Intelligent Systems for Molecular Biology
ઇન્ટેલિજન્ટ સિસ્ટમ્સ ફોર મોલેક્યુલર બાયોલોજી (ISMB) એ ઇન્ટરનેશનલ સોસાયટી ફોર કોમ્પ્યુટેશનલ બાયોલોજી (ISCB) દ્વારા આયોજિત બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ અને કોમ્પ્યુટેશનલ બાયોલોજીના વિષયો પર વાર્ષિક શૈક્ષણિક પરિષદ છે. આ પરિષદનું મુખ્ય ધ્યાન જૈવિક સમસ્યાઓ માટે અદ્યતન કોમ્પ્યુટેશનલ પદ્ધતિઓના વિકાસ અને ઉપયોગ પર છે. આ પરિષદ 1993 થી દર વર્ષે યોજાય છે અને 2004 માં 2,000 થી વધુ પ્રતિનિધિઓનું આયોજન કરીને આ ક્ષેત્રોમાં સૌથી મોટી અને સૌથી પ્રતિષ્ઠિત બેઠકોમાંની એક બની ગઈ છે. પ્રથમ બેઠકથી, આઇએસએમબી વિશ્વભરના સ્થળોએ યોજાય છે; 2007 થી, યુરોપ અને ઉત્તર અમેરિકામાં વારાફરતી બેઠકો યોજાય છે. 2004 થી, યુરોપિયન બેઠકો કોમ્પ્યુટેશનલ બાયોલોજી (ECCB) પર યુરોપિયન પરિષદ સાથે સંયુક્ત રીતે યોજાય છે. મુખ્ય ISMB પરિષદ સામાન્ય રીતે ત્રણ દિવસ સુધી યોજાય છે અને તેમાં પ્રસ્તુતિઓ, પોસ્ટર સત્રો અને મુખ્ય પ્રવચનોનો સમાવેશ થાય છે. મોટાભાગની પ્રસ્તુતિઓ બહુવિધ સમાંતર ટ્રેકમાં આપવામાં આવે છે; જો કે, મુખ્ય પ્રવચન એક જ ટ્રેકમાં રજૂ કરવામાં આવે છે અને બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સમાં ઉત્કૃષ્ટ સંશોધનને પ્રતિબિંબિત કરવા માટે પસંદ કરવામાં આવે છે. નોંધપાત્ર ISMB મુખ્ય વક્તાઓમાં આઠ નોબેલ વિજેતાઓનો સમાવેશ થાય છે. વરિષ્ઠ વૈજ્ઞાનિક પુરસ્કાર દ્વારા આઈ. એસ. સી. બી. ઓવરટન પુરસ્કાર અને આઈ. એસ. સી. બી. સિદ્ધિના પ્રાપ્તકર્તાઓને કાર્યક્રમના ભાગરૂપે મુખ્ય પ્રવચન આપવા માટે આમંત્રિત કરવામાં આવે છે. પરિષદની કાર્યવાહી હાલમાં જર્નલ બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ દ્વારા પ્રકાશિત કરવામાં આવે છે. ઇતિહાસ પ્રારંભિક બેઠકો ISMB પરિષદની ઉત્પત્તિ નવેમ્બર 1991માં આયોજિત મોલેક્યુલર બાયોલોજીમાં રસ ધરાવતા આર્ટિફિશિયલ ઇન્ટેલિજન્સ સંશોધકો માટેની વર્કશોપમાં છે. આ વર્કશોપનું આયોજન અમેરિકન સંશોધક લોરેન્સ હન્ટર દ્વારા કરવામાં આવ્યું હતું, જે તે સમયે મેરીલેન્ડના બેથેસ્ડા ખાતે યુનાઇટેડ સ્ટેટ્સ નેશનલ ઇન્સ્ટિટ્યૂટ ઓફ હેલ્થની નેશનલ લાઇબ્રેરી ઓફ મેડિસિન (એન. એલ. એમ.) ખાતે મશીન લર્નિંગ પ્રોજેક્ટના ડિરેક્ટર હતા. 1992માં એન. એલ. એમ. અને નેશનલ સાયન્સ ફાઉન્ડેશન દ્વારા આયોજિત આ જ વિષય પર યોજાયેલી વર્કશોપમાં સ્પષ્ટ કરવામાં આવ્યું હતું કે આ ક્ષેત્ર માટે નિયમિત આંતરરાષ્ટ્રીય પરિષદની જરૂર છે. આવી પરિષદ કૃત્રિમ બુદ્ધિના ઝડપથી વિકસતા ઉપયોગ તરીકે મોલેક્યુલર બાયોલોજીને સમર્પિત હશે. એએએઆઈ, એનઆઈએચ અને ડિપાર્ટમેન્ટ ઓફ એનર્જી ઓફિસ ઓફ હેલ્થ એન્ડ એન્વાયર્નમેન્ટલ રિસર્ચ પાસેથી અનુદાન માટે સફળતાપૂર્વક અરજી કર્યા પછી, પ્રથમ આઇએસએમબી પરિષદ જુલાઈ 1993માં એન. એલ. એમ. ખાતે યોજાઈ હતી. આ પરિષદની અધ્યક્ષતા હન્ટર, ડેવિડ સિયર્લ્સ (યુનિવર્સિટી ઓફ પેન્સિલવેનિયા સ્કૂલ ઓફ મેડિસિનમાં સંશોધન સહયોગી પ્રોફેસર) અને જુડ શાવલિક (યુનિવર્સિટી ઓફ વિસ્કોન્સિન-મેડિસનમાં કમ્પ્યુટર સાયન્સના સહાયક પ્રોફેસર) દ્વારા કરવામાં આવી હતી અને 13 દેશોના 200 થી વધુ ઉપસ્થિતોને આકર્ષ્યા હતા, જેમણે 69 વૈજ્ઞાનિક કાગળો રજૂ કર્યા હતા. પ્રથમ પરિષદની સફળતાએ બેઠકના અંતે બીજી ISMB પરિષદની જાહેરાતને પ્રેરિત કરી. ISMB 1994 શરૂઆતમાં સિએટલમાં યોજવાનું આયોજન કરવામાં આવ્યું હતું. જોકે, એક સ્પર્ધાત્મક બેઠકમાં ISMBને ટૂંકી નોટિસ પર સ્થળ બદલવાની ફરજ પડી હતી. આ પરિષદ ઓગસ્ટ 1994માં સ્ટેનફોર્ડ યુનિવર્સિટી ખાતે યોજાઈ હતી અને તેનું આયોજન સ્ટેનફોર્ડ યુનિવર્સિટી સ્કૂલ ઓફ મેડિસિનના સંશોધન વૈજ્ઞાનિક રસ ઓલ્ટમેન દ્વારા કરવામાં આવ્યું હતું. પરિષદના આંતરરાષ્ટ્રીય પાસા પર ભાર મૂકવા માટે, કેમ્બ્રિજની રોબિન્સન કોલેજમાં ISMB 1995નું આયોજન કરવામાં આવ્યું હતું. ISMB 1995 એ પણ પરિષદના કેન્દ્રમાં પરિવર્તનની નિશાની કરી. આઈ. એસ. સી. બી. બોર્ડના સભ્ય અને સ્પેનિશ નેશનલ બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ ઇન્સ્ટિટ્યૂટના ડિરેક્ટર આલ્ફોન્સો વેલેન્સિયાએ જણાવ્યું છે કે, 1995 માં, "પરિષદ કોમ્પ્યુટર વિજ્ઞાન આધારિત પરિષદથી એક એવા તબક્કે બદલાઈ ગઈ જ્યાં દરેકને સમજાયું કે, જો તમે પ્રગતિ કરવા માંગતા હો, તો જીવવિજ્ઞાનમાં વધુ ધ્યાન કેન્દ્રિત કરવું પડશે". આઈ. એસ. સી. બી. ની રચના અને વિસ્તરણ આઈ. એસ. એમ. બી. 1997 ગ્રીસના હલ્કિડિકીમાં યોજાયું હતું અને ઇન્ટરનેશનલ સોસાયટી ફોર કોમ્પ્યુટેશનલ બાયોલોજી (આઈ. એસ. સી. બી.) નો પાયો નાંખ્યો હતો. આઈ. એસ. સી. બી. ની રચના આઈ. એસ. એમ. બી. પરિષદના તમામ વૈજ્ઞાનિક, સંગઠનાત્મક અને નાણાકીય પાસાઓના સંચાલન પર ધ્યાન કેન્દ્રિત કરવા અને જૈવિક વિજ્ઞાનમાં કમ્પ્યુટર્સની ઉભરતી ભૂમિકાને સંબોધવા માટે વૈજ્ઞાનિકોને એક મંચ પ્રદાન કરવા માટે કરવામાં આવી હતી. આઈ. એસ. સી. બી. એ 1998 થી આઈ. એસ. એમ. બી. પરિષદ શ્રેણીના આયોજનમાં મદદ કરી છે. આઈ. એસ. સી. બી. ની રચના પછીના સમયગાળામાં આઈ. એસ. એમ. બી. ઉપસ્થિતોની સંખ્યામાં પણ વધારો થયો હતોઃ આઈ. એસ. એમ. બી. 2000 (યુનિવર્સિટી ઓફ કેલિફોર્નિયા, સાન ડિએગો ખાતે યોજાયેલ) માં 1,000 થી વધુ પ્રતિનિધિઓએ હાજરી આપી હતી, 141 વૈજ્ઞાનિક લેખો રજૂ કર્યા હતા. કદની મર્યાદાઓને કારણે યુનિવર્સિટીમાં ISMBની આ છેલ્લી બેઠક પણ હતી. ઇસીસીબી સાથે ભાગીદારી 2004 માં, આઇએસએમબી પ્રથમ વખત કોમ્પ્યુટેશનલ બાયોલોજી પર યુરોપિયન પરિષદ સાથે સંયુક્ત રીતે યોજવામાં આવી હતી. આ પરિષદ જનીનો, પ્રોટીન અને કોમ્પ્યુટર પરિષદ સાથે પણ સહ-સ્થિત હતી. યુકેના ગ્લાસગોમાં યોજાયેલી આ બેઠક અત્યાર સુધીની સૌથી મોટી બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ પરિષદ હતી, જેમાં 2,136 પ્રતિનિધિઓએ હાજરી આપી હતી અને 496 વૈજ્ઞાનિક લેખો રજૂ કર્યા હતા. આલ્ફોન્સો વેલેન્સિયા ISMB/ECCB 2004 ને ISMB ના ઇતિહાસમાં એક મહત્વપૂર્ણ સીમાચિહ્નરૂપ માને છેઃ "તે પ્રથમ હતું જ્યાં યુરોપ અને રાજ્યો વચ્ચેનું સંતુલન પરિષદનો એક મહત્વપૂર્ણ ભાગ બન્યું. અહીં અમે અમેરિકનો અને યુરોપિયનો વચ્ચેના નિયમો અને માર્ગો અને સહયોગની ભાવનાની સ્થાપના કરી હતી. સંયુક્ત પરિષદની સફળતાએ ભવિષ્યની યુરોપિયન ISMB બેઠકો ECCB સાથે સંયુક્ત રીતે યોજવાનો માર્ગ મોકળો કર્યો. તાજેતરની બેઠકો 2006ના અંત સુધીમાં, આઈ. એસ. સી. બી. નાણાકીય મુશ્કેલીમાં હતી. બે પરિષદો (આઈ. એસ. એમ. બી. 2003, બ્રિસ્બેનમાં અને આઈ. એસ. એમ. બી. 2006, ફોર્ટાલેઝામાં) માં તેમના સ્થાનને કારણે સહભાગીઓની સંખ્યામાં ભારે ઘટાડો થયો હતો, જેને અનુરૂપ આવકમાં ઘટાડો થયો હતો. વધુ પ્રતિનિધિઓને હાજરી આપવા માટે, પરિષદના સ્થળોને ઉત્તર અમેરિકા અને યુરોપ સુધી મર્યાદિત કરવાનો નિર્ણય લેવામાં આવ્યો હતો. જાન્યુઆરી 2007માં, ISMB અને ECCB દર બીજા વર્ષે યુરોપમાં સંયુક્ત પરિષદો યોજવા સંમત થયા હતા, જેની શરૂઆત ISMB/ECCB 2007થી થઈ હતી. સંયુક્ત બેઠકો વચ્ચેના વર્ષોમાં ઉત્તર અમેરિકામાં ISMBનું આયોજન કરવામાં આવશે. આ પેટર્ન ઓછામાં ઓછી 2019 સુધી ચાલુ રહેવાની પુષ્ટિ થઈ છે. ISMB/ECCB 2007 (વિયેના, ઑસ્ટ્રિયામાં યોજાયેલી) એ પ્રથમ પરિષદને ચિહ્નિત કરી હતી જેના આયોજનની સંપૂર્ણ જવાબદારી ISCBએ લીધી હતી. વિયેના ISMB/ECCB 2011 સાથે બે વાર ISMBનું આયોજન કરનાર પ્રથમ શહેર બન્યું હતું. આ 'પરત મુલાકાત' એક પ્રયોગ હતો જેનો હેતુ યોગ્ય પરિષદના સ્થળો શોધવા માટે જરૂરી વધતા પ્રયત્નોને ઘટાડવાનો હતો. જો કે ભાવમાં વધારાને કારણે વિયેના પરત ફરવું આંશિક રીતે જ સફળ માનવામાં આવ્યું હતું, તેમ છતાં બોસ્ટન (જેણે ISMB 2010 અને 2014નું આયોજન કર્યું હતું) એક 'સલામત' સ્થળ બનવાની આગાહી કરવામાં આવી છે, જ્યાં ISMB સમયાંતરે પરત ફરી શકે છે. આઇએસએમબીએ કેલિફોર્નિયાના લોંગ બીચ ખાતે આઇએસએમબી 2012 સાથે તેની 20મી બેઠકની ઉજવણી કરી હતી. આ કાર્યક્રમમાં લગભગ 1,600 પ્રતિનિધિઓએ 268 વૈજ્ઞાનિક લેખો રજૂ કર્યા હતા. રિચાર્ડ એચ. લેથ્રોપ અને લોરેન્સ હન્ટરએ અગાઉની આઇએસએમબી બેઠકો પર નજર નાખીને અને ભવિષ્યમાં બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સનું ક્ષેત્ર ક્યાં જઈ શકે છે તેની આગાહી કરવાનો પ્રયાસ કરીને એક વિશેષ મુખ્ય પ્રસ્તુતિ રજૂ કરી હતી. ISMB/ECCB 2013નું આયોજન જર્મનીના બર્લિનમાં થયું હતું અને તેમાં આશરે 2,000 પ્રતિનિધિઓએ હાજરી આપી હતી, જેમણે 233 વૈજ્ઞાનિક લેખો રજૂ કર્યા હતા. મુખ્ય ISMB પરિષદ સામાન્ય રીતે ત્રણ દિવસમાં યોજાય છે અને તેમાં પ્રસ્તુતિઓ, પોસ્ટર સત્રો અને મુખ્ય પ્રવચનોનો સમાવેશ થાય છે. આઈ. એસ. એમ. બી. ખાતે શૈક્ષણિક લેખો પરંપરાગત રીતે એક જ ટ્રેકમાં રજૂ કરવામાં આવતા હતા. આઈ. એસ. એમ. બી. 1994 ખાતેની પ્રસ્તુતિઓને અનુક્રમે પ્રોટીન ગૌણ માળખાની આગાહી, અનુક્રમ વિશ્લેષણ અને એ. આઈ. તકનીકો અને બાયોકેમિકલ એપ્લિકેશનો પર ધ્યાન કેન્દ્રિત કરીને ત્રણ થીમ આધારિત દિવસોમાં વહેંચવામાં આવી હતી. જેમ જેમ ISMB ખાતે હાજરીમાં વધારો થયો તેમ, સિંગલ ટ્રેક અભિગમ વધુને વધુ બિનટકાઉ બની ગયો અને ISMB/ECCB 2004 ખાતે બે સમાંતર ટ્રેક રજૂ કરવામાં આવ્યા. વધુ વિસ્તરણનો અર્થ એ થયો કે, ISMB 2012 સુધીમાં, બહુવિધ કાર્યવાહી ટ્રેક, હાઇલાઇટ્સ ટ્રેક અને ટેક્નોલોજી ટ્રેક સહિત નવ સમાંતર ટ્રેકમાં 200 થી વધુ વાટાઘાટો રજૂ કરવામાં આવી હતી. ISMB સાથે સમાંતર ટ્રેકની રજૂઆત વિવાદાસ્પદ હતી. ક્રિસ્ટોફર રોલિંગ્સે (રોથમસ્ટેડ રિસર્ચ ખાતે કોમ્પ્યુટેશનલ અને સિસ્ટમ્સ બાયોલોજીના વડા અને ISMB 1995 ના આયોજક) કહ્યું છેઃ "એવા ઘણા લોકો હતા જેઓ તેને AI ઇન્ટેલિજન્ટ સિસ્ટમ્સ મોડેલમાં વધુ મજબૂત રીતે રાખવા માંગતા હતા અને એક બેઠક યોજવા માંગતા હતા જ્યાં દરેક વ્યક્તિ દરેક વસ્તુ પર જશે. પરંતુ તે ખૂબ મોટી માત્રામાં હતી. અમે એમ ન કરી શક્યા ". જેમ જેમ રજૂ કરાયેલા કાર્યવાહીના દસ્તાવેજોની સંખ્યામાં વધારો થયો છે તેમ તેમ સ્વીકૃતિ દર નાટ્યાત્મક રીતે ઘટ્યો છે, જે 1994માં 75 ટકાથી ઘટીને 2012માં 13 ટકા થયો છે. 1993-2000 માંથી ISMB કાર્યવાહી એએએઆઈ પ્રેસ દ્વારા પ્રકાશિત કરવામાં આવી હતી. આઇએસએમબી 2001 થી, કાર્યવાહી બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ જર્નલમાં પ્રકાશિત કરવામાં આવી છે. ISMB ખાતે રજૂ કરાયેલા પોસ્ટરોની સંખ્યામાં પણ નાટ્યાત્મક વધારો થયો છે. ISMB 1994માં 25 પોસ્ટરો રજૂ કરવામાં આવ્યા હતા; તાજેતરની ISMB બેઠકોમાં, બહુવિધ પોસ્ટર સત્રોમાં 500-1,000 પોસ્ટરો રજૂ કરવામાં આવ્યા છે. મુખ્ય ભાષણો એક જ ટ્રેકમાં રજૂ કરવામાં આવે છે અને સામાન્ય રીતે સૌથી વધુ પ્રેક્ષકોને આકર્ષે છે. આ પ્રસ્તુતિઓ બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સના ક્ષેત્રમાં ઉત્કૃષ્ટ સંશોધનને પ્રકાશિત કરવા માટે પસંદ કરવામાં આવી છે. નોંધપાત્ર ISMB મુખ્ય વક્તાઓમાં આઠ નોબેલ વિજેતાઓનો સમાવેશ થાય છેઃ રિચાર્ડ જે. રોબર્ટ્સ (1994,2006માં મુખ્ય વક્તા), જ્હોન સુલ્સ્ટન (1995), મેનફ્રેડ ઇગેન (1999), ગેરાલ્ડ એડલમેન (2000), સિડની બ્રેનર (2003), કર્ટ વુથરિચ (2006), રોબર્ટ હ્યુબર (2006) અને માઇકલ લેવિટ (2015). ISMB 15 લાખ ડોલરથી વધુના બજેટ પર ચાલે છે અને આવકની દ્રષ્ટિએ અન્ય ISCB પરિષદો (ISCB-લેટિન અમેરિકા, ISCB-આફ્રિકા, ISCB-એશિયા, રોકી માઉન્ટેન બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ કોન્ફરન્સ, CSHALS અને ગ્રેટ લેક્સ બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ કોન્ફરન્સ) ની સરખામણીએ ચાર ગણી વધારે આવક લાવે છે. પ્રમાણભૂત નોંધણી ફી (2013 મુજબ) આઈ. એસ. સી. બી. ના સભ્યો હોય તેવા વિદ્વાનો માટે આશરે $1,000 (બિન-સભ્યો માટે $1,350) છે, જેમાં વિદ્યાર્થીઓ માટે નીચા દર અને કોર્પોરેટ પ્રતિનિધિઓ માટે ઊંચા દર અનુક્રમે છે. વહેલી નોંધણી માટે ડિસ્કાઉન્ટ આપવામાં આવે છે. સેટેલાઇટ ઇવેન્ટ્સ પૂર્વ-પરિષદ ટ્યુટોરિયલોએ પ્રથમ પરિષદથી જ ISMBમાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવી છે. ISMB 1994 ખાતેના ટ્યુટોરિયલ્સમાં આનુવંશિક અલ્ગોરિધમ્સ, ન્યુરલ નેટવર્ક્સ, મોલેક્યુલર જીવવિજ્ઞાનીઓ માટે AI અને કમ્પ્યુટર વૈજ્ઞાનિકો માટે મોલેક્યુલર બાયોલોજીનો સમાવેશ થાય છે. કોમ્પ્યુટેશનલ માસ સ્પેક્ટ્રોમેટ્રી-આધારિત પ્રોટિઓમિક્સ અને એનકોડ ડેટા એક્સેસ પરના ટ્યુટોરિયલ્સ ISMB/ECCB 2013 માં રજૂ કરવામાં આવ્યા હતા. 1990 ના દાયકાના અંતમાં આઇએસએમબીમાં હાજરીમાં વધારો થયો હોવાથી, મુખ્ય પરિષદની સાથે અનેક ઉપગ્રહ બેઠકો અને વિશેષ રસ ધરાવતા જૂથ (એસ. આઈ. જી.) ની બેઠકો રચાઈ હતી. SIG બેઠકો મુખ્ય પરિષદના એક કે બે દિવસ પહેલા યોજાય છે અને ચોક્કસ વિષય પર ધ્યાન કેન્દ્રિત કરે છે, જે મુખ્ય પરિષદમાં સમય હોય તેના કરતા વધુ વિગતવાર ચર્ચાને મંજૂરી આપે છે. નોંધપાત્ર એસ. આઈ. જી. બેઠકોમાં બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ ઓપન સોર્સ કોન્ફરન્સ (બી. ઓ. એસ. સી.) નો સમાવેશ થાય છે, જે 2000થી દર વર્ષે યોજાય છે અને બાયો-ઓન્ટોલોજી, જે 1998થી દર વર્ષે યોજાય છે. ઉપગ્રહ બેઠકો સામાન્ય રીતે બે દિવસ લાંબી હોય છે અને ISMB સાથે જોડાણમાં યોજાય છે. 12મી CAMDA પરિષદ અને 9મી 3DSIG બેઠક ISMB/ECCB 2013ની ઉપગ્રહ બેઠકો તરીકે યોજાઈ હતી. પરિષદોની યાદી આયોજિત ઘટનાઓ પણ જુઓ કોમ્પ્યુટેશનલ બાયોલોજી પર યુરોપિયન પરિષદ (ECCB) બાયોકોમ્પ્યુટિંગ પર પેસિફિક સિમ્પોસિયમ (PSSB) કોમ્પ્યુટેશનલ મોલેક્યુલર બાયોલોજીમાં સંશોધન (RECOMB) સંદર્ભો કોમ્પ્યુટેશનલ વિજ્ઞાન કોમ્પ્યુટર વિજ્ઞાન પરિષદો બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ બાયોલોજી પરિષદો