CheShift
ચેશિફ્ટ-2 (ઉચ્ચાર/ટીએચઇએચઆઇએફટી/) એ 13સીએ અને 13સીબીએ પ્રોટીન રાસાયણિક પાળીની ગણતરી કરવા અને પ્રોટીન માળખાને માન્ય કરવા માટે બનાવવામાં આવેલી એપ્લિકેશન છે. તે 20 એમિનો એસિડના ટોર્સનલ ખૂણાઓ (φ, si, ω અને χ1, χ2) ના કાર્ય તરીકે 13Cα અને 13Cβકેમિકલ શિફ્ટની ક્વોન્ટમ મિકેનિક્સ ગણતરીઓ પર આધારિત છે. ચેશિફ્ટ-2 પી. ડી. બી. ફાઇલમાંથી સૈદ્ધાંતિક રાસાયણિક શિફ્ટ મૂલ્યોની સૂચિ પરત કરી શકે છે. તે અપલોડ કરેલી PDB ફાઇલ અને રાસાયણિક શિફ્ટ મૂલ્યોના આધારે 3D પ્રોટીન મોડેલ પણ પ્રદર્શિત કરી શકે છે. 3D પ્રોટીન મોડેલ પાંચ રંગ કોડનો ઉપયોગ કરીને રંગીન કરવામાં આવે છે જે સૈદ્ધાંતિક વિરુદ્ધ અવલોકન કરેલ રાસાયણિક પરિવર્તન મૂલ્યોના તફાવતોને સૂચવે છે. અવલોકન કરાયેલ અને આગાહી કરાયેલ 13Cα અને 13Cβ રાસાયણિક પાળી વચ્ચેના તફાવતોનો ઉપયોગ સંવેદનશીલ તપાસ તરીકે થઈ શકે છે, જેની મદદથી પ્રોટીન માળખામાં સંભવિત સ્થાનિક ભૂલો શોધી શકાય છે. જો 13Cα અને 13Cβ બંને અવલોકન કરેલ રાસાયણિક પાળી પૂરી પાડવામાં આવે તો ચેશિફ્ટ-2 વૈકલ્પિક χ1 અને χ2 બાજુ-સાંકળના વળાંકવાળા ખૂણાઓની સૂચિ પ્રદાન કરવાનો પ્રયાસ કરશે જે અવલોકન કરેલ અને ગણતરી કરેલ રાસાયણિક પાળી વચ્ચેના તફાવતોને ઘટાડશે, આ મૂલ્યોનો ઉપયોગ પ્રોટીન માળખામાં ભૂલોને સુધારવા માટે થઈ શકે છે. ચેશિફ્ટ-2 ને ઓનલાઇન http://www.cheshift.com પર અથવા પાયમોલ પ્લગઇન દ્વારા એક્સેસ કરી શકાય છે. આ પણ જુઓ સ્ટ્રક્ચર વેલિડેશન બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ કોમ્પ્યુટેશનલ બાયોલોજી સંબંધિત સોફ્ટવેર શું છે જો સોફ્ટવેર PROCHECK PROSVS બાહ્ય લિંક્સ ચેશિફ્ટ પાયમોલ પ્લગઇન ગિટહબ રીપોઝીટરી સંદર્ભો બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ સોફ્ટવેર