TMEM212
ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રોટીન 212 એ એક પ્રોટીન છે જે મનુષ્યમાં TMEM212 જનીન દ્વારા એન્કોડ કરવામાં આવે છે. પ્રોટીનમાં 5 ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન ડોમેન્સ હોય છે અને તે પ્લાઝ્મા મેમ્બ્રેન અને એન્ડોપ્લાઝ્મિક રેટિક્યુલમમાં સ્થાનાંતરિત થાય છે. TMEM212 કરોડઅસ્થિધારી પ્રાણીઓમાં ઓર્થોલોગ્સ ધરાવે છે પરંતુ અપૃષ્ઠવંશી પ્રાણીઓમાં નહીં. TMEM212 આફ્રિકન અમેરિકનોમાં છૂટાછવાયા પાર્કિન્સન રોગ, ચહેરાની પ્રક્રિયા અને મેદસ્વીતા સાથે સંકળાયેલું છે. જનીન TMEM212 જનીન સ્થિતિ 3q26.3 પર રંગસૂત્ર 3 પર હોય છે અને પ્લસ સ્ટ્રાન્ડ પર સ્થિત હોય છે. જનીન સ્થિતિ 171,561,140 થી 171,577,108 સુધી એન્કોડ થયેલ છે. તેના સૌથી લાંબા આઇસોફોર્મમાં 4 એક્સોન, 1881 ન્યુક્લિયોટાઇડ્સનો કોડિંગ ક્રમ અને અપસ્ટ્રીમ ઇન-ફ્રેમ સ્ટોપ કોડનનો સમાવેશ થાય છે. કોડિંગ ક્રમ એ જનીન TMEM212 ના 36-660 પાયા છે. જનીન પડોશમાં અન્ય જનીનોમાં નીચેનાનો સમાવેશ થાય છેઃ પી. એલ. ડી. 1, આર. એન. યુ. <આઇ. ડી. 1> પી અને એફ. એન. ડી. સી. 3બી. ટ્રાન્સક્રિપ્ટ જનીન TMEM212 માં 2 આઇસોફોર્મ્સ છે. TMEM212 ના mRNA સ્પ્લાઇસ પ્રકારો છેલ્લા એક્સોન પર બદલાય છે. તેમાંથી એક સ્વરૂપે છેલ્લા એક્સોનના ભાગને વિભાજિત કર્યો છે-જે તેને 537 ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ ટૂંકા બનાવે છે. આ આઇસોફ્રોમમાં 1343 ન્યુક્લિયોટાઇડ્સનો mRNA ક્રમ છે. પછીના સ્વરૂપને એન. સી. બી. આઈ. માં સ્વીકારવામાં આવ્યું નથી. પ્રોટીન TMEM212 માં 5 ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રદેશો છે, જે તેને ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રોટીન બનાવે છે. 5 ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રદેશો મુખ્યત્વે બિન-ધ્રુવીય એમિનો એસિડ છે. જો કે, 2 ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રદેશોમાં ધ્રુવીય, ચાર્જ એમિનો એસિડ હોય છે. આ પ્રોટીન 194 એમિનો એસિડ લાંબુ છે અને તેનું ગણતરી કરેલ પરમાણુ વજન 21kDa છે. આઇસોઇલેક્ટ્રિક બિંદુ લગભગ 8 ના pH પર છે. TMEM212 ના એમિનો એસિડ ક્રમમાં કોઈ આંતરિક પુનરાવર્તન નથી. વધુમાં, તમામ એમિનો એસિડ સામાન્ય વિપુલતામાં હોય છે. માનવ TMEM212 કોષ્ટક 1 માં દર્શાવ્યા મુજબ તેના ઓર્થોલોગ્સ માટે સમાન પરમાણુ વજન અને આઇસોઇલેક્ટ્રિક બિંદુ દર્શાવે છે. કોષ્ટક 1: મનુષ્ય અને ઓર્થોલોગ્સમાં TMEM212 પ્રોટીન લાક્ષણિકતાઓ માધ્યમિક અને તૃતીય માળખું ફાયરે 2 અને અલી2ડી આગાહી કરે છે કે TMEM212 આલ્ફા હેલિસીસથી સમૃદ્ધ ગૌણ માળખું ધરાવે છે, ખાસ કરીને ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રદેશોમાં. આલ્ફા હેલિસીસ સસ્તન પ્રાણીઓથી માંડીને સરિસૃપ સુધીના ઓર્થોલોગ્સમાં સંરક્ષિત કરવામાં આવ્યા હતા. વધુમાં, ડાયના આગાહી કરે છે કે TMEM212 માં 6 સિસ્ટીન એમિનો એસિડ વચ્ચે 3 ડાયસલ્ફાઇડ બોન્ડ્સ છેઃ C46-C88, C105-C154, અને C135-C16. તૃતીય માળખામાં પટલની અંદર 5 પ્રદેશો હોય છે. જીન લેવલ રેગ્યુલેશન પ્રમોટર જેનોમેટિક્સ અનુસાર, TMEM212 પાસે 3 સંભવિત પ્રમોટર્સ છે. જો કે, TMEM212 માટે સૌથી વધુ સંભવિત પ્રમોટર TMEM212ના જીનની સીધી ઉપરની તરફ છે અને તે 1654 બેઝ જોડી (GXP _ 277729) છે. અભિવ્યક્તિ TMEM212 RNA મોટાભાગની પેશીઓના પ્રકારોમાં (GDS1096) નીચી અને સર્વવ્યાપક રીતે વ્યક્ત થાય છે. TMEM212 અંડાશય, મગજ, ફેફસાં, હૃદય, કિડની, વૃષણમાં સહેજ ઊંચા સ્તરે વ્યક્ત થાય છે. TMEM212 મગજના ચોક્કસ ભાગોમાં વ્યક્ત કરવામાં આવ્યું હતું જેમાં પોન્સ અને ટ્રાઇજેમિનલ ગેંગલિયનનો સમાવેશ થાય છે. મધ્યમ અભિવ્યક્તિ ધરાવતી અન્ય પેશીઓમાં મૂત્રપિંડની આચ્છાદન અને એપેન્ડિક્સનો સમાવેશ થાય છે. તમામ ઉપલબ્ધ આર. એન. એ.-અનુક્રમણિકા માહિતી દર્શાવે છે કે TMEM212 ફેફસાંમાં જોવા મળે છે. અનુલેખન સ્તર નિયમન 5 'અનુવાદિત પ્રદેશ 35 આધાર જોડીઓ લાંબો છે. 3 'અનુવાદિત પ્રદેશ લંબાઈમાં 1221 આધાર જોડીઓ ધરાવે છે અને આધાર 661 થી 1881 સુધી સ્થિત છે. 5 'યુ. ટી. આર. અને 3' યુ. ટી. આર. માટે સૌથી ઓછી ઊર્જા રચનાની આગાહી કરવામાં આવી હતી. ટૂંકી લંબાઈને કારણે, 5 'યુ. ટી. આર. માં 1 સ્ટેમ-લૂપ હોવાની આગાહી કરવામાં આવી હતી. 3 'યુ. ટી. આર. માં 17 સ્ટેમ-લૂપ્સ હોવાની આગાહી કરવામાં આવી છે. પ્રોટીન સ્તર નિયમનમાં ફેરફાર એવી આગાહી કરવામાં આવી છે કે TMEM212માં બે સલ્ફિકેશન સાઇટ્સ અને એક ફોસ્ફોરાયલેશન સાઇટ છે. એમિનો એસિડ 23 અને 24 વચ્ચે સંભવિત ક્લેવેજ સિગ્નલ પેપ્ટાઇડ છે. ફોસ્ફોરાયલેશન સાઇટ અને ક્લેવેજ સિગ્નલ પેપ્ટાઇડની હાજરી ઓર્થોલોગ્સમાં સામાન્ય છે. સબસેલ્યુલર સ્થાનિકીકરણ પ્રાથમિક સબસેલ્યુલર સ્થાનોમાં પ્લાઝ્મા પટલ અને એન્ડોપ્લાઝ્મિક રેટિક્યુલમનો સમાવેશ થાય છે. TMEM212 નું ઉપકોષીય સ્થાન ઓર્થોલોગ્સમાં સંરક્ષિત છે. TMEM212 એન્ટિબોડીઝનું ઇમ્યુનોફ્લોરેસન્ટ સ્ટેનિંગ દર્શાવે છે કે TMEM212 ન્યુક્લિયસમાં હાજર છે, પરંતુ તેનું કારણ અજ્ઞાત છે. TMEM212 મનુષ્યમાં મોટાભાગના પ્રોટીન કરતાં ઓછું વિપુલ પ્રમાણમાં હોય છે. ઇવોલ્યુશન પેરાલોગ TMEM212 પાસે એક જાણીતું પેરાલોગ છેઃ પટલ-ફેલાયેલું 4 ડોમેન્સ A7 (MS4A7). જનીન 11q12.2 પર રંગસૂત્ર 11 પર સ્થિત છે. MS4A7 સંભવતઃ TMEM212 435-475 મિલિયન વર્ષો પહેલા વિકસિત થયું હતું. આ જમણી બાજુએ દર્શાવવામાં આવ્યું છે જ્યાં વિવિધ પ્રોટીનના વિચલન દરની સરખામણી કરવામાં આવે છે. હોમો સેપિયન્સમાં ઓર્થોલોગ્સ TMEM212 ખૂબ જ સંરક્ષિત છે. તે કરોડઅસ્થિધારી પ્રાણીઓમાં જોવા મળે છે પરંતુ અપૃષ્ઠવંશી પ્રાણીઓમાં નહીં અને તેમાં સસ્તન પ્રાણીઓ, પક્ષીઓ, સરિસૃપ, ઉભયજીવી અને માછલી સહિત ઘણા ઓર્થોલોગ્સ છે. નીચેનું કોષ્ટક 2 સસ્તન પ્રાણીઓ, સરિસૃપ, પક્ષીઓ, ઉભયજીવીઓ અને માછલીઓમાં TMEM212 ના ઓર્થોલોગ્સ દર્શાવે છે. જમણી બાજુએ બહુવિધ અનુક્રમ સંરેખણમાં દર્શાવ્યા મુજબ, સસ્તન પ્રાણીઓ અને સરિસૃપ જેવા કડક ઓર્થોલોગ્સમાં અત્યંત સંરક્ષિત પ્રદેશો છે. મોટાભાગના સંરક્ષિત વિસ્તારો ત્યાં પડ્યા જ્યાં ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન પ્રદેશો સ્થાનિક છે. સાયટોક્રોમ સી અને ફાઇબ્રિનોજેન આલ્ફાના સંદર્ભ ક્રમની સરખામણીમાં TMEM212 સાધારણ રીતે ઝડપથી વિકસી રહ્યું છે. TMEM212, MS4A7, સાયટોક્રોમ C અને ફાઇબ્રિનોજેન આલ્ફાના વિચલન દરની સરખામણી કરતી વખતે આ જમણી બાજુએ દર્શાવવામાં આવ્યું છે. એમ. વાય. એ. = લાખો વર્ષ પહેલાં આંતરક્રિયા કરતા પ્રોટીન ત્રણ પ્રોટીન સંભવિત રીતે ટી. એમ. ઈ. એમ. 212 સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરે છેઃ ટી. એમ. ઈ. એમ. 45એ, જી. પી. આર. 137સી, અને એચ. એન. આર. એન. પી. એલ. આ પ્રોટીનને સહ-અભિવ્યક્તિ અથવા આકર્ષણ કેપ્ચર-આર. એન. એ. દ્વારા પ્રાયોગિક રીતે ઓળખવામાં આવ્યા હતા. તેમને ટેક્સ્ટ માઇનિંગનો ઉપયોગ કરીને પણ ઓળખવામાં આવ્યા હતા. ટી. એમ. ઈ. એમ. 45એ અને જી. પી. આર. 137 પણ પ્લાઝ્મા પટલમાં જોવા મળે છે, જે ટી. એમ. ઈ. એમ. 212ની જેમ આ ક્રિયાપ્રતિક્રિયાને સંભવિત બનાવે છે. કોષ્ટક 3: પ્રોટીન કે જે TMEM212 સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરે છે ક્લિનિકલ મહત્વ TMEM212 આફ્રિકન અમેરિકનોમાં ચરબી, ચહેરાની પ્રક્રિયા અને છૂટાછવાયા પાર્કિન્સન રોગ સાથે સંકળાયેલ હોઈ શકે છે. આફ્રિકન અમેરિકનોમાં ટી. એમ. ઈ. એમ. 212 (એમ. આર. એન. એ. અથવા પ્રોટીન) માં વધારો અને ઉચ્ચ બી. એમ. આઈ. એ એક કડી દર્શાવી છે કારણ કે ટી. એમ. ઈ. એમ. 212 નજીકના સ્થાન પર એસ. એન. પી. વધેલી ચરબી સાથે સંકળાયેલા છે. વધુમાં, જનીન TMEM212 ચહેરાની પ્રક્રિયામાં પણ સામેલ હોઈ શકે છે. ચહેરાની પ્રક્રિયા આનુવંશિક રીતે નિયંત્રિત થાય છે, અને ચહેરાના હાવભાવની પ્રતિક્રિયામાં, TMEM212 માં જોવા મળતા સામાન્ય SNP મગજના જમણા ફ્યુસિફોર્મ ગાયરસ વિસ્તારને સક્રિય કરવા તરફ દોરી જાય છે, જે ચહેરાની પ્રક્રિયા માટે મહત્વપૂર્ણ છે. આ ખાસ કરીને 3q26.31 પર થયું. SNP નંબર rs12485367 છે. જી એલ સાથેના લોકોમાં સી હોમોઝાયગોટ્સની તુલનામાં વધુ સક્રિયકરણ હતું. TMEM212 પાર્કિન્સન રોગ સાથે પણ સંકળાયેલ હોઈ શકે છે. ટી. એમ. ઇ. એમ. 212 જનીનમાં એસ. એન. પી. આર. એસ. 2270568 (રંગસૂત્ર 3 સ્થિતિ 172048861) માં ફેરફારો બેઝ ટીને સીમાં બદલવા સાથે સંકળાયેલા હતા અને છૂટાછવાયા પાર્કિન્સન રોગની ઘટનાઓમાં વધારો થયો હતો. સંદર્ભો