Twisted intercalating nucleic acid
ટ્વિસ્ટેડ ઇન્ટરકલેટિંગ ન્યુક્લિક એસિડ (ટી. આઈ. એન. એ.) એ એક ન્યુક્લિક એસિડ પરમાણુ છે, જે જ્યારે ટ્રીપ્લેક્સ બનાવતા ઓલિગોન્યુક્લિયોટાઇડ્સ (ટી. એફ. ઓ.) માં ઉમેરવામાં આવે છે, ત્યારે ડબલ-સ્ટ્રેન્ડેડ ડીએનએ (ડી. એસ. ડી. એન. એ.) અને ટી. એફ. ઓ. માંથી હૂગસ્ટીન ટ્રીપ્લેક્સ ડીએનએ રચનાને સ્થિર કરે છે. ટ્રિપલ બોન્ડની આસપાસ ટ્વિસ્ટ કરવાની તેની ક્ષમતા ટ્રિપલએક્સ ડીએનએ બનાવવા માટે ડબલ સ્ટ્રેન્ડેડ ડીએનએની અંદર ઇન્ટરકલેશનની સરળતામાં વધારો કરે છે. વોટસન-ક્રિક એન્ટીપેરેલલ ડુપ્લેક્સ ડીએનએને સ્થિર કરવા માટે અમુક રૂપરેખાંકનો દર્શાવવામાં આવ્યા છે. ટીના-ડી. એન. એ. પ્રાઇમર પી. સી. આર. માં બંધનની વિશિષ્ટતામાં વધારો કરે છે તેવું દર્શાવવામાં આવ્યું છે. જી-ક્વાડ્રુપ્લેક્સમાં ટીના નિવેશનો ઉપયોગ પણ એચ. આઈ. વી-1 વિરોધી પ્રવૃત્તિને વધારવા માટે દર્શાવવામાં આવ્યો છે. ટીના સ્ટેબિલાઇઝ્ડ પી. ટી. ડીએનએ આધારિત ક્લિનિકલ ડાયગ્નોસ્ટિક એસેઝની સુધારેલી સંવેદનશીલતા અને વિશિષ્ટતા દર્શાવે છે. ટ્રીપ્લેક્સ ડીએનએ ટ્રીપલ હેલિક્સ ત્યારે રચાય છે જ્યારે સિંગલ-સ્ટ્રેન્ડેડ ટ્રીપ્લેક્સ બનાવતી ઓલિગોન્યુક્લિયોટાઇડ (ટીએફઓ) ચોક્કસ મુખ્ય ખાંચની ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ દ્વારા ડીએસડીએનએના પ્યુરિન ધરાવતા સ્ટ્રાન્ડ સાથે જોડાય છે. સામાન્ય રીતે, સમાંતર (પાયરિમિડીન) બંધનકર્તા રચનામાં શારીરિક પરિસ્થિતિઓ હેઠળ પીએચ-સંવેદનશીલ સી +-જી-સી હૂગસ્ટીન બેઝ ટ્રીપ્લેક્સની રચનાની જરૂરિયાતને કારણે ટી. એફ. ઓ. ની ત્રીજી હરોળનું આકર્ષણ ઓછું હોય છે. ટી. એફ. ઓ. માં ફેરફાર કરવાનો પ્રયાસ કરવામાં આવ્યો છે જેથી તેમના લક્ષ્યો સાથે બંધનકર્તા સંબંધ સુધારી શકાય અને નવા ટ્રીપ્લેક્સ ન્યુક્લિયોબેઝની રચના સાથે ડી. એસ. ડી. એન. એ. ક્રમમાં પ્રતિબંધો ઘટાડી શકાય. તાજેતરમાં, એવું જાણવા મળ્યું છે કે હોમોપાયરિમિડીન ઓલિગોડોઓક્સિન્યુક્લિયોટાઇડ્સની મધ્યમાં (આર)-1-ઓ-[4-(1-પાયરેનીલેથિનિલ) ફેનાઇલમિથાઇલ] ગ્લિસરોલ (ટીઆઈએનએ) નો ઉછાળો હૂગસ્ટીન-પ્રકારનાં ટ્રીપ્લેક્સ અને ડુપ્લેક્સમાં થર્મલ સ્થિરતામાં વધારો કરી શકે છે, જ્યારે સમાન ન્યુક્લિયોટાઇડ સામગ્રીના વોટસન-ક્રિક-પ્રકારનાં ડુપ્લેક્સ અસ્થિર હતા. એ. ટી. એમ. ને વધારવા માટે, આધાર વિસંગતતાઓને ટી. એફ. ઓ. ની મધ્યમાં મૂકવી જોઈએ અને જ્યારે શક્ય હોય ત્યારે, એ. સી. અથવા ટી. થી જી. આધાર વિસંગતતાઓને ટાળવી જોઈએ. બેઝ મિસમેચની દરેક બાજુએ ટી. આઈ. એન. એ. ના ઇન્ટરકલેશન દ્વારા બેઝ મિસમેચને તટસ્થ કરી શકાય છે અને ટી. આઈ. એન. એ. ઇન્ટરકલેટિંગ ડાયરેક્ટ 3 'અથવા 5' દ્વારા ઢાંકવામાં આવે છે. એપ્લિકેશન્સ વિશિષ્ટતા પરીક્ષણ ડીએનએ સંકરણનો ઉપયોગ કરીને નિદાન પરીક્ષણો એન્ટિપેરેલલ ડુપ્લેક્સ હેલિસીસના વિયોજન દ્વારા મર્યાદિત છે. ઓર્થો-ટી. આઈ. એન. એ. જેવા ઇન્ટરકેલેટર્સ જેવા ડીએનએ સ્થિર અણુઓનો ઉપયોગ કરીને આમાં સુધારો કરી શકાય છે, જે ડુપ્લેક્સ રચનાને સ્થિર કરશે. અભ્યાસો દર્શાવે છે કે સ્થિરતામાં સૌથી વધુ વધારો ત્યારે થયો જ્યારે 3 'અને 5' છેડા પર ઇન્ટરકલેટિંગ પ્રાઈમરનો ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો હતો. ઓલિગોન્યુક્લિયોટાઇડમાં ટીના અણુનું પ્લેસમેન્ટ પ્રોબ સંકરણની વિશ્લેષણાત્મક સંવેદનશીલતામાં સુધારો કરવામાં સક્ષમ છે. પેરા-ટી. આઈ. એન. એ. અણુઓ તમામ સ્થાનો પર ટી. એમ. ઘટાડે છે, ખાસ કરીને જ્યારે ઓલિગોન્યુક્લિયોટાઇડના કેન્દ્રમાં હોય, જ્યારે ઓર્થો-ટી. આઈ. એન. એ. અણુઓમાં, કેન્દ્રમાં તટસ્થતા સાથે ક્યાંય પણ સુધારો જોવા મળ્યો હતો. ટર્મિનલ પેરા-અથવા ઓર્થો-મોલેક્યુલનું આંતરિક ટી. આઈ. એન. એ. મોલેક્યુલ સાથે સંયોજન ટી. એમ. માં સૌથી વધુ વધારો દર્શાવે છે. ટી. એમ. માં મહત્તમ વધારો કરવા માટે ટીના અણુઓને અંતિમ રીતે મૂકવા જોઈએ. ટી. એમ. માં વધારો પી. સી. આર. જેવા પરીક્ષણોની વિશિષ્ટતામાં વધારો કરે છે. એન્ટિ-એચઆઇવી-1 પ્રવૃત્તિ તાજેતરના અભ્યાસો દર્શાવે છે કે જી-ક્વાડ્રુપ્લેક્સમાં ટીના નિવેશનો ઉપયોગ પણ એન્ટિ-એચઆઇવી-1 પ્રવૃત્તિને વધારવા માટે દર્શાવવામાં આવ્યો છે. આવા અભ્યાસોમાં, કોષ રેખાઓ પર એન્ટિ-એચ. આઇ. વી.-1 પ્રવૃત્તિ દર્શાવતા બે જી ક્વાડ્રુપ્લેક્સને લૉક ન્યુક્લિક એસિડ (એલ. એન. એ.) અથવા ટી. આઈ. એન. એ. ના નિવેશનો ઉપયોગ કરીને સુધારવામાં આવ્યા હતા. આનો સમાવેશ એન્ટિ-એચઆઇવી-1 પ્રવૃત્તિમાં 8 ગણો સુધારો પૂરો પાડે છે અને 5 'ફોસ્ફેટની રજૂઆત જી-ક્વાડ્રુપ્લેક્સના ડાયમેરાઇઝેશનને અવરોધે છે તેવું દર્શાવવામાં આવ્યું હતું. ઓલિગોન્યુક્લિયોટાઇડ્સ બનાવતા ઘણા એન્ટિવાયરલ ક્વાડ્રુપ્લેક્સિસ વધુ ઉષ્મીય રીતે સ્થિર જી-ક્વાડ્રુપ્લેક્સિસ અને ઉચ્ચ ક્રમના જી ક્વાડ્રુપ્લેક્સ માળખાઓ બનાવે છે, જે એન્ટિવાયરલ પ્રવૃત્તિ માટે જવાબદાર હોઈ શકે છે. રોગનિવારક કાર્યક્રમો ટી. એફ. ઓ. તેમની ઉચ્ચ શ્રેણીની વિશિષ્ટતાને કારણે જનીન વિરોધી ઉપચારમાં આશાસ્પદ છે. જો કે, વિવોમાં પોટેશિયમનું સ્તર ટી. એફ. ઓ. ને જી-ચોકડી માળખાઓ રચવા માટે પ્રોત્સાહન આપે છે, જે ટી. એફ. ઓ. એસ. ને ટ્રીપ્લેક્સ રચનામાં ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરતા અટકાવે છે અને અસરકારકતા ટી. એફ. ઓ. કોષ ઉપચારમાં ઘટાડો કરે છે. જો કે, પરમશિવમ એટ અલ દ્વારા બતાવ્યા પ્રમાણે, ઉચ્ચ ગુઆનાઇન સાંદ્રતા ધરાવતા ટી. એફ. ઓ. માં (આર)-1-ઓ-[4-(1-પાયરેનાઈલિથિનિલ) ફેનાઇલમિથાઇલ] ગ્લિસરોલ (ટી. આઈ. એન. એ.) નો ઉછાળો દાખલ કરવાથી પોટેશિયમ દ્વારા સ્વ-જોડાણની હાજરીમાં ઘણો ઘટાડો થાય છે. ટીના-ટી. એફ. ઓ. નો ઉપયોગ ભવિષ્યમાં વિવોમાં જિનોમને લક્ષ્ય બનાવવા અને ઉપચારાત્મક અંત તરફ જિનોમ હેરફેર કરવા માટે થઈ શકે છે. પ્યુરિન ટી. આઈ. એન. એ.-ટી. એફ. ઓ. નો ઉપયોગ કે. આર. એ. એસ. પ્રોટો-ઓન્કોજીન તરફ એન્ટિજિન અણુઓ તરીકે ચોક્કસ વચન ધરાવે છે. સંદર્ભો ન્યુક્લિક એસિડ