KH domain
કે. હોમોલોજી (કે. એચ.) ડોમેન એ પ્રોટીન ડોમેન છે જે સૌપ્રથમ માનવ વિજાતીય પરમાણુ રિબોન્યુક્લિયોપ્રોટીન (એચ. એન. આર. એન. પી.) કે. માં ઓળખવામાં આવ્યું હતું. લગભગ 70 એમિનો એસિડનો ઉત્ક્રાંતિથી સંરક્ષિત ક્રમ, કે. એચ. ડોમેન વિવિધ પ્રકારના ન્યુક્લિક એસિડ-બંધનકર્તા પ્રોટીનમાં હાજર છે. કે. એચ. ડોમેન આર. એન. એ. ને જોડે છે, અને આર. એન. એ. ઓળખમાં કાર્ય કરી શકે છે. તે ઘણા પ્રોટીનમાં બહુવિધ નકલોમાં જોવા મળે છે, જ્યાં તેઓ સહકારથી અથવા સ્વતંત્ર રીતે કાર્ય કરી શકે છે. ઉદાહરણ તરીકે, એયુ-સમૃદ્ધ તત્વ આરએનએ-બંધનકર્તા પ્રોટીન કેએસઆરપીમાં, જેમાં 4 કેએચ ડોમેન્સ છે, કેએચ ડોમેન્સ 3 અને 4 એયુ-સમૃદ્ધ આરએનએ લક્ષ્યોના વિવિધ પ્રદેશો સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરવા માટે સ્વતંત્ર બંધનકર્તા મોડ્યુલો તરીકે વર્તે છે. ન્યુક્લિયર મેગ્નેટિક રેઝોનન્સ (એન. એમ. આર.) દ્વારા નિર્ધારિત એફ. એમ. આર. 1ના પ્રથમ કે. એચ. ડોમેન અને એચ. એન. આર. એન. પી. કે. ના સી-ટર્મિનલ કે. એચ. ડોમેનનું સોલ્યુશન સ્ટ્રક્ચર બીટા-આલ્ફા-આલ્ફા-બીટા-આલ્ફા સ્ટ્રક્ચર દર્શાવે છે. કે. એચ. ડોમેન પ્રોટીન, એન. ઓ. વી. એ. 1 માટે ઓટો એન્ટિબોડીઝ, પેરાનોપ્લાસ્ટિક ઓપ્સોક્લોનસ એટેક્સિયાનું કારણ બને છે. કેએચ ડોમેન રાઇબોસોમલ પ્રોટીન એસ 3 ના એન-ટર્મિનસ પર જોવા મળે છે. આ ડોમેન અસામાન્ય છે કારણ કે તે સામાન્ય કે. એચ. ડોમેનની તુલનામાં અલગ ગણો ધરાવે છે. ન્યુક્લિક એસિડ બંધનકર્તા કેએચ ડોમેન્સ આરએનએ અથવા સિંગલ સ્ટ્રેન્ડેડ ડીએનએ સાથે જોડાય છે. ન્યુક્લિક એસિડ ડોમેનની એક બાજુએ વિસ્તૃત રચનામાં બંધાયેલ છે. આ બંધન આલ્ફા હેલિક્સ 1, આલ્ફા હેલિક્સ 2, GXXG લૂપ (અત્યંત સંરક્ષિત અનુક્રમ રચના ધરાવે છે) અને ચલ લૂપ વચ્ચે રચાયેલી ફાટમાં થાય છે. બંધનકર્તા ફાટ પ્રકૃતિમાં હાઇડ્રોફોબિક છે જે સંકુલને સ્થિર કરવા માટે વિવિધ વધારાના પ્રોટીન વિશિષ્ટ ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ સાથે છે. વાલ્વર્ડે અને સહકર્મીઓ નોંધે છે કે, "ન્યુક્લિક એસિડ બેઝ-ટુ-પ્રોટીન એરોમેટિક સાઇડ ચેઇન સ્ટેકિંગ ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ જે અન્ય પ્રકારના સિંગલ સ્ટ્રેન્ડેડ ન્યુક્લિક એસિડ બાઈન્ડીંગ મોટિફ્સમાં પ્રચલિત છે, તે કેએચ ડોમેન ન્યુક્લિક એસિડ રેકગ્નિશનમાં નોંધપાત્ર રીતે ગેરહાજર છે". માળખાકીય જૂથો માળખાકીય રીતે ગ્રિશિન દ્વારા ઓળખાતા બે અલગ અલગ પ્રકારના કે. એચ. ક્ષેત્રો છે જેને પ્રકાર I અને પ્રકાર II કહેવામાં આવે છે. પ્રકાર I ડોમેન્સ મુખ્યત્વે યુકેરીયોટિક પ્રોટીનમાં જોવા મળે છે, જ્યારે પ્રકાર II ડોમેન્સ મુખ્યત્વે પ્રોકેરીયોટ્સમાં જોવા મળે છે. જ્યારે બંને પ્રકારો ન્યૂનતમ સર્વસંમતિ ક્રમની રચના ધરાવે છે ત્યારે તેમની પાસે વિવિધ માળખાકીય ગડી હોય છે. પ્રકાર I કે. એચ. ડોમેન્સમાં ત્રણ સ્ટ્રેન્ડેડ બીટા-શીટ હોય છે જ્યાં ત્રણેય સ્ટ્રેન્ડ્સ વિરોધી સમાંતર હોય છે. પ્રકાર II ડોમેનમાં ત્રણ બીટા સ્ટ્રેન્ડ્સમાંથી બે સમાંતર દિશામાં છે. જ્યારે પ્રકાર I ડોમેન્સ સામાન્ય રીતે પ્રોટીનની અંદર બહુવિધ નકલોમાં જોવા મળે છે, પ્રકાર II સામાન્ય રીતે પ્રોટીન દીઠ એક જ નકલમાં જોવા મળે છે. આ ડોમેન ધરાવતાં માનવ પ્રોટીન એ. કે. એ. પી. 1; એ. એન. કે. એચ. ડી. 1; એ. એન. કે. આર. ડી. 17; એ. એસ. સી. સી. 1; બી. આઈ. સી. સી. 1; ડી. ડી. એક્સ. 43; ડી. ડી. એક્સ. 53; ડી. પી. પી. એ. 5; એફ. એમ. આર. 1; એફ. યુ. બી. પી. 1; એફ. યુ. બી. પી. 3; એફ. એક્સ. આર. 1; એફ. એક્સ. આર. 2; જી. એલ. ડી. 1; એચ. ડી. એલ. બી. પી. 3; એચ. એન. આર. પી. કે.; આઇ. જી. એફ. 2. બી. પી. 1; આઇ. જી. એફ. 2. બી. પી. 2; આઇ. જી. એફ. 2. બી. પી