Genome diversity and karyotype evolution of mammals
2000ના દાયકામાં ઉત્ક્રાંતિવાદી રીતે વૈવિધ્યસભર પ્રજાતિઓમાં જીનોમ સિક્વન્સિંગ અને મેપિંગનો વિસ્ફોટ જોવા મળ્યો હતો. જ્યારે સસ્તન પ્રાણીઓનું સંપૂર્ણ જીનોમ સિક્વન્સિંગ ઝડપથી આગળ વધી રહ્યું છે, ત્યારે કેટલીક પ્રજાતિઓ કરતાં વધુમાંથી ઓર્થોલોગસ આખા રંગસૂત્ર પ્રદેશોને ભેગા કરવાની અને સંરેખિત કરવાની ક્ષમતા હજુ સુધી શક્ય નથી. ઘરેલું (કૂતરા અને બિલાડી), પ્રયોગશાળા (ઉંદર અને ઉંદર) અને કૃષિ (પશુ) પ્રાણીઓ માટે તુલનાત્મક નકશાના નિર્માણ પર સઘન ધ્યાન પરંપરાગત રીતે રોગ સંબંધિત અને તંદુરસ્ત ફીનોટાઇપ્સના અંતર્ગત આધારને સમજવા માટે ઉપયોગમાં લેવાય છે. આ નકશા કેરીયોટાઇપ ઉત્ક્રાંતિનું અનુમાન લગાવવા માટે એક સાધન તરીકે બહુ-પ્રજાતિ વિશ્લેષણનો ઉપયોગ કરવાની અભૂતપૂર્વ તક પણ પ્રદાન કરે છે. તુલનાત્મક રંગસૂત્ર ચિત્રકામ અને સંબંધિત તકનીકો તુલનાત્મક જીનોમ અભ્યાસોમાં ખૂબ જ શક્તિશાળી અભિગમો છે. વિવિધ પ્રજાતિઓના રંગસૂત્રો પર ફ્લોરોસન્સ ઇન સિટુ હાઇબ્રિડાઇઝેશન (એફઆઇએસએચ) માટે મોલેક્યુલરલી ડિફાઈન્ડ ડીએનએ પ્રોબ્સનો ઉપયોગ કરીને હોમોલોજીને ઉચ્ચ ચોકસાઈ સાથે ઓળખી શકાય છે. રંગસૂત્ર પેઇન્ટિંગની માહિતી હવે લગભગ તમામ સસ્તન વર્ગના સભ્યો માટે ઉપલબ્ધ છે. એવું જાણવા મળ્યું હતું કે મોટાભાગના ક્રમમાં, રંગસૂત્ર ઉત્ક્રાંતિના દર ધરાવતી પ્રજાતિઓ છે જેને 'ડિફોલ્ટ' દર તરીકે ગણી શકાય. એ નોંધવું જરૂરી છે કે ઉત્ક્રાંતિના ઇતિહાસમાં નક્કી થયેલી પુનઃગોઠવણીની સંખ્યા સસ્તન પ્રાણીઓના 180 મિલિયન વર્ષોના કિરણોત્સર્ગને કારણે પ્રમાણમાં ઓછી લાગે છે. આમ ઉત્ક્રાંતિ દરમિયાન થયેલા કેરીયોટાઇપ ફેરફારોના ઇતિહાસનો રેકોર્ડ તુલનાત્મક રંગસૂત્ર નકશા દ્વારા પ્રાપ્ત કરવામાં આવ્યો છે. સસ્તન પ્રાણીઓના ફિલોજેનોમિક્સ આધુનિક સસ્તન પ્રાણીઓ (વર્ગ સસ્તન પ્રાણીઓ) ને મોનોટ્રેમ્સ, માર્સુપિયલ્સ અને પ્લેસેન્ટલ્સમાં વહેંચવામાં આવે છે. પેટા વર્ગ પ્રોટોથેરિયા (મોનોટ્રેમ્સ) માં ઇંડા પાડતા સસ્તન પ્રાણીઓની પાંચ પ્રજાતિઓનો સમાવેશ થાય છેઃ પ્લેટિપસ અને ચાર ઇકિડના પ્રજાતિઓ. ઇન્ફ્રાક્લાસિસ મેટાથેરિયા (માર્સુપિયલ્સ) અને યુથેરિયા (પ્લેસેન્ટલ્સ) મળીને પેટા વર્ગ થેરિયાની રચના કરે છે. 2000 ના દાયકામાં યુથેરિયન સસ્તન પ્રાણીઓ વચ્ચેના સંબંધોની સમજણએ વર્ચ્યુઅલ ક્રાંતિનો અનુભવ કર્યો છે. મોલેક્યુલર ફિલોજેનોમિક્સ, નવી અશ્મિભૂત શોધો અને નવીન મોર્ફોલોજિકલ અર્થઘટનો હવે યુથેરિયનોની 4600 થી વધુ અસ્તિત્વ ધરાવતી પ્રજાતિઓને ચાર મુખ્ય સુપર-ઓર્ડિનલ ક્લેડ્સમાં જૂથબદ્ધ કરે છેઃ યુઆર્કોન્ટોગ્લિયર્સ (પ્રાઇમેટ્સ, ડર્મોપ્ટેરા, સ્કેન્ડેન્શિયા, રોડેન્શિયા અને લેગોમોર્ફા સહિત), લૌરાસીથેરિયા (સેટાર્ટીયોડેક્ટિલા, પેરિસોડેક્ટિલા, કાર્નિવોરા, ચિરોપ્ટેરા, ફોલિડોટા અને યુલિપોટાઇફ્લા), ઝેનાર્થ્રા અને એફ્રોથેરિયા (પ્રોબોસિડિયા, સિરેનિયા, હિરાકોઇડિયા, એફ્રોસોરિસિડા, ટ્યુબ્યુલિડેન્ટા અને મેક્રોસેલાઇડ) આ વૃક્ષ તુલનાત્મક સસ્તન પ્રાણીઓના સાયટોજેનેટિક્સમાં કોયડાના ભાગોને એકીકૃત કરવામાં ખૂબ જ ઉપયોગી છે. કેરીયોટાઇપ્સઃ જીનોમનું વૈશ્વિક દૃશ્ય દરેક જનીન દરેક કોષમાં સમાન રંગસૂત્રને નકશા કરે છે. જોડાણ એક જ રંગસૂત્ર પર બે અથવા વધુ સ્થાનની હાજરી દ્વારા નક્કી થાય છે. એક પ્રજાતિના સમગ્ર રંગસૂત્ર સમૂહને કેરીયોટાઇપ તરીકે ઓળખવામાં આવે છે. સામાન્ય પૂર્વજોના વંશના દેખીતી રીતે તાર્કિક પરિણામ એ છે કે વધુ નજીકથી સંબંધિત પ્રજાતિઓમાં વધુ રંગસૂત્રો સામાન્ય હોવા જોઈએ. જો કે, હવે વ્યાપકપણે એવું માનવામાં આવે છે કે જીનોમિક સંરક્ષણને કારણે પ્રજાતિઓમાં ફિનેટિકલી સમાન કેરીયોટાઇપ્સ હોઈ શકે છે. તેથી, તુલનાત્મક સાયટોજેનેટિક્સમાં, જાતિજન્ય સંબંધો રંગસૂત્રોના તફાવતો (વ્યુત્પન્ન લક્ષણો) ની ધ્રુવીયતાના આધારે નક્કી કરવા જોઈએ. તુલનાત્મક સાયટોજેનેટિક્સનો ઐતિહાસિક વિકાસ સસ્તન તુલનાત્મક સાયટોજેનેટિક્સ, જે ફિલોજેનોમિક્સનો અનિવાર્ય ભાગ છે, તે શુદ્ધ વર્ણનથી માંડીને જીનોમિક યુગના વધુ સંશોધનાત્મક વિજ્ઞાન સુધી શ્રેણીબદ્ધ પગલાંઓમાં વિકસિત થયો છે. તકનીકી પ્રગતિઓએ સાયટોજેનેટિક્સના વિવિધ વિકાસલક્ષી પગલાંને ચિહ્નિત કર્યા છે. સાયટોજેનેટિક્સનો શાસ્ત્રીય તબક્કો હ્યુમન જીનોમ પ્રોજેક્ટનું પ્રથમ પગલું ત્યારે થયું જ્યારે 1956માં ટીજીઓ અને લેવાને માનવ રંગસૂત્રોની સચોટ દ્વિગુણિત સંખ્યાને 2n = 46 તરીકે અહેવાલ આપ્યો. આ તબક્કા દરમિયાન, સેંકડો સસ્તન પ્રાણીઓની પ્રજાતિઓ (દ્વિગુણિત સંખ્યાઓ પરની માહિતી, સંબંધિત લંબાઈ અને રંગસૂત્રોની આકારવિજ્ઞાન, બી રંગસૂત્રોની હાજરી સહિત) ના કાર્યોટાઇપ્સ પરની માહિતીનું વર્ણન કરવામાં આવ્યું હતું. દ્વિગુણિત સંખ્યાઓ (2n) ભારતીય મુંટજેકમાં 2n = 6-7 થી કેટલાક ઉંદરોમાં 100 થી વધુ હોવાનું જણાયું હતું. રંગસૂત્ર બેન્ડિંગ બીજું પગલું સી-, જી-, આર-અને અન્ય બેન્ડિંગ તકનીકોની શોધમાંથી લેવામાં આવ્યું હતું અને તેને પેરિસ પરિષદ (1971) દ્વારા ચિહ્નિત કરવામાં આવ્યું હતું, જે દરેક માનવ રંગસૂત્રને ઓળખવા અને વર્ગીકૃત કરવા માટે પ્રમાણભૂત નામકરણ તરફ દોરી ગયું હતું. જી-અને આર-બેન્ડિંગ સૌથી વધુ ઉપયોગમાં લેવાતી બેન્ડિંગ પદ્ધતિઓ જી-બેન્ડિંગ (જિમેસા-બેન્ડિંગ) અને આર-બેન્ડિંગ (રિવર્સ-બેન્ડિંગ) છે. આ તકનીકો રંગસૂત્રો પર શ્યામ અને હળવા ત્રાંસા પટ્ટાના વિરોધાભાસી લાક્ષણિક પેટર્ન ઉત્પન્ન કરે છે. બેન્ડિંગ હોમોલોગસ રંગસૂત્રોને ઓળખવાનું અને ઘણી પ્રજાતિઓ માટે રંગસૂત્રોના નામકરણનું નિર્માણ કરવાનું શક્ય બનાવે છે. સમરૂપ રંગસૂત્રોની પટ્ટી રંગસૂત્રના ભાગો અને પુનઃગોઠવણીને ઓળખવાની મંજૂરી આપે છે. સસ્તન પ્રાણીઓના રંગસૂત્રોના એટલાસમાં 850 સસ્તન પ્રાણીઓની પ્રજાતિઓના પટ્ટાવાળા કાર્યોટાઇપ્સનો સારાંશ આપવામાં આવ્યો હતો. સસ્તન પ્રાણીઓમાં સી-બેન્ડિંગ અને હેટેરોક્રોમેટિન કેરીઓટાઇપ પરિવર્તનશીલતા મુખ્યત્વે દરેક સસ્તન પ્રાણીમાં હેટેરોક્રોમેટિનની વિવિધ માત્રાને કારણે છે. એકવાર કુલ જીનોમ સામગ્રીમાંથી હેટેરોક્રોમેટિનનું પ્રમાણ બાદ કરવામાં આવે, ત્યારે તમામ સસ્તન પ્રાણીઓમાં જીનોમનું કદ ખૂબ સમાન હોય છે. સસ્તન પ્રાણીઓની પ્રજાતિઓ હેટેરોક્રોમેટિન સામગ્રી અને સ્થાનમાં નોંધપાત્ર રીતે અલગ પડે છે. હેટેરોક્રોમેટિન મોટાભાગે સી-બેન્ડિંગનો ઉપયોગ કરીને શોધાય છે. સી-બેન્ડિંગનો ઉપયોગ કરતા પ્રારંભિક અભ્યાસો દર્શાવે છે કે મૂળભૂત સંખ્યા (એટલે કે, રંગસૂત્ર હથિયારોની સંખ્યા) માં તફાવત સંપૂર્ણપણે હેટેરોક્રોમેટિક રંગસૂત્ર હથિયારોના ઉમેરાને કારણે હોઈ શકે છે. હેટેરોક્રોમેટિનમાં વિવિધ પ્રકારના પુનરાવર્તિત ડીએનએ હોય છે, જે તમામ સી-બેન્ડિંગ સાથે જોવા મળતા નથી, જે નજીકથી સંબંધિત પ્રજાતિઓના કેરીયોટાઇપ્સ વચ્ચે પણ મોટા પ્રમાણમાં બદલાઈ શકે છે. કોન્જેનેરિક ઉંદર પ્રજાતિઓ વચ્ચે હેટેરોક્રોમેટિનની માત્રાનો તફાવત ડીપોડોમી પ્રજાતિઓમાં પરમાણુ ડીએનએના 33 ટકા, પેરોમિસ્કસ પ્રજાતિઓમાં 36 ટકા, એમ્મોસ્પર્મોફિલસમાં 42 ટકા અને થોમોમી પ્રજાતિઓમાં 60 ટકા સુધી પહોંચી શકે છે જ્યાં સી-વેલ્યુ (હેપ્લોઇડ ડીએનએ સામગ્રી) 2.1 થી 5.6 પી. જી. ની વચ્ચે હોય છે. લાલ વિસ્કાચા ઉંદર (ટિમ્પાનોક્ટોમીઝ બેરેરા) સસ્તન પ્રાણીઓમાં રેકોર્ડ સી-મૂલ્ય ધરાવે છે-9.2 પી. જી. જોકે ટેટ્રાપોઇડીને સૌપ્રથમ તેના ઉચ્ચ જીનોમ કદ અને દ્વિગુણિત રંગસૂત્ર સંખ્યા, સ્વાર્ટમેન એટ અલ માટે એક કારણ તરીકે પ્રસ્તાવિત કરવામાં આવ્યું હતું. તે દર્શાવે છે કે જીનોમનું ઊંચું કદ હેટેરોક્રોમેટિનના પ્રચંડ વિસ્તરણને કારણે હતું. તેમ છતાં એક જ નકલ જનીન તેના જિનોમમાં ડુપ્લિકેટ હોવાનું જણાયું હતું, મોટા જિનોમ સેગમેન્ટ ડુપ્લિકેશનની ગેરહાજરી (મોટાભાગના ઓક્ટોડોન ડિગુ પ્રોબ્સનો સિંગલ પેઇન્ટ) અને પુનરાવર્તિત ડીએનએ સંકરણ પુરાવા ટેટ્રાપ્લોઇડી સામે નિયમો ધરાવે છે. હેટેરોક્રોમેટિનની રચના, પુનરાવર્તિત ડીએનએ જથ્થો અને ઓક્ટોડોન્ટિડ્સના રંગસૂત્રો પર તેના વિતરણનો અભ્યાસ એ નક્કી કરવા માટે એકદમ જરૂરી છે કે લાલ વિસ્કાચા ઉંદરના મોટા જીનોમ માટે હેટેરોક્રોમેટિન અપૂર્ણાંક શું જવાબદાર છે. તુલનાત્મક સાયટોજેનેટિક્સમાં, પ્રજાતિઓ વચ્ચે રંગસૂત્ર સમરૂપતા બેન્ડિંગ પેટર્નમાં સમાનતાના આધારે પ્રસ્તાવિત કરવામાં આવી હતી. નજીકથી સંબંધિત પ્રજાતિઓમાં ઘણીવાર ખૂબ જ સમાન બેન્ડિંગ પેટર્ન હોય છે અને બેન્ડ્સની સરખામણી કર્યાના 40 વર્ષ પછી, નોંધપાત્ર અપવાદો હોવા છતાં, મોટાભાગના વર્ગીકરણ જૂથોમાં કેરીયોટાઇપ વિચલન તેમના ફિલોજેનેટિક સંબંધને અનુસરે છે તે સામાન્ય બનાવવું સલામત લાગે છે. મોટા રંગસૂત્ર વિભાગોનું સંરક્ષણ પ્રજાતિઓ વચ્ચેની સરખામણીને સાર્થક બનાવે છે. રંગસૂત્રની પટ્ટી બાંધવી એ એકંદરે રંગસૂત્ર સમરૂપતાનું વિશ્વસનીય સૂચક રહ્યું છે, એટલે કે. કે બેન્ડિંગના આધારે ઓળખાયેલ રંગસૂત્ર વાસ્તવમાં સમાન જનીનો ધરાવે છે. આ સંબંધ જાતિજન્ય રીતે દૂરની પ્રજાતિઓ અથવા પ્રજાતિઓ માટે નિષ્ફળ થઈ શકે છે જેમણે અત્યંત ઝડપી રંગસૂત્ર ઉત્ક્રાંતિનો અનુભવ કર્યો છે. બેન્ડિંગ હજુ પણ મોર્ફોલોજિકલ છે અને હંમેશા ડીએનએ સામગ્રીનું ફૂલપ્રૂફ સૂચક નથી. તુલનાત્મક મોલેક્યુલર સાયટોજેનેટિક્સ ત્રીજું પગલું ત્યારે આવ્યું જ્યારે મોલેક્યુલર તકનીકોને સાયટોજેનેટિક્સમાં સામેલ કરવામાં આવી હતી. આ તકનીકો ડીએનએ સ્તરે રંગસૂત્રોની તુલના કરવા માટે વિવિધ કદના ડીએનએ તપાસનો ઉપયોગ કરે છે. જાતિજન્ય રીતે દૂરની પ્રજાતિઓ અથવા અત્યંત પુનઃસંયોજિત પ્રજાતિઓ (દા. ત., ગિબ્બન્સ) વચ્ચે પણ સમરૂપતાની વિશ્વાસપૂર્વક સરખામણી કરી શકાય છે. ક્લેડિસ્ટિક વિશ્લેષણનો ઉપયોગ કરીને પુનઃગોઠવણી કે જેણે સસ્તન કેરીયોટાઇપમાં વિવિધતા લાવી છે તેને વધુ ચોક્કસપણે મેપ કરવામાં આવે છે અને ફિલોજેનોમિક પરિપ્રેક્ષ્યમાં મૂકવામાં આવે છે. "તુલનાત્મક રંગસૂત્રશાસ્ત્ર" મોલેક્યુલર અભિગમો સાથે કામ કરતા સાયટોજેનેટિક્સના ક્ષેત્રને વ્યાખ્યાયિત કરે છે, જો કે "રંગસૂત્રશાસ્ત્ર" મૂળરૂપે ક્રોમેટિન ગતિશીલતા અને ઇન્ટરફેઝ રંગસૂત્ર માળખામાં મોર્ફોલોજિકલ ફેરફારોના સંશોધનને વ્યાખ્યાયિત કરવા માટે રજૂ કરવામાં આવ્યું હતું. રંગસૂત્ર પેઇન્ટિંગ અથવા ઝૂ-ફિશ એ વ્યાપક અસર ધરાવતી પ્રથમ તકનીક હતી. આ પદ્ધતિ દ્વારા વિવિધ પ્રજાતિઓ વચ્ચેના રંગસૂત્ર પ્રદેશોની સમરૂપતાને એક વ્યક્તિના ડીએનએ ચકાસણીઓ, એક પ્રજાતિના સંપૂર્ણ રંગસૂત્રોને બીજી પ્રજાતિના રંગસૂત્રોને મેટાફેઝ કરવા માટે સંકરણ દ્વારા ઓળખવામાં આવે છે. તુલનાત્મક રંગસૂત્ર પેઇન્ટિંગ ઘણી પ્રજાતિઓની ઝડપી અને કાર્યક્ષમ સરખામણીને મંજૂરી આપે છે અને સમાનધર્મી પ્રદેશોનું વિતરણ રંગસૂત્ર ઉત્ક્રાંતિના સ્થાનાંતરણને ટ્રેક કરવાનું શક્ય બનાવે છે. જ્યારે વિવિધ સસ્તન વર્ગને આવરી લેતી ઘણી પ્રજાતિઓની સરખામણી કરવામાં આવે છે, ત્યારે આ વિશ્લેષણ વિવિધ શાખાઓમાં રંગસૂત્ર ઉત્ક્રાંતિના વલણો અને દર વિશે માહિતી પ્રદાન કરી શકે છે. જો કે, સમરૂપતા માત્ર ગુણાત્મક રીતે શોધાય છે, અને દ્રશ્યમાન પ્રદેશોના કદ દ્વારા રીઝોલ્યુશન મર્યાદિત હોય છે. આમ, આ પદ્ધતિ બહુવિધ પુનઃગોઠવણી (જેમ કે માઉસ અને માનવ વચ્ચે) માંથી તમામ નાના સમરૂપ પ્રદેશોને શોધી શકતી નથી. આ પદ્ધતિ મોટા વિભાગોમાં આંતરિક વ્યુત્ક્રમોની જાણ કરવામાં પણ નિષ્ફળ જાય છે. બીજી મર્યાદા એ છે કે મોટા ફિલોજેનેટિક અંતર પર ચિત્રકામ ઘણીવાર કાર્યક્ષમતામાં ઘટાડો કરે છે. તેમ છતાં, વિવિધ પ્રજાતિઓમાંથી મેળવેલા પેઇન્ટિંગ પ્રોબ્સનો ઉપયોગ તુલનાત્મક સિક્વન્સિંગ પ્રોજેક્ટ્સ સાથે જોડાઈને પદ્ધતિનું રિઝોલ્યુશન વધારવામાં મદદ કરે છે. વર્ગીકરણ ઉપરાંત, રંગસૂત્ર પેઇન્ટિંગ માટે તપાસ મેળવવા માટે રંગસૂત્રો અને રંગસૂત્ર પ્રદેશોના માઇક્રોડિસેક્શનનો પણ ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો હતો. શ્રેષ્ઠ પરિણામો ત્યારે પ્રાપ્ત થયા જ્યારે કુલ માનવ જીનોમને આવરી લેતી માઇક્રોડિસેક્શન ચકાસણીઓની શ્રેણીને મલ્ટિકલર બેન્ડિંગ (એમ. સી. બી.) દ્વારા એન્થ્રોપોઇડ પ્રાઇમેટ રંગસૂત્રો પર સ્થાનાંતરિત કરવામાં આવી હતી. જો કે એમ. સી. બી. ની મર્યાદા એ છે કે તેનો ઉપયોગ માત્ર નજીકથી સંબંધિત પ્રજાતિઓના જૂથમાં જ થઈ શકે છે ("ફિલોજેનેટિક" રીઝોલ્યુશન ખૂબ ઓછું છે). સ્પેક્ટ્રલ કેરીયોટાઇપિંગ (એસ. કે. વાય.) અને એમ. એફ. આઇ. એસ. એચ.-ગુણોત્તર લેબલિંગ અને સંપૂર્ણ રંગસૂત્ર સમૂહના એક સાથે સંકરણમાં સમાન ખામીઓ છે અને ક્લિનિકલ અભ્યાસોની બહાર તેનો બહુ ઓછો ઉપયોગ થાય છે. રંગસૂત્ર પેઇન્ટિંગ સહિત તુલનાત્મક જીનોમિક્સ ડેટા સસ્તન રંગસૂત્રોના નોંધપાત્ર સંરક્ષણની પુષ્ટિ કરે છે. કુલ માનવ રંગસૂત્રો અથવા તેમના હાથ ઘણા સ્તન્ય પ્રાણીઓમાં ગર્ભમાં રહેલા બચ્ચાની રક્ષા માટેનું આચ્છાદનમાં વિસ્તૃત રંગસૂત્ર પ્રદેશોને એફ્રોથેરિયા અને ઝેનાર્થ્રા સુધી અસરકારક રીતે રંગિત કરી શકે છે. માનવ રંગસૂત્રો પર જનીન સ્થાનિકીકરણની માહિતીને ઉચ્ચ વિશ્વસનીયતા સાથે અન્ય પ્રજાતિઓના સમરૂપ રંગસૂત્ર પ્રદેશોમાં વિસ્તૃત કરી શકાય છે. ઉપયોગી રીતે, મનુષ્યો સંરક્ષિત સિન્ટેનિક રંગસૂત્ર સંગઠનને તમામ ગર્ભસ્થ સસ્તન પ્રાણીઓની પૂર્વજોની સ્થિતિ જેવી જ વ્યક્ત કરે છે. પોસ્ટ-જીનોમિક સમય અને તુલનાત્મક રંગસૂત્રશાસ્ત્ર હ્યુમન જીનોમ પ્રોજેક્ટ પછી સંશોધકોએ વિવિધ પ્રજાતિઓના જીનોમ માળખાઓની ઉત્ક્રાંતિ વિષયક સરખામણીઓ પર ધ્યાન કેન્દ્રિત કર્યું. વ્યાપક સિંગલ-ન્યુક્લિયોટાઇડ નકશો મેળવવા માટે કોઈપણ પ્રજાતિના સમગ્ર જીનોમને સંપૂર્ણપણે અને વારંવાર અનુક્રમિત કરી શકાય છે. આ પદ્ધતિ તેમના વર્ગીકરણ અંતરને ધ્યાનમાં લીધા વિના કોઈપણ બે પ્રજાતિઓ માટે જીનોમની તુલના કરવાનું શક્ય બનાવે છે. ક્રમબદ્ધ પ્રયાસોએ મોલેક્યુલર સાયટોજેનેટિક્સમાં ઉપયોગી વિવિધ ઉત્પાદનો પૂરા પાડ્યા. ડીએનએ ક્લોન્સ (બીએસી અને વાયએસી ક્લોન્સ, કોસ્મિડ્સ) સાથે સિટુ સંકરણ (ફિશ) માં ફ્લોરોસન્સે કેટલાક મેગાબેઝના રિઝોલ્યુશન પર રંગસૂત્ર નકશાના નિર્માણની મંજૂરી આપી હતી જે પ્રમાણમાં નાના રંગસૂત્રની પુનઃગોઠવણીને શોધી શકે છે. ઇન્ટરફેઝ ક્રોમેટિન પર કેટલાક કિલોબેઝનું રિઝોલ્યુશન પ્રાપ્ત કરી શકાય છે. એક મર્યાદા એ છે કે જાતિજન્ય અંતર વધવાની સાથે સંકરણની કાર્યક્ષમતામાં ઘટાડો થાય છે. રેડિયેશન હાઇબ્રિડ (આર. એચ.) જીનોમ મેપિંગ એ અન્ય કાર્યક્ષમ અભિગમ છે. આ પદ્ધતિમાં જીનોમને ઇચ્છિત સંખ્યામાં ટુકડાઓમાં વિક્ષેપિત કરવા માટે કોષોના ઇરેડિયેશનનો સમાવેશ થાય છે જે પછીથી ચાઇનીઝ હેમસ્ટર કોષો સાથે જોડાય છે. પરિણામી શારીરિક કોષ સંકરમાં સંબંધિત જીનોમના વ્યક્તિગત ટુકડાઓ હોય છે. પછી, કુલ જીનોમને આવરી લેતા 90-100 (કેટલીકવાર, વધુ) ક્લોન પસંદ કરવામાં આવે છે, અને રસના ક્રમને પોલિમરેઝ ચેઇન રિએક્શન (પી. સી. આર.) અથવા સીધા ડીએનએ-ડીએનએ સંકરણ દ્વારા ક્લોન કરેલા ટુકડાઓ પર સ્થાનાંતરિત કરવામાં આવે છે. બે પ્રજાતિઓના જીનોમ અને રંગસૂત્રોની તુલના કરવા માટે, બંને પ્રજાતિઓ માટે આર. એચ. મેળવવી જોઈએ. જાતિ રંગસૂત્ર ઉત્ક્રાંતિ અન્ય ઘણા વર્ગોથી વિપરીત, થેરીયન સસ્તન પ્રાણીઓ અને પક્ષીઓને આનુવંશિક જાતિ નિર્ધારણની અત્યંત સંરક્ષિત પ્રણાલીઓ દ્વારા વર્ગીકૃત કરવામાં આવે છે જે ખાસ રંગસૂત્રો તરફ દોરી જાય છે, એટલે કે. જાતીય રંગસૂત્રો. યુથેરિયન પ્રજાતિઓમાં XX/XY લિંગ રંગસૂત્ર પ્રણાલી સૌથી સામાન્ય હોવા છતાં, તે સાર્વત્રિક નથી. કેટલીક પ્રજાતિઓમાં X-ઓટોસોમલ ટ્રાન્સલોકેશન "વધારાના Y" રંગસૂત્રોના દેખાવમાં પરિણમે છે (ઉદાહરણ તરીકે, કાળા મુંટજેકમાં XX/XY1Y2Y3 પ્રણાલીઓ). અન્ય પ્રજાતિઓમાં વાય-ઓટોસોમલ ટ્રાન્સલોકેશન વધારાના એક્સ રંગસૂત્રોના દેખાવ તરફ દોરી જાય છે (ઉદાહરણ તરીકે, કેટલાક ન્યૂ વર્લ્ડ પ્રાઇમેટ્સ જેમ કે હૉવલર વાંદરાઓમાં). આ પાસા અંગે, ઉંદરો ફરીથી એક વિશિષ્ટ વ્યુત્પન્ન જૂથનું પ્રતિનિધિત્વ કરે છે, જેમાં લાકડાના લેમિંગ, કોલર્ડ લેમિંગ, ક્રીપ વોલ, સ્પિનસ કન્ટ્રી ઉંદર, એકોડન અને બેન્ડિકૂટ ઉંદર જેવા બિન-શાસ્ત્રીય જાતિ રંગસૂત્રો ધરાવતી પ્રજાતિઓની વિક્રમી સંખ્યા સામેલ છે. સંદર્ભો સાયટોજેનેટિક્સ જીનોમિક્સ જીનોમ સસ્તન આનુવંશિકતા ફિલોજેનેટિક્સ