ZNF548
ઝિંક ફિંગર પ્રોટીન 548 (ZNF548) એ ZNF548 જનીન દ્વારા એન્કોડ થયેલ માનવ પ્રોટીન છે જે રંગસૂત્ર 19 પર સ્થિત છે. તે ન્યુક્લિયસમાં જોવા મળે છે અને આર. એન. એ. પોલિમરેઝ II દ્વારા ટ્રાન્સક્રિપ્શનના નિયમનમાં ભૂમિકા ભજવવાની ધારણા છે. તે ક્રુપેલ C2H2-પ્રકારના ઝિંક-ફિંગર પ્રોટીન પરિવાર સાથે સંબંધિત છે કારણ કે તેમાં ઘણા ઝિંક-ફિંગર રિપીટ્સ હોય છે. જીન આ પ્રોટીન કોડિંગ જનીન 4987 બી. પી. લાંબુ છે અને ટ્રાન્સક્રિપ્ટ વેરિઅન્ટ 1 ને એન્કોડ કરે છે જે સૌથી લાંબુ ZNF548 આઇસોફોર્મ છે. તે રંગસૂત્ર 19 પર જોવા મળે છે; પ્લસ સ્ટ્રાન્ડમાં તેની ચોક્કસ સ્થિતિ 19q13.43 છે. જનીનમાં 4 એક્સોન હોય છે જે ક્રુપેલ સંકળાયેલ બોક્સ (KRAB ડોમેન) માટે એન્કોડ કરે છે અને 11 ઝિંક ફિંગર પુનરાવર્તન કરે છે. ZNF548 જનીનનો પ્રવર્તક 1198 પાયા લાંબો છે અને તે રંગસૂત્ર 19 પર 57388850-57390047 પર સ્થિત છે. પ્રમોટર પ્રદેશ 6 ઓર્થોલોગમાં સંરક્ષિત છેઃ રીસસ મકાક (રીસસ વાનર), પાન ટ્રોગ્લોડાઇટ્સ (ચિમ્પાન્ઝી), ઓરીક્ટોલેગસ ક્યુનિક્યુલસ (યુરોપિયન સસલા), ઇક્વસ કેબેલસ (ઘોડો), કેનિસ લ્યુપસ પરિચિત (કૂતરો) અને સુસ સ્ક્રોફા (ડુક્કર). ટ્રાન્સક્રિપ્ટ ટ્રાન્સક્રિપ્ટ વેરિઅન્ટ 1 એ સૌથી લાંબી ટ્રાન્સક્રિપ્ટ છે અને સૌથી લાંબી પ્રોટીન આઇસોફોર્મ (ZNF548 આઇસોફોર્મ 1) ને એન્કોડ કરે છે જે 545 એમિનો એસિડ લાંબા છે. ટ્રાન્સક્રિપ્ટ વેરિઅન્ટ 2 માં એક્સોન 2 ખૂટે છે અને ZNF548 આઇસોફોર્મ 2 ને એન્કોડ કરે છે જે 533 એમિનો એસિડ લાંબા છે. પ્રોટીન ZNF548 ક્રુપેલ C2H2-પ્રકારના ઝિંક ફિંગર પ્રોટીન પરિવાર સાથે સંબંધિત છે કારણ કે તેમાં 11 Cys2His2-પ્રકારના ઝિંક ફિંગર રિપીટ્સ હોય છે. દરેક ઝિંક આંગળીમાં સંરક્ષિત ββα માળખું હોય છે જ્યાં ઝિંક અણુ C2H2 અવશેષો દ્વારા સ્થિર થાય છે. ZNF548 તેના C2H2 Zn મોટિફ્સ દ્વારા 44 bp લાંબા ક્રમમાં DNA સાથે જોડાવા માટે સક્ષમ છે, દરેક 4 DNA પાયા સાથે બંધનકર્તા છે. પ્રોટીનમાં ક્રુપેલ-સંકળાયેલ બોક્સ (કે. આર. એ. બી.) પણ હોય છે જે એન ટર્મિનસ પર જોવા મળતું ડોમેન છે અને તેમાં બહુવિધ ચાર્જ એમિનો એસિડ હોય છે. આ ડોમેન ટ્રાન્સક્રિપ્શનમાં ભૂમિકા ભજવે છે; તે કેએપી-1/ટીઆઈએફ-1 બીટા કો-રિપ્રેસરના રિંગ-બી બોક્સ-કોઇલ્ડ કોઇલ (આરબીસીસી) ડોમેન સાથે જોડાય છે. ZNF548ની તૃતીય માળખાની આગાહી I-Tasserનો ઉપયોગ કરીને કરવામાં આવી હતી. ZNF548 નું પરમાણુ વજન 64 kDa છે અને અનુમાનિત આઇસોઇલેક્ટ્રિક બિંદુ 8,21 છે. ઝેડ. એન. એફ. 548ના રચનાત્મક વિશ્લેષણમાં જાણવા મળ્યું છે કે એલનાઇન અપેક્ષા કરતા ઓછી ટકાવારી પર જોવા મળ્યું હતું જ્યારે હિસ્ટિડીન માનવ ઝેડ. એન. એફ. 548માં અપેક્ષા કરતા ઘણી વધારે ટકાવારી પર જોવા મળ્યું હતું. સબસેલ્યુલર અભિવ્યક્તિ પ્રોટીન ન્યુક્લિયસમાં જોવા મળે છે અને તે કોષરસ અથવા મિટોકોન્ડ્રિયામાં પણ શોધી શકાય છે. મનુષ્યમાં પેશી અભિવ્યક્તિ ZNF548 અભિવ્યક્તિ અન્ય પ્રોટીનની તુલનામાં પ્રમાણમાં ઓછી છે. તેની પેશીઓની વિશિષ્ટતા ઓછી હોય છે; તે તમામ માનવ પેશીઓમાં વ્યક્ત થાય છે અને શોધાય છે. અન્ય પ્રોટીન સાથેની ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ માનવ ઝેડ. એન. એફ. 548 પ્રોટીનની ન્યુક્લિયર ડિસ્ટ્રિબ્યુશન પ્રોટીન ન્યુડ-લાઇક 1 (એન. ડી. ઇ. એલ. 1) અને ડિસરપ્ટેડ ઇન સ્કિઝોફ્રેનિયા 1 (ડી. આઈ. એસ. સી. 1) પ્રોટીન સાથેની ક્રિયાપ્રતિક્રિયાને બે વર્ણસંકર ફ્રેગમેન્ટ પૂલિંગ અભિગમનો ઉપયોગ કરીને પ્રાયોગિક રીતે માન્ય કરવામાં આવી છે. 36 (એલ. આર. આર. સી. 36), માયોટુબ્યુલરીન 1 (એમ. ટી. એમ. 1), માયોટુબ્યુલરીન સંબંધિત પ્રોટીન 4 (એમ. ટી. એમ. આર. 4) અને આર. એન. એ. બંધનકર્તા મોટિફ પ્રોટીન 39 (આર. બી. એમ. 39) ધરાવતું લ્યુસીન સમૃદ્ધ પુનરાવર્તન પણ એફિનિટી કેપ્ચર-માસ સ્પેક્ટ્રોમેટ્રી દ્વારા ઝેડ. એન. એફ. 548 પ્રોટીન સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરે છે. કાર્ય ZNF548 જનીન અભિવ્યક્તિ સાથે સંકળાયેલું છે કારણ કે તે ન્યુક્લિક એસિડ તેમજ ઝિંક આયનો સાથે જોડાઈ શકે છે. અન્ય KRAB-ZNF પ્રોટીનના કાર્યના આધારે એવી ધારણા કરવામાં આવે છે કે તે RNA પોલિમરેઝ II દ્વારા ટ્રાન્સક્રાઇબ કરેલા પ્રોટીન-એન્કોડિંગ જનીનોના ટ્રાન્સક્રિપ્શનના નિયમનમાં ભૂમિકા ભજવે છે. ખાસ કરીને તે ડીએનએ-બંધનકર્તા અનુલેખન પરિબળ છે જે આરએનએ પોલિમરેઝ II દ્વારા અનુલેખન કરાયેલા ચોક્કસ જનીનોના અનુલેખનને વધારે છે અથવા અટકાવે છે. તે ટ્રાન્સક્રિપ્શન ફેક્ટર રેકગ્નિશન સિક્વન્સ સાથે જોડાવાની ક્ષમતા ધરાવે છે જે તેની ઝિંક-આંગળીઓ દ્વારા ટ્રાન્સક્રિપ્શન સ્ટાર્ટ સાઇટ જેવી જ સ્ટ્રાન્ડ (સી. આઈ. એસ.) પર હોય છે અને ન્યુક્લિયોપ્લાઝમમાં કે. આર. એ. બી.-ઝેડ. એન. એફ./કે. એ. પી. કોમ્પ્લેક્સનો ભાગ બને છે. કે. આર. એ. બી.-ઝેડ. એન. એફ. પ્રોટીન દમનકારી તરીકે જાણીતા છે. તેથી, જ્યારે કે. આર. એ. બી.-ઝેડ. એન. એફ. પ્રોટીન, જેમ કે ઝેડ. એન. એફ. 548, ડી. એન. એ. સાથે બંધાયેલ હોય છે અને સાથે સાથે તેના કે. આર. એ. બી. ડોમેન દ્વારા કે. એ. પી. 1 કો-રિપ્રેસર સાથે જોડાય છે, ત્યારે વિવિધ ઉત્સેચકો, જેમ કે હિસ્ટોન ડેસેટિલેસ, હિસ્ટોન મિથાઈલટ્રાન્સફેરેસ અને હેટેરોક્રોમેટિન પ્રોટીન, ક્રોમેટિન માળખાને સઘન બનાવવા માટે અને પરિણામે ટ્રાન્સક્રિપ્શનને રોકવા માટે ભરતી કરવામાં આવે છે. હોમોલોગ્સ ઓર્થોલોગ્સ ZNF548 પ્રોટીનના ઓર્થોલોગ્સ માત્ર સસ્તન પ્રાણીઓના વિવિધ ક્રમમાં સંરક્ષિત જોવા મળ્યા છે. આ એ હકીકત સાથે સુસંગત છે કે C2H2 જેવા ફોલ્ડ જૂથો સસ્તન ટ્રાન્સક્રિપ્શન પરિબળોમાં ખૂબ જ સામાન્ય છે. KRAB ડોમેન તેમજ ઝિંક ફિંગર રિપીટ્સ ઓર્થોલોગ્સમાં ખૂબ જ સંરક્ષિત છે. પેરાલોગ્સ ZNF548 માં માનવમાં 25 પેરાલોગસ પ્રોટીન છે જે નીચે કોષ્ટકમાં જોવા મળે છે. ક્લિનિકલ સિગ્નિફિકેન્સ ZNF548 ને મેટા-વાયરસ સિગ્નેચર (MVS) માં જનીન તરીકે ઓળખવામાં આવ્યું હતું, જેનો ઉપયોગ વાયરલ ચેપ ધરાવતા વ્યક્તિઓ અને બેક્ટેરિયલ ચેપ ધરાવતા લોકો તેમજ તંદુરસ્ત વ્યક્તિઓ વચ્ચે તફાવત કરવા માટે થઈ શકે છે. ZNF548 માઇક્રોઆરએનએ અભિવ્યક્તિ અંડાશયના કેન્સરનું નિદાન કરવા માટે માર્કર તરીકે કામ કરી શકે છે. ZNF548 રક્ત જનીન અભિવ્યક્તિ બાયોમાર્કરનો ઉપયોગ આત્મહત્યા માટે માર્કર તરીકે પણ થઈ શકે છે. સંદર્ભો માનવ રંગસૂત્ર 19 ઝિંક ફિંગર પ્રોટીન પર માનવ પ્રોટીન જનીનો