Nucleic acid test
নিউক্লিক অ্যাসিড টেস্ট (এনএটি) একটি কৌশল যা একটি নির্দিষ্ট নিউক্লিক অ্যাসিড ক্রম সনাক্ত করতে ব্যবহৃত হয় এবং এইভাবে সাধারণত একটি নির্দিষ্ট প্রজাতি বা জীবের উপ-প্রজাতি সনাক্ত এবং সনাক্ত করতে ব্যবহৃত হয়, প্রায়শই একটি ভাইরাস বা ব্যাকটেরিয়া যা রক্ত, টিস্যু, প্রস্রাবে প্যাথোজেন হিসাবে কাজ করে। এনএটি অন্যান্য পরীক্ষার থেকে আলাদা যে তারা অ্যান্টিজেন বা অ্যান্টিবডিগুলির পরিবর্তে জেনেটিক উপাদান (আরএনএ বা ডিএনএ) সনাক্ত করে। জেনেটিক উপাদানগুলির সনাক্তকরণ একটি রোগের প্রাথমিক নির্ণয়ের অনুমতি দেয় কারণ অ্যান্টিজেন এবং/অথবা অ্যান্টিবডিগুলির সনাক্তকরণের জন্য তাদের রক্ত প্রবাহে উপস্থিত হতে সময় লাগে। যেহেতু একটি নির্দিষ্ট জিনগত উপাদানের পরিমাণ সাধারণত খুব কম হয়, তাই অনেক এনএটি-তে এমন একটি পদক্ষেপ অন্তর্ভুক্ত থাকে যা জিনগত উপাদানকে প্রশস্ত করে-অর্থাৎ, এর অনেকগুলি অনুলিপি তৈরি করে। এই ধরনের এন. এ. টি-কে নিউক্লিক অ্যাসিড এম্প্লিফিকেশন টেস্ট (এন. এ. এ. টি) বলা হয়। পলিমারেজ চেইন রিঅ্যাকশন (পিসিআর), স্ট্র্যান্ড ডিসপ্লেসমেংট অ্যাসে (এসডিএ) বা ট্রান্সক্রিপশন মিডিয়েটেড অ্যাসে (টিএমএ) সহ পরিবর্ধন করার বিভিন্ন উপায় রয়েছে। কার্যত সমস্ত নিউক্লিক অ্যাসিড পরিবর্ধন পদ্ধতি এবং সনাক্তকরণ প্রযুক্তিগুলি ওয়াটসন-ক্রিক বেস জুটির নির্দিষ্টতা ব্যবহার করে; একক-স্ট্র্যান্ডেড প্রোব বা প্রাইমার অণুগুলি পরিপূরক স্ট্র্যান্ডের ডিএনএ বা আরএনএ লক্ষ্য অণু ধারণ করে। অতএব, সনাক্তকরণের সংবেদনশীলতা এবং নির্দিষ্টতা বাড়াতে প্রোব স্ট্র্যান্ডের নকশা অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ। যাইহোক, মিউট্যান্টগুলি যা বিভিন্ন মানুষের রোগের জন্য জিনগত ভিত্তি গঠন করে সাধারণত সাধারণ নিউক্লিক অ্যাসিডের থেকে কিছুটা আলাদা। প্রায়শই, এগুলি শুধুমাত্র একটি একক বেসে ভিন্ন হয়, যেমন, সন্নিবেশ, মুছে ফেলা এবং একক-নিউক্লিওটাইড পলিমরফিজম (এসএনপি)। এই ক্ষেত্রে, অসম্পূর্ণ প্রোব-টার্গেট বাইন্ডিং সহজেই ঘটতে পারে, যার ফলে মিথ্যা-ইতিবাচক ফলাফল হতে পারে যেমন একটি স্ট্রেনকে ভুল বোঝা যা প্যাথোজেনিক। একক-ভিত্তি নির্দিষ্টতা অর্জনের জন্য অনেক গবেষণা নিবেদিত হয়েছে। নিউক্লিক অ্যাসিড (ডি. এন. এ এবং আর. এন. এ) স্ট্র্যান্ডগুলি সংশ্লিষ্ট সিকোয়েন্সের সাথে জোড়ার চেইনে একসঙ্গে লেগে থাকে, ভেলক্রোর মতো ঝাঁপিয়ে পড়ে কাপড়ের ড্রায়ারে পড়ে যায়। তবে চেইনের প্রতিটি নোড খুব আঠালো নয়, তাই ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড চেইন ক্রমাগত আংশিকভাবে আনজিপ করে আসছে এবং পরিবেষ্টিত কম্পনের প্রভাবে নিজেকে পুনরায় জিপ করছে (তাপীয় শব্দ বা ব্রাউনিয়ান গতি হিসাবে উল্লেখ করা হয়)। দীর্ঘতর জুটিগুলি আরও স্থিতিশীল। নিউক্লিক অ্যাসিড পরীক্ষায় একটি "প্রোব" ব্যবহার করা হয় যা একটি দীর্ঘ স্ট্র্যান্ড যার সাথে একটি ছোট স্ট্র্যান্ড আটকে থাকে। দীর্ঘ প্রাইমার স্ট্র্যান্ডের একটি সংশ্লিষ্ট (পরিপূরক) ক্রম রয়েছে যা রোগ জীবাণু থেকে একটি "লক্ষ্য" স্ট্র্যান্ডের সনাক্ত করা হচ্ছে। রোগের স্ট্র্যান্ডটি লম্বা প্রাইমার স্ট্র্যান্ডের (যাকে "টোহোল্ড" বলা হয়) উন্মুক্ত অংশে শক্তভাবে লেগে থাকে এবং তারপর ধীরে ধীরে, প্রোব থেকে ছোট "প্রোটেক্টর" স্ট্র্যান্ডকে স্থানচ্যুত করে। শেষ পর্যন্ত, শর্ট প্রোটেক্টর স্ট্র্যান্ডটি কোনও কিছুর সাথে আবদ্ধ নয় এবং আনবাউন্ড শর্ট প্রাইমারটি সনাক্তযোগ্য। এই বিভাগের বাকি অংশটি এই প্রক্রিয়াটিকে একটি দরকারী পরীক্ষায় পরিণত করার জন্য প্রয়োজনীয় গবেষণার কিছু ইতিহাস দেয়। 2012 সালে, ইনের গবেষণা দল নিউক্লিক অ্যাসিড সংকরকরণের নির্দিষ্টতা অনুকূল করার বিষয়ে একটি গবেষণাপত্র প্রকাশ করে। তারা একটি 'টোহোল্ড এক্সচেঞ্জ প্রোব (পিসি)' চালু করেছে যা একটি প্রি-হাইব্রিডাইজড পরিপূরক স্ট্র্যান্ড সি এবং একটি প্রোটেক্টর স্ট্র্যান্ড পি নিয়ে গঠিত। পরিপূরক লক্ষ্য ক্রমের সাথে সম্পূর্ণরূপে পরিপূরক। যখন সঠিক লক্ষ্য (এক্স) টোহোল্ড এক্সচেঞ্জ প্রোবের (পিসি) সাথে প্রতিক্রিয়া দেখায়, তখন পি মুক্তি পায় এবং সংকর পণ্য এক্সসি গঠিত হয়। বিক্রিয়ার আদর্শ মুক্ত শক্তি ( মুংদ) শূন্যের কাছাকাছি। অন্যদিকে, যদি টোহোল্ড এক্সচেঞ্জ প্রোব (পিসি) জাল লক্ষ্য (এস)-এর সাথে প্রতিক্রিয়া দেখায়, তবে প্রতিক্রিয়াটি সামনের দিকে যায়, তবে আদর্শ মুক্ত শক্তি তাপগতিবিদ্যার দিক থেকে কম অনুকূল হয়। উৎপাদনে সুস্পষ্ট বৈষম্য দেওয়ার জন্য আদর্শ মুক্ত শক্তির পার্থক্য যথেষ্ট গুরুত্বপূর্ণ। বৈষম্যমূলক উপাদান 'কিউ "গণনা করা হয়, সঠিক লক্ষ্য সংকরণের ফলনকে জাল লক্ষ্য সংকরণের ফলন দ্বারা ভাগ করা হয়। 5টি সঠিক লক্ষ্য এবং 55টি জাল লক্ষ্য সহ সক্রিয়ভাবে প্রতিনিধিত্বকারী একক-ভিত্তি পরিবর্তন (প্রতিস্থাপন, মুছে ফেলা এবং সন্নিবেশ) সহ বিভিন্ন টোহোল্ড এক্সচেঞ্জ প্রোবের উপর পরীক্ষার মাধ্যমে, ইনের দল এই সিদ্ধান্তে পৌঁছেছে যে এই প্রোবের বৈষম্যমূলক কারণগুলি 3 থেকে 100 + এর মধ্যে ছিল এবং মধ্যবর্তী 26টি ছিল। প্রোবগুলি 10 ডিগ্রি সেলসিয়াস থেকে 37 ডিগ্রি সেলসিয়াস পর্যন্ত, 1 মিমি থেকে 47 মিমি পর্যন্ত এবং নিউক্লিক অ্যাসিডের ঘনত্ব 1 এনএম থেকে 5 মিমি পর্যন্ত শক্তিশালীভাবে কাজ করে। তারা আরও বুঝতে পেরেছিল যে টোহোল্ড এক্সচেঞ্জ প্রোবগুলি আরএনএ সনাক্তকরণেও শক্তিশালীভাবে কাজ করে। এরপর আরও গবেষণা করা হয়েছে। 2013 সালে, সেলিগের দল ফ্লুরোসেন্ট আণবিক প্রোব সম্পর্কে একটি গবেষণাপত্র প্রকাশ করে যা টোহোল্ড বিনিময় প্রতিক্রিয়াও ব্যবহার করে। এটি সঠিক লক্ষ্য এবং এসএনপি লক্ষ্যের অপটিক্যাল সনাক্তকরণ সক্ষম করে। তারা ই. কোলাই থেকে প্রাপ্ত নমুনায় এসএনপি সনাক্ত করতেও সফল হয়েছে। 2015 সালে, ডেভিডের দল 'প্রতিযোগিতামূলক রচনা' নামক ব্যবস্থা চালু করে একক-নিউক্লিওটাইড বৈকল্পিকের (এসএনভি) অত্যন্ত উচ্চ (1,000 +) নির্বাচনযোগ্যতা অর্জন করে। এই পদ্ধতিতে, তারা সর্বোত্তম প্যারামিটার মানগুলির পূর্বাভাস দেওয়ার জন্য অন্তর্নিহিত সংকরকরণ প্রক্রিয়াগুলির একটি গতিজ প্রতিক্রিয়া মডেল তৈরি করেছিল, যা এসএনভি এবং ওয়াইল্ডটাইপ (ডাব্লুটি) এর ক্রমের উপর ভিত্তি করে, প্রোব এবং সিঙ্কের নকশা স্থাপত্যের উপর, এবং বিকারক ঘনত্ব এবং পরীক্ষার অবস্থার উপর নির্ভর করে পরিবর্তিত হয়। তাদের মডেল 44টি ক্যান্সার-সম্পর্কিত ডি. এন. এ এস. এন. ভি-র জন্য মধ্যমা 890-গুণ নির্বাচনশীলতায় সফল হয়েছে, ন্যূনতম 200 সহ, যা পূর্ববর্তী সংকরায়ন-ভিত্তিক পরীক্ষার তুলনায় কমপক্ষে 30-গুণ উন্নতির প্রতিনিধিত্ব করে। উপরন্তু, তারা পিসিআর অনুসরণ করে মানুষের জিনোমিক ডিএনএ থেকে কম ভিএএফ সিকোয়েন্স পরীক্ষা করার জন্য এই প্রযুক্তি প্রয়োগ করেছিল, পাশাপাশি সরাসরি সিন্থেটিক আরএনএ সিকোয়েন্সগুলিতে। দক্ষতার ভিত্তিতে, তারা ব্লকার ডিসপ্লেসমেংট এম্প্লিফিকেশন (বিডিএ) নামে একটি নতুন পিসিআর পদ্ধতি তৈরি করেছে। এটি একটি তাপমাত্রা-স্ফীত পিসিআর যা নির্বাচিতভাবে প্রায় 20 এনটি উইন্ডোর মধ্যে সমস্ত ক্রম রূপগুলিকে বন্য প্রকারের ক্রমের উপর 1000 গুণ বৃদ্ধি করে, যা মূলত ≤ 0.1% অ্যালিল ফ্রিকোয়েন্সিতে শত শত সম্ভাব্যতা রূপগুলির সহজ সনাক্তকরণ এবং পরিমাণ নির্ধারণের অনুমতি দেয়। বিডিএ 56 ডিগ্রি সেলসিয়াস থেকে 64 ডিগ্রি সেলসিয়াস পর্যন্ত অ্যানিয়াল তাপমাত্রা জুড়ে অনুরূপ সমৃদ্ধকরণ কর্মক্ষমতা অর্জন করে। এই তাপমাত্রার দৃঢ়তা জিনোম জুড়ে বিভিন্ন রূপের মাল্টিপ্লেক্স সমৃদ্ধকরণকে সহজতর করে এবং বিরল ডিএনএ রূপ সনাক্তকরণের জন্য সস্তা এবং বহনযোগ্য থার্মোসাইক্লিং যন্ত্রের ব্যবহারকে সক্ষম করে। ফুসফুসের ক্যান্সার রোগীদের রক্তের প্লাজমা থেকে সংগৃহীত ক্লিনিকাল কোষ-মুক্ত ডিএনএ নমুনা সহ নমুনা প্রকারের ক্ষেত্রেও বিডিএ বৈধ করা হয়েছে। প্রয়োগ গনোকক্কাল এবং অন্যান্য নিসেরিয়াল সংক্রমণের নির্ণয়ঃ সনাক্তকরণের জন্য নির্দিষ্ট এন. গনোরিয়া ডিএনএ বা আরএনএ সিকোয়েন্সের সম্প্রসারণ। ইউরোজেনিটাল সি ট্রাকোমাটিস সংক্রমণ নির্ণয় মাইকোব্যাকটেরিয়াম টিউবারকিউলোসিস সনাক্তকরণ এইচআইভি আরএনএ সনাক্তকরণ বা জুনোটিক করোনভাইরাসের ডিএনএ সনাক্তকরণ সার্স-কোভ-2-এর জন্য ডায়াগনস্টিক পরীক্ষা অ্যান্টিবায়োটিক চিকিৎসার পরে অ্যান্টিবায়োটিক প্রতিরোধী ব্যাকটেরিয়া সনাক্তকরণ রেফারেন্স জেনেটিক্স নিবন্ধগুলিতে বিশেষজ্ঞের মনোযোগ প্রয়োজন জেনেটিক্স কৌশল চিকিৎসা পরীক্ষা