DIMPL
ડી. આઈ. એમ. પી. એલ. (ડિસ્કવરી ઓફ ઇન્ટરજેનિક મોટિફ્સ પાઇપલાઇન) એક બાયોઇન્ફોર્મેટિક પાઇપલાઇન છે જે બેક્ટેરિયલ જી. સી.-સમૃદ્ધ ઇન્ટરજેનિક પ્રદેશો (આઇ. જી. આર.) ના નિષ્કર્ષણ અને પસંદગીને સક્ષમ કરે છે જે સ્ટ્રક્ચર્ડ નોન-કોડિંગ આર. એન. એ. (એન. સી. આર. એન. એ.) માટે સમૃદ્ધ છે. એન. સી. આર. એન. એ. મોટિફ શોધ માટે બેક્ટેરિયલ આઇ. જી. આર. ને સમૃદ્ધ કરવાની પદ્ધતિ સૌપ્રથમ "બેક્ટેરિયામાં માળખાગત નોનકોડિંગ આર. એન. એ. ની જીનોમ-વાઇડ શોધ" માં અભ્યાસ માટે નોંધવામાં આવી હતી. ડી. આઈ. એમ. પી. એલ. પાઇપલાઇન આઇ. જી. આર. ને બહાર કાઢીને, તેમને લંબાઈ અને ન્યુક્લિક એસિડની રચના દ્વારા ફિલ્ટર કરીને, અને ઉમેદવારની રચનાઓને ઓળખવા અને તેમના સંભવિત કાર્યોને સોંપવા માટે જરૂરી માહિતી એકત્રિત કરીને કુલ જીનોમ વિશ્લેષણની પ્રક્રિયાને સ્વચાલિત કરે છે. ડી. આઈ. એમ. પી. એલ. પાઇપલાઇન સપોર્ટ વેક્ટર મશીન (એસ. વી. એમ.) ક્લાસિફાયર્સ દ્વારા એન. સી. આર. એન. એ. માટે સમૃદ્ધ જીનોમિક પ્રદેશોને ઓળખવા માટે પ્રજનનક્ષમ તકનીકો પ્રદાન કરે છે. તેનો ઉપયોગ ન્યુક્લીક એસિડ અને પ્રોટીન મોટિફ્સ શોધવા માટે થઈ શકે છે, જેમાં રિબોસ્વિચ જેવા તત્વો, અપસ્ટ્રીમ ઓપન રીડિંગ ફ્રેમ્સ (યુઓઆરએફ), શોર્ટ ઓપન રીડિંગ ફ્રેમ્સ (એસઓઆરએફ), રિબોસોમલ પ્રોટીન લીડર સિક્વન્સ, સ્વાર્થી આનુવંશિક તત્વો અને અજ્ઞાત કાર્યના અન્ય સંરચિત આરએનએ મોટિફ્સનો સમાવેશ થાય છે. ડી. આઈ. એમ. પી. એલ. વિવિધ અનુક્રમ વિશ્લેષણ સંસાધનોનો ઉપયોગ કરે છે, જેમાંઃ જાણીતા આર. એન. એ. પરિવારોના સંદર્ભ તરીકે આર. એફ. એ. એમ. ડેટાબેઝ, બી. એલ. એ. એસ. ટી. એક્સ. શોધ સાધન, બિનઅનુભવી પ્રોટીન કોડિંગ ક્ષેત્રોના ઇન્ફરનલ પેકેજને દૂર કરવા માટે, આઇ. જી. એસ. સિક્વન્સ સીએમફાઇન્ડરને શોધવા માટે, સંભવિત આર. એન. એ. ગૌણ માળખા સુવિધાઓ આર-સ્કેપ સોફ્ટવેર અને આર2આર ડ્રોઈંગ અલ્ગોરિધમ શોધવા માટે, સર્વસંમતિ મોડેલ આર. એન. એ. કોડ પેદા કરવા માટે, કોડિંગ ક્ષેત્રોની હાજરી જોવા માટે જીનોમવ્યૂ, ડી. આઈ. એમ. પી. એલ. નો ઉપયોગ કરીને શોધાયેલ આર. એન. એ. મોટિફના આનુવંશિક સંદર્ભની કલ્પના કરવા માટે એચ. એમ. પી.-પી. રિબોસ્વિચ, આઇ. સી. ડી.-II એન. સી. આર. એન. એ. મોટિફ, કાર એ. એન. સી. આર. એન. એ. મોટિફ, એલ. ડી. એચ. 2 એન. સી. આર. એન. એ. મોટિફનો સમાવેશ થાય છે. સંદર્ભો બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ કોમ્પ્યુટેશનલ બાયોલોજી