RNA-binding protein
આર. એન. એ.-બંધનકર્તા પ્રોટીન (ઘણીવાર આર. બી. પી. તરીકે સંક્ષિપ્તમાં) એ પ્રોટીન છે જે કોષોમાં ડબલ અથવા સિંગલ સ્ટ્રેન્ડેડ આર. એન. એ. સાથે જોડાય છે અને રિબોન્યુક્લિયોપ્રોટીન સંકુલની રચનામાં ભાગ લે છે. આર. બી. પી. માં વિવિધ માળખાકીય રચનાઓ હોય છે, જેમ કે આર. એન. એ. ઓળખ મોટિફ (આર. આર. એમ.), ડી. એસ. આર. એન. એ. બંધનકર્તા ક્ષેત્ર, ઝિંક ફિંગર અને અન્ય. તેઓ સાયટોપ્લાઝમિક અને ન્યુક્લિયર પ્રોટીન છે. જો કે, મોટાભાગના પરિપક્વ આર. એન. એ. ને ન્યુક્લિયસમાંથી પ્રમાણમાં ઝડપથી નિકાસ કરવામાં આવે છે, તેથી ન્યુક્લિયસમાં મોટાભાગના આર. બી. પી. પ્રોટીન અને પૂર્વ-એમ. આર. એન. એ. ના સંકુલ તરીકે અસ્તિત્વ ધરાવે છે જેને હેટેરોજિનિયસ રિબોન્યુક્લિયોપ્રોટીન કણો (એચ. એન. આર. એન. પી.) કહેવાય છે. વિવિધ સેલ્યુલર પ્રક્રિયાઓમાં આરબીપીની નિર્ણાયક ભૂમિકા હોય છે જેમ કેઃ સેલ્યુલર કાર્ય, પરિવહન અને સ્થાનિકીકરણ. તેઓ ખાસ કરીને આર. એન. એ. ના અનુલેખન પછીના નિયંત્રણમાં મુખ્ય ભૂમિકા ભજવે છે, જેમ કેઃ સ્પ્લિસિંગ, પોલીએડેનાઈલેશન, એમ. આર. એન. એ. સ્થિરીકરણ, એમ. આર. એન. એ. સ્થાનિકીકરણ અને અનુવાદ. યુકેરીયોટિક કોષો અનન્ય આર. એન. એ.-બંધનકર્તા પ્રવૃત્તિ અને પ્રોટીન-પ્રોટીન ક્રિયાપ્રતિક્રિયા સાથે વિવિધ આર. બી. પી. વ્યક્ત કરે છે. યુકેરીયોટિક આર. બી. પી. ડેટાબેઝ (ઇ. યુ. આર. બી. પી. ડી. બી.) અનુસાર, મનુષ્યોમાં આર. બી. પી. ને એન્કોડિંગ કરતા 2961 જનીનો છે. ઉત્ક્રાંતિ દરમિયાન, ઇન્ટ્રોનની સંખ્યામાં વધારો થતાં આરબીપીની વિવિધતામાં ઘણો વધારો થયો. વિવિધતાએ યુકેરીયોટિક કોષોને વિવિધ વ્યવસ્થાઓમાં આર. એન. એ. એક્સોનનો ઉપયોગ કરવા સક્ષમ બનાવ્યા, જે દરેક આર. એન. એ. માટે એક અનન્ય આર. એન. પી. (રિબોન્યુક્લિયોપ્રોટીન) ને જન્મ આપે છે. જનીન અભિવ્યક્તિમાં અનુલેખન પછીના નિયમનમાં આર. બી. પી. ની નિર્ણાયક ભૂમિકા હોવા છતાં, પ્રમાણમાં થોડા આર. બી. પી. નો અભ્યાસ કરવામાં આવ્યો છે જે હવે સ્પષ્ટ થઈ ગયું છે કે આર. એન. એ.-આર. બી. પી. ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ સજીવો વચ્ચેની ઘણી જૈવિક પ્રક્રિયાઓમાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવે છે. માળખું ઘણા આર. બી. પી. માં મોડ્યુલર માળખાં હોય છે અને તે માત્ર થોડા ચોક્કસ મૂળભૂત ક્ષેત્રોના બહુવિધ પુનરાવર્તનોથી બનેલા હોય છે જે ઘણીવાર મર્યાદિત ક્રમ ધરાવે છે. વિવિધ આર. બી. પી. માં આ શ્રેણીઓ વિવિધ સંયોજનોમાં ગોઠવાયેલી હોય છે. ચોક્કસ આર. એન. એ. ની ચોક્કસ પ્રોટીનની ઓળખ આ થોડા મૂળભૂત ક્ષેત્રોની પુનઃગોઠવણી દ્વારા વિકસિત થઈ છે. દરેક મૂળભૂત ડોમેન આર. એન. એ. ને ઓળખે છે, પરંતુ આમાંના ઘણા પ્રોટીનને કાર્ય કરવા માટે ઘણા સામાન્ય ડોમેનમાંથી એકની બહુવિધ નકલોની જરૂર પડે છે. વિવિધતા જેમ જેમ આર. એન. એ. પોલિમરેઝમાંથી પરમાણુ આર. એન. એ. ઉભરી આવે છે, તેમ આર. એન. એ. લખાણોને તરત જ આર. એન. એ.-બંધનકર્તા પ્રોટીનથી આવરી લેવામાં આવે છે જે આર. એન. એ. ચયાપચય અને કાર્યના દરેક પાસાને નિયંત્રિત કરે છે જેમાં આર. એન. એ. બાયોજેનેસિસ, પરિપક્વતા, પરિવહન, સેલ્યુલર સ્થાનિકીકરણ અને સ્થિરતા સામેલ છે. તમામ આર. બી. પી. આર. એન. એ. ને જોડે છે, જો કે તેઓ વિવિધ આર. એન. એ.-ક્રમની વિશિષ્ટતાઓ અને સમાનતાઓ સાથે આમ કરે છે, જે આર. બી. પી. ને તેમના લક્ષ્યો અને કાર્યો જેટલા વૈવિધ્યસભર બનવાની મંજૂરી આપે છે. આ લક્ષ્યાંકોમાં એમ. આર. એન. એ. નો સમાવેશ થાય છે, જે પ્રોટીન માટે કોડ કરે છે, તેમજ સંખ્યાબંધ કાર્યાત્મક બિન-કોડિંગ આર. એન. એ. નો સમાવેશ થાય છે. એન. સી. આર. એન. એ. લગભગ હંમેશા રિબોન્યુક્લિયોપ્રોટીન સંકુલ તરીકે કાર્ય કરે છે અને નગ્ન આર. એન. એ. તરીકે નહીં. આ બિન-કોડિંગ આર. એન. એ. માં માઇક્રો આર. એન. એ., નાના હસ્તક્ષેપ કરતા આર. એન. એ. (એસ. આઈ. આર. એન. એ.), તેમજ સ્પ્લિસોસોમલ નાના પરમાણુ આર. એન. એ. (એસ. એન. આર. એન. એ.) નો સમાવેશ થાય છે. વૈકલ્પિક સ્પ્લિસિંગ વૈકલ્પિક સ્પ્લિસિંગ એ એક એવી પદ્ધતિ છે જેના દ્વારા એક જ જનીનમાંથી પુખ્ત એમઆરએનએ (સંદેશવાહક આરએનએ) ના વિવિધ સ્વરૂપો ઉત્પન્ન થાય છે. તે એક નિયમનકારી પદ્ધતિ છે જેના દ્વારા એમ. આર. એન. એ. માં એક્સોનના સમાવેશમાં વિવિધતા એકથી વધુ સંબંધિત પ્રોટીનના ઉત્પાદન તરફ દોરી જાય છે, આમ સંભવિત જીનોમિક આઉટપુટનું વિસ્તરણ થાય છે. આરબીપી આ પ્રક્રિયાના નિયમનમાં વ્યાપકપણે કાર્ય કરે છે. કેટલાક બંધનકર્તા પ્રોટીન જેમ કે ન્યુરોનલ વિશિષ્ટ આર. એન. એ.-બંધનકર્તા પ્રોટીન, એટલે કે એન. ઓ. વી. એ. 1, આર. એન. એ. માં ચોક્કસ ક્રમને ઓળખીને અને બંધન કરીને એચ. એન. આર. એન. એ. ના સબસેટના વૈકલ્પિક વિભાજનને નિયંત્રિત કરે છે (વાય. સી. એ. વાય. જ્યાં વાય પાયરિમિડીન, યુ અથવા સી સૂચવે છે). આ પ્રોટીન પછી આ લક્ષ્ય સ્થળ પર સ્પ્લિસીસોમલ પ્રોટીનની ભરતી કરે છે. એસ. આર. પ્રોટીન એસ. એન. આર. એન. પી. ની ભરતી દ્વારા વૈકલ્પિક સ્પ્લિસિંગમાં તેમની ભૂમિકા માટે પણ જાણીતા છે, જે યુ1 એસ. એન. આર. એન. પી. અને યુ2એ. એફ. એસ. એન. આર. એન. પી. ની રચના કરે છે. જો કે, આર. બી. પી. પણ સ્પ્લિસસમનો જ એક ભાગ છે. સ્પ્લાઇસસોમ એ એસ. એન. આર. એન. એ. અને પ્રોટીન પેટા એકમોનું સંકુલ છે અને યાંત્રિક એજન્ટ તરીકે કામ કરે છે જે ઇન્ટ્રોનને દૂર કરે છે અને ફ્લેન્કિંગ એક્સોનને જોડતા હોય છે. કોર સ્પ્લાઇસસમ કોમ્પ્લેક્સ ઉપરાંત, આર. બી. પી. સિસ-એક્ટિંગ આર. એન. એ. તત્વોની સાઇટ્સ સાથે પણ જોડાય છે જે સ્પ્લિસિંગ દરમિયાન એક્સોનના સમાવેશ અથવા બાકાતને પ્રભાવિત કરે છે. આ સાઇટ્સને એક્સોનિક સ્પ્લિસિંગ એન્હાન્સર્સ (ઇ. એસ. ઇ.), એક્સોનિક સ્પ્લિસિંગ સાયલેન્સર્સ (ઇ. એસ. એસ.), ઇન્ટ્રોનિક સ્પ્લિસિંગ એન્હાન્સર્સ (આઇ. એસ. ઇ.) અને ઇન્ટ્રોનિક સ્પ્લિસિંગ સાયલેન્સર્સ (આઇ. એસ. એસ.) તરીકે ઓળખવામાં આવે છે અને તેમના બંધનના સ્થાનના આધારે, આર. બી. પી. સ્પ્લિસિંગ સાયલેન્સર્સ અથવા એન્હાન્સર્સ તરીકે કામ કરે છે. આર. એન. એ. સંપાદન આર. એન. એ. સંપાદનના સૌથી વ્યાપક રીતે અભ્યાસ કરાયેલા સ્વરૂપમાં એ. ડી. એ. આર. પ્રોટીનનો સમાવેશ થાય છે. આ પ્રોટીન આર. એન. એ. ની ન્યુક્લિયોટાઇડ સામગ્રીને બદલીને એમ. આર. એન. એ. લખાણોના અનુલેખન પછીના ફેરફાર દ્વારા કાર્ય કરે છે. આ એડીએઆર દ્વારા ઉત્પ્રેરિત ઉત્સેચકીય પ્રતિક્રિયામાં એડેનોસિનને ઇનોસિનમાં રૂપાંતરિત કરીને કરવામાં આવે છે. આ પ્રક્રિયા જીનોમ દ્વારા એન્કોડેડ આર. એન. એ. ક્રમને અસરકારક રીતે બદલે છે અને જનીન ઉત્પાદનોની વિવિધતાને વિસ્તરે છે. મોટા ભાગનું આર. એન. એ. સંપાદન આર. એન. એ. ના બિન-કોડિંગ પ્રદેશો પર થાય છે; જો કે, કેટલાક પ્રોટીન-એન્કોડિંગ આર. એન. એ. લખાણો સંપાદનને આધિન હોવાનું દર્શાવવામાં આવ્યું છે, જેના પરિણામે તેમના પ્રોટીનના એમિનો એસિડ ક્રમમાં તફાવત જોવા મળે છે. આનું એક ઉદાહરણ ગ્લુટામેટ રીસેપ્ટર એમઆરએનએ છે જ્યાં ગ્લુટામાઇનને આર્જિનિનમાં રૂપાંતરિત કરવામાં આવે છે જે પ્રોટીનની કાર્યક્ષમતામાં ફેરફાર તરફ દોરી જાય છે. પોલિઆડેનાઈલેશન એ ત્રણ મુખ્ય અનટ્રાન્સલેટેડ પ્રદેશમાં એએયુએએ ક્રમના ડાઉનસ્ટ્રીમમાં લગભગ 20 પાયાના આરએનએ ટ્રાન્સક્રિપ્ટમાં એડેનાઈલેટ અવશેષોની "પૂંછડી" નો ઉમેરો છે. એમ. આર. એન. એ. નું પોલીએડીનાઈલેશન તેના પરમાણુ પરિવહન, અનુવાદ કાર્યક્ષમતા અને સ્થિરતા પર મજબૂત અસર કરે છે. આ તમામ તેમજ પોલિઆડેનાઈલેશનની પ્રક્રિયા ચોક્કસ આર. બી. પી. ના બંધન પર આધારિત છે. થોડા અપવાદો સાથે તમામ યુકેરીયોટિક એમ. આર. એન. એ. ને લગભગ 200 ન્યુક્લિયોટાઇડ્સની 3 'પોલી (એ) પૂંછડીઓ મેળવવા માટે પ્રક્રિયા કરવામાં આવે છે. આ પ્રક્રિયામાં જરૂરી પ્રોટીન સંકુલમાંથી એક સી. પી. એસ. એફ. છે. સી. પી. એસ. એફ. 3 'પૂંછડી (એ. એ. યુ. એ. એ. એ.) ક્રમ સાથે જોડાય છે અને પોલી (એ)-બંધનકર્તા પ્રોટીન તરીકે ઓળખાતા અન્ય પ્રોટીન સાથે, પોલી (એ) પોલિમરેઝની પ્રવૃત્તિને ભરતી કરે છે અને ઉત્તેજિત કરે છે. પોલી (એ) પોલિમરેઝ તેના પોતાના પર નિષ્ક્રિય છે અને યોગ્ય રીતે કાર્ય કરવા માટે આ અન્ય પ્રોટીનના બંધનની જરૂર છે. નિકાસ પ્રક્રિયા પૂર્ણ થયા પછી, એમ. આર. એન. એ. ને કોષના કેન્દ્રમાંથી કોષરસમાં પરિવહન કરવાની જરૂર છે. આ ત્રણ તબક્કાની પ્રક્રિયા છે જેમાં ન્યુક્લિયસમાં કાર્ગો-વાહક સંકુલનું નિર્માણ થાય છે, ત્યારબાદ પરમાણુ છિદ્ર સંકુલ દ્વારા સંકુલનું સ્થાનાંતરણ થાય છે અને અંતે કાર્ગોને કોષરસમાં છોડવામાં આવે છે. ત્યારબાદ વાહકનું પુનઃચક્રણ કરવામાં આવે છે. ટી. એ. પી./એન. એક્સ. એફ. 1: પી15 હેટેરોડાઇમરને એમ. આર. એન. એ. નિકાસમાં મુખ્ય ખેલાડી માનવામાં આવે છે. ઝેનોપસ લેવિસ દેડકાઓમાં ટી. એ. પી. ની વધુ પડતી અભિવ્યક્તિ ટ્રાન્સક્રિપ્ટની નિકાસમાં વધારો કરે છે જે અન્યથા બિનકાર્યક્ષમ રીતે નિકાસ કરવામાં આવે છે. જોકે ટી. એ. પી. ને એડેપ્ટર પ્રોટીનની જરૂર છે કારણ કે તે એમ. આર. એન. એ. સાથે સીધો સંપર્ક કરવામાં અસમર્થ છે. એલી/આરઇએફ પ્રોટીન એમઆરએનએ ભરતી ટીએપી સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરે છે અને જોડાય છે. mRNA સ્થાનિકીકરણ mRNA સ્થાનિકીકરણ અવકાશી રીતે નિયંત્રિત પ્રોટીન ઉત્પાદનને મંજૂરી આપીને જનીન અભિવ્યક્તિનું નિયમન કરવા માટે મહત્વપૂર્ણ છે. એમ. આર. એન. એ. સ્થાનિકીકરણ દ્વારા પ્રોટીનને કોષના તેમના ઇચ્છિત લક્ષ્ય સ્થળમાં અનુવાદિત કરવામાં આવે છે. આ પ્રારંભિક વિકાસ દરમિયાન ખાસ કરીને મહત્વનું છે જ્યારે ઝડપી કોષ વિચ્છેદ વિવિધ કોષોને એમ. આર. એન. એ. ના વિવિધ સંયોજનો આપે છે જે પછી અત્યંત અલગ કોષ ભવિષ્ય તરફ દોરી શકે છે. આ એમ. આર. એન. એ. ના સ્થાનિકીકરણમાં આર. બી. પી. મહત્વપૂર્ણ છે જે પ્રોટીનને માત્ર તેમના ઇચ્છિત પ્રદેશોમાં જ અનુવાદિત થાય છે તેની ખાતરી આપે છે. આમાંથી એક પ્રોટીન ઝેડબીપી1 છે. ઝેડ. બી. પી. 1 ટ્રાન્સક્રિપ્શનના સ્થળે બીટા-એક્ટિન એમ. આર. એન. એ. સાથે જોડાય છે અને એમ. આર. એન. એ. સાથે કોષરસમાં જાય છે. તે પછી આ એમ. આર. એન. એ. ને કેટલાક અસમપ્રમાણ કોષ પ્રકારોના લેમેલ્લા પ્રદેશમાં સ્થાનાંતરિત કરે છે જ્યાં પછી તેનું ભાષાંતર કરી શકાય છે. 2008માં એવી દરખાસ્ત કરવામાં આવી હતી કે એફ. એમ. આર. પી. સંવર્ધિત હિપ્પોકેમ્પલ ચેતાકોષોના ચેતાકોષીય ડેંડ્રાઇટ્સમાં કેટલાક ડેંડ્રાઇટિક એમ. આર. એન. એ. ના ઉત્તેજના-પ્રેરિત સ્થાનિકીકરણમાં સામેલ છે. સી. એ. 1 હિપ્પોકેમ્પલ ચેતાકોષોના માઇક્રોડિસેક્ટેડ ડેંડ્રાઇટ્સમાં હાજર એફ. એમ. આર. પી.-બાઉન્ડ આર. એન. એ. ના તાજેતરના અભ્યાસોમાં જંગલી પ્રકાર વિરુદ્ધ એફ. એમ. આર. પી.-નલ માઉસ મગજમાં સ્થાનિકીકરણમાં કોઈ ફેરફાર જોવા મળ્યો નથી. અનુવાદ અનુવાદ નિયમન જનીન અભિવ્યક્તિને નિયંત્રિત કરવા માટે ઝડપી પદ્ધતિ પ્રદાન કરે છે. ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ સ્તરે જનીન અભિવ્યક્તિને નિયંત્રિત કરવાને બદલે, એમ. આર. એન. એ. પહેલેથી જ લખાયેલું છે પરંતુ રાઇબોસોમ્સની ભરતી નિયંત્રિત છે. જ્યારે સંકેત અનુવાદને સક્રિય કરે છે ત્યારે આ પ્રોટીનની ઝડપી પેઢીને મંજૂરી આપે છે. બી-એક્ટિન એમઆરએનએના સ્થાનિકીકરણમાં તેની ભૂમિકા ઉપરાંત ઝેડબીપી1 અનુવાદની શરૂઆતને અવરોધિત કરીને બીટા-એક્ટિન એમઆરએનએના અનુવાદાત્મક દમનમાં પણ સામેલ છે. ઝેડ. બી. પી. 1 ને એમ. આર. એન. એ. માંથી દૂર કરવું આવશ્યક છે જેથી રાઇબોઝોમ યોગ્ય રીતે જોડાઈ શકે અને અનુવાદ શરૂ થઈ શકે. પ્રોટીન-આર. એન. એ. ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ આર. એન. એ.-બંધનકર્તા પ્રોટીન તેમના ક્રમ, માળખા, પ્રધાનતત્ત્વ અને આર. એન. એ. ફેરફારોને ઓળખીને તેમના આર. એન. એ. લક્ષ્યોની અત્યંત ચોક્કસ ઓળખ દર્શાવે છે. આરએનએ-બંધનકર્તા પ્રોટીનનું ચોક્કસ બંધન તેમને તેમના લક્ષ્યોને અલગ પાડવા અને આરએનએ ટ્રાન્સક્રિપ્ટની પેઢી, પરિપક્વતા અને જીવનકાળના નિયંત્રણ દ્વારા વિવિધ સેલ્યુલર કાર્યોને નિયંત્રિત કરવાની મંજૂરી આપે છે. આ ક્રિયાપ્રતિક્રિયા અનુલેખન દરમિયાન શરૂ થાય છે કારણ કે કેટલાક આર. બી. પી. અધોગતિ સુધી આર. એન. એ. સાથે બંધાયેલા રહે છે જ્યારે અન્ય આર. એન. એ. સ્પ્લિસિંગ, પ્રક્રિયા, પરિવહન અને સ્થાનિકીકરણને નિયંત્રિત કરવા માટે આર. એન. એ. સાથે ક્ષણિક રીતે જોડાય છે. ક્રોસ-લિંકિંગ ઇમ્યુનોપ્રેસિપિટેશન (સી. એલ. આઈ. પી.) પદ્ધતિઓનો ઉપયોગ વિવિધ પેશીઓ અને સજીવોમાં આર. એન. એ.-બંધનકર્તા પ્રોટીનની સીધી આર. એન. એ. બંધનકર્તા જગ્યાઓને કડક રીતે ઓળખવા માટે થાય છે. આ વિભાગમાં, સૌથી વધુ વ્યાપક રીતે અભ્યાસ કરાયેલા આર. એન. એ.-બંધનકર્તા ક્ષેત્રોના ત્રણ વર્ગો (આર. એન. એ.-ઓળખ મોટિફ, ડબલ-સ્ટ્રેન્ડેડ આર. એન. એ.-બંધનકર્તા મોટિફ, ઝિંક-ફિંગર મોટિફ) ની ચર્ચા કરવામાં આવશે. આર. એન. એ.-રેકગ્નિશન મોટિફ (આર. આર. એમ.) આર. એન. એ. રેકગ્નિશન મોટિફ, જે સૌથી સામાન્ય આર. એન. એ.-બંધનકર્તા મોટિફ છે, તે <આઇ. ડી. 1> એમિનો એસિડનું એક નાનું પ્રોટીન ડોમેન છે જે બે α-હેલિસીસની સામે ચાર-સ્ટ્રેન્ડેડ β-શીટ બનાવે છે. આ માન્યતા થીમ અસંખ્ય સેલ્યુલર કાર્યોમાં તેની ભૂમિકા ભજવે છે, ખાસ કરીને mRNA/rRNA પ્રક્રિયા, સ્પ્લિસિંગ, અનુવાદ નિયમન, RNA નિકાસ અને RNA સ્થિરતામાં. એન. એમ. આર. સ્પેક્ટ્રોસ્કોપી અને એક્સ-રે ક્રિસ્ટલોગ્રાફી દ્વારા આર. આર. એમ. ની દસ રચનાઓની ઓળખ કરવામાં આવી છે. આ માળખાં આર. આર. એમ. ની પ્રોટીન-આર. એન. એ. ઓળખની જટિલતાને સમજાવે છે કારણ કે તેમાં પ્રોટીન-આર. એન. એ. ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ ઉપરાંત આર. એન. એ.-આર. એન. એ. અને પ્રોટીન-પ્રોટીન ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓનો સમાવેશ થાય છે. તેમની જટિલતા હોવા છતાં, તમામ દસ માળખાઓમાં કેટલીક સામાન્ય લાક્ષણિકતાઓ છે. તમામ આર. આર. એમ. ની મુખ્ય પ્રોટીન સપાટીઓ 'ફોર-સ્ટ્રેન્ડેડ β-શીટ આર. એન. એ. સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરતી જોવા મળી હતી, જે સામાન્ય રીતે ચોક્કસ રીતે બે કે ત્રણ ન્યુક્લિયોટાઇડ્સનો સંપર્ક કરે છે. વધુમાં, આંતર-ડોમેન લિંકર અને આર. એન. એ. વચ્ચે અને આર. આર. એમ. વચ્ચેની ક્રિયાપ્રતિક્રિયા દ્વારા મજબૂત આર. એન. એ. બંધનકર્તા આકર્ષણ અને વિવિધતા પ્રત્યેની વિશિષ્ટતા પ્રાપ્ત થાય છે. આર. આર. એમ. ની આ લવચિકતા સમજાવે છે કે શા માટે આર. આર. એમ. સૌથી વધુ વિપુલ ડોમેન છે અને શા માટે તે વિવિધ જૈવિક કાર્યોમાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવે છે. ડબલ-સ્ટ્રેન્ડેડ આર. એન. એ.-બાઈન્ડીંગ મોટિફ ડબલ-સ્ટ્રેન્ડેડ આર. એન. એ.-બાઈન્ડીંગ મોટિફ (ડી. એસ. આર. એમ., ડી. એસ. આર. બી. ડી.), એક <આઇ. ડી. 1> એમિનો એસિડ ડોમેન, આર. એન. એ. પ્રક્રિયા, આર. એન. એ. સ્થાનિકીકરણ, આર. એન. એ. હસ્તક્ષેપ, આર. એન. એ. સંપાદન અને અનુવાદાત્મક દમનમાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવે છે. 2005 સુધીમાં ઉકેલાયેલા ડોમેનની ત્રણેય રચનાઓ એકીકૃત સુવિધાઓ ધરાવે છે જે સમજાવે છે કે કેવી રીતે dsRMs ફક્ત dsDNA ને બદલે dsRNA સાથે જોડાય છે. ડી. એસ. આર. એમ. એ α-હેલિસીસ અને β1-β2 લૂપ બંને દ્વારા આર. એન. એ. ડુપ્લેક્સ સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરતા જોવા મળ્યા હતા. વધુમાં, ત્રણેય ડી. એસ. આર. બી. એમ. માળખાઓ મુખ્ય ખાંચની ખાંડ-ફોસ્ફેટ કરોડરજ્જુ અને એક નાના ખાંચની કરોડરજ્જુ સાથે સંપર્ક કરે છે, જે β1-β2 લૂપ દ્વારા આલ્ફા હેલિક્સ 2 ના એન-ટર્મિનસ પ્રદેશ સાથે મધ્યસ્થી કરે છે. આ ક્રિયાપ્રતિક્રિયા આર. એન. એ. ડબલ હેલિક્સના આકાર માટે એક અનન્ય અનુકૂલન છે કારણ કે તેમાં 2 '-હાઇડ્રોક્સિલ્સ અને ફોસ્ફેટ ઓક્સિજનનો સમાવેશ થાય છે. ડી. એસ. આર. બી. એમ. માં સામાન્ય માળખાકીય લાક્ષણિકતાઓ હોવા છતાં, તેઓ અલગ રાસાયણિક માળખાઓ પ્રદર્શિત કરે છે, જે સ્ટેમ-લૂપ્સ, આંતરિક લૂપ્સ, બલ્જેસ અથવા વિસંગતતા ધરાવતા હેલિસીસ સહિત આર. એન. એ. માળખાઓ માટે વિશિષ્ટતાને મંજૂરી આપે છે. ઝિંક ફિંગર CCHH-પ્રકારના ઝિંક-ફિંગર ડોમેન્સ યુકેરીયોટિક જિનોમની અંદર સૌથી સામાન્ય DNA-બંધનકર્તા ડોમેન છે. ડીએનએની ઉચ્ચ ક્રમ-વિશિષ્ટ ઓળખ પ્રાપ્ત કરવા માટે, ઘણી ઝિંક આંગળીઓનો ઉપયોગ મોડ્યુલર ફેશનમાં થાય છે. ઝિંકની આંગળીઓ ββα પ્રોટીનની ગડી દર્શાવે છે જેમાં β-હેરપિન અને α-હેલિક્સ આયન દ્વારા જોડાય છે. વધુમાં, મુખ્ય ખાંચમાં ડીએનએ પાયા સાથે α-હેલિક્સની પ્રોટીન બાજુ-સાંકળો વચ્ચેની ક્રિયાપ્રતિક્રિયા ડીએનએ-અનુક્રમ-વિશિષ્ટ ઓળખ માટે પરવાનગી આપે છે. ડીએનએની વ્યાપક માન્યતા હોવા છતાં, તાજેતરની શોધો થઈ છે કે ઝિંકની આંગળીઓમાં પણ આરએનએને ઓળખવાની ક્ષમતા છે. સી. સી. એચ. એચ. ઝિંક આંગળીઓ ઉપરાંત, સી. સી. સી. એચ. ઝિંક આંગળીઓ તાજેતરમાં ઇન્ટરમોલેક્યુલર હાઇડ્રોજન બોન્ડ્સ અને આર. એન. એ. પાયાના વોટસન-ક્રિક ધાર વચ્ચેની ક્રિયાપ્રતિક્રિયા દ્વારા સિંગલ-સ્ટ્રેન્ડેડ આર. એન. એ. ની અનુક્રમ-વિશિષ્ટ માન્યતાનો ઉપયોગ કરવા માટે શોધવામાં આવી હતી. સી. સી. એચ. એચ.-પ્રકારની ઝિંક આંગળીઓ આર. એન. એ. બંધનની બે પદ્ધતિઓનો ઉપયોગ કરે છે. પ્રથમ, ઝિંકની આંગળીઓ ડબલ હેલિક્સની કરોડરજ્જુ સાથે બિન-વિશિષ્ટ ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરે છે જ્યારે બીજી રીત ઝિંકની આંગળીઓને ખાસ કરીને વ્યક્તિગત પાયાને ઓળખવાની મંજૂરી આપે છે જે બહાર નીકળે છે. સી. સી. એચ. એચ.-પ્રકારથી અલગ, સી. સી. સી. એચ.-પ્રકારની ઝિંક ફિંગર આર. એન. એ. બંધનનો બીજો પ્રકાર દર્શાવે છે, જેમાં સિંગલ-સ્ટ્રેન્ડેડ આર. એન. એ. ને ક્રમ-વિશિષ્ટ રીતે ઓળખવામાં આવે છે. એકંદરે, જસતની આંગળીઓ ડી. એસ. ડી. એન. એ. ક્રમ અને આર. એન. એ. સાથે બંધન દ્વારા એસ. એસ. આર. એન. એ. ક્રમ દ્વારા સીધા ડીએનએને ઓળખી શકે છે. ગર્ભ વિકાસમાં આર. એન. એ.-બંધનકર્તા પ્રોટીનના અનુલેખન અને અનુલેખન પછીના આર. એન. એ. ના નિયમનની ભૂમિકા વિકાસ દરમિયાન જનીન અભિવ્યક્તિની પેટર્નને નિયંત્રિત કરવામાં ભૂમિકા ભજવે છે. નેમાટોડ સી. એલિગન્સ પર વ્યાપક સંશોધને આરએનએ-બંધનકર્તા પ્રોટીનને જર્મલાઇન અને પ્રારંભિક ગર્ભ વિકાસ દરમિયાન આવશ્યક પરિબળો તરીકે ઓળખી કાઢ્યા છે. તેમના ચોક્કસ કાર્યમાં શારીરિક પેશીઓ (ચેતાકોષો, હાયપોડર્મિસ, સ્નાયુઓ અને ઉત્સર્જન કોષો) નો વિકાસ તેમજ વિકાસલક્ષી ઘટનાઓ માટે સમયના સંકેતો પૂરા પાડવાનો સમાવેશ થાય છે. તેમ છતાં, તેમના આર. એન. એ. લક્ષ્યોને ઓળખવામાં મુશ્કેલીને કારણે વિકાસમાં આરબીપીના કાર્ય પાછળની પદ્ધતિ શોધવી અપવાદરૂપે પડકારજનક છે. આનું કારણ એ છે કે મોટાભાગના આર. બી. પી. માં સામાન્ય રીતે બહુવિધ આર. એન. એ. લક્ષ્યો હોય છે. જો કે, તે નિર્વિવાદ છે કે આર. બી. પી. વિકાસલક્ષી માર્ગોને સંકલિત રીતે નિયમન કરવામાં નિર્ણાયક નિયંત્રણનો ઉપયોગ કરે છે. ડ્રોસોફિલા મેલાનોગાસ્ટરમાં જર્મલાઇન વિકાસ, એલાવ, એસએક્સએલ અને ટ્રે-2 એ આરએનએ-બંધનકર્તા પ્રોટીન એન્કોડિંગ જનીનો છે જે પ્રારંભિક લિંગ નિર્ધારણ અને શારીરિક જાતીય સ્થિતિની જાળવણીમાં મહત્વપૂર્ણ છે. આ જનીનો ડ્રોસોફિલામાં લિંગ-વિશિષ્ટ વિભાજનને નિયંત્રિત કરીને અનુલેખન પછીના સ્તર પર અસર કરે છે. એસ. એક્સ. એલ. સ્ત્રીઓમાં કાર્યાત્મક ટી. આર. એમ. આર. એન. એ. ઉત્પન્ન કરવા માટે સ્ત્રીત્વ જનીન ટ્રેનું સકારાત્મક નિયમન કરે છે. સી. એલિગન્સમાં, એફઓજી-1, એમઓજી-1/- 4/- 5 અને આરએનપી-4 સહિતના આરએનએ-બંધનકર્તા પ્રોટીન જર્મલાઇન અને શારીરિક લિંગ નિર્ધારણને નિયંત્રિત કરે છે. વધુમાં, જી. એલ. ડી.-1, જી. એલ. ડી.-3, ડી. એ. ઝેડ.-1, પી. જી. એલ.-1 અને ઓ. એમ. એ.-1/- 2 જેવા કેટલાક આર. બી. પી. મેયોટિક પ્રોફેઝ પ્રગતિ, ગેમેટોજેનેસિસ અને અંડકોશિકા પરિપક્વતા દરમિયાન તેમના નિયમનકારી કાર્યોનો ઉપયોગ કરે છે. શારીરિક વિકાસ જર્મલાઇન વિકાસમાં આર. બી. પી. ના કાર્યો ઉપરાંત, અનુલેખન પછીનું નિયંત્રણ પણ શારીરિક વિકાસમાં નોંધપાત્ર ભૂમિકા ભજવે છે. જર્મલાઇન અને પ્રારંભિક ગર્ભ વિકાસમાં સામેલ આર. બી. પી. થી અલગ, શારીરિક વિકાસમાં કાર્યરત આર. બી. પી. એમ. આર. એન. એ. લક્ષ્યોના પેશી-વિશિષ્ટ વૈકલ્પિક વિભાજનને નિયંત્રિત કરે છે. દાખલા તરીકે, આર. આર. એમ. ક્ષેત્રો ધરાવતા એમ. ઇ. સી.-8 અને યુ. એન. સી.-75 અનુક્રમે હાયપોડર્મિસ અને ચેતાતંત્રના પ્રદેશોમાં સ્થાનિક બને છે. વધુમાં, અન્ય આર. આર. એમ. ધરાવતું આર. બી. પી., ઇ. એક્સ. સી.-7, શારીરિક વિકાસ દરમિયાન ગર્ભ ઉત્સર્જક નહેરના કોષોમાં અને સમગ્ર ચેતાતંત્રમાં સ્થાનિક હોવાનું બહાર આવ્યું છે. ન્યુરોનલ વિકાસ ઝેડ. બી. પી. 1 હિપ્પોકેમ્પલ ચેતાકોષોમાં ડેંડ્રિટોજેનેસિસ (ડેંડ્રાઇટ રચના) ને નિયંત્રિત કરવા માટે દર્શાવવામાં આવ્યો હતો. ડેંડ્રાઇટની રચનામાં સામેલ અન્ય આર. એન. એ.-બંધનકર્તા પ્રોટીન છે પ્યુમિલિયો અને નેનોસ, એફ. એમ. આર. પી., સી. પી. ઇ. બી. અને સ્ટોફેન 1 કેન્સર આર. બી. પી. માં ભૂમિકા ગાંઠના વિકાસમાં નિર્ણાયક ભૂમિકા ભજવવા માટે ઉભરી રહી છે. સેંકડો આર. બી. પી. માનવ કેન્સરમાં નોંધપાત્ર રીતે અનિયંત્રિત છે અને સામાન્ય પેશીઓ સાથે સંબંધિત ગાંઠોમાં મુખ્ય ડાઉનરેગ્યુલેશન દર્શાવે છે. ઘણા આર. બી. પી. કેન્સરના વિવિધ પ્રકારોમાં અલગ રીતે વ્યક્ત થાય છે, ઉદાહરણ તરીકે કે. એચ. ડી. આર. બી. એસ. 1 (સેમ 68), ઇ. એલ. એ. વી. એલ. 1 (એચ. યુ. આર.), એફ. એક્સ. આર. 1 અને યુ. એચ. એમ. કે. 1. કેટલાક આર. બી. પી. માટે, અભિવ્યક્તિમાં ફેરફાર કોપી નંબર વેરિએશન્સ (સી. એન. વી.) સાથે સંબંધિત છે, ઉદાહરણ તરીકે કોલોરેક્ટલ કેન્સરના કોષોમાં બી. વાય. એસ. એલ. ના સી. એન. વી. લાભ અને સ્તન કેન્સરમાં ઇ. એસ. આર. પી. 1, સી. ઇ. એલ. એફ. 3, યકૃત કેન્સરમાં આર. બી. એમ. 24, ફેફસાના કેન્સરમાં આઇ. જી. એફ. 2. બી. પી. 2, આઇ. જી. એફ. 2. બી. પી. 3 અથવા ફેફસાના કેન્સરમાં કે. એચ. ડી. આર. બી. એસ. 2 ના સી. એન. વી. નુકસાન. કેટલાક અભિવ્યક્તિ ફેરફારો આ આર. બી. પી. પર પરિવર્તનને અસર કરતા પ્રોટીનને કારણે થાય છે, ઉદાહરણ તરીકે એન. એસ. યુ. એન. 6, ઝેડ. સી. 3. એચ. 13, ઇ. એલ. એ. સી. 1, આર. બી. એમ. એસ. 3, અને ઝેડ. જી. પી. એ. ટી., એસ. એફ. 3. બી. 1, એસ. આર. એસ. એફ. 2, આર. બી. એમ. 10, યુ. 2. એ. એફ. 1, એસ. એફ. 3. બી. 1, પી. પી. આર. સી. 1, આર. બી. એમ. એક્સ. એલ. 1, એચ. એન. આર. એન. પી. સી. એલ. 1 વગેરે. કેટલાક અભ્યાસોએ આર. બી. પી. ની અભિવ્યક્તિમાં આ ફેરફારને કેન્સરમાં અસામાન્ય વૈકલ્પિક સ્પ્લિસિંગ સાથે સંબંધિત કર્યો છે. વર્તમાન સંશોધન આરએનએ-બંધનકર્તા પ્રોટીન અસંખ્ય સેલ્યુલર કાર્યો પર નોંધપાત્ર નિયંત્રણ કરે છે, તે ઘણા સંશોધકો માટે તપાસનું લોકપ્રિય ક્ષેત્ર રહ્યું છે. જૈવિક ક્ષેત્રમાં તેના મહત્વને કારણે, તાજેતરમાં આર. એન. એ.-બંધનકર્તા પ્રોટીનની ક્ષમતાઓ સંબંધિત અસંખ્ય શોધોનું અનાવરણ કરવામાં આવ્યું છે. આર. એન. એ.-બંધનકર્તા પ્રોટીનની પ્રાયોગિક ઓળખમાં તાજેતરના વિકાસથી આર. એન. એ.-બંધનકર્તા પ્રોટીનની સંખ્યામાં નોંધપાત્ર વધારો થયો છે, આર. એન. એ.-બંધનકર્તા પ્રોટીન સેમ68 ડેંડ્રાઇટ્સમાં યોગ્ય સિનેપ્ટિક કાર્ય પ્રાપ્ત કરવા માટે આર. એન. એ. ચયાપચયના અવકાશી અને અસ્થાયી વિભાગીકરણને નિયંત્રિત કરે છે. સેમ68નું નુકસાન અસામાન્ય અનુલેખન પછીના નિયમનમાં પરિણમે છે અને આખરે નાજુક એક્સ-સંકળાયેલ ધ્રુજારી/એટેક્સિયા સિન્ડ્રોમ જેવી ન્યુરોલોજીકલ વિકૃતિઓ તરફ દોરી જાય છે. સેમ68 એમઆરએનએ એન્કોડિંગ β-એક્ટિન સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરતું જોવા મળ્યું હતું, જે તેના સાયટોસ્કેલેટલ ઘટકો સાથે ડેંડ્રાઇટિક સ્પાઇન્સની સિનેપ્ટિક રચનાને નિયંત્રિત કરે છે. તેથી, પોસ્ટસિનેપ્ટિક β-એક્ટિન mRNA ચયાપચયના નિયંત્રણ દ્વારા સિનેપ્સ સંખ્યાને નિયંત્રિત કરવામાં સેમ68 મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવે છે. ન્યુરોન-વિશિષ્ટ સીઇએલએફ કુટુંબ આરએનએ-બંધનકર્તા પ્રોટીન યુએનસી-75 ખાસ કરીને સી. એલિગન્સના ન્યુરોનલ કોષોમાં એક્સોન 7એ પસંદગી માટે તેના ત્રણ આરએનએ માન્યતા પ્રણાલીઓ દ્વારા યુયુજીયુજીયુજીયુયુજીયુ એમઆરએનએ સ્ટ્રેચ સાથે જોડાય છે. જેમ કે એક્સોન 7એ બિન-ન્યુરોનલ કોષોમાં તેની નબળી સ્પ્લાઇસ સાઇટ્સને કારણે છોડવામાં આવે છે, યુએનસી-75 ખાસ કરીને ફક્ત ન્યુરોનલ કોષોમાં એક્સોન 7એ અને એક્સોન 8 વચ્ચે સ્પ્લિસિંગને સક્રિય કરે છે. કોલ્ડ ઇન્ડ્યુસિબલ આર. એન. એ. બંધનકર્તા પ્રોટીન સી. આઈ. આર. બી. પી. ટૂંકા તરંગલંબાઇ અલ્ટ્રાવાયોલેટ પ્રકાશ, હાયપોક્સિયા અને હાયપોથર્મિયા સહિત વિવિધ સેલ્યુલર તાણનો સામનો કરવા પર સેલ્યુલર પ્રતિક્રિયાને નિયંત્રિત કરવામાં ભૂમિકા ભજવે છે. આ સંશોધનથી બળતરા સાથે રોગની સ્થિતિઓના જોડાણ માટે સંભવિત અસરો મળી. આર. એન. એ.-બંધનકર્તા પ્રોટીન એસ. એલ. આર. 1 નું સેરીન-આર્જિનિન કુટુંબ કેન્ડિડા આલ્બિકન્સમાં ધ્રુવીકૃત વૃદ્ધિ પર નિયંત્રણ ધરાવે છે. ઉંદરમાં એસ. એલ. આર. 1 પરિવર્તનના પરિણામે ફિલામેન્ટેશનમાં ઘટાડો થાય છે અને ઉપકલા અને એન્ડોથેલિયલ કોષોને નુકસાન ઘટાડે છે જે એસ. એલ. આર. 1 જંગલી-પ્રકારનાં તાણની તુલનામાં વિસ્તૃત અસ્તિત્વ દર તરફ દોરી જાય છે. તેથી, આ સંશોધન દર્શાવે છે કે એસ. આર. જેવું પ્રોટીન એસ. એલ. આર. 1 સી. આલ્બિકન્સમાં હાયફલ રચના અને વાઈરુલેન્સને ઉશ્કેરવામાં ભૂમિકા ભજવે છે. ડીએનએ-બંધનકર્તા પ્રોટીન આરએનએ-બંધનકર્તા પ્રોટીન ડેટાબેઝ રિબોન્યુક્લિયોપ્રોટીન બાહ્ય લિંક્સ સ્ટારબેઝ પ્લેટફોર્મઃ મોટા પાયે સીએલઆઇપી-સેક (હિટ્સ-સીએલઆઇપી, પી. એ. આર.-સીએલઆઇપી, આઇસીએલઆઇપી, ક્લેશ) ડેટાસેટ્સમાંથી આરએનએ બંધનકર્તા પ્રોટીન (આર. બી. પી.) ની બંધનકર્તા સાઇટ્સને ડીકોડિંગ કરવા માટેનું એક પ્લેટફોર્મ પણ જુઓ. આરબીપીડીબી ડેટાબેઝઃ આરએનએ બંધનકર્તા પ્રોટીનનો ડેટાબેઝ. ઓઆરએનએમેન્ટઃ વિવિધ પ્રજાતિઓમાં કોડિંગ અને નોન-કોડિંગ આરએનએ બંનેમાં અનુમાનિત આરબીપી બંધનકર્તા સાઇટ ઉદાહરણોનો ડેટાબેઝ. એ. ટી. ટી. આર. એ. સી. ટી. ડેટાબેઝઃ આર. એન. એ. બંધનકર્તા પ્રોટીન અને સંકળાયેલ પ્રણાલીઓનો ડેટાબેઝ. સ્પ્લિસ્ડ એઇડ-એફઃ હાથથી તૈયાર કરાયેલ માનવ આર. એન. એ. બંધનકર્તા પ્રોટીન ડેટાબેઝનો ડેટાબેઝ. આર. એસ. આઈ. ટી. ડી. બી.: આર. એન. એ. બંધનકર્તા સાઇટ ડેટાબેઝ એસ. પી. ઓ. ટી.-સેક-આર. એન. એ.: આર. એન. એ. બંધનકર્તા પ્રોટીન અને તેમની જટિલ રચનાઓની નમૂના આધારિત આગાહી. એસ. પી. ઓ. ટી.-માળખું-આર. એન. એ.: 3ડી માળખાઓમાંથી આર. એન. એ. બંધનકર્તા પ્રોટીનની આગાહી. એન્કોડ પ્રોજેક્ટઃ જીનોમિક ડેટાસેટ્સનો સંગ્રહ (એટલે કે. આર. બી. પી. માટે આર. એન. એ. બાઈન્ડ-એન-સેક, ઇ. સી. એલ. આઈ. પી., આર. બી. પી. લક્ષિત એસ. આર. એન. એ. આર. એન. એ.-સેક) આર. બી. પી. આર. બી. પી. છબી ડેટાબેઝઃ કોષોમાં આર. બી. પી. ના સેલ્યુલર સ્થાનિકીકરણને દર્શાવતી છબીઓ આર. બી. પી. એસ. સ્પોટ સોફ્ટવેરઃ આર. બી. પી.-આર. એન. એ. ક્રિયાપ્રતિક્રિયાને શોધવા માટે એક ડીપ-લર્નિંગ આધારિત અત્યંત સચોટ સોફ્ટવેર. તે નવા આર. બી. પી.-આર. એન. એ. ક્રિયાપ્રતિક્રિયા મોડેલો બનાવવા માટે એક મોડ્યુલ પણ પ્રદાન કરે છે. સંદર્ભો કોષ જીવવિજ્ઞાન