Formate-nitrite transporter
ફોર્મેટ-નાઇટ્રાઇટ ટ્રાન્સપોર્ટર (એફએનટી) ફેમિલી મેજર ઇન્ટ્રિન્સિક પ્રોટીન (એમઆઇપી) સુપર ફેમિલી સાથે સંબંધિત છે. એફ. એન. ટી. પરિવારના સભ્યોને ગ્રામ-નેગેટિવ અને ગ્રામ-પોઝિટિવ બેક્ટેરિયા, આર્કિયા, યીસ્ટ, છોડ અને નીચલા યુકેરીયોટ્સથી અનુક્રમિત કરવામાં આવ્યા છે. એફ. એન. ટી. પરિવારના પ્રોકેરીયોટિક પ્રોટીન કદાચ માળખાકીય રીતે સંબંધિત સંયોજનો, ફોર્મેટ અને નાઇટ્રાઇટના પરિવહનમાં કાર્ય કરે છે. માળખું યીસ્ટ પ્રોટીન (627 એમિનો એસાઇલ અવશેષો) ના અપવાદ સાથે, પરિવારના તમામ લાક્ષણિક સભ્યો લંબાઈમાં 256-285 અવશેષોના હોય છે અને 6-8 અનુમાનિત ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન α-હેલિકલ સ્પૅનર્સ (TMSs) પ્રદર્શિત કરે છે. એક કિસ્સામાં, ઇ. કોલી ફોકા (TC #1.A.16.1.1) પ્રોટીનની 6 TMS ટોપોલોજી સ્થાપિત કરવામાં આવી છે. યીસ્ટ પ્રોટીન સમાન સ્પષ્ટ ટોપોલોજી ધરાવે છે પરંતુ લગભગ 400 અવશેષોનું વિશાળ સી-ટર્મિનલ હાઇડ્રોફિલિક વિસ્તરણ ધરાવે છે. ઇ. કોલીનું ફોકા એ એક સપ્રમાણ પેન્ટામર છે, જેમાં દરેક પેટા એકમ છ ટી. એમ. એસ. ધરાવે છે. ફિલોજેની ફિલોજેનેટિક વૃક્ષ કાર્ય અને ઓર્ગેનિઝમલ ફિલોજેની અનુસાર ક્લસ્ટરિંગ દર્શાવે છે. પાયરુવેટ-ફોર્મેટ લાઇઝ (પી. એફ. એલ.) સાથે સંકળાયેલા બેક્ટેરિયાના પુટેટિવ ફોર્મેટ ઇફ્લક્સ ટ્રાન્સપોર્ટર (એફ. ઓ. સી. એ.; <આઇ. ડી. 8> <આઇ. ડી. 4> અને <આઇ. ડી. 1>) માં ક્લસ્ટર I નો સમાવેશ થાય છે; ફોર્મેટ ડિહાઇડ્રોજનેઝ સાથે સંકળાયેલા બેક્ટેરિયા અને આર્કિયાના પુટેટિવ ફોર્મેટ અપટેક પરમીઝીસ (એફ. ડી. એચ. સી.; <આઇ. ડી. 8> <આઇ. ડી. 2> અને <આઇ. ડી. 7>) માં ક્લસ્ટર II નો સમાવેશ થાય છે; બેક્ટેરિયાના નાઇટ્રાઇટ અપટેક પરમીઝીસ (એન. આર. સી., <આઇ. ડી. 8> <આઇ. ડી. 6>, <આઇ. ડી. 3>, અને <આઇ. ડી. 5>) માં ક્લસ્ટર III નો સમાવેશ થાય છે, અને કાર્ય એફ. એન. ટી. પરિવારના પ્રોટીન માટે ઊર્જા જોડાણ પદ્ધતિઓને વ્યાપક રીતે વર્ગીકૃત કરવામાં આવી નથી. એચસીઓ અને નો અપટેકને એચ + સિમ્પોર્ટ સાથે જોડી શકાય છે. એચ. સી. ઓ. પ્રવાહ પટલની ક્ષમતા દ્વારા યુનિપોર્ટ મિકેનિઝમ અથવા એચ + એન્ટિપોર્ટ દ્વારા સંચાલિત થઈ શકે છે. ઇ. કોલીનું એફ. ઓ. સી. એ. દ્વિદિશાત્મક બંધારણીય પરિવહનને ઉત્પ્રેરિત કરે છે અને ચેનલ-પ્રકારની પદ્ધતિ દ્વારા કાર્ય કરી શકે છે. એફ. ઓ. સી. એ., શોર્ટ-ચેઇન એસિડનું પરિવહન કરે છે. FocA તેની કામગીરીની રીતને ઉચ્ચ બાહ્ય pH પર નિષ્ક્રિય નિકાસ ચેનલમાંથી ઓછી pH પર ગૌણ સક્રિય ફોર્મેટ/H + આયાતકારમાં ફેરવી શકે છે. pH 4.0 પર સાલ્મોનેલા ટાઇફિમ્યુરિયમ FocA નું સ્ફટિક માળખું દર્શાવે છે કે આ સ્વીચમાં પેન્ટામેરિક ચેનલમાં વ્યક્તિગત પ્રોટોમર્સના એમિનો ટર્મિનસની મુખ્ય પુનઃગોઠવણીનો સમાવેશ થાય છે. એમિનો-ટર્મિનલ હેલિસીસ એક સંકલિત, સહકારી ક્રિયામાં પરિવહનને ખોલે છે અથવા અવરોધે છે જે સૂચવે છે કે એફ. ઓ. સી. એ. ને પીએચ-આધારિત રીતે કેવી રીતે ગેટેડ કરવામાં આવે છે. ઇલેક્ટ્રોફિઝીયોલોજીકલ અભ્યાસો દર્શાવે છે કે પ્રોટીન pH 7 પર ચોક્કસ ફોર્મેટ ચેનલ તરીકે કાર્ય કરે છે અને તે pH ના 5.1 પર સ્થળાંતર પર બંધ થાય છે. પરિવહન પ્રતિક્રિયા એફ. એન. ટી. પરિવારના વિવિધ સભ્યો દ્વારા ઉત્પ્રેરિત સંભવિત પરિવહન પ્રતિક્રિયાઓ છેઃ (1) આર. સી. ઓ. અથવા એન. ઓ. (આઉટ) આર. સી. ઓ. અથવા એન. ઓ. (ઇન), (2) એચ. સી. ઓ. (ઇન) એચ. સી. ઓ. (આઉટ), (3) એચ. એસ.-(આઉટ) એચ. એસ.-(ઇન). સભ્યો એફ. એન. ટી. પરિવાર સાથે જોડાયેલા હાલમાં વર્ગીકૃત સભ્યોની પ્રતિનિધિ સૂચિ ટ્રાન્સપોર્ટર વર્ગીકરણ ડેટાબેઝમાં મળી શકે છે. કેટલાક લાક્ષણિકતા ધરાવતા સભ્યોમાં નીચેનાનો સમાવેશ થાય છેઃ ફોકા અને ફોકાબી (અનુક્રમે TC#s 1.A.16.1.1 અને 1.A.16.1.2), એસ્ચેરીચીયા કોલીમાંથી, ફોર્મેટના દ્વિદિશ પરિવહનમાં સામેલ પરિવહનકારો. એફ. ડી. એચ. સી., મિથેનોબેક્ટેરિયમ મેરિપાલુડિસ (ટી. સી. #<આઇ. ડી. 2>) અને મિથેનોથર્મોબેક્ટર થર્મોફોર્મિકમ (ટી. સી. #<આઇ. ડી. 1>) માંથી, સંભવિત ફોર્મેટ ટ્રાન્સપોર્ટર છે. નિર્સી, ઇ. કોલી (TC #1.A.16.3.1) માંથી, સંભવિત નાઇટ્રાઇટ ટ્રાન્સપોર્ટર છે. ક્લેમીડોમોનાસ રીનહાર્ડ્ટી (ક્લેમીડોમોનાસ સ્મિથી) નું નાર1 (TC #1.A.16.2.4), 355 એમિનો એસાઇલ અવશેષોનું નાઇટ્રાઇટ અપટેક પોર્ટર છે. બી. સબટિલિસ કાલ્પનિક પ્રોટીન વાયડબલ્યુસીજે (આઇપીએ-48આર) (ટીસી #1.A.16.3.2). સંદર્ભો પ્રોટીન પરિવારો પટલ પ્રોટીન ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રોટીન ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન ટ્રાન્સપોર્ટર પરિવહન પ્રોટીન ઇન્ટિગ્રલ મેમ્બ્રેન પ્રોટીન