Jmol
Jmol એ 3-પરિમાણોમાં મોલેક્યુલર મોડેલિંગ રાસાયણિક માળખા માટેનું કમ્પ્યુટર સોફ્ટવેર છે. Jmol અણુનું 3D પ્રતિનિધિત્વ આપે છે જેનો ઉપયોગ શિક્ષણ સાધન તરીકે અથવા રસાયણશાસ્ત્ર અને બાયોકેમિસ્ટ્રીમાં સંશોધન માટે થઈ શકે છે. તે પ્રોગ્રામિંગ ભાષા જાવામાં લખાયેલ છે, તેથી જો જાવા સ્થાપિત હોય તો તે ઓપરેટિંગ સિસ્ટમ્સ વિન્ડોઝ, મેકઓએસ, લિનક્સ અને યુનિક્સ પર ચાલી શકે છે. તે જી. એન. યુ. લેસર જનરલ પબ્લિક લાઇસન્સ (એલ. જી. પી. એલ.) વર્ઝન 2 હેઠળ મુક્ત અને ઓપન સોર્સ સોફ્ટવેર છે. એક સ્વતંત્ર એપ્લિકેશન અને સોફ્ટવેર ડેવલપમેન્ટ કીટ (એસ. ડી. કે.) અસ્તિત્વમાં છે જેને બાયોક્લિપ્સ અને ટેવર્ના જેવી અન્ય જાવા એપ્લિકેશનોમાં એકીકૃત કરી શકાય છે. એક લોકપ્રિય લક્ષણ એક એપ્લેટ છે જે વિવિધ રીતે અણુઓ પ્રદર્શિત કરવા માટે વેબ પૃષ્ઠોમાં સંકલિત કરી શકાય છે. ઉદાહરણ તરીકે, અણુઓને બોલ-એન્ડ-સ્ટિક નમૂનાઓ, જગ્યા ભરવાના નમૂનાઓ, રિબન આકૃતિઓ વગેરે તરીકે પ્રદર્શિત કરી શકાય છે. જે. એમ. ઓ. એલ. પ્રોટીન ડેટા બેંક (પી. ડી. બી.), ક્રિસ્ટલોગ્રાફિક ઇન્ફર્મેશન ફાઇલ (સી. આઈ. એફ.), એમ. ડી. એલ. મોલફાઇલ (એમ. ઓ. એલ.) અને કેમિકલ માર્કઅપ લેંગ્વેજ (સી. એમ. એલ.) સહિત રાસાયણિક ફાઇલ બંધારણોની વિશાળ શ્રેણીને ટેકો આપે છે. જાવાસ્ક્રિપ્ટ-ઓનલી (એચ. ટી. એમ. એલ. 5) વર્ઝન, જે. એસ. એમ. ઓ. એલ. પણ છે, જેનો ઉપયોગ જાવા વગરના કમ્પ્યુટર્સ પર થઈ શકે છે. જે. એમ. ઓ. એલ. એપ્લેટ, અન્ય ક્ષમતાઓ વચ્ચે, ચાઇમ પ્લગ-ઇનનો વિકલ્પ પ્રદાન કરે છે, જે હવે સક્રિય વિકાસ હેઠળ નથી. જ્યારે જે. એમ. ઓ. એલ. માં ઘણી લાક્ષણિકતાઓ છે જેનો ચાઇમમાં અભાવ છે, તે તમામ ચાઇમ કાર્યોને પુનઃઉત્પાદિત કરવાનો દાવો કરતું નથી, ખાસ કરીને, સ્કલ્પ્ટ મોડ. ચાઇમને પ્લગ-ઇન ઇન્સ્ટોલેશન અને માઈક્રોસોફ્ટ વિન્ડોઝ પર ઈન્ટરનેટ એક્સપ્લોરર 6.0 અથવા ફાયરફોક્સ 2.0 અથવા મેક ઓએસ 9 પર નેટસ્કેપ કોમ્યુનિકેટર 4.8 ની જરૂર છે. Jmol ને જાવા ઇન્સ્ટોલેશનની જરૂર છે અને તે વિવિધ પ્રકારના પ્લેટફોર્મ પર કામ કરે છે. ઉદાહરણ તરીકે, મોઝિલા ફાયરફોક્સ, ઈન્ટરનેટ એક્સપ્લોરર, ઓપેરા, ગૂગલ ક્રોમ અને સફારીમાં Jmol સંપૂર્ણપણે કાર્યરત છે. સ્ક્રીનશોટ પણ જુઓ રસાયણશાસ્ત્ર વિકાસ કિટ (સી. ડી. કે.) મોલેક્યુલર મિકેનિક્સ મોડેલિંગ માટે સોફ્ટવેરની સરખામણી મુક્ત અને ઓપન-સોર્સ સોફ્ટવેર પેકેજોની સૂચિ મોલેક્યુલર ગ્રાફિક્સ સિસ્ટમ્સની સૂચિ મોલેક્યુલર ગ્રાફિક્સ મોલેક્યુલ એડિટર પ્રોટિઓપીડિયા પી. એમ. ઓ. એલ. સેમસન સ્માઇલ્સ સંદર્ભો બાહ્ય લિંક્સ વેબસાઇટ્સ, વિકિઝ અને મૂડલ્સની સૂચિ સાથે વિકી મીડિયા વિકિ માટે જે. એમ. ઓ. એલ. એક્સ્ટેંશન લિનક્સ માટે બાયોમોડેલ મોલવ્યૂ રસાયણશાસ્ત્ર સોફ્ટવેર જાવા (પ્રોગ્રામિંગ ભાષા) મોલેક્યુલર મોડેલિંગ સોફ્ટવેરમાં પ્રોગ્રામ કરેલ મફત સોફ્ટવેર