Pseudomonas citronellolis
સ્યુડોમોનાસ સિટ્રોનેલોલિસ એ ગ્રામ-નેગેટિવ, બેસિલસ બેક્ટેરિયમ છે જેનો ઉપયોગ પાયરુવેટ કાર્બોક્સિલેઝની પદ્ધતિઓનો અભ્યાસ કરવા માટે થાય છે. તે સૌપ્રથમ યુનાઇટેડ સ્ટેટ્સના ઉત્તરીય વર્જિનિયામાં પાઇન વૃક્ષો નીચે જંગલની માટીમાંથી અલગ કરવામાં આવ્યું હતું. લાક્ષણિકતાઓ સ્યુડોમોનાસ સિટ્રોનેલોલિસ એ ગ્રામ-નેગેટિવ, બેસિલસ બેક્ટેરિયમ છે. તે સૌપ્રથમ યુનાઇટેડ સ્ટેટ્સના ઉત્તરીય વર્જિનિયામાં પાઇન વૃક્ષો નીચે જંગલની માટીમાંથી અલગ કરવામાં આવ્યું હતું. તેમાં એક ધ્રુવીય ફ્લાજેલમ છે જે તેને ગતિશીલ બનાવવાની મંજૂરી આપે છે. અગર પર, પી. સિટ્રોનેલોલિસ ગોળાકાર સફેદ વસાહતો બનાવે છે જે ફ્લોરોસન્ટ લીલા રંગદ્રવ્યો ઉત્પન્ન કરે છે. તે બાયોફિલ્મ પણ બનાવે છે અને મોટાભાગની એન્ટિબાયોટિક્સ સામે પ્રતિરોધક છે. બેક્ટેરિયાનો તેના છોડના યજમાન (પાઈન વૃક્ષો અથવા તુલસી સાથે) સાથે જૈવિક સંબંધ છે. તે એક પ્રકારનું હોર્મોન ઉત્પન્ન કરે છે જે છોડના કોષના વિસ્તરણ અને વિભાજનને પ્રેરિત કરે છે, જે સ્થાનિક ઉપલબ્ધ પોષક તત્ત્વોમાં વધારો તરફ દોરી જાય છે. ચયાપચયની ક્ષમતા પી. સિટ્રોનેલોલિસનો અભ્યાસ મહત્વપૂર્ણ છે કારણ કે તેનો ઉપયોગ ચયાપચય અને ગ્લુકોઝ સંબંધિત ઉત્સેચક પ્રવૃત્તિના સંશોધન માટે એક નમૂના તરીકે થઈ શકે છે. તેમાં પોલિઇથિલિનના બાયોડિગ્રેડેશનમાં ઉપયોગ કરવાની ક્ષમતા પણ છે. જીનોમનું કદ ડીએનએ કોડિંગ 6,028,113 bp ના કદ સાથે 6,951,444 bp છે. સરેરાશ GC સામગ્રી 67.11% અને 4,665,300 bp છે. 6169 અનુમાનિત જનીનોમાંથી, 6071 (98.41%) પ્રોટીન સીડીએસ હતા, જેમાંથી 4762 જનીનોમાં કાર્યની આગાહી હતી. 15 આર. આર. એન. એ. સહિત કુલ 96 આર. એન. એ. જનીનોની આગાહી કરવામાં આવી હતી. નમૂનાના 16sR અનુક્રમ માટે સ્યુડોમોનાસ સિટ્રોનેલોલિસના ડીએનએ અલગતામાં 25 માઇક્રોલ પાતળું જીનોમિક ડીએનએ બહાર આવ્યું હતું. બોક્સાયર, પુનરાવર્તિત એક્સ્ટ્રાજેનિક પેલિન્ડ્રોમિક સિક્વન્સ-આધારિત પી. સી. આર. વિશ્લેષણ (આર. ઈ. પી.-પી. સી. આર.), અને એન્ટરોબેક્ટેરિયલ પુનરાવર્તિત ઇન્ટરજેનિક સર્વસંમતિ (ઇ. આર. આઈ. સી.) નો ઉપયોગ ડીએનએને વધારવા માટે પ્રાઇમર તરીકે કરવામાં આવ્યો હતો. પી. સિટ્રોનેલોલિસના 29 જાતો માટે પી. સી. આર. એ 8 થી 12 વિસ્તૃત બેન્ડ મેળવ્યા. 9, 000 બી. પી. થી 100 બી. પી. સુધીના કદ સાથે આ ખૂબ જ અલગ હતા. આર. ઇ. પી.-પી. સી. આર. સૌથી જટિલ વિસ્તૃત બેન્ડિંગ પેટર્ન ઉત્પન્ન કરે છે, જે વિવિધ ચીકણું કાદવ-દૂષિત માટીના નમૂનાઓમાંથી અલગ કરવામાં આવેલા પી. સિટ્રોનેલોલિસ તાણ વચ્ચેની વિવિધતાને પ્રતિબિંબિત કરે છે. પી. સિટ્રોનેલોલિસ તાણના રાઇબોટાઇપ પેટર્નમાં બહુવિધ એમ્પ્લિકોન દર્શાવવામાં આવ્યા હતા જે આરઆરએનએ સ્પેસર પ્રદેશના બહુરૂપતાને મજબૂત રીતે સૂચવે છે. જીનોમ પરના આ પ્રયોગમાં કોઈ પ્લાઝમિડ ન હતું અને તેના અસ્તિત્વ માટે કોઈ પુરાવા પૂરા પાડવામાં આવ્યા ન હતા. 16S rRNA વિશ્લેષણના આધારે, પી. સિટ્રોનેલોલિસને પી. એરુગિનોસા જૂથમાં મૂકવામાં આવ્યું છે. પી. સિટ્રોનેલોલિસ "રેખીય મોનો-અને ડાયકાર્બોક્સિલિક એસિડ" માંથી પોલીહાઇડ્રોક્સિયલ-કેનોએટ્સના જૈવસંશ્લેષણમાં પણ સક્ષમ હોવાનું જાણવા મળ્યું છે, જે એક પ્રકારનો બેક્ટેરિયલ-સંશ્લેષિત પોલિએસ્ટર છે. પી. સિટ્રોનેલોલિસ પી3બી5 જીનોમમાં એવા જનીનો હોય છે જે લેક્ટમ એન્ટિબાયોટિક્સ સામે પ્રતિકાર કરતા છ અનુમાનિત લેક્ટામેઝ માટે સંકેતલિપી કરે છે. વધુમાં, જિનોમમાં ઇફ્લક્સ પંપ માટે જનીન એન્કોડિંગ હોય છે જે ટ્રાઇમેથોપ્રિમ જેવા અન્ય એન્ટિબાયોટિક્સને પ્રતિકાર પ્રદાન કરે છે. P3B5 જીનોમ જનીનોને એન્કોડ કરે છે જે તેને એલ્કેનને ઘટાડવામાં સક્ષમ બનાવે છે. તેના તણાવ-સ્થિતિસ્થાપકતા અને છોડ પર નિર્ભર જીવનશૈલી સાથે સંયોજનમાં, આ જીવતંત્રને છોડના ઉપચારના અભિગમો માટે એક રસપ્રદ ઉમેદવાર બનાવે છે. કેટલાક એબીનો પ્રતિકાર જોવા મળ્યો હતો અને કેટલાક એબીઆર જનીનો મળી આવ્યા હતા, પરંતુ એબીઆર જનીન એકત્રીકરણની સંભવિતતા માટે કોઈ પુરાવા મળી શક્યા ન હતા. સંદર્ભો બાહ્ય કડીઓ બેકડાઇવ ખાતે સ્યુડોમોનાસ સિટ્રોનેલોલિસનો પ્રકાર-1960માં વર્ણવેલ બેક્ટેરિયલ ડાયવર્સિટી મેટાડેટેબેઝ સ્યુડોમોનાડેલ્સ બેક્ટેરિયા