Activity-based proteomics
પ્રવૃત્તિ-આધારિત પ્રોટિઓમિક્સ અથવા પ્રવૃત્તિ-આધારિત પ્રોટીન પ્રોફાઇલિંગ (એબીપીપી) એ એક કાર્યાત્મક પ્રોટિઓમિક તકનીક છે જે રાસાયણિક ચકાસણીનો ઉપયોગ કરે છે જે ઉત્સેચકોના યાંત્રિક રીતે સંબંધિત વર્ગો સાથે પ્રતિક્રિયા આપે છે. વર્ણન એબીપીપીનું મૂળભૂત એકમ પ્રોબ છે, જેમાં સામાન્ય રીતે બે ઘટકોનો સમાવેશ થાય છેઃ પ્રતિક્રિયાશીલ જૂથ (આરજી, જેને ક્યારેક "વોરહેડ" કહેવામાં આવે છે) અને ટેગ. વધુમાં, કેટલીક ચકાસણીઓમાં બંધનકર્તા જૂથ હોઈ શકે છે જે પસંદગીમાં વધારો કરે છે. પ્રતિક્રિયાશીલ જૂથમાં સામાન્ય રીતે ખાસ રચાયેલ ઇલેક્ટ્રોફાઇલ હોય છે જે સક્રિય ઉત્સેચકના સક્રિય સ્થળે ન્યુક્લિયોફિલિક અવશેષો સાથે સહસંયોજક રીતે જોડાય છે. એક ઉત્સેચક કે જે અવરોધિત અથવા અનુવાદ પછી સંશોધિત થાય છે તે પ્રવૃત્તિ-આધારિત તપાસ સાથે પ્રતિક્રિયા કરશે નહીં. ટેગ ક્યાં તો ફ્લોરોફોર જેવા રિપોર્ટર અથવા બાયોટિન જેવા એફિનિટી લેબલ અથવા હ્યુસજેન 1,3-દ્વિધ્રુવી સાયક્લોડેશન (જેને ક્લિક રસાયણશાસ્ત્ર તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે) સાથે ઉપયોગ કરવા માટે એલ્કાઇન અથવા એઝાઇડ હોઈ શકે છે. ફાયદા એ. બી. પી. પી. નો મુખ્ય ફાયદો એ છે કે પ્રોટીન અથવા એમ. આર. એન. એ. ની વિપુલતા સુધી મર્યાદિત રહેવાને બદલે એન્ઝાઇમ સક્રિય સ્થળની ઉપલબ્ધતાનું સીધું નિરીક્ષણ કરવાની ક્ષમતા છે. સેરીન હાઈડ્રોલેઝ અને મેટાલોપ્રોટીઝ જેવા ઉત્સેચકોના વર્ગો કે જે ઘણીવાર એન્ડોજેનસ ઇન્હિબિટર્સ સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરે છે અથવા નિષ્ક્રિય ઝાયમોજેન્સ તરીકે અસ્તિત્વ ધરાવે છે, આ તકનીક પરંપરાગત તકનીકો પર મૂલ્યવાન લાભ આપે છે જે પ્રવૃત્તિને બદલે વિપુલતા પર આધાર રાખે છે. બહુપરીમાણીય પ્રોટીન ઓળખ ટેકનોલોજી તાજેતરના વર્ષોમાં એબીપીપીને ટેન્ડમ માસ સ્પેક્ટ્રોમેટ્રી સાથે જોડવામાં આવી છે, જે એક જ નમૂનામાંથી સેંકડો સક્રિય ઉત્સેચકોની ઓળખને સક્ષમ કરે છે. એબીપીપી-મડપીઆઈટી (બહુ-પરિમાણીય પ્રોટીન ઓળખ તકનીક) તરીકે ઓળખાતી આ તકનીક ખાસ કરીને પ્રોફાઇલિંગ અવરોધક પસંદગી માટે ઉપયોગી છે કારણ કે અવરોધકની શક્તિનું એક સાથે સેંકડો લક્ષ્યો સામે પરીક્ષણ કરી શકાય છે. એબીપીપી સૌપ્રથમ 1990ના દાયકામાં પ્રોટીએઝના અભ્યાસમાં નોંધવામાં આવ્યું હતું. માસ સ્પેક્ટ્રોમેટ્રી પ્રોટિઓમિક્સ સંબંધિત અવરોધકો એમએએફપી અને ડીઆઈએફપી કેમોપ્રોટોમિક્સ સંદર્ભો પ્રોટિઓમિક્સ જીનોમિક્સ પ્રોટીન પદ્ધતિઓ માસ સ્પેક્ટ્રોમેટ્રી પણ જુઓ.