Domain of unknown function
ડોમેન ઓફ અનનોન ફંક્શન (DUF) એ પ્રોટીન ડોમેન છે જેનું કોઈ લાક્ષણિક કાર્ય નથી. આ પરિવારોને પી. એફ. એ. એમ. ડેટાબેઝમાં ઉપસર્ગ ડી. યુ. એફ. નો ઉપયોગ કરીને એકત્રિત કરવામાં આવ્યા છે, જે પછી એક સંખ્યા છે, ઉદાહરણ તરીકે ડી. યુ. એફ. 2992 અને ડી. યુ. એફ. 1220 છે. 2019 સુધીમાં, પી. એફ. એ. એમ. ડેટાબેઝમાં લગભગ 4,000 ડીયુ. એફ. પરિવારો છે, જે 22 ટકાથી વધુ જાણીતા પરિવારોનું પ્રતિનિધિત્વ કરે છે. કેટલાક ડીયુએફને લોકપ્રિય ઉપયોગને કારણે નામકરણનો ઉપયોગ કરીને નામ આપવામાં આવ્યું નથી પરંતુ તેમ છતાં તે ડીયુએફ છે. ડીયુએફ હોદ્દો કામચલાઉ છે, અને આવા પરિવારોને કાર્યની ઓળખ થયા પછી વધુ ચોક્કસ નામ (અથવા હાલના ડોમેનમાં મર્જ) કરવામાં આવે છે. DUF નામકરણ યોજના ક્રિસ પોન્ટિંગ દ્વારા સ્માર્ટ ડેટાબેઝમાં DUF1 અને DUF2 ના ઉમેરા દ્વારા રજૂ કરવામાં આવી હતી. આ બે ક્ષેત્રો બેક્ટેરિયલ સિગ્નલિંગ પ્રોટીનમાં વ્યાપકપણે વહેંચાયેલા હોવાનું જાણવા મળ્યું હતું. ત્યારબાદ, આ ડોમેન્સના કાર્યોને ઓળખવામાં આવ્યા હતા અને ત્યારબાદ તેનું નામ બદલીને અનુક્રમે GGDEF ડોમેન અને EAL ડોમેન કરવામાં આવ્યું છે. લાક્ષણિકતા માળખાકીય જીનોમિક્સ કાર્યક્રમોએ માળખા નિર્ધારણ દ્વારા ડીયુએફના કાર્યને સમજવાનો પ્રયાસ કર્યો છે. 250થી વધુ ડીયુએફ પરિવારોના માળખાઓનું સમાધાન કરવામાં આવ્યું છે. આ (2009) અભ્યાસ દર્શાવે છે કે લગભગ બે તૃતિયાંશ ડીયુએફ પરિવારોનું માળખું અગાઉ ઉકેલાયેલા પરિવાર જેવું જ હતું અને તેથી તે હાલના પ્રોટીન સુપરફેમિલીના અલગ અલગ સભ્યો હોવાની શક્યતા છે, જ્યારે લગભગ એક તૃતિયાંશમાં નવીન પ્રોટીન ફોલ્ડ હોય છે. કેટલાક ડીયુએફ પરિવારો એવા ડોમેન્સ સાથે દૂરસ્થ અનુક્રમ સમરૂપતા વહેંચે છે જે લાક્ષણિક કાર્ય ધરાવે છે. આ સંબંધોને જોડવા માટે કોમ્પ્યુટેશનલ કાર્યનો ઉપયોગ કરી શકાય છે. 2015નું એક કાર્ય લાક્ષણિક માળખાકીય સુપરફેમિલીઓને 20 ટકા ડીયુએફ સોંપવામાં સક્ષમ હતું. પ્ફામ સતત "કુળ" સુપરફેમિલી એન્ટ્રીઓમાં (જાતે-ચકાસાયેલ) સોંપણી પણ કરે છે. આવર્તન અને સંરક્ષણ 2013 માં તમામ પ્રોટીન ડોમેન્સમાંથી 20 ટકાથી વધુને ડીયુએફ તરીકે વ્યાખ્યાયિત કરવામાં આવ્યા હતા. યુકેરીયોટ્સમાં માત્ર 1,500 થી વધુની સરખામણીમાં બેક્ટેરિયામાં આશરે 2,700 ડીયુએફ જોવા મળે છે. 800 થી વધુ ડીયુએફ બેક્ટેરિયા અને યુકેરીયોટ્સ વચ્ચે વહેંચાયેલા છે, અને તેમાંથી લગભગ 300 આર્કિયામાં પણ હાજર છે. કુલ 2,786 બેક્ટેરિયલ પી. એફ. એ. એમ. ક્ષેત્રો પ્રાણીઓમાં પણ જોવા મળે છે, જેમાં 320 ડીયુએફનો સમાવેશ થાય છે. જીવવિજ્ઞાનમાં ભૂમિકા ઘણા ડીયુએફ ખૂબ જ સંરક્ષિત છે, જે જીવવિજ્ઞાનમાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા દર્શાવે છે. જો કે, આવા ઘણા ડીયુએફ આવશ્યક નથી, તેથી તેમની જૈવિક ભૂમિકા ઘણીવાર અજ્ઞાત રહે છે. દાખલા તરીકે, મોટાભાગના બેક્ટેરિયા અને યુકેરીયોટિક જીનોમમાં DUF143 હાજર હોય છે. જો કે, જ્યારે તેને એસ્ચેરીચીયા કોલીમાં કાઢી નાખવામાં આવ્યું ત્યારે કોઈ સ્પષ્ટ ફીનોટાઇપ મળી આવ્યો ન હતો. પાછળથી એવું દર્શાવવામાં આવ્યું હતું કે જે પ્રોટીનમાં DUF143 હોય છે, તે રિબોસોમલ મૌન પરિબળો છે જે બે રિબોસોમલ પેટા એકમોની એસેમ્બલીને અવરોધે છે. જ્યારે આ કાર્ય આવશ્યક નથી, તે પ્રોટીન જૈવસંશ્લેષણને બંધ કરીને કોષોને ઓછી પોષક પરિસ્થિતિઓમાં અનુકૂલન કરવામાં મદદ કરે છે. પરિણામે, આ પ્રોટીન અને DUF ત્યારે જ સુસંગત બને છે જ્યારે કોષો ભૂખ્યા રહે છે. આમ એવું માનવામાં આવે છે કે ઘણા ડીયુએફ (અથવા અજ્ઞાત કાર્યના પ્રોટીન, પીયુએફ) માત્ર ચોક્કસ શરતો હેઠળ જરૂરી છે. આવશ્યક DUFs ગુડએકર એટ અલ. 355 આવશ્યક પ્રોટીન (16 મોડેલ બેક્ટેરિયલ પ્રજાતિઓમાં) માં 238 ડીયુએફની ઓળખ કરવામાં આવી છે, જેમાંથી મોટાભાગના સિંગલ-ડોમેન પ્રોટીનનું પ્રતિનિધિત્વ કરે છે, જે સ્પષ્ટપણે ડીયુએફની જૈવિક આવશ્યકતાને સ્થાપિત કરે છે. આ DUF ને "આવશ્યક DUF" અથવા eDUF કહેવામાં આવે છે. બાહ્ય કડીઓ D અક્ષરથી શરૂ થતા પ્ફામ પરિવારોની યાદી, જેમાં DUF પરિવારોના સંદર્ભો પ્રોટીન ક્ષેત્રોનો સમાવેશ થાય છે