Miniature Inverted-repeat Transposable Elements
લઘુચિત્ર ઇન્વર્ટેડ-રિપીટ ટ્રાન્સપોઝેબલ એલિમેન્ટ્સ (એમ. આઈ. ટી. ઇ.) એ બિન-સ્વાયત્ત વર્ગ II ટ્રાન્સપોઝેબલ એલિમેન્ટ્સ (ડી. એન. એ. સિક્વન્સ) નું જૂથ છે. બિન-સ્વાયત્ત હોવાથી, એમ. આઈ. ટી. ઈ. તેમના પોતાના ટ્રાન્સપોઝ માટે કોડ કરી શકતા નથી. તેઓ પ્રાણીઓ, છોડ, ફૂગ, બેક્ટેરિયા અને વાયરસના જીનોમમાં પણ અસ્તિત્વ ધરાવે છે. એમ. આઈ. ટી. ઈ. સામાન્ય રીતે ટૂંકા (50 થી 500 બી. પી.) ઘટકો હોય છે જેમાં ટર્મિનલ ઊંધી પુનરાવર્તનો (ટી. આઈ. આર.; <આઇ. ડી. 1> બી. પી.) અને બે ફ્લેન્કિંગ ટાર્ગેટ સાઇટ ડુપ્લિકેશન (ટી. એસ. ડી.) હોય છે. અન્ય ટ્રાન્સપોસન્સની જેમ, એમ. આઈ. ટી. ઈ. મુખ્યત્વે જનીન-સમૃદ્ધ પ્રદેશોમાં દાખલ કરવામાં આવે છે અને આ એક કારણ હોઈ શકે છે કે તેઓ જનીન અભિવ્યક્તિને અસર કરે છે અને યુકેરીયોટિક ઉત્ક્રાંતિને વેગ આપવામાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવે છે. નાના કદ હોવા છતાં તેમની ઉચ્ચ નકલ સંખ્યા એ રસનો વિષય રહ્યો છે. માઇટની ઉત્પત્તિ માઇટનો વિગતવાર અભ્યાસ દર્શાવે છે કે માઇટ પેટા પરિવારો એક જ જીનોમમાંથી સંબંધિત સ્વાયત્ત ઘટકોમાંથી ઉદ્ભવ્યા છે અને આ પેટા પરિવારો માઇટ પરિવારોની રચના કરે છે. એક પ્રકારનું સ્વાયત્ત તત્વ એક અથવા વધુ માઇટ પરિવારોને જન્મ આપી શકે છે. જાણીતા ટી. ઈ. સુપરફેમિલીઓ સાથે ટી. આઈ. આર. ના ક્રમમાં તેમના સંબંધોના આધારે વર્ગીકરણ, એમ. આઈ. ટી. ઈ. ને ચોક્કસ પરિવારોમાં વર્ગીકૃત કરવામાં આવ્યા છે. ઉદાહરણ તરીકે, ડબલ્યુટ્યુરિસ્ટ, એક્રોબેટ, હાર્ટહીલર એ અમુક છોડની પ્રજાતિઓમાં એમ. આઈ. ટી. ઈ. પરિવારો છે જે ટી. ઈ. સુપરફેમિલી પી. આઈ. એફ./હાર્બિંગર હેઠળ છે. સ્ટોવવે એ ટી. સી. 1/મરીનર ટી. ઈ. સુપરફેમિલીના સંબંધમાં ટી. એસ. ડી. ટી. એ. સાથે પીસમ સેટિવમ એલ. માં એક એમ. આઈ. ટી. ઈ. પરિવાર છે. પિગીબેક સુપરફેમિલી સાથે સંબંધિત સીએમઆઇટીઇએસ તરીકે ઓળખાતા માઇટ્સનું જૂથ અમુક કોરલ પ્રજાતિઓમાં જોવા મળ્યું હતું. જ્યારે મોટાભાગના એમ. આઈ. ટી. ઈ. ને જૂથબદ્ધ કરવામાં આવ્યા છે, ત્યારે તેમાંના કેટલાકને હજુ સુધી તેમના ટી. ઈ. સુપરફેમિલી ફાળવવામાં આવ્યા નથી. આવા પરિવારોમાં અરેબિડોપ્સિસ થાલિયાનામાં એ. ટી. એ. ટી. અને એડીસ એજિપ્ટીમાં જોવા મળતા એ. ટી. ઓ. એન. પરિવારનો સમાવેશ થાય છે. આ ઉપરાંત, ઘણા વધુ માઇટ પરિવારો શોધાય તેવી શક્યતા છે. પ્લાન્ટ જીનોમમાં માઇટ્સની શોધ સૌપ્રથમ છોડમાં થઈ હતી. સી. એ. સી. ટી. એ., એચ. એ. ટી., મ્યુટેટર, પી. આઈ. એફ. અને ટી. સી. 1/મેરિનર સુપરફેમિલીઝ સાથે સંકળાયેલા તત્વોનું વર્ણન કરવામાં આવ્યું છે. તેમના ટર્મિનલ ઊંધી પુનરાવર્તનો અને લક્ષ્ય સ્થળની પ્રતિકૃતિઓની સમાનતાને આધારે, છોડના જીનોમમાં મોટાભાગના એમ. આઈ. ટી. ઈ. ને બે મુખ્ય જૂથોમાં વહેંચવામાં આવે છેઃ પ્રવાસી જેવા એમ. આઈ. ટી. ઈ. (પી. આઈ. એફ. માંથી મેળવેલ) અને સ્ટોવે જેવા એમ. આઈ. ટી. ઈ. (ટી. સી. 1/મરીનરમાંથી મેળવેલ). સ્ટોવે અને પ્રવાસી તત્વો તેમના ક્રમમાં નોંધપાત્ર રીતે અલગ પડે છે. તેમ છતાં, તેઓ નોંધપાત્ર માળખાકીય સમાનતાઓ ધરાવતા હોવાનું જાણવા મળ્યું છે. સ્ટોવે તત્વો લક્ષ્ય સ્થળની વિશિષ્ટતા ધરાવે છે, નાના કદના હોય છે અને સંરક્ષિત ટર્મિનલ ઊંધી પુનરાવર્તન ધરાવે છે. એમ. આઈ. ટી. ઈ. જેવા પ્રવાસીઓમાં પણ આ કેસ નક્કી થાય છે. તેઓ સ્થિર ડીએનએ ગૌણ માળખાં બનાવી શકે છે જે તેમને ઓળખવામાં ખૂબ જ ઉપયોગી થઈ શકે છે. કેટલાક સ્ટોવવે ઘટકોમાં સીઆઈએસ-એક્ટિંગ રેગ્યુલેટરી ડોમેન્સ પણ હોય છે. અન્ય માઈટ સુપરફેમિલીનું પણ છોડમાં વર્ણન કરવામાં આવ્યું છે, જેમ કે કેળામાં એચએટી-પ્રકારનાં માઈટ અને નાઇટશેડ. મકાઈના જિનોમમાં માઇટ ફેમિલી હાર્ટબ્રેકર (એચ. બી. આર.) ની હાજરી અથવા ગેરહાજરીના આધારે આનુવંશિક માર્કર્સ તરીકે માઇટ, એક મોલેક્યુલર માર્કર વિકસાવવામાં આવ્યું હતું. આ એચ. બી. આર. માર્કર્સ સ્થિર હોવાનું સાબિત થયું છે, જે મકાઈના જિનોમમાં સમાનરૂપે વહેંચાયેલું છે. કાસા એટ અલ દ્વારા એક અભ્યાસ. તેમણે દર્શાવ્યું હતું કે એચ. બી. આર. માર્કર્સનો ઉપયોગ અન્ય મોલેક્યુલર માર્કર્સ સાથે મકાઈની સંબંધિત ઇનબ્રેડ રેખાઓના જીનોટાઇપનો અભ્યાસ કરવા માટે થઈ શકે છે. એફ. આઈ. એન. ડી. એમ. આઈ. ટી. ઈ. જેવા કોમ્પ્યુટેશનલ આસિસ્ટન્સ સોફ્ટવેર માઈટ પરિવારોને ઓળખવા માટે અમુક સરેરાશ કદના બી. પી. ની અનુક્રમ એન્ટ્રીઓનો ઉપયોગ કરે છે. ડિટેક્ટમાઈટ નામનો MATLAB-આધારિત કાર્યક્રમ વ્યાપક સ્તરે જિનોમ પર માઇટ્સને શોધી શકે છે અને ચોખાના જિનોમ પર તેનું પરીક્ષણ કરવામાં આવ્યું હતું. મસ્ટ અને માઇટ-હન્ટર જેવા અન્ય સાધનોનો પણ સમાન હેતુઓ માટે ઉપયોગ થાય છે. માઈટ પરિવારોની લાક્ષણિકતા દર્શાવવા માટે યાંગ અને હોલ દ્વારા માઈટ એનાલિસિસ કિટ મેક નામની ટૂલકિટ વિકસાવવામાં આવી છે. સંદર્ભો આનુવંશિક મેપિંગ જીનોમિક્સ