HYPHY (software)
HYPHY () એ એક મફત મલ્ટિપ્લેટફોર્મ (મેક, વિન્ડોઝ અને યુનિક્સ) કોમ્પ્યુટેશનલ ફિલોજેનેટિક્સ સોફ્ટવેર પેકેજ છે જેનો હેતુ આનુવંશિક અનુક્રમ ડેટાનું મહત્તમ સંભાવના વિશ્લેષણ કરવાનો છે અને વિવિધ આંકડાકીય પૂર્વધારણાઓનું પરીક્ષણ કરવા માટે સાધનોથી સજ્જ છે. HYPHY નામ એ "PHYlogenies નો ઉપયોગ કરીને પૂર્વધારણા પરીક્ષણ" નું સંક્ષિપ્ત નામ છે. માર્ચ 2018 સુધીમાં, લગભગ 2,000 પીઅર-રીવ્યૂ વૈજ્ઞાનિક જર્નલ લેખો HYPHY નો ઉલ્લેખ કરે છે. મુખ્ય લાક્ષણિકતાઓ પૂર્વનિર્ધારિત પ્રમાણભૂત નમૂનાઓ અથવા ઉત્ક્રાંતિના વપરાશકર્તા-નિર્ધારિત નમૂનાઓનો ઉપયોગ કરીને ન્યુક્લિયોટાઇડ, પ્રોટીન અને કોડન ક્રમના વિશ્લેષણને HYPHY સમર્થન આપે છે. પેકેજ મોટા અને જટિલ વિશ્લેષણ સ્થાપિત કરવા અને પરિણામો પર પ્રક્રિયા કરવા માટે ગ્રાફિકલ યુઝર ઇન્ટરફેસ તેમજ બેચ લેંગ્વેજ દ્વારા ક્રિયાપ્રતિક્રિયાને ટેકો આપે છે. હાઈફાઈમાં વ્યક્તિગત એમિનો એસિડ સાઇટ્સ અને/અથવા વંશાવલિ પર અનુકૂલનશીલ ઉત્ક્રાંતિને શોધવા માટેની પદ્ધતિઓનો બહુમુખી સમૂહ શામેલ છે, જેમાં નીલ્સન-યાંગ પી. એ. એમ. એલ. અને સુઝુકી-ગોજોબોરી અભિગમો અને અન્ય ઘણા લોકોના સામાન્યીકરણનો સમાવેશ થાય છે. હાઈફીનો વિકાસ 1997માં શરૂ થયો હતો, 2000માં પ્રથમ જાહેર પ્રકાશન સાથે અને ડિસેમ્બર 2020 સુધીમાં સૌથી તાજેતરનું સંસ્કરણ 2.5 હતું. સોફ્ટવેર/કોડની ઉપલબ્ધતા અને લાઇસન્સ HYPHY એમઆઇટી લાઇસન્સ હેઠળ બહાર પાડવામાં આવેલા સ્રોત કોડ સાથે ફ્રીવેર તરીકે વિતરિત કરવામાં આવે છે. મેક ઓએસ એક્સ અને વિન્ડોઝ માટે સંકલિત દ્વિસંગીઓ ડાઉનલોડ કરવા માટે ઉપલબ્ધ છે. સ્રોત કોડ ઉપલબ્ધ છે જેથી વપરાશકર્તાઓ પોસિક્સ સિસ્ટમો પર હાયફી એપ્લિકેશનનું સંકલન કરી શકે. અનુકૂલનશીલ ઉત્ક્રાંતિ શોધવા માટે HYPHY પદ્ધતિઓનો સબસેટ પણ ડેટામોંકી ક્લસ્ટર પર ટેમ્પલ યુનિવર્સિટી ખાતે HYPHY ટીમ દ્વારા ઉપલબ્ધ કરાવવામાં આવે છે. નોંધો બાહ્ય લિંક્સઃ HYPHY હોમ પેજઃ ડેટામોંકી સર્વર, જે વિવિધ HYPHY ટૂલ્સને સપોર્ટ કરે છે (કોઈ કિંમત વિના). : HYPHY/DataMonkey ફિલોજેનેટિક્સ સોફ્ટવેરને ટેકો આપે છે