Hydrophilicity plot
હાઇડ્રોફિલિસિટી પ્લોટ એ પ્રોટીનના એમિનો એસિડની હાઇડ્રોફોબિસિટી અથવા હાઇડ્રોફિલિસિટીની માત્રાત્મક વિશ્લેષણ છે. તેનો ઉપયોગ પ્રોટીનની સંભવિત રચના અથવા ક્ષેત્રોને લાક્ષણિકતા આપવા અથવા ઓળખવા માટે થાય છે. પ્લોટમાં તેની x-અક્ષ પર પ્રોટીનનો એમિનો એસિડ ક્રમ હોય છે, અને તેની y-અક્ષ પર હાઇડ્રોફોબિસિટી અને હાઇડ્રોફિલિસિટીની ડિગ્રી હોય છે. ચોક્કસ એમિનો એસિડ સાથે પાણી જેવા ધ્રુવીય દ્રાવકોની ક્રિયાપ્રતિક્રિયાના પ્રમાણને માપવા માટે ઘણી પદ્ધતિઓ છે. દાખલા તરીકે, કાઇટ-ડુલિટલ સ્કેલ હાઇડ્રોફોબિક એમિનો એસિડ સૂચવે છે, જ્યારે હોપ-વુડ્સ સ્કેલ હાઇડ્રોફિલિક અવશેષોને માપે છે. પ્લોટના આકારનું વિશ્લેષણ કરવાથી પ્રોટીનની આંશિક રચના વિશે માહિતી મળે છે. દાખલા તરીકે, જો આશરે 20 એમિનો એસિડનો વિસ્તાર હાઇડ્રોફોબિસિટી માટે હકારાત્મક દર્શાવે છે, તો આ એમિનો એસિડ લિપિડ બાયલેયરમાં ફેલાયેલા આલ્ફા-હેલિક્સનો ભાગ હોઈ શકે છે, જે હાઇડ્રોફોબિક ફેટી એસિડથી બનેલો છે. તેનાથી વિપરીત, ઉચ્ચ હાઇડ્રોફિલિસિટી ધરાવતા એમિનો એસિડ સૂચવે છે કે આ અવશેષો દ્રાવક અથવા પાણીના સંપર્કમાં છે અને તેથી તેઓ પ્રોટીનની બાહ્ય સપાટી પર રહે તેવી શક્યતા છે. ઉપરોક્ત કોષ્ટકમાંની માહિતી કમ્પ્યુટર પ્રોગ્રામનો ઉપયોગ કરીને બનાવવામાં આવી હતી જે પ્રોટીનની અંદરના ભાગોની સરેરાશ હાઇડ્રોફોબિસિટીનું મૂલ્યાંકન કરે છે અને સાહિત્યમાંથી એકત્રિત કરવામાં આવેલી માહિતીનો ઉપયોગ કરે છે. સંદર્ભો બાહ્ય કડીઓ એક્સપેસી પ્રોટોસ્કેલ પ્રોટીન હાઇડ્રોફોબિસિટી પ્લોટ્સ ફ્રોમ કોલોરાડો સ્ટેટ હાઇડ્રોપેથિસિટી પ્લોટ્સ ફ્રોમ ધ વર્લ્ડ ઓફ બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ પ્લોટ્સ (ગ્રાફિક્સ) પ્રોટીન સ્ટ્રક્ચર