MROH9
મેસ્ટ્રો હીટ જેવા પુનરાવર્તિત પ્રોટીન ધરાવતા પરિવારના સભ્ય 9 (એમ. આર. ઓ. એચ. 9) એ એક પ્રોટીન છે જે મનુષ્યમાં એમ. આર. ઓ. એચ. 9 જનીન દ્વારા એન્કોડ કરવામાં આવે છે. 'ઉસ્તાદ' શબ્દ પોતે એક ટૂંકાક્ષર છે, જે વિકાસશીલ પ્રજનન અંગો (એમ. આર. ઓ.) માં પુરુષ-વિશિષ્ટ અનુલેખન માટે વપરાય છે. એમ. આર. ઓ. જનીનો એમ. આર. ઓ. એચ. પરિવારના છે, જેમાં એમ. આર. ઓ. એચ. 9નો સમાવેશ થાય છે. જીન એમ. આર. ઓ. એચ. 9 ને C1orf129 અને એ. આર. એમ. સી. 11 (આર્મડિલો રિપીટ-યુક્ત 11) તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે. જીનોમિક સ્થાન તેના વત્તા છેડા પર રંગસૂત્ર 1 (1q24.3) પર છે, જે 129,232 આધાર જોડીઓમાં ફેલાયેલું છે. એમ. આર. ઓ. એચ. 9 જનીન એમ. આર. એન. એ. ટ્રાન્સક્રિપ્ટ દ્વારા એન્કોડ કરવામાં આવે છે જે લંબાઈમાં 3,102 ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ છે. mRNA ટ્રાન્સક્રિપ્ટ વેરિઅન્ટ 1 (NM_001163629.2), જે પ્રોટીન આઇસોફોર્મ 1 (NP_001157101.1) ને એન્કોડ કરે છે, તે સૌથી લાંબી, ઉચ્ચતમ ગુણવત્તાવાળી આઇસોફોર્મને એન્કોડિંગ કરતી સૌથી લાંબી ટ્રાન્સક્રિપ્ટ છે. ટ્રાન્સક્રિપ્ટ વેરિઅન્ટ 2માં વેરિઅન્ટ 1ની સરખામણીમાં ટૂંકા, વધુ દૂરના સી-ટર્મિનસ અને વૈકલ્પિક 3 'કોડિંગ ક્ષેત્ર અને 3' યુટીઆર હોવાનું જોવા મળે છે. ટ્રાન્સક્રિપ્ટ વેરિઅન્ટ 1 માં 23 એક્સોન છે, જે કોડિંગ ક્રમ બનાવે છે જે 2,586 ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ લાંબો છે. પ્રોટીન એમ. આર. ઓ. એચ. 9 એન્કોડ કરે છે તે પ્રબળ આઇસોફોર્મ પ્રોટીન આઇસોફોર્મ 1 છે, જેની લંબાઈ 861 એમિનો એસિડની છે. કોષ્ટક 1 એમ. આર. ઓ. એચ. 9 ના કેટલાક અન્ય સામાન્ય પ્રોટીન આઇસોફોર્મ્સને દર્શાવે છે. કોષ્ટક 1: એમ. આર. ઓ. એચ. 9 જનીનના વિવિધ આઇસોફોર્મ્સ વિશેની માહિતી એમ. આર. ઓ. એચ. 9 જનીનના આઇસોફોર્મ્સ અને તેમની સંબંધિત લંબાઈ અને એક્સોન સંખ્યાઓ. પરિવારના 11 એમ. આર. ઓ. એચ. જનીનોમાંથી, તેમના તમામ સંબંધિત પ્રોટીનમાં હીટ રિપીટ્સ હોય છે, જે બે આલ્ફા હેલિસીસને જોડતા ટૂંકા લૂપથી બનેલી પ્રોટીન માળખાકીય રચનાનો એક પ્રકાર છે. હીટ રિપીટ્સ, માળખાકીય રીતે આર્મડિલો રિપીટ્સ સાથે સંબંધિત છે, જે અંતઃકોશિકીય પરિવહનમાં સામેલ સુપરહેલિકલ માળખાઓ બનાવવા માટે જાણીતા છે. એમ. આર. ઓ. એચ. 9 જનીન દ્વારા એન્કોડેડ પ્રોટીન આઇસોફોર્મ 1 માં 5 હીટ પ્રદેશો અને 2 હીટ પુનરાવર્તનો હોય છે; કોષ્ટકમાં જોવા મળે છે તેમ, આની માત્રા વિવિધ આઇસોફોર્મ્સમાં બદલાય છે. માળખું માનવ એમ. આર. ઓ. એચ. 9 પ્રોટીન આઇસોફોર્મ 1 ની ગૌણ રચનામાં 49 આલ્ફા હેલિસીસ હોય છે જેમાં કોઈ સ્પષ્ટ શીટ્સ અથવા કોઇલ હોતી નથી. સૌથી વધુ સંભાવના સ્કોર સાથે તૃતીય માળખું દર્શાવતું I-TASSER પરિણામ પૃષ્ઠની ટોચ પર ચિત્રિત કરવામાં આવ્યું છે, અને આ માળખું ઓર્થોલોગ્સમાં પણ જોવા મળ્યું હતું. નિયમન જનીન સ્તર એમ. આર. ઓ જનીનોની એન્કોડેડ ટ્રાન્સક્રિપ્ટ એક અભ્યાસમાં "મ્યુરિન ગોનાડલ વિકાસ દરમિયાન જાતીય દ્વિરૂપ અભિવ્યક્તિ" દર્શાવવા માટે મળી આવી હતી. સંશોધકોએ માનવ વૃષણ પેશીઓમાં એમ. આર. ઓ જનીનોની વધેલી અભિવ્યક્તિ અને વૃષણ સૂક્ષ્મજીવ કોષોમાં પ્રોટીનની ચોક્કસ કોષરસાત્મક અભિવ્યક્તિ પેટર્ન પણ શોધી કાઢી હતી. NCBI જીનમાંથી RNAseq ડેટા દર્શાવે છે કે મનુષ્યોમાં MROH9 માત્ર ફેફસાંમાં જ સતત વ્યક્ત થાય છે અને અન્ય કોઈ પેશીઓમાં નથી, જો કે તે લગભગ તમામ સમૂહોમાં આંતરડા, પેટ અને પુરુષ/સ્ત્રી ગોનાડ્સમાં નોંધપાત્ર અભિવ્યક્તિ દર્શાવે છે. ઓછી સંભાવના સ્કોર્સ સૂચવે છે કે આ જનીન ખૂબ નીચા સ્તરે વ્યક્ત થઈ શકે છે. માઇક્રોએરે-મૂલ્યાંકન કરેલ પેશી અભિવ્યક્તિ પેટર્ન ડેટા પુષ્ટિ કરે છે કે ફેફસાંમાં અભિવ્યક્તિ વધારે છે, જો કે અન્ય તમામ વિવિધ પેશીઓમાં ખૂબ ઓછી છે. શરતી અભિવ્યક્તિ પેટર્ન ડેટા દર્શાવે છે કે એમ. આર. ઓ. એચ. 9 ખાસ કરીને કોઈ એક શરતમાં બીજી પર વ્યક્ત થતું નથી. એલન માઉસ બ્રેઇન એટલાસ ફેફસાં, આંતરડા અને ગોનાડ પેશીઓમાં જનીનની અભિવ્યક્તિની પુષ્ટિ કરે છે. એમ. આર. ઓ. એચ. 9 અભિવ્યક્તિ ખાસ કરીને એક સમૂહ સાથે સંબંધિત છે જે સિલિયમ સંગઠન અને સિલિયા કોષોમાં નિષ્ણાત છે. એલન માઉસ બ્રેઇન એટલાસ એ પણ દર્શાવે છે કે જનીન મગજના ઘ્રાણ બલ્બ પ્રદેશમાં અભિવ્યક્તિનું નોંધપાત્ર સ્તર દર્શાવે છે. ફેફસાં, ગોનાડ્સ, આંતરડા અને નાકને કાર્ય કરવા માટે સિલિયા કોષોની જરૂર હોવાથી, શક્ય છે કે એમ. આર. ઓ. એચ. 9 જનીન આવી પેશીઓનું કાર્ય પ્રદાન કરે. એમ. આર. ઓ. એચ. 9 આઇસોફોર્મ 1 પ્રોટીનનું પ્રોટીન સ્તરનું ઉપકોષીય સ્થાનિકીકરણ કોષરસની અંદર હોવાની આગાહી કરવામાં આવે છે. આ કડક અને દૂરના ઓર્થોલોગ્સમાં પણ સુસંગત છે, કારણ કે એમ. આર. ઓ. એચ. 9 પ્રોટીન મોટાભાગના સસ્તન પ્રાણીઓના વર્ગીકરણમાં કોષરસાત્મક ઉપકોષીય સ્થાનિકીકરણ દર્શાવે છે. જો કે, અનુમાનિત માહિતી અહેવાલ આપે છે કે પ્રોટીન મિટોકોન્ડ્રિયા, એન્ડોપ્લાઝ્મિક રેટિક્યુલમ અને ગોલ્ગી ઉપકરણમાં મહત્વપૂર્ણ હોઈ શકે છે. માયહિટ્સ મોટિફ સ્કેન દ્વારા નોંધાયેલા અનુવાદ પછીના અનુમાનિત ફેરફારો દર્શાવે છે કે એમ. આર. ઓ. એચ. 9 પ્રોટીનમાં 27 ફોસ્ફોરાયલેશન સાઇટ્સ, 7 એન-લિંક્ડ ગ્લાયકોસિલેશન સાઇટ્સ અને 4 માયરિસ્ટોયલેશન સાઇટ્સ હોઈ શકે છે. જો કે, સંભાવના સ્કોર્સ ખૂબ ઓછા છે અને આ પ્રોટીન સંભવતઃ કોષરસમાં સ્થિત છે-એટલે કે તે પટલમાં મુસાફરી કરતું નથી-અનુમાનિત એન-લિંક્ડ ગ્લાયકોસિલેશન અને માયરિસ્ટોલેશન સાઇટ્સ સંભવતઃ શૂન્ય છે. ફોસ્ફોરાયલેશન એ એકમાત્ર સંભવિત ફેરફાર છે જે આ પ્રોટીન માટે થઈ શકે છે, પરંતુ એમ. આર. ઓ. એચ. 9 ઓર્થોલોગ્સમાં માત્ર થોડીક અનુમાનિત સાઇટ્સ સંરક્ષિત છે. અન્ય ફોસ્ફોરાયલેશન સાઇટ્સ, તમામ અનુમાનિત એન-લિંક્ડ ગ્લાયકોસિલેશન અને માયરિસ્ટોયલેશન સાઇટ્સ સાથે, ઓર્થોલોગ્સમાં ખૂબ નબળી રીતે સંરક્ષિત છે. અનુમાનિત યુકેરીયોટિક રેખીય પ્રણાલીઓ (ઇ. એલ. એમ.) ક્લેવેજ સાઇટ્સ માટે ઘણી મેળ ખાતી શ્રેણીઓ દર્શાવે છે, જે સૂચવે છે કે એમ. આર. ઓ. એચ. 9 પ્રોટીન શ્રેણી તેના કાર્યના ભાગ રૂપે વિભાજિત થઈ શકે છે. ઉત્ક્રાંતિ કોષ્ટક 2: MROH9 ઓર્થોલોગ્સ અને સંબંધિત ગુણધર્મો સસ્તન પ્રાણીઓના વર્ગીકરણ જૂથોમાં વિવિધ પ્રાણીઓમાં માનવ MROH9 જનીન (NP_001157101.1) ના ઓર્થોલોગ્સ. એમવાયએ એ દર્શાવે છે કે કેટલા મિલિયન વર્ષો પહેલા સસ્તન પ્રાણીઓનું વર્ગીકરણ માનવ પ્રજાતિઓથી અલગ થયું હતું. રસપ્રદ વાત એ છે કે, એમ. આર. ઓ. એચ. 9 ઓર્થોલોગ્સ માત્ર સસ્તન પ્રજાતિઓમાં જોવા મળ્યા હતા, જે ઉપરના કોષ્ટકમાં જોવા મળે છે. કોઈપણ પક્ષીઓ, સરિસૃપ, ઉભયજીવી, અપૃષ્ઠવંશી, ફૂગ, છોડ અથવા બેક્ટેરિયામાં ચોક્કસપણે કોઈ હોમોલોગ્સ અથવા ઓર્થોલોગ્સ જોવા મળ્યા ન હતા. મોનોટ્રેમ્સ સિવાયની દરેક અસ્તિત્વ ધરાવતી સસ્તન પ્રજાતિઓમાં ઓર્થોલોગ્સ મળી શકે છે, જે ફક્ત વિવિધ આઇસોફોર્મ્સ અને વિવિધ પેરાલોગ્સ માટે હોમોલોગ્સ દર્શાવે છે. એવું પણ લાગે છે કે વિચલનની અંદાજિત તારીખ અને મનુષ્યો સાથે અનુક્રમ સમાનતા વચ્ચે કોઈ સીધો સંબંધ નથી; ગ્લિયર્સ ટેક્સોન (જે તાજેતરમાં સસ્તન પ્રાણીઓમાં વિચલન પામ્યું હતું) માં પ્રાણીઓમાં જોવા મળતા ઓર્થોલોગ્સ લાંબા સમય પહેલા વિચલન પામેલા સસ્તન જૂથોની તુલનામાં માનવ એમ. આર. ઓ. એચ. 9 અનુક્રમ સાથે ઓછી સમાનતા દર્શાવે છે. પેરાલોગ કોષ્ટક 3: એમ. આર. ઓ. એચ. 7 ના ઓર્થોલોગ્સ અને સંબંધિત ગુણધર્મો માનવ એમ. આર. ઓ. એચ. 7 જનીન (<આઇ. ડી. 1>) ના ઓર્થોલોગ્સ, એમ. આર. ઓ. એચ. 9 માટે પેરાલોગ, સસ્તન પ્રાણીઓના ટેક્સોન જૂથોમાં વિવિધ પ્રાણીઓમાં જે ઓર્થોલોગ ધરાવતા હતા. એમવાયએ એ દર્શાવે છે કે કેટલા મિલિયન વર્ષો પહેલા સસ્તન પ્રાણીઓનું વર્ગીકરણ માનવ પ્રજાતિઓથી અલગ થયું હતું. એમ. આર. ઓ. એચ. 7 એ એમ. આર. ઓ. એચ. 9 જનીનનું નોંધપાત્ર પ્રતિરૂપ છે અને તે મનુષ્યો તેમજ કેટલીક અન્ય પસંદ કરેલી સસ્તન પ્રજાતિઓમાં જોવા મળે છે. ઉપરનું બીજું કોષ્ટક આમાંના કેટલાક પેરાલોગ અને તેમની અનુક્રમ ઓળખ અને માનવ એમ. આર. ઓ. એચ. 7 જનીન સાથે સમાનતા દર્શાવે છે. માનવ એમ. આર. ઓ. એચ. 7 માનવ એમ. આર. ઓ. એચ. 9 જનીન સાથે 22 ટકા સહિયારી અનુક્રમ ઓળખ ધરાવે છે. જમણી બાજુનો આલેખ એમ. આર. ઓ. એચ. 9 ના વિચલનની મધ્ય તારીખ વિરુદ્ધ સુધારેલ ક્રમ વિચલન દર્શાવે છે. એમ. આર. ઓ. એચ. 9ના ઉત્ક્રાંતિના દરમાં ફાઈબ્રિનોજેન આલ્ફા (ઝડપથી વિકસતા જનીન), સાયટોક્રોમ સી (ધીમે ધીમે વિકસતા જનીન) અને એમ. આર. ઓ. એચ. 7 પેરાલોગના દર સામેલ છે. આલેખ દર્શાવે છે કે એમ. આર. ઓ. એચ. 7 ઉત્ક્રાંતિ માટેનો ઢોળાવ એમ. આર. ઓ. એચ. 9 કરતા ઘણો ઓછો છે, તેના વિચલનનો દર લગભગ સાયટોક્રોમ સી જેવો જ છે. એમ. આર. ઓ. એચ. 7 જનીનના તમામ ઓર્થોલોગ ઇતિહાસમાં જુદા જુદા સમયે અલગ હોવા છતાં સમાન અનુક્રમ ઓળખ દર્શાવે છે. આ સૂચવી શકે છે કે એમ. આર. ઓ. એચ. 7 જનીન માટેના ઓર્થોલોગ્સ એકબીજાની નજીકથી સંબંધિત છે, અને લગભગ 94 મિલિયન વર્ષો પહેલા એમ. આર. ઓ. એચ. 9 થી અલગ થઈ ગયા હોઈ શકે છે અને ત્યારથી તે વધુ વિકસિત થયા નથી. એમ પણ શક્ય છે કે એમ. આર. ઓ. એચ. 7 પેરાલોગ એમ. આર. ઓ. એચ. 9 જનીન કરતાં ધીમી ગતિએ વિકસી રહ્યું હોય. પરસ્પર ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરતા પ્રોટીન GLO1 અને RNF123 બંને કેટલાક ડેટાબેઝ અને લેખોમાં દેખાય છે, જે MROH9 માટે વાસ્તવિક ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરતા પ્રોટીન હોવાની શક્યતાને વધારે છે. RNF123 અને PARK2, અન્ય ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરતા પ્રોટીન, બંને E3 યુબીક્વિટિન લિગેસ છે, જે અધોગતિ માટે પ્રોટીનને લક્ષ્ય બનાવવા માટે જવાબદાર છે. જી. એલ. ઓ. 1, અથવા લેક્ટોયલગ્લુટાથિઓન લિગેઝ, એક ઉત્સેચક છે જે હેમિથિઓએસેટલ એડક્ટ્સના આઇસોમેરાઇઝેશનને ઉત્પ્રેરિત કરે છે. આ પરિણામો સમજાવે છે કે એમ. આર. ઓ. એચ. 9 કાર્ય આ અસ્થિબંધનની પ્રવૃત્તિ પર આધારિત હોઈ શકે છે અને તેનું અધઃપતન થઈ શકે છે. ક્લિનિકલ મહત્વ એમ. આર. ઓ. એચ. 9 ઘણા પ્રકાશનોમાં જોવા મળે છે જે વિવિધ પ્રકારના કેન્સરમાં ઓન્કોજીન તરીકે તેની સંભવિત ભૂમિકા દર્શાવે છે. એક પેપરમાં જાણવા મળ્યું છે કે એમ. આર. ઓ. એચ. 9 નજીક અતિશય ક્રોમેટિન લૂપિંગ હતું અને કેટલાક એફ. એમ. ઓ જનીનો (રંગસૂત્ર 1 પર એમ. આર. ઓ. એચ. 9ના જનીન પડોશીઓ), નાસૉફેરિન્જિયલ કેન્સરમાં અન્ય મુખ્ય ઓન્કોજીન્સ સાથે, સંભવિત રીતે એમ. આર. ઓ. એચ. 9ને ઓન્કોજીન ગુણધર્મો સાથે જોડે છે. એમ. આર. ઓ. એચ. 9 કેન્સરના અન્ય સ્વરૂપોમાં ઓન્કોજીન તરીકે પણ ભૂમિકા ભજવે છે; અભ્યાસોમાં જાણવા મળ્યું છે કે તે સંભવિત નેક્રોપ્ટોસિસ-સંબંધિત જનીન છે જે સ્વાદુપિંડના એડેનોકાર્સિનોમા માટે ઉચ્ચ જોખમ ધરાવતા જૂથોમાં વધુ પડતું વ્યક્ત થાય છે. એમ. આર. ઓ. એચ. 9 ને કેટલાક અભ્યાસો દ્વારા સ્તન કેન્સર માટે ઓન્કોજીન તરીકે વધુ પુષ્ટિ મળી છે, જેમાં અડધાથી વધુ સ્તન કેન્સરની ગાંઠોમાં રંગસૂત્ર 1 માં ફેરફારો વર્ણવવામાં આવ્યા છે. મોટી સંખ્યામાં કોપી નંબર ભિન્નતા (CNV) ખાસ કરીને રંગસૂત્ર 1ના 1Q હાથ પર જોવા મળે છે જ્યાં MROH9 જોવા મળે છે. અન્ય સંશોધનોમાં એમ. આર. ઓ. એચ. 9 એ એમ. આઈ. આર.-3646 નું અનુમાનિત લક્ષ્ય હોવાનું જાણવા મળ્યું છે, જે એક પ્રકારનો માઇક્રો આર. એન. એ. છે જે માનવ સ્તન કેન્સરના કોષોમાં કોષના પ્રસારને પ્રોત્સાહન આપે છે. આ ઉપરાંત, એમ. આર. ઓ. એચ. 9 એ રંગસૂત્ર 1 લોકસ પર પણ જોવા મળે છે જે કેન્દ્રીય કોર્નિયલ જાડાઈ સાથે સંકળાયેલ છે, જે ગ્લુકોમાનું માપ છે. તે PRRX1 સાથે સંકળાયેલ સ્થાન પર જોવા મળે છે, જે અન્ય જનીન છે, જે MROH9 સાથે, માનવ રંગસૂત્ર 1 પર પ્રણાલીગત લ્યુપસ એરિથેમેટોસસ સંદર્ભ જનીનોમાં પણ સંકળાયેલ પ્રકાર હોવાનું જાણવા મળ્યું હતું.