METTL26
METTL26, જેને અગાઉ C16orf13 નામ આપવામાં આવ્યું હતું, તે મિથાઈલટ્રાન્સફેરેઝ લાઇક 26 માટે પ્રોટીન-કોડિંગ જનીન છે, જેને JFP2 તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે. આ જનીનનું કાર્ય અજ્ઞાત હોવા છતાં, વિવિધ ડેટા દર્શાવે છે કે તે વિવિધ કેન્સરગ્રસ્ત પેશીઓમાં ઉચ્ચ સ્તરે વ્યક્ત થાય છે. આ જનીનની અસ્પષ્ટ અભિવ્યક્તિને મનુષ્યમાં રોગના પરિણામો સાથે પણ જોડવામાં આવી છે. જીન METTL26 મનુષ્યમાં રંગસૂત્ર 16ના ટૂંકા હાથ પર તેરમી ખુલ્લી વાંચન ફ્રેમમાં સ્થિત છે. 1, 2, 3, 4 અને 7 નામના આ જનીનના પાંચ ટ્રાન્સક્રિપ્ટ પ્રકારો છે. સૌથી લાંબી સી. ડી. એન. એ. ટ્રાન્સક્રિપ્ટ (ટ્રાન્સક્રિપ્ટ વેરિઅન્ટ 1) માં 854 બેઝ જોડી છે. આ લખાણ છ એક્સોનથી બનેલું છે, જે તમામ પ્રોટીનમાં સમાવિષ્ટ મુખ્ય સુપરફેમિલી, મિથાઈલટ્રાન્સફેરેસ સુપરફેમિલીમાં ફાળો આપે છે. આ જનીનનું પ્રાથમિક લખાણ 1,919 આધાર જોડીઓ લાંબું છે. પ્રજાતિ વિતરણ ડોટલેટ કાર્યક્રમનો ઉપયોગ કરીને, માનવ જનીનની તેના ચિમ્પાન્ઝી ઓર્થોલોગ સાથે સરખામણી કરવા માટે એક ડોટ પ્લોટનું નિર્માણ કરવામાં આવ્યું હતું. આ આલેખ જનીનની શરૂઆતમાં અને અંતે અનુક્રમ સંરક્ષણ સૂચવે છે, જે 5 'અને 3' અનુવાદિત ન હોય તેવા પ્રદેશોમાં સંરક્ષણ અને સમાનતા સૂચવે છે. 5 'યુ. ટી. આર. અને 3' યુ. ટી. આર. માં આ અનુક્રમ સમાનતા ભૂતકાળની સસ્તન પ્રજાતિઓનો વિસ્તાર કરતી નથી, અને ઝેનોપસ ટ્રોપિકલિસ જેવી દૂરથી સંબંધિત પ્રજાતિઓ સાથે માનવ જનીનના ડોટ પ્લોટમાં લગભગ કોઈ સમાનતા દર્શાવતી નથી. એસ. ડી. એસ. સી. બાયોલોજી વર્કબેન્ચનો ઉપયોગ કરીને હાથ ધરવામાં આવેલ બહુવિધ અનુક્રમ સંરેખણ જનીનના અપસ્ટ્રીમ પ્રદેશમાં વાંદરાઓ કરતાં વધુ દૂરથી સંબંધિત પ્રજાતિઓ વચ્ચે થોડી અનુક્રમ સમાનતા દર્શાવે છે. માનવ C16orf13 જનીનમાં ટ્રાન્સક્રિપ્શન સાઇટની શરૂઆતની નજીક, વાંદરાઓમાં ઉચ્ચ સંરક્ષણ છે જેમાં અપસ્ટ્રીમ ડેટા ઉપલબ્ધ હતો, ખાસ કરીને માનવ, ઓરંગુટન અને રીસસ મંકી C16orf13 જનીન ઓર્થોલોગ્સ. વાંદરાઓ વચ્ચે ઉચ્ચ શ્રેણીની સમાનતા પ્રમોટર પ્રદેશ, 5 'યુ. ટી. આર. અને C16orf13 જનીનમાં સ્પષ્ટ છે. નીચેનો આલેખ C16orf13 ટ્રાન્સક્રિપ્ટ વેરિઅન્ટ 1 માટે પસંદ કરેલ જનીન ઓર્થોલોગ્સ દર્શાવે છે. આ માહિતી એન. સી. બી. આઈ. બ્લાસ્ટમાંથી એકત્રિત કરવામાં આવી છે. પેશી વિતરણ એન. સી. બી. આઈ. યુનિજીનમાંથી માનવ અભિવ્યક્તિ રૂપરેખા સૂચવે છે કે આ જનીન શરીરમાં ઘણી જુદી જુદી પેશીઓમાં વ્યાપક અભિવ્યક્તિ ધરાવે છે. આ અભિવ્યક્તિ રૂપરેખા સૂચવે છે કે આ જનીન એક "હાઉસકીપિંગ જનીન" છે, જે પેશીઓને ધ્યાનમાં લીધા વિના તમામ કોષોમાં મહત્વપૂર્ણ અસરો ધરાવે છે. અભિવ્યક્તિનું ઉચ્ચતમ સ્તર મૂત્રપિંડની ગ્રંથિ, ફેફસાં અને પેરાથાઇરોઇડમાં જોવા મળે છે. આ ટોચના ત્રણ ઉપરાંત ઘણા વધારાના સ્થળો છે જ્યાં જનીન ઉચ્ચ સ્તરે વ્યક્ત થાય છે. જ્યાં જનીન વ્યક્ત થતું નથી તેવી કેટલીક પેશીઓમાં કોઈ વાસ્તવિક સમાનતા હોય તેવું લાગતું નથી. આ અભિવ્યક્તિ માહિતી ચોક્કસ કાર્યમાં કોઈ સંકેત આપતી હોય તેવું લાગતું નથી, સિવાય કે તે સૂચવે છે કે જનીન લગભગ તમામ કોષોના "હાઉસકીપિંગ" કાર્યમાં સામેલ છે. જનીન પડોશી C16orf13 જનીન રંગસૂત્ર 16 ના અંતની નજીક સ્થિત છે, જે સંભવિત રીતે વિલોપન પરિવર્તનને આધિન છે. સી16ઓઆરએફ13 જનીનની આસપાસના જનીનોમાં જમણી બાજુએ કાલ્પનિક પ્રોટીન એલઓસી100287175 અને એલઓસી100138285 અને ડાબી બાજુએ આરએબી40સી અને ડબલ્યુએફઆઈકેએન1નો સમાવેશ થાય છે. આ જનીન LOC100138285 સાથે માઈનસ સ્ટ્રાન્ડ પર સ્થિત છે. આસપાસના અન્ય જનીનો પ્લસ સ્ટ્રાન્ડ પર વિપરીત રીતે લક્ષી છે. જનીન પડોશીને નીચેની યોજનામાં રજૂ કરવામાં આવે છે, જે મૂળરૂપે NCBI જનીનમાંથી છે. પ્રોટીન જે પ્રોટીન માટે આ જનીન કોડ કરે છે તે યુપીએફ0585 તરીકે ઓળખાય છે, જ્યાં યુપીએફ અજ્ઞાત પ્રોટીન કાર્યને સંકેત આપે છે. આ પ્રોટીનના પાંચ આઇસોફોર્મ્સ છે, જે જનીનના પાંચ સ્પ્લાઇસ પ્રકારોને અનુરૂપ છે. આઇસોફોર્મ્સને a, b, c, d અને g નામ આપવામાં આવ્યા છે ઉપર જણાવ્યા મુજબ, આ એમિનો એસિડ ક્રમની BLAST શોધમાં શોધાયેલ સંરક્ષિત ક્ષેત્ર મિથાઈલટ્રાન્સફેરેઝ સુપરફેમિલી છે. સંરક્ષણ એસ. ડી. એસ. સી. બાયોલોજી વર્કબેન્ચમાં પ્રોટીન સાધનોનો ઉપયોગ કરીને હાથ ધરવામાં આવેલ બહુવિધ અનુક્રમ સંરેખણ, મિથાઈલટ્રાન્સફેરેઝ ડોમેન માટે કોડ તરીકે જાણીતા પ્રદેશમાં, આર્કિયા સુધી દૂરથી સંબંધિત પ્રોટીન ઓર્થોલોગ્સ વચ્ચે કેટલીક અનુક્રમ સમાનતા દર્શાવે છે. પ્રોટીનનો મિથાઈલટ્રાન્સફેરેઝ સુપરફેમિલી ભાગ વિવિધ પ્રજાતિઓમાં વધુ નજીકથી સંબંધિત ઓર્થોલોગસ પ્રોટીનમાં વધુ સંરક્ષિત દેખાય છે. પ્રજાતિ વિતરણ C16orf13 ઘણી પ્રજાતિઓમાં સમરૂપતા ધરાવે છે, જેમાં ફૂગ અને છોડમાં દૂરના ઓર્થોલોગ્સનો સમાવેશ થાય છે. આ પ્રોટીનના કોઈ જાણીતા પેરાલોગ નથી આ જનીન અને તેનું પ્રોટીન વાંદરાઓ અને સસ્તન પ્રાણીઓમાં, ખાસ કરીને કાર્યાત્મક મિથાઈલટ્રાન્સફેરેઝ ક્ષેત્રમાં ખૂબ જ સંરક્ષિત છે. નીચેનો આલેખ C16orf13 ટ્રાન્સક્રિપ્ટ વેરિઅન્ટ 1 માટે પસંદ કરેલ પ્રોટીન ઓર્થોલોગ્સ દર્શાવે છે. આ માહિતી એન. સી. બી. આઈ. બ્લાસ્ટમાંથી એકત્રિત કરવામાં આવી છે. અનુમાનિત ગુણધર્મો પ્રોટીનની અંદર આલ્ફા હેલિસીસ અને બીટા શીટ્સની ઘટનાની આગાહી કરવા માટે એલ્ગોરિધમ્સનો ઉપયોગ કરીને પ્રોટીનની ગૌણ રચનાની આગાહી કરી શકાય છે. એસ. ડી. એસ. સી. બાયોલોજી વર્કબેન્ચમાં CHOFAS, GOR4 અને PELE અલ્ગોરિધમ્સનો ઉપયોગ કરીને પ્રોટીન માળખાનું વિશ્લેષણ હાથ ધરવામાં આવ્યું હતું. વિશ્લેષણને જોડવામાં આવ્યું હતું અને નજીકના આકૃતિમાં સામેલ કરવામાં આવ્યું હતું. માત્ર એક કરતાં વધુ આઉટપુટમાં દેખાતી રચનાઓનો સમાવેશ કરવામાં આવ્યો હતો. ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ આ પ્રોટીન માટે થોડી જાણીતી ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ છે. જીનકાર્ડ ડેટાબેઝમાં અથવા MINT ડેટાબેઝમાં કોઈ ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ મળી ન હતી. એક સ્ટ્રીંગ શોધ બે જનીન આઉટપુટમાં પરિણમી હતી. આ બે જનીન ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ, જોકે, જનીન પડોશીની પુરાવા શ્રેણીમાં છે, જે જરૂરી નથી કે સૂચવે છે કે આ જનીનો કોઈપણ અર્થપૂર્ણ રીતે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરે છે, અથવા તે જ સમયે વ્યક્ત પણ થાય છે. આ પ્રોટીન સાથેની ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ માટે હાલમાં કોઈ મજબૂત પુરાવા નથી. માઇક્રોએરે પ્રયોગોમાંથી રોગ જોડાણ ડેટા આ જનીનની અભિવ્યક્તિને વિવિધ પેશીઓમાં કેન્સર સાથે જોડે છે, ખાસ કરીને સ્તન અને ગેસ્ટ્રિક કેન્સર. વધુમાં, આ જનીનની અભિવ્યક્તિ હેઠળ રોગ, ખાસ કરીને જોડાયેલી પેશીઓના રોગ, પોષણ અને ચયાપચયની વિકૃતિઓ અને પાચન વિકૃતિઓ સાથે પણ સંકળાયેલું છે. કેનસાર વર્કબેન્ચ ડેટાબેઝ માઇક્રોએરે ડેટા દર્શાવે છે જે C16orf13 જનીનની અભિવ્યક્તિને માનવ રંગસૂત્ર પર વિવિધ કાર્સિનોમા સંદર્ભ જનીનો સાથે જોડી શકે છે.