The Genomic HyperBrowser
જીનોમિક હાયપર બ્રાઉઝર એ જીનોમિક એનોટેશન ડેટાના આંકડાકીય વિશ્લેષણ માટેની વેબ-આધારિત પ્રણાલી છે. જીનોમિક હાયપર બ્રાઉઝર 2008ની શરૂઆતથી વિકસાવવામાં આવ્યું છે અને ડિસેમ્બર 2010માં જાહેર થયું હતું. આ પ્રણાલીનું નવીનતમ સંસ્કરણ (v1.6) મે 2013માં બહાર પાડવામાં આવ્યું હતું. આ સિસ્ટમ નોર્વેજીયન બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ પ્લેટફોર્મ દ્વારા વિકસાવવામાં આવી છે, જે યુનિવર્સિટી ઓફ બર્ગન, યુનિવર્સિટી ઓફ ઓસ્લો, નોર્વેજીયન યુનિવર્સિટી ઓફ સાયન્સ એન્ડ ટેકનોલોજી, યુનિવર્સિટી ઓફ ટ્રોમ્સો અને નોર્વેજીયન યુનિવર્સિટી ઓફ લાઇફ સાયન્સિસ વચ્ચેનો સંયુક્ત પ્રોજેક્ટ છે. જીનોમિક હાયપર બ્રાઉઝર એ જી. એન. યુ. જી. પી. એલ. વી. 3 હેઠળ મુક્ત સોફ્ટવેર છે. હાયપર બ્રાઉઝર જીનોમિક તપાસની શ્રેણીને મંજૂરી આપે છે (ઉદાહરણ તરીકે, જનીન અભિવ્યક્તિનું નિયમન, રોગ જોડાણ અથવા જીનોમના એપિજેનેટિક ફેરફારો સહિત). પ્રણાલીનું પ્રાથમિક ધ્યાન જીનોમિક ટ્રેક વચ્ચેના સંબંધો પર આંકડાકીય અનુમાન પર છે, જોકે સરળ વર્ણનાત્મક આંકડાશાસ્ત્ર અને વ્યક્તિગત ટ્રેકનું વિશ્લેષણ પણ સમર્થિત છે. વિશ્લેષણનું એક ઉદાહરણ હિસ્ટોન ફેરફારો અને જનીન અભિવ્યક્તિ વચ્ચેના સંબંધની તપાસ કરવાનું છે, જેમાં માઇક્રોએરે પ્રયોગમાંથી અભિવ્યક્તિ મૂલ્યો સાથે ચિહ્નિત થયેલ જનીનોના ટ્રેક વિરુદ્ધ હિસ્ટોન ફેરફારોના ચીપ-આધારિત ટ્રેકનો ઉપયોગ કરવામાં આવે છે. વેબ સર્વરમાં એનોટેશન ટ્રેકનો મોટો સંગ્રહ શામેલ છે, અને વપરાશકર્તા દ્વારા અપલોડ કરેલા ટ્રેકને પણ સપોર્ટ કરે છે. જીનોમિક હાયપર બ્રાઉઝર એકલ સિસ્ટમ તરીકે ચાલે છે, પરંતુ જીનોમિક ડેટાના સંચાલન માટે ગેલેક્સી સાયન્ટિફિક વર્કફ્લો પ્લેટફોર્મ સાથે ચુસ્ત રીતે સંકલિત છે, ખાસ કરીને યુઝર ઇન્ટરફેસ બાજુએ. વિભેદક રોગ નિયમનનું સંકલન કરવાના પ્રોજેક્ટમાં તમામ માનવ રોગો સામે ટ્રાન્સક્રિપ્શન પરિબળોના મેપિંગમાં જીનોમિક હાયપર બ્રાઉઝરનો ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો હતો. યુસીએસસી જીનોમ બ્રાઉઝર ગેલેક્સી સંદર્ભો બાહ્ય કડીઓ હાયપર બ્રાઉઝર વેબ સર્વર મફત બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ સોફ્ટવેર પણ જુઓ.