Rubicon homology domain
રુબીકોન હોમોલોજી ડોમેન (જેને આર. એચ. ડોમેન તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે) એ આશરે 250 એમિનો એસિડનું ઉત્ક્રાંતિથી સંરક્ષિત પ્રોટીન ડોમેન છે જે પ્રોટીન-પ્રોટીન ક્રિયાપ્રતિક્રિયામાં મધ્યસ્થી કરે છે. ઓટોફેગી અને એન્ડોસોમલ ટ્રાફિકિંગના નિયમનમાં સામેલ કેટલાક માનવ પ્રોટીનમાં આર. એચ. ડોમેન્સ હાજર છે. જ્યારે તમામ આર. એચ. ડોમેન્સની લાક્ષણિકતા દર્શાવવામાં આવી નથી, ત્યારે માનવ રુબીકોન અને પી. એલ. ઇ. કે. એચ. એમ. 1 નાના જી. ટી. પી. એસ. રબ 7 સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયામાં મધ્યસ્થી કરે છે, જે અંતમાં એન્ડોસોમ્સ અને ઓટોફેગોસોમ્સ પર જોવા મળે છે. આરએચ ડોમેન્સમાં 16 સંરક્ષિત સિસ્ટીન અને હિસ્ટિડાઇન અવશેષો હોય છે જે ઝિંક પરમાણુઓને જોડે છે અને ઓછામાં ઓછા 4 ઝિંક ફિંગર મોટિફ બનાવે છે. રુબિકોનના આર. એચ. ક્ષેત્રના સી-ટર્મિનસ તરફના એમિનો એસિડ અવશેષો રબ 7 સાથેની ક્રિયાપ્રતિક્રિયા માટે આવશ્યક હોવાનું દર્શાવવામાં આવ્યું છે. રચના રબ 7 સાથેના સંકુલમાં રુબીકોન આર. એચ. ક્ષેત્રની 3ડી અણુ રચના એક્સ-રે ક્રિસ્ટલોગ્રાફી દ્વારા નક્કી કરવામાં આવી છે. આરએચ ડોમેનનું માળખું "એલ" આકાર ધરાવે છે, જેમાં "એલ" નો આધાર રબ 7 ના સ્વિચ પ્રદેશો સાથે સંપર્ક કરે છે. આ માળખું મુખ્યત્વે આલ્ફા હેલિકલ છે, જેમાં ઝિંક ફિંગર મોટિફ્સની નજીકમાં ટૂંકા બીટા સ્ટ્રાન્ડ પ્રદેશો હાજર છે. રુબીકોન આરએચ ડોમેનનો એન-ટર્મિનલ વિસ્તાર એફવાયવીઇ ડોમેન જેવો દેખાય છે, જો કે પીઆઇ3પીના કેનોનિકલ એફવાયવીઇ ડોમેન બંધન માટે જરૂરી મૂળભૂત અવશેષો હાજર નથી. આર. એચ. ડોમેન આર. એચ. ડોમેન્સ ધરાવતા પ્રોટીન સંખ્યાબંધ પ્રોટીનમાં જોવા મળે છે, જેમાં (મનુષ્યમાં): રુબિકોન, પ્રોટીનના આર. એચ. ડોમેન ધરાવતા પરિવારના વ્યાખ્યાયિત સભ્ય અને ઓટોફેગી પી. એલ. ઇ. કે. એચ. એમ. 1 નું નકારાત્મક નિયમનકાર, ઓસ્ટીયોપેટ્રોસિસ પેસરમાં સંકળાયેલ પ્રોટીન, ઓટોફેગી ડી. ઇ. એફ. 8 નું સકારાત્મક નિયમનકાર, લાઇસોસોમ પેરિફેરલ વિતરણ પી. એલ. ઇ. કે. એચ. એમ. 3 નું નિયમનકાર, જે હાડપિંજરના સ્નાયુઓના તફાવતમાં સામેલ છે.