C12orf50
રંગસૂત્ર 12 ઓપન રીડિંગ ફ્રેમ 50 (C12orf50) એ પ્રોટીન-એન્કોડિંગ જનીન છે જે મનુષ્યમાં C12orf50 પ્રોટીન માટે એન્કોડ કરે છે. આ જનીન માટે જોડાણ ઓળખ NM _ 152589 છે. C12orf50 નું સ્થાન 12q21.32 છે. તે રિવર્સ સ્ટ્રાન્ડ પર 88429231 થી 88373811 (NCBI 37, ઓગસ્ટ 2010) સુધી 55.42 kb ને આવરી લે છે. C12orf50ના કેટલાક પડોશી જનીનો RPS4XP15, LOC107984542 અને C12orf29 છે. RPS4XP15 અપસ્ટ્રીમ C12orf50 છે અને તે જ સ્ટ્રાન્ડ પર છે. LOC107984542 અને C12orf29 બંને ડાઉનસ્ટ્રીમ છે. LOC107984542 વિરુદ્ધ સ્ટ્રાન્ડ પર છે જ્યારે C12orf29 સમાન સ્ટ્રાન્ડ પર છે. C12orf50માં છ આઇસોફોર્મ્સ છે. આ પાનું આઇસોફોર્મ X1 પર ધ્યાન કેન્દ્રિત કરી રહ્યું છે. C12orf50 આઇસોફોર્મ X1 1711 ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ લાંબુ છે અને તેની લંબાઈ 414 એએ છે. કાર્ય ઑન્ટોલોજી C12orf50 ના કાર્ય તરફ નિર્દેશ કરે છે તે mRNA અને પ્રોટીન બંધનને સક્ષમ કરવાનું છે. તે ન્યુક્લિયસમાંથી પોલી (એ) + એમઆરએનએ નિકાસમાં પણ સામેલ છે. આઇસોફોર્મ્સ C12orf50 જનીનમાં 6 આઇસોફોર્મ્સ છે. જનીન અભિવ્યક્તિ જીનોમ દ્વારા ચોક્કસ અભિવ્યક્તિ સાથે માનવ પેશીઓના વિશ્લેષણમાં, પેશી-વિશિષ્ટતા પ્રોટીન-કોડિંગ જનીનો નક્કી કરવા માટે 27 વિવિધ પેશીઓનું પ્રતિનિધિત્વ કરતી 95 માનવ વ્યક્તિઓના પેશીઓના નમૂનાઓ પર આરએનએ-સેક કરવામાં આવ્યું હતું જેમાં જાણવા મળ્યું હતું કે વૃષણ સિવાય મોટાભાગના માનવ પેશીઓમાં સી12ઓઆરએફ50ની અભિવ્યક્તિ ખૂબ ઓછી છે. C12orf50 ની અભિવ્યક્તિ વૃષણ તરફ મર્યાદિત હતી. પ્રોટીન લક્ષણવિહીન પ્રોટીન રંગસૂત્ર 12 ઓપન રીડિંગ ફ્રેમ 50 એ મનુષ્યમાં એક પ્રોટીન છે, જે C12orf50 જનીન દ્વારા એન્કોડ થયેલ છે. પ્રોટીન જોડાણ ID એ Q8NA57 છે. પ્રોટીનની લંબાઈ 414aa હોય છે. પ્રોટીનનું અનુમાનિત દળ 47.2 kDa છે. પ્રોટીનમાં CCCH-પ્રકારનું Zn ફિંગર ડોમેન સામેલ છે. પ્રોટીનમાં C-X8-C-X5-C-X3-H મોટિફ સાથે CCCH-પ્રકારનું Zn ફિંગર ડોમેન છે. ડોમેન પ્રોટીનની શરૂઆતમાં શરૂ થાય છે અને 44મા એમિનો એસિડમાં જાય છે. પ્રોટીનમાં ત્રણ અવ્યવસ્થિત પ્રદેશો પણ છે, 136મા એમિનો એસિડથી લઈને 33 એએની લંબાઈ સાથે 168મા, 37 એએની લંબાઈ સાથે 297માથી 333મા અને 69 એએની લંબાઈ સાથે 346માથી 414મા. અનુમાનિત પરમાણુ વજન 47.3 કેડીએ છે અને અનુમાનિત આઇસોઇલેક્ટ્રિક બિંદુ 8.79 છે. માળખું C12orf50 માટે અનુમાનિત તૃતીય માળખામાં ઝિંક ફિંગર ડોમેનમાં પ્રોટીનની શરૂઆતમાં બે બીટા-શીટ્સ અને 106-124 aa માંથી હેલિક્સ છે. આ સમગ્ર સસ્તન ઓર્થોલોગ્સમાં સંરક્ષિત છે. ત્યાં મોટી સંખ્યામાં કોઇલવાળા પ્રદેશો પણ છે. પ્રમોટર, 3 'યુ. ટી. આર. ક્ષેત્ર અને 5' યુ. ટી. આર. ખૂબ જ સારી રીતે સંરક્ષિત છે. એમિનો એસિડ 87 થી 111 સુધી હેલિક્સ પહેલાં અને શરૂઆતમાં એક નકારાત્મક ક્લસ્ટર (એસિડિક ડોમેન) હોય છે. સ્થાનિકીકરણ ન્યુક્લિયસમાં હોવાની 47.8% સંભાવના અને કોષરસમાં હોવાની 30.4% સંભાવના છે. સિગ્મા-એલ્ડ્રિચ દ્વારા ઇમ્યુનોહિસ્ટોકેમિસ્ટ્રી અને ઇમ્યુનોફ્લોરેસેન્સ દ્વારા આની પુષ્ટિ કરવામાં આવી હતી જે ન્યુક્લિયસ અને કોષરસ બંનેમાં હકારાત્મકતા દર્શાવે છે. ત્યાં પરમાણુ સ્થાન સંકેત અને એસિડિક ડોમેન છે. ઓર્થોલોગ્સ એ પણ પુષ્ટિ કરે છે કે C12orf50 ન્યુક્લિયસ અને કોષરસમાં સ્થાનિક છે. પ્રોટીનની ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ બે પ્રોટીન (જી. એ. પી. ડી. એચ. એસ. અને જી. ઓ. એલ. જી. એ. 2) છે જે C12orf50 સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરે છે. ગ્લિસરાલ્ડેહાઇડ-3-ફોસ્ફેટ ડિહાઇડ્રોજનેઝ, શુક્રાણુજન્ય (જી. એ. પી. ડી. એચ. એસ.) ઉત્સેચક વિવિધ ઊર્જા ઉત્પાદક માર્ગો વચ્ચેના પરિવર્તનને નિયંત્રિત કરવામાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવી શકે છે, અને તે શુક્રાણુ ગતિશીલતા અને પુરુષ પ્રજનનક્ષમતા માટે જરૂરી છે. અનુવાદ પછીના ફેરફારો C12orf50 વિવિધ ફોસ્ફોરાયલેશન, C-મેનોસિલેશન અને O-ગ્લાયકોસિલેશનમાંથી પસાર થવાની આગાહી કરવામાં આવી છે. ફોસ્ફોરાયલેશન સાઇટ્સ એમિનો એસિડ 262,349 અને 370 પર છે. ઓ-ગ્લાયકોસિલેશન સાઇટ્સ એમિનો એસિડ 139,238 અને 374 છે. સી-મેનોસિલેશન સાઇટ્સ એમિનો એસિડ 13,102,292 અને 388 છે. ઇવોલ્યુશન C12orf50 ઉત્ક્રાંતિ દર ધરાવે છે જે ફાઇબ્રિનોજેન આલ્ફાની નજીક છે, જે તેને પ્રમાણમાં ઝડપી બનાવે છે. C12orf50 માટે ઓર્થોલોગ સસ્તન પ્રાણીઓ, સરિસૃપ, પક્ષીઓ અને ઉભયજીવી સીસિલિયન્સમાં જોવા મળે છે. દેડકા, માછલી, અપૃષ્ઠવંશી અથવા ફૂગ માટે કોઈ ઓર્થોલોગ મળી આવ્યા ન હતા. સસ્તન ઓર્થોલોગ્સ પ્લાટિપસ સિવાય મનુષ્યો સાથે સૌથી વધુ સમાનતા ધરાવે છે. સસ્તન પ્રાણીઓથી મનુષ્યોના વિચલનની શ્રેણી 6.4-180 મિલિયન વર્ષ હતી. સરીસૃપ ઓર્થોલોગ્સ આગામી સમાન હતા અને લગભગ 318 મિલિયન વર્ષો પહેલા અલગ થયા હતા. પછી પક્ષીઓ સરીસૃપોની જેમ જ મનુષ્યોથી અલગ થઈ ગયા. ઉભયજીવી સિસિલિયન્સ સૌથી ઓછા સમાન હતા અને તેઓ લગભગ 351.7 મિલિયન વર્ષો પહેલા અલગ થઈ ગયા હતા. હોમોલોજી ઓર્થોલોગ્સ C12orf50 સસ્તન પ્રાણીઓ, પક્ષીઓ, સરિસૃપ અને સિસિલિયન ઉભયજીવીઓમાં ઓર્થોલોગ્સ ધરાવે છે. ઉભયજીવી દેડકા, અપૃષ્ઠવંશી, છોડ, ફૂગ અથવા યીસ્ટમાં કોઈ ઓર્થોલોગ જોવા મળ્યા ન હતા. નીચેનું કોષ્ટક કેટલાક ઓર્થોલોગ્સ દર્શાવે છે જે બ્લાસ્ટ પર મળી શકે છે. પેરાલોગ C12orf50માં બે પેરાલોગ છેઃ ZC3H11A અને ZC3H11B. ઝિંક એ આંગળીનું ક્ષેત્ર બંને પેરાલોગમાં ગણવામાં આવે છે. સંદર્ભો