Methyl-CpG-binding domain
મોલેક્યુલર બાયોલોજીમાં મિથાઈલ-સી. પી. જી.-બાઈન્ડીંગ ડોમેન (એમ. બી. ડી.) ડીએનએ સાથે જોડાય છે જેમાં એક અથવા વધુ સમપ્રમાણતાવાળા મિથાઇલેટેડ સી. પી. જી. હોય છે. એમ. બી. ડી. બિન-મિથાઈલેટેડ ડી. એન. એ. માટે નગણ્ય બિન-વિશિષ્ટ આકર્ષણ ધરાવે છે. ક્રોમોસોમલ પ્રોટીન એમ. ઇ. સી. પી. 2 સાથે ઈન વિટ્રો ફૂટ-પ્રિન્ટિંગ દર્શાવે છે કે એમ. બી. ડી. મિથાઈલ સી. પી. જી. જોડીની આસપાસના 12 ન્યુક્લિયોટાઇડ ક્ષેત્રનું રક્ષણ કરી શકે છે. સીપીજી ડાઇન્યુક્લિયોટાઇડ્સ ખાતે ડીએનએ મિથાઇલેશન, યુકેરીયોટ્સમાં સૌથી સામાન્ય ડીએનએ ફેરફાર, ક્રોમેટિન માળખામાં ફેરફાર, જીનોમિક છાપ, ટ્રાન્સપોસન અને રંગસૂત્ર એક્સ નિષ્ક્રિયતા, તફાવત અને કેન્સર જેવી વિવિધ ઘટનાઓ સાથે સંકળાયેલું છે. ડીએનએ મિથાઇલેશનની અસરો પ્રોટીન દ્વારા મધ્યસ્થી કરવામાં આવે છે જે સપ્રમાણ રીતે મિથાઇલેટેડ સી. પી. જી. સાથે જોડાય છે. આવા પ્રોટીનમાં ~ 70 અવશેષોનું ચોક્કસ ક્ષેત્ર હોય છે, મિથાઈલ-સી. પી. જી.-બંધનકર્તા ક્ષેત્ર (એમ. બી. ડી.), જે ક્રોમેટિન સાથે સંકળાયેલા વધારાના ક્ષેત્રો સાથે જોડાયેલું હોય છે, જેમ કે બ્રોમોડોમેન, એ. ટી. હૂક મોટિફ, સેટ ક્ષેત્ર અથવા પી. એચ. ડી. આંગળી. એમ. બી. ડી. ધરાવતા પ્રોટીન માળખાકીય પ્રોટીન તરીકે કામ કરે છે, જે વિવિધ હિસ્ટોન ડેસિટીલેઝ (એચ. ડી. એ. સી.) સંકુલ અને ક્રોમેટિન રિમોડેલિંગ પરિબળોની ભરતી કરે છે, જે ક્રોમેટિન કોમ્પેક્શન તરફ દોરી જાય છે અને પરિણામે, ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ દમન તરફ દોરી જાય છે. એમ. ઇ. સી. પી. 2, એમ. બી. ડી. 1, એમ. બી. ડી. 2, એમ. બી. ડી. 4 અને બી. એ. ઝેડ. 2 ની એમ. બી. ડી. ડીએનએ સાથે બંધનકર્તા છે, અને એમ. ઇ. સી. પી. 2, એમ. બી. ડી. 1 અને એમ. બી. ડી. 2 ના કિસ્સાઓમાં, પ્રાધાન્યમાં મિથાઇલેટેડ સી. પી. જી. માટે મધ્યસ્થી કરે છે. માનવ એમ. બી. ડી. 3 અને એસ. ઈ. ટી. ડી. બી. 1 માં, એમ. બી. ડી. પ્રોટીન-પ્રોટીનની ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓમાં મધ્યસ્થી કરે છે તેવું દર્શાવવામાં આવ્યું છે. એમ. બી. ડી. ડીએનએ ડીમીથાઇલેઝમાં પણ જોવા મળે છે. એમ. બી. ડી. આલ્ફા/બીટા સેન્ડવિચ માળખામાં ફોલ્ડ થાય છે જેમાં ટ્વિસ્ટેડ બીટા શીટના સ્તરનો સમાવેશ થાય છે, જે આલ્ફા 1 હેલિક્સ દ્વારા રચાયેલા અન્ય સ્તર અને સી ટર્મિનસ પર હેરપિન લૂપ દ્વારા સમર્થિત છે. આ સ્તરો બંને એમ્ફીપેથિક છે, જેમાં આલ્ફા 1 હેલિક્સ અને બીટા શીટ સમાંતર આવેલા છે અને હાઇડ્રોફોબિક ચહેરાઓ એકબીજા સામે ચુસ્ત રીતે ભરેલા છે. બીટા શીટ બે લાંબા આંતરિક સ્ટ્રેન્ડ્સ (બીટા 2 અને બીટા 3) થી બનેલી છે, જે બે ટૂંકા બાહ્ય સ્ટ્રેન્ડ્સ (બીટા 1 અને બીટા 4) દ્વારા સેન્ડવિચ થયેલ છે. મિથાઇલેટેડ ડીએનએ સાથે જોડાયેલા એમબીડી ડોમેનનું માળખું હલ કરવામાં આવ્યું છે (). તે મિથાઇલેટેડ સ્થળો પર મુખ્ય ખાંચના હાઇડ્રેશનને ઓળખે છે. સંદર્ભો પ્રોટીન ક્ષેત્રો