Group III pyridoxal-dependent decarboxylases
મોલેક્યુલર બાયોલોજીમાં, ગ્રુપ III પાયરિડોક્સલ-આશ્રિત ડીકાર્બોક્સિલેસ એ બેક્ટેરિયલ ઉત્સેચકોનું એક કુટુંબ છે જેમાં ઓર્નિથિન ડીકાર્બોક્સિલેસ, લાઇસિન ડીકાર્બોક્સિલેસ અને આર્જિનિન ડીકાર્બોક્સિલેસનો સમાવેશ થાય છે. પાયરિડોક્સલ-5 '-ફોસ્ફેટ-આધારિત એમિનો એસિડ ડેકાર્બોક્સિલેઝને એમિનો એસિડ ક્રમના આધારે ચાર જૂથોમાં વિભાજિત કરી શકાય છે. ગ્રુપ III માં પ્રોકેરીયોટિક ઓર્નિથિન અને લાઇસિન ડીકાર્બોક્સિલેઝ અને પ્રોકેરીયોટિક બાયોડિગ્રેડેટિવ પ્રકારના આર્જિનિન ડીકાર્બોક્સિલેઝનો સમાવેશ થાય છે. માળખું આ ઉત્સેચકો કેટલાક સંરક્ષિત ક્ષેત્રો ધરાવે છે. એન-ટર્મિનલ ડોમેનમાં ફ્લેવોડોક્સિન જેવી ગડી હોય છે, અને એકંદર 3D માળખામાં તેની સ્થિતિને કારણે તેને "વિંગ" ડોમેન કહેવામાં આવે છે. લેક્ટોબેસિલસ 30એ (એલ30એ ઓર્ન્ડડીસી) માંથી ઓર્નિથિન ડીકાર્બોક્સિલેઝ એ મોટા, પાયરિડોક્સલ-5 '-ફોસ્ફેટ-આધારિત ડીકાર્બોક્સિલેઝનું પ્રતિનિધિત્વ કરે છે જે લાઇસિન, આર્જિનિન અથવા ઓર્નિથિન પર કાર્ય કરે છે. L30a ઓર્ન્ડિસિનું સ્ફટિક માળખું 3 A રીઝોલ્યુશનમાં ઉકેલવામાં આવ્યું છે. C6 સમપ્રમાણતા દ્વારા સંબંધિત સિક્સ ડાયમર્સ ઉત્સેચકીય રીતે સક્રિય ડોડેકેમર (આશરે 106 Da) ની રચના કરે છે. L30a OrnDC ના દરેક મોનોમરને પાંચ ક્રમિક ફોલ્ડિંગ ડોમેન્સની દ્રષ્ટિએ વર્ણવી શકાય છે. એમિનો-ટર્મિનલ ડોમેન, અવશેષો 1 થી 107, "વિંગ" ડોમેન તરીકે ઓળખાતી પાંચ-ફસાયેલી બીટા-શીટ ધરાવે છે. દરેક ડાયમરના બે વિંગ ડોમેન્સ ડોડેકેમરના કેન્દ્ર તરફ અંદરની તરફ પ્રોજેક્ટ કરે છે અને ડોડેકેમર સ્થિરીકરણમાં ફાળો આપે છે. મુખ્ય ક્ષેત્રમાં સંરક્ષિત લાઇસિન અવશેષો છે, જે પાયરિડોક્સલ-ફોસ્ફેટ જૂથના જોડાણનું સ્થળ છે. ગ્રૂપ I પાયરિડોક્સલ-આધારિત ડીકાર્બોક્સિલેસ ગ્રૂપ II પાયરિડોક્સલ-આધારિત ડીકાર્બોક્સિલેસ ગ્રૂપ IV પાયરિડોક્સલ-આધારિત ડીકાર્બોક્સિલેસ સંદર્ભો પ્રોટીન ડોમેન્સ પણ જુઓ.