RNA motif
આર. એન. એ. મોટિફ એ આર. એન. એ. ના જૂથનું વર્ણન છે જે સંબંધિત માળખું ધરાવે છે. આર. એન. એ. મોટિફમાં સંબંધિત આર. એન. એ. ના પ્રાથમિક ક્રમ અને ગૌણ માળખામાં લાક્ષણિકતાઓની પેટર્નનો સમાવેશ થાય છે. આમ, તે આર. એન. એ. ગૌણ માળખાને સમાવવા માટે અનુક્રમ રચનાની વિભાવનાને વિસ્તરે છે. "આર. એન. એ. મોટિફ" શબ્દ પેટર્ન અને તેની સાથે મેળ ખાતી આર. એન. એ. સિક્વન્સ બંનેનો સંદર્ભ આપી શકે છે. આર. એન. એ. ની રચનાઓનું વર્ણન આર. એન. એ. ની રચનાઓને બે મુખ્ય સ્વરૂપોમાં વર્ણવી શકાય છેઃ બહુવિધ અનુક્રમ સંરેખણ અથવા સ્પષ્ટ શોધ પેટર્ન. સંરેખણ સામાન્ય રીતે સર્વસંમતિ ગૌણ માળખા સાથે વધારવામાં આવે છે, એટલે કે. માળખું જે તમામ અથવા મોટાભાગના આર. એન. એ. માટે સામાન્ય છે. સંરેખણમાં અનુક્રમ પછી સંરક્ષણની પેટર્નને સ્પષ્ટ રીતે વ્યાખ્યાયિત કરે છે જેનો ઉપયોગ, ઉદાહરણ તરીકે, આર. એન. એ. ના વધારાના ઉદાહરણો શોધવા માટે થઈ શકે છે. આ શોધ વ્યૂહરચના અન્ય લોકો વચ્ચે, ઇન્ફર્નલ સોફ્ટવેર પેકેજ દ્વારા અમલમાં મૂકવામાં આવે છે. આર. એફ. એ. એમ. ડેટાબેઝ એ બહુવિધ અનુક્રમ સંરેખણોનો સંગ્રહ છે જે વિશ્વસનીય રીતે જાણીતા આર. એન. એ. પ્રણાલીઓ અને સંકળાયેલ માહિતીના મોટા ઉપગણને વ્યાખ્યાયિત કરે છે. તેના ડેટાનો ઉપયોગ ઇન્ફર્નલ સોફ્ટવેર સાથે અનુક્રમ ડેટાબેઝમાં આવા આર. એન. એ. ના ઉદાહરણો શોધવા માટે કરી શકાય છે, દા. ત. જીનોમ સિક્વન્સ. વૈકલ્પિક રીતે, આર. એન. એ. મોટિફ્સને સ્પષ્ટ શોધ પેટર્નનો ઉપયોગ કરીને પણ વર્ણવી શકાય છે, જે ચોક્કસ પ્રાથમિક અનુક્રમ પેટર્નને વ્યાખ્યાયિત કરે છે, જે હેલિસીસની રચના ક્યાં થવી જોઈએ તેની મર્યાદાઓ સાથે જોડાય છે. આવી પેટર્નનો ઉપયોગ મોટા અનુક્રમ ડેટાબેઝમાં મેળ ખાતી અનુગામીઓ શોધવા માટે થઈ શકે છે. કેટલાક સોફ્ટવેર પેકેજો આવી શોધનો અમલ કરે છે, દા. ત. આરએનએરોબો અને આરએનએમોટિફ. નવીન આર. એન. એ. પ્રણાલીઓની શોધ નવીન આર. એન. એ. શોધવાની ઘણી પદ્ધતિઓ તુલનાત્મક અભિગમનો ઉપયોગ કરે છે, જેમાં સંરક્ષિત આર. એન. એ. ના લાક્ષણિક સંકેતોને શોધવા માટે વિવિધ શ્રેણીઓનું એકસાથે વિશ્લેષણ કરવામાં આવે છે. જ્યારે આવી પદ્ધતિઓ સફળ થાય છે, ત્યારે પરિણામી નવતર સંરક્ષિત આર. એન. એ. ને આર. એન. એ. રચના તરીકે જોઈ શકાય છે, જે સંરેખણ અથવા પેટર્નનો ઉપયોગ કરીને વ્યક્ત થાય છે. પ્રારંભિક ઉદાહરણ ટી-બોક્સની આસપાસ આધારિત આર. એન. એ. રચના છે, જે 1993માં એમિનોસિલ-ટી. આર. એન. એ. સિન્થેટેઝ જનીનો સાથે સંકળાયેલ હોવાનું નક્કી કરવામાં આવ્યું હતું. જે પદ્ધતિ દ્વારા આ આર. એન. એ. રચના જનીનોને નિયંત્રિત કરે છે તે પછીથી દર્શાવવામાં આવ્યું હતું, આમ આર. એન. એ. રચનાનું કાર્યાત્મક મહત્વ સ્થાપિત થયું હતું. પાછળથી, 1997માં, B12 ચયાપચય સાથે સંબંધિત જનીનોના ઉપરના ભાગમાં B12-બોક્સ તરીકે ઓળખાતી સંરક્ષિત RNA રચના મળી આવી હતી. આ આર. એન. એ. મોટિફ પાછળથી રિબોસ્વિચના એક ભાગને અનુરૂપ હોવાનું જાણવા મળ્યું હતું જે સહ-પરિબળ એડેનોસિલકોબાલામિનને જોડે છે, જેને ઘણીવાર કોબાલામિન રિબોસ્વિચ કહેવામાં આવે છે. (પછીના સ્વરૂપો અન્ય કોબાલામિન વ્યુત્પન્નને બાંધતા હોવાનું દર્શાવવામાં આવ્યું હતું.) આર. એન. એ. પ્રણાલીઓના અન્ય ઘણા ઉદાહરણો, જેમના કાર્યો પાછળથી નક્કી કરવામાં આવ્યા હતા, ખાસ કરીને રિબોસ્વિચના સંદર્ભમાં જાણીતા છે. જો કે, અન્ય પ્રકારના આર. એન. એ. મોટિફ્સને કાર્યાત્મક રીતે દર્શાવવામાં આવ્યા છે, જેમ કે 6સી. આર. એન. એ. જેવા બેક્ટેરિયલ એસ. આર. એન. એ., જે 2007માં એક મોટિફ તરીકે શોધાયા હતા અને 2016માં કાર્યાત્મક રીતે દર્શાવવામાં આવ્યા હતા, અથવા ટ્વિસ્ટર રાઇબોઝાઇમ જેવા રાઇબોઝાઇમ્સ, જે આર. એન. એ. મોટિફ તરીકે શોધાયા હતા અને તે જ પ્રકાશનમાં કાર્યાત્મક રીતે દર્શાવવામાં આવ્યા હતા. સંદર્ભો RNA