Iron dependent repressor
મોલેક્યુલર બાયોલોજીમાં, આયર્ન આધારિત રિપ્રેસર એ બેક્ટેરિયલ અને આર્કિયલ ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ રિપ્રેસરનો પરિવાર છે. તેમના એન-ટર્મિનસ પર તેઓ dtxR-પ્રકારનું HTH ડોમેન ધરાવે છે. આ ડી. ટી. એક્સ. આર./એમ. એન. ટી. આર. પરિવારના મેટાલોરેગ્યુલેટર્સમાં હાજર લગભગ 65 એમિનો એસિડનું ડીએનએ-બંધનકર્તા, પાંખવાળા હેલિક્સ-ટર્ન-હેલિક્સ (ડબલ્યુ. એચ. ટી. એચ.) ક્ષેત્ર છે. આ ક્ષેત્રનું નામ આયર્ન-વિશિષ્ટ ડિપ્થેરિયા ટોક્સિન રિપ્રેસર કોરીનેબેક્ટેરિયમ ડિપ્થેરીયા ડીટીએક્સઆર અને મેંગેનીઝ પરિવહન નિયંત્રક બેસિલસ સબટિલિસ એમએનટીઆર પરથી રાખવામાં આવ્યું છે. ડી. ટી. એક્સ. આર. અને આઈ. ડી. આર. જેવા આયર્ન-રિસ્પોન્સિવ મેટાલોરેગ્યુલેટર્સ ઉચ્ચ જી. સી. શાખાના ગ્રામ-પોઝિટિવ બેક્ટેરિયામાં જોવા મળે છે, જ્યારે એમ. એન. ટી. આર. જેવા મેંગેનીઝ-રિસ્પોન્સિવ મેટાલોરેગ્યુલેટર્સને ગ્રામ-પોઝિટિવ અને ગ્રામ-નેગેટિવ બેક્ટેરિયાની વિવિધ જાતિઓમાં અને આર્કિયામાં પણ વર્ણવવામાં આવે છે. ડી. ટી. એક્સ. આર./એમ. એન. ટી. આર. જેવા મેટાલોરેગ્યુલેટર્સમાં સામાન્ય રીતે એન-ટર્મિનલ ભાગમાં ડીએનએ-બંધનકર્તા ડી. ટી. એક્સ. આર.-પ્રકારનો એચ. ટી. એચ. ડોમેન હોય છે. સી-ટર્મિનલ ભાગમાં બે મેટલ-બાઇન્ડિંગ સાઇટ્સ સાથે ડાયમેરાઇઝેશન ડોમેન છે, જો કે એમએન (II)-રેગ્યુલેટર્સમાં પ્રાથમિક મેટલ-બાઇન્ડિંગ સાઇટ ઓછી સંરક્ષિત છે. ફે (II)-નિયંત્રિત પ્રોટીનમાં સી-ટર્મિનલ એક્સ્ટેંશન તરીકે એસએચ3 જેવા ડોમેન હોય છે, જે એમએન (II)-નિયંત્રિત એમએનટીઆરમાં ગેરહાજર હોય છે. ધાતુ-આયન આધારિત નિયમનકારો કેટલાક મહત્વપૂર્ણ માનવ પેથોજેન્સના વાઈરલન્સની રચના કરે છે. ડી. ટી. એક્સ. આર. પ્રોટીન પર્યાવરણીય આયર્નની સાંદ્રતાના જવાબમાં ડિપ્થેરિયા ઝેરની અભિવ્યક્તિને નિયંત્રિત કરે છે. વધુમાં, ડી. ટી. એક્સ. આર. અને આઈ. ડી. આર. આયર્ન ગ્રહણને નિયંત્રિત કરે છે. મેંગેનીઝનું હોમિયોસ્ટેસિસ, જે એક આવશ્યક પોષક તત્વ છે, તે એમ. એન. ટી. આર. દ્વારા નિયંત્રિત થાય છે. એક લાક્ષણિક ડી. ટી. એક્સ. આર.-પ્રકારનું મેટાલોરેગ્યુલેટર મોનોમર દીઠ બે ડાયવેલેન્ટ મેટલ ઇફેક્ટર્સને જોડે છે, જેના પર એલોસ્ટેરિક ફેરફારો થાય છે જે કોગ્નેટ ડીએનએ ઓપરેટરો સાથે મધ્યમ બંધન કરે છે. આયર્ન-બાઉન્ડ ડીટીએક્સઆર હોમોડિમર્સ 19 બી. પી. ના વિક્ષેપિત પેલિંડ્રોમ સાથે જોડાય છે, જે ~ 30 બી. પી. ના ક્રમનું રક્ષણ કરે છે. આયર્ન-રેગ્યુલેટેડ અને મેંગેનીઝ-રેગ્યુલેટેડ રિપ્રેસરની સ્ફટિક રચનાઓ દર્શાવે છે કે ડીએનએ બંધનકર્તા ક્ષેત્રમાં ત્રણ આલ્ફા-હેલિસીસ અને એન્ટિપેરેલલ બીટા-સ્ટ્રેન્ડ્સની જોડી હોય છે. હેલીસ 2 અને 3 માં હેલિક્સ-ટર્ન-હેલિક્સ મોટિફનો સમાવેશ થાય છે અને બીટા-સ્ટ્રેન્ડ્સને વિંગ કહેવામાં આવે છે. આ ડબલ્યુ. એચ. ટી. એચ. ટોપોલોજી એલ. આઈ. એસ. આર.-પ્રકાર એચ. ટી. એચ. જેવી જ છે. મોટાભાગના ડી. ટી. એક્સ. આર.-પ્રકારનાં મેટાલોરેગ્યુલેટર્સ ડીએનએ મુખ્ય ખાંચ સાથે ડાઇમર તરીકે જોડાય છે. કેટલાક પ્રોટીનમાં dtxR-પ્રકારનું HTH ડોમેન હોવાનું જાણીતું છે. તેમાં નીચેનાનો સમાવેશ થાય છેઃ કોરીનેબેક્ટેરિયમ ડિપ્થેરીયા ડીટીએક્સઆર, એક ડિપ્થેરિયા ટોક્સિન રિપ્રેસર, જે ઉચ્ચ-આકર્ષણ આયર્ન ગ્રહણ પ્રણાલી, અન્ય આયર્ન-સંવેદનશીલ જનીનો અને બેક્ટેરિયોફેજ ટોક્સ જનીનની અભિવ્યક્તિને નિયંત્રિત કરે છે. મેટલ-બાઉન્ડ ડી. ટી. એક્સ. આર. ટોક્સ ઓપરેટરને બાંધીને ટ્રાન્સક્રિપ્શનને દબાવે છે; જો આયર્ન મર્યાદિત હોય, તો ડબલ્યુ. એચ. ટી. એચ. ના રચનાત્મક ફેરફારો ડીએનએ-બંધનને વિક્ષેપિત કરે છે અને ડિપ્થેરિયા ટોક્સિન ઉત્પન્ન થાય છે. માયકોબેક્ટેરિયમ ટ્યુબરક્યુલોસિસ આઈ. ડી. આર., આયર્ન આધારિત નિયમનકાર છે જે આ રોગકારક માટે જરૂરી છે. નિયમનકાર આયર્ન સંપાદન માટે જનીનોને દબાવે છે અને આયર્ન સંગ્રહ જનીનોને સક્રિય કરે છે, અને ઓક્સિડેટીવ તણાવ પ્રતિસાદોનું સકારાત્મક નિયમનકાર છે. બેસિલસ સબટિલિસ એમ. એન. ટી. આર., એક મેંગેનીઝ પરિવહન નિયમનકાર, એમ. એન. 2 + ને પ્રભાવક તરીકે જોડે છે અને મેંગેનીઝની આયાત માટે પરિવહનકર્તાઓનું ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ રિપ્રેસર છે. ટ્રેપોનેમા પેલિડમ ટ્રોઆર, એક ધાતુ આધારિત ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ રિપ્રેસર છે. આર્કિયોગ્લોબસ ફુલગિડસ એમ. ડી. આર. 1 (ટી. ઓ. આર.), એક ધાતુ આધારિત ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ રિપ્રેસર છે, જે તેના પોતાના ટ્રાન્સક્રિપ્શનને નકારાત્મક રીતે નિયંત્રિત કરે છે. સંદર્ભો પ્રોટીન ક્ષેત્રો