TMEM131
ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રોટીન 131 (TMEM131) એ એક પ્રોટીન છે જે મનુષ્યમાં TMEM131 જનીન દ્વારા એન્કોડ કરવામાં આવે છે. TMEM131 પ્રોટીનમાં અજ્ઞાત કાર્ય 3651 (DUF3651) ના ત્રણ ડોમેન્સ અને બે ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન ડોમેન્સ છે. આ પ્રોટીનને ટી સેલ કાર્ય અને વિકાસમાં ભૂમિકા તરીકે દર્શાવવામાં આવ્યું છે. TMEM131 એ લોકસ (2q11.1) માં પણ રહે છે જે કાઢી નાખવામાં આવે ત્યારે નિએવરજેલ્ટ સિન્ડ્રોમ સાથે સંકળાયેલું હોય છે. ટી સેલ ફંક્શનમાં ભૂમિકા TMEM131 ડાઉન સિન્ડ્રોમ ધરાવતા દર્દીઓમાં હાયપરમેથાઇલેશન દર્શાવતું હોવાનું દર્શાવવામાં આવ્યું છે. આ અભ્યાસના લેખકોએ સૂચવ્યું હતું કે, ટી કોષના વિકાસ અને કાર્યમાં TMEM131sના માનવામાં આવતા કાર્યને જોતાં, આ હાયપરમિથાઇલેશન ડાઉન સિન્ડ્રોમ ધરાવતા દર્દીઓમાં દબાયેલા રોગપ્રતિકારક કાર્યમાં ભૂમિકા ભજવી શકે છે. ટી કોષોના વિકાસ અને તફાવત દરમિયાન ટી. એમ. ઈ. એમ. 131નું નિયમન કરવામાં આવ્યું હોવાનું પણ દર્શાવવામાં આવ્યું છે, અને અન્ય પેશીઓના પ્રકારોની તુલનામાં ટી કોષોમાં પ્રમાણમાં ઉચ્ચ સ્તરની અભિવ્યક્તિ હોવાનું દર્શાવવામાં આવ્યું છે. જનીન ઝાંખી TMEM131 એ 98,372,799-98,612,354 માંથી રંગસૂત્ર 2 ના નકારાત્મક DNA સ્ટ્રાન્ડ (સેન્સ જુઓ) પર સ્થિત છે. જનીન ઉત્પાદન એ માનવ જનીનમાં 41 અનુમાનિત એક્સોન સાથે 6,657 બેઝ જોડી એમઆરએનએ છે. એન્સેમ્બલ દસ વૈકલ્પિક સ્પ્લાઇસ સ્વરૂપોની આગાહી કરે છે, જેમાંથી ચાર પ્રોટીન કોડિંગ છે. જેનોમેટિક્સ સોફ્ટવેર પેજ દ્વારા એલ ડોરાડોનો ઉપયોગ કરીને પ્રમોટર આગાહી અને વિશ્લેષણ હાથ ધરવામાં આવ્યું હતું. અનુમાનિત પ્રમોટર વિસ્તાર રંગસૂત્ર 2ના માઈનસ સ્ટ્રાન્ડ પર 98,611,892 થી 98,612,893 સુધી 1002 આધાર જોડીઓમાં ફેલાયેલો છે. કાર્યક્રમ બે સંભવિત ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ પ્રારંભ સ્થાનોની આગાહી કરે છે. પ્રથમ 98,612,501 થી 98,612,716 સુધી 216 આધાર જોડીઓ ધરાવે છે. બીજો વિસ્તાર 98,612,262 થી 98,612,443 સુધી 182 આધાર જોડીઓ ધરાવે છે. જીન નેબરહૂડ TMEM131 હકારાત્મક DNA સ્ટ્રાન્ડ પર ZAP70 જનીન (98,330,331-98,356,323) ની સીધી બાજુમાં સ્થિત છે, તેમજ 2q11.2 લોકસ પર અસંખ્ય સ્યુડોજીન્સ છે. જનીન (વી. ડબલ્યુ. એ. 3બી) ધરાવતું વોન વિલેબ્રાન્ડ પરિબળ ટી. એમ. ઇ. એમ. 131થી ઉપરની તરફ હકારાત્મક તાર (<આઇ. ડી. 1>-<આઇ. ડી. 2>) પર સ્થિત છે. જનીન અભિવ્યક્તિ TMEM131 શરીરના મોટાભાગના ભાગોમાં નીચાથી મધ્યમ સ્તરે વ્યક્ત થાય છે, જેમાં લસિકા ગાંઠો, ગર્ભાશય અને ટી કોષોમાં સહેજ વધેલા સ્તરો જોવા મળે છે. ફળોના માખીના ગર્ભના વિકાસમાં અભિવ્યક્તિની માહિતી બી. ડી. જી. પી. થી મૂળ સ્થાને હોમપેજ પર ઉપલબ્ધ છે. પ્રોટીનના ગુણધર્મો/લાક્ષણિકતાઓ TMEM131 પ્રોટીનનું પ્રાથમિક કાર્ય સારી રીતે સમજી શકાયું નથી. માનવ સ્વરૂપમાં 1883 એમિનો એસિડ અવશેષો છે, જેમાં 8.74 નું આઇસોઇલેક્ટ્રિક બિંદુ અને 205,100 ડાલ્ટનનું પરમાણુ દ્રવ્યમાન છે. તેમાં અવશેષો 1,091-1,111 અને 1,118-1,138 પર બે ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન ડોમેન્સ હોવાનું દર્શાવવામાં આવ્યું છે. ત્રણ DUF3651 પ્રદેશો બે અડીને આવેલા ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન ડોમેન્સની N-ટર્મિનલ બાજુ પર સ્થિત છે. આ અવશેષો 173-245,502-582 અને 639-708 પર સ્થિત છે. પ્રોટીનનું આંતરકોષીય સ્થાન પ્રાયોગિક રીતે નક્કી કરવામાં આવ્યું નથી, પરંતુ તે પ્લાઝ્મા પટલ અથવા એન્ડોપ્લાઝ્મિક રેટિક્યુલમમાં રહે છે તેવું માનવામાં આવે છે, જેમાં ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રદેશોની એન-ટર્મિનલ અને સી-ટર્મિનલ બંને બાજુઓ પરનું દરેક ક્ષેત્ર સાયટોસોલિક હોય છે. તેમાં અસંખ્ય ફોસ્ફોરાયલેશન સ્થળો છે જે પ્રાયોગિક અને બાયોઇન્ફોર્મેટિક સાધનો બંને સાથે દર્શાવવામાં આવ્યા છે. નેટફોસ ટૂલનો ઉપયોગ કરીને પ્રોટીનના બાયોઇન્ફોર્મેટિક વિશ્લેષણમાં પ્રોટીનની સમગ્ર લંબાઈમાં 145 સંભવિત ફોસ્ફોરાયલેશન સાઇટ્સની આગાહી કરવામાં આવી હતી. TMEM131 માટે પ્રોટીન ક્રિયાપ્રતિક્રિયા વિશ્લેષણ કોમ્પ્યુટેશનલ સાધનોનો ઉપયોગ કરીને હાથ ધરવામાં આવ્યું છે. MINT ડેટાબેઝ દ્વારા કોઈ ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ ઓળખવામાં આવી ન હતી. સ્ટ્રીંગ શોધમાં ટેક્સ્ટ માઇનિંગ દ્વારા દસ સંભવિત પ્રોટીન ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ બહાર આવી હતી, જો કે આમાંથી કોઈ પણ વાસ્તવિક પ્રોટીન-પ્રોટીન ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ ગણવી જોઈએ નહીં. પરિણામોનું નજીકનું વિશ્લેષણ આ આગાહીઓ વાસ્તવિક હોવાની સંભાવના બહુ ઓછી દર્શાવે છે. ઇન્ટએક્ટ ટૂલનો પણ ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો હતો, અને આ દર્શાવે છે કે સુપરઓક્સાઇડ ડિસમ્યુટેઝ 2 (એસ. ઓ. ડી. 2) સાથે સંભવિત ક્રિયાપ્રતિક્રિયા મળી આવી હતી, જેને યીસ્ટ ટુ-હાઇબ્રિડ સ્ક્રિનિંગ અભ્યાસમાં ઓળખવામાં આવી હતી. સંરક્ષણ ઓર્થોલોગ્સ TMEM131 તેના તમામ ઓર્થોલોગ્સમાં સંરક્ષિત છે. સમગ્ર પ્રોટીન પ્રાઈમેટ ઓર્થોલોગ્સમાં ખૂબ જ સંરક્ષિત છે, જ્યારે વધુ દૂરના હોમોલોગ્સમાં DUF3651 અને ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રદેશોમાં સંરક્ષણ વધારે છે. સાન ડિએગો સુપર કમ્પ્યુટર બાયોલોજી વર્કબેન્ચ દ્વારા બ્લાસ્ટ અને ALIGN ટૂલનો ઉપયોગ કરીને ચોનોફ્લાગેલેટ મોનોસિગા બ્રેવિકોલિસ જેવી પ્રજાતિઓમાં ઓર્થોલોગ્સ જોવા મળ્યા હતા. નીચેનું કોષ્ટક TMEM131 ના હોમોલોગ્સ વિશે માહિતી આપે છે. પેરાલોગ TMEM131 પાસે એક જ પેરાલોગ છે, TMEM131L અથવા KIAA0922. આ જનીન TMEM131 જેવું જ છે, પરંતુ તેમાં ત્રણ DUF3651 પ્રદેશોમાંથી બીજા બેનો સમાવેશ થતો નથી. સંદર્ભો