TEDDM1
ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન એપિડિડાઇમલ પ્રોટીન 1 એ TEDDM1 જનીન દ્વારા એન્કોડ કરેલ ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રોટીન છે. TEDDM1 સામાન્ય રીતે TMEM45C તરીકે પણ ઓળખાય છે અને 273 એમિનો એસિડને એન્કોડ કરે છે જેમાં છ આલ્ફા-હેલિક્સ ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રદેશો હોય છે. પ્રોટીનમાં અજ્ઞાત કાર્યનું 118 એમિનો એસિડ લંબાઈ કુટુંબ છે. જ્યારે TEDDM1 નું ચોક્કસ કાર્ય સમજી શકાયું નથી, ત્યારે તે પ્લાઝ્મા પટલનો એક અભિન્ન ઘટક હોવાની આગાહી કરવામાં આવે છે. જીન લોકસ ટી. ઇ. ડી. ડી. એમ. 1 ગુણસૂત્ર 1 પર સ્થિત છે જે માઈનસ એન્ડ પર <આઇ. ડી. 1> પર જોવા મળે છે. TEDDM1 એક જ એક્સોનથી બનેલું છે. ટી. ઈ. ડી. ડી. એમ. 1ના જનીન પડોશમાં ગ્લુટામેટ-એમોનિયા લિગેઝ (જી. એલ. યુ. એલ.), લાંબા ઇન્ટરજેનિક નોન-પ્રોટીન કોડિંગ આર. એન. એ. 272 (એલ. આઈ. એન. સી. 00272) અને શાર્પર-એમ. પી. આર. એ. નિયમનકારી ક્ષેત્ર 13543 (એલ. ઓ. સી. 122149321) નો સમાવેશ થાય છે. અભિવ્યક્તિ TEDDM1 મોટાભાગની મુખ્ય પેશીઓમાં વ્યક્ત થાય છે. જનીન વૃષણમાં ઉચ્ચ સ્તરે અને TEDDM1 અભિવ્યક્તિ સાથે અન્ય તમામ પેશીઓની તુલનામાં હૃદયમાં નીચલા સ્તરે વ્યક્ત થાય છે. મગજમાં, TEDDM1 એમીગડાલા, હિપ્પોકેમ્પસ અને સ્ટ્રેટમમાં વ્યક્ત થાય છે. ઉંદરના મગજમાં, આર. એન. એ. પ્રોબનો ઉપયોગ કરીને સામાન્ય અભિવ્યક્તિ સાથે ટી. ઈ. ડી. ડી. એમ. 1 ની શોધ થઈ હતી. કોષની અંદર, TEDDM1 મુખ્યત્વે પ્લાઝ્મા પટલમાં વ્યક્ત થાય છે. અન્ય પટલ-બંધાયેલા પ્રોટીનની જેમ, TEDDM1 પ્રોટીનમાં અનુમાનિત સંકેત પેપ્ટાઇડ હોય છે, જો કે સંકેત પેપ્ટાઇડનો પ્રકાર અજ્ઞાત છે. કારણ કે TEDDM1 અન્ય ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રોટીન સાથે ઘણી લાક્ષણિકતાઓ વહેંચે છે, આ સૂચવે છે કે સિગ્નલ ટ્રાન્સડક્શન અને પ્રોટીનની હેરફેર જેવી વિવિધ કોષ પ્રક્રિયાઓમાં પ્રોટીનની ભૂમિકા હોઈ શકે છે. જનીન સ્તર નિયમન TEDDM1 ની અભિવ્યક્તિ પેટર્ન સર્વવ્યાપક હતી. મનુષ્યમાં TEDDM1 mRNAની વિપુલતા મધ્યમથી ઓછી હતી. પ્રોટીન ટી. ઈ. ડી. ડી. એમ. 1 પ્રોટીનનું પરમાણુ વજન આશરે 31.3 કે. ડી. એ. છે અને ટી. ઈ. ડી. ડી. એમ. 1 નું સૈદ્ધાંતિક આઇસોઇલેક્ટ્રિક બિંદુ (પી. આઈ.) 8.02 છે. નોંધપાત્ર રીતે, આ અન્ય પ્રોટીનના સરેરાશ પી. આઈ. કરતા અલગ છે કારણ કે તેમનું પી. આઈ. 4-7ની પી. એચ. શ્રેણીમાં આવે છે. આ સૂચવે છે કે TEDDM1 પ્રોટીનમાં મોટાભાગના પ્રોટીનની તુલનામાં મૂળભૂત એમિનો એસિડની અધિકતા હોય છે. ડોમેન્સ TEDDM1 પાસે DUF716 શીર્ષક ધરાવતું અજ્ઞાત કાર્યનું એક મુખ્ય ડોમેન છે. આ ક્ષેત્ર પ્રોટીનના એમિનો એસિડની સ્થિતિ 95 થી 219 સુધી ફેલાયેલું છે. DUF716માં મોટાભાગનું લ્યુસીન ઝિપર હોય છે જે સામાન્ય રીતે પ્રોટીનના ડાયમેરાઇઝેશન સાથે સંકળાયેલું હોય છે. DUF716 પ્રોટીનમાં છમાંથી ત્રણ ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રદેશો પણ ધરાવે છે, અને તેમાં ઉચ્ચ સંરક્ષણના એમિનો એસિડ સેગમેન્ટ્સ હોય છે, જે સૂચવે છે કે DUF716 સંભવતઃ TEDDM1 પ્રોટીન કાર્યમાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવે છે. અનુવાદ પછીના ફેરફારો TEDDM1 ઘણા અનુવાદ પછીના ફેરફારોને આધિન છે. ત્યાં અઢાર અનુમાનિત ફોસ્ફોરાયલેશન સ્થળો છે. અન્ય ચોક્કસ સ્થળોમાં એન-ગ્લાયકોસિલેશન સાઇટ, કેસીન કિનેઝ II ફોસ્ફોરાયલેશન સાઇટ, લ્યુસીન ઝિપર પેટર્ન, બે એન-મિરિસ્ટિલેશન સાઇટ્સ અને ત્રણ પ્રોટીન કિનેઝ સી ફોસ્ફોરાયલેશન સાઇટ્સનો સમાવેશ થાય છે. એન-ગ્લાયકોસિલેશન એ પટલ પ્રોટીનનું બીજું લાક્ષણિક લક્ષણ છે અને તે સ્ત્રાવ અને સાયટોસ્કેલેટલ સંસ્થામાં સામેલ છે. કેસિન કિનેઝ II પ્રોટીન સ્થિરતા અને કોષ સંકેત પ્રતિભાવ સાથે સંકળાયેલ છે. લ્યુસીન ઝિપર્સ એ અનુક્રમ પ્રણાલીઓ છે જે પ્રોટીન-પ્રોટીનની ક્રિયાપ્રતિક્રિયાને સરળ બનાવે છે. એન-મિરિસ્ટિલેશન સાઇટ્સ લિગાન્ડ બંધન અને પ્રોટીન ગતિશીલતામાં સામેલ છે. પ્રોટીન કિનેઝ સી ફોસ્ફોરાયલેશન કોષ પ્રસાર અને જનીન અભિવ્યક્તિના નિયમન સાથે સંબંધિત છે. માળખું TEDDM1 નું ગૌણ માળખું એન-ટર્મિનસ પર મુક્ત રેન્ડમ કોઇલ અને એક જ આલ્ફા હેલિક્સથી શરૂ થાય છે. ટી. ઈ. ડી. ડી. એમ. 1 માં છ ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રોટીન માળખાકીય રીતે સમાન આલ્ફા હેલિસીસ તરીકે વર્ગીકૃત થયેલ છે. પ્રોટીનનો આ વિસ્તાર એન-ટર્મિનસની તુલનામાં ખૂબ જ ઘનીકરણ છે. આલ્ફા હેલિસીસમાં સામાન્ય રીતે મુખ્યત્વે હાઇડ્રોફોબિક અવશેષો હોય છે, જે પ્લાઝ્મા પટલમાં સ્થિત આ પ્રદેશો સાથે સંરેખિત થાય છે. આલ્ફા હેલિસીસ પણ સામાન્ય રીતે ડીએનએ બંધનકર્તા પ્રણાલીઓ સાથે સંકળાયેલા છે. હોમોલોજી/ઇવોલ્યુશન પેરાલોગ્સ TEDDM1 બે જાણીતા પેરાલોગ્સ ધરાવે છે, TMEM45A અને TMEM45B. માનવ જનીન TEDDM1 માટે 100 થી વધુ ઓર્થોલોગ અસ્તિત્વ ધરાવે છે. આ જાણીતા ઓર્થોલોગ્સમાંથી તેઓ માત્ર સસ્તન પ્રાણીઓ, ઉભયજીવીઓમાં અસ્તિત્વ ધરાવતા હોવાનું જણાયું હતું અને મળી આવેલા તમામ ઓર્થોલોગ્સની fish.The વિચલન તારીખની સરખામણી હોમો સેપિયન્સ સાથે કરવામાં આવી હતી. માછલી ટી. ઈ. ડી. ડી. એમ. 1 એ માનવ ટી. ઈ. ડી. ડી. એમ. 1 સાથે સૌથી વધુ દૂરથી સંબંધિત ઓર્થોલોગ છે, જેમાં વિચલનની સૌથી દૂરની સરેરાશ તારીખ 46.4 કરોડ વર્ષ પહેલાંની છે. જ્યારે TEDDM1 માટે ઓર્થોલોગ્સ હાડકાની માછલીમાં અસ્તિત્વ ધરાવે છે, જેમ કે પ્રોટોપ્ટેરસ એનેક્ટેન્સમાં તેના અસ્તિત્વ દ્વારા પુરાવા મળે છે, જનીનના ઓર્થોલોગ્સ કાર્ટિલાજિનસ માછલીમાં વધુ વારંવાર જોવા મળતા હતા. ઉત્ક્રાંતિ TEDDM1 ના પરમાણુ ઉત્ક્રાંતિનો સંબંધિત દર ફાઈબ્રિનોજેન આલ્ફા જેવો જ હતો અને સાયટોક્રોમ સી. ઇન્ટરેક્ટિંગ પ્રોટીનના ઉત્ક્રાંતિ દર કરતાં ઘણો વધુ ઝડપી હતો. ક્લિનિકલ મહત્વ અગાઉના કેન્સર સંશોધન અભ્યાસો અનુસાર, જનીન-આધારિત સંગઠનના વિશ્લેષણમાં જાણવા મળ્યું છે કે જી. એલ. યુ. એલ. સાથે ટી. ઈ. ડી. ડી. એમ. 1 એ હીપેટાઇટિસ બી વાયરસ સંબંધિત હેપેટોસેલ્યુલર કાર્સિનોમા સાથે સૌથી વધુ નોંધપાત્ર રીતે સંકળાયેલા બે જનીનો છે, જે યકૃતના કેન્સરનું સૌથી સામાન્ય સ્વરૂપ છે. કેરાટિનોસાઇટ્સ સાથે તેની સંડોવણી અને ગર્ભ પ્રત્યારોપણ અને વિકાસના મહત્વપૂર્ણ નિયમનકાર માઇક્રોઆરએનએ-31ના અવરોધને કારણે પણ ટીઈડીડીએમ1નું નોંધપાત્ર તબીબી મહત્વ છે. સંદર્ભો