FAM83A
પ્રોટીન FAM83A (અનુક્રમ સમાનતા 83 સાથે પરિવારના સભ્ય) જેને ટ્યુમર એન્ટિજેન BJ-TSA-9 તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે તે એક પ્રોટીન છે જે મનુષ્યમાં FAM83A જનીન દ્વારા એન્કોડ કરવામાં આવે છે. આ પ્રોટીનમાં અજ્ઞાત કાર્ય 1669 (DUF1669) નું એક ડોમેન હોવાની આગાહી કરવામાં આવી છે, જે આ પ્રોટીનને PLDC _ સુપરફેમિલીમાં મૂકે છે. તેને ફેફસાં, પ્રોસ્ટેટ અને મૂત્રાશયના કેન્સરમાં સંભવિત બાયોમાર્કર તરીકે જોડવામાં આવ્યું છે. જીન FAM83A રંગસૂત્ર 8, લોકસ q24.13 પર સ્થિત છે અને 27,566 આધાર જોડીઓમાં ફેલાયેલું છે. જેનોમેટિક્સ દ્વારા ટૂલ એલડોરાડો દ્વારા આગાહી કરાયેલ પ્રમોટર લગભગ 4,000 બેઝ જોડી અપસ્ટ્રીમ છે. એફ. એ. એમ. 83એ જનીન સહિત રંગસૂત્રના આ ભાગમાં કાઢી નાંખવાથી ઘણીવાર લેંગર-ગિડિયન સિન્ડ્રોમમાં પરિણમે છે. એમઆરએનએ એફએએમ83એ એમઆરએનએમાં 10 જુદા જુદા સ્પ્લાઇસ સ્વરૂપો છે, જેમાં ટ્રાન્સક્રિપ્ટ વેરિઅન્ટ 1 આ લેખનો વિષય છે. આ એમઆરએનએમાં આશરે 2,900 બેઝ જોડીનો સમાવેશ થાય છે. તેમાં અજ્ઞાત કાર્ય 1669 (DUF1669) નું ડોમેન છે, અને તે PLDC _ SF સુપરફેમિલીનું સભ્ય છે. તેને FAM83A અને અન્ય N-ટર્મિનસ ફોસ્ફોલિપેઝ D-જેવા ડોમેન્સ વચ્ચેના અત્યંત સમાન ક્રમના આધારે આ સુપરફેમિલીમાં મૂકવામાં આવ્યું છે; જો કે, તેમાં કાર્યાત્મક હિસ્ટિડીન ખૂટે છે અને તેથી માત્ર સમાન માળખું હોવાની આગાહી કરવામાં આવી છે. ચાર એક્સોન આ એમઆરએનએ ધરાવે છે. આગાહીઓ એમ. આર. એન. એ. ના અનુવાદિત ન થયેલા પ્રદેશોમાં અનેક સંભવિત આર. એન. એ. સ્ટેમ લૂપ રચનાઓ દર્શાવે છે. પ્રોટીન FAM83A જનીન FAM83A પ્રોટીન આઇસોફોર્મ A માટે સંકેતલિપી કરે છે. આ પ્રોટીન લંબાઈમાં 434 એમિનો એસિડ ધરાવે છે અને તેનું વજન આશરે 45 કિલો ડાલ્ટન છે. જો કે માળખાની પુષ્ટિ થઈ નથી, તેમ છતાં GOR4 નો ઉપયોગ કરીને ચાર આલ્ફા હેલિસીસ અને પાંચ બીટા શીટ્સ હોવાની આગાહી કરવામાં આવી છે, જેમાં 8.964 ના આઇસોઇલેક્ટ્રિક બિંદુ સાથે કોઈ સિગ્નલ પેપ્ટાઇડ હોય તેવું લાગતું નથી અને તે ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રોટીન નથી. સી. બી. એલ. એ. એસ. ટી. નો ઉપયોગ કરીને, તે પ્રોટીન 3H0G સાથે એક સામાન્ય ક્રમ શેર કરતું જોવા મળ્યું હતું, જો કે, એફ. એ. એમ. 83એ. ના અનુમાનિત કાર્યાત્મક ક્ષેત્રમાં નહીં. આ હજુ પણ આ પ્રોટીન માટે સંભવિત આંશિક માળખા પર મૂલ્યવાન માહિતી પ્રદાન કરી શકે છે. અભિવ્યક્તિ FAM83A માનવ શરીરના ઘણા જુદા જુદા ક્ષેત્રોમાં અને ખૂબ જ અલગ સ્તરે વ્યક્ત થાય છે. ઇએસટી ડેટા સૂચવે છે કે આ જનીન મુખ્યત્વે પુખ્ત વયના લોકોમાં વ્યક્ત થાય છે. તે પ્રોસ્ટેટ, ફેફસાં અને અન્નનળીમાં અન્ય ઊભા અભિવ્યક્તિ સાથે મોં અને કંઠસ્થાનમાં નોંધપાત્ર સ્તર દર્શાવે છે. માથા અને ગરદનની ગાંઠો, ફેફસાના ગાંઠો, પ્રોસ્ટેટ કેન્સર અને મૂત્રાશયના કાર્સિનોમામાં આ સામાન્ય સ્તર વધુ ઊંચા હોય છે. માઇક્રોએરે એક્સપ્રેશન ડેટા પણ વિવિધ પર્યાવરણીય પરિસ્થિતિઓ દર્શાવે છે, ખાસ કરીને બળતરા. આવા બળતરા સિગારેટનો ધુમાડો હોઈ શકે છે, જ્યાં FAM83A 24 કલાકના સંપર્ક પછી અભિવ્યક્તિમાં વધારો કરે છે, અને શ્વાસનળીના ઉપકલા કોષો પર ઘરની ધૂળના જીવાતનો અર્ક, જ્યાં સંપર્ક પછી FAM83A અભિવ્યક્તિ પણ વધે છે. ટ્રાન્સક્રિપ્શન ફેક્ટર 2 (એટીએફ 2) ને સક્રિય કરતી વખતે એફએએમ83એ અભિવ્યક્તિમાં ઘટાડો દર્શાવે છે. એ. ટી. એફ. 2 પ્રમોટર ક્ષેત્રમાં બંધાય તેવી આગાહી કરવામાં આવી ન હોવાથી, તે સૂચવે છે કે એફ. એ. એમ. 83એ અને એ. ટી. એફ. 2 વચ્ચે પરોક્ષ સંબંધ છે. એટીએફ 2 સાથે પરોક્ષ સંબંધ સાથે બળતરા અને એલર્જનની અભિવ્યક્તિમાં વધારો થતાં, તે સૂચવે છે કે એફએએમ83એ સંકેત માર્ગમાં હોઈ શકે છે. કેન્સર એવા ઘણા અભ્યાસો છે જે ફેફસાં, પ્રોસ્ટેટ અને મૂત્રાશયના કેન્સરને FAM83A ઓવરએક્સપ્રેશન સાથે જોડે છે. સંશોધકોનું માનવું છે કે આ જનીન આ કેન્સર, ખાસ કરીને ફેફસાના કેન્સરની વહેલી તપાસ માટે સારો વિકલ્પ બની શકે છે. તે અજ્ઞાત છે કે શા માટે અથવા કેવી રીતે FAM83A નિયમન કરવામાં આવે છે. અભ્યાસોએ દર્શાવ્યું છે કે આર્સેનિક નિયમનનું કારણ બનતા પ્રવર્તકને એસિટિલેટ કરી શકે છે, જે સૂચવે છે કે આ જનીન કેન્સરમાં કેવી રીતે અનિયંત્રિત બને છે તેની સમાન પદ્ધતિ હોઈ શકે છે. પ્રોટીનની ક્રિયાપ્રતિક્રિયા એફએએમ83એ એ સ્ટ્રીંગ ટૂલ દ્વારા તાળવું, ફેફસાં અને અનુનાસિક એપિથેલિયમ કાર્સિનોમા સંકળાયેલ પ્રોટીન (પીએલયુએનસી) સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરે છે તેવું દર્શાવવામાં આવ્યું છે. એકત્રિત કરવામાં આવેલી આ માહિતી કેન્સર સાથે વ્યવહાર કરતી ટેક્સ્ટ માઇનિંગ માહિતીમાંથી આવી છે. હોમોલોજી FAM83A પ્રમાણમાં નવું જનીન હોવાનું જણાય છે, જેમાં BLAST અને BLAT માત્ર હાડકાની માછલીઓ દ્વારા ઓર્થોલોજી દર્શાવે છે. તે તેના સંબંધીઓ દ્વારા ખૂબ જ સંરક્ષિત છે DUF1669 ડોમેન એ પ્રોટીનનો સૌથી વધુ સંરક્ષિત પ્રદેશ છે, જેની બહારના વિસ્તારો વધુ પરિવર્તનશીલ છે. નીચે ઓર્થોલોગનું કોષ્ટક છે, જે નોંધે છે કે આ એક વ્યાપક સૂચિ નથીઃ સંદર્ભો