SDD-AGE
બાયોકેમિસ્ટ્રી અને મોલેક્યુલર બાયોલોજીમાં, એસ. ડી. ડી.-એ. જી. ઈ. અર્ધ-અસંતૃપ્ત ડિટર્જન્ટ એગરોઝ જેલ ઇલેક્ટ્રોફોરેસિસ માટે ટૂંકું છે. મોટાભાગના મોટા પ્રોટીન સંકુલથી વિપરીત, ઓરડાના તાપમાને 2 ટકા એસ. ડી. એસ. માં સ્થિર હોય તેવા મોટા પ્રોટીન પોલિમરને શોધવા અને લાક્ષણિકતા આપવા માટેની આ એક પદ્ધતિ છે. આ પદ્ધતિ પ્રિયોન અને એમીલોઈડ્સના અભ્યાસ માટે ખૂબ જ ઉપયોગી છે, જે પ્રોટીનયુક્ત પોલિમરની રચના દ્વારા વર્ગીકૃત થયેલ છે. અગરોજનો ઉપયોગ જેલ માટે થાય છે કારણ કે એસ. ડી. એસ.-પ્રતિરોધક પોલિમર મોટા હોય છે (200-4000 + kDa શ્રેણીમાં) અને પરંપરાગત પોલિઆક્રિલામાઇડ જેલમાં પ્રવેશી શકતા નથી, જેમાં નાના છિદ્રો હોય છે. બીજી તરફ અગરોજમાં મોટા છિદ્રો હોય છે, જે પોલિમરને અલગ કરવાની મંજૂરી આપે છે. આ પદ્ધતિના ઉપયોગથી સંશોધકોને એ સમજવામાં મદદ મળી કે ઓછામાં ઓછા અમુક પ્રકારના પ્રિઓન એકત્રીકરણ બે-સ્તરના માળખામાં અસ્તિત્વ ધરાવે છે-પોલિમરમાં જૂથબદ્ધ પ્રોટીન પરમાણુઓ, જે ખૂબ જ સ્થિર હોય છે અને ઓરડાના તાપમાને 2 ટકા એસ. ડી. એસ. સાથે સારવારનો સામનો કરે છે, અને એકત્રીકરણ, જે પોલિમરના બંડલ હોય છે, જે આ પરિસ્થિતિઓમાં અલગ પડે છે. પોલિમરના કદમાં તફાવતો વિવોમાં પોલિમર વિભાજનની કાર્યક્ષમતા સૂચવી શકે છે. આ પદ્ધતિ રશિયન કાર્ડિયોલોજી રિસર્ચ ઇન્સ્ટિટ્યૂટની મોલેક્યુલર જિનેટિક્સ લેબોરેટરીમાં બનાવવામાં આવી હતી અને 2003 માં ક્રિન્ડુશ્કિન એટ અલ દ્વારા પ્રકાશિત કરવામાં આવી હતી. મૂળ પદ્ધતિમાં ટી. એ. ઈ. બફરિંગ સિસ્ટમનો ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો હતો અને પ્રોટીનને પટલ (મૂળરૂપે પી. વી. ડી. એફ.) પર સ્થાનાંતરિત કરવા માટે સુધારેલી વેક્યૂમ બ્લોટિંગ સિસ્ટમનો સમાવેશ કરવામાં આવ્યો હતો. સુધારેલ વેક્યૂમ બ્લોટિંગ સિસ્ટમ વાસ્તવમાં વેક્યૂમ-આસિસ્ટેડ કેશિલરી ટ્રાન્સફર છે, કારણ કે વેક્યૂમ ફક્ત તે પ્રવાહીને મદદ કરે છે જે સિસ્ટમ છોડવા માટે જેલ અને પટલમાંથી પસાર થઈ ચૂક્યું હોય. ભિન્નતા અન્ય ફેરફારોનો પણ ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો છે, જેમ કે બાગ્રિઅન્ટસેવ એટ અલમાં વર્ણવેલ, પરંપરાગત વેટ ટ્રાન્સફર અને ટી. જી. બી. બફરિંગ સિસ્ટમનો ઉપયોગ કરીને, અને અન્ય અર્ધ-શુષ્ક ટ્રાન્સફર અથવા કેશિકા ટ્રાન્સફરનો ઉપયોગ કરીને. ડીડી-એજીઇ, પદ્ધતિની વધુ વિવિધતા જે સંપૂર્ણપણે ડિનેચ્યુરિંગ પરિસ્થિતિઓનો ઉપયોગ કરે છે-જેમાં ડિથિઓથ્રેઇટોલ (ડીટીટી) જેવા ઘટતા એજન્ટો અને 95 ડિગ્રી સેલ્સિયસ પર હીટ ડિનેચ્યુરેશનનો સમાવેશ થાય છે-તે પોલિગ્લુટામાઇન પ્રોટીનના હીટ-સ્ટેબલ ઇન્ક્લુઝન બોડીના વિશ્લેષણ માટે યોગ્ય છે. સંદર્ભ પ્રોટીન પદ્ધતિઓ મોલેક્યુલર બાયોલોજી