Ribosome shunting
રાઇબોસોમ શંટિંગ એ અનુવાદની શરૂઆતની એક પદ્ધતિ છે જેમાં રાઇબોસોમ પ્રારંભિક કોડોન સુધી પહોંચવા માટે 5 'અનુવાદિત ન હોય તેવા પ્રદેશના ભાગોને બાયપાસ કરે છે, અથવા "શન્ટ ઓવર" કરે છે. જો કે, રાઇબોસોમલ શંટિંગનો ફાયદો એ છે કે તે mRNA અણુમાં સામાન્ય કરતાં વધુ માહિતી સંગ્રહિત કરવાની મંજૂરી આપીને પાછળની તરફ અનુવાદ કરી શકે છે. કેટલાક વાયરલ આર. એન. એ. વાયરલ જીવન ચક્રના અમુક તબક્કાઓ દરમિયાન અથવા જ્યારે અનુવાદની શરૂઆતના પરિબળો દુર્લભ હોય ત્યારે અનુવાદના વધુ કાર્યક્ષમ સ્વરૂપ તરીકે રાઇબોઝોમ શંટિંગનો ઉપયોગ કરતા હોવાનું દર્શાવવામાં આવ્યું છે. વાયરલ પ્રોટીએઝ દ્વારા ક્લેવેજ). આ પદ્ધતિનો ઉપયોગ કરવા માટે જાણીતા કેટલાક વાયરસમાં એડિનોવાયરસ, સેન્ડાઇ વાયરસ, હ્યુમન પેપિલોમાવાયરસ, ડક હેપેટાઇટિસ બી પેરારેટ્રોવાયરસ, રાઇસ ટંગ્રો બેસિલીફોર્મ વાયરસ અને કોબીજ મોઝેક વાયરસનો સમાવેશ થાય છે. આ વાયરસમાં રાઇબોઝોમ આર. એન. એ. સેકન્ડરી સ્ટ્રક્ચર્સને અનવાઇન્ડ કરવાની જરૂર વગર સીધા જ અપસ્ટ્રીમ ઇનિશિએશન કોમ્પ્લેક્સથી સ્ટાર્ટ કોડન (એ. યુ. જી.) માં સ્થાનાંતરિત થાય છે. કોબીજ મોઝેક વાયરસમાં રાઇબોઝોમ શન્ટિંગ કોબીજ મોઝેક વાયરસ (સી. એ. એમ. વી.) 35 એસ આર. એન. એ. નું ભાષાંતર રાઇબોઝોમ શન્ટ દ્વારા શરૂ કરવામાં આવે છે. સી. એ. એમ. વી. ના 35 એસ. આર. એન. એ. માં ~ 600 ન્યુક્લિયોટાઇડ લીડર ક્રમ હોય છે જેમાં તાણના આધારે 7-9 ટૂંકી ખુલ્લી વાંચન ફ્રેમ (એસ. ઓ. આર. એફ.) હોય છે. આ લાંબો લીડર ક્રમ એક વ્યાપક જટિલ સ્ટેમ-લૂપ માળખું બનાવવાની ક્ષમતા ધરાવે છે, જે નીચેના ઓઆરએફની અભિવ્યક્તિ માટે એક અવરોધક તત્વ છે. જો કે, ઓ. આર. એફ. નું સી. એ. એમ. વી. 35 એસ. આર. એન. એ. લીડરના ડાઉનસ્ટ્રીમમાં ભાષાંતર સામાન્ય રીતે જોવા મળ્યું છે. રાઇબોસોમ શન્ટિંગ મોડેલ પ્રારંભિક પરિબળોના સહયોગથી સૂચવે છે, રાઇબોસોમ કેપ્ડ 5 '-એન્ડથી સ્કેન કરવાનું શરૂ કરે છે અને જ્યાં સુધી તે પ્રથમ એસ. ઓ. આર. એફ. સુધી પહોંચે ત્યાં સુધી ટૂંકા અંતર માટે સ્કેન કરે છે. નેતા દ્વારા રચાયેલ હેરપિન માળખું પ્રથમ લાંબા ઓઆરએફને 5 '-નિકટવર્તી એસઓઆરએફની નજીકની અવકાશી નજીકમાં લાવે છે. એસ. ઓ. આર. એફ. એ. દ્વારા વાંચ્યા પછી, 80S સ્કેનીંગ રાઇબોઝોમ સ્ટોપ કોડન પર અલગ પડે છે, જે શન્ટ ટેક-ઓફ સાઇટ છે. 40S રાઇબોસોમલ પેટા એકમો આર. એન. એ. સાથે સંયોજન ચાલુ રાખે છે, અને મજબૂત સ્ટેમ-લૂપ માળખાકીય તત્વને બાયપાસ કરે છે, શંટ સ્વીકારનાર સ્થળ પર ઉતરાણ કરે છે, સ્કેનીંગ ફરી શરૂ કરે છે અને પ્રથમ લાંબા ઓ. આર. એફ. પર પુનઃપ્રારંભ કરે છે. 5 '-નિકટવર્તી એસ. ઓ. આર. એફ. એ અને સ્ટેમ-લૂપ માળખું પોતે જ સી. એ. એમ. વી. શન્ટિંગ [5] માટે બે આવશ્યક ઘટકો છે. 2-15 કોડોન્સ સાથેના sORF અને sORF સ્ટોપ કોડોન્સ અને સ્ટેમ સ્ટ્રક્ચરના બેઝ વચ્ચેના 5-10 ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ રાઇબોસોમ શન્ટિંગ માટે શ્રેષ્ઠ છે, જ્યારે ન્યૂનતમ (સ્ટાર્ટ-સ્ટોપ) ORF શન્ટિંગને પ્રોત્સાહન આપતું નથી. રાઇસ ટંગ્રો બેસિલીફોર્મ પેરારેટ્રોવાયરસ રાઇબોસોમ શંટિંગ પ્રક્રિયામાં રાઇબોસોમ શંટિંગની શોધ સૌપ્રથમ 1993માં સી. એ. એમ. વી. માં થઈ હતી, અને પછી 1996માં રાઇસ ટંગ્રો બેસિલીફોર્મ વાયરસ (આર. ટી. બી. વી.) માં તેની જાણ કરવામાં આવી હતી. આર. ટી. બી. વી. માં રાઇબોઝોમ શંટિંગની પદ્ધતિ સી. એ. એમ. વી. જેવી જ છેઃ તેમાં પ્રથમ ટૂંકા ઓ. આર. એફ. તેમજ નીચેના મજબૂત ગૌણ માળખાની પણ જરૂર પડે છે. સી. એ. એમ. વી. અને આર. ટી. બી. વી. વચ્ચે સંરક્ષિત શંટ તત્વોની અદલાબદલીએ કાર્યક્ષમ શન્ટિંગ માટે ઉતરાણ ક્રમની ન્યુક્લિયોટાઇડ રચનાનું મહત્વ જાહેર કર્યું, જે સૂચવે છે કે રાઇબોસોમ શન્ટિંગની પદ્ધતિ છોડના પેરારેટ્રોવાયરસમાં સંરક્ષિત ઉત્ક્રાંતિ છે. સેન્ડાઇ વાયરસમાં રાઇબોસોમ શંટિંગ સેન્ડાઇ વાયરસ વાય પ્રોટીન રાઇબોસોમ શંટિંગ દ્વારા શરૂ થાય છે. સેન્ડાઇ વાયરસ પી/સી એમઆરએનએના 8 પ્રાથમિક અનુવાદ ઉત્પાદનોમાંથી, પ્રોટીન સી ', પી અને સી પ્રોટીનના અનુવાદ માટે લીકી સ્કેનીંગ જવાબદાર છે, જ્યારે પ્રોટીન વાય 1 અને વાય 2 ની અભિવ્યક્તિ રાઇબોસોમલ શન્ટ ડિસ્કંટીન્યુસ સ્કેનીંગ દ્વારા શરૂ કરવામાં આવે છે. સ્કેનીંગ કોમ્પ્લેક્સ 5 'કેપમાં પ્રવેશ કરે છે અને 5' યુ. ટી. આર. ના ~ 50 ન્યુક્લિયોટાઇડ્સને સ્કેન કરે છે, અને પછી તેને Y દીક્ષા કોડોન્સ પર સ્વીકારનાર સાઇટ પર ટ્રાન્સફર કરવામાં આવે છે અથવા બંધ કરવામાં આવે છે. સેન્ડાઇ વાયરસના કિસ્સામાં, કોઈ ચોક્કસ દાતા સાઇટ સિક્વન્સની જરૂર નથી. એડિનોવાયરસ રાઇબોસોમ શન્ટિંગમાં રાઇબોસોમ શંટ અંતમાં એડિનોવાયરસ એમઆરએનએની અભિવ્યક્તિ દરમિયાન જોવા મળે છે. અંતમાં એડિનોવાયરસ એમઆરએનએમાં 5 'ત્રિપક્ષીય નેતા હોય છે, જે 25-થી 44-ન્યુક્લિયોટાઇડ અનસ્ટ્રક્ચર્ડ 5' રચના સાથે અત્યંત સંરક્ષિત 200-ન્યુક્લિયોટાઇડ એનટીઆર ધરાવે છે, જે સ્થિર હેરપિન માળખાના જટિલ જૂથ દ્વારા અનુસરવામાં આવે છે, જે ઇઆઇએફ-4એફ (કેપ-બાઇન્ડિંગ પ્રોટીન કોમ્પ્લેક્સ) ની જરૂરિયાતને ઘટાડીને પ્રેફરેન્શિયલ ટ્રાન્સલેશન પ્રદાન કરે છે, જે સેલ્યુલર પ્રોટીન ટ્રાન્સલેશનમાં દખલ કરવા માટે એડિનોવાયરસ દ્વારા નિષ્ક્રિય કરવામાં આવે છે. જ્યારે ઇઆઇએફ4ઇ વિપુલ પ્રમાણમાં હોય છે, ત્યારે પેટા એકમ એમઆરએનએ પર 5 'કેપ સાથે જોડાય છે, જે ઇઆઇએફ4 સંકુલ બનાવે છે જે શન્ટિંગ તરફ દોરી જાય છે; જો કે, જ્યારે હીટ શોકના અંતમાં એડિનોવાયરસ ચેપ દરમિયાન ઇઆઇએફ4ઇમાં ફેરફાર કરવામાં આવે છે અથવા નિષ્ક્રિય કરવામાં આવે છે, ત્યારે ત્રિપક્ષીય નેતા સંપૂર્ણપણે અને અસરકારક રીતે શન્ટિંગ દ્વારા દીક્ષાને નિર્દેશિત કરે છે. જ્યારે એડિનોવાયરસને ત્રિપક્ષીય નેતા તરીકે ઓળખાતા કેપ-ઇનિશિયેશન કોમ્પ્લેક્સને વિક્ષેપિત કરીને તેના વિના કોષોને ચેપ લગાડવા માટે ટાયરોસિન કિનેઝની જરૂર હતી. તે ટાયરોસિન ફોસ્ફોરાયલેશનમાં રાઇબોસોમ શંટિંગ દ્વારા પ્રક્રિયામાં વિક્ષેપ પાડે છે. રાઇબોઝોમના બંધન માટે બે મુખ્ય સ્થળો છે. વાયરલ એમ. આર. એન. એ. નું ભાષાંતર કરવામાં અને અનુવાદને દબાવવામાં જ્યારે રાઇબોઝોમ શંટિંગ પ્રક્રિયા દ્વારા આવરી લેવામાં આવે છે. એડેનોવાયરસ લેટ એમ. આર. એન. એ. અને એચ. એસ. પી. 70 એમ. આર. એન. એ. ના કિસ્સામાં, પ્રથમ ટૂંકા ઓ. આર. એફ. ના સ્ટોપ કોડનને ઓળખવાને બદલે, અનુવાદને અટકાવવાનું કારણ ત્રણ સંરક્ષિત સિક્વન્સ સાથે રાઇબોઝોમને સ્કેન કરવાનું છે જે 18 એસ. રાઇબોસોમલ આર. એન. એ. ના 3 'હેરપિનના પૂરક છે. રાઇબોઝોમ શન્ટ માટેની પદ્ધતિમાં સ્ટાર્ટ કોડનના મોટા સબયૂનિટ બંધનનો સમાવેશ થાય છે. પોલિમરેઝ પછી કોડિંગ એમઆરએનએ પર સ્ટાર્ટ કોડનને બાયપાસ કરવા માટે પ્રોટીન બંધન અને પાવર સ્ટ્રોકનો ઉપયોગ કરીને કૂદકો મારવામાં સક્ષમ છે. પછી વધુ પ્રતિકૃતિ માટે નવી બંધનકર્તા સાઇટ બનાવવા માટે ટ્રાઇપેટને પેરેન્ટ સ્ટ્રાન્ડમાં દાખલ કરવામાં આવે છે. સંદર્ભો પ્રોટીન જૈવસંશ્લેષણ