The Proteolysis Map
પ્રોટીઓલિસિસ એમએપી (પીએમએપી) એ પ્રોટીએઝ પર કેન્દ્રિત એક સંકલિત વેબ સંસાધન હતું. તેનું ડોમેન હવે સ્કેમ/સ્પામ બ્રાઉઝર એક્સટેન્ડર સાથે જોડાય છે. રેશનલ પી. એમ. એ. પી. ની રચના પ્રોટીઝ સંશોધકોને પ્રોટીઓલિટિક નેટવર્ક અને મેટાબોલિક માર્ગો વિશે તર્ક કરવામાં મદદ કરવા માટે કરવામાં આવી હતી. ઇતિહાસ અને ભંડોળ પી. એમ. એ. પી. મૂળરૂપે બર્નહામ ઇન્સ્ટિટ્યૂટ ફોર મેડિકલ રિસર્ચ, લા જોલા, કેલિફોર્નિયામાં બનાવવામાં આવ્યું હતું. 2004માં નેશનલ ઇન્સ્ટિટ્યૂટ ઓફ હેલ્થ (એન. આઈ. એચ.) એ સેન્ટર ઓન પ્રોટીઓલિટિક પાથવેઝ (સી. પી. પી.) ની સ્થાપના માટે જેફરી ડબલ્યુ. સ્મિથની આગેવાની હેઠળની ટીમની પસંદગી કરી હતી. બાયોમેડિકલ સંશોધન માટે એન. આઈ. એચ. રોડમેપના ભાગરૂપે, કેન્દ્ર પ્રોટીનના વર્તનનો અભ્યાસ કરવા અને તે જ્ઞાનને મોટા પાયે વૈજ્ઞાનિક સમુદાયમાં વિતરિત કરવા માટે ટેકનોલોજી વિકસાવે છે. ફોકલ પોઇન્ટ પ્રોટીઝ એ ઉત્સેચકોનો એક વર્ગ છે જે પ્રોટીનમાં પેપ્ટાઇડ બંધને વિભાજીત કરીને કોષની અંદર અને બહાર માનવ શરીરમાં જે થાય છે તેના મોટા ભાગનું નિયમન કરે છે. આ પ્રવૃત્તિ દ્વારા, તેઓ ચાર આવશ્યક કોષ કાર્યોને સંચાલિત કરે છેઃ તફાવત, ગતિશીલતા, વિભાજન અને કોષ મૃત્યુ-અને લોહીના ગંઠાઈ જવામાં બાયોકેમિકલ કાસ્કેડ અસર જેવા મહત્વપૂર્ણ બાહ્યકોષીય પ્રસંગોને સક્રિય કરે છે. તેમના વિના જીવન શક્ય નહોતું. પ્રોટીએઝિસ (જેને પેપ્ટિડેઝિસ તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે) માટે વ્યાપક ઓનલાઇન વર્ગીકરણ પ્રણાલી MEROPS ડેટાબેઝમાં જમા કરવામાં આવે છે. ગોલ પ્રોટીઓલિટિક પાથવેઝ અથવા પ્રોટીઓલિસિસ એ ચોક્કસ ઉત્તેજનાના પ્રતિભાવમાં પ્રોટીએઝ દ્વારા નિયંત્રિત ઘટનાઓની શ્રેણી છે. લોહીના ગંઠાઈ જવા અને ઇન્સ્યુલિનના ઉત્પાદનને પ્રોટીઓલિટિક માર્ગો તરીકે જોઈ શકાય છે. પ્રોટીનનું સક્રિયકરણ, નિયમન અને અવરોધ એ ગ્લુકોઝના સ્તરને બદલવા માટે પ્રોટીએઝ પ્રતિક્રિયાઓ છે અને અન્ય પ્રોટીએઝને ડાઉનસ્ટ્રીમમાં ટ્રિગર કરે છે. ડેટાબેઝ સામગ્રી પી. એમ. એ. પી. પાંચ ડેટાબેઝને એકીકૃત કરે છે. પ્રોટીઝડીબી અને સબસ્ટ્રેટડીબી, સ્વચાલિત એનોટેશન પાઇપલાઇન દ્વારા સંચાલિત છે જે ગતિશીલ 'મોલેક્યુલ પૃષ્ઠો' ઉત્પન્ન કરે છે, જે મોલેક્યુલર માહિતીથી સમૃદ્ધ છે. કટડીબી પાસે 6,600 થી વધુ પ્રોટીઓલિટિક ઘટનાઓની માહિતી છે, અને પ્રોફાઇલડીબી પ્રોટીએઝની સબસ્ટ્રેટ ઓળખની વિશિષ્ટતાની માહિતી માટે સમર્પિત છે. પાથવેડીબીએ મેટાબોલિક માર્ગોનું સંચય કરવાનું શરૂ કર્યું છે, જેના કાર્યને નિયમ-આધારિત રીતે ગતિશીલ રીતે તૈયાર કરી શકાય છે. સાહિત્યમાંથી અર્ધ-સ્વચાલિત કિલિંગ દ્વારા કાલ્પનિક નેટવર્કનું અનુમાન કરવામાં આવે છે. પ્રોટીઝ સોફ્ટવેર ટૂલ્સ વ્યક્તિગત પ્રોટીઝ અને પ્રોટીઓમ-વાઇડ ડેટાસેટ્સનું વિશ્લેષણ કરવામાં મદદ કરી શકે છે. ઉપયોગ પી. એમ. એ. પી. માં લોકપ્રિય સ્થળો પ્રોટીઝ મોલેક્યુલ પૃષ્ઠો અને સબસ્ટ્રેટ મોલેક્યુલ પૃષ્ઠો છે. પ્રોટીઝ મોલેક્યુલ પૃષ્ઠો પ્રોટીઝના પબમેડ સાહિત્યમાં તાજેતરના સમાચાર, જાણીતા પ્રોટીઓલિટિક ઘટનાઓ, પ્રોટીન ડોમેન સ્થાન અને પ્રોટીન માળખું દૃશ્ય, તેમજ અન્ય બાયોઇન્ફોર્મેટિક ડેટાબેઝ વિભાગમાં ક્રોસ એનોટેશન દર્શાવે છે. સબસ્ટ્રેટ મોલેક્યુલ પૃષ્ઠો રસના આપેલ પ્રોટીન લક્ષ્ય માટે પ્રોટીન ડોમેન્સ અને પ્રાયોગિક રીતે મેળવેલ પ્રોટીઝ કટ-સાઇટ્સ પ્રદર્શિત કરે છે. સાયટોસ્કેપ કોમ્પ્યુટેશનલ જીનોમિક્સ મેટાબોલિક નેટવર્ક મોડેલિંગ પ્રોટીન-પ્રોટીન ક્રિયાપ્રતિક્રિયા આગાહી સંદર્ભો બાહ્ય કડીઓ સત્તાવાર વેબસાઇટ પ્રોટીયોલિસિસ કટ સાઇટ ડેટાબેઝ-વપરાશકર્તાઓ તરફથી ક્યુરેટેડ નિષ્ણાત એનોટેશન પ્રોટેઝ કટ સાઇટ્સ ગ્રાફિકલ ઇન્ટરફેસ પ્રોટેઝ કટીંગ પ્રિડિક્ટર મેરોપ્સ-પેપ્ટિડેઝ ડેટાબેઝ મોલેક્યુલર બાયોલોજી બાયોલોજિકલ ડેટાબેઝ બાયોલોજિકલ ડેટાબેઝ સિસ્ટમ્સ બાયોલોજી મેથેમેટિકલ અને સૈદ્ધાંતિક બાયોલોજી પ્રોટીન ડોમેન્સ પ્રોટીન પરિવારો પેરિફેરલ મેમ્બ્રેન પ્રોટીન પોસ્ટ-ટ્રાન્સલેશનલ મોડિફિકેશન પ્રોગ્રામ્ડ સેલ ડેથ એપોપ્ટોસિસ