SCRN3
સેકર્નિન-3 (એસસીઆરએન 3) એ એક પ્રોટીન છે જે માનવ એસસીઆરએન 3 જનીન દ્વારા એન્કોડ કરવામાં આવે છે. એસ. સી. આર. એન. 3 પેપ્ટિડેઝ સી69 પરિવાર અને સેકર્નિન ઉપકુટુંબ સાથે સંબંધિત છે. આ પરિવારના એક ભાગ તરીકે, પ્રોટીન સિસ્ટીન-પ્રકારની એક્સોપેપ્ટિડેઝ પ્રવૃત્તિ અને ડિપેપ્ટિડેઝ પ્રવૃત્તિને સક્ષમ કરવા તેમજ પ્રોટીઓલિસિસમાં સામેલ થવાની આગાહી કરવામાં આવે છે. તે મગજ, થાઇરોઇડ અને અન્ય 25 પેશીઓમાં સર્વવ્યાપક રીતે વ્યક્ત થાય છે. વધુમાં, SCRN3 સસ્તન પ્રાણીઓ, પક્ષીઓ, માછલીઓ, ઉભયજીવીઓ અને અપૃષ્ઠવંશી પ્રાણીઓ સહિત વિવિધ પ્રજાતિઓમાં સંરક્ષિત છે. એસ. સી. આર. એન. 3 કોષરસનો અભિન્ન ઘટક હોવાની આગાહી કરવામાં આવી છે. જીન SCRN3 સામાન્ય રીતે FLJ23142 અને SES3 તરીકે પણ ઓળખાય છે. લોકસ હોમો સેપિયન્સ સેકર્નિન-3 (એસસીઆરએન 3) એ પ્રોટીન-કોડિંગ જનીન છે. તે રંગસૂત્ર 2 પર મળી શકે છે, તેનું ચોક્કસ સ્થાન 2q31.1 છે, જે '+' સ્ટ્રાન્ડ પર છે. જનીન 33,846 આધાર જોડીઓ લાંબી છે અને તેમાં 8 એક્સોન છે. એસ. સી. આર. એન. 3 પ્રોટીન-કોડિંગ જનીનનું સૌથી સામાન્ય ટ્રાન્સક્રિપ્ટ ટ્રાન્સક્રિપ્ટ વેરિઅન્ટ 1 છે, જે 3052 બેઝ જોડી લાંબી છે. એસ. સી. આર. એન. 3 ઉચ્ચ સ્તરે વ્યક્ત થાય છે, જે આ પ્રકાશનમાં સરેરાશ જનીન કરતાં 2.4 ગણો વધારે છે. માનવ એસ. સી. આર. એન. 3 માં 8 જુદા જુદા આઇસોફોર્મ્સ છે. અભિવ્યક્તિ SCRN3 નું mRNA મનુષ્યમાં મધ્યમ હોવાનું જણાયું હતું. એસ. સી. આર. એન. 3 મોટાભાગના મુખ્ય પેશીઓમાં વ્યક્ત થાય છે. એમ. આર. એન. એ. અન્ય પેશીઓની તુલનામાં મગજ, થાઇરોઇડ, હૃદય અને પ્રોસ્ટેટમાં સહેજ ઊંચા સ્તરે વ્યક્ત થાય છે, જોકે અંતર્ગત વલણ વિવિધ પેશીઓમાં પ્રમાણમાં સુસંગત સર્વવ્યાપક અભિવ્યક્તિ હતું. ઉંદરના મગજ અને ગર્ભ બંનેના મૂળ સ્થાને સંકરણમાં SCRN3 ના વિશ્લેષણમાં, મજબૂત અભિવ્યક્તિના કોઈ ચોક્કસ ક્ષેત્રો જોવા મળ્યા ન હતા, તેના બદલે સમગ્રમાં મધ્યમ અભિવ્યક્તિ દર્શાવે છે, જે પુષ્ટિ કરે છે કે SCRN3 સંભવતઃ મોટાભાગની પેશીઓમાં સર્વવ્યાપક અભિવ્યક્તિ ધરાવે છે. ઇમ્યુનોહિસ્ટોકેમિસ્ટ્રી ડેટા એ પણ સૂચવે છે કે માનવ એસસીઆરએન 3 માં ઓછી પેશીઓ, એક કોષ, રોગપ્રતિકારક કોષ અને મગજ ક્ષેત્રની વિશિષ્ટતા છે, જે ફરી એકવાર સર્વવ્યાપક અભિવ્યક્તિના પુરાવામાં વધારો કરે છે. એસ. સી. આર. એન. 3 જનીનનો પ્રોટીન ટ્રાન્સક્રિપ્ટ પ્રકાર 1 સૌથી સામાન્ય પ્રોટીન આઇસોફોર્મ, સેકર્નિન-3 આઇસોફોર્મ 1 ને એન્કોડ કરે છે, જે 424 એમિનો એસિડ લાંબા હોય છે. બિનપરિવર્તિત SCRN3 પ્રોટીનનું પરમાણુ વજન આશરે 48.413 kDa છે અને SCRN3નું સૈદ્ધાંતિક આઇસોઇલેક્ટ્રિક બિંદુ (pI) 5.38 છે. સૈદ્ધાંતિક આઇસોઇલેક્ટ્રિક બિંદુ, પ્રોટીનની રચનામાં એસિડિક એમિનો એસિડ્સના વર્ચસ્વ સાથે, સૂચવે છે કે SCRN3 પ્રમાણમાં એસિડિક પ્રોટીન છે. વધુમાં, મનુષ્યોમાં એસસીઆરએન 3 ની સાપેક્ષ પ્રોટીનની વિપુલતા અન્ય માનવ પ્રોટીનની તુલનામાં 6.13 પીપીએમ પર સાધારણ રીતે વધારે હોવાનું જણાયું હતું. ડોમેન્સ SCRN3 પાસે એક જ નોંધપાત્ર ડોમેન છે, જેને પેપ્ટિડેઝ _ C69 ડોમેન અથવા ટૂંકમાં PepD ડોમેન તરીકે ઓળખવામાં આવે છે. આ ક્ષેત્ર પ્રોટીનના એમિનો એસિડની સ્થિતિ 5 થી 226 સુધી ફેલાયેલું છે. આ ડોમેનમાં જોવા મળતા સિક્વન્સ પેપ્ટિડેઝ C69 પરિવારની લાક્ષણિકતા છે, અને ખાસ કરીને સેસર્નિન સબફૅમિલી, જે મુખ્યત્વે ડિપેપ્ટિડેઝ તરીકે ઓળખાય છે. આ કુટુંબની અંદર, તુલનાત્મક ક્રમ અને માળખાકીય વિશ્લેષણમાં ઉત્પ્રેરક ન્યુક્લિયોફાઇલ તરીકે સિસ્ટીન હોવાનું બહાર આવ્યું છે, જે એક લક્ષણ છે જે સેસર્નિન-3 પર મળી શકે છે. માળખું એસ. સી. આર. એન. 3 ના અનુમાનિત તૃતીય માળખામાં, સૌથી વધુ સંરક્ષિત એમિનો એસિડ મુખ્યત્વે પ્રોટીનના આંતરિક ભાગમાં જોવા મળ્યા હતા. આ સૂચવે છે કે સૌથી વધુ સંરક્ષિત એમિનો એસિડ, અંદરની બાજુએ હોવાથી, પ્રોટીનનું માળખું પ્રદાન કરવા તેમજ આંતરિક કાર્યક્ષમતા પ્રદાન કરવા માટે મહત્વપૂર્ણ છે. કોષની અંદર સ્થાનિકીકરણ, એસસીઆરએન 3 મુખ્યત્વે કોષરસમાં વ્યક્ત થવાની આગાહી કરવામાં આવે છે. કોષરસાત્મક સ્થાનિકીકરણની આગાહી 5 વધારાના ઓર્થોલોગ્સ (મૌરેમીસ રીવેસી, ગેલસ ગેલસ, માઇક્રોસીસિલિયા યુનિકોલર, ડેનિઓ રેરીઓ અને એનોફેલીસ ગેમ્બિયા) વચ્ચે સુસંગત હતી, જે માનવ એસ. સી. આર. એન. 3 ના અનુમાનિત કોષરસાત્મક ઉપકોષીય સ્થાનિકીકરણની પુષ્ટિ કરે છે. અનુવાદ પછીના ફેરફારો એસ. સી. આર. એન. 3 એ અનુવાદ પછીના કેટલાક અનુમાનિત ફેરફારોને આધિન છે, જેમાં ફોસ્ફોરાયલેશન, સર્વવ્યાપકતા, સુમોલેશન, લાઇસિન એસિટાયલેશન અને ઓ-બીટા-જી. એલ. સી. એન. એ. સી. જોડાણ સાઇટ્સનો સમાવેશ થાય છે. વધુમાં, સેકર્નિન-3 એ રિવર્સ-પોલેરિટી પ્રવૃત્તિ-આધારિત પ્રોટીન પ્રોફાઇલિંગ (આરપી-એબીપીપી) ના ઉપયોગ દ્વારા અનુમાનિત કુદરતી રીતે બનતું એન-ટર્મિનલ ગ્લાયોક્સિલાઇલ (ગ્લોક્સ) ઇલેક્ટ્રોફાઇલનું પ્રથમ ઉદાહરણ પૂરું પાડ્યું હતું. હાઈડ્રાઝિન ચકાસણીનો ઉપયોગ કરીને, તે પુષ્ટિ કરવામાં આવી હતી કે સિસ્ટીન (સી. આઈ. એસ.) અવશેષો અનુવાદ પછી ગ્લોક્સમાં રૂપાંતરિત થયા હતા. આનાથી સેકર્નિન-3માં પ્રથમ વખત ઇલેક્ટ્રોફિલિક એન-ટર્મિનલ ગ્લાયોક્સિલિલ જૂથની ઓળખ થઈ, જોકે કોફેક્ટર તરીકે પ્રોટીન અને ગ્લોક્સ બંનેના કાર્યોને હજુ સુધી પ્રાયોગિક રીતે માન્ય કરવામાં આવ્યા નથી. હોમોલોજી/ઇવોલ્યુશન પેરાલોગ્સ SCRN3માં બે જાણીતા પેરાલોગ્સ છે, SCRN2 અને SCRN1, જે અનુક્રમે SCRN3 પ્રોટીન ક્રમ સાથે 67.4% અને 63.8% સમાનતા ધરાવે છે. બંને પેરાલોગ એસ. સી. આર. એન. 3 સાથે સાધારણ રીતે સંબંધિત છે. એસ. સી. આર. એન. 2 એ એસ. સી. આર. એન. 3 જેવા જ પ્રજાતિ જૂથોમાં જોવા મળ્યું હતું. એસ. સી. આર. એન. 1 સસ્તન પ્રાણીઓ, પક્ષીઓ, સરિસૃપ, ઉભયજીવી અને કાર્ટિલાજિનસ માછલી સહિત ઓછા પ્રજાતિ જૂથોમાં સંરક્ષિત કરવામાં આવ્યું હતું, પરંતુ અન્ય માછલીઓ અથવા અપૃષ્ઠવંશી પ્રાણીઓમાં નહીં. માનવ જનીન SCRN3 માટે 100થી વધુ ઓર્થોલોગ અસ્તિત્વ ધરાવે છે. જાણીતા ઓર્થોલોગ્સ કરોડઅસ્થિધારી પ્રાણીઓ અને અપૃષ્ઠવંશી પ્રાણીઓમાં અસ્તિત્વ ધરાવતા હોવાનું જણાયું હતું, પરંતુ છોડ, બેક્ટેરિયા અથવા ફૂગમાં નહીં. મળી આવેલી 20 ઓર્થોલોગ્સની વિચલન તારીખની સરખામણી હોમો સેપિયન્સ સાથે કરવામાં આવી હતી. અપૃષ્ઠવંશી પ્રાણીઓ માનવ એસ. સી. આર. એન. 3 સાથે સૌથી વધુ દૂરથી સંબંધિત ઓર્થોલોગ્સ છે, જેમાં ઓર્થોલોગ્સના આ સમૂહથી 69.4 કરોડ વર્ષ પહેલાંની વિચલનની સૌથી દૂરની સરેરાશ તારીખ છે. ઉત્ક્રાંતિ એસ. સી. આર. એન. 3 માટે પરમાણુ ઉત્ક્રાંતિનો સાપેક્ષ દર સાધારણ રીતે ઊંચો હતો, જે ફાઇબ્રિનોજેન આલ્ફાના ઉત્ક્રાંતિ દર કરતા થોડો ઓછો હતો, અને સાયટોક્રોમ સી. એસ. સી. આર. એન. 3 ના ઉત્ક્રાંતિ દર કરતાં વધુ ઝડપી હતો, જે અંદાજે 69.4 કરોડ વર્ષ પહેલાં અપૃષ્ઠવંશી પ્રાણીઓમાં પ્રથમ વખત દેખાયો હોવાનો અંદાજ છે, જે આખરે મનુષ્યમાં જોવા મળે છે. પી. એસ. સી. ક્યુ. યુ. આઈ. સી. ની શોધમાં 5 પ્રોટીનની ઓળખ થઈ છે જે માનવ એસ. સી. આર. એન. 3 પ્રોટીન સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરે છે. સંદર્ભો માનવ રંગસૂત્ર 2 પર આનુવંશિક પ્રોટીન જનીનો