Tandem mass tag
ટેન્ડમ માસ ટેગ (ટી. એમ. ટી.) એ એક રાસાયણિક લેબલ છે જે માસ સ્પેક્ટ્રોમેટ્રી (એમ. એસ.) આધારિત માત્રામાં નમૂનાના મલ્ટિપ્લેક્સિંગ અને પ્રોટીન, પેપ્ટાઇડ્સ અને ન્યુક્લિક એસિડ જેવા જૈવિક મેક્રોમોલેક્યુલ્સની ઓળખની સુવિધા આપે છે. ટી. એમ. ટી. એ આઇસોબેરિક માસ ટેગ્સ તરીકે ઓળખાતા રીએજન્ટ્સના પરિવાર સાથે સંબંધિત છે, જે સમાન દળવાળા અણુઓનો સમૂહ છે, પરંતુ વિભાજન પછી અલગ દળના રિપોર્ટર આયનો ઉત્પન્ન કરે છે. માપેલા રિપોર્ટર આયનોના સાપેક્ષ ગુણોત્તર ટેગ કરેલા અણુની સાપેક્ષ વિપુલતાને રજૂ કરે છે, જો કે આયન દમનની ચોકસાઈ પર હાનિકારક અસર પડે છે. આ ગૂંચવણો હોવા છતાં, ટી. એમ. ટી. આધારિત પ્રોટિઓમિક્સ લેબલ-મુક્ત પરિમાણ કરતાં વધુ ચોકસાઇ પરવડે તેવું દર્શાવવામાં આવ્યું છે. પ્રોટીનના જથ્થામાં મદદ કરવા ઉપરાંત, ટી. એમ. ટી. ટેગ આર. પી. એલ. સી.-એમ. એસ. વિશ્લેષણમાં ફોસ્ફોપેપ્ટાઇડ્સ જેવા અમુક ઉચ્ચ હાઇડ્રોફિલિક વિશ્લેષકોની શોધ સંવેદનશીલતામાં પણ વધારો કરી શકે છે. આવૃત્તિઓ હાલમાં ટી. એમ. ટી. ની છ જાતો ઉપલબ્ધ છેઃ ટી. એમ. ટી. ઝીરો, એક બિન-સમસ્થાનિક અવેજી કોર માળખું; ટી. એમ. ટી. ડુપ્લેક્સ, એક સમસ્થાનિક અવેજી સાથે સામૂહિક ટેગની એક સમસ્થાનિક જોડી; ટી. એમ. ટી. સિક્સપ્લેક્સ, પાંચ સમસ્થાનિક અવેજી સાથે છ સામૂહિક ટેગનો એક સમસ્થાનિક સમૂહ; ટી. એમ. ટી. 10-પ્લેક્સ-10 સમસ્થાનિક સામૂહિક ટેગનો સમૂહ જે ટી. એમ. ટી. સિક્સપ્લેક્સ રિપોર્ટર ક્ષેત્રનો ઉપયોગ કરે છે, પરંતુ 0.0063 Da નો સામૂહિક તફાવત બનાવવા માટે વિવિધ મૂળભૂત આઇસોટોપનો ઉપયોગ કરે છે, ટી. એમ. ટી. પ્રો. મૂળ ટી. એમ. ટી. અને ટી. એમ. ટી. પ્રો ઝીરો કરતાં અલગ રિપોર્ટર અને સામૂહિક સામાન્યીકરણ સાથે 16 પ્લેક્સ સંસ્કરણ. ટેગમાં ચાર પ્રદેશો છે, એટલે કે માસ રિપોર્ટર ક્ષેત્ર (એમ), ક્લેવેબલ લિંકર ક્ષેત્ર (એફ), માસ નોર્મલાઇઝેશન ક્ષેત્ર (એન) અને પ્રોટીન પ્રતિક્રિયાશીલ જૂથ (આર). તમામ ટૅગ્સની રાસાયણિક રચનાઓ સમાન હોય છે પરંતુ દરેકમાં વિવિધ સ્થાનો પર અવેજી આઇસોટોપ હોય છે, જેમ કે માસ રિપોર્ટર અને માસ નોર્મલાઇઝેશન પ્રદેશોમાં દરેક ટેગમાં અલગ પરમાણુ દળ હોય છે. ટેગના સંયુક્ત એમ. એફ. એન. આર. પ્રદેશોમાં સમાન કુલ પરમાણુ વજન અને માળખું હોય છે જેથી ક્રોમેટોગ્રાફિક અથવા ઇલેક્ટ્રોફોરેટિક વિભાજન દરમિયાન અને સિંગલ એમએસ મોડમાં, વિવિધ ટેગ સાથે લેબલ થયેલ અણુઓ અવિભાજ્ય હોય. એમએસ/એમએસ મોડમાં ફ્રેગમેન્ટેશન પર, પેપ્ટાઇડ બેક બોનના ફ્રેગમેન્ટેશનમાંથી ક્રમની માહિતી મેળવવામાં આવે છે અને ટેગના ફ્રેગમેન્ટેશનમાંથી એક સાથે ક્વોન્ટિફિકેશન ડેટા મેળવવામાં આવે છે, જે માસ રિપોર્ટર આયનોને જન્મ આપે છે. લેબલ થયેલ પેપ્ટાઇડ્સનું પ્રમાણ TMT ટેગનું માળખું unimod.org પર યુનિમોડ ડેટાબેઝ દ્વારા જાહેરમાં ઉપલબ્ધ છે અને તેથી, માસ્કોટ જેવા માસ સ્પેક્ટ્રોમેટ્રી સોફ્ટવેર ટેગ માસ માટે જવાબદાર છે. વધુમાં, આવૃત્તિ 2.2 મુજબ, માસ્કોટમાં વધારાના સોફ્ટવેરનો ઉપયોગ કર્યા વિના ટીએમટી અને અન્ય આઇસોબેરિક માસ ટેગનો ઉપયોગ કરવાની ક્ષમતા છે. સહજ ભાવે, પ્રોટીન માપન સાથે સંકળાયેલ વિશ્વાસ વિવિધ પેપ્ટાઇડ્સના ગુણોત્તરની સમાનતા અને આ માપનના સંકેત સ્તર પર આધાર રાખે છે. BACIQ તરીકે ઓળખાતો ગાણિતિક રીતે સખત અભિગમ, જે પ્રોટીન ગુણોત્તર માટે વિશ્વાસ અંતરાલોમાં પેપ્ટાઇડની તીવ્રતા અને પેપ્ટાઇડ-માપન કરારને એકીકૃત કરે છે. TKO ધોરણનો ઉપયોગ હસ્તક્ષેપનું મૂલ્યાંકન કરવા માટે થઈ શકે છે, આઇસોબેરિક વાહક ખ્યાલ TMT ટેગનો ઉપયોગ સામાન્ય રીતે સમાન વિપુલતાના નમૂનાઓને લેબલ કરવા માટે થાય છે. જો લેબલ કરેલા નમૂનાઓમાંથી એક વધુ વિપુલ પ્રમાણમાં હોય, તો તે તમામ નમૂનાઓ માટે વિશ્લેષણની સંવેદનશીલતામાં વધારો કરી શકે છે. આવા આઇસોબેરિક લેબલવાળા નમૂનાઓને આઇસોબેરિક વાહક તરીકે ઓળખવામાં આવે છે. તેઓ માસ સ્પેક્ટ્રોમેટ્રી દ્વારા સિંગલ-સેલ પ્રોટીન વિશ્લેષણ માટે રજૂ કરવામાં આવ્યા હતા, અને અન્ય ઘણી એપ્લિકેશનો મળી છે. સંદર્ભો બાયોકેમિસ્ટ્રી શોધ પદ્ધતિઓ બાયોટેકનોલોજી માસ સ્પેક્ટ્રોમેટ્રી