UBALD1
યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 (યુબીક્વિટિન-સંકળાયેલ 1 ધરાવતું ડોમેન) એ યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 જનીન દ્વારા એન્કોડ થયેલ પ્રોટીન છે, જે મનુષ્યમાં રંગસૂત્ર 16 પર સ્થિત છે. યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 ઉચ્ચ સર્વવ્યાપક પેશી અભિવ્યક્તિ ધરાવે છે અને ન્યુક્લિયસ અને કોષરસમાં સ્થાન પામે છે. UBALD1 અપૃષ્ઠવંશી પ્રાણીઓ સહિત પ્રાણીઓમાં સંરક્ષિત છે. UBALD1 નું ઉપનામ FAM100A છે. જનીન માનવ યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 જનીન સાયટોજેનેટિક સ્થાન <આઇ. ડી. 1> પર રંગસૂત્ર 16ના માઈનસ સ્ટ્રાન્ડ પર સ્થિત છે. જનીનમાં ત્રણ એક્સોન અને બે ઇન્ટ્રોન હોય છે, જેની કુલ જનીન લંબાઈ 6,145 આધાર જોડી હોય છે. ટ્રાન્સક્રિપ્ટ્સ મનુષ્યોમાં યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 ના ત્રણ આઇસોફોર્મ્સ છે, જેમાંના તમામમાં ત્રણ એક્સોન છે. યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 આઇસોફોર્મ 1 માં 1,374 ન્યુક્લિયોટાઇડ્સનો એમ. આર. એન. એ. ક્રમ છે અને તે સૌથી લાંબા પ્રોટીનને એન્કોડ કરે છે. આઇસોફોર્મ 2 એ એક્સોન 3 ની શરૂઆતમાં 75 ન્યુક્લિયોટાઇડ્સના બાકાત સાથે અલગ પડે છે, અને આઇસોફોર્મ 3 એ એક્સોન 1 ના અંતે 185 ન્યુક્લિયોટાઇડ્સના નિવેશ સાથે અલગ પડે છે. પ્રોટીન આઇસોફોર્મ્સ યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 આઇસોફોર્મ 1 સૌથી લાંબા પ્રોટીનને એન્કોડ કરે છે જેમાં 177 એમિનો એસિડ હોય છે. આઇસોફોર્મ 2 નો પ્રોટીન ક્રમ 85.9% આઇસોફોર્મ 1 જેવો જ છે. આઇસોફોર્મ 2 એ એક્સોન 3 માં 25 એમિનો એસિડનો બાકાત ધરાવે છે અને તેમાં PHA03247 ડોમેનનો અભાવ છે. આઇસોફોર્મ 3 આઇસોફોર્મ 1 અને 2 થી ઘણું અલગ છે, જે 35.6% આઇસોફોર્મ 1 જેવું જ છે. આઇસોફોર્મ 3 માં 122 એમિનો એસિડ હોય છે અને એક્સોન 1 પર સમાવેશ થાય છે, જેના કારણે કોડોનની ફ્રેમ શિફ્ટ થાય છે અને તેના સ્ટોપ કોડોનની અગાઉની ઘટના થાય છે. આઇસોફોર્મ 3માં પણ PHA03247 ડોમેનનો અભાવ છે. પ્રોપરાઇટ્સ અને ડોમેન્સ યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 આઇસોફોર્મ 1 દ્વારા એન્કોડેડ પ્રોટીનનું અનુમાનિત આઇસોઇલેક્ટ્રિક બિંદુ 6.13 અને મોલેક્યુલર વજન 19.0 કેડીએ છે. યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 રચના એલેનાઇન અને પ્રોલાઇનથી સમૃદ્ધ છે, અને તેમાં આ અવશેષોના બહુવિધ ડુપ્લેટ્સ/ત્રિપાઇ હોય છે. પ્રોલાઇન અવશેષો અને બહુવિધ ખૂબ જ સંરક્ષિત છે, ખાસ કરીને PHA03247 ડોમેનમાં. પ્રોટીનમાં એક ડોમેન, PHA03247, અથવા મોટા ટેગ્યુમેંટ પ્રોટીન યુએલ36 ડોમેન હોય છે. ટેગમેન્ટ પ્રોટીન યુએલ36 એ હર્પીસ સિમ્પ્લેક્સ વાયરસ 1 માં જોવા મળતું સૌથી મોટું ટેગમેન્ટ પ્રોટીન છે, અને તેમાં ડ્યૂબિક્વિટિનેટિંગ પ્રવૃત્તિ છે. માળખું UBALD1 પ્રોટીન ગૌણ માળખામાં મોટે ભાગે કોઇલ અને ચાર ટૂંકા આલ્ફા હેલિકલ પ્રદેશો (સ્થિતિ 5-22,25-46,76-83, અને 170-173) નો સમાવેશ થાય છે. તેની તૃતીય માળખું પછીથી કોઇલ્ડ અને ગોળાકાર જેવું છે. નિયમન જનીન સ્તર અભિવ્યક્તિ યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 એ ખૂબ જ વ્યક્ત થયેલ જનીન છે, જે સરેરાશ જનીન કરતાં 1.4x વધુ વ્યક્ત થયેલ છે. યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 સર્વવ્યાપક અભિવ્યક્તિ ધરાવે છે, જેમાં સ્તન્ય પ્રાણીઓમાં ગર્ભમાં રહેલા બચ્ચાની રક્ષા માટેનું આચ્છાદન, હાડપિંજરના સ્નાયુ, યકૃત અને મગજમાં તેનું ઉચ્ચતમ સ્તર છે. મગજની અંદર, યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 અભિવ્યક્તિ હિપ્પોકેમ્પલ રચનામાં સૌથી વધુ હોય છે અને ઘ્રાણ ક્ષેત્રોમાં પ્રોટીન સ્તરનું નિયમન યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 પ્રોટીન ન્યુક્લિયસ અને કોષરસમાં સ્થાન પામવાની આગાહી કરવામાં આવે છે. પરમાણુ નિકાસ સંકેત મધ્યમ રીતે સ્થિતિ 79-85 પર અને મજબૂત રીતે સ્થિતિ 174-177 પર સ્થિત હોય છે. UBALD1 પાસે S88, S90, S93 અને S96 પર જાણીતા ફોસ્ફોરાયલેશન સ્થળો સાથે ઘણા અનુમાનિત ફોસ્ફોરાયલેશન અને ગ્લાયકોસિલેશન સ્થળો છે. ઉત્ક્રાંતિ ઇતિહાસ ઓર્થોલોગ્સ યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 માટે ઓર્થોલોગની જગ્યા મોટી છે, જેમાં તેના સૌથી દૂરના ઓર્થોલોગ્સ 694 મિલિયન વર્ષો પહેલા અપૃષ્ઠવંશી પ્રાણીઓમાં અલગ પડે છે. ઓર્થોલોગ્સમાં મોટાભાગના કરોડઅસ્થિધારી પ્રાણીઓનો સમાવેશ થાય છે, જેમ કે સસ્તન પ્રાણીઓ, પક્ષીઓ, સરીસૃપ, ઉભયજીવી, માછલીઓ, તેમજ કેટલાક અપૃષ્ઠવંશી પ્રાણીઓ, જેમ કે આર્થ્રોપોડ્સ, સિનિડેરિયા, મોલસ્ક, ઇચિનોડર્મ્સ અને નેમાટોડ્સ. ફૂગ, છોડ અથવા બેક્ટેરિયામાં કોઈ ઓર્થોલોગ નથી. સસ્તન પ્રાણીઓ, પક્ષીઓ અને સરિસૃપ સહિત નજીકથી સંબંધિત ઓર્થોલોગ્સ, શ્રેણી 67-92% અનુક્રમ સમાનતા ધરાવે છે. ઉભયજીવી અને માછલીઓ સહિત મધ્યમ સંબંધિત ઓર્થોલોગ્સ, શ્રેણીમાં 55-75% સમાનતા ધરાવે છે. અપૃષ્ઠવંશી પ્રાણીઓ સહિત દૂરના સંબંધિત ઓર્થોલોગ્સ, શ્રેણી 29-50% અનુક્રમ સમાનતા ધરાવે છે. પેરાલોગ્સ માનવ UBALD1 પ્રોટીનમાં એક પેરાલોગ હોય છે, UBALD2, જે કરોડઅસ્થિધારી પ્રાણીઓમાં હાજર હોય છે પરંતુ અપૃષ્ઠવંશી પ્રાણીઓમાં હાજર નથી. તેઓ 63.1% સેક્વેન્સ ઓળખ અને 70.9% સેક્વેન્સ સમાનતા સાથે સમાન છે. યુ. બી. એ. એલ. ડી. 2 પ્રોટીનની લંબાઈ 164 એમિનો એસિડની હોય છે, અનુમાનિત આઇસોઇલેક્ટ્રિક બિંદુ 6.78 અને મોલેક્યુલર વજન 17.7 કેડીએ છે. યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 નું યુ. એલ. 36 ટેગમેન્ટ પ્રોટીન ડોમેન આંશિક રીતે યુ. બી. એ. એલ. ડી. 2 પેરાલોગમાં સંરક્ષિત છે. યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 એક સમાંતર અભિવ્યક્તિ ધરાવે છે, જ્યારે યુ. બી. એ. એલ. ડી. 2 દ્વિભાષી અભિવ્યક્તિ ધરાવે છે. સંરક્ષણ એક્સોન 1 અને એક્સોન 3 ની શરૂઆત (સ્થિતિ 64-79), કડક અને દૂરના ઓર્થોલોગ્સમાં ખૂબ જ સંરક્ષિત છે. ખાસ કરીને, એક્સોન 3 (P65, P69, P72, P73, P76) માં પ્રોલાઇન અવશેષો મજબૂત રીતે સંરક્ષિત છે. આંતરક્રિયા કરતા પ્રોટીન યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 ને ન્યુક્લિયસમાં જોવા મળતા પ્રોટીન એમ. ઈ. ડી. 8 અને કોષરસમાં જોવા મળતા આર. પી. એલ. 9 સાથે ભૌતિક જોડાણ છે. યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 ઇ. પી. આર. એસ. અને ઇ. ઇ. એફ. 1ઇ. 1 સાથે પણ સંકળાય છે, જે બંને એમિનોસિલ-ટી. આર. એન. એ. સિન્થેટેઝ મલ્ટિએન્ઝાઇમ સંકુલમાં ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરવા અને તેમાં સામેલ થવા માટે જાણીતા છે. ક્લિનિકલ મહત્વ યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 વિવિધ કેન્સરના પ્રકારો સાથે સંકળાયેલું છે, અને લિમ્ફોમાના દર્દીઓમાં નોંધપાત્ર રીતે ઉન્નત ઓટોએન્ટિબોડી તરીકે ઓળખવામાં આવ્યું હતું. યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 પ્રમોટર ક્ષેત્રનું હાયપોમેથાઇલેશન સેલ-સેલ સંલગ્નતા, બી સેલ સક્રિયકરણ અને લિમ્ફોસાઇટ સક્રિયકરણ સાથે સંકળાયેલું હતું, જે પ્લેટિનમ-આધારિત કેમોથેરાપ્યુટિક્સના પ્રાથમિક પ્રતિકારની આગાહી કરવા માટે સંભવિત બાયોમાર્કર છે. યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 હાયપોમેથાઇલેશન પણ લિંગ અસંગતતા સાથે સંકળાયેલું છે. યુ. બી. એ. એલ. ડી. 1 માં લિંગ-સમર્થન હોર્મોન ઉપચાર પ્રાપ્ત કરતા પહેલા જન્મ સમયે પુરુષને સોંપવામાં આવેલી ટ્રાન્સ સ્ત્રીઓમાં નોંધપાત્ર સી. પી. જી. હાયપોમેથાઇલેશન છે, જ્યારે જન્મ સમયે પુરુષને સોંપવામાં આવેલા સી. આઈ. એસ. પુરુષોની સરખામણીમાં. માનવ રંગસૂત્ર 16 પર જનીનોના સંદર્ભો