TMEM269
ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રોટીન 269 (TMEM269) એ એક પ્રોટીન છે જે મનુષ્યમાં TMEM269 જનીન દ્વારા એન્કોડ કરવામાં આવે છે. જનીન 1p34.2 ના સાયટોજેનેટિક સ્થાન સાથે વત્તા સ્ટ્રાન્ડ પર સ્થિત છે અને તેમાં જોડાણ નંબર A0A1B0GVZ9.1 છે. જનીનનો સમયગાળો આશરે 160,000 આધાર જોડીનો હોય છે. તેમાં TMEM269 ની વિરુદ્ધ દિશામાં નકારાત્મક સ્ટ્રાન્ડ પર વ્યક્ત કરાયેલ એક અલગ ટ્રાન્સક્રિપ્ટ છે. ટ્રાન્સક્રિપ્ટ આર. એન. એ.-સેક ડેટા મનુષ્યમાં પેશીઓના પ્રકાર અનુસાર આર. એન. એ.-સેક ડેટાના અભ્યાસમાં વૃષણ, મગજ, એન્ડોમેટ્રીયમ અને કિડનીમાં ટી. એમ. ઈ. એમ. 269ની અભિવ્યક્તિ સૌથી વધુ જોવા મળી હતી. ડેટા સૂચવે છે કે TMEM269 પેશીઓના પ્રકારોમાં એકદમ નીચા દરે સર્વવ્યાપક રીતે લખાયેલું છે, જેમાં કોઈ પેશીનો પ્રકાર નથી, જેમાં પ્રતિ મિલિયન વાંચન દીઠ પ્રતિ કિલોબેઝ 0.40 થી વધુ વાંચે છે. પેશીઓના પ્રકારોમાં RNA-SEQ ડેટાનો એક અલગ અભ્યાસ મગજમાં TMEM269 માટે સૌથી વધુ અભિવ્યક્તિ, મૂત્રપિંડ ગ્રંથિ અને અનુવાદના વૃષણ નિયમન સૂચવે છે માઉસ મોડેલોમાં ડાયાબિટીક કિડની રોગ (DKD) ના એક અભ્યાસમાં નક્કી કરવામાં આવ્યું છે કે miRNA-181b-5b, એક miRNA કે જે DKD ઉંદરમાં નાટ્યાત્મક રીતે ડાઉન-રેગ્યુલેટેડ છે, નાટ્યાત્મક રીતે TMEM269 (-4.52 ગણો તફાવત અથવા 22.12% કુલ મૂળ અભિવ્યક્તિ, p-મૂલ્ય <0.01) ની અભિવ્યક્તિમાં ઘટાડો કરે છે. મૂળ અભ્યાસમાંથી કોષ્ટક IIIa નો પેટા વિભાગ TMEM269 સાથે સંબંધિત મૂલ્યો સાથે નીચે સમાવવામાં આવ્યો છે. TMEM269 એ 27 જનીનોમાંથી એક છે જેણે પરીક્ષણ કરાયેલા જનીનોની અભિવ્યક્તિમાં નોંધપાત્ર (4 ગણો તફાવત) ઘટાડો કર્યો હતો; આ જનીનોમાં સૌથી મજબૂત અસર માટે તે 18 મા ક્રમે છે. ઉચ્ચ ફોસ્ફોલિપિડ માઇક્રોડાઇટ્સ (હાઇ-પી. એલ.) ની સરખામણીમાં પેલાગિક સોલ લાર્વામાં નીચા ફોસ્ફોલિપિડ માઇક્રોડાઇટ્સ (લો-પી. એલ.) દ્વારા TMEM269 ને પ્રાયોગિક રીતે ડાઉન-રેગ્યુલેટેડ હોવાનું નક્કી કરવામાં આવ્યું હતું. લો-પી. એલ. ડાયેટરી એક્સપોઝર (ડાઉન-રેગ્યુલેટેડ 12 ના જૂથમાંથી) અનુસાર ઓળખાયેલ 15 અલગ રીતે વ્યક્ત કરાયેલ લખાણોમાં TMEM269 એક હતું. પ્રોટીન TMEM269 બે આઇસોફોર્મ્સ ધરાવે છે, જેમાં વધુ સામાન્ય પ્રકાર લંબાઈમાં 245 એમિનો એસિડ છે. તે પ્રોટીનની સમગ્ર લંબાઈમાં 5 ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન ડોમેન્સ ધરાવે છે અને ફોસ્ફેટિડિલસેરિન સિન્થેઝના ક્રમ સાથે એક મોટી પ્રદેશ સમાનતા ધરાવે છે. TMEM269 ના બે આઇસોફોર્મ્સ બીજા, ઓછા સામાન્ય, આઇસોફોર્મ સિવાય સમાન સિક્વન્સ ધરાવે છે, જે પ્રથમ આઇસોફોર્મના ક્રમમાં જોવા મળતા પ્રથમ 42 એમિનો એસિડ્સને કાઢે છે. અન્ય માનવ પ્રોટીનના સંબંધમાં, TMEM269 મેથિઓનાઇન, સેરીન, ફેનીલાલાનાઇન અને લ્યુસીનથી સમૃદ્ધ છે, જ્યારે તેમાં ગ્લુટામિક એસિડ, ગ્લુટામાઇન અને આર્જિનિનની ઓછી ટકાવારી છે. TMEM269 નું અનુમાનિત પરમાણુ વજન 26.9 kDa છે અને અનુમાનિત આઇસોઇલેક્ટ્રિક બિંદુ 6.7 છે. અનુવાદ પછીના ફેરફારો TMEM269 માટે એન-મિરિસ્ટોલિયેશનની ચાર અનુમાનિત સાઇટ્સ છે (એમિનો એસિડની સ્થિતિ પર 89-94,102-107,113-118,137-142). એન-મિરિસ્ટોયલેશન સિગ્નલ ટ્રાન્સડક્શન, પ્રોટીન સ્થિરતા અને પટલમાં પ્રોટીનની હેરફેરમાં સામેલ હોઈ શકે છે. આ એન-મિરિસ્ટોલીએશન સાઇટ્સની આગાહી ઉંદર, ચિકન અને ઝેબ્રાફિશ સહિતના મનુષ્યો ઉપરાંત વિવિધ મોડેલ સજીવોમાં કરવામાં આવે છે. TMEM269 પ્રોટીન પર O-લિંક્ડ ગ્લાયકોસિલેશનની બે અનુમાનિત સાઇટ્સ છે; આ પ્રકારનો ફેરફાર પ્રોટીનની રચના, સ્થિરતા અને મલ્ટીમેરિક પ્રોટીન એસેમ્બલીને નિયંત્રિત કરી શકે છે. આ આગાહીઓ યિનોયાંગ પોસ્ટ ટ્રાન્સલેશનલ મોડિફિકેશન આગાહી અલ્ગોરિધમ પર 0.50 નેટફોસ થ્રેશોલ્ડને વટાવી જનારી સાઇટ્સ પર આધારિત છે આ સાઇટ્સ પ્રોટીન પર એમિનો એસિડની સ્થિતિ 35 અને 125 પર સ્થિત છે. સબસેલ્યુલર સ્થાનિકીકરણ સબસેલ્યુલર સ્થાનિકીકરણ આગાહીઓ સૂચવે છે કે TMEM269 એન્ડોપ્લાઝ્મિક રેટિક્યુલમ અને પ્લાઝ્મા પટલમાં સ્થિત હોવાની સૌથી મજબૂત સંભાવના ધરાવે છે. સાયટપ્લાજ્મિક/ન્યુક્લિયર ભેદભાવ માટે રેઇનહાર્ટની પદ્ધતિ માનવ TMEM269 પ્રોટીનને 94.1 ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓના વિશ્વસનીયતા સ્કોર સાથે સાયટોપ્લાઝ્મિક હોવાની આગાહી કરે છે એક અભ્યાસમાં TMEM269ને યીસ્ટ ટુ-હાઇબ્રિડ સ્ક્રિનિંગ દ્વારા પ્રોટીન Fam183b સાથે બિન-પ્રોમિસ્ક્યુસ ક્રિયાપ્રતિક્રિયા માટે ઉમેદવાર તરીકે નક્કી કરવામાં આવ્યું છે. ફેમ183બીને ઝેનોપસમાં ગતિશીલ સિલિયા માટે આવશ્યક તરીકે દર્શાવવામાં આવ્યું છે પરંતુ ફેમ183બી કાર્યક્ષમતાના નુકસાનના અભ્યાસોમાં ઉંદરોનો ઉપયોગ કરીને કરવામાં આવેલા પ્રયોગોમાં કોઈ ખામી (સિલિયા અથવા અન્યથા) જોવા મળી નથી. TMEM269 એ બે પ્રોટીનમાંથી એક હતું જેને આ પ્રોટીન સાથે સંભવિત ક્રિયાપ્રતિક્રિયા તરીકે ઓળખવામાં આવ્યું હતું. ઇવોલ્યુશન TMEM269 તમામ જડબાના કરોડઅસ્થિધારી પ્રાણીઓમાં સંરક્ષિત છે પરંતુ તેમાં સાયક્લોસ્ટોમી, અપૃષ્ઠવંશી અથવા બિન-પ્રાણી જીવન સ્વરૂપોમાં ઓર્થોલોગ્સ નથી. કોન્ડ્રિચથિઝ અથવા કાર્ટિલાજિનસ માછલી એ સજીવોના જૂથ છે જે મનુષ્યો સાથે સૌથી વધુ દૂરથી સંબંધિત છે જે હજુ પણ TMEM269 ઓર્થોલોગ ધરાવે છે. મોટાભાગની કાર્ટિલાજિનસ માછલીઓ માટે હોમો સેપિયન્સથી અલગ થવાની અંદાજિત ઉત્ક્રાંતિ તારીખ 46.4 કરોડ વર્ષ પહેલાંની હોવાનો અંદાજ છે. ઓર્થોલોગ્સના ક્રમની માહિતીના આધારે, પ્રોટીનનું માનવ સંસ્કરણ માછલીમાં તેના સૌથી દૂરના ઓર્થોલોગ્સ સાથે લગભગ 50-60% ની એમિનો એસિડ ઓળખ ધરાવે છે અને સસ્તન પ્રાણીઓમાં નજીકના ઓર્થોલોગ્સ માટે 70 થી 98 ટકા (વધુ નજીકથી સંબંધિત જૂથો માટે ઉચ્ચ ટકાવારી જેમ કે વાંદરાઓ). TMEM269 પાસે કોઈ સ્પષ્ટ રીતે ઓળખી શકાય તેવા પેરાલોગ નથી. ઉત્ક્રાંતિના દરને સમજવાનું એક માપ એ નક્કી કરવાનું છે કે અન્ય પ્રોટીનની તુલનામાં ક્રમ કેટલો ઝડપથી અલગ થઈ રહ્યો છે. ઝડપથી બદલાતા પ્રોટીન ફાઇબ્રિનોજેન આલ્ફા ચેઇન અને ધીમે ધીમે બદલાતા પ્રોટીન સાયટોક્રોમ સીની સરખામણીમાં TMEM269 ઓર્થોલોગ્સમાં મધ્યમ દરે અલગ થઈ રહ્યું છે.