ORF10
ORF10 એ SARS-CoV-2 કોરોનાવાયરસના જિનોમમાં જોવા મળતી ખુલ્લી વાંચન ફ્રેમ (ORF) છે. તે 38 કોડોન લાંબુ છે. તે તમામ સારબેકોવાયરસ (SARS-CoV સહિત) માં સંરક્ષિત નથી. કોવિડ-19 રોગચાળા દ્વારા પ્રેરિત અભ્યાસોમાં, ORF10 એ SARS-CoV અને SARS-CoV-2 વચ્ચે સંરક્ષિત ન હોય તેવા બે વાયરલ સહાયક પ્રોટીન જનીનોમાંથી એક તરીકે સંશોધન રસ આકર્ષિત કર્યો હતો અને શરૂઆતમાં સકારાત્મક પસંદગી હેઠળ પ્રોટીન-કોડિંગ જનીન તરીકે વર્ણવવામાં આવ્યું હતું. જો કે, જો કે તે કેટલીકવાર SARS-CoV-2 સહાયક જનીનોની યાદીમાં સામેલ કરવામાં આવે છે, પ્રાયોગિક અને બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ પુરાવા સૂચવે છે કે ORF10 સંભવતઃ કાર્યાત્મક પ્રોટીન-કોડિંગ જનીન નથી. ગુણધર્મો ORF10 એ N જનીનની નીચેની બાજુએ સ્થિત છે, જે કોરોનાવાયરસ ન્યુક્લિયોકેપ્સિડ પ્રોટીનને એન્કોડ કરે છે. તે જીનોમના 3 'અંત સુધી સૌથી દૂરની એનોટેટેડ ઓપન રીડિંગ ફ્રેમ છે. તે 38-એમિનો એસિડ કાલ્પનિક પ્રોટીનને એન્કોડ કરે છે. અભિવ્યક્તિ અને કાર્ય તે અસંભવિત છે કે ORF10 કુદરતી પરિસ્થિતિઓમાં અનુવાદિત થાય છે, કારણ કે ORF10 પ્રદેશ ધરાવતો સબજેનોમિક RNA શોધી શકાયો નથી, જો કે ત્યાં કેટલાક રાઇબોસોમ ફૂટપ્રિન્ટિંગ સિગ્નલ છે. જ્યારે પ્રાયોગિક રીતે વધુ પડતું વ્યક્ત કરવામાં આવે છે, ત્યારે ORF10 પ્રોટીન ZYG11B અને તેના કલિન-રિંગ લિગેઝ પ્રોટીન સંકુલ સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરે છે. જો કે, વાયરલ જીવન ચક્રના ઈન વિટ્રો અભ્યાસોમાં આ ક્રિયાપ્રતિક્રિયા વિતરણક્ષમ હોવાનું દર્શાવવામાં આવ્યું છે. SARS-CoV-2 જીનોમના કેટલાક અભ્યાસોએ ORF10 ને કાર્યાત્મક અને સકારાત્મક પસંદગી હેઠળ હોવાનું વર્ણવ્યું છે. જો કે, SARS-CoV-2 પ્રકારો અને ઘણા સરબેકોવાયરસ ક્રમમાં અકાળ સ્ટોપ કોડોન્સની ઓળખ કરવામાં આવી છે, જે સૂચવે છે કે અનુમાનિત પ્રોટીન ઉત્પાદન વાયરલ પ્રતિકૃતિ માટે જરૂરી નથી. ઓ. આર. એફ. 10નું નુકસાન પણ ઈન વિટ્રોમાં પ્રાયોગિક પરિસ્થિતિઓ હેઠળ પ્રતિકૃતિ પર કોઈ અસર દર્શાવતું નથી. બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ વિશ્લેષણ દ્વારા એવું સૂચન કરવામાં આવ્યું છે કે SARS-CoV-2 ORF10 માં સ્પષ્ટ અનુક્રમ સંરક્ષણ પ્રોટીન-કોડિંગ કાર્યને કારણે ન પણ હોઈ શકે, પરંતુ તેના બદલે આ પ્રદેશમાં સંરક્ષિત RNA ગૌણ માળખાને કારણે હોઈ શકે છે. સંરક્ષિત પ્રદેશ, જે ORF10 થી આગળ વિસ્તરે છે, તે કોરોનાવાયરસ 3 'UTR સ્યુડોકનોટ પ્રદેશ સાથે ઓવરલેપ થાય છે, જે જીનોમ પ્રતિકૃતિમાં સામેલ હોવાનું જાણીતું ગૌણ માળખું છે. સંદર્ભો કોરોનાવાયરસ પ્રોટીન