Tohoku Medical Megabank Project
ટોહોકુ મેડિકલ મેગાબેંક પ્રોજેક્ટ જાપાનમાં એક રાષ્ટ્રીય પ્રોજેક્ટ છે. ટોહોકુ મેડિકલ મેગાબેંક (ટી. એમ. એમ.) પ્રોજેક્ટનું ધ્યેય મિયાગી અને ઇવાટે પ્રીફેક્ચર્સમાં લાંબા ગાળાનું આરોગ્ય સર્વેક્ષણ હાથ ધરવાનું છે, જે ગ્રેટ ઇસ્ટ જાપાન ભૂકંપથી પ્રભાવિત થયા હતા અને બાયોબેંકની સ્થાપના કરીને અને સમૂહ અભ્યાસો હાથ ધરીને વ્યક્તિગત દવાના વિકાસ માટે સંશોધન માળખું પૂરું પાડવાનું છે. તેની શરૂઆત 2012માં થઈ હતી. ટીએમએમ પ્રોજેક્ટ ટોહોકુ યુનિવર્સિટીની ટોહોકુ મેડિકલ મેગાબેંક ઓર્ગેનાઇઝેશન (ટોમો) અને ઇવાટે મેડિકલ યુનિવર્સિટીની ઇવાટે ટોહોકુ મેડિકલ મેગાબેંક ઓર્ગેનાઇઝેશન (આઇએમએમ) દ્વારા હાથ ધરવામાં આવે છે. પરિયોજનાઓ નીચેના સમૂહ અભ્યાસો અને સંશોધન પરિયોજનાઓ પ્રગતિમાં છે અથવા પૂર્ણ થઈ છે. સંભવિત સમૂહ સમુદાય આધારિત સમૂહ (સામાન્ય વસ્તી) નો અભ્યાસ કરે છે. જન્મ અને ત્રણ પેઢીનો સમૂહ. બાયો બેન્કિંગ અને ડેટાબેઝ. સહભાગીઓને પરિણામો પરત કરવા (જીનોમિક માહિતી સહિત). સંશોધન પ્રોજેક્ટ ટૂંકા વાંચન અને લાંબા વાંચન તકનીકો સાથે સંપૂર્ણ જીનોમ અનુક્રમણિકા. એસ. એન. પી. એરે જાપાનિકા એરે સાથે જીનોટાઇપિંગ કરે છે. જાપાની માનવ જીનોમ સંદર્ભનું નિર્માણ. એન. એમ. આર. અને માસ સ્પેક્ટ્રોમેટ્રી સાથે પ્લાઝમા ચયાપચય વિશ્લેષણ. પ્રોટીમ વિશ્લેષણ. ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ વિશ્લેષણ. એપિજેનોમ વિશ્લેષણ. મૌખિક માઇક્રોબાયોમ વિશ્લેષણ. સમયરેખા 2013 ટી. એમ. એમ. સમુદાય આધારિત સમૂહની ભરતી શરૂ થાય છે. ટી. એમ. એમ. બર્થ અને થ્રી-જનરેશન કોહોર્ટ સ્ટડીની ભરતી શરૂ થઈ છે. 2014 જાપાનીઝ જિનોમ સંદર્ભ પેનલ (1કેજેપીએન), જે 1,070 સમૂહ સહભાગીઓના સંપૂર્ણ જિનોમ અનુક્રમણિકાના આધારે વિવિધ એલીલ આવર્તન દર્શાવે છે, તે બહાર પાડવામાં આવ્યું છે (ડ્રાફ્ટ સંસ્કરણ 2014, સત્તાવાર સંસ્કરણ 2015). જાપોનિકા એરે, 1કેજેપીએન હેપ્લોટાઇપ માહિતીનો લાભ લઈને જાપાનીઝ વસ્તી માટે ઑપ્ટિમાઇઝ કરાયેલ એસએનપી એરે, પ્રકાશિત કરવામાં આવી છે. 2015 જાપાનીઝ મલ્ટી ઓમિક્સ રેફરન્સ પેનલ (જે. એમ. ઓ. આર. પી.) ની એક પોર્ટલ સાઇટ ખોલવામાં આવી છે, જે સમૂહ સહભાગીઓ પાસેથી ચયાપચય અને પ્રોટીઓમની માહિતી પૂરી પાડે છે. 2022 સુધીમાં, જેમોર્પ મેટાબોલોમ, પ્રોટીઓમ, ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ, મિથાઇલોમ તેમજ જીનોમ સંદર્ભ પેનલને આવરી લે છે. 2016માં ટી. એમ. એમ. સમુદાય આધારિત સમૂહની ભરતી 80,000થી વધુ સહભાગીઓ સાથે પૂર્ણ થઈ છે. 2017 ટી. એમ. એમ. બર્થ અને થ્રી-જનરેશન કોહોર્ટ સ્ટડીની ભરતી 70,000 થી વધુ સહભાગીઓ સાથે પૂર્ણ થઈ છે. બીજો અનુવર્તી સર્વેક્ષણ શરૂ થાય છે. 2018 જાપાનીઝ જિનોમ સંદર્ભ પેનલ (3.5KJPNv2), જે 3,554 સમૂહ સહભાગીઓના સંપૂર્ણ જિનોમ અનુક્રમણિકાના આધારે વિવિધ પ્રકારની એલીલ આવર્તન દર્શાવે છે, તે બહાર પાડવામાં આવી છે (2019 માં પ્રકાશિત). 2019 જાપાની સંદર્ભ જીનોમ (JG1) પ્રકાશિત કરવામાં આવ્યો છે (2021 માં પ્રકાશિત). 67, 000 ટી. એમ. એમ. સમુદાય આધારિત કોહોર્ટ નમૂનાના ડેટાનું વિતરણ શરૂ થયું છે. જાપાનીઝ જીનોમ સંદર્ભ પેનલ (4.7KJPN) પ્રકાશિત કરવામાં આવી છે. જાપોનિકા એરે NEO, 3.5KJPN હેપ્લોટાઇપ માહિતીનો લાભ લઈને જાપાનીઝ વસ્તી માટે ઓપ્ટિમાઇઝ કરેલ SNP એરે, પ્રકાશિત કરવામાં આવી છે (2021 માં પ્રકાશિત). 2020 54,000 SNP એરે ડેટાનું વિતરણ શરૂ થયું. ટી. એમ. એમ. બર્થ અને થ્રી-જનરેશન કોહોર્ટ નમૂનાના ડેટાનું વિતરણ શરૂ થાય છે. જાપાનીઝ જીનોમ સંદર્ભ પેનલ (8.3KJPN) પ્રકાશિત કરવામાં આવી છે. જાપાની સંદર્ભ જીનોમ (જે. જી. 2) પ્રકાશિત થાય છે. 2021 ત્રીજો અનુવર્તી સર્વેક્ષણ શરૂ થાય છે. જાપાનીઝ જીનોમ સંદર્ભ પેનલ (14કેજેપીએન) પ્રકાશિત કરવામાં આવી છે. JSV1, એક માળખાકીય વિવિધતા પેનલ, જે લાંબા સમય સુધી વાંચેલા અનુક્રમણિકા ડેટા સાથે બનાવવામાં આવી છે, તેને બહાર પાડવામાં આવે છે. 2022 50,000 સમૂહ સહભાગીઓનું સંપૂર્ણ જીનોમ સિક્વન્સિંગ પૂર્ણ થયું હતું. જાપાનીઝ જીનોમ સંદર્ભ પેનલ (38કેજેપીએન) પ્રકાશિત કરવામાં આવી છે. 2023 માં 69,000 સમૂહ સહભાગીઓનું સંપૂર્ણ જીનોમ સિક્વન્સિંગ પૂર્ણ થયું હતું. જાપાનીઝ જીનોમ સંદર્ભ પેનલ (54કેજેપીએન) પ્રકાશિત કરવામાં આવી છે. માહિતી પોર્ટલ સાઇટ, જેમોર્પ દ્વારા ઉપલબ્ધ છે. સંદર્ભો બાહ્ય કડીઓ ટોહોકુ મેડિકલ મેગાબેંક ઓર્ગેનાઇઝેશન Iwate ટોહોકુ મેડિકલ મેગાબેંક ઓર્ગેનાઇઝેશન જેમોર્પઃ જાપાનીઝ મલ્ટી ઓમિક્સ રેફરન્સ પેનલ iMETHYL: માનવ ડીએનએ મિથાઇલેશન, જનીન અભિવ્યક્તિ અને જીનોમિક વિવિધતાનો એક સંકલિત ડેટાબેઝ. બાયોબેંક સંસ્થાઓ કોહોર્ટ જાપાનમાં મેડિસિનનો અભ્યાસ કરે છે 2012 જાપાનમાં ટોહોકુ યુનિવર્સિટીની સંસ્થાઓ Iwate યુનિવર્સિટી આનુવંશિક ડેટાબેસેસ