એવી પ્રક્રિયા છે જેના દ્વારા જીવતંત્રના કોષો બિન-કાર્યાત્મક અથવા બિનજરૂરી સ્વ-ઘટકોનો નાશ કરે છે. ખાસ કરીને, ઓટોફેગી એ એક અપચય પ્રક્રિયા છે જેમાં લાઇસોસોમલ મશીનરી દ્વારા કોષના પોતાના ઘટકોના અધઃપતનનો સમાવેશ થાય છે. ઓટોફેગી ભૂખમરો અને સંભવિત જોખમી સેલ્યુલર સામગ્રીને દૂર કરવાના ઉદાહરણો માટે પણ નિર્ણાયક છે, જે જીવન જાળવવા માટે તેની જરૂરિયાત સૂચવે છે. સંલગ્ન આકૃતિ ઓટોફેગીમાં જોવા મળે છે તેમ, સેલ્યુલર ઉત્પાદનો કોષના ઉપયોગ માટે નવી સામગ્રીનું ઉત્પાદન કરવા માટે લાઇસોસોમ જેવા વિનાશક સેલ્યુલર ઘટકો દ્વારા અધોગતિ પામે છે. ઓટોફેગી અને તેની સંબંધિત પ્રક્રિયાઓમાં સંશોધન તાજેતરના વર્ષોમાં વિસ્ફોટ થયું છે, જો કે, આમાંની ઘણી પ્રક્રિયાઓ સંપૂર્ણપણે સમજી શકાઇ નથી અને આમાંના ઘણા પ્રોટીન માટે વિવિધ પ્રજાતિઓમાં સમરૂપતા મળી નથી. સેંકડો ઓટોફેગી-સંબંધિત જનીનો અને પ્રોટીન દ્વારા પુરાવા તરીકે આ ક્ષેત્રમાં નાટકીય પ્રગતિ હોવા છતાં તેની પરમાણુ પદ્ધતિઓ સંપૂર્ણપણે સ્પષ્ટ કરવામાં આવી નથી. જેમ કે, માનવ ઓટોફેગી પ્રોટીન અને ઘટકો અને/અથવા તેમના હોમોલોગ્સ, તેમજ અન્ય પ્રજાતિઓમાં ઓર્થોલોગ્સને લાક્ષણિકતા આપવા માટે ડેટાબેઝની જરૂરિયાત દર્શાવવામાં આવી હતી. ઓટોફેગી ડેટાબેઝ ઓટોફેગી ડેટાબેઝ એ નેશનલ ઇન્સ્ટિટ્યૂટ ઓફ જિનેટિક્સ (એન. આઈ. જી.) એન. આઈ. જી. નું ઉત્પાદન છે, જેની સ્થાપના જૂન 1949માં શિક્ષણ, વિજ્ઞાન, રમતગમત અને સંસ્કૃતિ મંત્રાલય દ્વારા કરવામાં આવી હતી, જેમાં પ્રો. કાન ઓગુમાને પ્રથમ નિયામક તરીકે ચૂંટવામાં આવ્યા હતા. સમય જતાં, આનુવંશિકતા, જીનોમિક્સ, ડીએનએ સંશોધન અને, ખાસ કરીને અમારા હેતુઓ માટે, ડીએનએ ડેટા બેંક જેવા વિવિધ કાર્યક્રમો માટે ઘણા વિભાગો ઉમેરવામાં આવ્યા છે. એન. આઈ. જી. એ જાપાનીઝ રિસર્ચ ઓર્ગેનાઈઝેશન ઓફ ઇન્ફર્મેશન એન્ડ સિસ્ટમ્સનો એક વિભાગ છે, અને હાલમાં તે તેના નવમા નિયામકની દેખરેખ હેઠળ છે. એન. આઈ. જી. નો ઉદ્દેશ માહિતીને સુવ્યવસ્થિત કરવા તેમજ સંશોધનમાંથી સામાજિક ઉપયોગમાં માહિતીનો પ્રસાર કરવા માટે ઉચ્ચ-સ્તરનું સંશોધન કરવાનો છે. આ હેતુ માટે આ સંસ્થા દ્વારા બનાવવામાં આવેલું સાધન ઓટોફેગી ડેટાબેઝ છે. ઓટોફેગી ડેટાબેઝ એ ઓટોફેગીમાં સામેલ પ્રોટીનનો ડેટાબેઝ છે. ઓટોફેગી ડેટાબેઝ તમામ સંબંધિત માહિતી એકત્રિત કરવા, તેને ગોઠવવા અને તેને જાહેરમાં ઉપલબ્ધ કરાવવાનો ઇરાદો ધરાવે છે જેથી તેના વપરાશકર્તાઓ સરળતાથી અદ્યતન જ્ઞાન મેળવી શકે. ખાસ કરીને, ઓટોફેગી ડેટાબેઝ ઓટોફેગીમાં રસ, સંશોધન અને અન્યથા ધરાવતા લોકો માટે "ફ્રી-ફોર-ઓલ" ટૂલ પ્રદાન કરે છે. આ ઉદ્દેશને વધુ સારી રીતે પૂર્ણ કરવા માટે, એન. આઈ. જી. માંથી ઉપલબ્ધ ઓટોફેગી ડેટાબેઝ ડેટાબેઝના વપરાશકર્તાઓને માહિતીનો પ્રસાર કરવા અને શેર કરવા માટે કહે છે, જેથી ઓટોફેગી-સંબંધિત ડેટા જેની જરૂર હોય તે બધા માટે મફતમાં ઉપલબ્ધ થઈ શકે. રસ ધરાવતા સંશોધન સમુદાય માટે, સંશોધન પ્રસારનું આ મોડેલ આશાસ્પદ છે. અત્યાર સુધીમાં, આ ડેટાબેઝમાં 582 સમીક્ષા કરાયેલ પ્રોટીન ઉપલબ્ધ હતા. હોમોલોજેન, એન. સી. બી. આઈ. માં ઉપલબ્ધ ઓટોફેગિક પ્રોટીન સહિત, કુલ 52,000થી વધુ પ્રોટીન છે. ઓટોફેગી ડેટાબેઝ નવા અને જૂના ઓટોફેગી-સંબંધિત પ્રોટીન શોધવા માટે 41 જુદી જુદી પ્રજાતિઓ વચ્ચે હોમોલોગસ પ્રોટીનની સરખામણી પ્રદાન કરે છે, જેથી વર્તમાન ઓટોફેગી સંશોધનને સુવ્યવસ્થિત કરી શકાય. આ ડેટાબેઝ માર્ચ 2010માં જાહેરમાં ઉપલબ્ધ કરાવવામાં આવ્યો હતો અને હાલમાં તેમાં 82 યુકેરીયોટ્સમાં 7,444 જનીનો/પ્રોટીનનો સમાવેશ થાય છે. હ્યુમન ઓટોફેગી ડેટાબેઝ હ્યુમન ઓટોફેગી ડેટાબેઝ લક્ઝમબર્ગ ઇન્સ્ટિટ્યૂટ ઓફ હેલ્થ (LIH) નું ઉત્પાદન છે. LIHની સમગ્ર લક્ઝમબર્ગમાં બાયોમોનિટરિંગ, ચેપ અને રોગપ્રતિકારક શક્તિ, આરોગ્ય વહીવટ, ઓન્કોલોજી, સ્પોર્ટ્સ મેડિસિન અને બાયોબેંક માટે ઘણી શાખાઓ ઉપલબ્ધ છે. આ દરેક વિભાગોનો ઉદ્દેશ એલ. આઈ. એચ. મિશન સ્ટેટમેન્ટને ટેકો આપવાનો છે, જે "આરોગ્ય સંભાળ અને વ્યક્તિગત દવાના ભાવિ પડકારો પર અસર સાથે ક્લિનિકલ એપ્લિકેશન્સમાં સંશોધન જ્ઞાન પેદા કરવા અને અનુવાદિત કરવા" છે. તે સાધનો ઓફર કરે છે. એલ. આઈ. એચ. ની લેબોરેટરી ઓફ એક્સપેરિમેન્ટલ કેન્સર રિસર્ચે આમાંથી એક સાધન સ્થાપિત કરવામાં મદદ કરી, તે સાધન હ્યુમન ઓટોફેગી ડેટાબેઝ તરીકે ઓળખાતું ડેટાબેઝ છે. હ્યુમન ઓટોફેગી ડેટાબેઝ (એચએડીબી) એ અન્ય ઉપલબ્ધ ઓટોફેગી સંસાધન છે. ઓટોફેગી ડેટાબેઝથી વિપરીત, હ્યુમન ઓટોફેગી ડેટાબેઝ માત્ર મનુષ્યમાં જોવા મળતા પ્રોટીનની સરખામણી કરે છે. એચએડીબી એ પ્રથમ માનવ-માત્ર ઓટોફેગી ડેટાબેઝ છે, જ્યાં સંશોધકો પ્રત્યક્ષ અને પરોક્ષ રીતે સંબંધિત ઓટોફેગિક પ્રોટીનની અદ્યતન સૂચિ શોધી શકે છે, ઓટોફેગી સંશોધનમાં વિશાળ વિસ્તરણની ભરપાઈ કરવા માટે અગાઉ કોઈ સુસંગત ડેટાબેઝ ઉપલબ્ધ નથી. એચએડીબી માત્ર રસના જનીન વિશે માહિતી પ્રદાન કરતું નથી, પરંતુ તેનો હેતુ ડેટાબેઝમાં વિકસિત થવાનો પણ છે જેનો ઉપયોગ રસના જનીનનું વિશ્લેષણ કરવા માટે થઈ શકે છે. આ હેતુ માટે, એચ. એ. ડી. બી. ને ઓટોફેગી-સંબંધિત પ્રોટીનની દ્રષ્ટિએ શક્ય તેટલું સંપૂર્ણ બનાવવામાં આવ્યું હતું, જો કે નવા શોધાયેલ પ્રોટીન અને જનીનો વિવિધ વપરાશકર્તાઓ દ્વારા સબમિશન વિભાગમાં રજૂ કરી શકાય છે. હ્યુમન ઓટોફેગી ડેટાબેઝ દ્વારા પૂરી પાડવામાં આવેલી માહિતીનો બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ એપ્લિકેશન્સમાં વધુ ઉપયોગ કરી શકાય છે. બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સમાં ઉપયોગ આ ડેટાબેઝ જૈવિક માહિતીનો મોટો સંગ્રહ છે તે જોતાં, તેનો ઉપયોગ માહિતી સંગ્રહ અને વિશ્લેષણને સરળ બનાવવા માટે બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ એપ્લિકેશન્સમાં થઈ શકે છે. બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ સુધારેલી વૈજ્ઞાનિક શોધોમાં મદદ કરવા માટે મોટા ડેટા સાથે જૈવિક શોધોને જોડવાનું જુએ છે. દરેક ડેટાબેઝનો ઉપયોગ ઓટોફેગિક પ્રોટીન અથવા રસના જનીનનો અભ્યાસ કરવા માટે થઈ શકે છે, જ્યાં આ ડેટાબેઝ વપરાશકર્તા સબમિશન દ્વારા જાળવવામાં આવે છે. દરેક જનીન માટેની માહિતીનો ઉપયોગ એન્ટ્રેઝ, એન્સેમ્બલ અને પબમેડ સુધી પહોંચવા માટે થઈ શકે છે. બ્લાસ્ટ જેવી સાઇટ્સનો ઉપયોગ કરીને અનુક્રમ વિશ્લેષણ માટે પણ ફાસ્ટા ક્રમ ઉપલબ્ધ છે. ઓટોફેગી ડેટાબેઝ અને હ્યુમન ઓટોફેગી ડેટાબેઝ માટે ઉપલબ્ધ ચોક્કસ ઉપયોગો નીચે દર્શાવેલ છે. ઓટોફેગી ડેટાબેઝમાં વિવિધ પ્રજાતિઓમાં ઓટોફેગી-સંબંધિત પ્રોટીન શોધવા માટે ઘણા ઉપલબ્ધ કાર્યો છે. વપરાશકર્તા http://www.tanpaku.org/autophagy/index.html પર ઓટોફેગી ડેટાબેઝને ઍક્સેસ કરી શકે છે. "ADb માટે વિકલ્પો", આ ડેટાબેઝ માટે ઉપલબ્ધ વિવિધ વિકલ્પો દર્શાવે છે. બધા પ્રકાશિત ન થયેલા ટૅબ્સ જનીન શોધ સાથે અસંબંધિત વધારાની માહિતી અને સંપર્ક માહિતી પ્રદાન કરે છે. વપરાશકર્તા ઉલ્લેખ કરી શકે છેઃ પ્રોટીન સૂચિ, પ્રકાશિત પીળો, જ્યાં વપરાશકર્તા જીવતંત્ર પસંદ કરી શકે છે અને અન્ય કાર્યો વચ્ચે સમાનાર્થી શબ્દો, જીન ID અને પ્રોટીન જોડાણ માટે શોધ કરી શકે છે. આ કાર્ય વપરાશકર્તાને રસના જનીનો પર માહિતી કેવી રીતે શોધવી તે અંગે બહુવિધ વિકલ્પો પ્રદાન કરે છે. પ્રોટીન સૂચિ માટે ઓટોફેગી ડેટાબેઝ પર ઉપલબ્ધ વિકલ્પો જમણી બાજુએ આપવામાં આવેલી યોગ્ય પ્રોટીન સૂચિને આપવામાં આવેલા ઉદાહરણમાં જોઈ શકાય છે. સમાનાર્થી શબ્દો જેવા વિવિધ વિકલ્પો પસંદ કરવાથી વપરાશકર્તા ચોક્કસ પ્રશ્નોનો ઉપયોગ કરીને શોધ કરી શકે છે. હોમોલોગ્સ ટેબ હેઠળ હોમોલોગ્સ અને ઓર્થોલોગ્સ વચ્ચે ઓટોફેગી-સંબંધિત પ્રોટીનની મેળ, લીલા રંગમાં પ્રકાશિત. આનો ઉપયોગ જમણી બાજુની છબી, હોમોલોગ્સ અનુસાર થઈ શકે છે, જ્યાં જરૂરી બોક્સ પસંદ કરીને વિવિધ સજીવો અને ટેક્સાની વચ્ચે ઓર્થોલોગ્સ અને હોમોલોગ્સની સરખામણી કરી શકાય છે. ચોક્કસ જનીનો માટે શોધ કરો. આ મુખ્ય શબ્દ શોધનો ઉપયોગ કરીને પૂર્ણ કરી શકાય છે, જે વાદળી રંગમાં પ્રકાશિત થાય છે, અને તેનો ઉપયોગ ચોક્કસ પ્રજાતિ સાથે રસના જાણીતા જનીનને મેચ કરવા માટે પણ થઈ શકે છે. આ સંભવિત ઓર્થોલોગ્સ નક્કી કરવામાં મદદ કરે છે. રસના જનીન માટે હોમોલોગ અને ઓર્થોલોગ. નારંગીમાં પ્રકાશિત થયેલ સમરૂપતા શોધનો ઉપયોગ જાણીતા જનીનની એફ. એ. એસ. ટી. એ. અથવા બિન-ફોર્મેટ કરેલ લખાણ શ્રેણી શોધવા માટે થઈ શકે છે. આ જોડાયેલ ઓટોફેગી-સંબંધિત પ્રોટીન શોધવામાં અથવા હોમોલોગ્સ અથવા ઓર્થોલોગ્સ શોધવામાં મદદ કરી શકે છે. હોમોલોગ્સ અને ઓર્થોલોગ્સની સરખામણી વપરાશકર્તા દ્વારા પ્રજાતિઓની અંદર અથવા વચ્ચે કરી શકાય છે, જે સંબંધિત આકૃતિમાં જોવા મળતા વિવિધ પ્રજાતિઓ અને ટેક્સાના વિકલ્પોને આપવામાં આવે છે. ડેટાબેઝમાં ઉપલબ્ધ એક જનીન અને ઓટોફેગી જનીનો વચ્ચેના જોડાણોનું વિશ્લેષણ કરો. મૂળ વિશ્લેષણ, જે ભૂખરા રંગમાં પ્રકાશિત થયેલ છે, તેનો ઉપયોગ જાણીતા જનીન સાથે સંભવિત ઓટોફેગી-સંબંધિત જનીન મેળ શોધવા માટે થઈ શકે છે. આ કાર્યોનો શ્રેષ્ઠ ઉપયોગ કરવા માટે, વપરાશકર્તાએ તમામ જનીન ફાઇલોને ડાઉનલોડ કરવા માટે "ડાઉનલોડ કરો" ટેબનો સંદર્ભ લેવો જોઈએ, જેથી ઓટોફેગી ડેટાબેઝના કાર્યનો સંપૂર્ણ ઉપયોગ કરી શકાય. હ્યુમન ઓટોફેગી ડેટાબેઝમાં લુક ફોર જીન અને ક્લસ્ટરિંગ માટે ઉપલબ્ધ કાર્યો છે. http://autophagy.lu/index.html ને ઍક્સેસ કરતી વખતે, આ વિકલ્પોને ઍક્સેસ કરી શકાય છે. રસ ધરાવતા પક્ષો ડેટાબેઝમાં નવા માનવ ઓટોફેગી પ્રોટીન પણ સબમિટ કરી શકે છે. વપરાશકર્તા નીચેના વિકલ્પો અનુસાર ડેટાબેઝનો ઉપયોગ કરી શકે છેઃ વપરાશકર્તા લુક ફોર જનીન શ્રેણીમાં નામ દ્વારા જનીન શોધી શકે છે. જનીન તેના જનીન પ્રતીક, એન્સેમ્બલ જોડાણ સંખ્યા, રંગસૂત્ર સ્થાન અથવા સંબંધિત મુખ્ય શબ્દનો ઉપયોગ કરવા માટે શોધી શકાય છે. આ પદ્ધતિનો ઉપયોગ કરીને રસના જનીનને કેવી રીતે ઍક્સેસ કરવું તે માટેની સરળ સૂચનાઓ "જનીન માટે જુઓઃ એચએડીબી" માટે આકૃતિમાં આપવામાં આવી છે. ટૂંકમાં, વપરાશકર્તા વેબસાઇટને ઍક્સેસ કરશે, હાઇલાઇટ કરેલ ટેબ પસંદ કરશે અને સંકળાયેલ છબીમાં આપેલા ઉપલબ્ધ ટેબ્સનો ઉપયોગ કરીને તેમના રસના જનીનની શોધ કરશે. ખાસ કરીને, વપરાશકર્તા તે પસંદ કરશે કે તેઓ સંકળાયેલ કોષ્ટકમાં કયા વિકલ્પનો ઉપયોગ કરવા માંગે છે, અને પછી ઇચ્છિત ટેબ માટે માહિતી ભરો, પછી ભલે તે પ્રતીક અથવા સમાનાર્થી, રંગસૂત્ર, જોડાણ સંખ્યા અથવા મુખ્ય શબ્દ હોય. એકવાર ટેબ પસંદ થઈ જાય પછી, કોઈપણ સંકળાયેલ ઓટોફેગી-સંબંધિત પ્રોટીન નક્કી કરવા માટે માહિતી દાખલ કરી શકાય છે અને શોધી શકાય છે. વપરાશકર્તા ક્લસ્ટરિંગનો પણ ઉલ્લેખ કરી શકે છે જ્યાં જનીનોને મૂળાક્ષર ક્રમમાં જોઈ શકાય છે. આ શોધ કેવી રીતે કરવી તેનો સરળ નકશો "ક્લસ્ટરિંગઃ એચએડીબી" છબીમાં દર્શાવવામાં આવ્યો છે. વપરાશકર્તા પહેલા http://autophagy.lu/index.html નો સંદર્ભ લેશે, જે પછી તેઓ તેમના રસના જનીનને ઍક્સેસ કરવા માટે "ક્લસ્ટરિંગ" છબીમાં હાઇલાઇટ કરેલ ટેબ પસંદ કરશે. પછી વપરાશકર્તા વધુ માહિતી એકત્રિત કરવા માટે મૂળાક્ષરમાં તેમના રસના જનીનને પસંદ કરી શકે છે. જો કે આ ડેટાબેઝમાં માત્ર માનવ ઓટોફેગી જનીનો છે, વપરાશકર્તાએ ઉપયોગ માટે ડેટાબેઝ ડાઉનલોડ કરવાની જરૂર નથી, અને ઓટોફેગીની જટિલ પ્રક્રિયામાં સામેલ જનીનો અને પ્રોટીન શોધી શકે છે. ડેટાબેઝની મર્યાદાઓ દરેક ડેટાબેઝ તેની પોતાની શક્તિ અને નબળાઈઓ પ્રદાન કરે છે. ઓટોફેગી ડેટાબેઝઃ કલ્પનાત્મક રીતે, ઓટોફેગી ડેટાબેઝ વિવિધ પ્રજાતિઓમાં ઓટોફેગી-સંબંધિત પ્રોટીન પર સરળતાથી માહિતી મેળવવાની તક આપે છે. જો કે, આ ડેટાબેઝનો ઉપયોગ કરવામાં કેટલીક સમસ્યાઓ છે. વપરાશકર્તા એડીબી માટે ઉપલબ્ધ ટેબ વિકલ્પોની ભાત અજમાવી શકે છે, જો કે આ વિકલ્પોનો ઉપયોગ ઓટોફેગી ડેટાબેઝમાંથી સામગ્રી ડાઉનલોડ કર્યા વિના કરી શકાતો નથી. જોકે વપરાશકર્તા ડાઉનલોડ ટેબનો ઉપયોગ કરી શકે છે (સફેદ રંગમાં "ADb માટેના વિકલ્પો" માં દેખાય છે), આ U.S.-based વાઇફાઇ સેવાનો ઉપયોગ કરતી વખતે માત્ર ટેક્સ્ટ આઉટપુટ પ્રદાન કરે છે. જેમ કે, વપરાશકર્તા GUI ફોર્મેટમાં ઉપર ઉલ્લેખિત વિવિધ વિકલ્પોને ઍક્સેસ કરી શકતો નથી, પરંતુ તેના બદલે ટેક્સ્ટ આઉટપુટ શોધવું આવશ્યક છે. વપરાશકર્તા ઓટોફેગી ડેટાબેઝ ડાઉનલોડ કરી શકે છે, પરંતુ એપલ ઓએસનો ઉપયોગ કરીને આ ફાઇલોને ઍક્સેસ કરવી મુશ્કેલ હોઈ શકે છે. આ U.S.-based વપરાશકર્તા માટે ઉપયોગમાં સરળતાને જટિલ બનાવે છે, ઓટોફેગી ડેટાબેઝની ઉપયોગિતાને ઘટાડે છે. આ આંતરરાષ્ટ્રીય સ્તરે ઉપલબ્ધ ડેટાબેઝની સંભવિત ગૂંચવણ છે, જે તેના ઉપયોગમાં સરળતાને જટિલ બનાવે છે. માનવ ઓટોફેગી ડેટાબેઝઃ આંતરરાષ્ટ્રીય સ્તરે ઉપલબ્ધ ડેટાબેઝ હોવા છતાં, માનવ ઓટોફેગી ડેટાબેઝ માટે ઉપયોગમાં સરળતામાં નોંધપાત્ર સુધારો થયો છે. તમામ ઉપલબ્ધ વિકલ્પો, મર્યાદિત હોવા છતાં, U.S.-based વાઇફાઇ સેવાનો ઉપયોગ કરીને એક્સેસ કરી શકાય છે. માનવ ઓટોફેગી ડેટાબેઝ ડેટા સંગ્રહ અને વિશ્લેષણ માટે ઉપલબ્ધ વિકલ્પોની શ્રેણીમાં મર્યાદિત છે, કારણ કે ઓટોફેગી ડેટાબેઝ દ્વારા આપવામાં આવતા વિકલ્પો કરતાં ઓછા વિકલ્પો ઉપલબ્ધ છે. ડેટાબેઝ માત્ર માનવ ઓટોફેગી-સંબંધિત જનીનો અને પ્રોટીનનો સંગ્રહ કરે છે, જ્યારે ઓટોફેગી ડેટાબેઝમાં ઓટોફેગી-સંબંધિત જનીનો અને વિવિધ પ્રજાતિઓ માટે ઉપલબ્ધ પ્રોટીનની માહિતી હોય છે. ડેટાબેઝના ફાયદા જોકે દરેક ડેટાબેઝની પોતાની શક્તિ અને નબળાઈઓ હોય છે, તે દરેક અંતરને ભરવામાં મદદ કરે છે. વધુ ઉમેરાઓ ભવિષ્યમાં આ ડેટાબેઝને સુધારવામાં મદદ કરી શકે છે. જોકે એવા ડેટાબેઝ ઉપલબ્ધ હોઈ શકે છે જે સામાન્ય જનીન અથવા પ્રોટીન શોધ માટે વધુ સંપૂર્ણ દેખાય છે, જેમ કે એન. સી. બી. આઈ., એચ. એ. ડી. બી. અને ઓટોફેગી ડેટાબેઝ ઓટોફેગી-સંબંધિત જનીનો અને પ્રોટીન પર સૌથી સંપૂર્ણ માહિતી પ્રદાન કરે છે. GUI દરેક માટે સંપૂર્ણપણે શુદ્ધ નથી, અને તેનો ઉપયોગ કરવો મુશ્કેલ હોઈ શકે છે, પરંતુ આ દરેક ડેટાબેઝ ઓટોફેગી પર ધ્યાન કેન્દ્રિત કરે છે, જ્યારે NCBI ઓટોફેગી પર સમાન કેન્દ્રિત અભિગમનો ઉપયોગ કરતું નથી. જેમ કે, એચએડીબી અને ઓટોફેગી ડેટાબેઝ ઓટોફેગી-સંબંધિત જનીનો અને પ્રોટીનના સંશોધન માટે એક રસપ્રદ માર્ગ પ્રદાન કરી શકે છે. ઓટોફેગી ઓર્થોલોગ હોમોલોગ હોમોલોગીન નેશનલ સેન્ટર ફોર બાયોટેકનોલોજી ઇન્ફર્મેશન એન્ટ્રેઝ એન્સેમ્બલ પબમેડ ફાસ્ટા બ્લાસ્ટ રેફરન્સ બાહ્ય લિંક્સ https://web.archive.org/web/20110309173256/http:// tp-apg.genes.nig.ac.jp/autophagy માનવ ઓટોફેગી (http://autophagy.lu) માં વિશેષતા ધરાવતો અન્ય ડેટાબેઝ પણ જાહેરમાં ઉપલબ્ધ છે. જૈવિક ડેટાબેઝ પ્રોગ્રામ કરેલ કોષ મૃત્યુ