Multi-Omics Profiling Expression Database
મલ્ટી-ઓમિક્સ પ્રોફાઇલિંગ એક્સપ્રેશન ડેટાબેઝ (એમ. ઓ. પી. ઈ. ડી.) એ એક વિસ્તરી રહેલું મલ્ટી-ઓમિક્સ સંસાધન હતું જે પ્રતિકૃતિશાસ્ત્ર અને પ્રોટોમિક્સ માહિતીના ઝડપી બ્રાઉઝિંગને મોડેલ સજીવો અને મનુષ્યો પર જાહેરમાં ઉપલબ્ધ અભ્યાસોમાંથી ટેકો આપે છે. આજની તારીખે (2021) તેણે પ્રવૃત્તિઓ બંધ કરી દીધી છે અને તે ઓનલાઈન અપ્રાપ્ય છે. સિસ્ટેમેટિક પ્રોટીન ઇન્વેસ્ટિગેટિવ રિસર્ચ એન્વાયર્નમેન્ટ એમઓપીઈડી વધુ મોટા સંશોધન સમુદાય માટે ડેટાની સરખામણી અને વહેંચણીને સરળ બનાવવા માટે રચાયેલ છે. એમઓપીઈડી પ્રોટીન સ્તરના સંપૂર્ણ અને સંબંધિત અભિવ્યક્તિ ડેટા, મેટા-વિશ્લેષણ ક્ષમતાઓ અને માત્રાત્મક ડેટા અનન્ય રીતે પ્રદાન કરવા માટે પ્રમાણિત વિશ્લેષણ પાઇપલાઇન સ્પાયરનો ઉપયોગ કરે છે. પ્રોસેસ્ડ રિલેટિવ એક્સપ્રેશન ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ ડેટા જીન એક્સપ્રેશન ઓમ્નીબસ (જી. ઇ. ઓ.) માંથી મેળવવામાં આવ્યા હતા. ચોક્કસ પ્રોટીન અને જનીનો માટે માહિતીની પૂછપરછ કરી શકાય છે, જીવતંત્ર, પેશીઓ, સ્થાનિકીકરણ અને સ્થિતિના આધારે બ્રાઉઝ કરી શકાય છે અને ખોટા શોધ દર અને અભિવ્યક્તિ દ્વારા સૉર્ટ કરી શકાય છે. એમ. ઓ. પી. ઇ. ડી. વપરાશકર્તાઓને તેમના પોતાના અભિવ્યક્તિ ડેટાની કલ્પના કરવા અને તેને હાલના અભ્યાસો સાથે સરખાવવા માટે સશક્ત બનાવે છે. વધુમાં, એમઓપીઈડી જીનકાર્ડ્સ, પેન્થર, એન્ટ્રેઝ, યુનિપ્રોટ, કેઈજીજી, સીડ અને રિએક્ટોમ સહિત વિવિધ પ્રોટીન અને પાથવે ડેટા-બેઝ સાથે જોડાય છે. પ્રોટીન અને જનીન ઓળખકર્તાઓ જીનકાર્ડ્સ (એમ. ઓ. પી. ઈ. ડી. સાથે ક્રોસ-રેફરેન્સ), જેનબેંક, રેફસેક, યુનિપ્રોટ, વોર્મબેઝ અને સૅકરોમાઇસીસ જીનોમ ડેટાબેઝ (એસ. જી. ડી.) માંથી સંકલિત છે. એમ. ઓ. પી. ઈ. ડી. ના વર્તમાન સંસ્કરણ (એમ. ઓ. પી. ઈ. ડી. 2.5,2014) માં ~ 260 પ્રયોગો અને ~ 390 શરતો સહિત આશરે 5 મિલિયન કુલ રેકોર્ડ છે. સિએટલ ચિલ્ડ્રન્સ રિસર્ચ ઇન્સ્ટિટ્યૂટ ખાતે કોલ્કર ટીમ દ્વારા એમઓપીઈડી વિકસાવવામાં આવ્યું છે અને તેને ટેકો આપવામાં આવ્યો છે. મોડલ ઓર્ગેનિઝમ પ્રોટીન એક્સપ્રેશન ડેટાબેઝ એમ. ઓ. પી. ઈ. ડી. તેનું નામ બદલીને મલ્ટી-ઓમિક્સ પ્રોફાઇલિંગ એક્સપ્રેશન ડેટાબેઝ કરતા પહેલા મોડલ ઓર્ગેનિઝમ પ્રોટીન એક્સપ્રેશન ડેટાબેઝ તરીકે જાણીતું હતું. સંદર્ભો વધુ વાંચન જૈવિક ડેટાબેઝ પ્રોટિઓમિક્સ ઓમિક્સ