Structure and genome of HIV
1983માં વાયરસની શોધ થઈ ત્યારથી એચ. આઈ. વી. (હ્યુમન ઇમ્યુનોડેફિસિયન્સી વાયરસ) ના જીનોમ અને પ્રોટીન વ્યાપક સંશોધનનો વિષય રહ્યા છે. "કારક એજન્ટની શોધમાં, શરૂઆતમાં એવું માનવામાં આવતું હતું કે વાયરસ હ્યુમન ટી-સેલ લ્યુકેમિયા વાયરસ (એચ. ટી. એલ. વી.) નું એક સ્વરૂપ છે, જે તે સમયે માનવ રોગપ્રતિકારક શક્તિને અસર કરે છે અને ચોક્કસ લ્યુકેમિયાનું કારણ બને છે. જો કે, પેરિસમાં પાશ્ચર ઇન્સ્ટિટ્યૂટના સંશોધકોએ એઇડ્સના દર્દીઓમાં અગાઉ અજ્ઞાત અને આનુવંશિક રીતે અલગ રેટ્રોવાયરસને અલગ પાડ્યો હતો જેને પાછળથી એચ. આય. વી. નામ આપવામાં આવ્યું હતું. દરેક વિરિયનમાં વાયરલ પરબિડીયું અને સંબંધિત મેટ્રિક્સનો સમાવેશ થાય છે જે કેપ્સિડને ઘેરી લે છે, જે પોતે સિંગલ-સ્ટ્રેન્ડેડ આરએનએ જિનોમની બે નકલો અને કેટલાક ઉત્સેચકોને ઘેરી લે છે. એઇડ્સ-સંબંધિત બીમારીઓના પ્રથમ મોટા કેસના અહેવાલના બે વર્ષ પછી વાયરસની શોધ થઈ હતી. માળખું ચેપી વાયરસમાંથી કાઢવામાં આવેલા એચ. આય. વી-1 જીનોમના સંપૂર્ણ ક્રમને સિંગલ-ન્યુક્લિયોટાઇડ રિઝોલ્યુશનમાં ઉકેલવામાં આવ્યો છે. એચ. આઈ. વી. જીનોમ નાની સંખ્યામાં વાયરલ પ્રોટીનને એન્કોડ કરે છે, જે એચ. આઈ. વી. પ્રોટીન અને એચ. આઈ. વી. અને યજમાન પ્રોટીન વચ્ચે સહકારી સંગઠનો સ્થાપિત કરે છે, જેથી યજમાન કોષો પર આક્રમણ કરી શકાય અને તેમની આંતરિક મશીનરીને હાઇજેક કરી શકાય. એચ. આઈ. વી. અન્ય રેટ્રોવાયરસથી માળખામાં અલગ છે. એચ. આય. વી વિરિયનનો વ્યાસ ~ 100 એનએમ છે. તેના અંદરના ભાગમાં શંકુ આકારના કોરનો સમાવેશ થાય છે જેમાં (પોઝિટિવ સેન્સ) એસએસઆરએનએ જીનોમની બે નકલો, ઉત્સેચકો રિવર્સ ટ્રાન્સક્રિપ્ટેસ, ઇન્ટિગ્રેઝ અને પ્રોટીઝ, કેટલાક નાના પ્રોટીન અને મુખ્ય કોર પ્રોટીનનો સમાવેશ થાય છે. હ્યુમન ઇમ્યુનોડેફિસિયન્સી વાયરસ (એચ. આઈ. વી.) નો જીનોમ એચ. આઈ. વી. જીવન ચક્ર દરમિયાન આવશ્યક ભૂમિકા ભજવતા 8 વાયરલ પ્રોટીનને એન્કોડ કરે છે. એચ. આઈ. વી.-1 બિન-સહસંયોજક રીતે જોડાયેલા, અનસ્પ્લિસ્ડ, પોઝિટિવ-સેન્સ સિંગલ-સ્ટ્રેન્ડેડ આર. એન. એ. ની બે નકલોથી બનેલો છે, જે લેન્ટીવાયરસની લાક્ષણિક વાયરલ પ્રોટીન પી24થી બનેલા શંકુ આકારના કેપ્સિડથી ઘેરાયેલો છે. આરએનએ સ્ટ્રેન્ડ્સની બે નકલો એચઆઇવી-1 પુનઃસંયોજનમાં ફાળો આપવા માટે મહત્વપૂર્ણ છે, જે વાયરલ પ્રતિકૃતિના રિવર્સ ટ્રાન્સક્રિપ્શન દરમિયાન થાય છે. વિરિયનની અંદર સિંગલ-સ્ટ્રેન્ડેડ આર. એન. એ. ની બે નકલોનું નિયંત્રણ પરંતુ માત્ર એક જ ડીએનએ પ્રોવાઇરસના ઉત્પાદનને સ્યુડોડિપ્લોઇડી કહેવામાં આવે છે. આર. એન. એ. ઘટક 9749 ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ લાંબો છે અને 5 'કેપ (જી. પી. પી. પી.), 3' પોલી (એ) પૂંછડી અને ઘણી ખુલ્લી વાંચન ફ્રેમ (ઓ. આર. એફ.) ધરાવે છે. વાયરલ માળખાકીય પ્રોટીન લાંબા ઓઆરએફ દ્વારા એન્કોડ કરવામાં આવે છે, જ્યારે નાના ઓઆરએફ વાયરલ જીવન ચક્રના નિયમનકારોને એન્કોડ કરે છેઃ જોડાણ, પટલ ફ્યુઝન, પ્રતિકૃતિ અને એસેમ્બલી. સિંગલ-સ્ટ્રાન્ડ આરએનએ પી7 ન્યુક્લિયોકેપ્સિડ પ્રોટીન, લેટ એસેમ્બલી પ્રોટીન પી6 અને વિરિયનના વિકાસ માટે જરૂરી ઉત્સેચકો, જેમ કે રિવર્સ ટ્રાન્સક્રિપ્ટેસ અને ઇન્ટિગ્રેઝ સાથે ચુસ્ત રીતે બંધાયેલ છે. લાઇસિન ટી. આર. એન. એ. એ મેગ્નેશિયમ-આધારિત રિવર્સ ટ્રાન્સક્રિપ્ટેસનો પ્રાઇમર છે. ન્યુક્લિયોકેપ્સિડ જીનોમિક આર. એન. એ. (હેક્સામર દીઠ એક અણુ) સાથે સંકળાય છે અને આર. એન. એ. ને ન્યુક્લિયસ દ્વારા પાચનથી રક્ષણ આપે છે. વીરીયન કણની અંદર વીઆઈએફ, વીપીઆર, નેફ અને વાયરલ પ્રોટીઝ પણ બંધ હોય છે. વિરિયનનું પરબિડીયું યજમાન કોષ મૂળના પ્લાઝ્મા પટલ દ્વારા રચાય છે, જે વાયરલ પી 17 પ્રોટીનથી બનેલા મેટ્રિક્સ દ્વારા સમર્થિત છે, જે વિરિયન કણની અખંડિતતાને સુનિશ્ચિત કરે છે. વિરિયનની સપાટી પર એચ. આય. વીના પરબિડીયું ગ્લાયકોપ્રોટીન (એન. વી.) ની મર્યાદિત સંખ્યા મળી શકે છે, જે જી. પી. 120 અને જી. પી. 41ના હેટેરોડાઇમર દ્વારા રચાયેલ ટ્રીમર છે. એનવી તેના પ્રાથમિક યજમાન રીસેપ્ટર, સીડી4 અને તેના સહ-રીસેપ્ટર (મુખ્યત્વે સી. સી. આર. 5 અથવા સી. એક્સ. સી. આર. 4) સાથે બંધન માટે જવાબદાર છે, જે તેના લક્ષ્ય કોષમાં વાયરલ પ્રવેશ તરફ દોરી જાય છે. વાયરસની સપાટી પરના એકમાત્ર પ્રોટીન તરીકે, પરબિડીયું ગ્લાયકોપ્રોટીન (જી. પી. 120 અને જી. પી. 41) એ એચ. આઈ. વી. રસીના પ્રયાસો માટેના મુખ્ય લક્ષ્યાંકો છે. ટ્રાઇમેરિક પરબિડીયું સ્પાઇકના જથ્થાના અડધાથી વધુ ભાગ એન-લિંક્ડ ગ્લાયકેન્સ છે. તેની ઘનતા વધારે છે કારણ કે ગ્લાયકેન્સ એન્ટિબોડીઝ દ્વારા તટસ્થ થવાથી વાયરલ પ્રોટીનને રક્ષણ આપે છે. આ જાણીતા સૌથી ગીચ ગ્લાયકોસિલેટેડ અણુઓમાંનું એક છે અને એન્ડોપ્લાઝ્મિક રેટિક્યુલમ અને ગોલ્ગી ઉપકરણમાં બાયોજેનેસિસ દરમિયાન ગ્લાયકેન્સની સામાન્ય પરિપક્વતા પ્રક્રિયાને રોકવા માટે ઘનતા પૂરતી વધારે છે. તેથી મોટાભાગના ગ્લાયકેન્સ અપરિપક્વ 'ઉચ્ચ-મેનોઝ' ગ્લાયકેન્સ તરીકે અટકેલા હોય છે જે સામાન્ય રીતે સ્ત્રાવ અથવા કોષની સપાટી પરના માનવ ગ્લાયકોપ્રોટીન પર હાજર હોતા નથી. અસામાન્ય પ્રક્રિયા અને ઉચ્ચ ઘનતાનો અર્થ એ છે કે લગભગ તમામ વ્યાપક રીતે તટસ્થ એન્ટિબોડીઝ કે જે અત્યાર સુધી ઓળખવામાં આવી છે (ઘણા મહિનાઓથી વર્ષોથી ચેપગ્રસ્ત દર્દીઓના સબસેટમાંથી) આ એન્વલપ ગ્લાયકેન્સ સાથે જોડાય છે અથવા તેનો સામનો કરવા માટે અનુકૂળ છે. વાયરલ સ્પાઇકનું પરમાણુ માળખું હવે એક્સ-રે ક્રિસ્ટલોગ્રાફી અને ક્રાયો-ઇલેક્ટ્રોન માઇક્રોસ્કોપી દ્વારા નક્કી કરવામાં આવ્યું છે. માળખાકીય જીવવિજ્ઞાનમાં આ પ્રગતિ જી. પી. 41 માં પ્રોલાઇન મ્યુટેશન માટે ઇન્ટરસબુનિટ ડાયસલ્ફાઇડ બોન્ડ અને આઇસોલ્યુસીનની રજૂઆત દ્વારા વાયરલ સ્પાઇકના સ્થિર રિકોમ્બિનન્ટ સ્વરૂપોના વિકાસને કારણે શક્ય બની હતી. કહેવાતા એસ. ઓ. એસ. આઈ. પી. ટ્રીમર માત્ર મૂળ વાયરલ સ્પાઇકના એન્ટિજેનિક ગુણધર્મોને જ પુનઃઉત્પાદિત કરતા નથી પણ મૂળ વાયરસ પર પ્રસ્તુત અપરિપક્વ ગ્લાયકેન્સની સમાન માત્રા પણ પ્રદર્શિત કરે છે. રિકોમ્બિનન્ટ ટ્રાઇમેરિક વાયરલ સ્પાઇક્સ રસીના ઉમેદવારોને આશાસ્પદ છે કારણ કે તેઓ રિકોમ્બિનન્ટ મોનોમેરિક જી. પી. 120 કરતા ઓછા બિન-તટસ્થ એપિટોપ્સ પ્રદર્શિત કરે છે જે લક્ષિત એપિટોપ્સના રોગપ્રતિકારક પ્રતિભાવને દબાવવાનું કાર્ય કરે છે. જીનોમ સંસ્થા એચ. આઈ. વી. માળખાકીય પ્રોટીન માટે ઘણા મુખ્ય જનીનો કોડિંગ ધરાવે છે જે તમામ રેટ્રોવાયરસ તેમજ એચ. આઈ. વી. માટે અનન્ય કેટલાક બિન-માળખાકીય ("સહાયક") જનીનોમાં જોવા મળે છે. એચ. આય. વી જીનોમમાં નવ જનીનો હોય છે જે પંદર વાયરલ પ્રોટીનને એન્કોડ કરે છે. આને પોલીપ્રોટીન તરીકે સંશ્લેષણ કરવામાં આવે છે જે વીરીયન આંતરિક માટે પ્રોટીન ઉત્પન્ન કરે છે, જેને ગેગ કહેવાય છે, જૂથ વિશિષ્ટ એન્ટિજેન; વાયરલ ઉત્સેચકો (પોલ, પોલિમરેઝ) અથવા વીરીયન એનવી (પરબિડીયું) ના ગ્લાયકોપ્રોટીન. આ ઉપરાંત, એચ. આય. વી પ્રોટીન માટે એન્કોડ કરે છે જે ચોક્કસ નિયમનકારી અને સહાયક કાર્યો પણ ધરાવે છે. એચ. આય. વી-1માં બે મહત્વપૂર્ણ નિયમનકારી ઘટકો છેઃ ટેટ અને રેવ અને નેફ, વી. પી. આર., વી. આઈ. એફ. અને વી. પી. યુ. જેવા કેટલાક મહત્વપૂર્ણ સહાયક પ્રોટીન છે જે ચોક્કસ પેશીઓમાં પ્રતિકૃતિ માટે જરૂરી નથી. ગેગ જનીન વાયરસનું મૂળભૂત ભૌતિક માળખું પૂરું પાડે છે, અને પોલ મૂળભૂત પદ્ધતિ પ્રદાન કરે છે જેના દ્વારા રેટ્રોવાયરસ પ્રજનન કરે છે, જ્યારે અન્ય એચ. આય. વી. ને યજમાન કોષમાં પ્રવેશવામાં અને તેના પ્રજનનને વધારવામાં મદદ કરે છે. તેમ છતાં તેમાં પરિવર્તન દ્વારા ફેરફાર થઈ શકે છે, ટી. ઈ. વી. સિવાયના આ તમામ જનીનો એચ. આઈ. વી. ના તમામ જાણીતા સ્વરૂપોમાં અસ્તિત્વ ધરાવે છે; જુઓ એચ. આઈ. વી. ની આનુવંશિક વિવિધતા. એચ. આઈ. વી. 10કે. બી. થી ઓછા જિનોમમાંથી નવ અલગ અલગ જનીન ઉત્પાદનો મેળવવા માટે વિભેદક આર. એન. એ. સ્પ્લિસિંગની અત્યાધુનિક પ્રણાલીનો ઉપયોગ કરે છે. એચ. આઈ. વી. માં 9.2kb અનસ્પ્લાઇસ કરેલ જીનોમિક ટ્રાન્સક્રિપ્ટ છે જે ગેગ અને પોલ પ્રીકર્સર માટે એન્કોડ કરે છે; એનવી, વીઆઈએફ, વીપીઆર અને વીપીયુ માટે સિંગલ સ્પ્લાઇસ કરેલ, 4.5કેબી એન્કોડિંગ અને ટેટ, રેવ અને નેફ માટે મલ્ટિપ્લાય સ્પ્લાઇસ કરેલ, 2કેબી એમઆરએનએ એન્કોડિંગ. પૂર્વવર્તી ગેગ પોલીપ્રોટીન માટે વાયરલ માળખાકીય પ્રોટીન ગેગ (જૂથ-વિશિષ્ટ એન્ટિજેન) કોડ જે વાયરલ પ્રોટીઝ દ્વારા એમએ (મેટ્રિક્સ પ્રોટીન, પી 17) પરિપક્વતા દરમિયાન પ્રક્રિયા કરવામાં આવે છે; સીએ (કેપ્સિડ પ્રોટીન, પી 24); એસપી 1 (સ્પેસર પેપ્ટાઇડ 1, પી 2); એનસી (ન્યુક્લિયોકેપ્સિડ પ્રોટીન, પી 7); એસપી 2 (સ્પેસર પેપ્ટાઇડ 2, પી 1) અને પી 6 પ્રોટીન. વાયરલ ઉત્સેચકો માટે પોલ કોડ રિવર્સ ટ્રાન્સક્રિપ્ટેસ (આરટી) અને આરએનએઝ એચ, ઇન્ટિગ્રેઝ (આઈએન), અને એચઆઇવી પ્રોટીઝ (પીઆર). એચ. આય. વી પ્રોટીઝ માળખાકીય પ્રોટીનનું ઉત્પાદન કરવા માટે પૂર્વવર્તી ગેગ પોલીપ્રોટીનને તોડવા માટે જરૂરી છે, આરએનએ નમૂનામાંથી ડીએનએ લખવા માટે આરટી જરૂરી છે, અને યજમાન જીનોમમાં ડબલ-સ્ટ્રેન્ડેડ વાયરલ ડીએનએને એકીકૃત કરવા માટે આઈએન જરૂરી છે. env ("પરબિડીયું" માટે) gp160 માટેના કોડ, જે યજમાન કોષના એન્ડોપ્લાઝ્મિક રેટિક્યુલમની અંદર યજમાન પ્રોટીઝ, ફ્યુરિન દ્વારા વિભાજીત થાય છે. અનુવાદ પછીની પ્રક્રિયા સપાટી પર ગ્લાયકોપ્રોટીન, જી. પી. 120 અથવા એસ. યુ. ઉત્પન્ન કરે છે, જે લિમ્ફોસાઇટ્સ પર હાજર સીડી 4 રીસેપ્ટર્સ સાથે જોડાય છે, અને જી. પી. 41 અથવા ટી. એમ., જે વાયરસને લક્ષ્ય કોષો સાથે જોડવા અને ફ્યૂઝ કરવા માટે વાયરલ પરબિડીયુંમાં જડિત કરે છે. આવશ્યક નિયમનકારી ઘટકો (એચ. આય. વી ટ્રાન્સ-એક્ટિવેટર) વાયરલ જીનોમ આર. એન. એ. ના રિવર્સ ટ્રાન્સક્રિપ્શનને નિયંત્રિત કરવામાં, વાયરલ એમ. આર. એન. એ. ના કાર્યક્ષમ સંશ્લેષણને સુનિશ્ચિત કરવામાં અને ચેપગ્રસ્ત કોષોમાંથી વાયરિયનના પ્રકાશનને નિયંત્રિત કરવામાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવે છે. ટાટને 72-એમિનો એસિડ વન-એક્સોન ટેટ તેમજ 86-101-એમિનો એસિડ ટુ-એક્સોન ટેટ તરીકે વ્યક્ત કરવામાં આવે છે, અને એચ. આય. વી સંક્રમણની શરૂઆતમાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવે છે. TAT (14-15 kDa) ટ્રાન્સ-એક્ટિવેશન રિસ્પોન્સ એલિમેન્ટ (TAR) ની રચના કરતા 5 'LTR ક્ષેત્રની નજીક ઉભેલા જીનોમિક RNA સ્ટેમ-લૂપ ગૌણ માળખા સાથે જોડાય છે. રેવ (વિરિયન પ્રોટીનની અભિવ્યક્તિનું નિયમનકાર): રેવ પ્રોટીન આર્જિનિન-સમૃદ્ધ આરએનએ-બંધનકર્તા રચના દ્વારા વાયરલ જીનોમ સાથે જોડાય છે જે એનએલએસ (પરમાણુ સ્થાનિકીકરણ સંકેતો) તરીકે પણ કામ કરે છે, જે વાયરલ પ્રતિકૃતિ દરમિયાન સાયટોસોલમાંથી ન્યુક્લિયસમાં રેવના પરિવહન માટે જરૂરી છે. રેવ ટાટ અને રેવના કોડિંગ એક્સોનને અલગ કરતા ઇન્ટ્રોનમાં સ્થિત એમઆરએનએ એનવીના જટિલ સ્ટેમ-લૂપ માળખાને ઓળખે છે, જેને એચઆઇવી રેવ રિસ્પોન્સ એલિમેન્ટ (આરઆરઇ) તરીકે ઓળખવામાં આવે છે. રેવ મુખ્ય વાયરલ પ્રોટીનના સંશ્લેષણ માટે મહત્વપૂર્ણ છે અને તેથી વાયરલ પ્રતિકૃતિ માટે જરૂરી છે. સહાયક નિયમનકારી પ્રોટીન વી. પી. આર. (લેન્ટીવાયરસ પ્રોટીન આર): વી. પી. આર. એ વિરિયન-સંકળાયેલ, ન્યુક્લિયોસાયટોપ્લાઝમિક શટલ નિયમનકારી પ્રોટીન છે. એવું માનવામાં આવે છે કે તે વાયરસની પ્રતિકૃતિમાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવે છે, ખાસ કરીને, પૂર્વ એકીકરણ સંકુલની પરમાણુ આયાત. વી. પી. આર. પણ તેના યજમાન કોષોને જી2 તબક્કામાં તેમના કોષ ચક્રને અટકાવવાનું કારણ બને છે. આ ધરપકડ યજમાન ડીએનએ રિપેર મશીનરીને સક્રિય કરે છે જે વાયરલ ડીએનએના એકીકરણને સક્ષમ કરી શકે છે. એચ. આઈ. વી.-2 અને એસ. આઈ. વી. વી. પી. એક્સ નામના વધારાના વી. પી. આર. સંબંધિત પ્રોટીનને એન્કોડ કરે છે જે વી. પી. આર. સાથે જોડાણમાં કાર્ય કરે છે. વીઆઇએફ-વીઆઇએફ એ અત્યંત સંરક્ષિત, 23 કેડીએ ફોસ્ફોપ્રોટીન છે જે કોષના પ્રકાર પર આધાર રાખીને એચઆઇવી-1 વાઈરિયન્સની સંક્રામકતા માટે મહત્વપૂર્ણ છે. એચ. આય. વી-1ને લિમ્ફોસાઇટ્સ, મેક્રોફેજ અને અમુક માનવ કોષ રેખાઓમાં ચેપી વાયરસનું સંશ્લેષણ કરવા માટે વીઆઇએફની જરૂર હોવાનું જાણવા મળ્યું છે. તેને અન્ય લોકો વચ્ચે હેલા કોષો અથવા સી. ઓ. એસ. કોષોમાં સમાન પ્રક્રિયા માટે વી. આઈ. એફ. ની જરૂર હોય તેવું લાગતું નથી. નેફ-નેફ, નકારાત્મક પરિબળ, એ એન-ટર્મિનલ માયરિસ્ટોઇલેટેડ પટલ-સંકળાયેલ ફોસ્ફોપ્રોટીન છે. તે વાયરસના પ્રતિકૃતિ ચક્ર દરમિયાન બહુવિધ કાર્યોમાં સામેલ છે. એવું માનવામાં આવે છે કે તે સેલ એપોપ્ટોસિસમાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવે છે અને વાયરસની ચેપમાં વધારો કરે છે. વી. પી. યુ. (વાયરસ પ્રોટીન યુ)-વી. પી. યુ. એચ. આઈ. વી.-1 માટે વિશિષ્ટ છે. તે અસંખ્ય જૈવિક કાર્યો સાથે પ્રથમ વર્ગનું ઓલિગોમેરિક અભિન્ન પટલ ફોસ્ફોપ્રોટીન છે. વી. પી. યુ. યુબીક્વિટિન પ્રોટીઝોમ માર્ગને સંડોવતા સીડી4 અધઃપતનમાં તેમજ ચેપગ્રસ્ત કોષોમાંથી વાઇરિઅન્સના સફળ પ્રકાશનમાં સામેલ છે. ટેવઃ આ જનીન માત્ર થોડા એચ. આય. વી-1 આઇસોલેટ્સમાં હાજર છે. તે ટેટ, એનવી અને રેવ જનીનોના ભાગોનું મિશ્રણ છે, અને ટેટના કેટલાક ગુણધર્મો સાથે પ્રોટીન માટેના કોડ છે, પરંતુ રેવના ગુણધર્મોમાંથી બહુ ઓછા અથવા કોઈ નહીં. આર. એન. એ. ગૌણ માળખું એચ. આય. વી. આર. એન. એ. જીનોમમાં કેટલાક સંરક્ષિત ગૌણ માળખાના તત્વોની ઓળખ કરવામાં આવી છે. એચ. આય. વી વાયરલ આર. એન. એ. માળખાં રિવર્સ ટ્રાન્સક્રિપ્શનની પ્રગતિને નિયંત્રિત કરે છે. 5 'યુ. ટી. આર. માળખામાં નાના લિંકર દ્વારા જોડાયેલા સ્ટેમ-લૂપ માળખાઓની શ્રેણીનો સમાવેશ થાય છે. આ સ્ટેમ-લૂપ્સ (5 'થી 3') માં ટ્રાન્સ-એક્ટિવેશન ક્ષેત્ર (ટી. એ. આર.) તત્વ, 5 'પોલીએડેનાઈલેશન સિગ્નલ [પોલી (એ)], પી. બી. એસ., ડી. આઈ. એસ., મુખ્ય એસ. ડી. અને જિનોમના 5' છેડા અને એન. વી. જનીનની અંદર એચ. આઈ. વી. રેવ રિસ્પોન્સ તત્વ (આર. આર. ઈ.) ની અંદર સ્થિત હેરપિન માળખું સામેલ છે. અન્ય આર. એન. એ. માળખું જે ઓળખવામાં આવ્યું છે તે ગેગ સ્ટેમ લૂપ 3 (જી. એસ. એલ. 3) છે, જે વાયરલ પેકેજિંગમાં સામેલ હોવાનું માનવામાં આવે છે. આર. એન. એ. ગૌણ માળખાઓને એચ. આય. વી પ્રોટીઝ અને રિવર્સ ટ્રાન્સક્રિપ્ટેસના કાર્યમાં ફેરફાર કરીને એચઆઇવી જીવન ચક્રને અસર કરવાની દરખાસ્ત કરવામાં આવી છે, જો કે ઓળખાયેલ તમામ તત્વોને કાર્ય સોંપવામાં આવ્યું નથી. SHAPE વિશ્લેષણ દ્વારા નિર્ધારિત RNA ગૌણ માળખામાં ત્રણ સ્ટેમ લૂપ્સ હોવાનું દર્શાવવામાં આવ્યું છે અને તે HIV પ્રોટીઝ અને રિવર્સ ટ્રાન્સક્રિપ્ટ જનીનો વચ્ચે સ્થિત છે. આ સીઆઈએસ નિયમનકારી આરએનએ સમગ્ર એચઆઇવી પરિવારમાં સંરક્ષિત હોવાનું દર્શાવવામાં આવ્યું છે અને તે વાયરલ જીવન ચક્રને પ્રભાવિત કરે છે તેવું માનવામાં આવે છે. વી3 લૂપ ત્રીજો ચલ લૂપ અથવા વી3 લૂપ એ હ્યુમન ઇમ્યુનોડેફિસિયન્સી વાયરસનો એક ભાગ અથવા પ્રદેશ છે. વિરોનના પરબિડીયું ગ્લાયકોપ્રોટીનનું V3 લૂપ, gp120, તેને એચ. આય. વીના તાણના આધારે લક્ષ્ય માનવ રોગપ્રતિકારક કોષ પર સાયટોકીન રીસેપ્ટર સાથે જોડાઈને માનવ રોગપ્રતિકારક કોષોને ચેપ લગાડવાની મંજૂરી આપે છે, જેમ કે CCR5 કોષ અથવા CXCR4 કોષ. કોષોમાં એચ. આય. વી-1ના પ્રવેશ માટે પરબિડીયું ગ્લાયકોપ્રોટીન (એન. વી.) જી. પી. <આઇ. ડી. 1> જરૂરી છે. એનવી એચઆઇવી-1 ચેપ ધરાવતી વ્યક્તિઓની સારવાર કરતી દવાના મોલેક્યુલર લક્ષ્ય તરીકે અને એઇડ્સની રસી વિકસાવવા માટે ઇમ્યુનોજેનના સ્ત્રોત તરીકે કામ કરે છે. જો કે, કાર્યાત્મક એનવી ટ્રીમરનું માળખું અસ્પષ્ટ રહ્યું છે. આ પણ જુઓ એચ. આય. વી/એડ્સ સંશોધન સંદર્ભો બાહ્ય કડીઓ એચઆઇવી પોલ-1 સ્ટેમ લૂપ સંપૂર્ણ એચઆઇવી 1 વિરિયન એચઆઇવી/એડ્સના 3ડી મોડેલ માટે આર. એફ. એ. એમ. એન્ટ્રી