ORF9c
ORF9c (અગાઉ ORF14 તરીકે પણ ઓળખાતું હતું) એ સબજેનસ સરબેકોવાયરસના કોરોનાવાયરસ જીનોમમાં એક ઓપન રીડિંગ ફ્રેમ (ORF) છે. તે SARS-CoV-2 જિનોમમાં 73 કોડન લાંબા છે. જો કે તે ઘણીવાર સરબેકોવાયરસ વાયરલ સહાયક પ્રોટીન જનીનોની યાદીમાં સામેલ કરવામાં આવે છે, પ્રાયોગિક અને બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ પુરાવા સૂચવે છે કે ORF9c કાર્યાત્મક પ્રોટીન-કોડિંગ જનીન ન પણ હોઈ શકે. નામકરણ વૈજ્ઞાનિક સાહિત્યમાં આ જનીન માટે ઉપયોગમાં લેવાતા નામકરણમાં અસંગતતા જોવા મળી છે. SARS-CoV પરના કેટલાક કાર્યોમાં, તેને ORF14 તરીકે ઓળખવામાં આવે છે. તેને કેટલીકવાર ORF9b તરીકે ઓળખવામાં આવે છે, જ્યારે તેના લાંબા અપસ્ટ્રીમ પડોશી ORF9b ને ORF9a નામ આપવામાં આવ્યું હતું. વર્તમાન ભલામણ કરાયેલ નામકરણ આ જનીનને ORF9c તરીકે અને અપસ્ટ્રીમ જનીનને ORF9b તરીકે ઉલ્લેખ કરે છે. અભિવ્યક્તિ અને ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ ORF9c એ એન જનીન એન્કોડિંગ કોરોનાવાયરસ ન્યુક્લિયોકેપ્સિડ પ્રોટીનની ખુલ્લી વાંચન ફ્રેમમાં સંપૂર્ણપણે સમાવિષ્ટ બે ઓવરલેપિંગ જનીનોમાંથી એક છે, બીજું ORF9b છે. તે અસ્પષ્ટ છે કે ORF9c એ SARS-CoV-2 ચેપ દરમિયાન કાર્યાત્મક રીતે વ્યક્ત થાય છે કે કેમ; તે પ્રાયોગિક પરિસ્થિતિઓમાં અનુવાદિત નથી. જ્યારે પ્રાયોગિક રીતે વધુ પડતું અભિવ્યક્ત થાય છે, ત્યારે પ્રોટીન સિગ્મા રીસેપ્ટર્સ સાથે અને એન. એફ.-કે. બી. માર્ગ સાથે સંપર્ક કરે છે. SARS-CoV પ્રોટીન ડાયમર અથવા ઉચ્ચ ક્રમના ઓલિગોમરની રચના સૂચવતી સ્વ-ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓ બનાવે છે. ઇવોલ્યુશન ORF9c એ SARS-CoV અને SARS-CoV-2 વચ્ચે લગભગ 74 ટકા અનુક્રમ ઓળખ ધરાવે છે. SARS-CoV-2 પ્રકારોને ઓળખવામાં આવ્યા છે જેમાં અકાળ સ્ટોપ કોડન દાખલ કરવામાં આવે છે અથવા જ્યાં તેનો પ્રારંભ કોડન ખોવાઈ ગયો હતો, અને એમિનો એસિડ ક્રમ નબળી રીતે સંરક્ષિત છે, જે પૂર્વધારણાને ટેકો આપે છે કે તે કાર્યાત્મક પ્રોટીનને એન્કોડ કરતું નથી. સંદર્ભો કોરોનાવાયરસ પ્રોટીન