Influenza A segment 7 splice site
ઈન્ફલ્યુએન્ઝા એ વાયરસ સેગમેન્ટ 7 પ્રી-એમઆરએનએની 3 'સ્પ્લાઇસ સાઇટ બે અલગ અલગ પ્રકારના આરએનએ માળખાને અપનાવી શકે છેઃ સ્યુડોકનોટ અને હેરપિન. આ કન્ફોર્મેશનલ સ્વીચ આર. એન. એ. વૈકલ્પિક સ્પ્લિસિંગમાં ભૂમિકા ભજવવાની દરખાસ્ત કરવામાં આવી છે અને આ પૂર્વ-એમ. આર. એન. એ. ના સ્પ્લિસિંગ દ્વારા ઉત્પાદિત એમ1 અને એમ2 પ્રોટીનના ઉત્પાદનને પ્રભાવિત કરી શકે છે. ઝાંખી આ સંરચિત પ્રદેશ સૌપ્રથમ થર્મોડાયનેમિક ફોલ્ડિંગ ફ્રી એનર્જી અને એમિનો એસિડ કોડન દમન પર આધારિત ઈન્ફલ્યુએન્ઝા A ના બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ સર્વેક્ષણમાં શોધાયો હતો. ગૌણ માળખાના પ્રારંભિક નમૂનાઓ ન્યુક્લિક એસિડ માળખાની આગાહી માટે ગણતરીની પદ્ધતિઓ પર આધારિત હતા. હેરપિનની રચનાની આગાહી આર. એન. એ. કેલિફોલ્ડનો ઉપયોગ કરીને કરવામાં આવી હતી, જ્યારે સ્યુડોકનોટની આગાહી ડોટનોટ સાથે કરવામાં આવી હતી. સેગમેન્ટ 7 એમ1 પ્રોટીન અને નાના એમ2 પ્રોટોન ચેનલ પ્રોટીનને એન્કોડ કરે છે, જે આરએનએ સ્પ્લિસિંગ દ્વારા ઉત્પન્ન થાય છે. એમ2 પ્રોટીન વાયરસ માટે મહત્વપૂર્ણ છેઃ તે આયન ચેનલો બનાવે છે જે વિરિયનના એસિડિફિકેશન માટે પરવાનગી આપે છે જે અન-કોટિંગમાં ઉત્તેજિત થાય છે. એમ2 ઉત્પન્ન કરવા માટે ઉપયોગમાં લેવાતા 3 'સ્પ્લાઇસ સાઇટ વિસ્તારની માળખા-સંવેદનશીલ રસાયણો અને ઉત્સેચકો સાથે પ્રાયોગિક રીતે તપાસ કરવામાં આવી હતી અને તે દ્રાવણમાં હેરપિન અને સ્યુડોકનોટ બંધારણ બંનેને અપનાવતો હોવાનું જાણવા મળ્યું હતું. દરેક રચના વિવિધ માળખાકીય વાતાવરણમાં મહત્વપૂર્ણ સ્પ્લિસિંગ નિયમનકારી સાઇટ્સ મૂકે છે, જે સેગમેન્ટ 7 ટ્રાન્સક્રિપ્ટના સ્પ્લિસિંગના મોડ્યુલેશન માટે અસરો ધરાવે છે. ઉદાહરણ તરીકે, સ્પ્લાઇસ સાઇટ, પોલીપાયરિમિડીન ટ્રેક્ટ, શાખા બિંદુ અને ASF/SF2 એક્સોનિક એન્હાન્સર બાઈન્ડીંગ સાઇટ્સ હેરપિનની રચનામાં વધુ સુલભ અને સ્યુડોકનોટમાં ઓછી સુલભ હોવાની અપેક્ષા છે (આકૃતિ 1). સ્યુડોકનોટ અને હેરપિન વચ્ચેના સંતુલનને બદલીને અનુક્રમે એમ2 સ્પ્લિસિંગને ઘટાડવું અથવા વધારવું શક્ય બની શકે છે. સંભવિત વહેંચાયેલ મિકેનિઝમ આ અનુમાનિત મિકેનિઝમ તે પણ હોઈ શકે છે જે સ્પ્લિસ્ડ ઈન્ફલ્યુએન્ઝા ટ્રાન્સક્રિપ્ટ માટે સામાન્ય છે. સમાન રીતે મૂકવામાં આવેલ, પરંતુ માળખાકીય રીતે અલગ, ઈન્ફલ્યુએન્ઝા વાયરસ સ્યુડોકનોટ/હેરપિનને સેગમેન્ટ 8 ટ્રાન્સક્રિપ્ટની 3 'સ્પ્લાઇસ સાઇટમાં પણ વર્ણવવામાં આવ્યું હતું, જે એનપીને એન્કોડ કરે છે અને, સ્પ્લિસિંગ દ્વારા, એનઇપી પ્રોટીન. આ માળખાઓ ઈન્ફલ્યુએન્ઝા એ અને ઈન્ફલ્યુએન્ઝા બી યજમાન પ્રજાતિઓ વચ્ચે વહેંચાયેલ માળખાગત આર. એન. એ. નું કુટુંબ બનાવે છે ચોક્કસ માળખાકીય સ્થિરતા ઈન્ફલ્યુએન્ઝા એ વિભાગ 7 માં 3 'સ્પ્લાઇસ સાઇટ સ્ટ્રક્ચર્સ માળખાકીય સ્થિરતામાં યજમાન-પ્રજાતિઓ ચોક્કસ વલણો દર્શાવે છે. માળખાકીય રીતે સ્થિર પરિવર્તનની સૌથી મોટી સંખ્યા એવિયન ચોક્કસ તાણમાં જોવા મળે છે, જ્યારે સૌથી વધુ માળખાકીય રીતે અસ્થિર પરિવર્તન માનવ તાણમાં જોવા મળે છેઃ ડુક્કર વચ્ચે પડી ગયા. સ્થિરતામાં આ સામાન્ય વલણ એવિયન, ડુક્કર, માનવ, લગભગ તે તાપમાનને અનુસરે છે કે જેના પર ઈન્ફલ્યુએન્ઝા વાયરસ દરેક યજમાન પ્રજાતિઓમાં પ્રજનન કરે છે. એવિયન આંતરડા અને ડુક્કર અને માનવ ફેફસાનું તાપમાન અનુક્રમે 42,37 અને 34 ડિગ્રી સેલ્સિયસ હોય છે. આ નિરીક્ષણ ઈન્ફલ્યુએન્ઝા એ કોડિંગ ક્રમમાં વૈશ્વિક વલણનું સ્થાનિક ઉદાહરણ છે, જ્યાં એવિયન, ડુક્કર અને માનવ તાણ અલગ સ્થિરતા દર્શાવે છે. એવું બની શકે છે કે કાર્યાત્મક માળખાં અથવા મહત્વપૂર્ણ માળખાકીય સંતુલન જાળવવા માટે જ્યાં પ્રતિકૃતિ તાપમાન ઊંચું હોય તેવા યજમાનોમાં આર. એન. એ. માળખું વધુ સ્થિર હોય. સ્યુડોકોનૉટ નોન-કોડિંગ આરએનએ ન્યુક્લિક એસિડ સેકન્ડરી સ્ટ્રક્ચર સંદર્ભો સ્યુડોબેઝ + +-ડેટાબેઝ ઓફ આરએનએ સ્યુડોકોનૉટ સેકન્ડરી સ્ટ્રક્ચર્સ ટર્નર લેબ સિસ-રેગ્યુલેટરી આરએનએ એલિમેન્ટ્સ મોલેક્યુલર જિનેટિક્સ ઈન્ફલ્યુએન્ઝા