Protein fold class
મોલેક્યુલર બાયોલોજીમાં, પ્રોટીન ફોલ્ડ વર્ગો પ્રોટીન ટર્શરી સ્ટ્રક્ચર ટોપોલોજીની વ્યાપક શ્રેણીઓ છે. તેઓ પ્રોટીનના જૂથોનું વર્ણન કરે છે જે સમાન એમિનો એસિડ અને ગૌણ માળખાના પ્રમાણને શેર કરે છે. દરેક વર્ગમાં બહુવિધ, સ્વતંત્ર પ્રોટીન સુપરફેમિલીઝ (એટલે કે. જરૂરી નથી કે તેઓ ઉત્ક્રાંતિથી એકબીજા સાથે સંબંધિત હોય). સામાન્ય રીતે માન્યતા પ્રાપ્ત વર્ગો પ્રોટીનના ચાર મોટા વર્ગો કે જે સામાન્ય રીતે બે મુખ્ય માળખા વર્ગીકરણ ડેટાબેઝ (એસસીઓપી અને સીએટીએચ) દ્વારા સંમત થાય છે. બધા-α બધા-α પ્રોટીન એ માળખાકીય ક્ષેત્રોનો એક વર્ગ છે જેમાં પરિઘ પર થોડા અલગ β-શીટ્સના સંભવિત અપવાદ સાથે ગૌણ માળખું સંપૂર્ણપણે α-હેલિસીસથી બનેલું છે. સામાન્ય ઉદાહરણોમાં બ્રોમોડોમેન, ગ્લોબિન ફોલ્ડ અને હોમિયોડોમેન ફોલ્ડનો સમાવેશ થાય છે. બધા-બીટા બધા-બીટા પ્રોટીન એ માળખાકીય ક્ષેત્રોનો એક વર્ગ છે જેમાં ગૌણ માળખું સંપૂર્ણપણે β-શીટ્સથી બનેલું હોય છે, જેમાં પરિઘ પર થોડા અલગ α-હેલિસીસનો સંભવિત અપવાદ હોય છે. સામાન્ય ઉદાહરણોમાં SH3 ડોમેન, બીટા-પ્રોપેલર ડોમેન, ઇમ્યુનોગ્લોબ્યુલિન ફોલ્ડ અને B3 DNA બંધનકર્તા ડોમેનનો સમાવેશ થાય છે. α + βα + β પ્રોટીન એ માળખાકીય ક્ષેત્રોનો એક વર્ગ છે જેમાં ગૌણ માળખું α-હેલિસીસ અને β-સ્ટ્રેન્ડ્સથી બનેલું હોય છે જે કરોડરજ્જુની સાથે અલગથી થાય છે. તેથી β-સ્ટ્રેન્ડ્સ મોટે ભાગે વિરોધી સમાંતર છે. સામાન્ય ઉદાહરણોમાં ફેરેડોક્સિન ફોલ્ડ, રિબોન્યુક્લીઝ એ અને એસએચ2 ડોમેનનો સમાવેશ થાય છે. α/βα/β પ્રોટીન એ માળખાકીય ક્ષેત્રોનો એક વર્ગ છે જેમાં ગૌણ માળખું કરોડરજ્જુની સાથે વૈકલ્પિક α-હેલિસીસ અને β-સ્ટ્રેન્ડ્સથી બનેલું હોય છે. તેથી β-સ્ટ્રેન્ડ મોટે ભાગે સમાંતર હોય છે. સામાન્ય ઉદાહરણોમાં ફ્લેવોડોક્સિન ફોલ્ડ, ટીઆઈએમ બેરલ અને રિબોન્યુક્લીઝ અવરોધક જેવા લ્યુસીન-સમૃદ્ધ-પુનરાવર્તન (એલઆરઆર) પ્રોટીનનો સમાવેશ થાય છે. વધારાના વર્ગો પટલ પ્રોટીન પટલ પ્રોટીન જૈવિક પટલ સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરે છે ક્યાં તો તેમાં દાખલ કરીને, અથવા સહસંયોજક રીતે જોડાયેલ લિપિડ દ્વારા બાંધવામાં આવે છે. તેઓ દ્રાવ્ય ગોળાકાર પ્રોટીન, તંતુમય પ્રોટીન અને અવ્યવસ્થિત પ્રોટીન સાથે પ્રોટીનના સામાન્ય પ્રકારોમાંથી એક છે. તેઓ તમામ આધુનિક ઔષધીય દવાઓના 50 ટકાથી વધુનું લક્ષ્ય છે. એવો અંદાજ છે કે મોટાભાગના જીનોમમાં તમામ જનીનોમાંથી 20-30% પટલ પ્રોટીનને એન્કોડ કરે છે. આંતરિક રીતે અવ્યવસ્થિત પ્રોટીન આંતરિક રીતે અવ્યવસ્થિત પ્રોટીનમાં નિશ્ચિત અથવા ક્રમબદ્ધ ત્રિ-પરિમાણીય માળખાનો અભાવ હોય છે. આઇડીપી સંપૂર્ણપણે અસંરચિતથી આંશિક રીતે સંરચિત સ્થિતિઓના વર્ણપટને આવરી લે છે અને તેમાં રેન્ડમ કોઇલ, (પૂર્વ-) પીગળેલા ગોળાકાર અને લવચીક લિંકર દ્વારા જોડાયેલા મોટા મલ્ટી-ડોમેન પ્રોટીનનો સમાવેશ થાય છે. તેઓ પ્રોટીનના મુખ્ય પ્રકારોમાંથી એક છે (ગોળાકાર, તંતુમય અને પટલ પ્રોટીનની સાથે). કોઇલ્ડ કોઇલ પ્રોટીન કોઇલ્ડ કોઇલ પ્રોટીન બાહ્યકોષીય મેટ્રિક્સમાં સામેલ લાંબા, અદ્રાવ્ય તંતુઓ બનાવે છે. કેરાટિન, કોલેજન, ઇલાસ્ટિન અને ફાઇબ્રોઇન સહિત ઘણા સ્ક્લેરોપ્રોટીન સુપરફેમિલીઝ છે. આવા પ્રોટીનની ભૂમિકાઓમાં રક્ષણ અને ટેકો, જોડાયેલી પેશીઓ, રજ્જૂ, અસ્થિ મેટ્રિક્સ અને સ્નાયુ તંતુઓનો સમાવેશ થાય છે. નાના પ્રોટીન નાના પ્રોટીનમાં સામાન્ય રીતે તૃતીય માળખું હોય છે જે ડાયસલ્ફાઇડ બ્રિજ (સિસ્ટીન-સમૃદ્ધ પ્રોટીન), ધાતુના લિગાન્ડ્સ (ધાતુ-બંધનકર્તા પ્રોટીન) અને હેમ જેવા સહ-પરિબળો દ્વારા જાળવવામાં આવે છે. રચાયેલ પ્રોટીન અસંખ્ય પ્રોટીન માળખાં તર્કસંગત રચનાનું પરિણામ છે અને પ્રકૃતિમાં અસ્તિત્વમાં નથી. પ્રોટીનની રચના શરૂઆતથી (નવી ડિઝાઇન) અથવા જાણીતા પ્રોટીન માળખા અને તેના ક્રમ (પ્રોટીન રીડિઝાઇન તરીકે ઓળખાય છે) પર ગણતરીમાં ફેરફાર કરીને કરી શકાય છે. તર્કસંગત પ્રોટીન ડિઝાઇન અભિગમો પ્રોટીન-ક્રમની આગાહીઓ કરે છે જે ચોક્કસ માળખામાં ફોલ્ડ થશે. આ અનુમાનિત સિક્વન્સને પછી પેપ્ટાઇડ સંશ્લેષણ, સાઇટ-નિર્દેશિત મ્યુટેજેનેસિસ અથવા કૃત્રિમ જનીન સંશ્લેષણ જેવી પદ્ધતિઓ દ્વારા પ્રાયોગિક રીતે માન્ય કરી શકાય છે. પ્રોટીન સુપરફેમિલી SCOP ડેટાબેઝ CATH ડેટાબેઝ FSSP ડેટાબેઝ સંદર્ભો પ્રોટીન ફોલ્ડ્સ પણ જુઓ.