Adenylylation
એડેનીલાઈલેશન, જે વધુ સામાન્ય રીતે એએમપીલેશન તરીકે ઓળખાય છે, તે એક પ્રક્રિયા છે જેમાં એડેનોસિન મોનોફોસ્ફેટ (એએમપી) પરમાણુ પ્રોટીનની એમિનો એસિડ બાજુની સાંકળ સાથે સહસંયોજક રીતે જોડાયેલ હોય છે. પ્રોટીનની હાઇડ્રોક્સિલ બાજુની સાંકળમાં એએમપીનો આ સહસંયોજક ઉમેરો અનુવાદ પછીનો ફેરફાર છે. એડેનીલાઈલેશનમાં એડેનીલાઈલેશનમાંથી પસાર થતા પરમાણુના હાઇડ્રોક્સિલ જૂથ અને એડેનોસિન મોનોફોસ્ફેટ ન્યુક્લિયોટાઇડના ફોસ્ફેટ જૂથ વચ્ચે ફોસ્ફોડીસ્ટર બંધનો સમાવેશ થાય છે. એડિનિલિક એસિડ). આ પ્રક્રિયાને ઉત્પ્રેરિત કરવામાં સક્ષમ ઉત્સેચકોને એએમપીલેટર કહેવામાં આવે છે. પ્રોટીનમાં લક્ષિત થવા માટે જાણીતા એમિનો એસિડ ટાયરોસિન અને થ્રેઓનિન છે, અને કેટલીકવાર સેરીન છે. જ્યારે પ્રોટીન પરના ચાર્જમાં ફેરફાર થાય છે, ત્યારે તે પ્રોટીનની લાક્ષણિકતાઓને અસર કરે છે, સામાન્ય રીતે એમિનો એસિડની ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ દ્વારા તેના આકારમાં ફેરફાર કરીને જે પ્રોટીન બનાવે છે. એએમપિલેશન પ્રોટીન પર વિવિધ અસરો કરી શકે છે. આ પ્રોટીનના ગુણધર્મો છે જેમ કે, સ્થિરતા, ઉત્સેચકીય પ્રવૃત્તિ, સહ-પરિબળ બંધન અને પ્રોટીનની અન્ય ઘણી કાર્યાત્મક ક્ષમતાઓ. એડેનિલિલેશનનું બીજું કાર્ય એમિનો એસિડ સક્રિયકરણ છે, જે ટી. આર. એન. એ. એમિનોસિલ સિન્થેટેઝ દ્વારા ઉત્પ્રેરિત થાય છે. એએમપિલેશન પ્રાપ્ત કરવા માટે સૌથી સામાન્ય રીતે ઓળખાયેલ પ્રોટીન જીટીપેસીસ અને ગ્લુટામાઇન સિન્થેટેઝ છે. એએમપિલેશન માટે જવાબદાર એડેનિલિલેટર ઉત્સેચકો, જેને એએમપિલેટર્સ અથવા એડેનિલિલટ્રાન્સફેરેઝ કહેવાય છે, તે બે અલગ અલગ પરિવારોમાં આવે છે, જે તમામ તેમના માળખાકીય ગુણધર્મો અને ઉપયોગમાં લેવાતી પદ્ધતિ પર આધાર રાખે છે. એએમપીલેટર બે ઉત્પ્રેરક સમાનધર્મી અર્ધભાગ દ્વારા બનાવવામાં આવે છે. એક અડધો ભાગ એડેનિલિલેશન પ્રતિક્રિયાને ઉત્પ્રેરિત કરવા માટે જવાબદાર છે, જ્યારે બીજો અડધો ભાગ ફોસ્ફોરોલિટિક ડેડેનિલિલેશન પ્રતિક્રિયાને ઉત્પ્રેરિત કરે છે. આ બે પરિવારો ડીએનએ-બીટા-પોલિમરેઝ જેવા અને ફિક પરિવાર છે. ડીએનએ-બીટા-પોલિમરેઝ જેવું, ન્યુક્લિયોટિડિલટ્રાન્સફેરેઝનું એક કુટુંબ છે. તે વધુ ખાસ રીતે જી. એલ. એન. ઇ. પરિવાર તરીકે ઓળખાય છે. એક ચોક્કસ રચના છે જેનો ઉપયોગ આ ચોક્કસ કુટુંબને સ્પષ્ટ કરવા માટે થાય છે. મોટિફમાં ત્રણ સ્ટ્રેન્ડેડ β-શીટનો સમાવેશ થાય છે જે મેગ્નેશિયમ આયન સંકલન અને ફોસ્ફેટ બંધનનો ભાગ છે. આ પરિવારમાં થતી પ્રવૃત્તિ માટે એસ્પાર્ટેટ આવશ્યક છે. ફિક ડોમેન ફિડો (ફિક/ડોક) સુપરફેમિલી સાથે સંબંધિત છે, જે ચક્રીય એએમપી ડોમેન દ્વારા પ્રેરિત ફિલામેન્ટેશન છે, જે એએમપીલેશન કરવા માટે જાણીતું છે. આ શબ્દ ત્યારે બનાવવામાં આવ્યો હતો જ્યારે વિબ્રિયો પેરાહેમોલિટિકસમાંથી વી. ઓ. પી. એસ. ની શોધ સેરીન પર એએમપી સાથે આર. એચ. ઓ. જી. ટી. પી. ને સંશોધિત કરવા માટે કરવામાં આવી હતી. પ્રોટીનનું આ કુટુંબ પૃથ્વી પરના જીવનના તમામ ક્ષેત્રોમાં જોવા મળે છે. તે ATP-બંધનકર્તા-સાઇટ આલ્ફા હેલિક્સ મોટિફની પદ્ધતિ દ્વારા મધ્યસ્થી કરવામાં આવે છે. ચેપી બેક્ટેરિયા આ ડોમેનનો ઉપયોગ ફેગોસાયટોસિસને વિક્ષેપિત કરવા અને કોષના મૃત્યુનું કારણ બને છે. ફિક ડોમેન્સ એ પ્રોકેરીયોટ્સ અને યુકેરીયોટ્સમાં ઉત્ક્રાંતિથી સંરક્ષિત ડોમેન્સ છે જે ફિડો ડોમેન સુપરફેમિલી સાથે સંબંધિત છે. એએમપિલેટર્સ તેમની એટીપી હાઇડ્રોલિસિસ પ્રવૃત્તિ અને પ્રોટીન સબસ્ટ્રેટની હાઇડ્રોક્સિલ બાજુની સાંકળમાં મેટાબોલાઇટના ઉલટાવી શકાય તેવા સ્થાનાંતરણને કારણે કાઇનેઝ સાથે તુલનાત્મક હોવાનું દર્શાવવામાં આવ્યું છે. જો કે, એએમપિલેશન α-ફોસ્ફેટ જૂથ પર ન્યુક્લિયોફિલિક હુમલાને ઉત્પ્રેરિત કરે છે, જ્યારે ફોસ્ફોરાયલેશન પ્રતિક્રિયામાં કિનેઝ γ-ફોસ્ફેટને લક્ષ્ય બનાવે છે. એએમપીલેશનનો ન્યુક્લિયોફિલિક હુમલો પાયરોફોસ્ફેટ છોડવા તરફ દોરી જાય છે અને એએમપી-સંશોધિત પ્રોટીન એએમપીલેશન પ્રતિક્રિયાના ઉત્પાદનો છે. ડી-એડેનીલાઈલેટર્સ ડી-એમ્પિલેશન એ વિપરીત પ્રતિક્રિયા છે જેમાં એએમપી પરમાણુ સાંકળ પ્રોટીનની એમિનો એસિડ બાજુથી અલગ પડે છે. આ પ્રતિક્રિયા માટે ત્રણ જાણીતી પદ્ધતિઓ છે. બેક્ટેરિયલ જી. એસ.-એટીઝ (જી. એલ. એન. ઈ.) અલગ એન-ટર્મિનલ એએમપિલેશન અને સી-ટર્મિનલ ડી-એએમપિલેશન ડોમેન્સ સાથે દ્વિપક્ષી પ્રોટીનને એન્કોડ કરે છે, જેની પ્રવૃત્તિ પી. આઈ. આઈ. અને સંબંધિત પોસ્ટટ્રાન્સલેશનલ ફેરફારો દ્વારા નિયંત્રિત થાય છે. તેના સબસ્ટ્રેટ એએમપિલેટેડ ગ્લુટામાઇન સિન્થેટેઝનું ડી-એમ્પિલેશન જીએસ અને ઓર્થોફોસ્ફેટના એડેનાઇલ-ટાયરોસિન વચ્ચે ફોસ્ફોરોલિટિક પ્રતિક્રિયા દ્વારા આગળ વધે છે, જે એડીપી અને બિનપરિવર્તિત ગ્લુટામાઇન સિન્થેટેઝની રચના તરફ દોરી જાય છે. સી. આઈ. ડી. ડી., રોગકારક બેક્ટેરિયા લીજીઓનેલા ન્યુમોફિલા દ્વારા યજમાન કોષમાં રજૂ કરાયેલ પ્રોટીન, ડી-એએમપિલેટ્સ રેબ 1 એ યજમાન પ્રોટીન છે જે એક અલગ લીજીઓનેલા ન્યુમોફિલા એન્ઝાઇમ, એએમપિલેઝ સી. આઈ. ડી. એમ. દ્વારા એએમપિલેટેડ છે. જ્યારે યજમાનમાં આ બે વિરોધાભાસી અસરોને રજૂ કરવાના રોગકારકનો ફાયદો અસ્પષ્ટ રહે છે, ત્યારે સિડડી દ્વારા હાથ ધરવામાં આવતી બાયોકેમિકલ પ્રતિક્રિયામાં યજમાનના રેબ 1 ના ટાયરોસિન 77 માંથી એએમપીના હાઇડ્રોલાઇટિક દૂરને ઉત્પ્રેરિત કરવા માટે ફોસ્ફેટેઝ જેવા ક્ષેત્રનો ઉપયોગ સામેલ છે. પ્રાણીઓના કોષોમાં બી. આઈ. પી./જી. આર. પી. 78ના થ્રેઓનિન 518માંથી એ. એમ. પી. ને દૂર કરવું એ જ ઉત્સેચક, એફ. આઈ. સી. ડી. દ્વારા ઉત્પ્રેરિત થાય છે, જે એ. એમ. પી. બી. આઈ. પી. ને ઉત્તેજિત કરે છે. બેક્ટેરિયલ જી. એસ.-એટીઝથી વિપરીત, એફ. આઈ. સી. ડી. સમાન ઉત્પ્રેરક ક્ષેત્ર સાથે બંને પ્રતિક્રિયાઓ કરે છે. પ્રોકેરીયોટિક બેક્ટેરિયલ હોમિયોસ્ટેસિસ એએમપિલેશન બેક્ટેરિયલ હોમિયોસ્ટેસિસમાં સામેલ છે. સૌથી પ્રસિદ્ધ ઉદાહરણ એએમપીલેટર જીએસ-એટીઝ (જીએલએનઈ) છે, જે એએમપીલેશન અને ડીએએમપીલેશન ભાગોમાં રજૂ કરવામાં આવેલા ગ્લુટામાઇન સિન્થેટેઝના એએમપીલેશન દ્વારા નાઇટ્રોજન ચયાપચયના જટિલ નિયમનમાં ફાળો આપે છે. બેક્ટેરિયલ હોમિયોસ્ટેસિસમાં ભૂમિકા ભજવતા એએમપિલેટરનું બીજું ઉદાહરણ વર્ગ I ફિક એએમપિલેટર (એફ. આઈ. સી. ટી.) છે, જે ટોપોઇસોમરેઝ IV ખાતે પેરઈ સબયૂનિટના એટીપી બંધન માટે સંરક્ષિત ટાયરોસિન અવશેષ, ડીએનએ ગાયરેઝના જીઆરબી સબયૂનિટમાં ફેરફાર કરે છે. એએમપિલેશન દ્વારા આ ડીએનએ ગાયરેસ નિષ્ક્રિયતા એસ. ઓ. એસ. પ્રતિક્રિયાના સક્રિયકરણ તરફ દોરી જાય છે, જે ડીએનએ નુકસાન માટે સેલ્યુલર પ્રતિસાદ છે. એફ. આઈ. સી. ટી. એમ્પિલેશનની પ્રવૃત્તિ ઉલટાવી શકાય તેવી છે અને તે માત્ર વૃદ્ધિ અટકાવ તરફ દોરી જાય છે, પરંતુ કોષના મૃત્યુ તરફ નહીં. તેથી, એફ. આઈ. સી. ટી. એમ્પિલેશન કોષના તણાવને નિયંત્રિત કરવામાં ભૂમિકા ભજવે છે, જે વોલ્બાચિયા બેક્ટેરિયામાં દર્શાવવામાં આવ્યું છે કે ડોક્સીસાઇક્લિનના પ્રતિભાવમાં એફ. આઈ. સી. ટી. નું સ્તર વધે છે. એ. ટી. પી. બંધન માટે સંરક્ષિત ટાયરોસિન પર એ. એમ. પાઈલેટ ગાયરબીમાં ફેરફાર કરવા માટે એન. મેનિન્જીટીડિસનું વર્ગ III ફિક એએમપીલેટર એન. એમ. એફ. આઈ. સી. પણ જોવા મળે છે. આ દર્શાવે છે કે ફિક ડોમેન્સ ખૂબ જ સંરક્ષિત છે જે બેક્ટેરિયામાં સેલ્યુલર તણાવને નિયંત્રિત કરવામાં એએમપિલેશનની મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા સૂચવે છે. એન. એમ. એફ. આઈ. સી. ના નિયમનમાં એન. એમ. એફ. આઈ. સી. પ્રવૃત્તિના સક્રિયકરણ માટે એકાગ્રતા-આધારિત મોનોમેરાઇઝેશન અને ઓટોએમ્પાયલેશનનો સમાવેશ થાય છે. બેક્ટેરિયલ પેથોજેનિસિટી બેક્ટેરિયા પ્રોટીન, જેને ઇફેક્ટર્સ તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે, તે એએમપીલેશનનો ઉપયોગ કરે છે તેવું દર્શાવવામાં આવ્યું છે. વી. ઓ. પી. એસ., આઈ. બી. પી. એ. અને ડી. આર. આર. એ. જેવી અસરો, એ. એમ. પી. એ. હોસ્ટ જી. ટી. પી. એસ. ને દર્શાવે છે અને એક્ટિન સાયટોસ્કેલેટન ફેરફારો કરે છે. જી. ટી. પી. એસ. એ એએમપિલેટરના સામાન્ય લક્ષ્યાંકો છે. રો, રબ અને આર્ફ જીટીપેઝ પરિવારો એક્ટિન સાયટોસ્કેલેટન ગતિશીલતા અને વેસિક્યુલર હેરફેરમાં સામેલ છે. તેઓ યજમાન કોષમાં ફેગોસાયટોસિસ જેવી સેલ્યુલર નિયંત્રણ પદ્ધતિઓમાં પણ ભૂમિકા ભજવે છે. રોગકારક યજમાન કોષ ફેગોસાયટોસિસને પ્રેરિત કરીને અથવા અટકાવીને તેના આંતરિકકરણને વધારે છે અથવા અટકાવે છે. વિબ્રિયો પેરાહેમોલિટિકસ એ ગ્રામ-નેગેટિવ બેક્ટેરિયમ છે જે મનુષ્યમાં કાચા અથવા ઓછા રાંધેલા સીફૂડના સેવનના પરિણામે ફૂડ પોઈઝનીંગનું કારણ બને છે. VopS, વિબ્રિયો પેરાહેમોલિટિકસમાં જોવા મળતો પ્રકાર III પ્રભાવક, એક Fic ડોમેન ધરાવે છે જેમાં સંરક્ષિત HPFx (D/E) GN (G/K) R મોટિફ હોય છે જેમાં AMPilation માટે જરૂરી હિસ્ટિડીન અવશેષો હોય છે. વી. ઓ. પી. એસ. રો જી. ટી. પીસેસના સ્વીચ 1 પ્રદેશમાં થ્રેઓનિન અવશેષોમાં ફેરફાર કરીને એક્ટિન એસેમ્બલીને અવરોધે છે. એ. ટી. પી. નો ઉપયોગ કરીને થ્રીઓનિન અવશેષોમાં એએમપી ભાગનું સ્થાનાંતરણ સ્ટેરિક અવરોધમાં પરિણમે છે, અને આમ રો જીટીપેસિસને ડાઉનસ્ટ્રીમ પ્રભાવકો સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરતા અટકાવે છે. વી. ઓ. પી. એસ. આર. એચ. ઓ. એ. અને કોષ વિભાજન ચક્ર 42 (સી. ડી. સી. 42) ને પણ એડિનિલેટ કરે છે, જે એક્ટિન ફિલામેન્ટ નેટવર્કના વિભાજન તરફ દોરી જાય છે. પરિણામે, યજમાન કોષનું એક્ટિન સાયટોસ્કેલેટન નિયંત્રણ નિષ્ક્રિય થઈ જાય છે, જે કોષ ગોળાકાર તરફ દોરી જાય છે. આઇ. બી. પી. એ. એચ. સોમ્નીમાંથી યુકેરીયોટિક કોષોમાં સ્ત્રાવ થાય છે, જે પશુઓમાં ગ્રામ-નેગેટિવ બેક્ટેરિયમ છે જે શ્વસન ઉપકલાના ચેપનું કારણ બને છે. આ પ્રભાવક સી-ટર્મિનલ ક્ષેત્ર પર બે ફિક ડોમેન્સ ધરાવે છે. રો ફેમિલી જી. ટી. પીઝેસના આઇ. બી. પી. એ. ફિક ડોમેનનું એમ્પિલેશન તેની સાયટોટોક્સિસિટી માટે જવાબદાર છે. બંને ફિક ડોમેન્સ યજમાન કોષોના સાયટોસ્કેલેટન પર વી. ઓ. પી. એસ. જેવી જ અસરો ધરાવે છે. સ્વીચ 1 પ્રદેશના ટાયરોસિન અવશેષો પર એએમપિલેશન પી. એ. કે. જેવા ડાઉનસ્ટ્રીમ સબસ્ટ્રેટ્સ સાથે જી. ટી. પી. ની ક્રિયાપ્રતિક્રિયાને અવરોધે છે. ડી. આર. એ. એ લીજીઓનેલા ન્યુમોફિલામાંથી ડોટ/આઇ. સી. એમ. પ્રકાર IV ટ્રાન્સલોકેશન સિસ્ટમ સબસ્ટ્રેટ ડી. આર. એ. છે. તે એલ. ન્યુમોફિલા દ્વારા યજમાન કોષોના જીટીપેસીસમાં ફેરફાર કરવા માટે સ્ત્રાવ થતો પ્રભાવક છે. આ ફેરફાર યજમાન કોષોમાં બેક્ટેરિયાના અસ્તિત્વને વધારે છે. ડી. આર. આર. એ. રબ1બી વિશિષ્ટ ગુઆનાઇન ન્યુક્લિયોટાઇડ એક્સચેન્જ ફેક્ટર (જીઇએફ) ડોમેન, સી-ટર્મિનલ લિપિડ બંધનકર્તા ડોમેન અને અસ્પષ્ટ સાયટોટોક્સિક ગુણધર્મો સાથે એન-ટર્મિનલ ડોમેનથી બનેલું છે. સંશોધન કાર્યો દર્શાવે છે કે એન-ટર્મિનલ અને પૂર્ણ લંબાઈના ડી. આર. આર. એ. યજમાનના રબ1બી પ્રોટીન (રાસ સંબંધિત પ્રોટીન) તરફ એએમપિલેટરની પ્રવૃત્તિ દર્શાવે છે, જે રબ1બી જીઇએફ ડોમેનનું સબસ્ટ્રેટ પણ છે. રેબ1બી પ્રોટીન એ જીટીપેઝ રેબ છે જે ફોલ્લાઓના પરિવહન અને પટલના મિશ્રણને નિયંત્રિત કરે છે. બેક્ટેરિયા એએમપિલેટર દ્વારા એડિનિલેશન રબ1બીની જીટીપી-બાઉન્ડ સ્થિતિને લંબાવે છે. આમ, અસરકર્તા ડી. આર. આર. એ. ની ભૂમિકા ચેપ દરમિયાન તેમની પ્રતિકૃતિ માટે બેક્ટેરિયાના વેક્યુલ્સના ફાયદા સાથે જોડાયેલી છે. યુકેરીયોટિક છોડ અને યીસ્ટ્સમાં કોઈ જાણીતા અંતર્જનિત એએમપિલેટિંગ ઉત્સેચકો નથી, પરંતુ પ્રાણીઓના જીનોમ્સને ફિક-ડોમેન એએમપિલેઝ એન્કોડિંગ જનીનની એક નકલ સાથે સંપન્ન કરવામાં આવે છે, જે સંભવતઃ પ્રાણીઓના પ્રારંભિક પૂર્વજો દ્વારા પ્રોકેરીઓટમાંથી આડી જનીન સ્થાનાંતરણ દ્વારા હસ્તગત કરવામાં આવી હતી. સામાન્ય રીતે એફ. આઈ. સી. ડી. તરીકે ઓળખાતા માનવ પ્રોટીનને અગાઉ હન્ટિંગટિન સંકળાયેલ પ્રોટીન ઇ (હાઇપ; યીસ્ટના બે-હાઇબ્રિડ સ્ક્રીનમાંથી ઉદભવે છે, પરંતુ શંકાસ્પદ સુસંગતતા ધરાવે છે, કારણ કે હન્ટિંગટિન અને હાઇપ/એફ. આઈ. સી. ડી. વિવિધ સેલ્યુલર ખંડોમાં સ્થાનિક છે) તરીકે ઓળખવામાં આવ્યું હતું. ડ્રોસોફિલા મેલાનોગાસ્ટર (CG9523) અને સી. એલિગન્સ (Fic-1) માં CG9523 હોમોલોગ્સ પર પણ ધ્યાન આપવામાં આવ્યું છે. તમામ પ્રાણીઓમાં એફ. આઈ. સી. ડી. ની રચના સમાન હોય છે. તે એક પ્રકાર II ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન ડોમેન પ્રોટીન છે, જેમાં ટૂંકા સાયટોપ્લાઝમિક ડોમેન પછી મેમ્બ્રેન એન્કર હોય છે જે એન્ડોપ્લાઝમિક રેટિક્યુલમ (ઇઆર) માં પ્રોટીન ધરાવે છે અને લાંબા સી-ટર્મિનલ ભાગ જે ઇઆરમાં રહે છે અને ટેટ્રાટ્રિકોપેપ્ટાઇડ રિપીટ્સ (ટી. પી. આર.) ને આવરી લે છે અને ત્યારબાદ ઉત્પ્રેરક ફિક ડોમેન આવે છે. એન્ડોપ્લાઝ્મિક રેટિક્યુલમ એનિમલ સેલ એએમપીલેઝની શોધ, ત્યારબાદ તેના ઇઆર સ્થાનિકીકરણની શોધ અને બી. આઈ. પી. તેની પ્રવૃત્તિ માટે એક અગ્રણી સબસ્ટ્રેટ છે તે મહત્વપૂર્ણ સફળતાઓ હતી. બી. આઈ. પી. (જેને જી. આર. પી. 78 તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે) લાંબા સમયથી અનુવાદ પછીના નિષ્ક્રિય ફેરફારમાંથી પસાર થવા માટે જાણીતું હતું, પરંતુ તે પ્રકૃતિ પ્રપંચી રહે છે. વ્યાપક રીતે એ. ડી. પી.-રાયબોસિલેશન હોવાનું માનવામાં આવે છે, તે એફ. આઈ. સી. ડી.-મધ્યસ્થ એએમપિલેશન હોવાનું બહાર આવ્યું છે, કારણ કે કોષોમાં એફ. આઈ. સી. ડી. જનીનને નિષ્ક્રિય કરવાથી બી. આઈ. પી. ના તમામ માપી શકાય તેવા અનુવાદ પછીના ફેરફારોને નાબૂદ કરવામાં આવ્યા હતા. બી. આઈ. પી. એ ઇ. આર.-સ્થાનિક પ્રોટીન ચેપરોન છે, જેની પ્રવૃત્તિ અનફોલ્ડેડ પ્રોટીન રિસ્પોન્સ (યુ. પી. આર.) તરીકે ઓળખાતા જનીન-અભિવ્યક્તિ કાર્યક્રમ દ્વારા ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ સ્તરે કડક રીતે નિયંત્રિત થાય છે. યુ. પી. આર. એ એક હોમિયોસ્ટેટિક પ્રક્રિયા છે જે ઇ. આર. પ્રોટિઓસ્ટેસિસ જાળવવામાં મદદ કરવા માટે બી. આઈ. પી. (અને અન્ય ઘણા પ્રોટીન) ના ટ્રાન્સક્રિપ્શન દરને ઇ. આર. (કહેવાતા ઇ. આર. તણાવ) માં ખુલ્લા પ્રોટીનના ભાર સાથે જોડે છે. એએમપિલેશન બી. આઈ. પી. ની પ્રવૃત્તિના નિયંત્રણના અનુવાદ પછીના અન્ય ઝડપી સ્તરને ઉમેરે છે, કારણ કે એએમપી સાથે બી. આઈ. પી. ના સબસ્ટ્રેટ-બાઇન્ડિંગ ડોમેનના Thr518 નો ફેરફાર ચેપરોનને નિષ્ક્રિય રચનામાં તાળું મારે છે. વધારાના બી. આઈ. પી. ને નિષ્ક્રિય કરવા માટે, આ ફેરફાર પસંદગીયુક્ત રીતે ઇ. આર. સ્ટ્રેસ ઘટવા તરીકે લાગુ કરવામાં આવે છે. જો કે, જેમ જેમ ER તણાવ ફરીથી વધે છે, તે જ એન્ઝાઇમ, FICD, વિપરીત પ્રતિક્રિયા, BiP ડી-એમ્પિલેશનને ઉત્પ્રેરિત કરે છે. બી. આઈ. પી. એમ્પિલેશન અને ડી-એમ્પિલેશનના માળખાકીય આધારની સમજ ધીમે ધીમે ઉભરી રહી છે, જેમ કે એલોસ્ટરી માટેના સંકેતો છે જે એફ. આઈ. સી. ડી. ની પ્રવૃત્તિમાં ફેરફારને નિયંત્રિત કરી શકે છે પરંતુ આ પ્રક્રિયાની મહત્વપૂર્ણ વિગતો જે કોષોમાં થાય છે તે શોધવાનું બાકી છે. થ્રી518 પર બી. આઈ. પી. એમ્પિલેશન (અને ડી-એમ્પિલેશન) માં એફ. આઈ. સી. ડી. ની ભૂમિકાને બાયોકેમિકલ અને માળખાકીય અભ્યાસો દ્વારા સારી રીતે સમર્થન આપવામાં આવ્યું છે. પુરાવા પણ રજૂ કરવામાં આવ્યા છે કે કેટલાક સંજોગોમાં એફ. આઈ. સી. ડી. બી. આઈ. પી. ના ન્યુક્લિયોટાઇડ બંધનકર્તા ક્ષેત્રમાં એક અલગ અવશેષ, Thr366 ને એમ્પાયલેટ કરી શકે છે. કેનોરહૅબિડાઇટિસ એલિગન્સ ફિક-1 એ એકમાત્ર ફિક પ્રોટીન છે જે સી. એલિગન્સના આનુવંશિક કોડમાં હાજર છે. તે મુખ્યત્વે પુખ્ત જર્મલાઇન કોષો અને ગર્ભ કોષોના ER પરમાણુ પરબિડીયુંમાં જોવા મળે છે, પરંતુ કોષરસની અંદર થોડી માત્રામાં મળી શકે છે. એફ. આઈ. સી. ડી.-1 ના આ એક્સ્ટ્રા-ઇ. આર. પૂલને નેમાટોડની અંદર કોર હિસ્ટોન્સ અને ઇ. ઇ. એફ. 1-એ પ્રકારનાં અનુવાદ પરિબળોના એમ્પિલેશનનો શ્રેય આપવામાં આવે છે. જો કે એએમપિલેશનના વિવિધ સ્તરોએ નેમાટોડની વર્તણૂક અથવા શરીરવિજ્ઞાનમાં કોઈ નોંધપાત્ર અસરો પેદા કરી ન હતી, તેમ છતાં ફિક-1 નોકઆઉટ વોર્મ્સ સક્રિય ફિક-1 ડોમેન્સ સાથેના સમકક્ષોની તુલનામાં સ્યુડોમોનાસ એરુગિનોસા દ્વારા ચેપ માટે વધુ સંવેદનશીલ હતા, જે નેમાટોડ્સની અંદર સેલ્યુલર લક્ષ્યોના એએમપિલેશન અને રોગપ્રતિકારક પ્રતિક્રિયાઓ વચ્ચેની કડી સૂચવે છે. એફ. આઈ. સી. ડી. (સી. જી. 9523) નો અભાવ ધરાવતી ડ્રોસોફિલા મેલાનોગાસ્ટર માખીઓને અંધ તરીકે વર્ણવવામાં આવી છે. શરૂઆતમાં, આ ખામીને કોષની સપાટી પર કેપિટ અનુમાનની એફ. આઈ. સી. ડી. ની ભૂમિકાને આભારી હતી-ન્યુરોટ્રાન્સમીટર રિસાયક્લિંગની એક અનુમાનિત સાઇટ, જો કે પછીના અભ્યાસમાં દ્રશ્ય સમસ્યામાં બી. આઈ. પી. Thr366 ના એફ. આઈ. સી. ડી.-મધ્યસ્થ એએમપિલેશનને સામેલ કરવામાં આવ્યું હતું. αSynના હાયપ-મધ્યસ્થ એડેનિલિલેશન દરમિયાન, αSynનું એકત્રીકરણ ઘટે છે અને ન્યુરોટોક્સિસિટી અને ER તણાવ બંને ઈન વિટ્રોમાં ઘટાડો કરે છે. આમ, αSyn નું એડેનિલિલેશન સંભવતઃ ER તણાવ અને αSyn એકત્રીકરણ માટે રક્ષણાત્મક પ્રતિભાવ છે. જો કે, aSyn અને FICD જુદા જુદા વિભાગોમાં રહેતા હોવાથી આ દાવાઓના મહત્વની પુષ્ટિ કરવા માટે વધુ સંશોધન કરવાની જરૂર છે. શોધ રાસાયણિક હેન્ડલ રાસાયણિક હેન્ડલનો ઉપયોગ અનુવાદ પછીના સંશોધિત પ્રોટીનને શોધવા માટે થાય છે. તાજેતરમાં, એક એન6પીએટીપી છે જેમાં એટીપીના એડેનિનની એન6 સ્થિતિ પર એલ્કિનિલ ટેગ (પ્રોપાર્જિલ) હોય છે. આ N6pATP AMPylated પ્રોટીનને શોધવા માટે ક્લિક પ્રતિક્રિયા સાથે જોડાય છે. અજાણ્યા સંશોધિત પ્રોટીનને શોધવા અને VopS સબસ્ટ્રેટ્સને લેબલ કરવા માટે, એડેનિન N6 NH2 પર ફ્લોરોફોર સાથે ATP ડેરિવેટિવ્ઝનો ઉપયોગ તે કરવા માટે થાય છે. એન્ટિબોડી-આધારિત પદ્ધતિ એન્ટિબોડી તેની ઉચ્ચ આત્મીયતા અને પસંદગી માટે પ્રખ્યાત છે, તેથી તે એએમપીલેટેડ પ્રોટીનને શોધવાની સારી રીત છે. તાજેતરમાં, ɑ-AMP એન્ટિબોડીઝનો ઉપયોગ કોશિકાઓ અને સેલ લાઇસેટ્સમાંથી સીધા જ AMPylated પ્રોટીન (ખાસ કરીને AMPylated ટાયરોસિન અને AMPylated થ્રેઓનિન) ને શોધવા અને અલગ કરવા માટે થાય છે. એએમપિલેશન એ અનુવાદ પછીનો ફેરફાર છે, તેથી તે એએમપી અને હાઇડ્રોફોબિસિટીનું ધ્રુવીય પાત્ર આપીને પ્રોટીનના ગુણધર્મોમાં ફેરફાર કરશે. આમ, સંપૂર્ણ પેપ્ટાઇડ ક્રમને શોધતી એન્ટિબોડીઝનો ઉપયોગ કરવાને બદલે, ચોક્કસ એમિનો એસિડને સીધા લક્ષ્યમાં રાખીને એએમપી એન્ટિબોડીઝ વધારવાનું પસંદ કરવામાં આવે છે. માસ સ્પેક્ટ્રોમેટ્રી અગાઉ, ઘણા વિજ્ઞાન કાર્યોમાં એએમપિલેટેડ પેપ્ટાઇડ્સને શોધવા માટે વિવિધ ફ્રેગમેન્ટેશન સ્થિતિઓમાં માસ સ્પેક્ટ્રોમેટ્રી (એમએસ) નો ઉપયોગ થતો હતો. વિશિષ્ટ ફ્રેગમેન્ટેશન તકનીકોના પ્રતિભાવમાં, એએમપીના વિવિધ ભાગોમાં એએમપીલેટેડ પ્રોટીન સિક્વન્સ વિખેરાઈ ગયા. જ્યારે ઇલેક્ટ્રોન ટ્રાન્સફર ડિસોસીએશન (ઇટીડી) લઘુતમ ટુકડાઓ અને ઓછા જટિલ સ્પેક્ટ્રા બનાવે છે, ત્યારે અથડામણ-પ્રેરિત વિયોજન (સીઆઇડી) અને ઉચ્ચ-ઊર્જા અથડામણ (એચસીડી) વિભાજન બહુવિધ એએમપી ટુકડાઓ ઉત્પન્ન કરીને એએમપીલેટેડ પ્રોટીન ઓળખ માટે યોગ્ય લાક્ષણિકતા આયનો ઉત્પન્ન કરે છે. એએમપીની સ્થિરતાને કારણે, પેપ્ટાઇડ ફ્રેગમેન્ટેશન સ્પેક્ટ્રા જાતે અથવા સર્ચ એન્જિન સાથે વાંચવામાં સરળ છે. 6 થી 50 માઇક્રોન સુધીના અવરોધક અચળાંક (કી) સાથે પ્રોટીન એએમપિલેશનના અવરોધક અને ઓછામાં ઓછી 30 ગણી પસંદગી વિરુદ્ધ હાયપઈની શોધ કરવામાં આવી છે. સંદર્ભો બાયોકેમિસ્ટ્રી