Vitamin B12-binding domain
મોલેક્યુલર બાયોલોજીમાં, વિટામિન બી12-બંધનકર્તા ક્ષેત્ર એ પ્રોટીન ક્ષેત્ર છે જે કોબાલામિન (વિટામિન બી12) સાથે જોડાય છે. તે કોબાલામિન કોફેક્ટરના બે અલગ-અલગ સ્વરૂપોને જોડી શકે છે, જેમાં કોબાલ્ટ મિથાઈલ જૂથ (મિથાઈલકોબાલામિન) અથવા 5 '-ડિઓક્સીએડેનોસિન (એડેનોસિલકોબાલામિન) સાથે બંધાયેલ છે. કોબાલામિન-બંધનકર્તા ક્ષેત્રો મુખ્યત્વે પ્રાણીઓ અને પ્રોકેરીયોટ્સમાં હાજર ઉત્સેચકોના બે પરિવારોમાં જોવા મળે છે, જે કોબાલ્ટ-કાર્બન બંધ પર અલગ પ્રકારની પ્રતિક્રિયાઓ કરે છે. ઉત્સેચકો કે જેને મિથાઈલકોબાલામિનની જરૂર હોય છે તે મિથાઈલ ટ્રાન્સફર પ્રતિક્રિયાઓ કરે છે. ઉત્સેચકો કે જેને એડેનોસિલકોબાલામિનની જરૂર હોય તે પ્રતિક્રિયાઓને ઉત્પ્રેરિત કરે છે જેમાં પ્રથમ પગલું એ એડેનોસિલકોબાલામિનનું વિભાજન છે જે કોબ (II) એલામિન અને 5 '-ડિઓક્સીએડેનોસિલ રેડિકલ બનાવે છે, અને આમ આમૂલ જનરેટર તરીકે કાર્ય કરે છે. બંને પ્રકારના ઉત્સેચકોમાં B12-બંધનકર્તા ક્ષેત્ર કોબાલામિન કોફેક્ટર્સના કોબાલ્ટ અણુને બાંધવા માટે હિસ્ટિડીનનો ઉપયોગ કરે છે. આ હિસ્ટિડાઇન DXHXXG અનુક્રમમાં સમાયેલ છે, જે ડોમેનની સૌથી વધુ સંરક્ષિત પ્રાથમિક અનુક્રમ રચના છે. કોબાલામિન-બંધનકર્તા ક્ષેત્ર ધરાવતા પ્રોટીનમાં નીચેનાનો સમાવેશ થાય છેઃ એનિમલ અને પ્રોકેરીયોટિક મેથિઓનાઇન સિન્થેઝ (), જે મિથાઈલ-કોબાલામિનથી હોમોસિસ્ટીનમાં મિથાઈલ જૂથના સ્થાનાંતરણને ઉત્પ્રેરિત કરે છે, જે એન્ઝાઇમ-બાઉન્ડ કોબ (I) એલામિન અને મેથિઓનાઇન આપે છે. પ્રાણી અને પ્રોકેરીયોટિક મિથાઈલમેલોનીલ-કોએ મ્યુટેઝ (), જે પ્રોપિઓનિલ-કોએ દ્વારા ટ્રાઇકાર્બોક્સિલિક એસિડ ચક્રમાં કેટલાક એમિનો એસિડ, ઓડ-ચેઇન ફેટી એસિડ અને કોલેસ્ટ્રોલના અધઃપતનમાં સામેલ છે. પ્રોકેરીયોટિક લાઇસિન 5,6-એમિનોમ્યુટેઝ (). પ્રોકેરીયોટિક ગ્લુટામેટ મ્યુટેઝ (). પ્રોકેરીયોટિક મિથાઇલીનગ્લુટેરેટ મ્યુટેઝ (). પ્રોકેરીયોટિક આઇસોબ્યુટ્રીલ-કોએ મ્યુટેઝ (). કોબાલામિન-બંધનકર્તા ક્ષેત્રની મુખ્ય રચના પાંચ-ફસાયેલા આલ્ફા/બીટા (રોસમેન) ફોલ્ડ દ્વારા વર્ગીકૃત થયેલ છે, જેમાં ત્રણ સ્તરો (આલ્ફા/બીટા/આલ્ફા) માં 4-5 આલ્ફા હેલિસીસથી ઘેરાયેલા 5 સમાંતર બીટા-શીટ્સ હોય છે. કોબાલામિનને બાંધવા પર, બંધનકર્તા સ્થળના મહત્વના ઘટકો સંરચિત હોવાનું જણાય છે, જેમાં આલ્ફા-હેલિક્સનો સમાવેશ થાય છે, જે કોફેક્ટરની ન્યુક્લિયોટાઇડ 'પૂંછડી' ને સમાવતી ફાટની એક બાજુએ રચાય છે. કોબાલામિનમાં, કોબાલ્ટ અણુ ક્યાં તો મુક્ત (ડી. એમ. બી.-ઓફ) હોઈ શકે છે અથવા પી. એચ. અનુસાર ડાઇમિથાઇલબેન્ઝીમિડાઝોલ (ડી. એમ. બી.-ઓન) સાથે બંધાયેલો હોઈ શકે છે. જ્યારે કોબાલામિન-બંધનકર્તા ક્ષેત્ર સાથે બંધાયેલ હોય, ત્યારે ડાઇમિથાઇલબેન્ઝીમિડાઝોલ લિગાન્ડને DXHXXG મોટિફના સક્રિય હિસ્ટિડીન (હિસ-ઓન) દ્વારા બદલવામાં આવે છે. હિસ્ટિડાઇન દ્વારા ડાઇમિથાઇલબેન્ઝીમિડાઝોલનું સ્થાનાંતર ઉત્પ્રેરક અને સક્રિયકરણ ચક્ર વચ્ચે ફેરવવાની મંજૂરી આપે છે. મેથિઓનાઇન સિન્થેઝમાં કોબાલામિન કોફેક્ટર કોબાલામિન-બંધનકર્તા ડોમેન અને આશરે 90 અવશેષો એન-ટર્મિનલ ડોમેન વચ્ચે સેન્ડવિચ કરવામાં આવે છે, જે બે જોડી વિરોધી સમાંતર હેલિસીસનો સમાવેશ કરતું હેલિકલ બંડલ બનાવે છે. આ એન-ટર્મિનલ ડોમેન 4-હેલિકલ બંડલ કેપ બનાવે છે, આ એન્ઝાઇમની સક્રિય રચનામાં રૂપાંતરમાં, 4-હેલિકલ કેપ કોબાલામિન કોફેક્ટરને સક્રિયકરણ ડોમેનને બાંધવા માટે પરવાનગી આપે છે. સંદર્ભો પ્રોટીન ક્ષેત્રો