EF-Ts
ઇ. એફ.-ટી. એસ. (વિસ્તરણ પરિબળ થર્મો સ્ટેબલ) એ પ્રોકેરીયોટિક વિસ્તરણ પરિબળોમાંથી એક છે. તે માનવ મિટોકોન્ડ્રિયામાં ટી. એસ. એફ. એમ. તરીકે જોવા મળે છે. તે યુકેરીયોટિક EF-1B જેવું જ છે. ઇએફ-ટીએસ ઇએફ-તુ (વિસ્તરણ પરિબળ થર્મો અસ્થિર) માટે ગુઆનાઇન ન્યુક્લિયોટાઇડ વિનિમય પરિબળ તરીકે કામ કરે છે, જે ઇએફ-તુમાંથી ગુઆનોસિન ડાયફોસ્ફેટના પ્રકાશનને ઉત્પ્રેરિત કરે છે. આ ઇ. એફ.-ટુને નવા ગુઆનોસિન ટ્રાઇફોસ્ફેટ પરમાણુ સાથે જોડાવા, ઇ. એફ.-ટી. એસ. ને મુક્ત કરવા અને અન્ય એમિનોસિલ ટી. આર. એન. એ. ઉમેરાને ઉત્પ્રેરિત કરવા સક્ષમ બનાવે છે. માળખું પ્રોટીન ક્યુબીટા-રેપ્લિકેઝ એ ટેટ્રામેરિક પ્રોટીન છે, જેનો અર્થ છે કે તેમાં ચાર પેટા એકમો છે. આ પેટા એકમો બે વિસ્તરણ પરિબળો છે, ઇ. એફ.-ટુ અને ઇ. એફ.-ટી. એસ., રાઇબોસોમલ પ્રોટીન પેટા એકમ એસ1 અને આર. એન. એ. આધારિત આર. એન. એ. પોલિમરેઝ β-પેટા એકમ. બે વિસ્તરણ પરિબળો હેટેરોડાઇમર માળખું બનાવે છે જે વિસ્તરણ પરિબળ સંકુલ તરીકે ઓળખાય છે, જે આર. ડી. આર. પી. β-સબ્યુનિટની પોલિમરાઇઝેશન પ્રવૃત્તિ માટે જરૂરી છે. તેના ગૌણ માળખાકીય ઘટકોમાં α-હેલિસીસ, β-શીટ્સ અને β-બેરલનો સમાવેશ થાય છે. ઇએફ-ટીમાં પ્રોટીનનો મોટાભાગનો ટોચનો ભાગ હોય છે, જ્યારે ઇએફ-ટુ નીચેનો અડધો ભાગ બનાવે છે જ્યાં બીટા બેરલ જોવા મળે છે. જ્યારે ઇએફ-ટુમાં સક્રિય સ્થળ સાથે કોઈ ગુઆનાઇન ન્યુક્લિયોટાઇડ બંધાયેલ ન હોય ત્યારે આ રચનાને ખુલ્લી માનવામાં આવે છે. ઇ. એફ.-ટી. એસ. સાંકળમાં ચાર મહત્વપૂર્ણ ક્ષેત્રો છે, સી-ટર્મિનલ ક્ષેત્ર, એન-ટર્મિનલ ક્ષેત્ર, ડાયમેરાઇઝેશન ક્ષેત્ર અને કોર ક્ષેત્ર જે પ્રોટીનની રચના અને કાર્યક્ષમતામાં ચોક્કસ ભૂમિકા ભજવે છે. ડાયમેરાઇઝેશન ડોમેનમાં ચાર એન્ટિ-પેરેલલ α-હેલિસીસ હોય છે જે ડાયમર સ્ટ્રક્ચર ડોમેન બનાવવા માટે EF-Du અને EF-Ts વચ્ચેના સંપર્કનો મુખ્ય સ્રોત છે N-ટર્મિનલ ડોમેન રહેઠાણ 1-54 (n1-n54) થી ફેલાયેલું છે, કોર ડોમેન n55-n179 થી છે, ડાયમેરાઇઝેશન ડોમેન n180-n228 થી છે, અને છેલ્લે C-ટર્મિનલ ડોમેન જે n264-n282 થી છે. કોર ડોમેનમાં બે પેટા ડોમેન છે, સી અને એન જે અનુક્રમે ઇએફ-તુના ડોમેન 3 અને 1 સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરે છે. વિસ્તરણ પ્રક્રિયા માર્ગ EF-Ts ગુઆનાઇન ન્યુક્લિયોટાઇડ વિનિમય પરિબળ તરીકે કાર્ય કરે છે, તે EF-ટુ * GTP (સક્રિય) માટે EF-ટુ * GDP (નિષ્ક્રિય સ્વરૂપ) ની પ્રતિક્રિયાને ઉત્પ્રેરિત કરે છે. ઇ. એફ.-તુ (સક્રિય) પછી એમિનોસિલ-ટી. આર. એન. એ. ને રાઇબોઝોમમાં પહોંચાડે છે. તેથી, ઇ. એફ.-ટી. એસ. ની મુખ્ય ભૂમિકા અન્ય વિસ્તરણ ચક્રને પૂર્ણ કરવા માટે ઇ. એફ.-તુને તેની સક્રિય સ્થિતિમાં પાછું રિસાયકલ કરવાની છે. આ માર્ગનો મોટાભાગનો ભાગ ઇએફ-ટુ ડોમેન 1 ના રચનાત્મક ફેરફારો દ્વારા કરવામાં આવે છે જેમાં સક્રિય સાઇટ અને રાઇબોઝોમ અને ટીઆરએનએ દ્વારા સ્વીચ 1 અને 2 પ્રદેશોની હેરફેરનો સમાવેશ થાય છે. પ્રથમ, EF-Tu ના ડોમેન 1 માં GTPase પ્રવૃત્તિ સ્થળને હાઇડ્રોફોબિક અવશેષોની શ્રેણી દ્વારા અવરોધિત કરવામાં આવે છે જે EF-Ts દ્વારા સક્રિય થતાં પહેલાં ઉત્પ્રેરક અવશેષ તેના 84 ને નિષ્ક્રિય સ્વરૂપમાં અવરોધિત કરે છે. એકવાર ટી. આર. એન. એ. ઇ. એફ.-તુ સાથે બંધાયેલ થઈ જાય, પછી તેને રાઇબોસોમમાં પહોંચાડવામાં આવે છે જે જી. ટી. પી. ને હાઇડ્રોલાઇઝ કરે છે અને ઇ. એફ.-તુને ટી. આર. એન. એ. ને બાંધવા માટે ઓછી આત્મીયતા સાથે છોડી દે છે. રાઇબોઝોમ સ્વીચ 1 ક્ષેત્રની હેરફેર દ્વારા આ કરે છે, જી. ટી. પી. હાઇડ્રોલિસિસ પછી ગૌણ માળખું મુખ્યત્વે α-હેલિસીસથી β-હેરપિનમાં બદલાય છે. EF-Ts દ્વારા ફરી એકવાર સક્રિય ન થાય ત્યાં સુધી ચક્ર પૂર્ણ કરતી નિષ્ક્રિય સ્થિતિમાં રાઇબોસોમમાંથી EF-ટુ મુક્ત થાય છે. ઇએફ-ટુના હેલિક્સ ડીએ ગુઆનાઇન ન્યુક્લિયોટાઇડ વિનિમય માટે ઇએફ-ટીએસના એન-ટર્મિનલ ડોમેન સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરવી આવશ્યક છે. તાજેતરના એક અભ્યાસમાં માર્ગમાં સામેલ પ્રાથમિક અવશેષોને જોવા માટે ઇએફ-ટુના હેલિક્સ ડી પર ચોક્કસ અવશેષોને પરિવર્તિત કરીને ગુઆનાઇન ન્યુક્લિયોટાઇડ વિનિમયની પ્રતિક્રિયા ગતિશાસ્ત્ર પર સંશોધન કરવામાં આવ્યું હતું. લ્યુ148 અને ગ્લુ 152ના પરિવર્તનથી EF-Ts N-ટર્મિનલ ડોમેન હેલિક્સ D સાથે નોંધપાત્ર રીતે જોડાય છે તે દરમાં ઘટાડો થયો છે, અને નિષ્કર્ષ કાઢ્યો છે કે આ બે અવશેષો પ્રતિક્રિયા માર્ગમાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવે છે. સજીવો વચ્ચે એમિનો એસિડનું સંરક્ષણ આ લેખ EF-Ts પર ધ્યાન કેન્દ્રિત કરે છે કારણ કે તે Qβ-બેક્ટેરિયોફેજમાં અસ્તિત્વ ધરાવે છે, જો કે ઘણા સજીવો પ્રોટીન સાથે સમાન વિસ્તરણ પ્રક્રિયાનો ઉપયોગ કરે છે જે EF-Ts જેટલું જ કાર્ય કરે છે. ઇ. એફ.-ટી. એસ. પ્રોટીનના જૂથ સાથે સંબંધિત છે જેને ગુઆનાઇન ન્યુક્લિયોટાઇડ વિનિમય પરિબળો તરીકે ઓળખવામાં આવે છે અને આ પ્રોટીન ઘણા જુદા જુદા બાયોકેમિકલ માર્ગોમાં કાર્ય કરે છે, તે ટી. એસ. એફ. સુપરફેમિલી સાથે પણ સંબંધિત છે. અન્ય સજીવો વચ્ચે જોવા મળતા મોટાભાગના એમિનો એસિડનું સંરક્ષણ એન-ટર્મિનલ ડોમેનમાં સ્થિત છે જ્યાં ઇએફ-ટીએસ ઇએફ-તુ સાથે જોડાય છે અને ગુઆનાઇન ન્યુક્લિયોટાઇડનું વિનિમય થાય છે. નીચે EF-Ts ના મહત્વપૂર્ણ N-ટર્મિનલ ડોમેનનું સંરેખણ છે જે અન્ય સજીવોમાં અસ્તિત્વમાં છે. E.Coli: 8-LVKELRETGAGMDCCKALT-20 LACBS: 8-LVAELRKRTEVSITKARIALS-20 બોસ વૃષભઃ 8-LLMKLRKTGYSFINCKKALE-20 ડ્રોસોફિલાઃ 8-ALAALRKKTGYTFANCKKKALE-20 તમામ ચારમાં સંરક્ષિત એમિનો એસિડ લ્યુ 12 અને આર્ગ 18 (ઉપર મોટા અક્ષરોમાં જોવા મળે છે) છે, તે તારણ કાઢી શકાય છે કે આ બે અવશેષો ગુઆનાઇન ન્યુક્લિયોટાઇડ વિનિમયમાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવે છે કારણ કે તે માત્ર બે જ સંપૂર્ણપણે સંરક્ષિત છે. યુકેરીયોટ્સમાં EF-1 એ જ કાર્ય કરે છે, અને ગુઆનાઇન ન્યુક્લિયોટાઇડ વિનિમય માટેની પદ્ધતિ EF-Ts જેવી લગભગ સમાન છે, પરંતુ માળખાકીય રીતે અલગ છે. પ્રોકેરીયોટિક વિસ્તરણ પરિબળો EF-ટુ (વિસ્તરણ પરિબળ થર્મો અસ્થિર) EF-G (વિસ્તરણ પરિબળ G) EF-P (વિસ્તરણ પરિબળ P) પ્રોટીન અનુવાદ GTPase સંદર્ભો પ્રોટીન જૈવસંશ્લેષણ પણ જુઓ.