Toxic Small RNA
મોલેક્યુલર બાયોલોજીમાં, ટોક્સિક સ્મોલ આર. એન. એ. (ટી. એસ. આર. એન. એ., જેને ટી. આર. એન. એ.-વ્યુત્પન્ન નાના આર. એન. એ. સાથે ભેળસેળ ન કરવી) એ ટ્રાન્સ-એન્કોડેડ નાના નોન-કોડિંગ આર. એન. એ. નું એક કુટુંબ છે જે ફક્ત બીટાપ્રોટોબેક્ટેરિયાના ઇન્ટરજેનિક પ્રદેશોમાં જોવા મળે છે. કેટલાક પેરાલોગસ લોકી દરેક કોડિંગ જિનોમમાં સમાન (પરંતુ સમાન નહીં) tsRNA ને એન્કોડ કરી શકે છે. સામાન્ય રીતે, બુર્ખહોલ્ડેરિયાની દરેક પ્રજાતિમાં 3-5 સમાનધર્મી ટી. એસ. આર. એન. એ. હોય છે. બુર્ખહોલ્ડેરિયા વંશની ચાર પ્રજાતિઓ સાથેના પ્રયોગોએ લઘુગણક વૃદ્ધિના તબક્કામાં ટી. એસ. આર. એન. એ. ની સંરક્ષિત અને રચનાત્મક અભિવ્યક્તિ દર્શાવી હતી. ક્રમ અને માળખું બુર્ખહોલ્ડેરિયા સેનોસેપેશિયામાં 4 ટી. એસ. આર. એન. એ. ના ગૌણ માળખાઓની લાક્ષણિકતા સૂચવે છે કે તેઓ ડબલ હેરપિન માળખા બનાવે છે. કેટલીકવાર, આ માળખું આર. એન. એ. ની પ્રક્રિયા થયા પછી જ પરિણમે છે (એન. સી. એસ. 27ની જેમ). લાક્ષણિક રીતે, ગૌણ માળખાના જોડી વગરના ભાગોમાં સીયુ-સમૃદ્ધ (સાયટોસિન અને યુરેસિલ સમૃદ્ધ) પ્રદેશ હોય છે. આ સીયુ-સમૃદ્ધ પ્રદેશને કાર્યાત્મક પ્રદેશ તરીકે સૂચવવામાં આવે છે જે એમઆરએનએના રિબોઝોમ-બંધનકર્તા સ્થળ (આરબીએસ) ને જોડે છે. કાર્ય જ્યારે ક્રિયાની પદ્ધતિ લક્ષ્યના આધારે બદલાઈ શકે છે, ત્યારે એવું સૂચન કરવામાં આવ્યું છે કે ટી. એસ. આર. એન. એ. બહુવિધ એમ. આર. એન. એ. ના રાઇબોઝોમ બંધનકર્તા ક્રમને બાંધીને જનીન અભિવ્યક્તિનું નિયમન કરે છે. હર્બાસ્પિરિલમ સેરોપેડિકામાં જોવા મળતા ટી. એસ. આર. એન. એ. ની ઓછી જી. સી. (ગુઆનાઇન અને સાયટોસિન) સામગ્રી આ પૂર્વધારણાને સમર્થન આપશે. શક્ય છે કે આ ક્રિયાપ્રતિક્રિયાને સ્થિર કરવા માટે ચેપરોન પ્રોટીન એચ. એફ. ક્યુ. ની જરૂર હોય, પરંતુ તેની ભૂમિકા અસ્પષ્ટ છે. મોટે ભાગે, એવું સૂચવવામાં આવે છે કે ટી. એસ. આર. એન. એ. બુર્ખહોલ્ડેરિયામાં કાર્બોહાઇડ્રેટ અને એમિનો એસિડ ચયાપચયને નિયંત્રિત કરે છે. જ્યારે બી. સેનોસેપેશિયાને ભૂખમરાના વાતાવરણ કરતાં ગ્લુકોઝથી સમૃદ્ધ માધ્યમમાં ઉગાડવામાં આવે છે ત્યારે તે વધુ તીવ્ર રીતે વ્યક્ત થાય છે. તેનાથી વિપરીત, ટી. એસ. આર. એન. એ. ની અતિશય અભિવ્યક્તિ એમિનો એસિડ સમૃદ્ધ વાતાવરણમાં વૃદ્ધિને નબળી પાડે છે. વૃદ્ધિનું આ ક્ષીણતા માધ્યમની ચોક્કસ સામગ્રી પર આધાર રાખે છે, કારણ કે સામાન્ય વૃદ્ધિ હજુ પણ ઘણા વાતાવરણમાં થાય છે. જ્યારે મોટાભાગના ચોક્કસ ટી. એસ. આર. એન. એ. મોટે ભાગે બિનપરંપરાગત રહે છે, ત્યારે એન. સી. એસ. 27ના કાર્યનો અભ્યાસ કરવામાં આવ્યો છે. તેમાં એક સંરક્ષિત ક્રમ છે જે ઘણા પરિવહન અને ચયાપચયના લખાણોના શાઇન-ડાલ્ગાર્નો ક્રમનો વિપરીત પૂરક છે. સંભવિત લક્ષ્યાંકોમાં ઘણા જનીનોનો સમાવેશ થાય છે જે કાર્બોહાઇડ્રેટ પરિવહન અને સુગંધિત એમિનો એસિડના અધઃપતનને નિયંત્રિત કરે છે. ચોક્કસ લક્ષ્યાંકોમાં 4-હાઇડ્રોક્સિફિનાઇલપાયરુવિક એસિડ ડાયઓક્સિજનેઝ (એચ. પી. પી. ડી.) અને ઈન્ડોલેપાયરુવેટ ફેરેડોક્સિન ઓક્સિડોરિડક્ટેઝ (આઈ. ઓ. આર.) નો સમાવેશ થાય છે. આ ઉત્સેચકો ફેનાઇલાલેનાઇન અને ટાયરોસિન કેટાબોલિઝમમાં સામેલ છે. અન્ય સંભવિત લક્ષ્યોમાં ગ્લિસરોલ કિનેઝ અને એટીપી-બંધનકર્તા કેસેટ ટ્રાન્સપોર્ટર (એબીસી ટ્રાન્સપોર્ટર) માં સબસ્ટ્રેટ બંધનકર્તા પ્રોટીનનો સમાવેશ થાય છે. તેથી, પુરાવાઓના ઘણા ટુકડાઓ સૂચવે છે કે ટી. એસ. આર. એન. એ. કાર્બોહાઇડ્રેટ અને એમિનો એસિડ ચયાપચયને નિયંત્રિત કરે છે, જો કે, કાર્યની પુષ્ટિ થઈ નથી. પ્રમાણમાં અભ્યાસ ન કરાયેલ ટી. એસ. આર. એન. એ., એન. સી. એસ. 62, ટી. એન.-સેક ડેટાના આધારે આવશ્યક હોવાનું સૂચવવામાં આવ્યું છે. મૂળરૂપે, ટી. એસ. આર. એન. એ. નું નામ આપવામાં આવ્યું હતું કારણ કે જ્યારે ક્લોનિંગ વેક્ટર પર વ્યક્ત કરવામાં આવે ત્યારે તેઓ ઇ. કોલીની વૃદ્ધિને અવરોધે છે. જે પદ્ધતિ દ્વારા ટી. એસ. આર. એન. એ. ઝેરી છે તે હજુ પણ અજ્ઞાત છે. જ્યારે વૃદ્ધિ માધ્યમમાં હોય ત્યારે ટી. એસ. આર. એન. એ. ઇ. કોલાઈ માટે ઝેરી નથી, ન તો જ્યારે ઇ. કોલાઈ સાથે ઉગાડવામાં આવે ત્યારે બી. સેનોસેપેસિયા દ્વારા તે સ્ત્રાવ થાય છે. વધુમાં, તેઓ બેક્ટેરિયા માટે ઝેરી નથી જેમાં આ આર. એન. એ. પરમાણુઓ જોવા મળે છે (બી. સેનોસેપેશિયા). એન. સી. આર. એન. એ. ના આ પરિવાર માટે નામમાં ફેરફાર સૂચવવામાં આવ્યો છે. તેમની રચનાના આધારે, અમુક ટી. એસ. આર. એન. એ. ને 'ડબલ હેરપિન આર. એન. એ.' કહેવાની દરખાસ્ત કરવામાં આવી છે. મૂળ રૂપે 2015માં ઓળખાયેલ ટી. એસ. આર. એન. એ. (એન. સી. એસ. 27) ને બુર્ખહોલ્ડેરિયા ડબલ-હેરપિન એસ. આર. એન. એ. રેગ્યુલેટર માટે બી. ડી. એચ. આર. 1 નામ સૂચવવામાં આવ્યું છે. એસ્ચેરીચીયા કોલી એસ. આર. એન. એ. બાહ્યકોષીય આર. એન. એ. ની યાદી આર. એન. એ. ની આર. એન. એ. હસ્તક્ષેપ નાની દખલ કરતી આર. એન. એ. નાની ન્યુક્લિયોલર આર. એન. એ.-વ્યુત્પન્ન માઇક્રો આર. એન. એ. બાહ્ય કડીઓ પાનડાટોક્સ-બેક્ટેરિયા માટે ઝેરી જનીનોનો ડેટાબેઝ આર. એફ. એ. એમ. ડેટાબેઝ-સંબંધિત એન. સી. આર. એન. એ. ના સેંકડો પરિવારોની ક્યુરેટેડ સૂચિ સંદર્ભો બિન-કોડિંગ આર. એન. એ.