Rubicon (protein)
રુબીકોન (રન ડોમેન બેક્લિન-1-ઇન્ટરેક્ટિંગ અને સિસ્ટીન-સમૃદ્ધ ડોમેન ધરાવતું પ્રોટીન) એ એક પ્રોટીન છે જે મનુષ્યમાં આરયુબીસીએન જનીન દ્વારા એન્કોડ કરવામાં આવે છે. રુબીકોન એ ઓટોફેગીના થોડા જાણીતા નકારાત્મક નિયમનકારોમાંનું એક છે, એક સેલ્યુલર પ્રક્રિયા જે બિનજરૂરી અથવા ક્ષતિગ્રસ્ત સેલ્યુલર ઘટકોને ઘટાડે છે. રુબિકોનને નાના જીટીપેઝ રેબ 7 સાથેની ક્રિયાપ્રતિક્રિયા દ્વારા તેના કાર્યસ્થળો પર ભરતી કરવામાં આવે છે, અને પીઆઇ3કેસી3-સી2 (વર્ગ III ફોસ્ફેટિડિલિનોસિટોલ 3-કિનેઝ કોમ્પ્લેક્સ 2) ના અવરોધ દ્વારા ઓટોફેગીના ઓટોફેગોસોમ-લિસોસોમ ફ્યુઝન પગલાને નબળી પાડે છે. રુબિકોનનું નકારાત્મક મોડ્યુલેશન વૃદ્ધત્વ અને વૃદ્ધત્વ-સંબંધિત રોગોના ઘટાડા સાથે સંકળાયેલું છેઃ રુબિકોનની નોકઆઉટ રાઉન્ડવોર્મ અને માદા ફળની માખીઓમાં આયુષ્ય વધારે છે, અને ઉંદરમાં કિડની ફાઇબ્રોસિસ અને α-સિન્યુક્લિન સંચયમાં ઘટાડો થાય છે. ઓટોફેગીના નિયમન ઉપરાંત, એલ. સી. 3-સંકળાયેલ ફેગોસાયટોસિસ (એલ. એ. પી.) અને એલ. સી. 3-સંકળાયેલ એન્ડોસાયટોસિસ (એલ. એ. એન. ડી. ઓ.) માટે રુબિકોન જરૂરી હોવાનું દર્શાવવામાં આવ્યું છે. રુબીકોન બહુવિધ ડાઉનસ્ટ્રીમ નિયમનકારી અણુઓ સાથે સીધી ક્રિયાપ્રતિક્રિયા દ્વારા જન્મજાત રોગપ્રતિકારક પ્રતિભાવને નકારાત્મક રીતે નિયંત્રિત કરે છે તેવું પણ દર્શાવવામાં આવ્યું છે. સ્ટ્રક્ચર રુબીકોનમાં 972 એમિનો એસિડ હોય છે અને તેમાં એન-ટર્મિનલ રન ડોમેન, મિડલ રિજન (એમઆર) અને સી-ટર્મિનલ રુબીકોન હોમોલોજી (આરએચ) ડોમેન હોય છે. રુબીકોન હોમોલોજી ડોમેન સિસ્ટીન અવશેષોથી સમૃદ્ધ છે અને ઓછામાં ઓછા 4 દ્વૈત ઝિંક આયનોને જોડે છે, જે ઝિંક ફિંગર મોટિફ બનાવે છે. રુબીકોન અને GTP-બાઉન્ડ રબ 7 વચ્ચેની ક્રિયાપ્રતિક્રિયા માટેનો માળખાકીય આધાર પ્રાયોગિક રીતે નક્કી કરવામાં આવ્યો છે (PDB ID: 6WCW). કાર્ય એન-ટર્મિનલ રન ડોમેનનું કાર્ય અજ્ઞાત છે, પરંતુ તે ઓટોફેગી દમન માટે જરૂરી છે. મધ્ય પ્રદેશમાં PI3K-બંધનકર્તા ક્ષેત્ર (PIKBD) છે, જે PI3KC3-C2ના અવરોધમાં મધ્યસ્થી કરે છે. સી-ટર્મિનલ રુબીકોન હોમોલોજી ડોમેન રબ 7 સાથેની ક્રિયાપ્રતિક્રિયામાં મધ્યસ્થી કરે છે, અને તે અન્ય આર. એચ. ડોમેન ધરાવતા ઓટોફેગી નિયમનકારી પ્રોટીન દ્વારા વહેંચાયેલું છે, જેમાં પી. એલ. ઇ. કે. એચ. એમ. 1 અને પેસર (જેને આર. યુ. બી. સી. એન. એલ., રુબીકોન જેવા ઓટોફેગી એન્હાન્સર તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે) નો સમાવેશ થાય છે. ઓટોફેગી-આધારિત રુબીકોન PI3KC3-C2 સાથે જોડાણ અને અવરોધ દ્વારા ઓટોફેગીને દબાવી દે છે. ખાસ કરીને, રુબીકોન સીધા PI3KC3-C2 ને જોડે છે અને બેક્લિન-1 સબયૂનિટના કન્ફોર્મેશનલ મોડ્યુલેશન દ્વારા પટલમાં PI3KC3-C2 ની ભરતી અટકાવે છે. આ પ્રવૃત્તિ ઓટોફેગોસોમ પટલ પર ફોસ્ફેટિડિલિનોસિટોલ 3-ફોસ્ફેટ (PI3P) ની PI3KC3-નિર્દેશિત પેઢીને અટકાવે છે, અને પરિણામે ઓટોફેગોસોમ-લિસોસોમ ફ્યુઝનને નિર્દેશિત કરતી મશીનરીની ભરતી કરવામાં નિષ્ફળતા થાય છે. રબ 7 સાથે સીધી ક્રિયાપ્રતિક્રિયા દ્વારા રુબિકોન તેની ક્રિયા સ્થળ પર લક્ષિત છે, જે અંતમાં એન્ડોસોમ્સ અને અંતમાં ઓટોફેગોસોમ્સને શણગારે છે. એલ. સી. 3-સંકળાયેલ ફેગોસાયટોસિસ (એલ. એ. પી.) અને એલ. સી. 3-સંકળાયેલ એન્ડોસાયટોસિસ (એલ. એ. એન. ડી. ઓ.) માટે ઓટોફેગી-સ્વતંત્ર રુબીકોન જરૂરી છે. રુબીકોન પી. આઈ. 3. કે. સી. 3ના ફેગોસોમ્સના સ્થાનિકીકરણમાં ભૂમિકા ભજવે છે, જે પટલ પર પી. આઈ. 3. પી. ઉત્પાદન અને એન. ઓ. એક્સ. 2 સહિત ડાઉનસ્ટ્રીમ પ્રભાવકોની ભરતી માટે મહત્વપૂર્ણ છે. રુબીકોન જન્મજાત રોગપ્રતિકારક પ્રતિક્રિયાને દબાવવા માટે દર્શાવવામાં આવ્યું છે અને કેટલાક કિસ્સાઓમાં વાયરલ પ્રતિકૃતિને વધારે તીવ્ર બનાવે છે. રુબીકોન એન. એફ.-κ. બી. આવશ્યક મોડ્યુલેટર (એન. ઇ. એમ. ઓ.), ઇન્ટરફેરોન નિયમનકારી પરિબળ 3 (આઇ. આર. એફ. 3) અને કેસ્પેઝ ભરતી ડોમેન ધરાવતા પ્રોટીન 9 (કાર્ડ 9) સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા દ્વારા સાયટોકીન પ્રતિસાદોને દબાવી દે છે. વૃદ્ધત્વ અને રોગમાં ભૂમિકા વૃદ્ધત્વ-સંબંધિત રોગો રુબીકોન અભિવ્યક્તિનું સ્તર ઉંદર અને અન્ય મોડેલ સજીવોમાં વય સાથે વધે છે, જે સૂચવે છે કે રુબીકોન વય-સંબંધિત ઓટોફેગીમાં ઘટાડો કરી શકે છે. ઓટોફેગીમાં ઘટાડો વૃદ્ધત્વ અને વય-સંબંધિત રોગો સાથે સંકળાયેલો હોવાથી, રુબિકોનનું મોડ્યુલેશન સંભવિત ઉપચારાત્મક લક્ષ્ય તરીકે ઓળખવામાં આવ્યું છે. ઉંદરમાં, રુબીકોન નોકઆઉટ મગજમાં α-સિન્યુક્લિન સંચય ઘટાડે છે અને કિડનીમાં ઇન્ટર્સ્ટિશલ ફાઇબ્રોસિસ ઘટાડે છે. રુબીકોન નોકઆઉટ વૃદ્ધત્વ ઓટોફેગીના મોડ્યુલેશન દ્વારા રાઉન્ડવોર્મ્સ (સી. એલિગન્સ) માં જીવનકાળ વધારે છે, અને માદા ફળની માખીઓ (ડી. મેલાનોગાસ્ટર) માં જીવનકાળ પણ વધારે છે. નોન-આલ્કોહોલિક ફેટી લીવર ડિસીઝ (એન. એ. એફ. એલ. ડી.) નોન-આલ્કોહોલિક ફેટી લીવર ડિસીઝ (એન. એ. એફ. એલ. ડી.) ના માઉસ મોડેલોમાં રુબિકોનનું સ્તર વધે છે. હેપેટોસાઇટ્સમાં રુબીકોનની નોકઆઉટ લીવર સ્ટીટોસિસ અને ઓટોફેગીમાં સુધારો કરે છે, જે સૂચવે છે કે રુબીકોન એનએએફએલડી પેથોજેનેસિસમાં ફાળો આપે છે. ચયાપચય રોગ ચરબીયુક્ત પેશીઓમાં રુબીકોન અભિવ્યક્તિનો વય-આધારિત ઘટાડો અતિશય ઓટોફેજિક પ્રવૃત્તિને કારણે ચયાપચયની વિકૃતિઓને વધારી શકે છે. સાલિહ અટાક્સિયા (એસ. સી. એ. આર. 15) રુબીકોનની અંદર એક જ ન્યુક્લિયોટાઇડ વિલોપન પરિવર્તન સાલિહ અટાક્સિયા (ઓ. એમ. આઈ. એમ. આઇ. ડી.: 615705) નું કારણ છે. સાલિહ અટાક્સિયા (જેને સ્પિનોસેરેબેલર અટાક્સિયા, ઓટોસોમલ રીસેસિવ 15 અથવા SCAR15 તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે) એ સ્પિનોસેરેબેલર અટાક્સિયાનું એક સ્વરૂપ છે જે હાથ, ચાલ, વાણી અને આંખની હિલચાલના સંકલનની પ્રગતિશીલ ખોટ દ્વારા વર્ગીકૃત થયેલ છે. આ રોગ પરિવર્તન (c.2624delC p.Ala875ValfsX146) ધરાવતા બાળકોમાં જોવા મળ્યો હતો, જે ફ્રેમશિફ્ટ પરિવર્તન અને એલનાઇન 875 થી શરૂ થતા રુબીકોન-કોડિંગ જનીનમાં ખોટી ખુલ્લી વાંચન ફ્રેમનું કારણ બને છે. સી-ટર્મિનલ ડોમેનના પરિણામી વિક્ષેપથી રબ 7 અને અંતમાં એન્ડોસોમ્સ સાથે રુબિકન સબસેલ્યુલર સ્થાનિકીકરણને નુકસાન થાય છે. આ પણ જુઓ PLEKHM1 RUBCએનએલ (રુબિકોન જેવી) આરએબી7એ બેક્લિન-1 સંદર્ભો