Gard model
ઉત્ક્રાંતિ જીવવિજ્ઞાનમાં, GARD (ગ્રેડેડ ઓટોકેટાલિસિસ રેપ્લિકેશન ડોમેન) મોડેલ એ હોમિયોસ્ટેટિક-વૃદ્ધિ અને રચનાત્મક-એસેમ્બલીઓના વિખંડન માટેનું એક સામાન્ય ગતિશીલ મોડેલ છે, જેમાં લિપિડ્સ તરફ ચોક્કસ ઉપયોગ થાય છે. એબિયોજેનેસિસના સંદર્ભમાં, લિપિડ-વર્લ્ડ સૂચવે છે કે લિપિડ્સ જેવા સરળ અણુઓની એસેમ્બલી માહિતીનો સંગ્રહ અને પ્રસાર કરી શકે છે, આમ ઉત્ક્રાંતિમાંથી પસાર થાય છે. આ 'રચનાત્મક સંમેલનો' જીવનની ઉત્પત્તિમાં ભૂમિકા ભજવવા માટે સૂચવવામાં આવ્યા છે. વિચાર એ છે કે પેઢીઓ દરમિયાન સ્થાનાંતરિત થતી માહિતી એ રચનાત્મક માહિતી છે-એસેમ્બલીની અંદર અણુઓના વિવિધ પ્રકારો અને જથ્થા. આ આર. એન. એ. અથવા ડી. એન. એ. માં એન્કોડેડ માહિતીથી અલગ છે, જે આવા અણુમાં પાયાનો ચોક્કસ ક્રમ છે. આમ, આ મોડેલને આર. એન. એ. વિશ્વ પૂર્વધારણાના વૈકલ્પિક અથવા પૂર્વજ તરીકે જોવામાં આવે છે. મોડેલ એસેમ્બલીના કમ્પોઝિશન વેક્ટરને આ રીતે લખવામાં આવે છેઃ એસેમ્બલીની અંદર લિપિડ પ્રકાર I ની પરમાણુ ગણતરીઓ ક્યાં છે, અને એન. જી. એ છે કે કેટલા વિવિધ લિપિડ પ્રકારો અસ્તિત્વમાં છે (સંગ્રહનું કદ). પરમાણુ પ્રકાર i ની ગણતરીમાં ફેરફાર આ રીતે વર્ણવવામાં આવે છેઃ અને બેઝલ ફોરવર્ડ (જોડાઈ) અને બેકવર્ડ (છોડી) દર સ્થિરાંકો છે, βij એ બિન-નકારાત્મક દર વૃદ્ધિ છે જે અણુ પ્રકાર j દ્વારા પર્યાવરણમાંથી પ્રકાર i પર એસેમ્બલીની અંદર કરવામાં આવે છે, અને ρ એ દરેક અણુ પ્રકારની પર્યાવરણીય સાંદ્રતા છે. β ને નિર્દેશિત, ભારિત, જટિલ નેટવર્ક તરીકે જોવામાં આવે છે. એસેમ્બલીનું વર્તમાન કદ છે. એકવાર એસેમ્બલી મહત્તમ કદ, એન. એમ. એ. એક્સ., સામાન્ય રીતે એન. જી. ના ક્રમમાં પહોંચે તે પછી વિખંડન ક્રિયા લાદીને સિસ્ટમને સંતુલનથી દૂર રાખવામાં આવે છે. આ વિભાજન ક્રિયા સમાન કદના બે સંતાન પેદા કરે છે, અને જેમાંથી એક ફરીથી ઉગાડવામાં આવે છે. આ મોડેલ ગિલેસ્પી અલ્ગોરિધમનો ઉપયોગ કરીને મોન્ટે કાર્લો અલ્ગોરિધમ આધારિત સિમ્યુલેશનને આધિન છે. 2010 માં, ઇઓર્સ સ્ઝાથમેરી અને સહયોગીઓએ GARD ને મૂળ ચયાપચય-પ્રથમ અનુભૂતિ તરીકે પસંદ કર્યું છે. તેઓએ મોડેલમાં પસંદગી ગુણાંક રજૂ કર્યો છે, જે એસેમ્બલીઓના વિકાસ દરમાં વધારો અથવા ઘટાડો કરે છે, જે તે આપેલ લક્ષ્ય સાથે કેટલા સમાન અથવા અસમાન છે તેના આધારે છે. તેમને જાણવા મળ્યું કે એસેમ્બલીઓની રેન્કિંગ પસંદગીના દબાણથી અસરગ્રસ્ત નથી, અને તારણ કાઢ્યું કે GARD ડાર્વિનિયન ઉત્ક્રાંતિનું પ્રદર્શન કરતું નથી. 2012માં એવું દર્શાવવામાં આવ્યું હતું કે આ ટીકા ખોટી છે અને ડોરોન લેન્સેટ અને ઓમર માર્કોવિચે તેનું ખંડન કર્યું હતું. 2010ના પેપરની બે મુખ્ય ખામીઓ હતીઃ (1) તેઓએ સામાન્ય સભા પર ધ્યાન કેન્દ્રિત કર્યું છે અને કોમ્પોઝોમ અથવા કોમ્પોટાઇપ પર નહીં (અનુક્રમે વિશ્વાસુપણે પ્રતિકૃતિ અને ક્વાસિસ પ્રજાતિઓ); (2) તેમણે પસંદગીની ક્ષમતાને ચકાસવા માટે માત્ર એક જ, રેન્ડમ, સિમ્યુલેશન કર્યું છે. ક્વાસિસ પ્રજાતિ ક્વાસિસ પ્રજાતિ મોડેલ પ્રતિકૃતિઓની વસ્તીનું વર્ણન કરે છે જે પ્રમાણમાં ઉચ્ચ પરિવર્તન સાથે પ્રતિકૃતિ બનાવે છે. પરિવર્તન અને પીઠના પરિવર્તનને કારણે વસ્તી આખરે મુખ્ય-પ્રતિકૃતિ (મુખ્ય ક્રમ) ની આસપાસ કેન્દ્રિત થાય છે. જી. એ. આર. ડી. ની વસ્તી માસ્ટર-કોમ્પોટાઇપની આસપાસ ક્વાસિસ પ્રજાતિ બનાવે છે અને આર. એન. એ. વાયરસ જેવી ક્લાસિકલ ક્વાસિસ પ્રજાતિઓની જેમ ભૂલ આપત્તિ દર્શાવે છે. એબીઓજેનેસિસ પ્રોટોસેલ રેફરન્સ બાહ્ય કડીઓ GARD10 MATLAB કોડ પણ જુઓ (માર્કોવિચ અને લેન્સેટ, 2012 જુઓ): https://github.com/ModelingOriginsofLife/GARD વીઝમેન ઇન્સ્ટિટ્યૂટ ઓફ સાયન્સ ખાતે ડોરોન લેન્સેટ હોમપેજ, જે GARDના શોધક છે. વેઇઝમેન ઇન્સ્ટિટ્યૂટ ખાતે જીવનની ઉત્પત્તિ (OOL). ઉત્ક્રાંતિવાદી જીવવિજ્ઞાન જીવનની ઉત્પત્તિ સ્ટોકેસ્ટિક સિમ્યુલેશન