ORF6
ORF6 એ એક જનીન છે જે SARS-CoV અને SARS-CoV-2 સહિત સબજેનસ સારબેકોવાયરસના કોરોનાવાયરસમાં વાયરલ એક્સેસરી પ્રોટીનને એન્કોડ કરે છે. તે MERS-CoVમાં હાજર નથી. એવું માનવામાં આવે છે કે તે ઇન્ટરફેરોન દુશ્મનાવટ દ્વારા વાયરલ ચેપ સામે રોગપ્રતિકારક તંત્રની પ્રતિક્રિયાને ઘટાડે છે. માળખું ORF6 પ્રોટીન SARS-CoVમાં 63 એમિનો એસિડ અવશેષો અને SARS-CoV-2માં 61 અવશેષો સાથે એકદમ નાનું છે. ORF6 ક્રમ સારી રીતે સંરક્ષિત નથી અને તે લગભગ 66 ટકા પર બે વાયરસ વચ્ચે પ્રમાણમાં ઓછી અનુક્રમ ઓળખ ધરાવે છે. તેમાં એમ્ફીપેથિક એન-ટર્મિનલ આલ્ફા હેલિક્સ હોય છે જે પટલ સાથે જોડાય છે, પરંતુ તે ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રોટીન નથી. તેની આશરે 20-અવશેષ સી-ટર્મિનલ પૂંછડી ધ્રુવીય છે અને સાયટોસોલમાં વિસ્તરે છે, અને તેમાં પ્રોટીનની હેરફેર માટે સંકેત ક્રમ છે. અભિવ્યક્તિ અને સ્થાનિકીકરણ અન્ય સહાયક પ્રોટીન માટેના જનીનોની જેમ, ઓ. આર. એફ. 6 જનીન કોરોનાવાયરસ આર. એન. એ. જિનોમના 5 'છેડે માળખાકીય પ્રોટીનને એન્કોડિંગ કરતા જનીનોની નજીક સ્થિત છે. ORF7a, ORF7b અને ORF8 સાથે, ORF6 પટલ (M) અને ન્યુક્લિયોકેપ્સિડ (N) જનીનો વચ્ચે સ્થિત છે. તે એન્ડોપ્લાઝ્મિક રેટિક્યુલમ અને ગોલ્ગી ઉપકરણમાં સ્થાનિક છે, SARS-CoV-2 માં થયેલા અભ્યાસો પણ ઓટોફેગોસોમ્સ અને લાઇસોસોમ્સ જેવા વેસિકલ્સ સાથે જોડાણ સૂચવે છે. કાર્ય ORF6 પ્રોટીનનું પ્રાથમિક કાર્ય ઇમ્યુનોમોડ્યુલેશન અને ઇન્ટરફેરોન એન્ટાગોનિઝમ હોવાનું માનવામાં આવે છે. તે વાયરલ પ્રતિકૃતિ માટે જરૂરી નથી, તેમ છતાં તેની ગેરહાજરી પ્રતિકૃતિ કાર્યક્ષમતામાં ઘટાડો કરે છે. SARS-CoVમાં વાયરલ પ્રોટીન ક્રિયાપ્રતિક્રિયા અભ્યાસો સૂચવે છે કે ORF6 પ્રોટીન અન્ય વાયરલ સહાયક પ્રોટીન, ORF9b પ્રોટીન સાથે પ્રોટીન-પ્રોટીન ક્રિયાપ્રતિક્રિયા દર્શાવે છે. SARS-CoV માં, પરંતુ રિકોમ્બિનન્ટ મ્યુરિન હીપેટાઇટિસ વાયરસમાં નહીં, ORF6 પ્રોટીન વાયરસ જેવા કણો અને પુખ્ત વાયરિયનમાં મળી આવ્યું છે, જે સૂચવે છે કે તે એક નાનું વાયરલ માળખાકીય પ્રોટીન હોઈ શકે છે. રોગપ્રતિકારક અસરો SARS-CoV અને SARS-CoV-2 બંનેમાંથી ORF6 પ્રોટીન એક ઇન્ટરફેરોન એન્ટાગોનિસ્ટ છે અને રોગપ્રતિકારક શક્તિની ચોરીમાં સામેલ હોવાનું માનવામાં આવે છે. યજમાન કોષ પ્રોટીન સાથેની કેટલીક પ્રોટીન-પ્રોટીન ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ આ અસરને મધ્યસ્થી કરવા માટે વર્ણવવામાં આવી છે. તે STAT ટ્રાન્સક્રિપ્શન પરિબળની પરમાણુ આયાતને અટકાવે છે, જે ઇન્ટરફેરોન સક્રિયકરણને અટકાવે છે. SARS-CoV અહેવાલના અભ્યાસોમાં આની મધ્યસ્થી ORF6 પ્રોટીનને કેરીઓફેરિન સાથે બાંધીને થઈ શકે છે. સાર્સ-કોવી-2માં, ઓ. આર. એફ. 6 પ્રોટીન કથિત રીતે આર. એ. ઈ. 1 અને એન. યુ. પી. 98 સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરે છે, જે કેરીઓફેરિનની ક્રિયાપ્રતિક્રિયાને અવરોધે છે. સંદર્ભો કોરોનાવાયરસ પ્રોટીન