BitterDB
બિટરડીબી એ એવા સંયોજનોનો ડેટાબેઝ છે જેનો સ્વાદ મનુષ્યો માટે કડવો હોવાનું નોંધવામાં આવ્યું હતું. બિટરડીબી ડેટાબેઝનો ઉદ્દેશ કડવો સ્વાદ ધરાવતા કુદરતી અને કૃત્રિમ સંયોજનો અને તેમના સંબંધિત કડવો સ્વાદ રીસેપ્ટર્સ (ટી2આર અથવા ટીએએસ2આર) વિશે માહિતી એકત્રિત કરવાનો છે. સારાંશ બિટરડીબીમાં 670 થી વધુ સંયોજનોનો સમાવેશ થાય છે જેનો સ્વાદ મનુષ્યો માટે કડવો હોવાનું નોંધવામાં આવ્યું હતું. સંયોજનોને નામ, રાસાયણિક માળખું, અન્ય કડવા સંયોજનો સાથે સમાનતા, ચોક્કસ માનવ કડવો સ્વાદ રીસેપ્ટર સાથેના જોડાણ અને અન્ય ગુણધર્મો દ્વારા પણ શોધી શકાય છે. ડેટાબેઝમાં કડવા સ્વાદ રીસેપ્ટર્સમાં પરિવર્તન વિશેની માહિતી પણ છે જે કડવા સંયોજનો દ્વારા રીસેપ્ટર સક્રિયકરણને પ્રભાવિત કરતી હોવાનું દર્શાવવામાં આવ્યું હતું. ડેટાબેઝ ઝાંખી કડવા સંયોજનો બિટરડીબી હાલમાં 670 થી વધુ સંયોજનો ધરાવે છે જેને સાહિત્યમાં કડવા તરીકે ટાંકવામાં આવ્યા હતા. દરેક સંયોજન માટે, ડેટાબેઝ તેના પરમાણુ ગુણધર્મો, સંયોજનની કડવાશ માટેના સંદર્ભો, સંયોજનની કડવાશ શ્રેણી વિશે વધારાની માહિતી સહિત માહિતી પ્રદાન કરે છે (દા. ત. 'કડવી-મીઠી' અથવા 'થોડી કડવી' ટિપ્પણી), વિવિધ સંયોજન ઓળખકર્તાઓ (સ્માઇલ્સ, સીએએસ રજિસ્ટ્રી નંબર, આઇયુપીએસી વ્યવસ્થિત નામ), સંકેત છે કે સંયોજન કુદરતી સ્રોતમાંથી લેવામાં આવ્યું છે કે કૃત્રિમ છે, સંયોજનની પબકેમ એન્ટ્રીની લિંક અને ડાઉનલોડ કરવા માટે વિવિધ ફાઇલ ફોર્મેટ (એસડીએફ, છબી, સ્મિત). 200 થી વધુ કડવા સંયોજનોને પ્રાયોગિક રીતે તેમના અનુરૂપ માનવ કડવા સ્વાદના રીસેપ્ટર્સ સાથે જોડવામાં આવ્યા છે. તે સંયોજનો માટે, બિટરડીબી વધારાની માહિતી પૂરી પાડે છે, જેમાં આ લિગાન્ડ-રીસેપ્ટર ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ સૂચવતા પ્રકાશનોની કડીઓ, રીસેપ્ટર સક્રિયકરણ માટે અસરકારક સાંદ્રતા અને/અથવા ઇસી 50 મૂલ્ય અને બિટરડીબીમાં સંકળાયેલ કડવા સ્વાદ રીસેપ્ટર એન્ટ્રીઓની કડીઓનો સમાવેશ થાય છે. કડવા સંયોજનોની પૂછપરછ અને બ્રાઉઝિંગ અલગ અલગ રીતે કરી શકાય છે અને બ્રાઉઝ કરી શકાય છે. ઉદાહરણ તરીકે, 'અદ્યતન શોધ' વિકલ્પ વપરાશકર્તાને વિવિધ માપદંડોમાં બંધબેસતા સંયોજનોને પુનઃપ્રાપ્ત કરવાની મંજૂરી આપે છે, જેમ કે ચોક્કસ ભૌતિક ગુણધર્મોનું સંયોજન અથવા સંકળાયેલ માનવ કડવા સ્વાદ રીસેપ્ટર્સનું સંયોજન. ક્વેરીંગ વિકલ્પો ઉપરાંત, વપરાશકર્તા બધા બિટરડીબી સંયોજનો સાથે સૉર્ટેબલ ટેબલ દ્વારા બ્રાઉઝ કરી શકે છે. કડવો સ્વાદ રીસેપ્ટર્સ બિટરડીબી 25 જાણીતા માનવ કડવો સ્વાદ રીસેપ્ટર્સ વિશેની માહિતી ધરાવે છે. દરેક રીસેપ્ટર માટે કેટલાક ગુણધર્મો દર્શાવવામાં આવે છે. કડવા સ્વાદના રીસેપ્ટર્સને વિવિધ માપદંડોનો ઉપયોગ કરીને શોધી શકાય છેઃ નામ, જાણીતા લિગાન્ડ્સ અને યુનિપ્રોટ જોડાણ સંખ્યા. એક ટેબલનો ઉપયોગ કરીને જે તમામ કડવા સ્વાદના રીસેપ્ટર્સ અને તેમના વિશેની કેટલીક માહિતી રજૂ કરે છે, વપરાશકર્તા વિવિધ વિકલ્પો દ્વારા બ્રાઉઝ અને સૉર્ટ કરી શકે છે, જેમ કે રીસેપ્ટર સાથે સંકળાયેલા કડવા લિગાન્ડ્સની સંખ્યા. સ્થાનિક બ્લાસ્ટ સેવા અને વૈશ્વિક સંરેખણ બિટરડીબી બે વધારાની સુવિધાઓ પ્રદાન કરે છેઃ ક્વેરી ક્રમ અને વિવિધ માનવ કડવા સ્વાદ રીસેપ્ટર્સ વચ્ચેની સ્થાનિક સમાનતા નક્કી કરવા માટે સ્થાનિક બ્લાસ્ટ સેવા, અને 25 માનવ કડવા સ્વાદ રીસેપ્ટર્સનું વૈશ્વિક સંરેખણ. સંરેખણ ક્લસ્ટલ ડબલ્યુ 2 નો ઉપયોગ કરીને બનાવવામાં આવ્યું હતું, અને ટોપકોન્સ સર્વર દ્વારા આગાહી મુજબ દરેક રીસેપ્ટરનું ગૌણ માળખું પ્રદર્શિત કરે છે. બિટરડીબી સંયોજનો અપલોડ કરવાથી 'અપલોડ' વિકલ્પ મળે છે, જ્યાં વપરાશકર્તાઓને કડવા સંયોજનો વિશેની માહિતી સબમિટ કરવા માટે પ્રોત્સાહિત કરવામાં આવે છે. આ ડેટાની લેખકો દ્વારા સમીક્ષા કરવામાં આવશે અને તે મુજબ ડેટાબેઝમાં અપલોડ કરવામાં આવશે. ડેટાબેઝ અપડેટ્સ મેળવવા માટે વપરાશકર્તાઓ મેઇલિંગ સૂચિમાં જોડાઈ શકે છે. ઉદાહરણો કડવા સંદર્ભો બાહ્ય કડીઓ http://bitterdb.agri.huji.ac.il/bitterdb જૈવિક ડેટાબેઝ સેન્સરી સિસ્ટમ્સ ગુસ્ટેશન ગસ્ટેટરી સિસ્ટમ કડવા સંયોજનો પણ જુઓ.