UBA2
યુબીક્વિટિન જેવા 1-સક્રિય એન્ઝાઇમ E1B (UBLE1B), જેને સુમો-સક્રિય એન્ઝાઇમ સબયૂનિટ 2 (SAE2) તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે, તે એક એન્ઝાઇમ છે જે મનુષ્યમાં UBA2 જનીન દ્વારા એન્કોડ કરવામાં આવે છે. નાના પ્રોટીન એસ. યુ. એમ. ઓ. (જુઓ એસ. યુ. એમ. ઓ. 1), અથવા સુમોલેશનના ઉમેરા દ્વારા પ્રોટીનનું અનુવાદ પછીનું ફેરફાર, પ્રોટીન માળખું અને અંતઃકોશિક સ્થાનિકીકરણનું નિયમન કરે છે. એસ. એ. ઈ. 1 અને યુ. બી. એ. 2 હેટેરોડાઇમર બનાવે છે જે પ્રોટીનના સુમોલેશન માટે એસ. યુ. એમ. ઓ.-સક્રિય એન્ઝાઇમ તરીકે કાર્ય કરે છે. માળખું ડીએનએ યુબીએ2 સીડીએનએ ટુકડો 2683 બી. પી. લાંબો છે અને 640 એમિનો એસિડના પેપ્ટાઇડને એન્કોડ કરે છે. અનુમાનિત પ્રોટીન ક્રમ માનવ યુબીએ3 અથવા ઇ1 (યુબીક્વિટિન માર્ગમાં) કરતાં યીસ્ટ યુબીએ2 (35 ટકા ઓળખ) સાથે વધુ સમાન છે. યુબીએ જનીન રંગસૂત્ર 19 પર સ્થિત છે. પ્રોટીન યુ. બી. એ. 2 સબયૂનિટ 72 કે. ડી. એ. ના પરમાણુ વજન સાથે 640 એએ અવશેષો લાંબા હોય છે. તેમાં ત્રણ ક્ષેત્રોનો સમાવેશ થાય છેઃ એડેનાઈલેશન ક્ષેત્ર (એડેનાઈલેશન સક્રિય ક્ષેત્ર ધરાવતું), ઉત્પ્રેરક સી. આઈ. એસ ક્ષેત્ર (થિયોએસ્ટર બંધની રચનામાં ભાગ લેનાર ઉત્પ્રેરક સી. આઈ. એસ. 173 અવશેષ ધરાવતું) અને યુબીક્વિટિન જેવા ક્ષેત્ર. એસ. યુ. એમ. ઓ.-1 ઉત્પ્રેરક સી. આઈ. એસ. ડોમેન અને યુ. બી. એલ. ડોમેન વચ્ચે યુ. બી. એ. 2 સાથે જોડાય છે. મિકેનિઝમ એસ. યુ. એમ. ઓ. સક્રિય એન્ઝાઇમ (ઇ1, એસ. એ. ઈ. 1 અને યુ. બી. એ. 2 નું હેટેરોડાઇમર) એસ. યુ. એમ. ઓ.-1 ને સક્રિય કરવાની અને તેને યુ. બી. સી. 9 (એસ. યુ. એમ. ઓ. ઓ. ઇલેશન માટેનું એકમાત્ર જાણીતું ઇ2) માં સ્થાનાંતરિત કરવાની પ્રતિક્રિયાને ઉત્પ્રેરિત કરે છે. પ્રતિક્રિયા ત્રણ તબક્કામાં થાય છેઃ એડેનાઇલેશન, થિયોએસ્ટર બોન્ડની રચના અને ઇ 2 માં એસ. યુ. એમ. ઓ. ટ્રાન્સફર. પ્રથમ, એસ. યુ. એમ. ઓ. સી-ટર્મિનલ ગ્લાયસીન અવશેષોનું કાર્બોક્સિલ જૂથ એ. ટી. પી. પર હુમલો કરે છે, જે એસ. યુ. એમ. ઓ.-એ. એમ. પી. અને પાયરોફોસ્ફેટ બનાવે છે. આગળ, યુ. બી. એ. 2 સક્રિય સાઇટમાં ઉત્પ્રેરક સિસ્ટીનનું થિયોલ જૂથ એસ. યુ. એમ. ઓ.-એ. એમ. પી. પર હુમલો કરે છે, જે એસ. યુ. એમ. ઓ. ના યુ. બી. એ. 2 અને સી-ટર્મિનલ ગ્લાયસીન વચ્ચે ઉચ્ચ ઊર્જા થિયોએસ્ટર બોન્ડ બનાવે છે અને એ. એમ. પી. મુક્ત કરે છે. છેવટે, એસ. યુ. એમ. ઓ. ને ઇ2 સિસ્ટીનમાં સ્થાનાંતરિત કરવામાં આવે છે, જે અન્ય થિયોએસ્ટર બોન્ડ બનાવે છે. ફંક્શન યુબીક્વિટિન ટેગ પ્રોટીનને પ્રોટીઝોમ દ્વારા અધોગતિ તરફ દોરવાની સારી રીતે સમજી શકાય તેવી ભૂમિકા ધરાવે છે. એસ. યુ. એમ. ઓ. અણુઓ ભજવે છે તે ભૂમિકા વધુ જટિલ છે અને ઘણી ઓછી સારી રીતે સમજી શકાય છે. સુમોઇલેશનના પરિણામોમાં અન્ય પ્રોટીન માટે અથવા ડીએનએ સાથે સબસ્ટ્રેટની આત્મીયતામાં ફેરફાર, સબસ્ટ્રેટ સ્થાનિકીકરણમાં ફેરફાર અને યુબીક્વિટિન બંધનને અવરોધિત (જે સબસ્ટ્રેટના અધઃપતનને અટકાવે છે) નો સમાવેશ થાય છે. કેટલાક પ્રોટીન માટે, સુમોઇલેશનનું કોઈ કાર્ય હોય તેવું લાગતું નથી. અસ્થિર કોષોમાં એન. એફ.-કે. બી. ટ્રાન્સક્રિપ્શન પરિબળ એન. એફ.-કે. બી. આઈ. કે. બી. એ. અવરોધક પ્રોટીન બંધન દ્વારા નિષ્ક્રિય થાય છે. એન. એફ.-કે. બી. નું સક્રિયકરણ સર્વવ્યાપકતા અને આઈ. કે. બી. એ. ના અનુગામી અધઃપતન દ્વારા પ્રાપ્ત થાય છે. આઇ. કે. બી. એ. નું સુમોઇલેશન એન. એફ.-કે. બી.-આધારિત અનુલેખન પર મજબૂત અવરોધક અસર ધરાવે છે. ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ સક્રિયકરણ માટે ઉપલબ્ધ એન. એફ.-કે. બી. ની સંખ્યાને નિયંત્રિત કરવા માટે કોષ માટે આ એક પદ્ધતિ હોઈ શકે છે. પી53 ટ્રાન્સક્રિપ્શન પરિબળ પી53 એ કોષ ચક્ર નિયમન અને એપોપ્ટોસિસમાં સામેલ જનીનોને સક્રિય કરીને કામ કરતું ગાંઠ દબાવનાર છે. તેનું સ્તર mdm2-આધારિત સર્વવ્યાપકતા દ્વારા નિયંત્રિત થાય છે. પી53નું સુમોઇલેશન (યુબીક્વિટિન ફેરફાર સ્થળોથી અલગ લાઇસિન અવશેષો પર) પ્રોટીઝોમના અધઃપતનને અટકાવે છે અને પી53 પ્રતિભાવ માટે વધારાના નિયમનકાર તરીકે કામ કરે છે. અભિવ્યક્તિ અને નિયમન યીસ્ટના ઉભરતા અને વિખંડનના અભ્યાસો દર્શાવે છે કે કોષ ચક્રના નિયમનમાં સુમોઇલેશન મહત્વપૂર્ણ હોઈ શકે છે. કોષ ચક્ર દરમિયાન, યુ. બી. એ. 2 સાંદ્રતામાં નોંધપાત્ર ફેરફાર થતો નથી જ્યારે એસ. એ. ઈ. 1 સ્તર નાટકીય વધઘટ દર્શાવે છે, જે સૂચવે છે કે યુ. બી. એ. 2 ને બદલે એસ. એ. ઈ. 1 અભિવ્યક્તિનું નિયમન એ કોષ માટે સુમોલેશનને નિયંત્રિત કરવાનો એક માર્ગ હોઈ શકે છે. જો કે, તે સમયે જ્યારે SAE1નું સ્તર ઓછું હોય છે, ત્યારે SAE1-UBA2 હેટેરોડાઇમર સિવાય UBA2 ધરાવતા પ્રોટીન સંકુલના બહુ ઓછા પુરાવા જોવા મળે છે. એક સંભવિત સમજૂતી એ હશે કે આ સંકુલ માત્ર ટૂંકા ગાળા માટે અસ્તિત્વ ધરાવે છે, આમ કોષના અર્કમાં સ્પષ્ટ નથી. યુ. બી. એ. 2 અભિવ્યક્તિ મગજ, ફેફસાં અને હૃદય સહિત મોટાભાગના અવયવોમાં જોવા મળે છે, જે આ અવયવોમાં સુમોઇલેશન માર્ગના સંભવિત અસ્તિત્વને સૂચવે છે. વૃષણમાં યુ. બી. એ. 2 નું ઊંચું સ્તર (તેમજ માર્ગના અન્ય તમામ ઉત્સેચક ઘટકો) જોવા મળે છે, જે અર્ધસૂત્રણ અથવા શુક્રાણુજનનમાં યુ. બી. એ. 2 માટે સંભવિત ભૂમિકા સૂચવે છે. ન્યુક્લિયસની અંદર, યુ. બી. એ. 2 સમગ્ર ન્યુક્લિયસમાં વહેંચાયેલું છે પરંતુ ન્યુક્લિયોલીમાં જોવા મળતું નથી, જે સૂચવે છે કે સુમોઇલેશન મુખ્યત્વે ન્યુક્લિયસમાં થઈ શકે છે. એસ. એ. ઈ. 1 અને યુ. બી. એ. 2 નું સાયટોપ્લાઝમિક અસ્તિત્વ પણ શક્ય છે અને તે સાયટોપ્લાઝમિક સબસ્ટ્રેટ્સના જોડાણ માટે જવાબદાર છે. યુ. બી. એ. 2 કાર્યના અભ્યાસમાં નમૂના સજીવો માઉસ નમૂના જીવોનો ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો છે. Uba2TM1a (KOMP) Wtsi નામની શરતી નોકઆઉટ માઉસ લાઇન, વેલકમ ટ્રસ્ટ સેંગર ઇન્સ્ટિટ્યૂટ ખાતે ઇન્ટરનેશનલ નોકઆઉટ માઉસ કન્સોર્ટિયમ પ્રોગ્રામના ભાગ રૂપે બનાવવામાં આવી હતી-રસ ધરાવતા વૈજ્ઞાનિકોને રોગના પ્રાણીઓના નમૂનાઓ બનાવવા અને વિતરિત કરવા માટે એક ઉચ્ચ-થ્રુપુટ મ્યુટેજેનેસિસ પ્રોજેક્ટ. નર અને માદા પ્રાણીઓને કાઢી નાખવાની અસરો નક્કી કરવા માટે પ્રમાણિત ફેનોટાઇપિક સ્ક્રીનમાંથી પસાર કરવામાં આવ્યા હતા. મ્યુટન્ટ ઉંદર પર પચીસ પરીક્ષણો હાથ ધરવામાં આવ્યા હતા અને ચાર નોંધપાત્ર અસાધારણતા જોવા મળી હતી. સગર્ભાવસ્થા દરમિયાન કોઈ હોમોઝાયગસ મ્યુટન્ટ ભ્રૂણની ઓળખ કરવામાં આવી ન હતી, અને તેથી કોઈ પણ દૂધ છોડાવે ત્યાં સુધી બચી શક્યું ન હતું. બાકીના પરીક્ષણો હેટેરોઝાયગસ મ્યુટન્ટ પુખ્ત ઉંદર પર હાથ ધરવામાં આવ્યા હતા. DEXA દ્વારા સ્ત્રીઓના શરીરની લંબાઈમાં ઘટાડો જોવા મળ્યો હતો, જ્યારે બંને જાતિના પ્રાણીઓમાં એક્સ-રેમાં કટિ અને ત્રિકાસ્થિ કરોડરજ્જુની સંખ્યામાં ઘટાડો થયો હતો. ડ્રોસોફિલા યુ. બી. એ. 2 હોમોલોગ ડુબા 2 જનીનનું કોડિંગ ક્ષેત્ર 2.3 કે. બી. લાંબુ છે અને તેમાં 2 ઇન્ટ્રોન (53 અને 52 બી. પી.) છે. અનુમાનિત પ્રોટીનમાં 766 એમિનો એસિડ અવશેષો હોય છે અને તેનું વજન 84 કેડીએ હોય છે. પ્રોટીનની એકંદર ઓળખ 47 ટકાથી એચયુબીએ2 અને 31 ટકા યીસ્ટ યુબીએ2 છે. ત્રણ સમાનધર્મી પ્રોટીન વચ્ચે સંપૂર્ણ ઓળખના ઘણા પ્રદેશો પણ છે. કોડિંગ ક્રમના સી-ટર્મિનલ પ્રદેશમાં અનુમાનિત પરમાણુ સ્થાનિકીકરણ ક્રમ પણ હોય છે. ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ SAE2 એ SAE1, સ્મોલ યુબીક્વિટિન-સંબંધિત મોડિફાયર 1 અને UBE2I સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરતી હોવાનું દર્શાવવામાં આવ્યું છે. સંદર્ભો વધુ વાંચન બાહ્ય કડીઓ ઇ. સી. 6.3. ઉંદરમાં રૂપાંતરિત જનીનો