ORF9b
ORF9b (અગાઉ કેટલીકવાર ORF13 તરીકે ઓળખાતું) એક જનીન છે જે SARS-CoV અને SARS-CoV-2 સહિત સબજેનસ સારબેકોવાયરસના કોરોનાવાયરસમાં વાયરલ સહાયક પ્રોટીનને એન્કોડ કરે છે. તે એક ઓવરલેપિંગ જનીન છે જેની ખુલ્લી વાંચન ફ્રેમ સંપૂર્ણપણે એન જનીનમાં સમાયેલી હોય છે, જે કોરોનાવાયરસ ન્યુક્લિયોકેપ્સિડ પ્રોટીનને એન્કોડ કરે છે. એન્કોડેડ પ્રોટીન SARS-CoVમાં 97 એમિનો એસિડ અવશેષો અને SARS-CoV-2માં 98 છે, જે બંને કિસ્સાઓમાં પ્રોટીન ડાયમર બનાવે છે. નામકરણ વૈજ્ઞાનિક સાહિત્યમાં આ જનીન માટે ઉપયોગમાં લેવાતા નામકરણમાં અસંગતતા જોવા મળી છે. SARS-CoV પરના કેટલાક કાર્યોમાં, તેને ORF13 તરીકે ઓળખવામાં આવે છે. તેને કેટલીકવાર ORF9a તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે, જેના પરિણામે SARS-CoVમાં 76 કોડોન્સના ડાઉનસ્ટ્રીમ ORFમાં પરિણમે છે, જે N જનીન સાથે પણ ઓવરલેપ થાય છે, જેને ORF9b નામ આપવામાં આવ્યું છે. ભલામણ કરાયેલ નામકરણ લાંબા ORF ને 9b તરીકે અને ડાઉનસ્ટ્રીમ, ટૂંકા ORF ને ORF9c તરીકે સંદર્ભિત કરે છે. માળખું ORF9b પ્રોટીન એ SARS-CoV માં 97 એમિનો એસિડ અવશેષો અને SARS-CoV-2 માં 98 છે. તે કેન્દ્રમાં હાઇડ્રોફોબિક પોલાણ સાથે બીટા શીટ-સમૃદ્ધ હોમોડિમર બનાવે છે જે લિપિડ્સને જોડે છે. લિપિડ-બંધનકર્તા પોલાણ પ્રોટીનને પટલમાં લંગર કરવા માટે એક અસામાન્ય પદ્ધતિ તરીકે કામ કરી શકે છે. SARS-CoV-2 ORF9b પ્રોટીનનો એક ટુકડો માળખાકીય રીતે ટોમ 70 સાથે પ્રોટીન સંકુલમાં દર્શાવવામાં આવ્યો છે જેમાં ORF9b અલગ રીતે જોવા મળતા બીટા-શીટ માળખાને બદલે આલ્ફા હેલિક્સ બનાવે છે. આ ફોલ્ડ સ્વિચિંગ વર્તણૂક બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સની આગાહીઓ સાથે પણ સુસંગત છે અને SARS-CoV હોમોલોગ માટે પણ થઈ શકે છે. અભિવ્યક્તિ અને સ્થાનિકીકરણ ORF9b એ એન જનીન એન્કોડિંગ કોરોનાવાયરસ ન્યુક્લિયોકેપ્સિડ પ્રોટીનની ખુલ્લી વાંચન ફ્રેમમાં સંપૂર્ણપણે સમાવિષ્ટ બે ઓવરલેપિંગ જનીનોમાંથી એક છે, બીજું ORF9c છે. ORF9b તેના બિસ્ટ્રોનીક સબજેનોમિક RNAમાંથી રાઇબોઝોમ લીકી સ્કેનીંગ દ્વારા વ્યક્ત થાય છે. તેના પાડોશી ORF9c થી વિપરીત, તેની લંબાઈ સાર્બેકોવાયરસમાં સારી રીતે સંરક્ષિત છે અને તે એક કાર્યાત્મક પ્રોટીન-કોડિંગ જનીન છે તેના મજબૂત પુરાવા છે. SARS-CoV માં, પ્રોટીન એન્ડોપ્લાઝ્મિક રેટિક્યુલમ (ER) અને ઇન્ટ્રાસેલ્યુલર વેસિકલ્સમાં સ્થાનાંતરિત થાય છે. તેમાં પરમાણુ સ્થાનિકીકરણનો ક્રમ નથી પરંતુ નિષ્ક્રિય પ્રસરણ દ્વારા કોષના કેન્દ્રમાં પ્રવેશ કરી શકે છે; જો કે તે કેન્દ્રમાંથી બહાર નીકળવા માટે પરમાણુ નિકાસ ક્રમ ધરાવે છે. SARS-CoV-2 માં, તે કથિત રીતે મિટોકોન્ડ્રીયલ પટલ સાથે સંકળાયેલું છે. કાર્ય ORF9b પ્રોટીનનું કાર્ય સારી રીતે દર્શાવવામાં આવતું નથી. તે વાયરલ પ્રતિકૃતિ માટે જરૂરી નથી. વાયરલ પ્રોટીન ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ ORF9b પ્રોટીન ORF6, બિન-માળખાકીય પ્રોટીન 5, બિન-માળખાકીય પ્રોટીન 14 અને કોરોનાવાયરસ એન્વેલપ પ્રોટીન સહિત સંખ્યાબંધ અન્ય વાયરલ પ્રોટીન સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરે છે. તે પરિપક્વ SARS-CoV વાઈરિઅન્સમાં મળી આવ્યું છે અને આમ તે એક નાનું વાયરલ માળખાકીય પ્રોટીન હોઈ શકે છે. યજમાન કોષની અસરો ORF9b પ્રોટીન યજમાનની રોગપ્રતિકારક શક્તિના પ્રતિભાવમાં ફેરફાર કરવામાં સામેલ હોઈ શકે છે. સાર્સ-કોવ-2 પ્રોટીન બાહ્ય પટલ (ટી. ઓ. એમ.) સંકુલના મિટોકોન્ડ્રીયલ ટ્રાન્સલોકેસના એક ઘટક ટોમ 70 સાથેની તેની ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ દ્વારા ઇન્ટરફેરોન પ્રતિક્રિયાને દબાવવાની જાણ કરવામાં આવી છે. સંદર્ભો કોરોનાવાયરસ પ્રોટીન