CCDC188
સી. સી. ડી. સી. 188 અથવા પ્રોટીન ધરાવતું કોઇલ-કોઇલ ડોમેન એ એક પ્રોટીન છે જે મનુષ્યમાં સી. સી. ડી. સી. 188 જનીન દ્વારા એન્કોડ કરવામાં આવે છે. જનીન માનવ CCDC188 જનીન 3715 ન્યુક્લિયોટાઇડ્સમાં ફેલાયેલું છે અને તે 22q11.21 પર રંગસૂત્ર 22ના માઈનસ સ્ટ્રાન્ડ પર સ્થિત છે. તે પ્રોટીન કોડિંગ જનીન છે જે CCDC188 પ્રોટીનને એન્કોડ કરે છે. એમઆરએનએ ટ્રાન્સક્રિપ્ટમાં 9 જુદા જુદા એક્સોનનો સમાવેશ થાય છે જે 6 અલગ-અલગ સીસીડીસી188 પ્રોટીન આઇસોફોર્મ્સ બનાવવા માટે જોડવામાં આવે છે. સી. સી. ડી. સી. 188ના આનુવંશિક પડોશીઓમાં ઝેડ. ડી. એચ. એચ. સી. 8, એસ. એન. ઓ. આર. એ. 77બી અને આર. એ. એન. બી. પી. 1 નો સમાવેશ થાય છે. આર. એન. એ. અભિવ્યક્તિ CCDC188 કફોત્પાદક ગ્રંથિ અને વૃષણમાં વધેલી અભિવ્યક્તિ સાથે તમામ પુખ્ત પેશીઓમાં નીચા સ્તરે વ્યક્ત થાય છે. CCDC188 એ કોષ ચક્રના G1 માં અભિવ્યક્તિમાં ઘટાડો કર્યો છે. હાયપોથેલેમસ, સુપ્રાઓપ્ટિક ન્યુક્લિયસ અને ડેન્ટેટ ગાયરસમાં સમાન એમઆરએનએ અભિવ્યક્તિ ધરાવતા જનીનો નીચે કોષ્ટકમાં દર્શાવવામાં આવ્યા છે. CCDC188 માટે પ્રમોટર પ્રદેશમાં અત્યંત સંરક્ષિત p53 અને CREB-ATF4 બંધનકર્તા સાઇટ્સ છે. ક્રોમેટિન-ઇમ્યુનોપ્રેસિપિટેશન વિશ્લેષણ CCDC188 ના પ્રમોટર ક્ષેત્ર સાથે p53 બંધનની પુષ્ટિ કરે છે. નોંધપાત્ર રીતે દબાવી દેવાયેલા CCDC188 mRNA અભિવ્યક્તિ વૃષણ રોગાણુ રેખા ગાંઠો અને ફેફસાના સ્ક્વામસ સેલ કેન્સર બંનેમાં જોવા મળે છે. ફેફસાના સ્ક્વામસ સેલ ટ્યુમરમાં સી. સી. ડી. સી. 188ની કોપી નંબર ભિન્નતાઓ પણ ઓળખવામાં આવી છે, જેમાં 16 ગાંઠોમાં એમ્પ્લીફિકેશન હોય છે અને 4માં હોમોડેલીશન હોય છે. ફેફસાના સ્ક્વામસ સેલ ગાંઠોમાં CCDC188 એમ્પ્લીફિકેશન હેઠળ નોંધપાત્ર રીતે વધેલા mRNA અભિવ્યક્તિવાળા જનીનો નીચે કોષ્ટકમાં દર્શાવવામાં આવ્યા છે. CCDC188 માટે અન્ય અનુમાનિત અનુલેખન પરિબળ બંધનકર્તા સાઇટ્સ જમણી બાજુની આકૃતિમાં દર્શાવવામાં આવી છે. ટ્રાન્સક્રિપ્ટ રેગ્યુલેશન અનુમાનિત CCDC188 3 'UTR સ્ટેમ લૂપ્સ નીચેની આકૃતિમાં દર્શાવવામાં આવ્યા છે. પ્રોટીન CCDC188 પ્રોટીન 402 એમિનો એસિડ લાંબુ અને 4.3 kDa છે. પ્રોટીનમાં લ્યુસીન ઝિપર અને ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન ડોમેન હોય છે. લ્યુસીન ઝિપર ડોમેન અને ટ્રાન્સમેમ્બ્રેન ડોમેન બંનેની હાજરી સૂચવે છે કે CCDC188 પ્રોટીન ટ્રાન્સક્રિપ્શન પરિબળ તરીકે કાર્ય કરે છે જે ચુસ્ત રીતે નિયંત્રિત હોય છે અને સક્રિય થવા માટે તેને પટલમાંથી બહાર કાઢવું આવશ્યક છે. પ્રોટીનનું નિષ્ક્રિય સ્વરૂપ એન્ડોપ્લાઝ્મિક રેટિક્યુલમમાં એન-ટર્મિનસ સાથે અને સાયટોસોલમાં મૂળભૂત લ્યુસીન ઝિપર લક્ષી હોવાની આગાહી કરવામાં આવે છે. અન્ય પટલથી બંધાયેલા મૂળભૂત લ્યુસીન ઝિપર્સમાં એટીએફ 6 અને ઓએએસઆઈએસનો સમાવેશ થાય છે. એન્ડોપ્લાઝ્મિક રેટિક્યુલમમાં પટલથી બંધાયેલા ટ્રાન્સક્રિપ્શન પરિબળો માટે જાણીતા પરમાણુ પરિવહન માર્ગોમાં ER લ્યુમેન ક્ષેત્રનું સર્વવ્યાપકકરણ અને વિનાશ અને નિવાસી પ્રોટીઝ દ્વારા પ્રોટીઓલિટિક ક્લેવેજ માટે ગોલ્ગીમાં COPII વેસિક્યુલર પરિવહનનો સમાવેશ થાય છે. અનુવાદ પછીના ફેરફારો બી-સેલ લ્યુકેમિયામાં સેરીન અવશેષો 322 અને 324 પર બે ફોસ્ફેટ જૂથોની પ્રાયોગિક રીતે ચકાસણી કરવામાં આવી છે. હોમોલોજી સી. સી. ડી. સી. 188 મોનોટ્રેમ્સ, માર્સુપિયલ્સ અને સ્તન્ય પ્રાણીઓમાં ગર્ભમાં રહેલા બચ્ચાની રક્ષા માટેનું આચ્છાદન સહિત તમામ સસ્તન પ્રાણીઓમાં સંરક્ષિત છે જ્યારે સી. સી. ડી. સી. 188 લગભગ 180 મિલિયન વર્ષો પહેલા મોનોટ્રેમ્સમાં પ્રથમ વખત દેખાયું હતું, ત્યારે તેમાં મૂળભૂત લ્યુસીન ઝિપરનો અભાવ હતો. માર્સુપિયલ્સ એ પ્રથમ સસ્તન પ્રાણીઓ હતા જેમણે CCDC188 મૂળભૂત લ્યુસીન ઝિપર ડોમેન વિકસાવ્યું હતું. મનુષ્યોમાં અનુક્રમ ઓળખ દ્વારા માપવામાં આવેલા CCDC188ના ઉત્ક્રાંતિનો દર દર્શાવે છે કે CCDC188 શરૂઆતમાં દર દસ લાખ વર્ષોમાં 100 એમિનો એસિડ દીઠ 0.97 ફેરફારોના દરે ઝડપથી વિકસ્યું હતું. પ્રથમ સ્તન્ય પ્રાણીઓમાં ગર્ભમાં રહેલા બચ્ચાની રક્ષા માટેનું આચ્છાદનથી શરૂ કરીને, CCDC188 ઉત્ક્રાંતિ દર દસ લાખ વર્ષોમાં 100 એમિનો એસિડ દીઠ 0.45 ફેરફારોના દરે ધીમી પડી. CCDC188 માટે એક પેરાલોગ મનુષ્યમાં CCDC188-જેવા તરીકે ઓળખાય છે. આ જનીન સૌપ્રથમ માર્સુપિયલ્સમાં દેખાયું હતું. પેથોલોજી CCDC188 ના કોડિંગ ક્ષેત્રમાં એક નોનસેન્સ પરિવર્તનને રેટિનાઇટિસ પિગમેન્ટોસામાં સામેલ કરવામાં આવ્યું છે, જે લાકડીના કોષોના અનિયંત્રિત મૃત્યુ દ્વારા ચિહ્નિત થયેલ રેટિના અધોગતિ પ્રક્રિયા છે. 22q11.2 ડીલીશન સિન્ડ્રોમમાં પણ CCDC188 કાઢી નાખવામાં આવે છે. સંદર્ભો