OrthoFinder
ઓર્થોફાઇન્ડર એ તુલનાત્મક જીનોમિક્સ માટેનું કમાન્ડ-લાઇન સોફ્ટવેર ટૂલ છે. ઓર્થોફાઇન્ડર વિવિધ સજીવોમાં જનીનો વચ્ચેના પત્રવ્યવહારને નિર્ધારિત કરે છે (જેને ઓર્થોલોજી વિશ્લેષણ તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે). આ પત્રવ્યવહાર પૃથ્વી પરના જીવનની ઉત્ક્રાંતિને સમજવા માટે એક માળખું પૂરું પાડે છે, અને સજીવો વચ્ચે જૈવિક જ્ઞાનના બહિર્વેશન અને સ્થાનાંતરણને સક્ષમ કરે છે. ઓર્થોફાઇન્ડર પ્રોટીન સિક્વન્સની એફ. એ. એસ. ટી. એ. ફાઇલોને ઇનપુટ (પ્રજાતિ દીઠ એક) તરીકે લે છે અને આઉટપુટ પ્રદાન કરે છેઃ ઓર્થોગ્રુપ્સ તમામ ઓર્થોગ્રુપ્સના મૂળ ધરાવતા ફિલોજેનેટિક વૃક્ષો ઇનપુટ ડેટાસેટમાં સમાવિષ્ટ પ્રજાતિઓના સમૂહ માટે મૂળ ધરાવતું પ્રજાતિ વૃક્ષ પ્રજાતિ વૃક્ષના દરેક નોડ માટે શ્રેણીબદ્ધ ઓર્થોગ્રુપ્સ તમામ પ્રજાતિઓ વચ્ચેના ઓર્થોલોગ્સ જીન ડુપ્લિકેશન ઇવેન્ટ્સ પ્રજાતિ વૃક્ષની શાખાઓમાં મેપ કરવામાં આવે છે તુલનાત્મક જીનોમિક આંકડા ઓગસ્ટ 2021 સુધીમાં, ટૂલને 1500 થી વધુ પ્રકાશિત અભ્યાસો દ્વારા સંદર્ભિત કરવામાં આવ્યું છે. બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ હોમોલોજી (જીવવિજ્ઞાન) સિક્વન્સ હોમોલોજી પ્રોટીન ફેમિલી સિક્વન્સ ક્લસ્ટરિંગ સંદર્ભો ઇવોલ્યુશનરી બાયોલોજી બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ સોફ્ટવેર ફિલોજેનેટિક્સ પણ જુઓ.