Atromentin
એટ્રોમેન્ટિન એ એક કુદરતી રાસાયણિક સંયોજન છે જે અગરિકોલીસ અને થેલેફોરેલ્સ ક્રમમાં અગરિકોમાઇસેટ્સ ફૂગમાં જોવા મળે છે. તે પ્રયોગશાળાના સંશ્લેષણ દ્વારા પણ તૈયાર કરી શકાય છે. રાસાયણિક રીતે, તે પોલિફીનોલ અને બેન્ઝોક્વિનોન છે. ક્લાયટોસાઇબ સબિલુડેન્સની સંસ્કૃતિમાં અને હાઇડનેલમ પેકીના અર્કમાં એટ્રોમેન્ટિન જોવા મળે છે. તેના જૈવસંશ્લેષણમાં પ્રથમ ઉત્સેચકો ટેપિનેલા પેનુઓઇડ્સમાં દર્શાવવામાં આવ્યા છે. તેમાંથી એકને એટ્રોમેન્ટિન સિન્થેટેઝ કહેવામાં આવે છે. એટ્રોમેન્ટિનની સંખ્યાબંધ સંભવિત જૈવિક પ્રવૃત્તિઓનો ઈન વિટ્રોમાં અભ્યાસ કરવામાં આવ્યો છે. એટ્રોમેન્ટિન ઈન વિટ્રો એન્ટીબેક્ટેરિયલ પ્રવૃત્તિ ધરાવે છે, જે સ્ટ્રેપ્ટોકોકસ ન્યુમોનિયા બેક્ટેરિયામાં એન્ઝાઇમ એનોયલ-એસાઇલ કેરિયર પ્રોટીન રિડક્ટેઝ (ફેટી એસિડ્સના જૈવસંશ્લેષણ માટે જરૂરી) ને અટકાવે છે. એટ્રોમેન્ટિન એક સરળ સ્નાયુ ઉત્તેજક હોવાનું દર્શાવવામાં આવ્યું છે. તે અલગ માનવ લ્યુકેમિયા U937 કોષોમાં એપોપ્ટોસિસને પણ પ્રેરિત કરે છે. તે એક એન્ટીકોએગ્યુલેન્ટ પણ છે. એટ્રોમેન્ટિનનો આનુવંશિક અને ઉત્સેચકીય આધાર 4-હાઇડ્રોક્સિફિનાઇલપાયરુવિક એસિડ (4-એચ. પી. પી.) ના બે એકમોમાંથી બિન-રાઇબોસોમલ પેપ્ટાઇડ સિન્થેટેઝ જેવા એન્ઝાઇમ (એટ્રોમેન્ટિન સિન્થેટેઝ) દ્વારા જૈવસંશ્લેષિત થાય છે, જેમાં ડોમેન આર્કિટેક્ચર એડેનાઇલેશન-થિયોલેશન-થિયોએસ્ટેરેઝ (એ-ટી-ટીઇ) હોય છે. 4-એચ. પી. પી. એ એમિનોટ્રાન્સફેરેઝ દ્વારા ડીએમિનેશનમાંથી ઉત્પન્ન થાય છે. આ બે જનીનોનો આનુવંશિક આધાર સમૂહબદ્ધ છે (એટલે કે, એક બીજાને અડીને). આ ઉત્સેચકો સૌપ્રથમ ટેપિનેલા પેનુઓઇડ્સમાં ઇ. કોલીમાં સંબંધિત જનીનો (એ. ટી. આર. એ. અને એ. ટી. આર. ડી.) ને વધુ પડતા અભિવ્યક્ત કરીને અને એટ્રોમેન્ટિનની રચનાનું નિરીક્ષણ કરવા માટે 4-એચ. પી. પી. સાથે હોલો-ઉત્સેચકનું સેવન કરીને દર્શાવવામાં આવ્યા હતા. આ પછી સુઇલસ ગ્રેવિલેઇમાં એન્ઝાઇમ ગ્રેએ, પેક્સિલસ ઇન્વોલ્યુટસમાં છ (આઈએનવીએ1-6, જેમાંથી આઈએનવીએ1,2 અને 5 કાર્યરત હતા) અને સેર્પુલા લેક્રિમન્સમાંથી એનપીએસ3નું લાક્ષણિકતા નિરૂપણ કરવામાં આવ્યું હતું. વધુમાં, આલ્કોહોલ ડિહાઇડ્રોજિનેઝ/ઓક્સિડોરિડક્ટેઝ માટે અન્ય સંલગ્ન અને સંરક્ષિત જનીન એન્કોડિંગ છે જેનું કાર્ય અસ્પષ્ટ છે. મોટાભાગના કિસ્સાઓમાં ક્લસ્ટર્ડ બાયોસિન્થેટિક જનીનો બેસિડિઓમાઇસેટ્સમાં ઓર્થોલોગસ જોવા મળે છે. 23 જુદા જુદા એટ્રોમેન્ટિન-ઉત્પાદક બેસિડિઓમાઇસેટ્સના એટ્રોમેન્ટિન સિન્થેટેઝ અને એમિનોટ્રાન્સફેરેઝ વચ્ચે એક સામાન્ય પ્રમોટર થીમ વહેંચાયેલી જોવા મળી હતી, જે લગભગ તમામ કિસ્સાઓમાં આલ્કોહોલ ડિહાઇડ્રોજનેઝથી ગેરહાજર હતી, જે બે આવશ્યક જનીનોના સહ-નિયમનને સૂચવે છે જે સામાન્ય ટ્રાન્સક્રિપ્શન પરિબળ દ્વારા એટ્રોમેન્ટિનના ઉત્પાદનને સુનિશ્ચિત કરે છે. એક્ટોમિકોરિહઝે માટે એટ્રોમેન્ટિન જનીનોની અગાઉના વધારાના પ્રોત્સાહક પ્રધાનતત્ત્વોની ઓળખ કરવામાં આવી હતી જે ભૂરા રંગના સડોમાંથી ગેરહાજર હતા, જે એટ્રોમેન્ટિનના અસમાન આનુવંશિક નિયમનને સૂચવે છે. એસ. લેક્રિમન્સમાંથી એટ્રોમેન્ટિન સિન્થેટેઝ અને એમિનોટ્રાન્સફેરેઝ માટેના જનીનોને બેક્ટેરિયા સાથે સહ-સેવન દરમિયાન નિયમન કરવામાં આવ્યા હતા. બાયોસિંથેસિસ માટે એમિનો એસિડ નોનરીબોસોમલ કોડ નોનરીબોસોમલ પેપ્ટાઇડ સિન્થેટેઝ જેવા એન્ઝાઇમ (એટ્રોમેન્ટિન સિન્થેટેઝ) કે જે 4-એચ. પી. પી. ના બે મોનોમર્સને સમપ્રમાણતાથી ઘનીકરણ કરે છે તેમાં એડેનાઇલેશન ડોમેન હોય છે જે ઉત્પ્રેરણ પહેલાં સબસ્ટ્રેટ્સને સ્વીકારે છે. સ્વીકારનાર ડોમેનમાં 10 એમિનો એસિડ કોડ હોય છે જે નોનરીબોસોમલ કોડ (NRPS કોડ) તરીકે ઓળખાય છે. અહીં, સ્યુઇલ્સ ગ્રેવિલે, જી. આર. એ. માંથી એટ્રોમેન્ટિન સિન્થેટેઝનું ઉદાહરણ વપરાય છે. કોડ એમિનો એસિડ સ્થાનો 235 (V), 236 (A), 239 (E), 278 (F), 299 (S), 301 (G), 322 (G), 320 (A), 331 (C), 517 (K) પર જોવા મળે છે. કોડ એસ. લેક્રિમન્સ (એન. પી. એસ. 3), ટેપિનેલા પેનુઓઇડ્સ (એ. ટી. આર. એ.) અને પેક્સિલસ ઇન્વોલ્યુટસ (આઈ. એન. વી. એ.) ના એટ્રોમેન્ટિન સિન્થેટેસ સાથે સંરેખિત થાય છે. તેવી જ રીતે, એટ્રોમેન્ટિન ઉત્પાદન માટેનો NRPS કોડ અન્ય સુગંધિત આલ્ફા-કેટો એસિડ-વ્યુત્પન્ન સંયોજનો માટે સાર્વત્રિક કોડને ટેકો આપે છે, જેમ કે એલ-ફેનિલેલાનિન જેવા કે રાલ્ફુરાનોન બી મારફતે ફેનિલપાયરુવિક એસિડ, અને એલ-ટ્રિપ્ટોફેન જેવા કે ડિડેમિથાઇલ એસ્ટરિક્વિનોન ડી મારફતે ઇન્ડોલ-3-પાયરુવિક એસિડ (નોટ એટ્રોમેન્ટિન સુગંધિત આલ્ફા-કેટો એસિડ એલ-ટાયરોસિનમાંથી 4-હાઇડ્રોક્સિફેનિલપાયરુવિક એસિડ દ્વારા મેળવવામાં આવે છે). પેક્સિલસ ઇન્વોલ્યુટસના આઈ. એન. વી. એ. માટે, થિયોએસ્ટેરેસ ડોમેન (છેલ્લું ડોમેન) માં એક સામાન્ય એમિનો એસિડ મોટિફ પણ જોવા મળ્યું હતું, જે એરોમેન્ટિનની રચનાને પૂર્ણ કરવા માટે એન્ઝાઇમ કાર્યરત છે કે નહીં તેના બાયોકેમિકલ ડેટાને ટેકો આપે છે. એટ્રોમેન્ટિનનું જૈવસંશ્લેષણ સુગંધિત એમિનો એસિડ એલ-ટાયરોસિન એ 4-હાઇડ્રોક્સિફિનાઇલપાયરુવિક એસિડનું પુરોગામી છે, અને 4-એચ. પી. પી. ના 2 એકમો એટ્રોમેન્ટિન બનાવવા માટે ઘનીકરણ થાય છે. પ્રારંભિક પગલું એ એમિનોટ્રાન્સફેરેઝ દ્વારા ડીએમિનેશન છે. બીજું પગલું નોનરીબોસોમલ પેપ્ટાઇડ સિન્થેટેઝ જેવા એન્ઝાઇમ દ્વારા ઉત્પ્રેરિત થાય છે (એનઆરપીએસ-જેવું, કારણ કે તેમાં કેનોનિકલ કન્ડેન્સેશન ડોમેન નથી, જેને એટ્રોમેન્ટિન/ક્વિનોન સિન્થેટેઝ કહેવાય છે). આ એન. આર. પી. એસ. જેવા ઉત્સેચકનું એડેનાઈલેશન ડોમેન એ. ટી. પી.-પી. પી. આઈ.-એક્સચેન્જ એસે દ્વારા નિર્ધારિત 4-એચ. પી. પી. સ્વીકારે છે. એન્ઝાઇમ, જ્યારે ઇ. કોલીમાં ઉત્પન્ન થાય છે, ત્યારે તેને ફોસ્ફોપાન્ટેથેઇનિલ ટ્રાન્સફર (પેન્ટ) દ્વારા તેના હોલો સ્વરૂપમાં પ્રાથમિક બનાવવાની જરૂર છે, જો કે ઇ. કોલી વિવો પ્રાઇમમાં એપો-એન્ઝાઇમ (દા. ત.) કરી શકે છે. એન્ટડી દ્વારા). એ. નિડુલન્સમાંથી મેળવેલા સી. ડી. એન. એ. માંથી પેન્ટનો સફળતાપૂર્વક ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો છે. એન. પી. જી. એ.), સ્ટ્રેપ્ટોમાઇસીસ વર્ટીસીલસ (એસ. વી. પી.), અને પેક્સિલસ ઇન્વોલ્યુટસ (પી. પી. ટી. એ.). કેટલાક અભ્યાસો, ખાસ કરીને બિગિન્સ એટ અલ દ્વારા બેક્ટેરિયમ બુર્ખહોલ્ડેરિયા થાઇલેન્ડન્સિસમાંથી, દર્શાવ્યું છે કે એમિનોટ્રાન્સફેરેઝ જનીન ગેરહાજર હોઈ શકે છે, અને આ પ્રવૃત્તિ તેના પ્રાથમિક ચયાપચય દ્વારા પૂરી પાડી શકાય છે. કોન્જેનર રંગદ્રવ્યો એટ્રોમેન્ટિન એ વિવિધ અન્ય રંગદ્રવ્યોના અગ્રદૂત છે, જેમાં વેરિયેગેટિક એસિડ, ઝેરોકોમિક એસિડ, હોમોક્સેરોકોમિક એસિડ, આઇસોક્સેરોકોમિક એસિડ, એટ્રોમેન્ટિક એસિડ, વેરિયેગેટોરૂબિન, ઝેરોકોમોરૂબિન અને અન્ય સુધારેલા વ્યુત્પન્ન જેવા પલ્વિનિક એસિડનો સમાવેશ થાય છે. મુખ્ય પલ્વિનિક એસિડ પ્રકારનાં રંજકદ્રવ્યો બેક્ટેરિયા સાથે સહ-ઉષ્માયન દરમિયાન અથવા ઉચ્ચ કાર્બનિક નાઇટ્રોજન સામગ્રીની રજૂઆત (અકાર્બનિક નાઇટ્રોજન ધરાવતા બિન-પ્રેરક માધ્યમની વૃદ્ધિની સરખામણીમાં) દરમિયાન સ્ત્રાવ થતા જોવા મળ્યા હતા. ડાયેરિલસાયક્લોપેન્ટેનોન્સમાં ઇન્વોલ્યુટિન, ઇન્વોલ્યુટોન, ગાયરોસાયકેનિન, ગાયરોપોરિન (ગાયરોસાયનિનનો ઓક્સિડાઇઝ્ડ પ્રકાર), એનહાઇડ્રોઇનવોલ્યુટિન અને કેમોનિક્સિનનો સમાવેશ થાય છે. માળખાકીય રીતે સમાન હોવા છતાં, ગ્રેવિલેન્સ (એ-ડી) 4-એચ. પી. પી. માંથી મેળવવામાં આવે છે, જે એટ્રોમેન્ટિનના પુરોગામી છે. ગ્રેવિલિન એ સુઇલસ જાતિ માટે કેમોટેક્સોનોમિક માર્કર છે. એટ્રોમેન્ટિનના ફેરફારોમાં લ્યુકોએટ્રોમેન્ટિન, લ્યુકોમેન્ટિન-3, લ્યુકોમેન્ટિન-4 અને સિલ્કોલેયુકોમેલોનનો સમાવેશ થાય છે. વધુમાં, થેલેફોરિક એસિડ એક વ્યુત્પન્ન છે જે થેલેફોરોઇડ ક્લેડમાંથી આવે છે. તેના અગ્રદૂત એટ્રોમેન્ટિનના ઉત્પાદન માટે આનુવંશિક અને ઉત્સેચકીય આધાર સિવાય આ રંજકદ્રવ્યોની રચનામાં સામેલ વિવિધ ઉત્સેચકો અજ્ઞાત છે. પુષ્કળ જૈવસંશ્લેષણ પેક્સિલસ ઇન્વોલ્યુટસમાં, જે. જી. આઈ. માયકોકોસમ પોર્ટલ દ્વારા ઉપલબ્ધ એનોટેટેડ જિનોમમાં છ નોનરીબોસોમલ પેપ્ટાઇડ સિન્થેટેઝ જેવા ઉત્સેચકોની ઓળખ કરવામાં આવી હતી. આઈ. એન. વી. એ. <આઇ. ડી. 1>, 4,5 અને 6 તરીકે ઓળખાતા આ જનીનો, ઇ. કોલીમાં વધુ પડતા અભિવ્યક્ત થયા હતા અને જનીનોને તેની લાક્ષણિકતા યુવી-વિસ સ્પેક્ટ્રમ અને મોનોઆઇસોટોપિક માસ દ્વારા નોંધાયેલા એટ્રોમેન્ટિનની રચના નક્કી કરવા માટે 4-એચ. પી. પી. સાથે એપો-ઉત્સેચકને સહ-ઉષ્માયન દ્વારા વર્ગીકૃત કરવામાં આવ્યા હતા. છમાંથી ત્રણ ઉત્સેચકો કાર્યરત હોવાનું જાણવા મળ્યું હતું. આનાથી બેસીડિઓમાઇસેટમાં એટ્રોમેન્ટિનના ઉત્પાદન માટે અભૂતપૂર્વ અતિરેક જોવા મળ્યો હતો. સંદર્ભો એન્ટિકોએગ્યુલેન્ટ્સ એન્ટિમાઇક્રોબાયલ્સ ઓક્સિડોરિડક્ટેઝ ઇન્હિબિટર્સ હાઇડ્રોક્સિબેન્ઝોક્વિનોન પોલિફીનોલ્સ