Alphaproteobacteria
આલ્ફાપ્રોટોબેક્ટેરિયા એ સ્યૂડોમોનાડોટા (અગાઉ પ્રોટીઓબેક્ટેરિયા) વંશના બેક્ટેરિયાનો એક વર્ગ છે. મેગ્નેટોકોકેલ્સ અને મેરીપ્રોફંડેલ્સને આલ્ફાપ્રોટોબેક્ટેરિયાની મૂળભૂત અથવા બહેન માનવામાં આવે છે. આલ્ફાપ્રોટોબેક્ટેરિયા અત્યંત વૈવિધ્યસભર છે અને તેમાં થોડી સમાનતાઓ છે, પરંતુ તેમ છતાં એક સામાન્ય પૂર્વજ ધરાવે છે. તમામ પ્રોટીઓબેક્ટેરિયાની જેમ, તેના સભ્યો ગ્રામ-નેગેટિવ હોય છે અને તેના કેટલાક અંતઃકોશિક પરોપજીવી સભ્યોમાં પેપ્ટિડોગ્લાયકેનનો અભાવ હોય છે અને પરિણામે ગ્રામ ચલ હોય છે. લાક્ષણિકતાઓ આલ્ફાપ્રોટોબેક્ટેરિયા એક વૈવિધ્યસભર વર્ગીકરણ છે અને તેમાં કેટલીક ફોટોટ્રોફિક જાતિઓનો સમાવેશ થાય છે, જેમાં કેટલીક જાતિઓ ચયાપચય કરતા C1-સંયોજનો (દા. ત., મિથાઈલોબેક્ટેરિયમ એસપીપી) નો સમાવેશ થાય છે. ), છોડના પ્રતીકો (દા. ત., રાઇઝોબિયમ એસપીપી. ), આર્થ્રોપોડ્સના એન્ડોસિમ્બિયોન્ટ્સ (વોલ્બાચિયા) અને ઇન્ટ્રાસેલ્યુલર પેથોજેન્સ (દા. ત. રિકેટ્સિયા). વધુમાં, આ વર્ગ પ્રોટોમિટોકોન્ડ્રિયનની બહેન છે, જે બેક્ટેરિયમ યુકેરીયોટિક પૂર્વજ દ્વારા ઘેરાયેલું હતું અને મિટોકોન્ડ્રિયાને જન્મ આપ્યો હતો, જે યુકેરીયોટિક કોષોમાં ઓર્ગેનેલ્સ છે (એન્ડોસિમ્બાયોટિક થિયરી જુઓ). તકનીકી રસ ધરાવતી પ્રજાતિ રાઇઝોબિયમ રેડિયોબેક્ટર (અગાઉ એગ્રોબેક્ટેરિયમ ટુમેફેસિઅન્સ) છેઃ વૈજ્ઞાનિકો ઘણીવાર આ પ્રજાતિનો ઉપયોગ છોડના જીનોમમાં વિદેશી ડીએનએને સ્થાનાંતરિત કરવા માટે કરે છે. એરોબિક એનોક્સિજેનિક ફોટોટ્રોફિક બેક્ટેરિયા, જેમ કે પેલાગીબેક્ટર યુબીક, આલ્ફાપ્રોટોબેક્ટેરિયા છે જે વ્યાપકપણે વહેંચાયેલા છે અને ખુલ્લા મહાસાગરના માઇક્રોબાયલ સમુદાયના 10 ટકાથી વધુ હિસ્સો ધરાવે છે. ઉત્ક્રાંતિ અને જીનોમિક્સ ઓર્ડરની ફિલોજેની પર કેટલાક મતભેદ છે, ખાસ કરીને પેલાગીબેક્ટેરલ્સના સ્થાન માટે, પરંતુ એકંદરે કેટલીક સર્વસંમતિ છે. આ વિસંગતતા જનીનની સામગ્રીમાં મોટા તફાવતને કારણે પેદા થાય છે (દા. ત. પેલાગીબેક્ટર યુબીકમાં જીનોમ સુવ્યવસ્થિત) અને ઘણા ઓર્ડરના સભ્યો વચ્ચે જીસી-સામગ્રીમાં મોટો તફાવત. ખાસ કરીને, પેલાગીબેક્ટેરેલ્સ, રિકેટસિયાલિસ અને હોલોસ્પોરેલ્સમાં એટી-સમૃદ્ધ જીનોમ ધરાવતી પ્રજાતિઓ હોય છે. એવી દલીલ કરવામાં આવી છે કે તે અભિસારી ઉત્ક્રાંતિનો કિસ્સો હોઈ શકે છે જે એક કલાકૃતિ ક્લસ્ટરિંગમાં પરિણમશે. જો કે, કેટલાક અભ્યાસો અસંમત છે. વધુમાં, એવું જાણવા મળ્યું છે કે રાઇબોસોમલ આર. એન. એ. (પ્રોકેરીયોટ્સ માટેનું પરંપરાગત ફિલોજેનેટિક માર્કર) ની જી. સી.-સામગ્રી જીનોમની જી. સી.-સામગ્રીને ઓછી પ્રતિબિંબિત કરે છે. ફિલોજેની સાથે રાઇબોસોમલ જી. સી.-સામગ્રીના આ બિનપરંપરાગત સુશોભનનું એક ઉદાહરણ એ છે કે હોલોસ્પોરેલ્સના સભ્યો પેલાગીબેક્ટેરેલ્સ અને રિકેટ્સિયલ્સના સભ્યોની તુલનામાં ઘણી વધારે રાઇબોસોમલ જી. સી.-સામગ્રી ધરાવે છે, તેમ છતાં તેઓ ઉચ્ચ જીનોમિક જી. સી.-સામગ્રી ધરાવતી પ્રજાતિઓ સાથે વધુ નજીકથી સંબંધિત છે. વર્ગ આલ્ફાપ્રોટોબેક્ટેરિયાને ત્રણ પેટા વર્ગોમાં વહેંચવામાં આવે છે-મેગ્નેટોકોસિડે, રિકેટસિડે અને કોલોબેક્ટેરિડે. મૂળભૂત જૂથ મેગ્નેટોકોકિડે છે, જે મેગ્નેટોટેક્ટિક બેક્ટેરિયાની વિશાળ વિવિધતા દ્વારા બનેલું છે, પરંતુ માત્ર એકનું વર્ણન કરવામાં આવ્યું છે, મેગ્નેટોકોકસ મેરિનસ. રિકેટ્સિડે ઇન્ટ્રાસેલ્યુલર રિકેટ્સિયલ્સ અને મુક્ત-જીવંત પેલાગીબેક્ટેરેલ્સથી બનેલો છે. કોલોબેક્ટેરિડેમાં હોલોસ્પોરેલ્સ, રોડોસ્પિરિલેલ્સ, સ્ફિંગોમોનાડેલ્સ, રોડોબેક્ટેરેલ્સ, કોલોબેક્ટેરેલ્સ, કિલોનીએલેલ્સ, કોર્ડિમોનાડેલ્સ, પર્વ્યુલરક્યુલેલ્સ અને સ્નીથીએલેલ્સનો સમાવેશ થાય છે. અનુક્રમિત જીનોમના તુલનાત્મક વિશ્લેષણથી પણ વ્યાપક રીતે વિતરિત પ્રોટીન અને સંપૂર્ણ પ્રોટીન (એટલે કે સંપૂર્ણ પ્રોટીન) માં ઘણા સંરક્ષિત નિવેશ-વિલોપન (ઇન્ડેલ્સ) ની શોધ થઈ છે. સિગ્નેચર પ્રોટીન) જે તમામ આલ્ફાપ્રોટોબેક્ટેરિયા અથવા તેમના વિવિધ મુખ્ય ક્રમની વિશિષ્ટ લાક્ષણિકતાઓ છે. રાઇઝોબિયલ્સ, રોડોબેક્ટેરલ્સ, રોડોસ્પિરિલલ્સ, રિકેટ્સિયલ્સ, સ્ફિંગોમોનાડેલ્સ અને કોલોબેક્ટેરલ્સ) અને પરિવારો (એટલે કે. રિકેટ્સિયેસી, એનાપ્લાસ્મેટેસી, રોડોસ્પિરિલેસી, એસીટોબેક્ટેરેસી, બ્રેડીરિઓઝોબિયાસી, બ્રુસેલેસી અને બાર્ટોનેલેસી). આ પરમાણુ સંકેતો આ વર્ગીકરણ જૂથોની ઘેરાબંધી માટે અને આ જૂથોમાં નવી પ્રજાતિઓની ઓળખ/સોંપણી માટે નવીન માધ્યમો પૂરા પાડે છે. મોટી સંખ્યામાં અન્ય પ્રોટીનમાં ફિલોજેનેટિક વિશ્લેષણ અને સંરક્ષિત ઇન્ડેલ્સ પુરાવા પૂરા પાડે છે કે બીટાપ્રોટોબેક્ટેરિયા અને ગામાપ્રોટોબેક્ટેરિયા સિવાયના મોટાભાગના અન્ય ફાયલા અને બેક્ટેરિયાના વર્ગો કરતાં આલ્ફાપ્રોટોબેક્ટેરિયાની શાખાઓ પાછળથી બંધ થઈ ગઈ છે. આલ્ફાપ્રોટોબેક્ટેરિયાના ફિલોજેનીની સતત સમીક્ષા કરવામાં આવે છે અને તેમાં સુધારા કરવામાં આવે છે. આલ્ફાપ્રોટોબેક્ટેરિયામાં મેગ્નેટોકોસિડેના સમાવેશ માટે કેટલીક ચર્ચાઓ છે. ઉદાહરણ તરીકે, મેગ્નેટોકોકિડે માટે એક સ્વતંત્ર પ્રોટિઓબેક્ટેરિયલ વર્ગ (ઇટાપ્રોટોબેક્ટેરિયા) ની દરખાસ્ત કરવામાં આવી છે. તાજેતરના ફિલોજેનોમિક અભ્યાસ સૂચવે છે કે મેગ્નેટોકોકિડે અને અન્ય તમામ આલ્ફાપ્રોટોબેક્ટેરિયલ ટેક્સાની વચ્ચે પ્રોટોમિટોકોન્ડ્રીયલ ક્લેડની પ્લેસમેન્ટ સૂચવે છે, જે મેગ્નેટોકોકિડે સિવાયના બાકીના આલ્ફાપ્રોટોબેક્ટેરિયાથી પ્રોટોમિટોકોન્ડ્રીયલ વંશના પ્રારંભિક વિચલન સૂચવે છે. આ ફિલોજેની એ પણ સૂચવે છે કે પ્રોટોમિટોકોન્ડ્રીયલ વંશનો રિકેટસિડે સાથે ગાઢ સંબંધ હોવો જરૂરી નથી. ઇન્સેર્ટે સેડિસ આલ્ફાપ્રોટોબેક્ટેરિયાને નીચેના ટેક્સાને સોંપવામાં આવ્યા છે, પરંતુ એક અથવા વધુ મધ્યવર્તી વર્ગીકરણ રેન્કને સોંપવામાં આવ્યા નથીઃ ઉપવર્ગ મિનવ્યુલીસ સન એટ અલને સોંપવામાં ન આવેલા ઓર્ડર્સ. 2018 જેનેરા "કેન્ડિડેટસ એનોક્સિપેલાગિબેક્ટર" રુઇઝ-પેરેઝ એટ અલ પરિવારને સોંપવામાં આવ્યું નથી. 2021 "બિલોફોકોકસ" મોએન્ચ 1988 "ચેરોનોમાઇક્રોબિયમ" સોટોની એટ અલ. 2011 "કેન્ડિડેટસ એન્ડોલિસોક્લિનમ" ક્વાન એટ અલ. 2012 "કેન્ડિડેટસ એન્ડોવેટર્સપોરા" એન્ડરસન અને હેગુડ 2007 "કેન્ડિડેટસ હેલિસોમિક્રોબિયમ" લેવાન્ટેસી એટ અલ. 2004 "કેન્ડિડેટસ હેલિસોસ્ફેરા" ક્રેગેલન્ડ એટ અલ. 2006 "કેન્ડિડેટસ હોજકિનિયા" મેકકચ્યોન એટ અલ. 2009 "કેન્ડિડેટસ લારિસ્કેલા" માત્સુઉરા એટ અલ. 2012 "મેરિનોસલ્ફોનોમાસ" હોમ્સ એટ અલ. 1997 "કેન્ડિડેટસ મેસોપેલાગિબેક્ટર" રુઇઝ-પેરેઝ એટ અલ. 2021 "મિથાઈલોસલ્ફોનોમોનાસ" હોમ્સ એટ અલ. 1997 "કેન્ડિડેટસ મોનિલીબેક્ટર" ક્રેગેલુંડ એટ અલ. 2006 "નેનોબેક્ટેરિયમ" સિફ્ટસિઓગ્લુ એટ અલ. 1997 "ઓલિયોમોનાસ" કાનામોરી એટ અલ. 2002 "કેન્ડિડેટસ પેરાહોલોસ્પોરા" Eschbach et al. 2009 "કેન્ડિડેટસ ફાયકોસોસીયસ" તનાબે એટ અલ. 2015 "કેન્ડિડેટસ પુનિસિસ્પિરિલમ" ઓહ એટ અલ. 2010 "ટેટ્રાકોક્કસ" બ્લેકલ એટ અલ. 1997 "ટ્યુબેરોઇડોબેક્ટર" નિકિટિન 1983 પ્રજાતિઓ વિબ્રિયો અનુકૂલન મુઇર એટ અલ જાતિને સોંપવામાં આવી નથી. 1990 વિબ્રિયો સાયક્લોસાઇટ્સ મુઇર એટ અલ. 1990 ફિલોજેની હાલમાં સ્વીકૃત વર્ગીકરણ સ્ટેન્ડિંગ ઇન નોમેનક્લેચર (એલ. પી. એસ. એન.) સાથે પ્રોકેરીયોટિક નામોની સૂચિ પર આધારિત છે. ફિલોજેની સંપૂર્ણ જીનોમ વિશ્લેષણ પર આધારિત છે. પેટા વર્ગના નામો ફર્લા એટ અલ પર આધારિત છે. (2013). આલ્ફાપ્રોટોબેક્ટેરિયામાં કુદરતી આનુવંશિક પરિવર્તન પર માત્ર થોડા જ અભ્યાસોની જાણ કરવામાં આવી હોવા છતાં, આ પ્રક્રિયાને એગ્રોબેક્ટેરિયમ ટુમેફેસિઅન્સ, મિથાઈલોબેક્ટેરિયમ ઓર્ગેનોફિલમ અને બ્રેડીરીઝોબિયમ જેપોનિકમમાં વર્ણવવામાં આવી છે. કુદરતી આનુવંશિક પરિવર્તન એ એક જાતીય પ્રક્રિયા છે જેમાં મધ્યવર્તી માધ્યમ દ્વારા એક બેક્ટેરિયલ કોષમાંથી બીજામાં ડીએનએ ટ્રાન્સફર થાય છે, અને સમરૂપ પુનઃસંયોજન દ્વારા પ્રાપ્તકર્તા જિનોમમાં દાતા ક્રમનું એકીકરણ થાય છે. નોંધો સંદર્ભો બાહ્ય કડીઓ બેક્ટેરિયલ (પ્રોકેરીયોટિક) ફિલોજેની વેબપૃષ્ઠઃ આલ્ફા પ્રોટીઓબેક્ટેરિયા. બેક્ટેરિયાના વર્ગો