ORF3c
ORF3c એ SARS-CoV અને SARS-CoV-2 સહિત સબજેનસ સારબેકોવાયરસના કોરોનાવાયરસમાં જોવા મળતું જનીન છે. તે સૌપ્રથમ SARS-CoV-2 જિનોમમાં ઓળખવામાં આવ્યું હતું અને અજ્ઞાત કાર્યના 41 એમિનો એસિડ બિન-માળખાકીય પ્રોટીનને એન્કોડ કરે છે. તે SARS-CoV જિનોમમાં પણ હાજર છે, પરંતુ SARS-CoV-2 હોમોલોગની ઓળખ ન થાય ત્યાં સુધી તેને ઓળખવામાં આવ્યું ન હતું. નામકરણ SARS-CoV-2 ના સહાયક પ્રોટીન માટે ઉપયોગમાં લેવાતા નામકરણની આસપાસ વૈજ્ઞાનિક સાહિત્યમાં નોંધપાત્ર મૂંઝવણ છે, ખાસ કરીને ORF3a સાથે કેટલાક ઓવરલેપિંગ જનીનો. ORF3c જનીનના અનુમાનિત પ્રોટીન ઉત્પાદનને ઓછામાં ઓછું એક વખત "3b પ્રોટીન" તરીકે ઓળખવામાં આવે છે, પરંતુ તેને બિન-સમરૂપ જનીન ORF3b સાથે ભેળસેળ ન કરવી જોઈએ. તેને ORF3h અને ORF3a.iORF1 નામો હેઠળ પણ વર્ણવવામાં આવ્યું છે. SARS-CoV-2 માટે ભલામણ કરેલ નામકરણ આ જનીન માટે ORF3c શબ્દનો ઉપયોગ કરે છે. તુલનાત્મક જીનોમિક્સ ORF3c એ એક ઓવરલેપિંગ જનીન છે જેની ખુલ્લી વાંચન ફ્રેમ SARS-CoV-2 જિનોમમાં ORF3a અને ORF3d બંનેને ઓવરલેપ કરે છે. આ સંભવિત રીતે સમાન અનુક્રમ ક્ષેત્ર એન્કોડિંગ કાર્યાત્મક પ્રોટીનની ત્રણેય સંભવિત વાંચન ફ્રેમોનું એક દુર્લભ ઉદાહરણ રજૂ કરે છે. સરબેકોવાયરસ સિક્વન્સના બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ વિશ્લેષણ સૂચવે છે કે ORF3c નો ક્રમ અને લંબાઈ સારી રીતે સંરક્ષિત છે, જે સૂચવે છે કે તે કાર્યાત્મક પ્રોટીનને એન્કોડ કરે તેવી શક્યતા છે. તે શુદ્ધિકરણ પસંદગીને આધિન હોવાનું જણાય છે. ગુણધર્મો રાઇબોસોમ પ્રોફાઇલિંગ પ્રયોગો પુષ્ટિ કરે છે કે ORF3c જનીન પ્રોટીન ઉત્પાદનને વ્યક્ત કરે છે. પ્રમાણમાં ટૂંકા 41-અવશેષ પ્રોટીનમાં ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન ડોમેન હોવાની આગાહી કરવામાં આવી છે અને તેમાં વાઇરોપોરિનના સૂચક લક્ષણો છે. સંદર્ભો કોરોનાવાયરસ પ્રોટીન વાયરલ બિન-માળખાકીય પ્રોટીન