Very short patch repair
વેરી શોર્ટ પેચ (વી. એસ. પી.) રિપેર એ ડી. એન. એ. રિપેર સિસ્ટમ છે જે 5-મિથાઈલસાયટોસિનના થાઇમિનમાં વિસર્જન દ્વારા સર્જાયેલી જી. ટી. વિસંગતતાઓને દૂર કરે છે. આ પ્રણાલી અસ્તિત્વમાં છે કારણ કે ગ્લાયકોસિલેસ જે સામાન્ય રીતે ડીએમિનેટેડ પાયાને લક્ષ્ય બનાવે છે તે થાઇમિનને લક્ષ્ય બનાવી શકતી નથી (તે ડીએનએમાં નિયમિત ચાર પાયામાંથી એક છે). સિસ્ટમના ઘટકો મ્યુટ્સ છે, જે જી. ટી. મેળ ખાતો નથી, વી. એસ. આર. એન્ડોન્યુક્લીઝ, જે ડીએનએને કાપી નાખે છે, અને મ્યુટીએલ, જે યુ. વી. આર. ડી. હેલિકેઝની ભરતી કરે છે. વીએસઆર (ખૂબ ટૂંકા પેચ રિપેર) એન્ડોન્યુક્લીઝીસ વિવિધ પ્રકારના બેક્ટેરિયામાં જોવા મળે છે. જો આધાર જોડીમાં પરિવર્તન થાય અથવા નુકસાન થાય તો તેઓ કાપીને અથવા તેના બદલે ડીએનએમાં નિક બનાવીને કામ કરે છે. ડીએનએની આધાર જોડીમાં કાર્ય પરિવર્તન સજીવ માટે હાનિકારક હોઈ શકે છે. ખાસ કરીને, સી થી ટી પરિવર્તન ઘણી વાર સાયટોસિનના મિથાઇલેશનને કારણે થાય છે. તેથી, વી. એસ. આર. એન્ડોન્યુક્લીઝેસ કોષને પરિવર્તનશીલ ડી. એન. એ. દ્વારા થતા નુકસાનથી બચાવવાનું કાર્ય કરે છે. મિકેનિઝમ વી. એસ. આર. ટી. જી. મેળ ખાતી બેઝ જોડીને ઓળખે છે, જે મિથાઇલેટેડ સાયટોસિન્સના સ્વયંસ્ફુરિત ડીએમિનેશન પછી ઉત્પન્ન થાય છે, અને તે થાઇમીનની 5 'બાજુએ ફોસ્ફેટની કરોડરજ્જુને વિભાજીત કરીને એક જ સ્ટ્રાન્ડ પર નિક બનાવે છે. પછી ડીએનએ પોલિમરેઝ I 3 'સ્ટ્રાન્ડ પરના ટી અને કેટલાક ન્યુક્લિયોટાઇડ્સને દૂર કરે છે અને પછી પેચનું પુનઃસંશ્લેષણ કરે છે. વધુમાં, જો સમારકામ ન કરવામાં આવે તો જી. ટી. વિસંગતતાઓ સી-ટુ-ટી સંક્રમણ પરિવર્તન તરફ દોરી શકે છે. વીએસઆર જી-ધરાવતા સ્ટ્રાન્ડની તરફેણમાં વિસંગતતાઓને સુધારે છે. એસ્ચેરીચીયા કોલીમાં, આ એન્ડોન્યુક્લીઝ થાઇમિડીન અવશેષની બાજુમાં સીટી (એટી) જીએન અથવા એનટી (એટી) જીજી અનુક્રમમાં ડબલ-સ્ટ્રેન્ડેડ ડીએનએને નિષ્ક્રિય કરે છે, જે 2 '-ડિઓક્સીગુનોસિન સાથે મેળ ખાતો નથી. આ ચીરો મેળ ખાતો નથી અને દોર વિશિષ્ટ છે. માળખું વીએસઆરનું માળખું પ્રતિબંધ એન્ડોન્યુક્લીઝની મુખ્ય રચના જેવું જ છે, જેમાં 3-સ્તરની આલ્ફા/બીટા/આલ્ફા ટોપોલોજી હોય છે. વીએસઆરમાં ત્રણ સુગંધિત અવશેષો (ફે67, ટીઆરપી68 અને ટીઆરપી86) હોય છે, જે મુખ્ય ખાંચમાં એકબીજા સાથે જોડાય છે, ડીએનએને વળે છે અને બે સેરને અલગ કરે છે. એન-ટર્મિનલ ડોમેન પ્રોટીન અને ક્લીવ્ડ પ્રોડક્ટ વચ્ચેની ક્રિયાપ્રતિક્રિયાને સ્થિર કરે છે, જેથી ડીએનએ પોલીમરેઝ I ના આગમન સુધી ડીએનએ લિગેઝથી નિકનું રક્ષણ કરે છે.