CBS domain
મોલેક્યુલર બાયોલોજીમાં, સીબીએસ ડોમેન એ પ્રોટીન ડોમેન છે જે બેક્ટેરિયાથી લઈને મનુષ્યો સુધીની તમામ પ્રજાતિઓમાં પ્રોટીનની શ્રેણીમાં જોવા મળે છે. તેને સૌપ્રથમ 1997માં સંરક્ષિત અનુક્રમ ક્ષેત્ર તરીકે ઓળખવામાં આવ્યું હતું અને તેનું નામ સિસ્ટેથિઓનાઇન બીટા સિન્થેઝ પરથી રાખવામાં આવ્યું હતું, જે તેમાં જોવા મળતા પ્રોટીનમાંથી એક છે. સીબીએસ ડોમેન્સ વિવિધ પ્રકારના અન્ય પ્રોટીનમાં પણ જોવા મળે છે જેમ કે ઇનોસિન મોનોફોસ્ફેટ ડિહાઇડ્રોજિનેઝ, વોલ્ટેજ ગેટેડ ક્લોરાઇડ ચેનલો અને એએમપી-એક્ટિવેટેડ પ્રોટીન કિનેઝ (એએમપીકે). સીબીએસ ડોમેન્સ એએમપી અને એટીપી, અથવા એસ-એડેનોસિલમેથિઓનાઇન જેવા એડેનોસિલ જૂથો સાથે બંધનકર્તા અણુઓના જવાબમાં સંકળાયેલ એન્ઝાઇમેટિક અને ટ્રાન્સપોર્ટર ડોમેન્સની પ્રવૃત્તિને નિયંત્રિત કરે છે. માળખું સીબીએસ ડોમેન બીટા-આલ્ફા-બીટા-બીટા-આલ્ફા સેકન્ડરી સ્ટ્રક્ચર પેટર્નથી બનેલું છે જે ગોળાકાર તૃતીય માળખામાં ફોલ્ડ કરવામાં આવે છે જેમાં એક બાજુ બે α-હેલિસીસ સાથે ત્રણ-ફસાયેલા એન્ટિપેરેલલ β-શીટ હોય છે. સીબીએસ ડોમેન્સ હંમેશા પ્રોટીન ક્રમમાં જોડીમાં જોવા મળે છે અને આ ડોમેન્સની દરેક જોડી તેમના β-શીટ્સ દ્વારા કહેવાતા સીબીએસ-જોડી અથવા બેટમેન ડોમેન બનાવીને સ્યુડો ડાયમેરિક વ્યવસ્થામાં ચુસ્તપણે જોડાય છે. આ સીબીએસ ડોમેન જોડીઓ હેડ-ટુ-હેડમાં જોડાઈ શકે છે (એટલે કે. પી. ડી. બી. કોડ્સ,) અથવા હેડ-ટુ-ટેલ (એટલે કે. પી. ડી. બી. કોડ્સ,) ડિસ્ક જેવી સઘન રચના બનાવે છે. આમ કરવાથી, તેઓ ફાટ બનાવે છે જે કેનોનિકલ લિગાન્ડ બંધનકર્તા પ્રદેશોની રચના કરે છે. સૈદ્ધાંતિક રીતે, કેનોનિકલ બંધનકર્તા સ્થળોની સંખ્યા અણુમાં સીબીએસ ડોમેન્સની સંખ્યા સાથે મેળ ખાય છે અને પરંપરાગત રીતે સીબીએસ ડોમેન અનુસાર ક્રમાંકિત કરવામાં આવે છે જેમાં દરેક સંરક્ષિત એસ્પાર્ટેટ અવશેષો હોય છે જે સંભવિત રીતે ન્યુક્લિયોટાઇડ્સના રાઇબોઝ સાથે ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરે છે. જો કે, આ તમામ પોલાણ આવશ્યકપણે ન્યુક્લિયોટાઇડ્સને બાંધી શકતા નથી અથવા કાર્યાત્મક હોઈ શકતા નથી. તાજેતરમાં, એએમપી માટે બિન-પ્રમાણભૂત સ્થળનું વર્ણન એમ. જાન્નાસ્ચીના પ્રોટીન એમજે1225માં પણ કરવામાં આવ્યું છે, જોકે તેની કાર્યાત્મક ભૂમિકા હજુ પણ અજ્ઞાત છે. એવું દર્શાવવામાં આવ્યું છે કે સીબીએસ ડોમેન્સ એએમપી અને એટીપી, અથવા એસ-એડેનોસિલમેથિઓનાઇન જેવા અણુઓમાં એડેનોસિલ જૂથો સાથે જોડાય છે, પરંતુ તેઓ Mg2 + જેવા ધાતુના આયનોને પણ બાંધી શકે છે. આ વિવિધ લિગાન્ડ્સને બાંધવા પર સીબીએસ ડોમેન્સ સંકળાયેલ એન્ઝાઇમેટિક ડોમેન્સની પ્રવૃત્તિને નિયંત્રિત કરે છે. આ નિયમન અંતર્ગત મોલેક્યુલર મિકેનિઝમ્સ હમણાં જ સ્પષ્ટ થવા લાગી છે. આ ક્ષણે, બે અલગ અલગ પ્રકારની પદ્ધતિઓ પ્રસ્તાવિત કરવામાં આવી છે. પ્રથમ દાવો કરે છે કે લિગાન્ડનો ન્યુક્લિયોટાઇડ ભાગ આવશ્યકપણે પ્રોટીન માળખામાં કોઈ ફેરફારને પ્રેરિત કરતો નથી, બંધનકર્તા સ્થળ પર ઇલેક્ટ્રોસ્ટેટિક પોટેન્શિયલ એ એડેનોસિન ન્યુક્લિયોટાઇડ બંધનનો સૌથી નોંધપાત્ર ગુણધર્મ છે. આ "સ્થિર" પ્રતિભાવ એવી પ્રક્રિયાઓમાં સામેલ હશે જેમાં ઊર્જા ચાર્જ દ્વારા નિયમન ફાયદાકારક રહેશે. તેનાથી વિપરીત, બીજા પ્રકારની પદ્ધતિ ("ગતિશીલ" તરીકે સૂચવવામાં આવે છે) માં લિગાન્ડ બંધન પર પ્રોટીન માળખામાં નાટ્યાત્મક રચનાત્મક ફેરફારોનો સમાવેશ થાય છે અને થર્મસ થર્મોફિલસમાંથી Mg2 + ટ્રાન્સપોર્ટર MgtE ના સાયટોસોલિક ડોમેન, M. જાન્નાશીમાંથી અજ્ઞાત કાર્ય પ્રોટીન MJ0100 અને ક્લોસ્ટ્રિડિયમ પરફ્રિન્જન્સ પાયરોફોસ્ફેટેઝના નિયમનકારી ક્ષેત્ર માટે જાણ કરવામાં આવી છે. એસોસિએટેડ ડોમેન્સ સીબીએસ ડોમેન્સ ઘણીવાર પ્રોટીનમાં જોવા મળે છે જેમાં અન્ય ડોમેન્સ હોય છે. આ ડોમેન્સ સામાન્ય રીતે ઉત્સેચકીય, પટલ પરિવહન અથવા ડીએનએ-બંધનકર્તા ડોમેન્સ હોય છે. જો કે, પ્રોટીન કે જે ફક્ત સીબીએસ ડોમેન્સ ધરાવે છે તે પણ ઘણીવાર જોવા મળે છે, ખાસ કરીને પ્રોકેરીયોટ્સમાં. આ એકલ સીબીએસ ડોમેન પ્રોટીન અન્ય પ્રોટીન જેમ કે કાઇનેઝ સાથે બંધન પર સંકુલ બનાવી શકે છે જેની સાથે તેઓ ક્રિયાપ્રતિક્રિયા કરે છે અને નિયમન કરે છે. કેટલાક માનવ સીબીએસ ડોમેન ધરાવતા પ્રોટીનમાં રોગ પરિવર્તન તરફ દોરી જતા પરિવર્તન આનુવંશિક રોગો તરફ દોરી જાય છે. ઉદાહરણ તરીકે, સિસ્ટેથિઓનાઇન બીટા સિન્થેઝ પ્રોટીનમાં પરિવર્તન હોમોસિસ્ટિનુરિયા () નામના ચયાપચયની વારસાગત વિકૃતિ તરફ દોરી જાય છે. એએમપીકે ઉત્સેચકના ગામા પેટા એકમમાં પરિવર્તન વોલ્ફ-પાર્કિન્સન-વ્હાઇટ સિન્ડ્રોમ () સાથે પારિવારિક હાયપરટ્રોફિક કાર્ડિયોમાયોપથી તરફ દોરી જાય છે. આઇએમપીડીએચ એન્ઝાઇમના સીબીએસ ડોમેન્સમાં પરિવર્તન આંખની સ્થિતિ રેટિનાઇટિસ પિગમેન્ટોસા () તરફ દોરી જાય છે. મનુષ્યોમાં સંખ્યાબંધ વોલ્ટેજ-ગેટેડ ક્લોરાઇડ ચેનલ જનીનો હોય છે, અને તેમાંના કેટલાંક સીબીએસ ડોમેન્સમાં પરિવર્તન આનુવંશિક રોગોના કારણ તરીકે ઓળખવામાં આવ્યા છે. સી. એલ. સી. એન. 1 માં પરિવર્તન માયોટોનીયા () તરફ દોરી જાય છે, સી. એલ. સી. એન. 2 માં પરિવર્તન ઇડિઓપેથિક સામાન્યકૃત વાઈ () તરફ દોરી શકે છે, સી. એલ. સી. એન. 5 માં પરિવર્તન ડેન્ટ્સ રોગ () તરફ દોરી શકે છે, સી. એલ. સી. એન. 7 માં પરિવર્તન ઓસ્ટીયોપેટ્રોસિસ () તરફ દોરી શકે છે અને સી. એલ. સી. એન. કે. બી. માં પરિવર્તન બાર્ટર સિન્ડ્રોમ () તરફ દોરી શકે છે. સંદર્ભો પ્રોટીન ક્ષેત્રો