Glutamine riboswitch
ગ્લુટામાઇન રિબોસ્વિચ (અગાઉ જી. એન. એ. આર. એન. એ. મોટિફ) એ સંરક્ષિત આર. એન. એ. માળખું છે જેની બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ દ્વારા આગાહી કરવામાં આવી હતી. તે સાયનોબેક્ટેરિયાના વિવિધ વંશમાં હાજર છે, તેમજ કેટલાક ફેજીસ કે જે સાયનોબેક્ટેરિયાને ચેપ લગાવે છે. તે સમુદ્રમાં રહેતા બિનઉત્પાદિત બેક્ટેરિયામાંથી કાઢવામાં આવેલા ડીએનએમાં પણ જોવા મળે છે જે સંભવતઃ સાયનોબેક્ટેરિયાની પ્રજાતિઓ છે. જી. એન. એ. આર. એન. એ. નાઇટ્રોજન ચયાપચયમાં સામેલ પ્રોટીનના બહુવિધ વર્ગોને એન્કોડિંગ કરતા જનીનોના અનુમાનિત 5 'અનુવાદિત વિસ્તારોમાં જોવા મળે છે. આ પ્રોટીન વર્ગોમાં સૌથી અગ્રણી એમોનિયમ ટ્રાન્સપોર્ટર, ઉત્સેચકો ગ્લુટામાઇન સિન્થેટેઝ અને ગ્લુટામેટ સિન્થેઝ અને PII પ્રોટીન છે, જે પોતે નાઇટ્રોજન ચયાપચયને નિયંત્રિત કરે છે. નાઇટ્રોજન ચયાપચયના નિયંત્રણમાં સિસ-નિયમનકારી તત્વ તરીકે સંભવિત ભૂમિકાને વધુ ટેકો આપતા, પીએમટી1479 તરીકે રચાયેલ પ્રોક્લોરોકોકસ મેરિનસ જનીન આ જીવતંત્રમાં અન્ય જનીનો કરતાં વધુ દબાવી દેવામાં આવ્યું હતું જ્યારે તે નાઇટ્રોજનના પૂરતા પુરવઠાની વૃદ્ધિ વિના હતું. એવું દર્શાવવામાં આવ્યું હતું કે જી. એલ. એન. એ. આર. એન. એ. ગ્લુટામાઇન-બંધનકર્તા રિબોસ્વિચને અનુરૂપ છે, એટલે કે, તેઓ એકંદર નાઇટ્રોજનની ઉપલબ્ધતાને માપવા માટે ગ્લુટામાઇનની સાંદ્રતાને અનુભવે છે, અને ડાઉનસ્ટ્રીમ જનીનોને યોગ્ય રીતે નિયંત્રિત કરે છે. રાઇબોસ્વિચ કાર્યની મૂળ દરખાસ્ત ઉપરોક્ત પુરાવા પર આધારિત હતી કે જી. એલ. એન. એ. આર. એન. એ. સિસ-રેગ્યુલેટરી છે, તેમજ જી. એલ. એન. એ. આર. એન. એ. મોટિફના ત્રણ-સ્ટેમ જંક્શનમાં મધ્યમ માળખાકીય જટિલતા જે અન્ય જાણીતા રાઇબોસ્વિચની રચનાઓ સાથે તુલનાત્મક છે. કેટલાક જી. એન. એ. આર. એન. એ. અન્ય જી. એન. એ. આર. એન. એ. ની બાજુમાં સ્થિત છે. આ "ટેન્ડમ વ્યવસ્થા" ગ્લાયસીન રિબોસ્વિચ અને ટી. પી. પી. રિબોસ્વિચ દ્વારા પણ પ્રદર્શિત થાય છે જ્યાં તેઓ રિબોસ્વિચ લિગાન્ડની સાંદ્રતાના નાના ફેરફારની અંદર કોષને જનીનોને બંધ અથવા ચાલુ કરવાની મંજૂરી આપે છે. બીજા શબ્દોમાં કહીએ તો, રિબોસ્વિચનો પ્રતિસાદ વળાંક ડિજિટલ કાર્ય સાથે વધુ સારી રીતે મેળ ખાય છે. જો કે, આવા સહકારી બંધનનું પાલન કરવામાં આવ્યું ન હતું. પ્રથમ ઇન વિવો પુરાવા દર્શાવે છે કે આર. એન. એ. ગ્લુટામાઇન રિબોસ્વિચ તરીકે કાર્ય કરે છે કે આ રિબોસ્વિચ સિનેકોસિસ્ટિસ એસપીમાં ગ્લુટામાઇન સિન્થેટેઝ અવરોધક પ્રોટીન આઇએફ 17ની અભિવ્યક્તિને નિયંત્રિત કરે છે. પીસીસી 6803 આમ સાયનોબેક્ટેરિયામાં જીએસ પ્રવૃત્તિ માટે મુખ્ય નિયંત્રણ તત્વનું પ્રતિનિધિત્વ કરે છે. જી. એલ. એન. એ. આર. એન. એ. રચના અને ડાઉનસ્ટ્રીમ-પેપ્ટાઇડ રચના વચ્ચે સંભવિત માળખાકીય સામ્યતા જોવા મળી હતી. સૌથી વધુ સ્પષ્ટ સમાનતા દરેક રચનામાં "પી 1" લેબલવાળા દાંડા વચ્ચે છે, પરંતુ અન્ય સમાનતાઓ જોવા મળી હતી. એવી દરખાસ્ત કરવામાં આવી હતી કે બંને પ્રણાલીઓ નાઇટ્રોજન ચયાપચયમાં સામેલ રાઇબોસ્વિચનું પ્રતિનિધિત્વ કરે છે. હકીકત એ છે કે બંને રચનાઓમાંથી આર. એન. એ. પસંદગીયુક્ત રીતે ગ્લુટામાઇનને જોડે છે તે આ પૂર્વધારણાને સમર્થન આપે છે, પરંતુ વિગતવાર માળખાકીય માહિતી હજુ સુધી ઉપલબ્ધ નથી. જી. એલ. એન. એ. મોટિફની અંદર ઇ-લૂપ માળખું (જેને બલ્જ્ડ-જી મોડ્યુલ પણ કહેવાય છે) હોય છે. સંદર્ભો બાહ્ય કડીઓ સિસ-નિયમનકારી આર. એન. એ. તત્વો રિબોસ્વિચ