Genomespace
જીનોમસ્પેસ એ જીનોમિક્સ સોફ્ટવેર સાધનો અને કાર્યક્રમો માટેનું વાતાવરણ છે. તે વપરાશકર્તાઓને વેબ એપ્લિકેશન્સ અને ડેસ્કટોપ ટૂલ્સ સહિત બહુવિધ વિવિધ સાધનોને સંડોવતા તેમના વિશ્લેષણ વર્કફ્લોને સંચાલિત કરવામાં મદદ કરે છે અને સ્વચાલિત ફોર્મેટ રૂપાંતરણ દ્વારા સાધનો વચ્ચે ડેટાના સ્થાનાંતરણની સુવિધા આપે છે. વિશ્લેષણ સ્થાનિક અથવા ક્લાઉડ-આધારિત સ્ટોર્સમાંથી ડેટાનો ઉપયોગ કરી શકે છે. જિનોમસ્પેસમાં વપરાશકર્તાઓ માટે વેબ-આધારિત વપરાશકર્તા ઇન્ટરફેસ (UI) અને જિનોમસ્પેસ સાથે તેમની એપ્લિકેશનોને એકીકૃત કરતા વિકાસકર્તાઓ માટે પ્રતિનિધિત્વાત્મક સ્ટેટ ટ્રાન્સફર (RESTful) એપ્લિકેશન પ્રોગ્રામિંગ ઇન્ટરફેસ (API) અને જાવા-આધારિત ક્લાયન્ટ ડેવલપમેન્ટ કીટ (CDK) બંનેનો સમાવેશ થાય છે. જિનોમસ્પેસ સાધનો જિનોમિક્સ વિશ્લેષણ માટે કેટલાક સાધનો અને માહિતી સ્રોતો સાથે જોડાયેલા છેઃ સાયટોસ્કેપ, ગેલેક્સી, જીનપેટર્ન, જિનોમિકા, જીઓવર્કબેન્ચ, ઇનસિલિકો ડીબી, ઇન્ટિગ્રેટિવ જિનોમિક્સ વ્યૂઅર (આઇજીવી) અને યુસીએસસી જિનોમ બ્રાઉઝર. આ કાર્યક્રમો નેટવર્ક વિશ્લેષણ અને વિઝ્યુલાઇઝેશન, અનુક્રમ વિશ્લેષણ, સંપૂર્ણ જીનોમ વિશ્લેષણ, સામાન્ય આંકડાકીય પદ્ધતિઓ, જનીન અભિવ્યક્તિ વિશ્લેષણ, પ્રોટિઓમિક્સ, ફ્લો સાયટોમેટ્રી, આગામી પેઢીના અનુક્રમ વિશ્લેષણ અને જીનોમિક ડેટાસેટ્સ સહિત વિવિધ પ્રકારના જીનોમિક વિશ્લેષણ પ્રદાન કરે છે. અન્ય જીનોમિક્સ સોફ્ટવેરના વિકાસકર્તાઓ તેમના સાધનો ઉમેરવા માટે જીનોમસ્પેસ એપીઆઈનો ઉપયોગ કરી શકે છે. સહયોગીઓ જીનોમસ્પેસ પ્રોજેક્ટ બ્રોડ ઇન્સ્ટિટ્યૂટ ખાતે મેસિરોવ અને રેગેવ પ્રયોગશાળાઓ; સ્ટેનફોર્ડ યુનિવર્સિટી ખાતે ચાંગ પ્રયોગશાળા; યુનિવર્સિટી ઓફ કેલિફોર્નિયા, સાન ડિએગો ખાતે ઇડેકર પ્રયોગશાળા; પેન્સિલવેનિયા સ્ટેટ યુનિવર્સિટી ખાતે નેક્રુટેનકો પ્રયોગશાળા; વેઇઝમેન ઇન્સ્ટિટ્યૂટ ઓફ સાયન્સ ખાતે સેગલ પ્રયોગશાળા; અને યુનિવર્સિટી ઓફ કેલિફોર્નિયા, સાન્ટા ક્રૂઝમાં હૌસ્લર અને કેન્ટ પ્રયોગશાળાઓનો સહયોગ છે. જીનોમસ્પેસને નેશનલ ઇન્સ્ટિટ્યૂટ ઓફ હેલ્થની નેશનલ હ્યુમન જીનોમ રિસર્ચ ઇન્સ્ટિટ્યૂટ દ્વારા ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે. સંદર્ભો બાહ્ય કડીઓ મુક્ત બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ સોફ્ટવેર