Hp53int1
হিউম্যান প্রোটিন 53 ইন্ট্রন 1 (এইচপি53আইএনটি1) হল মানুষের এইচপি53আইএনটি1 জিন দ্বারা এনকোড করা একটি প্রোটিন। জিন এইচপি53ইন্ট1 জিনটি ক্রোমোজোম 17p.13-এ অবস্থিত, যা ডিএনএ সিকোয়েন্স 1125 বেস জোড়া দৈর্ঘ্য দ্বারা এনকোড করা হয়, যা অঞ্চল 7,685,260 বিপি-7,686,371 বিপি জুড়ে থাকে। এইচপি53আইএনটি1 জিনের দুটি উপনাম রয়েছে, ডাব্লুআরএপি53আইএনটি1 এবং টিপি53আইএনটি1, ক্রোমোজোম 17-এ ডাব্লুআরএপি53 এবং টিপি53আইএনটি1 জিনের সাথে এর ওভারল্যাপ অনুসারে। এইচপি53ইন্ট1 পি53পি2 স্টার্ট সাইটের নিচের দিকে অবস্থিত। এইচপি53ইন্ট1-এর একাধিক এক্সন নেই এবং তাই এর কোনও আইসোফর্ম নেই। টিপি53-এর সাথে গুরুত্বপূর্ণ সম্পর্ক এইচপি53ইন্ট1 জিনটি টিপি53-এর মতো একই দিকে প্রতিলিপি করা হয় এবং টিপি53 প্রোটিন সমৃদ্ধ মায়েলয়েড লিউকেমিয়া কোষ এইচএল-60 এবং ইউ937-এ উপস্থিত থাকে। এটি ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর, প্রোমোটার সিগন্যাল, টিস্যু এক্সপ্রেশন এবং সাবসেলুলার স্থানীয়করণ সহ টিপি53 জিন এবং পরবর্তী প্রোটিনের সাথে একটি শক্তিশালী সম্পর্কের পরামর্শ দেয়। যদিও এই জিনগুলি অভিন্ন নয়, এই সম্পর্কটি কার্যকারিতা, কাঠামো এবং অভিব্যক্তির সূত্র দিতে পারে। mRNA প্রতিলিপি Hp53int1 একটি পলিঅ্যাডেনাইলেটেড প্রতিলিপি 1125 বেস জোড়া দৈর্ঘ্য দ্বারা এনকোড করা হয়। বেস জোড়া 633.926 এবং বেস জোড়া 496.1000-এর মধ্যে একটি নিয়ন্ত্রক পলি এ টেল সিকোয়েন্সের মধ্যে একটি পুনরাবৃত্তি ক্রম রয়েছে। মূল জোড়া 633 এবং 926-এর মধ্যে পুনরাবৃত্তির ক্রম আলু এসসি উপপরিবারের পুনরাবৃত্তির অনুরূপ বলে উল্লেখ করা হয়েছে, এটি এমন একটি ক্রম যা মানুষ এবং প্রাইমেটদের মধ্যে সর্বাধিক প্রচুর পুনরাবৃত্তির ক্রমকে চিহ্নিত করে এবং যা সম্ভবত প্রায় 32 মিলিয়ন বছর আগে অন্যান্য আলু উপপরিবারের কমপ্লেক্স থেকে বিচ্ছিন্ন হয়েছিল। প্রোমোটার সিকোয়েন্স Hp53int1 জিনের প্রোমোটার সিকোয়েন্স দৈর্ঘ্যে 540 বেস জোড়া হিসাবে দেখানো হয়েছিল। ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর এস. এম. এ. ডি. 2, এস. আর. ওয়াই এবং ই. টি. ভি. 7-এর বেসওয়াইজ কনজারভেশন স্কোর ছিল যথাক্রমে 2.99,2.73 এবং 3.03, যার মান 4 যা সর্বোচ্চ সংরক্ষণ এবং-0.5 সর্বনিম্ন নির্দেশ করে। কে. এল. এফ2 এবং কে. এল. এফ5-এর স্কোর ছিল 3.73। তুলনা করা প্রজাতিগুলি হল হাতি, কুকুর, রিসাস ম্যাকাক এবং মুরগি। প্রোটিন এইচপি53ইন্ট1 প্রোটিনের আণবিক ওজন 13.3 কে. ডি. এল এবং দৈর্ঘ্যে 118টি অ্যামিনো অ্যাসিড রয়েছে। এটি একটি মৌলিক প্রোটিন। 102-110 এর মধ্যে একটি অত্যন্ত সংরক্ষিত অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রম রয়েছে। আর্জিনাইন এবং টাইরোসিন সাইটের তুলনায় সেরিন সাইটের বিতরণ উল্লেখযোগ্যভাবে বেশি। অ্যামিনো অ্যাসিড 22-25-এর মধ্যে একটি সম্ভাব্য কেসিন কিনেজ II ফসফোরিলেশন সাইট রয়েছে। কেসিন কিনেজ II ফসফোরিলেশন কোষের বিস্তারের সাথে জড়িত। এইচপি53আইএনটি1 প্রোটিনের জন্য ব্যাধিটির তিনটি অঞ্চলের পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। পোস্ট ট্রান্সলেশনাল পরিবর্তন অ্যামিনো অ্যাসিড 14-20 এর মধ্যে একটি সম্ভাব্য O-β-GlcNAc সাইট রয়েছে। কোনও ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন বা সিগন্যাল পেপটাইড নেই। এস5, এস15 এবং এস20-তে একটি সংরক্ষিত ফসফরিলেশন সাইট রয়েছে। স্ট্রাকচার সেকেন্ডারি এইচপি53ইন্ট1 প্রোটিনে একটি আলফা হেলিক্স এবং পাঁচটি বিটা শীট থাকবে বলে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। আটটি সম্ভাব্য প্রোটিন বাঁধাই সাইট রয়েছে। টারশিয়ারি সাবসেলুলার স্থানীয়করণ একটি 56.5% সম্ভাবনা রয়েছে যে Hp53int1 প্রোটিন সাইটোপ্লাজমের মধ্যে স্থানীয়কৃত। টিস্যু এক্সপ্রেশন এইচপি53ইন্ট1 জিনের জন্য টিস্যু নির্দিষ্টতা কম। প্রাপ্তবয়স্ক মানুষের টিস্যুর বিভিন্ন নমুনার তুলনা করার সময় থাইমাস, ডিম্বাশয়, লিম্ফ নোড এবং শ্বেত রক্ত কোষে উচ্চ অভিব্যক্তি দেখা যায়। প্রক্সিমাল ডাইজেস্টিভ ট্র্যাক্ট, গ্যাস্ট্রোইনটেস্টাইনাল ট্র্যাক্ট এবং পুরুষ/মহিলা টিস্যুতে আরএনএ এক্সপ্রেশন এবং প্রোটিন এক্সপ্রেশন উভয়ের জন্যই উচ্চ এক্সপ্রেশন স্কোর ছিল। 10 থেকে 16 সপ্তাহের মধ্যে ভ্রূণের বিকাশের সময়, ফুসফুস এবং হৃৎপিণ্ডের টিস্যুতে উচ্চতর অভিব্যক্তি থাকে। এইচপি53আইএনটি1 কোষের বিস্তার বা অ্যাপোপটোসিসের প্রয়োজন এমন পরিস্থিতিতে পৃথকভাবে প্রকাশ করা হয়, টিপি53 টিউমার দমনকারী জিন হোমোলজি এবং বিবর্তন প্যারালগের সাথে এর সামঞ্জস্য অনুসারে এইচপি53আইএনটি1 জিনের কোনও প্যারালগ পাওয়া যায়নি। এনসিবিআই ব্লাস্ট সিকোয়েন্স বিশ্লেষণ এবং ক্লাস্টাল ডাব্লু ব্যবহার করে এইচপি53ইন্ট1 এবং কুড়িটি শীর্ষ ব্লাস্ট হিটগুলির জন্য একাধিক সিকোয়েন্স সারিবদ্ধকরণ তৈরি করা হয়েছিল। যদিও এই গবেষণার উদ্দেশ্য ছিল বিভিন্ন স্তন্যপায়ী প্রাণী, মেরুদণ্ডী প্রাণী এবং অমেরুদণ্ডী প্রাণীদের মধ্যে বেশ কয়েকটি অর্থোলগ খুঁজে বের করা, তবে কেবল দুটি শ্রেণীতে ফলাফল পাওয়া গেছেঃ প্রাইমেট এবং ব্যাকটেরিয়া। উপরন্তু, এইচপি53আইএনটি1-এর মধ্যে শুধুমাত্র একটি অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রম ছিল এবং এর দৈর্ঘ্যে সাধারণ 20টি অ্যামিনো অ্যাসিডের অর্থোলগ ছিল যা সরাসরি সারিবদ্ধ ছিল)। প্রাইমেট জিনগুলি ক্রোমোজোম 13-এ অবস্থিত এবং এইচপি53ইন্ট1 ক্রোমোজোম 17-এ অবস্থিত। পারমাণবিক খামের মধ্যে প্রাইমেট প্রোটিনের উপকোষীয় স্থানীয়করণের প্রমাণও রয়েছে, যেখানে এইচপি53ইন্ট1-এর প্রমাণ থেকে জানা যায় যে এটি সাইটোপ্লাজমে রয়েছে। সুতরাং, এটা ধরে নেওয়া যুক্তিসঙ্গত যে প্রাইমেটরা কঠোর অর্থোলগ নয়। কেন কঠোর Hp53int1 সারিবদ্ধকরণ শুধুমাত্র ব্যাকটেরিয়ায় পাওয়া যায় তার একটি সম্ভাব্য ব্যাখ্যা হল ব্যাকটেরিয়া এবং প্রাইমেটদের একটি সাধারণ পূর্বপুরুষের মধ্যে ভাগ করা একটি সম্ভাব্য ক্রসিং ওভার ইভেন্ট। ফাংশন এইচপি53ইন্ট1 প্রোটিন সম্ভবত কোষীয় বিস্তার এবং অ্যাপোপটোসিস নিয়ন্ত্রণে জড়িত। এটি অ্যাপোপটোসিস-নিয়ন্ত্রক এবং সর্বব্যাপী নিয়ন্ত্রক মিথস্ক্রিয়াশীল প্রোটিনের ব্যবহার, টিপি53 (বিশেষত এসএমএডি2, এসআরওয়াই এবং ইটিভি7 ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর) এর সাথে ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরের অংশ, পি53পি2 স্টার্ট সাইটের নিচের দিকে এর অবস্থান, এর কেসিন কাইনেজ II ফসফোরিলেশন সাইট এবং টিস্যু জুড়ে এর সর্বব্যাপী অভিব্যক্তি দ্বারা নির্দেশিত হয়। Hp53int1 জিন অভিব্যক্তি পরিবেশে বৃদ্ধি পায় যখন কোষের বিস্তার হ্রাসকারী প্রোটিনগুলি অতিরিক্তভাবে প্রকাশিত হয়, যা কোষের বৃদ্ধিকে আটকানোর জন্য প্রয়োজনীয় কোষের পরিবেশে এর প্রয়োজনীয়তার পরামর্শ দেয়। এছাড়াও, পরিমাণগত বিশ্লেষণ দেখায় যে ডিএনএ ক্ষতির জন্য কোষীয় প্রতিক্রিয়া সক্রিয় করার জন্য সাধারণ এইচপি53 প্রোটিন একেবারেই প্রয়োজন। আন্তঃক্রিয়াশীল প্রোটিন TP53-এর জন্য নিম্নলিখিত আন্তঃক্রিয়াশীল প্রোটিন পাওয়া গেছে, তবে তাদের ক্রোমোসোমাল সম্পর্কের কারণে Hp53int1-এ প্রয়োগ করা যেতে পারে। লক্ষ্য করা গুরুত্বপূর্ণঃ এই মিথস্ক্রিয়াশীল প্রোটিনগুলির কার্যকারিতা সরাসরি কোষ নিয়ন্ত্রণের (সর্বব্যাপীকরণ, প্রতিলিপি নিয়ন্ত্রক, অ্যাপোপটোসিস এবং প্রোটিন-টাইরোসিন কাইনেজ) সাথে জড়িত। এইচপি53ইন্ট1-এর জন্য দুটি চিহ্নিত এসএনপিএস রয়েছে। টিপি53 প্রবর্তকের বৃহত্তম ওআরএফ-এর উজানে অবস্থিত 43টি অবশিষ্টাংশের ক্রম অনুসারে এসএনপি 15 32তম স্থানে রয়েছে। এসএনপি 20 তখন 1125 বিপি সিডিএনএ (এইচপি53ইন্ট1)-এর 3 'প্রান্তের 45 বিপি ডাউনস্ট্রিমে অবস্থিত। ক্লিনিকাল তাৎপর্য প্রমাণ রয়েছে যে এইচপি53ইন্ট1 জিন টিউমার দমনে জড়িত। Hp53int1 TP53 এক্সন 1 (TAD1) এর সাথে ওভারল্যাপ করে। এই অঞ্চলের মধ্যে মিউটেশনের ফলে বিকল্প এক্সন এক্সপ্রেশন বা অসম্পূর্ণ স্প্লাইসিং এবং টিউমার দমনকারী কার্যকারিতা হ্রাস পেতে পারে। অস্টিওসারকোমা সম্পর্কে, টিএডি1-এর মধ্যে এই পুনর্বিন্যাসগুলি টিপি53-এর অসম্পূর্ণ স্প্লাইসিং জড়িত ক্ষেত্রে ~20%-এ সনাক্ত করা হয়েছে। এই পুনর্বিন্যাসগুলি টিপি53 ইন্ট্রন 1-এর সম্পূর্ণ ক্রম জুড়ে অবস্থিত, তবে তাদের বেশিরভাগই এইচপি53ইন্ট1 প্রতিলিপির একটি ডোমেনে গুচ্ছবদ্ধ হবে, যা পরামর্শ দেয় যে এই পুনর্বিন্যাসগুলি এই লোকাসের মধ্যে ক্রোমাটিন গঠন দ্বারা সহজতর হতে পারে।