Liquid–liquid phase separation sequence-based predictors
એલએલપીએસમાં ઘણીવાર અનુક્રમ પ્રદેશોનો સમાવેશ થાય છે જેમાં અનન્ય કાર્યાત્મક લાક્ષણિકતાઓ હોય છે, તેમજ પ્રિયોન જેવા અને આરએનએ-બંધનકર્તા ક્ષેત્રોની હાજરી હોય છે. આજકાલ એલ. એલ. પી. એસ. ચલાવવા માટે પ્રોટીનના વલણની આગાહી કરવા માટે માત્ર થોડી પદ્ધતિઓ છે. એલ. એલ. પી. એસ. માં સામેલ જૈવિક પદ્ધતિઓની શ્રેણી, આ પદ્ધતિઓ વિશે મર્યાદિત જ્ઞાન અને એલ. એલ. પી. એસ. ના મહત્વપૂર્ણ સંદર્ભ આધારિત ઘટક આ સમસ્યાને પડકારજનક બનાવે છે. છેલ્લા વર્ષોમાં, આ ક્ષેત્રમાં પ્રગતિ હોવા છતાં, પ્રોટીન અનુક્રમ ગુણધર્મો અને એલ. એલ. પી. એસ. ચલાવવાની ક્ષમતા વચ્ચેના સંબંધને સમજવાનો પ્રયાસ કરતા, એલ. એલ. પી. એસ. માટે વિશિષ્ટ, માત્ર થોડા આગાહીકર્તાઓ વિકસાવવામાં આવ્યા છે. અહીં આપણે અત્યાધુનિક એલ. એલ. પી. એસ. અનુક્રમ-આધારિત આગાહીકારોમાં સુધારો કરીશું, ટૂંકમાં તેમનો પરિચય આપીશું અને સમજાવીશું કે એલ. એલ. પી. એસ. ના સંદર્ભમાં તેઓ કઈ વ્યક્તિગત પ્રોટીન લાક્ષણિકતાઓ ઓળખે છે. એલએલપીએસ સિમ્યુલેશન એલએલપીએસના ક્ષેત્રમાં અન્ય મહત્વપૂર્ણ કોમ્પ્યુટેશનલ સંસાધન એ પ્રોટીનનું સૈદ્ધાંતિક સિમ્યુલેશન છે, ખાસ કરીને આંતરિક રીતે અવ્યવસ્થિત પ્રોટીન (આઇડીપી), જે એલએલપીએસને ચલાવે છે. આ સિમ્યુલેશન પ્રયોગોના પૂરક છે અને એલ. એલ. પી. એસ. ચલાવતા વ્યક્તિગત પ્રોટીનની પરમાણુ પદ્ધતિઓ વિશે મહત્વપૂર્ણ આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે. ડિગ્નોન એટ અલની સમીક્ષા. પ્રાયોગિક પરિણામોનું અર્થઘટન કરવા, તબક્કાના વર્તનને સમજાવવા અને ટ્યુન કરી શકાય તેવા તબક્કાના સંક્રમણ ગુણધર્મો સાથે પ્રોટીનની રચના કરવા માટે આગાહીયુક્ત માળખું પ્રદાન કરવા માટે આ સિમ્યુલેશન કેવી રીતે લાગુ કરી શકાય તેની ચર્ચા કરી. પડકાર એ મોડેલના રિઝોલ્યુશન અને કોમ્પ્યુટેશનલ કાર્યક્ષમતા વચ્ચેનું સમાધાન છે, કારણ કે IDPs સાથે સંકળાયેલી મોટી સિસ્ટમોના તમામ અણુ સિમ્યુલેશન હજુ પણ કરવું મુશ્કેલ છે. વધુમાં, ટીપાં-સ્થિતિમાં IDPs વચ્ચે પરમાણુ ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ હજુ પણ નબળી રીતે સમજી શકાય છે, અને પ્રાયોગિક માહિતી અને સિમ્યુલેશનનું સંયોજન તેમને સ્પષ્ટ કરવા માટે અનિવાર્ય છે. આ પદ્ધતિઓને જાગૃત કરવા માટે આગામી કેટલાક વર્ષોમાં નમૂના અને અનુકરણ પદ્ધતિઓમાં સુધારો થઈ શકે છે. આંતરિક રીતે અવ્યવસ્થિત પ્રોટીન ડિસપ્રોટ ડેટાબેઝ મોબીડીબી ડેટાબેઝ સંદર્ભો પ્રોટીન માળખું સ્ટ્રક્ચરલ બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ પ્રોટિઓમિક્સ ન્યુરોડિજનરેટિવ ડિસઓર્ડર્સ પણ જુઓ.