B-box zinc finger
મોલેક્યુલર બાયોલોજીમાં બી-બોક્સ-પ્રકારનું ઝિંક ફિંગર ડોમેન લંબાઈમાં લગભગ 40 એમિનો એસિડ અવશેષોનું ટૂંકું પ્રોટીન ડોમેન છે. બી-બોક્સ ઝિંક આંગળીઓને બે જૂથોમાં વહેંચી શકાય છે, જ્યાં પ્રકાર 1 અને 2 બી-બોક્સ ડોમેન્સ તેમના સર્વસંમતિ ક્રમમાં અને 7-8 ઝિંક-બંધનકર્તા અવશેષોના અંતરમાં અલગ પડે છે. કેટલાક પ્રોટીનમાં બંને પ્રકારના 1 અને 2 બી-બોક્સ હોય છે, જે આ બે ક્ષેત્રો વચ્ચે અમુક સ્તરની સહકારિતા સૂચવે છે. ઘટના બી-બોક્સ ક્ષેત્રો વિવિધ સજીવોના 1500 થી વધુ પ્રોટીનમાં જોવા મળે છે. તેઓ TRIM (ત્રિપક્ષીય મોટિફ) પ્રોટીનમાં જોવા મળે છે જેમાં એન-ટર્મિનલ રિંગ ફિંગર (મૂળરૂપે એ-બોક્સ તરીકે ઓળખાતી) હોય છે, ત્યારબાદ 1-2 બી-બોક્સ ડોમેન અને કોઇલ્ડ-કોઇલ ડોમેન (જેને રિંગ, બી-બોક્સ, કોઇલ્ડ-કોઇલ માટે આરબીસીસી પણ કહેવાય છે) હોય છે. TRIM પ્રોટીનમાં પ્રકાર 2 બી-બોક્સ ડોમેન હોય છે, અને તેમાં પ્રકાર 1 બી-બોક્સ પણ હોઈ શકે છે. પ્રોટીનમાં કે જેમાં રિંગ અથવા કોઇલ-કોઇલ ડોમેન નથી, બી-બોક્સ ડોમેન મુખ્યત્વે પ્રકાર 2 છે. ઘણા પ્રકાર 2 બી-બોક્સ પ્રોટીન સર્વવ્યાપકતામાં સામેલ છે. બી-બોક્સ ઝિંક ફિંગર ડોમેન ધરાવતા પ્રોટીનમાં ટ્રાન્સક્રિપ્શન પરિબળો, રિબોન્યુક્લિયોપ્રોટીન અને પ્રોટો-ઓન્કોપ્રોટીનનો સમાવેશ થાય છે; ઉદાહરણ તરીકે, MID1, MID2, TRIM9, Tએનએલ, TRIM36, TRIM63, TRIFIC, NCL1 અને CONSTANS જેવા પ્રોટીન. માઇક્રોટ્યુબ્યુલ-સંકળાયેલ E3 લિગેઝ MID1 (ઇસી) પ્રકાર 1 બી-બોક્સ ઝિંક ફિંગર ડોમેન ધરાવે છે. MID1 ખાસ કરીને આલ્ફા-4 ને જોડે છે, જે બદલામાં ફોસ્ફેટેઝ 2A (PP2Ac) ના ઉત્પ્રેરક પેટા એકમની ભરતી કરે છે. પ્રોટીઝોમ-મધ્યસ્થ અધોગતિ માટે પી. પી. 2. એ. સી. ના લક્ષ્યાંક માટે આ સંકુલ જરૂરી છે. MID1 B-બોક્સ બે ઝિંક આયનોને સંકલન કરે છે અને બીટા/બીટા/આલ્ફા ક્રોસ-બ્રેસ માળખું અપનાવે છે જે ઝેડઝેડ, પીએચડી, રિંગ અને એફવાયવીઇ ઝિંક આંગળીઓ જેવું જ છે. હોમોલોગ્સ ડોમેનના પ્રોકેરીયોટિક હોમોલોગ્સ કેટલાક બેક્ટેરિયલ વંશજો અને મિથેનોજેનિક આર્કિયામાં હાજર છે, અને ઘણીવાર રોમ્બોઇડ જેવા સેરીન પેપ્ટિડેઝ અને ઝેડએન-આધારિત મેટાલોપેપ્ટિડેઝ જેવા પેપ્ટિડેઝ ડોમેન્સમાં ફ્યુઝન દર્શાવે છે. અન્ય આવૃત્તિઓમાં સામાન્ય રીતે ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન હેલિસીસ હોય છે અને તે ડીએનએજે, એફએચએ, એસએચ3, ડબલ્યુડી40 અને ટેટ્રાટ્રિકોપેપ્ટાઇડ રિપીટ્સ જેવા ડોમેન્સમાં ફ્યુઝન પણ બતાવી શકે છે. એકસાથે આ સંગઠનો પ્રોટીઓલિટિક પ્રક્રિયા, પટલ-સંકળાયેલ પ્રોટીનની ફોલ્ડિંગ અથવા સ્થિરતામાં બી-બોક્સ ઝિંક ફિંગર ડોમેનના પ્રોકેરીયોટિક હોમોલોગ્સ માટે ભૂમિકા સૂચવે છે. ડોમેન આર્કિટેક્ચરલ વાક્યરચના એ એ. એન. 1 ઝિંક ફિંગર અને એલ. આઈ. એમ. ડોમેન્સના પ્રોકેરીયોટિક હોમોલોગ્સમાં જોવા મળતી નોંધપાત્ર રીતે સમાન છે. સંદર્ભો પ્લાન્ટ TFDB: પ્લાન્ટ ટ્રાન્સક્રિપ્શન ફેક્ટર ડેટાબેઝ પર CO-જેવા કુટુંબ, DBB કુટુંબની બાહ્ય કડીઓ પણ જુઓ ઝિંક ફિંગર પ્રોટીન ડોમેન્સ