The Genomic HyperBrowser
জিনোমিক হাইপার ব্রাউজার হল জিনোমিক অ্যানোটেশন ডেটার পরিসংখ্যানগত বিশ্লেষণের জন্য একটি ওয়েব-ভিত্তিক ব্যবস্থা। ইতিহাস জিনোমিক হাইপার ব্রাউজার 2008 সালের গোড়ার দিক থেকে তৈরি করা হয়েছে এবং 2010 সালের ডিসেম্বরে প্রকাশ্যে আসে। সিস্টেমের সর্বশেষ সংস্করণ (v1.6) মে 2013 সালে মুক্তি পায়। সিস্টেমটি নরওয়েজিয়ান বায়োইনফরম্যাটিক্স প্ল্যাটফর্ম দ্বারা তৈরি করা হয়েছে, যা বার্গেন বিশ্ববিদ্যালয়, অসলো বিশ্ববিদ্যালয়, নরওয়েজিয়ান বিজ্ঞান ও প্রযুক্তি বিশ্ববিদ্যালয়, ট্রমসো বিশ্ববিদ্যালয় এবং নরওয়েজিয়ান জীবন বিজ্ঞান বিশ্ববিদ্যালয়ের মধ্যে একটি যৌথ প্রকল্প। জিনোমিক হাইপার ব্রাউজার হল জি. এন. ইউ. জি. পি. এল. ভি3-এর অধীনে একটি মুক্ত সফ্টওয়্যার। হাইপার ব্রাউজারটি জিনোমিক তদন্তের একটি পরিসরের অনুমতি দেয় (উদাহরণস্বরূপ, জিন অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ, রোগের সংযোগ বা জিনোমের এপিজেনেটিক পরিবর্তন সহ)। সিস্টেমের প্রাথমিক ফোকাস জিনোমিক ট্র্যাকগুলির মধ্যে সম্পর্কের উপর পরিসংখ্যানগত অনুমানের উপর, যদিও সহজ বর্ণনামূলক পরিসংখ্যান এবং পৃথক ট্র্যাকগুলির বিশ্লেষণও সমর্থিত। বিশ্লেষণের একটি উদাহরণ হল হিস্টোন পরিবর্তন এবং জিন অভিব্যক্তির মধ্যে সম্পর্ক তদন্ত করা, হিস্টোন পরিবর্তনের চিআইপি-ভিত্তিক ট্র্যাক বনাম একটি মাইক্রো অ্যারে পরীক্ষা থেকে অভিব্যক্তি মান দিয়ে চিহ্নিত জিনের ট্র্যাক ব্যবহার করে। ওয়েব সার্ভারে অ্যানোটেশন ট্র্যাকের একটি বড় সংগ্রহ রয়েছে এবং ব্যবহারকারী-আপলোড করা ট্র্যাকগুলিকেও সমর্থন করে। জিনোমিক হাইপার ব্রাউজারটি একটি স্বতন্ত্র সিস্টেম হিসাবে চলে, তবে জিনোমিক ডেটা পরিচালনার জন্য গ্যালাক্সি বৈজ্ঞানিক ওয়ার্কফ্লো প্ল্যাটফর্মের সাথে শক্তভাবে সংহত করা হয়েছে, বিশেষত ইউজার ইন্টারফেসের দিকে। একটি ডিফারেনশিয়াল ডিজিজ রেগুলেম সংকলনের জন্য একটি প্রকল্প মানব রোগের বিরুদ্ধে ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর ম্যাপিংয়ে জিনোমিক হাইপার ব্রাউজার ব্যবহার করে। আরও দেখুন ইউসিএসসি জিনোম ব্রাউজার গ্যালাক্সি রেফারেন্স এক্সটার্নাল লিঙ্ক হাইপার ব্রাউজার ওয়েব সার্ভার ফ্রি বায়োইনফরম্যাটিক্স সফ্টওয়্যার