'The All-Species Living Tree' Project
ઓલ-સ્પીશીઝ લિવિંગ ટ્રી પ્રોજેક્ટ એ એ. આર. બી., સિલ્વા આર. આર. એન. એ. ડેટાબેઝ પ્રોજેક્ટ અને એલ. પી. એસ. એન. જેવા વિવિધ શૈક્ષણિક જૂથો/સંસ્થાઓ વચ્ચેનો સહયોગ છે, જેનો ઉદ્દેશ બેક્ટેરિયા અને આર્કિયાની તમામ માન્ય રીતે પ્રકાશિત પ્રજાતિઓના 16 એસ આર. આર. એન. એ. સિક્વન્સનો ડેટાબેઝ એકત્ર કરવાનો છે. એક તબક્કે, 23S સિક્વન્સ પણ એકત્રિત કરવામાં આવ્યા હતા, પરંતુ ત્યારથી આ બંધ થઈ ગયું છે. હાલમાં સંરેખિત ડેટાસેટમાં 10,950 થી વધુ પ્રજાતિઓ છે અને નવી પ્રજાતિઓ શોધવામાં આવે છે અથવા ડેટાબેઝમાં રજૂ ન થતી પ્રજાતિઓ અનુક્રમિત કરવામાં આવે છે ત્યારે કેટલીક વધુ પ્રજાતિઓ ઉમેરવામાં આવી રહી છે. શરૂઆતમાં બીજા જૂથમાં 7 ટકા પ્રજાતિઓ હતી. સમાન (અને વધુ તાજેતરના) પ્રોજેક્ટ્સમાં જીનોમિક એન્સાયક્લોપેડિયા ઓફ બેક્ટેરિયા એન્ડ આર્કિયા (જીઇબીએ) નો સમાવેશ થાય છે, જે બેક્ટેરિયા અને આર્કિયાના સંપૂર્ણ જીનોમ સિક્વન્સિંગ પર કેન્દ્રિત છે. વૃક્ષ બુટસ્ટ્રેપ વિના મહત્તમ સંભાવના વિશ્લેષણ દ્વારા બનાવવામાં આવ્યું હતુંઃ પરિણામે કદ માટે ચોકસાઈનો વેપાર કરવામાં આવે છે અને ઘણા ફાયલમ સ્તરના ક્લેડ્સનું યોગ્ય રીતે નિરાકરણ કરવામાં આવતું નથી (જેમ કે ફર્મિક્યુટ્સ). (યુકેરીયોટ્સ વિશ્લેષણમાં હાજર નથી). આ ફિલોજેની એ 16S rRNA આધારિત LTP _ 01 _ 2022 નો સારાંશ છે અને તેમાં જાન્યુઆરી 2022 સુધી માન્ય રીતે પ્રકાશિત નામો સાથેની તમામ પ્રકારની પ્રજાતિઓ છે. બેક્ટેરિયલ ફાયલાનો શાખા ક્રમ (વોઇસ, 1987) બેક્ટેરિયલ ફાયલાની શાખા ક્રમ (ગુપ્તા, 2001) બેક્ટેરિયલ ફાયલાની શાખા ક્રમ (કેવેલિયર-સ્મિથ, 2002) બેક્ટેરિયલ ફાયલાની શાખા ક્રમ (રેપ્પે અને જિયોવાનોની, 2003) બેક્ટેરિયલ ફાયલાની શાખા ક્રમ (બેટિસ્ટુઝી એટ અલ., 2004) બેક્ટેરિયલ ફાયલાની શાખા ક્રમ (સિકેરેલી એટ અલ., 2006) બેક્ટેરિયલ ફાયલાની શાખા ક્રમ (જીનોમ ટેક્સોનોમી ડેટાબેઝ, 2018) બેક્ટેરિયલ ફાયલા લિસ્ટ ઓફ આર્કિયા જેનેરા લિસ્ટ ઓફ બેક્ટેરિયલ જેનેરા ઓર્ડર એલ. પી. એસ. એન., સ્વીકૃત બેક્ટેરિયલ અને આર્કિયલ નામોની સૂચિ