Interferon-inducible GTPase 5
ઇન્ટરફેરોન-ઇન્ડ્યુસિબલ જી. ટી. પી. એસ. 5 જેને રોગપ્રતિકારક શક્તિ-સંબંધિત જી. ટી. પી. એસ. સિનેમા 1 (આઈ. આર. જી. સી. 1) તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે તે એક એન્ઝાઇમ છે જે મનુષ્યમાં આઈ. આર. જી. સી. જનીન દ્વારા કોડેડ છે. તે p47-GTPase-જેવા અને IRG પરિવારોમાં અન્ય પ્રોટીનની જેમ વર્તે તેવી આગાહી કરવામાં આવી છે. તે વૃષણમાં સૌથી વધુ વ્યક્ત થાય છે. જીન આઈ. આર. જી. સી. રંગસૂત્ર 19 પર સ્થિતિ 19q13.31 પર સ્થિત છે અને તેમાં બે એક્સોન છે. તે ફોરવર્ડ સ્ટ્રાન્ડ પર છે અને ફોસ્ફોલિપેઝ એ2 ઇન્હિબિટર અને લાઇ6/પીએલએયુઆર ડોમેન-ધરાવતી પ્રોટીન-લાઈક (એલઓસી105372412) ની ઉપરની તરફ અને નોનસેન્સ મેડિએટેડ એમઆરએનએ ડિકે ફેક્ટર (એસએમજી9) ની નીચેની તરફ છે. હોમોલોજી અને ઇવોલ્યુશન પેરાલોગ આઈ. આર. જી. સી. માટે આઈ. આર. જી. એમ. નામનો એક પેરાલોગ છે. IRGM, અથવા રોગપ્રતિકારક શક્તિ સંબંધિત GTPase M, અંતઃકોશિક સંરક્ષણ સાથે સંકળાયેલ છે. બંને p47-GTPase જેવા પરિવાર અને P-લૂપ NTPase ડોમેન સુપર ફેમિલીનો ભાગ છે. પેરાલોગ આઈ. આર. જી. સી. ની 12 ટકા ઓળખ ધરાવે છે. ઓર્થોલોગ્સ આઈ. આર. જી. સી. બધા કરોડઅસ્થિધારી પ્રાણીઓમાં સંરક્ષિત હોવાનું જોવા મળ્યું હતું. જી. ટી. પી./મેગ્નેશિયમ અને પોલિપેપ્ટાઇડ બંધનકર્તા પ્રદેશો અને ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રદેશ પ્રજાતિઓ વચ્ચે વાજબી રીતે સંરક્ષિત છે. 500 મિલિયન વર્ષોથી દરેક જનીન માટે સમાન પ્રજાતિઓની ટકાવારી ઓળખની સરખામણી કરતી વખતે ઇવોલ્યુશન આઈ. આર. જી. સી. સાયટોક્રોમ સી અને β-હિમોગ્લોબિન કરતાં વધુ ઝડપથી વિકસિત થવાની આગાહી કરવામાં આવી છે. સંભવ છે કે આઈ. આર. જી. સી. અને આઈ. આર. જી. એમ. 350 થી 375 મિલિયન વર્ષો પહેલા અલગ થયા હતા. ટ્રાન્સક્રિપ્શન પ્રમોટર એક પ્રમોટર ક્ષેત્ર હતું, GXP _ 311825, જે રંગસૂત્ર 19 પર IRGC માટે મળી આવ્યું હતું. તે 1521 આધાર જોડી લાંબી છે અને આધાર જોડી 43714694 થી શરૂ થાય છે. તે પરીક્ષણ કરાયેલા તમામ 7 ઓર્થોલોગસ સિક્વન્સ પર સંરક્ષિત છે અને 8.090 ટી. પી. એમ. પર વૃષણ સાથે સૌથી વધુ જોડાણ ધરાવે છે. છ સંભવિત લખાણોમાં, GXT _ 26231691 પાસે સૌથી વધુ CAGE ટેગ હતા. ટેસ્ટિસને 873 CAGE ટૅગ્સમાંથી 839 પર લેબલ કરવામાં આવ્યું હતું. આઈ. આર. જી. સી. માટે સૌથી સામાન્ય ટ્રાન્સક્રિપ્ટ 1596 બેઝ જોડી લાંબી છે અને તેમાં જોડાણ નંબર NM _ 019612 છે. અન્ય લખાણોમાં આઇસોફોર્મ X1, XM _005259058, આઇસોફોર્મ X2, XM _ 011527118, અને આઇસોફોર્મ X3, XM _ 006723283 નો સમાવેશ થાય છે. પ્રોટીન બાયોકેમિસ્ટ્રી ઇન્ટરફેરોન-ઇન્ડ્યુસિબલ જીટીપેઝ 5 એ 463 એમિનો એસિડ લાંબા છે, તેનું પરમાણુ વજન 50.3 કેડીએ છે, અને અનુમાનિત આઇસોઇલેક્ટ્રિક બિંદુ 5.22 છે. સિગ્નલ પેપ્ટાઇડ હોવાની શક્યતા નથી. અવશેષો 364 અને 384 વચ્ચે ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રદેશની ખૂબ આગાહી કરવામાં આવે છે, જેમાં ક્રમનો પ્રથમ વિભાગ પટલની બહાર અને બીજો વિભાગ પટલની અંદર હોય છે. ગૌણ માળખું પ્રોટીનની ગૌણ માળખામાં બીટા શીટ્સ કરતાં વધુ આલ્ફા હેલિસીસ હોવાની અપેક્ષા છે, ક્લોઝ ઓર્થોલોગ્સમાં અત્યંત સમાન ગૌણ માળખાં હોવાનું જોવા મળ્યું હતું. તૃતીય માળખું સંબંધિત એક્સ-રે ક્રિસ્ટલોગ્રાફી માળખાઓ સાથે તૃતીય માળખાની આગાહી કરી શકાય છે. પ્રોટીન માટે એક હિટ હતી, લિગપ 1 [મ્યુસ મસ્ક્યુલસ], જેનું ઇ-મૂલ્ય 2ઇ-76 હતું અને પ્રોટીન ક્રમના 82 ટકાથી વધુ 34 ટકા ઓળખ હતી. અનુવાદ પછીના ફેરફારો પ્રોટીન જી. ટી. પી. અને મેગ્નેશિયમ બંધનકર્તા હોવાની અપેક્ષા છે કારણ કે તેમાં ઘણી સંબંધિત બંધનકર્તા સાઇટ્સ છે. તેણે અવશેષો 153 અને 163 વચ્ચે પોલિપેપ્ટાઇડ બંધન માટે હોમોડિમર ઇન્ટરફેસ પ્રદેશોની પણ આગાહી કરી છે. સેર247 અને સેર304 ખાતે બે સંભવિત ફોસ્ફીન ક્રિયાપ્રતિક્રિયા સ્થળો છે. સમગ્ર ક્રમમાં સેરીન અને થોડા થ્રેઓનાઇન પર ફોસ્ફોરાયલેશન સામાન્ય હોવાની અપેક્ષા છે, જો કે અવશેષ 330 પછી વધુ થવાની સંભાવના છે. કેટલીક ગ્લાયોસિલેશન અને ગ્લાયકેશન સાઇટ્સની આગાહી કરવામાં આવી છે, જોકે કેટલીક આગાહીઓ સંભવિત ફોસ્ફોરાયલેશન સાઇટ્સ સાથે ઓવરલેપ થાય છે. સબસેલ્યુલર સ્થાન પ્રોટીન બિન-સાયટોપ્લાઝમિક હોઈ શકે છે, જોકે આ સમયે વધુ સ્થાનિકીકરણ અજ્ઞાત છે. ક્લિનિકલ સિગ્નિફિકન્સ એક્સપ્રેશન ઇન્ટરફેરોન-ઇન્ડ્યુસિબલ જીટીપેઝ 5 વૃષણમાં સૌથી વધુ વ્યક્ત થાય છે. બે એન્ટિબોડીઝ (HPA046769 અને HPA060064) નો ઉપયોગ ગોળાકાર શુક્રાણુઓ કરતાં વિસ્તરેલ શુક્રાણુઓમાં ઉચ્ચ અભિવ્યક્તિ દર્શાવે છે. લેડિગ કોષો, શુક્રાણુ અને પ્રીલેપ્ટોટિન શુક્રાણુના કોષોમાં અભિવ્યક્તિ ઓછી હોવાનું નોંધાયું હતું. ડ્યુઓડેનમ, નાના આંતરડાના, એપેન્ડિક્સ અને કિડનીમાં બંને એન્ટિબોડીઝ સાથે નીચાથી મધ્યમ અભિવ્યક્તિ જોવા મળી હતી. માયોસાઇટ્સ અને થાઇરોઇડ, પેરાથાઇરોઇડ અને મૂત્રપિંડની ગ્રંથીઓમાં કેટલીક અભિવ્યક્તિ હોઈ શકે છે. કેન્સરની સ્થિતિમાં પેથોલોજી એક્સપ્રેશનમાં ઘટાડો જોવા મળ્યો છે. 3 'અને 5' યુ. ટી. આર. અને કોડિંગ ક્ષેત્રની અંદર ટ્રાન્સક્રિપ્ટ ભિન્નતા સાથે અજ્ઞાત તબીબી જોડાણ છે. સંદર્ભો વધુ વાંચન ઇસી 3.6.5