Regulation of gene expression
જનીન અભિવ્યક્તિના નિયમન અથવા જનીન નિયમનમાં વિવિધ પદ્ધતિઓનો સમાવેશ થાય છે જેનો ઉપયોગ કોષો દ્વારા ચોક્કસ જનીન ઉત્પાદનો (પ્રોટીન અથવા આર. એન. એ.) ના ઉત્પાદનને વધારવા અથવા ઘટાડવા માટે થાય છે. જનીન અભિવ્યક્તિના અદ્યતન કાર્યક્રમો જીવવિજ્ઞાનમાં વ્યાપકપણે જોવા મળે છે, ઉદાહરણ તરીકે વિકાસલક્ષી માર્ગોને વેગ આપવા, પર્યાવરણીય ઉત્તેજનાઓને પ્રતિસાદ આપવા અથવા નવા ખાદ્ય સ્રોતો સાથે અનુકૂલન કરવા. જનીન અભિવ્યક્તિનું વર્ચ્યુઅલ કોઈપણ પગલું ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ દીક્ષાથી આરએનએ પ્રક્રિયા અને પ્રોટીનના અનુવાદ પછીના ફેરફાર સુધી મોડ્યુલેટ કરી શકાય છે. મોટેભાગે, એક જનીન નિયમનકાર બીજાને નિયંત્રિત કરે છે, અને તેથી વધુ, જનીન નિયમનકારી નેટવર્કમાં. વાયરસ, પ્રોકેરીયોટ્સ અને યુકેરીયોટ્સ માટે જનીન નિયમન આવશ્યક છે કારણ કે તે જ્યારે જરૂર પડે ત્યારે કોષને પ્રોટીન વ્યક્ત કરવાની મંજૂરી આપીને જીવતંત્રની વૈવિધ્યતા અને અનુકૂલનક્ષમતામાં વધારો કરે છે. જો કે 1951 ની શરૂઆતમાં, બાર્બરા મેકક્લિન્ટોકે મકાઈના બિયારણના રંગની રચનામાં બે આનુવંશિક સ્થાન, સક્રિયક (એસી) અને વિઘટનકર્તા (ડીએસ) વચ્ચેની ક્રિયાપ્રતિક્રિયા દર્શાવી હતી, જનીન નિયમન પ્રણાલીની પ્રથમ શોધને વ્યાપકપણે 1961 માં લાખ ઓપેરોનની ઓળખ માનવામાં આવે છે, જેની શોધ ફ્રાન્કોઇસ જેકબ અને જેક્સ મોનોડ દ્વારા કરવામાં આવી હતી, જેમાં લેક્ટોઝ ચયાપચયમાં સામેલ કેટલાક ઉત્સેચકો ઇ. કોલી દ્વારા માત્ર લેક્ટોઝની હાજરી અને ગ્લુકોઝની ગેરહાજરીમાં વ્યક્ત કરવામાં આવે છે. બહુકોશિક સજીવોમાં, જનીન નિયમન ગર્ભમાં સેલ્યુલર તફાવત અને મોર્ફોજેનેસિસને ચલાવે છે, જે વિવિધ પ્રકારના કોષોની રચના તરફ દોરી જાય છે જે સમાન જિનોમ ક્રમમાંથી વિવિધ જનીન અભિવ્યક્તિ રૂપરેખાઓ ધરાવે છે. જોકે આ જનીન નિયમનની ઉત્પત્તિ કેવી રીતે થઈ તે સમજાવતું નથી, તેમ છતાં ઉત્ક્રાંતિવાદી જીવવિજ્ઞાનીઓ તેને પરમાણુ સ્તરે ઉત્ક્રાંતિ કેવી રીતે કાર્ય કરે છે તેના આંશિક સમજૂતી તરીકે સામેલ કરે છે, અને તે ઉત્ક્રાંતિ વિકાસાત્મક જીવવિજ્ઞાન ("ઇવો-દેવો") ના વિજ્ઞાનનું કેન્દ્ર છે. જનીન અભિવ્યક્તિનાં નિયમનકારી તબક્કાઓ જનીન અભિવ્યક્તિનાં કોઈપણ પગલામાં નિયમન થઈ શકે છે, સંકેતોથી માંડીને અનુલેખનથી માંડીને પ્રોટીનનાં અનુવાદ પછીનાં ફેરફારો સુધી. નીચેના તબક્કાઓની યાદી છે જ્યાં જનીન અભિવ્યક્તિનું નિયમન કરવામાં આવે છે, જ્યાં સૌથી વધુ ઉપયોગમાં લેવાતું બિંદુ ટ્રાન્સક્રિપ્શનની શરૂઆત છે, ટ્રાન્સક્રિપ્શનમાં પ્રથમ તબક્કોઃ સિગ્નલ ટ્રાન્સડક્શન ક્રોમેટિન, ક્રોમેટિન રિમોડેલિંગ, ક્રોમેટિન ડોમેન્સ ટ્રાન્સક્રિપ્શન પોસ્ટ-ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ મોડિફિકેશન આરએનએ ટ્રાન્સપોર્ટ ટ્રાન્સલેશન એમઆરએનએ ડિગ્રેડેશન ડીએનએમાં ફેરફાર યુકેરીયોટ્સમાં, ડીએનએના મોટા પ્રદેશોની સુલભતા તેના ક્રોમેટિન માળખા પર આધાર રાખી શકે છે, જેને ડીએનએ મિથાઇલેશન, એનસીઆરએનએ અથવા ડીએનએ-બંધનકર્તા પ્રોટીન દ્વારા નિર્દેશિત હિસ્ટોન ફેરફારોના પરિણામે બદલી શકાય છે. તેથી આ ફેરફારો જનીનની અભિવ્યક્તિને ઉપર અથવા નીચે નિયંત્રિત કરી શકે છે. આમાંના કેટલાક ફેરફારો કે જે જનીન અભિવ્યક્તિનું નિયમન કરે છે તે વારસાગત છે અને તેને એપિજેનેટિક નિયમન તરીકે ઓળખવામાં આવે છે. ડીએનએનું માળખાકીય અનુલેખન તેની રચના દ્વારા નક્કી થાય છે. સામાન્ય રીતે, તેના પેકિંગની ઘનતા ટ્રાન્સક્રિપ્શનની આવર્તનનું સૂચક છે. હિસ્ટોન્સ તરીકે ઓળખાતા ઓક્ટામેરિક પ્રોટીન સંકુલ અને આઠ હિસ્ટોન પ્રોટીનની આસપાસના ડીએનએના એક ભાગ (એકસાથે ન્યુક્લિયોસોમ તરીકે ઓળખાય છે) ડીએનએના સુપરકોઈલિંગની માત્રા માટે જવાબદાર છે, અને આ સંકુલને ફોસ્ફોરાયલેશન જેવી પ્રક્રિયાઓ દ્વારા અસ્થાયી રૂપે સુધારી શકાય છે અથવા મિથાઇલેશન જેવી પ્રક્રિયાઓ દ્વારા વધુ કાયમી ધોરણે સુધારી શકાય છે. આવા ફેરફારો જનીન અભિવ્યક્તિના સ્તરોમાં વધુ કે ઓછા કાયમી ફેરફારો માટે જવાબદાર માનવામાં આવે છે. ડીએનએનું રાસાયણિક મિથાઇલેશન એ જનીન મૌન કરવાની એક સામાન્ય પદ્ધતિ છે. ડીએનએ સામાન્ય રીતે સી. પી. જી. ડાયન્યુક્લિયોટાઇડ ક્રમમાં સાયટોસિન ન્યુક્લિયોટાઇડ પર મિથાઈલટ્રાન્સફેરેઝ ઉત્સેચકો દ્વારા મિથાઇલેટ થાય છે (જ્યારે ગીચ ક્લસ્ટર થાય છે ત્યારે તેને "સી. પી. જી. ટાપુઓ" પણ કહેવાય છે). ડીએનએના આપેલ પ્રદેશમાં મિથાઇલેશનની પેટર્નનું વિશ્લેષણ (જે પ્રમોટર હોઈ શકે છે) બાયસલ્ફાઇટ મેપિંગ નામની પદ્ધતિ દ્વારા પ્રાપ્ત કરી શકાય છે. મિથાઇલેટેડ સાયટોસિન અવશેષો સારવાર દ્વારા બદલાતા નથી, જ્યારે અનમિથાઇલેટેડ અવશેષોને યુરેસિલમાં બદલવામાં આવે છે. તફાવતનું વિશ્લેષણ ડી. એન. એ. ક્રમ દ્વારા અથવા એસ. એન. પી. ને માપવા માટે વિકસાવવામાં આવેલી પદ્ધતિઓ દ્વારા કરવામાં આવે છે, જેમ કે પાયરોસીક્વેન્સિંગ (બાયોટેજ) અથવા માસએરે (સિક્વેનોમ), જે સી. જી. ડિન્યુક્લિયોટાઇડ પર સી/ટીની સંબંધિત માત્રાને માપે છે. અસામાન્ય મિથાઇલેશન પેટર્ન ઓન્કોજેનેસિસમાં સામેલ હોવાનું માનવામાં આવે છે. ટ્રાન્સક્રિપ્શનમાં હિસ્ટોન એસિટિલેશન પણ એક મહત્વપૂર્ણ પ્રક્રિયા છે. સી. આર. ઈ. બી.-બંધનકર્તા પ્રોટીન જેવા હિસ્ટોન એસિટિલટ્રાન્સફેરેઝ ઉત્સેચકો (એચ. એ. ટી.) પણ હિસ્ટોન સંકુલમાંથી ડી. એન. એ. ને અલગ કરે છે, જેનાથી અનુલેખનને આગળ વધવાની મંજૂરી મળે છે. મોટેભાગે, ડીએનએ મિથાઇલેશન અને હિસ્ટોન ડિસેટીલેશન જનીન મૌનમાં સાથે મળીને કામ કરે છે. બંનેનું સંયોજન જનીન અભિવ્યક્તિને ઘટાડીને, ડીએનએને વધુ ગીચતાથી પેક કરવા માટેનો સંકેત લાગે છે. ટ્રાન્સક્રિપ્શનનું નિયમન ટ્રાન્સક્રિપ્શનનું નિયમન આમ ટ્રાન્સક્રિપ્શન ક્યારે થાય છે અને કેટલું આર. એન. એ. બને છે તે નિયંત્રિત કરે છે. આર. એન. એ. પોલિમરેઝ દ્વારા જનીનનું અનુલેખન અનેક પદ્ધતિઓ દ્વારા નિયંત્રિત કરી શકાય છે. ચોક્કસ પરિબળો આપેલ પ્રમોટર અથવા પ્રમોટરના સમૂહ માટે આર. એન. એ. પોલિમરેઝની વિશિષ્ટતામાં ફેરફાર કરે છે, જે તેને તેમની સાથે જોડાવાની શક્યતા વધારે કે ઓછી બનાવે છે (એટલે કે, પ્રોકેરીયોટિક ટ્રાન્સક્રિપ્શનમાં ઉપયોગમાં લેવાતા સિગ્મા પરિબળો). રિપ્રેસર ઓપરેટર સાથે જોડાય છે, ડીએનએ સ્ટ્રાન્ડ પર કોડિંગ સિક્વન્સ જે પ્રમોટર ક્ષેત્રની નજીક અથવા ઓવરલેપ થાય છે, સ્ટ્રાન્ડ સાથે આરએનએ પોલિમરેઝની પ્રગતિને અવરોધે છે, આમ જનીનની અભિવ્યક્તિને અવરોધે છે. જમણી બાજુની છબી લેક ઓપેરોનમાં રિપ્રેસર દ્વારા નિયમન દર્શાવે છે. સામાન્ય અનુલેખન પરિબળો પ્રોટીન-કોડિંગ ક્રમની શરૂઆતમાં આર. એન. એ. પોલિમરેઝને સ્થાન આપે છે અને પછી એમ. આર. એન. એ. ને અનુલેખન કરવા માટે પોલિમરેઝને મુક્ત કરે છે. સક્રિયકો આર. એન. એ. પોલિમરેઝ અને ચોક્કસ પ્રવર્તક વચ્ચેની ક્રિયાપ્રતિક્રિયામાં વધારો કરે છે, જે જનીનની અભિવ્યક્તિને પ્રોત્સાહિત કરે છે. સક્રિયકો પ્રવર્તક માટે આર. એન. એ. પોલિમરેઝનું આકર્ષણ વધારીને, આર. એન. એ. પોલિમરેઝના પેટા એકમો સાથેની ક્રિયાપ્રતિક્રિયા દ્વારા અથવા પરોક્ષ રીતે ડી. એન. એ. ની રચનાને બદલીને આ કરે છે. એન્હાન્સર્સ એ ડીએનએ હેલિક્સ પરની સાઇટ્સ છે જે દીક્ષા સંકુલમાં ચોક્કસ પ્રમોટરને લાવતા ડીએનએને લૂપ કરવા માટે સક્રિયકો દ્વારા બંધાયેલી હોય છે. પ્રોકેરીયોટ્સ કરતાં યુકેરીયોટ્સમાં એન્હાન્સર્સ વધુ સામાન્ય છે, જ્યાં માત્ર થોડા ઉદાહરણો અસ્તિત્વમાં છે (આજ સુધી). સાયલેન્સર્સ એ ડીએનએ સિક્વન્સના પ્રદેશો છે, જે જ્યારે ચોક્કસ ટ્રાન્સક્રિપ્શન પરિબળો દ્વારા બંધાયેલા હોય, ત્યારે જનીનની અભિવ્યક્તિને શાંત કરી શકે છે. આર. એન. એ. આર. એન. એ. દ્વારા નિયમન જનીન પ્રવૃત્તિનું એક મહત્વપૂર્ણ નિયમનકાર હોઈ શકે છે, દા. ત. માઇક્રો આર. એન. એ. (એમ. આઈ. આર. એન. એ.), એન્ટિસેન્સ-આર. એન. એ. અથવા લાંબા નોન-કોડિંગ આર. એન. એ. (એલ. એન. સી. આર. એન. એ.) દ્વારા. એલએનસીઆરએનએ એ અર્થમાં એમઆરએનએથી અલગ છે કે તેઓ ઉપકોષીય સ્થાનો અને કાર્યોને નિર્દિષ્ટ કરે છે. તેઓ સૌપ્રથમ ન્યુક્લિયસ અને ક્રોમેટિનમાં સ્થિત હોવાનું જાણવા મળ્યું હતું, અને સ્થાનિકીકરણ અને કાર્યો હવે અત્યંત વૈવિધ્યસભર છે. કેટલાક હજુ પણ ક્રોમેટિનમાં રહે છે જ્યાં તેઓ પ્રોટીન સાથે સંપર્ક કરે છે. જ્યારે આ એલએનસીઆરએનએ આખરે પાર્કિન્સન, હંટીંગ્ટન અને અલ્ઝાઇમર રોગ જેવી ચેતાકોષીય વિકૃતિઓમાં જનીન અભિવ્યક્તિને અસર કરે છે, અન્ય, જેમ કે, પીએનસીટીઆર (પાયરિમિડીન-સમૃદ્ધ બિન-કોડિંગ ટ્રાન્સક્રિપ્ટર્સ), ફેફસાના કેન્સરમાં ભૂમિકા ભજવે છે. રોગમાં તેમની ભૂમિકાને ધ્યાનમાં રાખીને, એલએનસીઆરએનએ સંભવિત બાયોમાર્કર્સ છે અને દવાઓ અથવા જનીન ઉપચાર માટે ઉપયોગી લક્ષ્યો હોઈ શકે છે, જો કે હજી સુધી એલએનસીઆરએનએને લક્ષ્ય કરતી કોઈ માન્ય દવાઓ નથી. માનવ જિનોમમાં એલએનસીઆરએનએની સંખ્યા નબળી રીતે વ્યાખ્યાયિત કરવામાં આવી છે, પરંતુ કેટલાક અંદાજો 16,000 થી 100,000 એલએનસી જનીનો સુધીના છે. એપિજેનેટિક જનીન નિયમન એપિજેનેટિક્સ એ જનીનોના ફેરફારનો ઉલ્લેખ કરે છે જે ડીએનએ અથવા આરએનએ ક્રમમાં ફેરફાર કરતા નથી. જનીન અભિવ્યક્તિને પ્રભાવિત કરવામાં એપિજેનેટિક ફેરફારો પણ મુખ્ય પરિબળ છે. તેઓ જીનોમિક ડીએનએ અને હિસ્ટોન્સ પર થાય છે અને તેમના રાસાયણિક ફેરફારો વધુ કાર્યક્ષમ રીતે જનીન અભિવ્યક્તિને નિયંત્રિત કરે છે. સસ્તન પ્રાણીઓના કોષોમાં ડીએનએ (સામાન્ય રીતે મિથાઇલેશન) ના ઘણા ફેરફારો અને આરએનએના 100 થી વધુ ફેરફારો છે. "તે ફેરફારો ડીએનએ સાથે પ્રોટીન બંધનમાં ફેરફાર અને આરએનએ સ્થિરતા અને અનુવાદ કાર્યક્ષમતામાં ફેરફારમાં પરિણમે છે. માનવ જીવવિજ્ઞાન અને રોગના વિશેષ કિસ્સાઓમાં કેન્સરમાં અનુલેખનનું નિયમન કરોડઅસ્થિધારી પ્રાણીઓમાં, મોટાભાગના જનીન પ્રવર્તકો અસંખ્ય CpG સ્થળો સાથે CpG ટાપુ ધરાવે છે. જ્યારે જનીનની ઘણી પ્રમોટર સી. પી. જી. સાઇટ્સ મિથાઇલેટેડ થાય છે ત્યારે જનીન શાંત થઈ જાય છે. કોલોરેક્ટલ કેન્સરમાં સામાન્ય રીતે 3 થી 6 ડ્રાઇવર મ્યુટેશન અને 33 થી 66 હાઈચકિકર અથવા પેસેન્જર મ્યુટેશન હોય છે. જો કે, કેન્સરની પ્રગતિમાં પરિવર્તન કરતાં ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ મૌન વધુ મહત્વનું હોઈ શકે છે. ઉદાહરણ તરીકે, કોલોરેક્ટલ કેન્સરમાં લગભગ 600 થી 800 જનીનોને સી. પી. જી. આઇલેન્ડ મિથાઇલેશન દ્વારા અનુલેખન દ્વારા શાંત કરવામાં આવે છે (કેન્સરમાં અનુલેખનનું નિયમન જુઓ). કેન્સરમાં ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ દમન અન્ય એપિજેનેટિક પદ્ધતિઓ દ્વારા પણ થઈ શકે છે, જેમ કે માઇક્રોઆરએનએની બદલાયેલી અભિવ્યક્તિ. સ્તન કેન્સરમાં, બી. આર. સી. એ. 1 નું ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ દમન બી. આર. સી. એ. 1 પ્રમોટરના હાયપરમેથાઇલેશન કરતાં વધુ-અભિવ્યક્ત માઇક્રોઆરએનએ-182 દ્વારા વધુ વારંવાર થઈ શકે છે (સ્તન અને અંડાશયના કેન્સરમાં બી. આર. સી. એ. 1 ની ઓછી અભિવ્યક્તિ જુઓ). વ્યસનમાં અનુલેખનનું નિયમન વ્યસનની મુખ્ય લાક્ષણિકતાઓમાંની એક તેની દ્રઢતા છે. સતત વર્તણૂકીય ફેરફારો લાંબા સમય સુધી ચાલતા ફેરફારોને કારણે હોવાનું જણાય છે, જે મગજના ચોક્કસ પ્રદેશોમાં જનીન અભિવ્યક્તિને અસર કરતા એપિજેનેટિક ફેરફારોના પરિણામે થાય છે. દુરુપયોગની દવાઓ મગજમાં ત્રણ પ્રકારના એપિજેનેટિક પરિવર્તનનું કારણ બને છે. આ છે (1) હિસ્ટોન એસિટિલેશન અને હિસ્ટોન મિથાઇલેશન, (2) સી. પી. જી. સ્થળો પર ડી. એન. એ. મિથાઇલેશન, અને (3) માઇક્રો આર. એન. એ. નું એપિજેનેટિક ડાઉનરેગ્યુલેશન અથવા અપરેગ્યુલેશન. (કેટલીક વિગતો માટે કોકેન વ્યસનના એપિજેનેટિક્સ જુઓ.) ઉંદરમાં ક્રોનિક નિકોટિનનું સેવન હિસ્ટોન્સના એસિટિલેશન દ્વારા જનીન અભિવ્યક્તિના મગજના કોષના એપિજેનેટિક નિયંત્રણને બદલે છે. આનાથી એફ. ઓ. એસ. બી. પ્રોટીનના મગજમાં અભિવ્યક્તિ વધે છે, જે વ્યસનમાં મહત્વપૂર્ણ છે. સિગારેટના વ્યસનનો અભ્યાસ લગભગ 16,000 મનુષ્યોમાં પણ કરવામાં આવ્યો હતો, જેમાં ક્યારેય ધૂમ્રપાન ન કરનારાઓ, વર્તમાનમાં ધૂમ્રપાન કરનારાઓ અને 30 વર્ષ સુધી ધૂમ્રપાન છોડનારાઓનો સમાવેશ થાય છે. રક્ત કોશિકાઓમાં, 18,000 થી વધુ સી. પી. જી. સાઇટ્સે (જિનોમમાં અંદાજે 450,000 વિશ્લેષણ કરાયેલ સી. પી. જી. સાઇટ્સમાંથી) વર્તમાન ધૂમ્રપાન કરનારાઓમાં વારંવાર મિથાઇલેશનમાં ફેરફાર કર્યો હતો. આ સી. પી. જી. સાઇટ્સ 7,000 થી વધુ જનીનોમાં અથવા જાણીતા માનવ જનીનોના આશરે ત્રીજા ભાગમાં જોવા મળે છે. ધૂમ્રપાન બંધ કર્યાના પાંચ વર્ષમાં મોટાભાગની વિભેદક રીતે મિથાઇલેટેડ સી. પી. જી. સાઇટ્સ ક્યારેય ધૂમ્રપાન ન કરનારાઓના સ્તરે પરત ફરી હતી. જો કે, 942 જનીનોમાંથી 2,568 સી. પી. જી. અગાઉના અને ક્યારેય ધૂમ્રપાન ન કરનારાઓમાં અલગ રીતે મિથાઇલેટેડ રહ્યા હતા. આવા બાકીના એપિજેનેટિક ફેરફારોને "મોલેક્યુલર સ્કાર્સ" તરીકે જોઈ શકાય છે જે જનીન અભિવ્યક્તિને અસર કરી શકે છે. ઉંદરના નમૂનાઓમાં, કોકેન, મેથામ્ફેટામાઇન, આલ્કોહોલ અને તમાકુના ધુમાડાના ઉત્પાદનો સહિતની દુરુપયોગની દવાઓ, મગજમાં ડીએનએને નુકસાન પહોંચાડે છે. ડીએનએ નુકસાનના સમારકામ દરમિયાન કેટલીક વ્યક્તિગત સમારકામની ઘટનાઓ નુકસાનના સ્થળો પર ડીએનએના મિથાઇલેશન અને/અથવા હિસ્ટોન્સના એસિટિલેશન અથવા મિથાઇલેશનમાં ફેરફાર કરી શકે છે, અને આમ ક્રોમેટિન પર એપિજેનેટિક ડાઘ છોડવામાં ફાળો આપી શકે છે. આવા એપિજેનેટિક નિશાન સંભવતઃ વ્યસનમાં જોવા મળતા સતત એપિજેનેટિક ફેરફારોમાં ફાળો આપે છે. શીખવા અને યાદશક્તિમાં અનુલેખનનું નિયમન સસ્તન પ્રાણીઓમાં, ડીએનએમાં સાયટોસિનનું મિથાઇલેશન (આકૃતિ જુઓ) એ મુખ્ય નિયમનકારી મધ્યસ્થી છે. મિથાઇલેટેડ સાયટોસિન મુખ્યત્વે ડાયન્યુક્લિયોટાઇડ ક્રમમાં જોવા મળે છે જ્યાં સાયટોસિન પછી ગુઆનાઇન, એક સી. પી. જી. સાઇટ આવે છે. માનવ જીનોમમાં સી. પી. જી. સાઇટ્સની કુલ સંખ્યા આશરે 28 મિલિયન છે. અને સામાન્ય રીતે તમામ સી. પી. જી. સાઇટ્સમાંથી લગભગ 70 ટકા સાઇટોસિન મિથાઈલેટેડ હોય છે. ઉંદરમાં, શીખવાનો પીડાદાયક અનુભવ, સંદર્ભિત ભય અનુકૂલન, એક જ તાલીમ કાર્યક્રમ પછી જીવનભરની ભયાનક સ્મૃતિમાં પરિણમી શકે છે. ઉંદરના હિપ્પોકેમ્પસ ચેતાકોષ ડીએનએમાં તમામ જનીનોના લગભગ 9.17% ના પ્રમોટર પ્રદેશોમાં સાયટોસિન મિથાઇલેશનમાં ફેરફાર કરવામાં આવે છે જે સંક્ષિપ્ત ભય અનુકૂલન અનુભવને આધિન છે. હિપ્પોકેમ્પસ એ છે જ્યાં શરૂઆતમાં નવી યાદોને સંગ્રહિત કરવામાં આવે છે. જનીનના પ્રમોટર પ્રદેશમાં સી. પી. જી. નું મિથાઇલેશન ટ્રાન્સક્રિપ્શનને દબાવે છે જ્યારે જનીનના શરીરમાં સી. પી. જી. નું મિથાઇલેશન અભિવ્યક્તિમાં વધારો કરે છે. TET ઉત્સેચકો મિથાઇલેટેડ સાયટોસિનના ડિમાઇથાઇલેશનમાં કેન્દ્રિય ભૂમિકા ભજવે છે. TET ઉત્સેચક પ્રવૃત્તિ દ્વારા જનીન પ્રવર્તકમાં CpGનું ડિમાઇથાઇલેશન જનીનનું અનુલેખન વધારે છે. જ્યારે ઉંદર પર સંદર્ભિત ભય અનુકૂલન લાગુ કરવામાં આવે છે, ત્યારે ઉંદર હિપ્પોકેમ્પસ ન્યુરલ જિનોમમાં હિપ્પોકેમ્પસમાં અનુકૂલનના એક કલાક અને 24 કલાક પછી 5,000 થી વધુ ભિન્ન રીતે મિથાઇલેટેડ પ્રદેશો (દરેક 500 ન્યુક્લિયોટાઇડ્સના) થાય છે. આના કારણે લગભગ 500 જનીનોને નિયમન કરવામાં આવે છે (ઘણીવાર પ્રમોટર પ્રદેશમાં સી. પી. જી. સાઇટ્સના ડિમાઇથાઇલેશનને કારણે) અને લગભગ 1,000 જનીનોને ડાઉન-રેગ્યુલેટ કરવામાં આવે છે (ઘણીવાર પ્રમોટર પ્રદેશમાં સી. પી. જી. સાઇટ્સ પર નવા રચાયેલા 5-મિથાઈલસાયટોસિનને કારણે). ચેતાકોષોની અંદર પ્રેરિત અને દબાયેલા જનીનોની પેટર્ન ઉંદરના મગજના હિપ્પોકેમ્પસમાં આ તાલીમ પ્રસંગની પ્રથમ ક્ષણિક યાદશક્તિ બનાવવા માટે પરમાણુ આધાર પૂરો પાડે છે. અનુલેખન પછીનું નિયમન ડીએનએ અનુલેખન થયા પછી અને એમઆરએનએની રચના થયા પછી, એમઆરએનએ પ્રોટીનમાં કેટલું અનુવાદિત થાય છે તેના પર અમુક પ્રકારનું નિયમન હોવું આવશ્યક છે. કોષો કેપિંગ, સ્પ્લિસિંગ, પોલી (એ) પૂંછડીનો ઉમેરો, ક્રમ-વિશિષ્ટ પરમાણુ નિકાસ દર અને કેટલાક સંદર્ભોમાં, આર. એન. એ. ટ્રાન્સક્રિપ્ટનું વિભાજન કરીને આ કરે છે. આ પ્રક્રિયાઓ યુકેરીયોટ્સમાં થાય છે પરંતુ પ્રોકેરીયોટ્સમાં નહીં. આ મોડ્યુલેશન એ પ્રોટીન અથવા ટ્રાન્સક્રિપ્ટનું પરિણામ છે, જે બદલામાં, નિયંત્રિત થાય છે અને ચોક્કસ સિક્વન્સ માટે આકર્ષણ ધરાવે છે. ત્રણ મુખ્ય અનુવાદિત પ્રદેશો અને માઇક્રોઆરએનએ મેસેન્જર આરએનએ (એમઆરએનએ) ના ત્રણ મુખ્ય અનુવાદિત પ્રદેશો (3 '-યુટીઆર) ઘણીવાર નિયમનકારી ક્રમ ધરાવે છે જે અનુલેખન પછી જનીન અભિવ્યક્તિને પ્રભાવિત કરે છે. આવા 3 '-યુ. ટી. આર. માં ઘણીવાર માઇક્રો આર. એન. એ. (એમ. આઈ. આર. એન. એ.) તેમજ નિયમનકારી પ્રોટીન માટે બંને બંધનકર્તા સ્થળો હોય છે. 3 '-યુ. ટી. આર. ની અંદર ચોક્કસ સ્થળો સાથે જોડાણ કરીને, એમ. આઈ. આર. એન. એ. અનુવાદને અવરોધિત કરીને અથવા સીધા ટ્રાન્સક્રિપ્ટના અધઃપતનનું કારણ બનીને વિવિધ એમ. આર. એન. એ. ની જનીન અભિવ્યક્તિને ઘટાડી શકે છે. 3 '-યુ. ટી. આર. માં સાયલેન્સર વિસ્તારો પણ હોઈ શકે છે જે રિપ્રેસર પ્રોટીનને જોડે છે જે એમ. આર. એન. એ. ની અભિવ્યક્તિને અટકાવે છે. 3 '-યુ. ટી. આર. માં ઘણીવાર એમ. આઈ. આર. એન. એ. પ્રતિક્રિયા ઘટકો (એમ. આર. ઈ.) હોય છે. એમ. આર. ઈ. એ એવા ક્રમ છે જેની સાથે એમ. આઈ. આર. એન. એ. જોડાય છે. આ 3 '-યુ. ટી. આર. માં પ્રચલિત રૂપાંકનો છે. 3 '-યુ. ટી. આર. ની અંદરની તમામ નિયમનકારી પ્રણાલીઓમાં (દા. ત. સાયલેન્સર પ્રદેશો સહિત), એમ. આર. ઈ. લગભગ અડધા મોટિફ બનાવે છે. 2014 સુધીમાં, miRNA સિક્વન્સ અને એનોટેશન્સના આર્કાઇવ, miRBase વેબ સાઇટ, 233 જૈવિક પ્રજાતિઓમાં 28,645 એન્ટ્રીઓની યાદી આપે છે. આમાંથી, 1,881 miRNAs એનોટેટેડ માનવ miRNA લોકીમાં હતા. એમ. આઈ. આર. એન. એ. માં સરેરાશ લગભગ ચારસો લક્ષિત એમ. આર. એન. એ. (સેંકડો જનીનોની અભિવ્યક્તિને અસર કરતા) હોવાની આગાહી કરવામાં આવી હતી. ફ્રીડમેન એટ અલ. એવો અંદાજ છે કે માનવ એમ. આર. એન. એ. 3 '-યુ. ટી. આર. ની અંદર 45,000 એમ. આઈ. આર. એન. એ. લક્ષિત સ્થળો પૃષ્ઠભૂમિ સ્તરથી ઉપર સંરક્ષિત છે, અને> 60 ટકા માનવ પ્રોટીન-કોડિંગ જનીનો એમ. આઈ. આર. એન. એ. સાથે જોડી જાળવવા માટે પસંદગીયુક્ત દબાણ હેઠળ છે. સીધા પ્રયોગો દર્શાવે છે કે એક એમ. આઈ. આર. એન. એ. સેંકડો અનન્ય એમ. આર. એન. એ. ની સ્થિરતાને ઘટાડી શકે છે. અન્ય પ્રયોગો દર્શાવે છે કે એક જ miRNA સેંકડો પ્રોટીનના ઉત્પાદનને દબાવી શકે છે, પરંતુ આ દમન ઘણીવાર પ્રમાણમાં હળવું (2 ગણાથી ઓછું) હોય છે. જનીન અભિવ્યક્તિની miRNA અનિયમિતતાની અસરો કેન્સરમાં મહત્વપૂર્ણ હોવાનું જણાય છે. દાખલા તરીકે, જઠરાંત્રિય કેન્સરમાં, 2015ના એક પેપરમાં નવ એમ. આઈ. આર. એન. એ. ને એપિજેનેટિકલી બદલાયેલા અને ડીએનએ રિપેર ઉત્સેચકોને ડાઉન-રેગ્યુલેટ કરવામાં અસરકારક તરીકે ઓળખવામાં આવ્યા હતા. સ્કિઝોફ્રેનિયા, બાયપોલર ડિસઓર્ડર, મેજર ડિપ્રેસિવ ડિસઓર્ડર, પાર્કિન્સન રોગ, અલ્ઝાઇમર રોગ અને ઓટીઝમ સ્પેક્ટ્રમ ડિસઓર્ડર્સ જેવી ન્યુરોસાઇકિયાટ્રિક ડિસઓર્ડર્સમાં જનીન અભિવ્યક્તિની miRNA ડિસરેગ્યુલેશનની અસરો પણ મહત્વપૂર્ણ હોવાનું જણાય છે. અનુવાદનું નિયમન એમ. આર. એન. એ. ના અનુવાદને સંખ્યાબંધ પદ્ધતિઓ દ્વારા પણ નિયંત્રિત કરી શકાય છે, મોટે ભાગે આરંભના સ્તરે. નાના રિબોસોમલ પેટા એકમોની ભરતી ખરેખર mRNA ગૌણ માળખું, એન્ટિસેન્સ RNA બંધન અથવા પ્રોટીન બંધન દ્વારા મોડ્યુલેટ કરી શકાય છે. પ્રોકેરીયોટ્સ અને યુકેરીયોટ્સ બંનેમાં, મોટી સંખ્યામાં આર. એન. એ. બંધનકર્તા પ્રોટીન અસ્તિત્વ ધરાવે છે, જે ઘણીવાર ટ્રાન્સક્રિપ્ટની ગૌણ રચના દ્વારા તેમના લક્ષ્ય ક્રમ તરફ નિર્દેશિત થાય છે, જે અમુક પરિસ્થિતિઓના આધારે બદલાઈ શકે છે, જેમ કે તાપમાન અથવા લિગાન્ડ (એપ્ટામર) ની હાજરી. કેટલાક લખાણો રાઇબોઝાઇમ્સ તરીકે કામ કરે છે અને તેમની અભિવ્યક્તિને સ્વ-નિયંત્રિત કરે છે. જનીન નિયમનના ઉદાહરણો ઉત્સેચક પ્રેરણ એ એક પ્રક્રિયા છે જેમાં અણુ (દા. ત., દવા) ઉત્સેચકની અભિવ્યક્તિને પ્રેરિત કરે છે (એટલે કે, પ્રારંભ કરે છે અથવા વધારે છે). ફળની માખી ડ્રોસોફિલા મેલાનોગાસ્ટરમાં હીટ શોક પ્રોટીનનો સમાવેશ થાય છે. જનીન અભિવ્યક્તિને કેવી રીતે નિયંત્રિત કરી શકાય છે તેનું એક રસપ્રદ ઉદાહરણ લેક ઓપેરોન છે. વાયરસ, માત્ર થોડા જનીનો હોવા છતાં, એન્ટી-ટર્મિનેટર (લેમ્બડા ફેજ) અથવા સ્પ્લિસિંગ મોડ્યુલેટર (એચ. આઈ. વી.) દ્વારા નિયંત્રિત કોલિનિયર સિસ્ટમનો ઉપયોગ કરીને, સામાન્ય રીતે પ્રારંભિક અને અંતમાં તબક્કામાં તેમની જનીન અભિવ્યક્તિને નિયંત્રિત કરવાની પદ્ધતિઓ ધરાવે છે. ગેલ4 એ ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ એક્ટિવેટર છે જે જીએએલ1, જીએએલ7 અને જીએએલ10 (આ બધા ખમીરમાં ગેલેક્ટોઝના મેટાબોલિક માટેના કોડ) ની અભિવ્યક્તિને નિયંત્રિત કરે છે. જનીન અભિવ્યક્તિનો અભ્યાસ કરવા માટે જી. એ. એલ. 4/યુ. એ. એસ. પ્રણાલીનો ઉપયોગ વિવિધ જાતિઓમાં વિવિધ સજીવોમાં કરવામાં આવે છે. વિકાસલક્ષી જીવવિજ્ઞાન મોટી સંખ્યામાં અભ્યાસ કરાયેલી નિયમનકારી પ્રણાલીઓ વિકાસલક્ષી જીવવિજ્ઞાનમાંથી આવે છે. ઉદાહરણોમાં નીચેનાનો સમાવેશ થાય છેઃ હોક્સ જનીન સમૂહની તેમના નેસ્ટેડ એન્ટેરો-પશ્ચાદવર્તી પેટર્ન સાથે કોલીનિયરિટી હાથની પેટર્ન જનરેશન (અંકો-આંતર અંકો): અંગમાં ધ્રુવીકરણ પ્રવૃત્તિના ક્ષેત્રમાંથી સોનિક હેજહોગ (સ્ત્રાવિત પ્રેરક પરિબળ) નો ઢાળ, જે સક્રિય Gli3 નો ઢાળ બનાવે છે, જે ગ્રેમલિનને સક્રિય કરે છે, જે અંગમાં સ્ત્રાવ થતા BMP ને પણ અટકાવે છે, પરિણામે આ પ્રતિક્રિયા-પ્રસરણ પ્રણાલીના પરિણામે પ્રવૃત્તિની વૈકલ્પિક પેટર્નની રચના થાય છે. સોમિટોજેનેસિસ એ એક સમાન પેશી (પૂર્વ-સોમેટિક મેસોડર્મ) માંથી સેગમેન્ટ્સ (સોમાઈટ્સ) ની રચના છે. તેઓ અગ્રવર્તીથી પશ્ચાદવર્તી સુધી ક્રમિક રીતે રચાય છે. આ એમ્નિઓટ્સમાં સંભવતઃ બે વિરોધી ઢાળ દ્વારા પ્રાપ્ત થાય છે, અગ્રવર્તી (તરંગમુખ) માં રેટિનોઇક એસિડ અને પશ્ચાદવર્તીમાં ડબલ્યુ. એન. ટી. અને ડબલ્યુ. એફ. જી. એફ., જે એફ. જી. એફ. + નોચ અને ડબલ્યુ. એન. ટી. થી બનેલી ઓસિલેટિંગ પેટર્ન (વિભાજન ઘડિયાળ) સાથે જોડાયેલ છે. ડ્રોસોફિલાના સોમામાં લિંગ નિર્ધારણ માટે સેક્સ રંગસૂત્ર-એન્કોડેડ જનીનો સાથે ઓટોસોમલ જનીનોના ગુણોત્તરની સંવેદના જરૂરી છે, જે સ્ત્રીઓમાં સેક્સલેસ સ્પ્લિસિંગ પરિબળના ઉત્પાદનમાં પરિણમે છે, પરિણામે ડબલસેક્સની સ્ત્રી આઇસોફોર્મ થાય છે. સર્કિટરી અપ-રેગ્યુલેશન અને ડાઉન-રેગ્યુલેશન અપ-રેગ્યુલેશન એ એક પ્રક્રિયા છે જે સંકેત (કોષની આંતરિક અથવા બાહ્ય ઉત્પત્તિ) દ્વારા પ્રેરિત કોષની અંદર થાય છે, જેના પરિણામે એક અથવા વધુ જનીનોની અભિવ્યક્તિમાં વધારો થાય છે અને પરિણામે પ્રોટીન તે જનીનો દ્વારા એન્કોડ થાય છે. તેનાથી વિપરીત, ડાઉન-રેગ્યુલેશન એ એક પ્રક્રિયા છે જે જનીનમાં ઘટાડો અને અનુરૂપ પ્રોટીન અભિવ્યક્તિમાં પરિણમે છે. અપ-રેગ્યુલેશન થાય છે, ઉદાહરણ તરીકે, જ્યારે કોઈ પ્રકારના રીસેપ્ટરમાં કોષની ઉણપ હોય છે. આ કિસ્સામાં, વધુ રીસેપ્ટર પ્રોટીનનું સંશ્લેષણ કરવામાં આવે છે અને કોષના પટલમાં પરિવહન કરવામાં આવે છે અને આમ, કોષની સંવેદનશીલતાને સામાન્ય સ્થિતિમાં લાવવામાં આવે છે, હોમિયોસ્ટેસિસને પુનઃસ્થાપિત કરે છે. ડાઉન-રેગ્યુલેશન થાય છે, ઉદાહરણ તરીકે, જ્યારે કોષને ન્યુરોટ્રાન્સમીટર, હોર્મોન અથવા દવા દ્વારા લાંબા સમય સુધી વધુ ઉત્તેજિત કરવામાં આવે છે, અને કોષને સુરક્ષિત રાખવા માટે રીસેપ્ટર પ્રોટીનની અભિવ્યક્તિમાં ઘટાડો થાય છે (ટેકીફિલેક્સિસ પણ જુઓ). ઇન્ડ્યુસિબલ વિ. રિપ્રેસિબલ સિસ્ટમ્સ જીન રેગ્યુલેશનને સંબંધિત સિસ્ટમના પ્રતિસાદ દ્વારા સારાંશ આપી શકાય છેઃ ઇન્ડ્યુસિબલ સિસ્ટમ્સ-જ્યાં સુધી કોઈ અણુ (જેને ઇન્ડ્યુસર કહેવાય છે) ની હાજરી ન હોય ત્યાં સુધી એક ઇન્ડ્યુસિબલ સિસ્ટમ બંધ હોય છે જે જનીન અભિવ્યક્તિ માટે પરવાનગી આપે છે. આ પરમાણુને "અભિવ્યક્તિને પ્રેરિત" કરવા માટે કહેવામાં આવે છે. જે રીતે આવું થાય છે તે નિયંત્રણ પદ્ધતિઓ તેમજ પ્રોકેરીયોટિક અને યુકેરીયોટિક કોષો વચ્ચેના તફાવતો પર આધારિત છે. દમનક્ષમ પ્રણાલીઓ-જનીન અભિવ્યક્તિને દબાવતા કેટલાક અણુ (જેને કોરપ્રેસર કહેવાય છે) ની હાજરી સિવાય દમનક્ષમ પ્રણાલી ચાલુ હોય છે. અણુને "અભિવ્યક્તિનું દમન" કહેવામાં આવે છે. જે રીતે આવું થાય છે તે નિયંત્રણ પદ્ધતિઓ તેમજ પ્રોકેરીયોટિક અને યુકેરીયોટિક કોષો વચ્ચેના તફાવતો પર આધારિત છે. જી. એ. એલ. 4/યુ. એ. એસ. સિસ્ટમ એ ઇન્ડ્યુસિબલ અને રિપ્રેસિબલ સિસ્ટમ બંનેનું ઉદાહરણ છે. ગેલ4 એ જીએએલ1/જીએએલ7/જીએએલ10 કેસેટના અનુલેખનને સક્રિય કરવા માટે અપસ્ટ્રીમ સક્રિયકરણ ક્રમ (યુએએસ) ને જોડે છે. બીજી બાજુ, ગ્લુકોઝની હાજરીનો MIG1 પ્રતિસાદ GAL4 ને અટકાવી શકે છે અને તેથી GAL1/GAL7/GAL10 કેસેટની અભિવ્યક્તિને અટકાવી શકે છે. સૈદ્ધાંતિક સર્કિટ્સ રિપ્રેસર/ઇન્ડ્યુસરઃ સેન્સરનું સક્રિયકરણ જનીન નકારાત્મક પ્રતિસાદની અભિવ્યક્તિમાં ફેરફારમાં પરિણમે છેઃ જનીન ઉત્પાદન તેના પોતાના ઉત્પાદનને પ્રત્યક્ષ અથવા પરોક્ષ રીતે ઓછું નિયમન કરે છે, જે ટ્રાન્સક્રિપ્ટના સ્તરને સ્થિર/પ્રમાણસર રાખવામાં પરિણમી શકે છે જ્યારે સકારાત્મક પ્રતિસાદ લૂપ સાથે જોડાઈને ટ્રાન્સક્રિપ્શન અને અનુવાદના સમય વિલંબમાં લાભ લઈને ઓસિલેટર બનાવે છે, એમ જોતાં કે એમઆરએનએ અને પ્રોટીન અર્ધ-જીવન ટૂંકા હકારાત્મક પ્રતિસાદ છેઃ જનીન ઉત્પાદન તેના પોતાના ઉત્પાદનને પ્રત્યક્ષ અથવા પરોક્ષ રીતે નિયમન કરે છે, જે બે જનીનો એકબીજાને અવરોધે છે અને બંનેમાં સકારાત્મક પ્રતિસાદ જનરેશન પેટર્ન અભ્યાસ પદ્ધતિઓ હોય ત્યારે સિગ્નલ એમ્પ્લીફિકેશન બિસ્ટેબલ સ્વિચમાં પરિણમી શકે છે સામાન્ય રીતે, વિભેદક અભિવ્યક્તિની તપાસ કરતા મોટાભાગના પ્રયોગો સંપૂર્ણ કોષ અર્કનો ઉપયોગ કરે છે. જો કે, આ માહિતીપ્રદ નથી કે નિયમન ક્યાં થયું છે અને વિરોધાભાસી નિયમનકારી પ્રક્રિયાઓને છુપાવી શકે છે (અનુલેખન પછીનું નિયમન જુઓ), પરંતુ તે હજુ પણ સૌથી સામાન્ય રીતે વિશ્લેષણ કરવામાં આવે છે (માત્રાત્મક પી. સી. આર. અને ડી. એન. એ. માઇક્રોએરે). જનીન અભિવ્યક્તિનો અભ્યાસ કરતી વખતે, વિવિધ તબક્કાઓ જોવા માટે ઘણી પદ્ધતિઓ છે. યુકેરીયોટ્સમાં આનો સમાવેશ થાય છેઃ પ્રદેશના સ્થાનિક ક્રોમેટિન વાતાવરણને આર. એન. એ. પોલિમરેઝ II, હિસ્ટોન 3 ફેરફારો, ટ્રિથોરેક્સ-જૂથ પ્રોટીન, પોલિકોમ્બ-જૂથ પ્રોટીન અથવા અન્ય કોઈપણ ડીએનએ-બંધનકર્તા તત્વ કે જેના માટે સારી એન્ટિબોડી ઉપલબ્ધ છે તેને નીચે ખેંચીને ચીપ-ચિપ વિશ્લેષણ દ્વારા નક્કી કરી શકાય છે. ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ પછીના નિયમનને કારણે કૃત્રિમ આનુવંશિક શ્રેણી વિશ્લેષણ દ્વારા એપિસ્ટેટિક ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓની તપાસ કરી શકાય છે, ટ્રાન્સક્રિપ્શન દર અને કુલ આર. એન. એ. સ્તર નોંધપાત્ર રીતે અલગ પડે છે. અનુલેખન દરને માપવા માટે પરમાણુ રન-ઓન પરીક્ષણો કરી શકાય છે અને કિરણોત્સર્ગને બદલે થિયોલ લેબલિંગનો ઉપયોગ કરીને નવી ઉચ્ચ-થ્રુપુટ પદ્ધતિઓ વિકસાવવામાં આવી રહી છે. ન્યુક્લિયસ બહાર નીકળતા માત્ર 5 ટકા આર. એન. એ. પોલિમરાઇઝ થાય છે, અને માત્ર ઇન્ટ્રોન જ નહીં, અબોર્ટિવ પ્રોડક્ટ્સ અને નોન-સેન્સ ટ્રાન્સક્રિપ્ટનું પણ અધઃપતન થાય છે. તેથી, પરમાણુ અને કોષરસ સ્તરમાં તફાવત સૌમ્ય લિસિસ દ્વારા બે અપૂર્ણાંકોને અલગ કરીને જોઈ શકાય છે. વૈકલ્પિક સ્પ્લિસિંગનું વિશ્લેષણ સ્પ્લિસિંગ એરે અથવા ટાઇલિંગ એરે સાથે કરી શકાય છે (ડીએનએ માઇક્રોએરે જુઓ). વિવો આર. એન. એ. માં તમામ આર. એન. પી. તરીકે જટિલ છે. ચોક્કસ પ્રોટીન સાથે જોડાયેલા લખાણોના જથ્થાનું વિશ્લેષણ પણ આર. આઈ. પી.-ચિપ દ્વારા કરી શકાય છે. ઉદાહરણ તરીકે, ડી. સી. પી. 2 સીક્વેસ્ટર્ડ પ્રોટીનનો સંકેત આપશે; રાઇબોસોમ-બાઉન્ડ ટ્રાન્સક્રિપ્શનમાં સક્રિય ટ્રાન્સક્રિપ્ટનો સંકેત આપે છે અને સંકેત આપે છે (જોકે વધુ તારીખવાળી પદ્ધતિ, જેને પોલીસોમ અપૂર્ણાંક કહેવાય છે, તે હજુ પણ કેટલીક પ્રયોગશાળાઓમાં લોકપ્રિય છે) પ્રોટીનના સ્તરનું વિશ્લેષણ માસ સ્પેક્ટ્રોમેટ્રી દ્વારા કરી શકાય છે, જેની સરખામણી માત્ર માત્રાત્મક પી. સી. આર. ડેટા સાથે કરી શકાય છે, કારણ કે માઇક્રોએરે ડેટા સંબંધિત છે અને સંપૂર્ણ નથી. આર. એન. એ. અને પ્રોટીનના અધઃપતન દરને અનુક્રમે ટ્રાન્સક્રિપ્શન અવરોધકો (એક્ટિનોમાઇસિન ડી અથવા α-અમનિટિન) અથવા અનુવાદ અવરોધકો (સાયક્લોહેક્સિમાઇડ) દ્વારા માપવામાં આવે છે. કૃત્રિમ ટ્રાન્સક્રિપ્શન પરિબળો (નાના અણુઓ કે જે ટ્રાન્સક્રિપ્શન પરિબળ પ્રોટીનની નકલ કરે છે) સેલ્યુલર મોડેલ સંરક્ષિત બિન-કોડિંગ ડીએનએ ક્રમ એન્હાન્સર (જિનેટિક્સ) જનીન માળખું સ્પેટિઓટેમ્પોરલ જનીન અભિવ્યક્તિ નોંધો અને સંદર્ભો ગ્રંથસૂચિ બાહ્ય કડીઓ પ્લાન્ટ ટ્રાન્સક્રિપ્શન ફેક્ટર ડેટાબેઝ અને પ્લાન્ટ ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ રેગ્યુલેશન ડેટા અને એનાલિસિસ પ્લેટફોર્મ ચિપબેઝ નોન-કોડિંગ આરએનએ અને પ્રોટીન-કોડિંગ જનીનોના ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ રેગ્યુલેટરી નેટવર્કને ડીકોડ કરવા માટે એક ખુલ્લો ડેટાબેઝ ચિપ-સેક ડેટામાંથી. જનીન અભિવ્યક્તિ ડીએનએ આરએનએ પોસ્ટ-ટ્રાન્સલેશનલ મોડિફિકેશન ઇવોલ્યુશનરી ડેવલપમેન્ટલ બાયોલોજી