Nidoviral papain-like protease
નિડોવાયરલ પેપેઇન જેવા પ્રોટીઝ (પીએલપ્રો અથવા પીએલપી) એ નિડોવાયરસના જીનોમમાં એન્કોડ કરેલ પેપેઇન જેવા પ્રોટીઝ પ્રોટીન ડોમેન છે. તે ORF1a જનીનમાંથી મોટા પોલીપ્રોટીનના ભાગ રૂપે વ્યક્ત થાય છે અને તેમાં સિસ્ટીન પ્રોટીઝ એન્ઝાઇમેટિક પ્રવૃત્તિ છે જે પોલીપ્રોટીનની અંદર કેટલાક N-ટર્મિનલ વાયરલ નોનસ્ટ્રક્ચરલ પ્રોટીનના પ્રોટીઓલિટિક ક્લેવેજ માટે જવાબદાર છે. ORF1a દ્વારા એન્કોડ કરાયેલ બીજો પ્રોટીઝ, જેને 3C-જેવા પ્રોટીઝ અથવા મુખ્ય પ્રોટીઝ કહેવાય છે, તે મોટા ભાગના વધુ ક્લેવેજ માટે જવાબદાર છે. કોરોનાવાયરસમાં એક કે બે પેપેઇન જેવા પ્રોટીઝ ડોમેન હોય છે; SARS-CoV અને SARS-CoV-2 માં, એક PLPro ડોમેન કોરોનાવાયરસ નોનસ્ટ્રક્ચરલ પ્રોટીન 3 (nsp3) માં સ્થિત છે. આર્ટરીવાયરસમાં બેથી ત્રણ પી. એલ. પી. ડોમેન્સ હોય છે. તેમની પ્રોટીઝ પ્રવૃત્તિ ઉપરાંત, પીએલપી ડોમેન્સ ડ્યુબીક્વિટેટીંગ ઉત્સેચકો (ડીયુબી) તરીકે કાર્ય કરે છે જે યુબીક્વિટિન સાંકળોમાં જોવા મળતા આઇસોપેપ્ટાઇડ બોન્ડને તોડી શકે છે. તેઓ "ડીઆઇએસજીઇલેટિંગ" ઉત્સેચકો પણ છે જે સેલ્યુલર પ્રોટીનમાંથી યુબીક્વિટિન જેવા ડોમેન ઇન્ટરફેરોન-સ્ટિમ્યુલેટેડ જનીન 15 (આઇએસજી 15) ને દૂર કરે છે. આ પ્રવૃત્તિઓ સંભવતઃ યજમાનની જન્મજાત રોગપ્રતિકારક શક્તિની પ્રવૃત્તિનો વિરોધ કરવા માટે જવાબદાર છે. કારણ કે તેઓ વાયરલ પ્રતિકૃતિ માટે આવશ્યક છે, પેપેઇન જેવા પ્રોટીઝ ડોમેન્સને MERS-CoV, SARS-CoV અને SARS-CoV-2 જેવા માનવ પેથોજેન્સ સામે એન્ટિવાયરલ દવાઓના વિકાસ માટે ડ્રગ લક્ષ્ય માનવામાં આવે છે. વર્ગીકરણ અને નામકરણ એમ. ઇ. આર. ઓ. પી. એસ. પ્રોટીઝ વર્ગીકરણ પ્રણાલી અનુસાર, નિડોવાયરલ પેપેઇન જેવા પ્રોટીઝ એ પેપેઇન જેવા પ્રોટીઝ કુળ સી. એ. ના સભ્યો છે, જેમની રચનાઓ અને ઉત્પ્રેરક પદ્ધતિઓ પેપેઇન જેવી જ છે. આ જૂથમાં ઘણા વાયરલ પોલીપ્રોટીન-પ્રોસેસિંગ પ્રોટીઝ છે. આ જૂથમાં પ્રોટીઝ જીવનના તમામ ક્ષેત્રોમાં જોવા મળે છે. કોરોનાવાયરસમાં, સિંગલ પેપેઇન જેવા પ્રોટીઝ ડોમેન્સને સામાન્ય રીતે PLPro તરીકે ઓળખવામાં આવે છે, ઉદાહરણ તરીકે SARS-CoV અને SARS-CoV-2 માં. જ્યારે જિનોમમાં આવા બે ડોમેન્સને એન્કોડ કરવામાં આવે છે, ત્યારે તેઓ PLP1 અને PLP2 અથવા PLPro1 અને PLPro2 તરીકે ઓળખાય છે, જ્યાં સિંગલ-ડોમેન વાયરસનો PLPro વધુ PLP2 જેવો જ હોય છે. ધમની વાયરસમાં, ત્રણ પી. એલ. પી. ક્ષેત્રો પી. એલ. પી. 1α, પી. એલ. પી. 1β અને પી. એલ. પી. 2 તરીકે ઓળખાય છે. ફંક્શન પીએલપ્રો એ એક બહુવિધ કાર્યાત્મક એન્ઝાઇમ છે જે વાયરલ જીવન ચક્રમાં બહુવિધ ભૂમિકાઓ ધરાવે છે, જેમાં પ્રોટીઝ, ડ્યુબિક્વિટિનેઝ અને ડીઆઈએસજીઇલેટિંગ પ્રવૃત્તિઓનો સમાવેશ થાય છે. કોરોનાવાયરસમાં, તે મોટા, મલ્ટી-ડોમેન નોનસ્ટ્રક્ચરલ પ્રોટીન 3 (એન. એસ. પી. 3) પ્રોટીનની અંદર પ્રોટીન ડોમેન તરીકે જોવા મળે છે. વાયરલ પ્રતિકૃતિ માટે પીએલપ્રો પ્રવૃત્તિ આવશ્યક છે. યજમાનની જન્મજાત રોગપ્રતિકારક શક્તિના પ્રતિભાવને પ્રભાવિત કરવા માટેની પદ્ધતિ તરીકે ડ્યૂબિક્વિટિનેશન અને ડીઆઈએસજીલેશન માટે વાયરલ પ્રોટીએઝનું ઉત્ક્રાંતિ વિષયક પુનઃઉત્પાદન સંખ્યાબંધ વાયરલ પરિવારો માટે જાણીતું છે. પ્રોટીઓલિટિક પ્રક્રિયા નિડોવાયરલ પીએલપ્રો ડોમેન્સને ઓઆરએફ1એબી જનીન દ્વારા એન્કોડેડ મોટા પોલીપ્રોટીનના ભાગ રૂપે વ્યક્ત કરવામાં આવે છે. તેઓ પરિપક્વ વાયરલ નોનસ્ટ્રક્ચરલ પ્રોટીન (એન. એસ. પી. એસ.) પેદા કરવા માટે પોલીપ્રોટીનની પ્રોટીઓલિટિક પ્રક્રિયા માટે જવાબદાર છે, જેમાંથી ઘણા પ્રતિકૃતિ-ટ્રાન્સક્રિપ્ટેસ સંકુલના ઘટકો છે. કોરોનાવાયરસમાં, પીએલપ્રો ડોમેન્સ એન-ટર્મિનલ એનએસપીએસ1-4 ના ક્લેવેજને અમલમાં મૂકે છે, જ્યારે 3સી જેવા પ્રોટીઝ (મુખ્ય પ્રોટીઝ) બાકીના પ્રોટીન એનએસપી 5-16 ને વિભાજિત કરે છે. ઇમ્યુન મોડ્યુલેશન ડ્યુબિક્વિટિનેશન SARS-CoV PLPro માટે ડ્યુબિક્વિટિનેઝ (DUB) પ્રવૃત્તિની આગાહી યુબિક્વિટિન-વિશિષ્ટ પ્રોટીઝ 18 સાથે માળખાકીય સરખામણી દ્વારા કરવામાં આવી હતી, જે માનવ જિનોમમાં એન્કોડેડ સિસ્ટીન પ્રોટીઝ DUB ના જૂથમાંથી એક છે. આ આગાહીની પુષ્ટિ પાછળથી સાર્સ-કોવ-2 સહિત સંખ્યાબંધ કોરોનાવાયરસ અને આર્ટરીવાયરસ પીએલપી ડોમેન્સ માટેના ઈન વિટ્રો પ્રયોગો દ્વારા કરવામાં આવી હતી. ડીઆઇએસજીલેશન આઇએસજી15 એ એક નાનું યુબીક્વિટિન જેવું પ્રોટીન છે જે યુબીક્વિટિન જેવી જ રીતે અનુવાદ પછીના ફેરફાર તરીકે અન્ય પ્રોટીન સાથે જોડાઈ શકે છે. ડીયુબીક્વિટિનેટિંગ પ્રવૃત્તિ ઉપરાંત, કોરોનાવાયરસ અને આર્ટરીવાયરસ પીએલપી ડોમેન્સને ડીઆઈએસજીઇલેઝ ઉત્સેચકો તરીકે ઓળખવામાં આવ્યા છે, જે સેલ્યુલર પ્રોટીનમાંથી આઇએસજી 15 ને દૂર કરવામાં સક્ષમ છે. SARS-CoV-2 PLPro ના ઈન વિટ્રો અભ્યાસો સૂચવે છે કે યુબીક્વિટિન કરતાં ISG માટે વધુ આકર્ષણ છે. સંદર્ભો વાયરલ પ્રોટીનને સુરક્ષિત કરે છે