Scaffold/matrix attachment region
એસ/એમ. એ. આર. (સ્કેફોલ્ડ/મેટ્રિક્સ જોડાણ ક્ષેત્ર) શબ્દ, અન્યથા એસ. એ. આર. (સ્કેફોલ્ડ-જોડાણ ક્ષેત્ર) અથવા એમ. એ. આર. (મેટ્રિક્સ-સંકળાયેલ ક્ષેત્ર) તરીકે ઓળખાય છે, તે યુકેરીયોટિક રંગસૂત્રોના ડી. એન. એ. માં અનુક્રમ છે જ્યાં પરમાણુ મેટ્રિક્સ જોડાય છે. સ્થાપત્ય ડીએનએ ઘટકો કે જે યુકેરીયોટ્સના જીનોમને કોષના કેન્દ્રકની અંદર કાર્યાત્મક એકમોમાં ગોઠવે છે, S/MARs કેન્દ્રકની અંદર ક્રોમેટિનની માળખાકીય સંસ્થામાં મધ્યસ્થી કરે છે. આ ઘટકો ક્રોમેટિન સ્કેફોલ્ડ માટે ડીએનએના એન્કર પોઇન્ટ બનાવે છે અને ક્રોમેટિનને માળખાકીય ક્ષેત્રોમાં ગોઠવવાનું કામ કરે છે. વ્યક્તિગત જનીનો પરના અભ્યાસો એ નિષ્કર્ષ તરફ દોરી ગયા કે S/MAR તત્વો દ્વારા મધ્યસ્થી કરાયેલ ક્રોમેટિનની ગતિશીલ અને જટિલ સંસ્થા જનીન અભિવ્યક્તિના નિયમનમાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવે છે. સારાંશ તે ઘણા વર્ષોથી જાણીતું છે કે પોલિમર મેશવર્ક, કહેવાતા "ન્યુક્લિયર મેટ્રિક્સ" અથવા "ન્યુક્લિયર-સ્કેફોલ્ડ" યુકેરીયોટિક ન્યુક્લિયસનો એક આવશ્યક ઘટક છે. આ પરમાણુ હાડપિંજર આનુવંશિક માહિતીના ફેલાવાને લગતી ઘણી વિશિષ્ટ ઘટનાઓ માટે ગતિશીલ આધાર તરીકે કામ કરે છે (નીચે જુઓ). એસ/એમ. એ. આર. જીનોમમાં બિન-યાદૃચ્છિક સ્થાનો પર નકશો બનાવે છે. તેઓ ટ્રાન્સક્રાઇબ કરેલા પ્રદેશોની બાજુઓ પર, 5 '-ઇન્ટ્રોનમાં અને જનીન બ્રેકપૉઇન્ટ ક્લસ્ટર પ્રદેશો (BCR) પર પણ જોવા મળે છે. પ્રમાણભૂત અને કાર્યક્ષમ રંગસૂત્ર પ્રતિકૃતિ અને અનુલેખન માટે, પુનઃસંયોજન અને રંગસૂત્ર ઘનીકરણ માટે સામાન્ય પરમાણુ માળખાકીય પ્રોટીન એસ/એમ. એ. આર. માટે જોડાણ બિંદુઓ હોવા જરૂરી છે. એસ/એમ. એ. આર. માં સ્પષ્ટ સર્વસંમતિ ક્રમ નથી. જો કે પ્રોટોટાઇપ ઘટકોમાં એટી-સમૃદ્ધ પ્રદેશોની લંબાઈમાં સેંકડો આધાર જોડીનો સમાવેશ થાય છે, તેમ છતાં એકંદર આધાર રચના ચોક્કસપણે તેમની પ્રવૃત્તિનો પ્રાથમિક નિર્ધારક નથી. તેના બદલે, તેમના કાર્ય માટે "એટી-પેચ" ની પેટર્નની જરૂર પડે છે જે ટોર્સનલ તાણ હેઠળ સ્થાનિક સ્ટ્રાન્ડ અનપેયરિંગ માટે વલણ પ્રદાન કરે છે. બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સના અભિગમો એ વિચારને ટેકો આપે છે કે, આ ગુણધર્મો દ્વારા, એસ/એમ. એ. આર. માત્ર આપેલ ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ એકમ (ક્રોમેટિન ડોમેન) ને તેના પડોશીઓથી અલગ પાડતા નથી, પરંતુ આપેલ ડોમેનમાં ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ ઇવેન્ટ્સને સક્ષમ કરતા પરિબળોની એસેમ્બલી માટે પ્લેટફોર્મ પણ પ્રદાન કરે છે. ડીએનએ સ્ટ્રેન્ડ્સ (કહેવાતા 'સ્ટ્રેસ ઇન્ડ્યુસ્ડ ડુપ્લેક્સ ડિસ્ટેબિલાઇઝેશન' પોટેન્શિયલ, એસ. આઈ. ડી. ડી.) ને અલગ કરવાની વધેલી વૃત્તિ ક્રુસિફોર્મ્સ અથવા સ્લિપેજ સ્ટ્રક્ચર્સ જેવી ગૌણ રચનાઓની રચના કરી શકે છે, જે સંખ્યાબંધ ઉત્સેચકો (ડીએનએસીસ, ટોપોઆઇસોમરેઝ, પોલી (એડીપી-રાઇબોસિલ) પોલિમરેઝ અને હિસ્ટોન-એસિટિલેશન અને ડીએનએ-મિથાઇલેશન ઉપકરણના ઉત્સેચકો) માટે ઓળખી શકાય તેવી લાક્ષણિકતાઓ છે. એસ/એમ. એ. આર. ને તેમના ગતિશીલ ગુણધર્મોના આધારે બંધારણીય (તમામ કોષ પ્રકારોમાં કાયમી ડોમેન સીમાઓ તરીકે કામ કરતા) અથવા ફેકલ્ટેટિવ (કોષ પ્રકાર-અને પ્રવૃત્તિ-સંબંધિત) તરીકે વર્ગીકૃત કરવામાં આવ્યા છે. જ્યારે માનવ જિનોમમાં એસ/એમ. એ. આર. ની સંખ્યા 64,000 (ક્રોમેટિન ડોમેન્સ) વત્તા વધારાના 10,000 (પ્રતિકૃતિ ફોસી) સુધી પહોંચવાનો અંદાજ છે, 2007 માં હજુ પણ માત્ર એક નાનો અપૂર્ણાંક (તમામ યુકેરીયોટ્સ માટે 559) એસ/એમ. એ. આર. ટી. ડેટાબેઝમાં એનોટેશન માટેના પ્રમાણભૂત માપદંડને પૂર્ણ કરે છે. સંદર્ભ-આધારિત ગુણધર્મો પરમાણુ મેટ્રિક્સના વર્તમાન દૃશ્યો તેને એક ગતિશીલ અસ્તિત્વ તરીકે જુએ છે, જે કોષના કેન્દ્રકની જરૂરિયાતો સાથે તેના ગુણધર્મોને બદલે છે-જે રીતે સાયટોસ્કેલેટન તેની રચના અને કાર્યને બાહ્ય સંકેતો સાથે અનુકૂળ કરે છે. પાછલી નજરમાં એ નોંધવું જોઈએ કે એસ/એમ. એ. આર. ની શોધના બે મુખ્ય માર્ગો છેઃ લેમલી અને સહકાર્યકરો દ્વારા સ્કેફોલ્ડ-જોડાણ ઘટકો (એસ. એ. આર.) નું વર્ણન, જે આપેલ ક્રોમેટિન ક્ષેત્રની સરહદોને મેટ્રિક્સ-સંકળાયેલ પ્રદેશો (એમ. એ. આર.) ની લાક્ષણિકતાઓનું સીમાંકન કરવાનું માનવામાં આવતું હતું, જેના પ્રથમ ઉદાહરણોએ ઇમ્યુનોગ્લોબ્યુલિન કેપ-ચેઇન એન્હાન્સરને ટ્રાન્સક્રિપ્શન પરિબળો સાથે તેના કબજા અનુસાર ટેકો આપ્યો હતો. જ્યારે બંધારણીય S/MARs 'બધા' કોષ પ્રકારોમાં DNase I અતિસંવેદનશીલ સાઇટ સાથે સંકળાયેલા હોવાનું જણાયું હતું (બંધ ડોમેન લખવામાં આવ્યું હતું કે નહીં), ફેકલ્ટેટિવ પ્રકારની DNAse I અતિસંવેદનશીલતા ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ સ્થિતિ પર આધારિત હતી. એસ/એમ. એ. આર. ના આ બે કાર્યાત્મક પ્રકારો વચ્ચેનો મુખ્ય તફાવત તેમનું કદ છેઃ રચનાત્મક ઘટકો કેટલાંક કિલોબેઝ જોડી સુધી વિસ્તરી શકે છે, જ્યારે ફેકલ્ટેટિવ ઘટકો 300 બેઝ જોડીની આસપાસ નીચલા કદની મર્યાદા પર હોય છે. આ આંકડો આ ગુણધર્મો વિશેની આપણી હાલની સમજણ દર્શાવે છે અને તેમાં નીચેના તારણોનો સમાવેશ થાય છેઃ હેલોફિશ તપાસ દ્વારા મેળવેલા એસ/એમ. એ. આર.-સ્કેફોલ્ડ સંપર્કોના ગતિશીલ ગુણધર્મો એ હકીકત છે કે ટ્રાન્સક્રિપ્શન દરમિયાન ડી. એન. એ. આર. એન. એ.-પોલિમરેઝ દ્વારા રીલેડ થાય છે જે પોતે પરમાણુ મેટ્રિક્સનો એક નિશ્ચિત ઘટક છે અને હકીકત એ છે કે ચોક્કસ ડોમેન-આંતરિક એસ/એમ. એ. આર. ને સક્રિય થવા માટે નજીકના ટ્રાન્સક્રિપ્શન પરિબળનો ટેકો જરૂરી છે. જનીન ઉપચારમાં ઉપયોગ વાયરલ વેક્ટરના વિકલ્પ તરીકે, જે દર્દીના શરીરમાં અનિચ્છનીય અસરો કરી શકે છે, જનીન ઉપચારની બિન-વાયરલ પદ્ધતિઓનો અભ્યાસ કરવામાં આવી રહ્યો છે. આવી પદ્ધતિઓમાંની એક ખાસ ગુણધર્મો સાથે પ્લાઝમિડનો ઉપયોગ કરે છે-કહેવાતા એપિસોમ્સ. એપિસોમ્સમાં મિટોસિસ દરમિયાન બાકીના યુકેરીયોટિક જીનોમ સાથે એકસાથે વહેંચવાની ક્ષમતા હોય છે. પ્રમાણભૂત પ્લાઝમિડની તુલનામાં તેઓ ન્યુક્લિયસની અંદર એપિજેનેટિકલી શાંત નથી અને ઉત્સેચકીય રીતે નાશ પામતા નથી. એપિસોમ્સ તેમની રચનામાં S/MAR ક્રમની હાજરી દ્વારા આ ક્ષમતા પ્રાપ્ત કરે છે. વધારાની માહિતી તાજેતરમાં, ટેટકોને અરેબિડોપ્સિસ થાલિયાનામાં જનીનોની સ્પેટિઓટેમ્પોરલ અભિવ્યક્તિ સાથે ઇન્ટ્રાજેનિક એસ/એમ. એ. આર. નો મજબૂત સહસંબંધ મળ્યો છે. જીનોમ સ્કેલ પર, એસ/એમ. એ. આર. ધરાવતા જનીનોની સ્પષ્ટ પેશી-અને અંગ-વિશિષ્ટ અને વિકાસલક્ષી અભિવ્યક્તિ પેટર્ન મળી આવી છે. નોંધપાત્ર રીતે, અનુલેખન પરિબળ જનીનોમાં એસ/એમ. એ. આર. નો નોંધપાત્ર ઊંચો ભાગ હોય છે. એસ/એમ. એ. આર. ધરાવતા જનીનોની અભિવ્યક્તિ લાક્ષણિકતાઓમાં સ્પષ્ટ તફાવત તેમના કાર્યાત્મક મહત્વ અને છોડમાં તેમજ અન્ય યુકેરીયોટ્સમાં જનીન નિયમન માટે માળખાકીય રંગસૂત્ર લાક્ષણિકતાઓના મહત્વ પર ભાર મૂકે છે. સંદર્ભો મોલેક્યુલર જિનેટિક્સ