Pseudopeptidoglycan
સ્યુડોપેપ્ટિડોગ્લાયકેન (જેને સ્યુડોમ્યુરેન તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે; પી. પી. જી. હવે પછી) એ કેટલાક આર્કિયાનો મુખ્ય કોષ દિવાલ ઘટક છે જે રાસાયણિક માળખામાં બેક્ટેરિયલ પેપ્ટિડોગ્લાયકેનથી અલગ છે, પરંતુ કાર્ય અને ભૌતિક માળખામાં બેક્ટેરિયલ પેપ્ટિડોગ્લાયકેન જેવું લાગે છે. સ્યુડોપેપ્ટિડોગ્લાયકેન, સામાન્ય રીતે, માત્ર થોડા મિથેનોજેનિક આર્કિયામાં હાજર હોય છે. મૂળભૂત ઘટકો એન-એસિટિલગ્લૂકોસામાઇન અને એન-એસિટિલટાલોસામિન્યુરોનિક એસિડ (તેના બદલે એન-એસિટિલમુરમિક એસિડ ધરાવતું બેક્ટેરિયલ પેપ્ટિડોગ્લાયકેન) છે, જે β-1,3-ગ્લાયકોસિડિક બોન્ડ્સ દ્વારા જોડાયેલા છે. લાયસોઝાઇમ, માનવ સ્ત્રાવમાં હાજર યજમાન સંરક્ષણ પદ્ધતિ (દા. ત. લાળ અને આંસુ) પેપ્ટિડોગ્લાયકેનને ખરાબ કરવા માટે β-1,4-ગ્લાયકોસિડિક બોન્ડ્સને તોડે છે. જો કે, સ્યુડોપેપ્ટિડોગ્લાયકેનમાં β-1,3-ગ્લાયકોસિડિક બોન્ડ્સ હોવાથી, લાઇસોઝાઇમ બિનઅસરકારક છે. કોષની દિવાલના રસાયણશાસ્ત્રમાં આ મોટા તફાવતો પરથી એવું માનવામાં આવતું હતું કે પ્રાચીન કોષની દિવાલો અને બેક્ટેરિયાની કોષની દિવાલો સામાન્ય પૂર્વજમાંથી વિકસિત થઈ નથી પરંતુ તે માત્ર એક અભિસારી ઉત્ક્રાંતિનું પરિણામ છે, પરંતુ તાજેતરના માળખાકીય કાર્યોએ ઊંડા સમરૂપતા જાહેર કરી છે. કોઈ આર્કિયલ ઉત્સેચકો જાણીતા નથી કે જે સ્યુડોપેપ્ટિડોગ્લાયકેનમાં β-1,3-ગ્લાયકોસિડિક બોન્ડ્સને વિભાજીત કરે છે, પરંતુ તે બે પ્રોફેજ દ્વારા એન્કોડેડ સ્યુડોમ્યુરેન એન્ડોઇસોપેપ્ટિડેઝ દ્વારા અધોગતિ પામી શકે છે. સ્યુડોમ્યુરેન એન્ડોઇસોપેપ્ટિડેસિસ નજીકના સ્યુડોપેપ્ટિડોગ્લાયકેન સેર વચ્ચેના પેપ્ટાઇડ લિંક્સને વિભાજીત કરીને કાર્ય કરે છે. રચના સ્યુડોપેપ્ટિડોગ્લાયકેન બે શર્કરા, એન-એસિટિલગ્લૂકોસામાઇન અને એન-એસિટિલટાલોસામિન્યુરોનિક એસિડથી બનેલું છે. આ શર્કરા વિવિધ એમિનો એસિડમાંથી બને છે, અને સ્યુડોપેપ્ટિડોગ્લાયકેનની અંદર પેપ્ટાઇડ ક્રોસ-લિંક્સ વિવિધ એમિનો એસિડ સાથે રચાય છે. પેપ્ટાઇડ બોન્ડ એન-એસિટિલ્ટાલોસામિન્યુરોનિક એસિડના લાઇસિન અને સમાંતર એન-એસિટિલ્ટાલોસામિન્યુરોનિક એસિડના ગ્લુટામાઇન વચ્ચે રચાય છે. સ્યુડોપેપ્ટિડોગ્લાયકેન, બેક્ટેરિયામાં પેપ્ટિડોગ્લાયકેનની જેમ, આર્કિયાના પ્લાઝ્મા પટલની બહાર જાળી જેવું સ્તર બનાવે છે. કાર્ય માત્ર થોડા મિથેનોજેનિક આર્કિયામાં સ્યુડોપેપ્ટિડોગ્લાયકેનની બનેલી કોષ દિવાલો હોય છે. આ ઘટક બેક્ટેરિયાના કોષમાં પેપ્ટિડોગ્લાયકેનની જેમ કાર્ય કરે છે. સ્યુડોપેપ્ટિડોગ્લાયકેનનો ઉપયોગ આર્કિયલ કોષ દ્વારા તેનો આકાર નક્કી કરવા અને કોષને માળખું પ્રદાન કરવા માટે થાય છે. તેનો ઉપયોગ કોષને અનિચ્છનીય અણુઓ અથવા તેના પર્યાવરણમાં હાનિકારક કોઈપણ વસ્તુથી બચાવવા માટે પણ થાય છે. બાયોસિંથેસિસ પી. પી. જી. બે જનીન સમૂહના ઉત્સેચકો દ્વારા ઉત્પન્ન થાય છે. પેપ્ટાઇડ અસ્થિબંધન પર તાજેતરના સંશોધનો દર્શાવે છે કે, આશ્ચર્યજનક રીતે, મ્યુરિન સંશ્લેષણ સાથે એક સામાન્ય મૂળ છે. આ માર્ગ હવે ઓર્થોલોગસ-ટુ-બેક્ટેરિયા કાર્બ, એમ. આર. સી./ડી. (પેપ્ટાઇડ લિગેઝ), એમ. આર. જી., એમ. આર. એ. વાય., યુ. પી. પી., યુ. પી. એસ. અને ફ્લિપેઝનો સમાવેશ કરવા માટે જાણીતો છે જે સંભવતઃ સમાન કાર્ય કરે છે, અને બે નવીન પરંતુ સંરક્ષિત ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રોટીન છે. જી. એલ. એમ. એમ. અને જી. એલ. એમ. યુ., જે બેક્ટેરિયામાં યુ. ડી. પી.-જી. એલ. સી. એન. એ. સી. ઉત્પન્ન કરે છે, તે પણ ફોસ્ફોગ્લુકોમ્યુટેઝ (પી. જી. એમ.) સાથે હાજર છે. અડધી પ્રજાતિઓમાં મર્ટ અને જીએટીડી પણ હોય છે, જે બેક્ટેરિયામાં કોષ દિવાલમાં ફેરફારો કરવા માટે જાણીતા છે. કોઈ ઓર્થોલોગસ ક્રોસ-લિંકિંગ ઉત્સેચકો ઓળખવામાં આવ્યા નથી. નોંધપાત્ર રીતે, "ગ્લાયકોપેપ્ટાઇડ મોનોમરના ડિસેકરાઇડ ભાગની રચના એમ. આર. એ. વાય. દ્વારા પટલ પ્રોટીનમાં સ્થાનાંતરણ પહેલાં થાય છે", બેક્ટેરિયામાં તેના વિપરીત. આ માહિતીને સુસંગત માર્ગ સાથે જોડવા માટે વધુ કામ કરવાની જરૂર પડશે. સ્યુડોપેપ્ટિડોગ્લાયકેન પર વિવિધ બેક્ટેરિયલ દવાઓની અસરો લિસોઝાઇમ એ મનુષ્યમાં એક કુદરતી સંરક્ષણ પદ્ધતિ છે જે બેક્ટેરિયાના કોષોમાં પેપ્ટિડોગ્લાયકેનને તોડવાની ક્ષમતા ધરાવે છે. તે β-1,4-ગ્લાયકોસિડિક બોન્ડ્સને લક્ષ્યાંક બનાવીને પેપ્ટિડોગ્લાયકેનનું અધઃપતન કરે છે જે વૈકલ્પિક એમિનો શર્કરાને જોડે છે જેમાં તે બનેલું છે. પેપ્ટિડોગ્લાયકેનની અંદર ગ્લાયકોસિડિક બોન્ડ્સના આ અધઃપતનને કારણે શર્કરા પેપ્ટિડોગ્લાયકેન અને બેક્ટેરિયાની માળખાકીય અખંડિતતાને અલગ કરે છે અને અટકાવે છે. સ્યુડોપેપ્ટિડોગ્લાયકેન, જોકે, એક અલગ એસિડિક એમિનો ખાંડથી બનેલું છે, જે એન-એસિટિલ્ટાલોસામિન્યુરોનિક એસિડ છે. આ તફાવત એ કારણ છે કે તેમાં β-1,3-ગ્લાયકોસિડિક બોન્ડ્સ છે (બેક્ટેરિયામાં β-1,4-ગ્લાયકોસિડિક બોન્ડ્સના વિરોધમાં). લાઇસોઝાઇમ્સ પેપ્ટિડોગ્લાયકેનમાં જોડાણને લક્ષ્ય બનાવે છે, અને તે વિના, સ્યુડોપેપ્ટિડોગ્લાયકેન સામે બિનઅસરકારક બની જાય છે. પેનિસિલિન એ એન્ટિબાયોટિક્સનો સમૂહ છે જે ઘણા બેક્ટેરિયાના ચેપ સામે અસરકારક છે. તે ટ્રાન્સપેપ્ટિડેઝને નિશાન બનાવીને અને અટકાવીને બેક્ટેરિયા પર હુમલો કરે છે જે પેપ્ટિડોગ્લાયકેનમાં એમિનો શર્કરાના ક્રોસ-લિંકિંગને ઉત્પ્રેરિત કરે છે. જો કે, પેપ્ટિડોગ્લાયકેનમાં વિવિધ એમિનો શર્કરા હોય છે, અને તેથી, એક અલગ ઉત્પ્રેરક ઉત્સેચકનો ઉપયોગ થાય છે. વિવિધ એમિનો એસિડ એન્ટિબાયોટિક્સનું કારણ બને છે, જે પેનિસિલિન જેવી કોષ દિવાલોને લક્ષ્ય બનાવે છે, જે સ્યુડોપેપ્ટિડોગ્લાયકેન સામે બિનઅસરકારક છે. વર્ગીકરણ વિતરણ પી. પી. જી. મિથેનોબેક્ટેરિયલ અને મિથેનોપાયરલના પ્રાચીન ક્રમમાં જોવા મળે છે. આ ક્રમ હેઠળની કેટલીક જાતિઓ છેઃ મિથેનોબેક્ટેરિયમ મિથેનોબ્રેવિબેક્ટર મિથેનોથર્મોબેક્ટર મિથેનોથર્મસ મિથેનોસ્ફેરા મિથેનોપાયરસ સેલ વોલ મિથેનોકોન્ડ્રોઇટિન પેપ્ટિડોગ્લાયકેન સંદર્ભો વધુ વાંચન મેમ્બ્રેન બાયોલોજી