Semantide
સેમેન્ટાઇડ્સ (અથવા સેમેન્ટોફોરેટિક મોલેક્યુલ્સ) એ જૈવિક મેક્રોમોલેક્યુલ્સ છે જે આનુવંશિક માહિતી અથવા તેની પ્રતિલિપિ ધરાવે છે. ત્રણ જુદી જુદી શ્રેણીઓ અથવા સિમેન્ટીડ્સને અલગ પાડવામાં આવે છેઃ પ્રાથમિક, માધ્યમિક અને તૃતીય. પ્રાથમિક સિમેન્ટીડ્સ જનીનો છે, જેમાં ડીએનએનો સમાવેશ થાય છે. ગૌણ સિમેન્ટીડ્સ એ સંદેશવાહક આર. એન. એ. ની સાંકળો છે, જે ડીએનએમાંથી લખવામાં આવે છે. ટર્શરી સિમેન્ટિડ્સ પોલિપેપ્ટાઇડ્સ છે, જે મેસેન્જર આર. એન. એ. માંથી અનુવાદિત થાય છે. યુકેરીયોટિક સજીવોમાં, પ્રાથમિક સિમેન્ટીડ્સમાં પરમાણુ, મિટોકોન્ડ્રીયલ અથવા પ્લાસ્ટિડ ડીએનએ હોઈ શકે છે. બધા પ્રાથમિક સિમેન્ટીડ્સ આખરે તૃતીય સિમેન્ટીડ્સ બનાવતા નથી. કેટલાક પ્રાથમિક સિમેન્ટીડ્સ એમ. આર. એન. એ. (નોન-કોડિંગ ડી. એન. એ.) માં લખાતા નથી અને કેટલાક ગૌણ સિમેન્ટીડ્સ પોલિપેપ્ટાઇડ્સ (નોન-કોડિંગ આર. એન. એ.) માં અનુવાદિત થતા નથી. સિમેન્ટીડ્સની જટિલતા ખૂબ બદલાય છે. તૃતીય સિમેન્ટિડ્સ માટે, મોટી ગોળાકાર પોલિપેપ્ટાઇડ સાંકળો સૌથી વધુ જટિલ હોય છે જ્યારે માળખાકીય પ્રોટીન, પુનરાવર્તિત સરળ ક્રમ ધરાવતા, ઓછામાં ઓછા જટિલ હોય છે. સિમેન્ટીડ શબ્દ અને સંબંધિત શબ્દો લિનસ પૌલિંગ અને એમિલ ઝુકરકંડલ દ્વારા રચવામાં આવ્યા હતા. આધુનિક ફિલોજેનેટિક્સમાં ઉપયોગમાં લેવાતા મુખ્ય પ્રકારનાં ડેટા સિમેન્ટીડ્સ હોવા છતાં, આ શબ્દનો ઉપયોગ સામાન્ય રીતે થતો નથી. સંબંધિત શબ્દો આઇસોસેમેન્ટિક ડીએનએ અથવા આરએનએ કે જે આધાર અનુક્રમમાં અલગ પડે છે, પરંતુ સમાન પોલિપેપ્ટાઇડ સાંકળોમાં અનુવાદિત થાય છે તેને આઇસોસેમેન્ટિક તરીકે ઓળખવામાં આવે છે. એપિસેમેન્ટીક મોલેક્યુલ્સ કે જે ઉત્સેચકો (તૃતીય સિમેન્ટીડ્સ) દ્વારા સંશ્લેષિત થાય છે તેને એપિસેમેન્ટીક મોલેક્યુલ્સ તરીકે ઓળખવામાં આવે છે. એપિસેમેન્ટીક અણુઓ સિમેન્ટીડ્સ કરતાં પ્રકારોમાં મોટી વિવિધતા ધરાવે છે, જેમાં માત્ર ત્રણ પ્રકારો (ડીએનએ, આરએનએ અથવા પોલિપેપ્ટાઇડ્સ) હોય છે. બધા પોલિપેપ્ટાઇડ્સ તૃતીય સિમેન્ટીડ્સ નથી. કેટલાક, મુખ્યત્વે નાના પોલિપેપ્ટાઇડ્સ, એપિસેમેન્ટિક અણુઓ પણ હોઈ શકે છે. સજીવ દ્વારા ઉત્પન્ન ન થતા સિમેન્ટીક અણુઓને સિમેન્ટીક અણુઓ તરીકે ઓળખવામાં આવે છે, કારણ કે તેમાં કોઈ આનુવંશિક માહિતી હોતી નથી. એસેમેન્ટિક અણુઓને એનાબોલિક પ્રક્રિયાઓ દ્વારા એપિસોડિક અણુઓમાં બદલી શકાય છે. સિમેન્ટીક પરમાણુઓ પણ સિમેન્ટીક અણુઓ બની શકે છે જ્યારે તેઓ જીનોમમાં એકીકૃત થાય છે. અમુક વાયરસ અને એપિસોમ્સમાં આ ક્ષમતા હોય છે. જ્યારે અણુનો સિમેન્ટીક, એપિસેમેન્ટીક અથવા એસેમેન્ટીક તરીકે ઉલ્લેખ કરવામાં આવે છે, ત્યારે આ ફક્ત ચોક્કસ જીવતંત્રને જ લાગુ પડે છે. એક જીવતંત્ર માટે સિમેન્ટીક પરમાણુ બીજા જીવતંત્ર માટે સિમેન્ટીક હોઈ શકે છે. સજીવોના ઉત્ક્રાંતિ ઇતિહાસનો અભ્યાસ કરવા માટે સંશોધન કાર્યક્રમો સેમેન્ટાઇડ્સનો ઉપયોગ જાતિજન્ય માહિતી તરીકે થાય છે. પ્રાથમિક સિમેન્ટીડ્સનો ઉપયોગ તુલનાત્મક જૈવવિવિધતા વિશ્લેષણમાં પણ થાય છે. જો કે, બાહ્યકોષીય ડીએનએ થોડા સમય માટે ટકી શકે છે, આ પ્રકારના વિશ્લેષણ નિષ્ક્રિય અને અથવા મૃત સજીવોમાંથી સક્રિયને ઓળખી શકતા નથી. ઉત્ક્રાંતિ ઇતિહાસના અભ્યાસ માટે જૈવિક મેક્રોમોલેક્યુલ્સ કેટલી હદે માહિતીપ્રદ છે તે અલગ છે. અણુ જેટલો વધુ જટિલ હોય છે, તે ફિલોજેનેટિક્સ માટે વધુ માહિતીપ્રદ હોય છે. પ્રાથમિક અને માધ્યમિક શબ્દાર્થમાં સૌથી વધુ માહિતી હોય છે. તૃતીયાંશ સિમેન્ટીડ્સમાં, કેટલીક માહિતી ખોવાઈ જાય છે, કારણ કે ઘણા એમિનો એસિડને એકથી વધુ કોડન દ્વારા કોડેડ કરવામાં આવે છે. એપિસેમેન્ટીક અણુઓ (દા. ત. કેરોટીનોઇડ્સ) પણ ફિલોજેનેટિક્સ માટે માહિતીપ્રદ છે. જો કે, આ અણુઓનું વિતરણ સિમેન્ટીડ્સ પર આધારિત ફિલોજેનીઝ સાથે સંપૂર્ણ રીતે સંકળાયેલું નથી. તેથી, સ્વતંત્ર પુષ્ટિ ઘણીવાર હજુ પણ જરૂરી છે. સંશ્લેષણ માર્ગમાં જેટલા વધુ ઉત્સેચકો સામેલ હોય છે, તેટલા જ સંભવિત નથી કે આવા માર્ગો અલગથી વિકસિત થયા હોય. તેથી, એપિસેમેન્ટીક અણુઓ માટે, જે અણુઓ ઓછામાં ઓછા જટિલ એસેમેન્ટીક અણુઓમાંથી સંશ્લેષિત થાય છે તે ફિલોજેનેટિક્સમાં સૌથી વધુ માહિતીપ્રદ છે. જો કે, વિવિધ માર્ગો સમાન અથવા તો સમાન અણુઓનું સંશ્લેષણ કરી શકે છે. ઉદાહરણ તરીકે, પ્રાણીઓ, છોડ અને અન્ય યુકેરીયોટ્સમાં, વિટામિન સી સંશ્લેષણ માટે વિવિધ માર્ગો મળી આવ્યા છે. તેથી, અમુક અણુઓનો ઉપયોગ જાતિજન્ય સંબંધોના અભ્યાસ માટે થવો જોઈએ નહીં. અર્થહીન અણુઓ સજીવોના જૂથના કેટલાક માત્રાત્મક અથવા ગુણાત્મક લક્ષણો સૂચવી શકે છે, તેમ છતાં તેઓ ફિલોજેનેટિક્સ માટે અવિશ્વસનીય અને બિન-માહિતીપ્રદ માનવામાં આવે છે. વિવિધ સિમેન્ટીડ્સનો ઉપયોગ કરીને કરવામાં આવેલા વિશ્લેષણ વિરોધાભાસી ફિલોજેનીઝ પેદા કરી શકે છે. જો કે, જો ફિલોજેનીઝ એકરૂપ હોય, તો ઉત્ક્રાંતિ સંબંધ માટે વધુ ટેકો છે. મોટા અનુક્રમોનું વિશ્લેષણ કરીને (દા. ત. સંપૂર્ણ મિટોકોન્ડ્રીયલ જીનોમ સિક્વન્સ), ફિલોજેનીઝનું નિર્માણ કરી શકાય છે, જે વધુ ઉકેલાયેલા હોય છે અને વધુ આધાર ધરાવે છે. અભ્યાસોમાં વારંવાર ઉપયોગમાં લેવાતા સેમેન્ટાઇડ્સના ઉદાહરણો મોટાભાગના સજીવો માટે સામાન્ય છે અને સમય જતાં ધીમે ધીમે બદલાતા રહે છે. આ મેક્રોમોલેક્યુલ્સના ઉદાહરણો છેઃ એટીપીએઝ સાયટોક્રોમ બી સાયટોક્રોમ સી ઓક્સિડેઝ સબયૂનિટ I હીટ શોક પ્રોટીન જનીનો હિસ્ટોન એચ 3 આરસીએ પુનઃસંયોજન સક્રિય જનીન 1 રિબોન્યુક્લીઝ પી આરએનએ રાઇબોસોમલ ડીએનએ (દા. ત. 28S rDNA) રાઇબોસોમલ RNA (દા. ત. 16S rRNA) સંદર્ભો ફિલોજેનેટિક્સ