Pseudoproline
পেপটাইডের এফ. এম. ও. সি কঠিন-পর্যায় সংশ্লেষণের সময় সমষ্টি হ্রাস করার জন্য সিউডোপ্রোলিন (এছাড়াও সিউডো-প্রোলিন, ±-প্রো) ডেরিভেটিভ কৃত্রিমভাবে তৈরি করা হয়। বড় পেপটাইডের রাসায়নিক সংশ্লেষণ এখনও সলিড ফেজ পেপটাইড সংশ্লেষণের (এস. পি. পি. এস) সময় কম দ্রবণের সমস্যা বা সম্পূর্ণ সুরক্ষিত পেপটাইড টুকরোগুলির সীমিত দ্রবণীয়তার দ্বারা সীমাবদ্ধঃ এমনকি কেমোসিলেক্টিভ লাইগেশন পদ্ধতিগুলিও অরক্ষিত পেপটাইড ব্লকগুলির স্ব-সংযোগ দ্বারা বাধাগ্রস্ত হয়। ক্রমবর্ধমান পেপটাইড শৃঙ্খলের পছন্দসই গঠন এবং এর ভৌত রাসায়নিক বৈশিষ্ট্যগুলির মধ্যে সম্পর্কের ব্যাখ্যা থেকে জানা যায় যে β-শীট (বিটা-শীট) গঠন প্রায়শই দ্রবণতা এবং দ্রবণীয়তার উল্লেখযোগ্য হ্রাস দ্বারা সমান্তরাল হয়। বাহ্যিক কারণগুলির দ্বারা পেপটাইডের দ্রবণ বাড়ানোর প্রচেষ্টা ছাড়াও, খুব কম প্রচেষ্টা, অর্থাৎ। এন-প্রতিস্থাপিত এইচ. এম. বি অ্যামিনো অ্যাসিড ডেরিভেটিভস এবং সিউডোপ্রোলিনগুলি (উপরের ডানদিকে চিত্র দেখুন) সমষ্টি এবং গৌণ কাঠামো গঠনের জন্য দায়ী পেপটাইডের অভ্যন্তরীণ বৈশিষ্ট্যগুলি সংশোধন করার জন্য রিপোর্ট করা হয়েছে। সিউডোপ্রোলিনগুলি সেরিন-(অক্সা) বা থ্রেওনিন-উদ্ভূত অক্সাজোলিডিন [অক্সা (5-মি)] এবং প্রোলিন-সদৃশ বলয়ের কাঠামো সহ সিস্টিন-উদ্ভূত থায়াজোলিডিন (টিএইচজেড) নিয়ে গঠিত (উপরের ডানদিকে দেখুন)। মাটার এবং সহকর্মীরা সেরিন, থ্রেওনিন এবং সিস্টিনের অক্সা-এবং থায়াপ্রোলিন ডেরিভেটিভকে সের (siPro) দিয়ে সংজ্ঞায়িত করেছেন। Thr (siPro), এবং Cys (siPro), যথাক্রমে, যেখানে সংক্ষেপণ siPro প্রোলাইনের সাথে সম্পর্ক নির্দেশ করে (অবস্থান 4-এ হেটেরোআটোমিক রিং প্রতিস্থাপন সহ)। প্রোলাইন বলয়ের অবস্থান 2-এ প্রতিস্থাপন সহ সিউডোপ্রোলাইনগুলিকে সের/থ্র/সিস-(প্রো) বলা হয়। সি2-প্রতিস্থাপিত সিউডোপ্রোলিনের পূর্ববর্তী অবশিষ্টাংশের সাথে একটি সিস-অ্যামাইড বন্ধনের পছন্দের কারণে, তাদের অন্তর্ভুক্তির ফলে পেপটাইড মেরুদণ্ডের একটি কিঙ্ক গঠন ঘটে, এইভাবে পেপটাইড সমষ্টি, স্ব-সমিতি বা β-কাঠামো গঠন প্রতিরোধ করে। অতএব, সিউডোপ্রোলিনগুলি একই সাথে দুটি কাজ সম্পাদন করেঃ তারা (1) সের, থ্র এবং সিসের জন্য অস্থায়ী পার্শ্ব-শৃঙ্খল সুরক্ষা হিসাবে এবং (2) পেপটাইড সংশ্লেষণের সময় এবং পরবর্তী শৃঙ্খল সমাবেশে দ্রবণ এবং সংযোগের হার বাড়ানোর জন্য দ্রবণীয় বিল্ডিং ব্লক হিসাবে কাজ করে। মুক্ত অ্যামিনো অ্যাসিডগুলিকে অ্যালডিহাইড বা কিটোন দিয়ে বিক্রিয়া করে সিউডোপ্রোলিন পাওয়া যায়। এন-টার্মিনাল সিউডোপ্রোলিনযুক্ত ক্রমবর্ধমান পেপটাইড শৃঙ্খলে অ্যামিনো অ্যাসিড ডেরিভেটিভের সংযোগের ফলে সাধারণত অক্সাজোলিডিন (থায়াজোলিডিন) রিং সিস্টেমের স্টেরিক্যালি বাধাগ্রস্ত প্রকৃতির কারণে এবং নাইট্রোজেন পরমাণুর নিউক্লিওফিলিসিটি হ্রাসের কারণে কম ফলন হয়। ফলস্বরূপ, পেপটাইড সংশ্লেষণে ব্যবহারের জন্য এফ. এম. ও. সি-এক্স. এ. এ-1-ও. এক্স./টি. এইচ. জি-ও. এইচ প্রকারের উপযুক্তভাবে সুরক্ষিত ডাইপেপটাইড ডেরিভেটিভের পূর্বনির্ধারণ শ্রেয়। অক্সাজোলিডিন-এবং থায়াজোলিডিন-রিং-যুক্ত ডাইপেপটাইড ডেরিভেটিভ প্রস্তুত করার জন্য দুটি ধারণাগতভাবে ভিন্ন পদ্ধতি সম্ভবঃ (1) অ্যাসিড ফ্লোরাইড বা এন-কার্বোক্সিয়ানহাইড্রাইড (এনসিএ) ব্যবহার করে সের-বা থ্রে-উদ্ভূত অক্সাজোলিডিন বা সিস-উদ্ভূত থায়াজোলিডিনের ইন সিটু অ্যাসিলেশন; এবং (2) সি-টার্মিনাল সের বা থ্রে ধারণকারী ডাইপেপটাইডগুলিতে (পোস্ট-ইনসারশন) অক্সাজোলিডিন সিস্টেমের সরাসরি সন্নিবেশ। পছন্দের পদ্ধতিটি ওয়েলআই হিসাবে সিউডোপ্রোলিনের প্রকৃতির উপর দৃঢ়ভাবে নির্ভর করে যেমন চক্রাকার ব্যবস্থার সি2-এ প্রতিস্থাপনের উপর। সুবিধা সিউডোপ্রোলিনগুলি সিন্থেটিক পেপটাইডের গুণমান উন্নত করার জন্য একটি শক্তিশালী হাতিয়ার। সিউডোপ্রোলিন ডিপেপটাইড দীর্ঘ এবং কঠিন উভয় পেপটাইড সংশ্লেষণে সাফল্যের হার ব্যাপকভাবে বৃদ্ধি করেছে। সিউডোপ্রোলিন ডাইপেপটাইডগুলি অন্যান্য অ্যামিনো অ্যাসিড ডেরিভেটিভের মতো একই পদ্ধতিতে চালু করা যেতে পারে। সেরিন এবং থ্রেওনিনযুক্ত পেপটাইডের এফ. এম. ও. সি সলিড ফেজ পেপটাইড সংশ্লেষণ (এস. পি. পি. এস)-এ সিউডোপ্রোলিন (অক্সাজোলিডিন) ডাইপেপটাইডের নিয়মিত ব্যবহার অপরিশোধিত পণ্যের গুণমান এবং উৎপাদনে উল্লেখযোগ্য উন্নতি ঘটায় এবং ব্যর্থ ক্রমের অপ্রয়োজনীয় পুনরাবৃত্তি সংশ্লেষণ এড়াতে সহায়তা করে। সিউডোপ্রোলাইন ডিপেপটাইডগুলি নিষ্ক্রিয় পেপটাইড, দীর্ঘ পেপটাইড/ছোট প্রোটিন এবং চক্রীয় পেপটাইড সংশ্লেষণের ক্ষেত্রে বিশেষভাবে কার্যকর প্রমাণিত হয়েছে, যা অনেক ক্ষেত্রে পেপটাইড উৎপাদন করতে সক্ষম করে যা অন্যথায় তৈরি করা যেত না। এই ডাইপেপটাইডগুলি ব্যবহার করা অত্যন্ত সহজঃ উপযুক্ত সিউডোপ্রোলিন ডাইপেপটাইড দিয়ে পেপটাইড অনুক্রমের পূর্ববর্তী অ্যামিনো অ্যাসিড অবশিষ্টাংশের সাথে একটি সেরিন বা থ্রেওনাইনের অবশিষ্টাংশ প্রতিস্থাপন করুন (আপনার ডানদিকে চিত্রটি দেখুন)। ক্লিভেজ এবং ডিপ্রোটেকশনে নেটিভ সিকোয়েন্স পুনরুজ্জীবিত হয়। সাম্প্রতিক বছরগুলিতে, বেশ কয়েকটি পেপটাইড, যেমন টি-20 (ডিপি178 নামেও পরিচিত), এপ্টিফিব্যাটাইড, জিকোনোটাইড, প্রামলিন্টাইড, এক্সনাটাইড এবং বিভালিরুডিন, মার্কিন খাদ্য ও ওষুধ প্রশাসন দ্বারা অনুমোদিত হয়েছে এবং বিভিন্ন রোগের চিকিৎসায় ব্যবহারের জন্য বাজারে রয়েছে। আরও গুরুত্বপূর্ণ বিষয় হল, 2004 সালের শেষের দিকে, 600 টিরও বেশি পেপটাইড হয় বিকাশে বা উন্নত প্রাক-ক্লিনিকাল পর্যায়ে ছিল। উন্নতি ঐতিহ্যগতভাবে, কঠিন-পর্যায় সংশ্লেষণ সব ধরনের পেপটাইড সংশ্লেষণের জন্য পলিস্টাইরিন-ভিত্তিক রজনগুলির উপর নির্ভর করে। যাইহোক, তাদের উচ্চ হাইড্রোফোবিসিটির কারণে, এই রজনগুলির কিছু সীমাবদ্ধতা রয়েছে, বিশেষত জটিল পেপটাইড সংশ্লেষণের ক্ষেত্রে, এবং এই জাতীয় ক্ষেত্রে, পলিথিলিন গ্লাইকোল (পিইজি)-ভিত্তিক রজনগুলি প্রায়শই উচ্চতর ফলাফল দিতে দেখা যায়। জটিল পেপটাইডের সমাবেশ ত্বরান্বিত করার জন্য আরেকটি শক্তিশালী কৌশল হল সিউডোপ্রোলিন ডিপেপটাইড ব্যবহার করা। এই ডেরিভেটিভগুলি চেইনের মধ্যে মিথস্ক্রিয়াকে ব্যাহত করে যা সাধারণত সমষ্টিগত ক্রমে দুর্বল সংযুক্তি উৎপাদনের কারণ। 40 টি অ্যামিনো অ্যাসিড অবশিষ্টাংশ পর্যন্ত প্রায় সমস্ত পেপটাইড সংশ্লেষণের জন্য এখন রাসায়নিক সরঞ্জামের একটি বড় অস্ত্রাগার উপলব্ধ। যাইহোক, বেশ কয়েকটি ছোট আকারের পেপটাইড এবং অনেক বড় পেপটাইড এবং/অথবা প্রোটিন এখনও শাস্ত্রীয় পদ্ধতিতে অনুপলব্ধ। সম্প্রতি, RANTES (24-91)-এর একটি দক্ষ ধাপে ধাপে কঠিন-পর্যায় সংশ্লেষণ প্রকাশিত হয়েছে। RANTES হল সিডি8 + টি কোষ দ্বারা উৎপাদিত একটি প্রধান এইচআইভি-দমনকারী কারণ। সেরিন প্রোটিজ CD26/ডাইপেপটিডাইল-পেপটিডেজ IV (CD26/DPP IV) RANTES (1-91) থেকে RANTES (24-91)-এ একটি NH2-টার্মিনাল ছাঁটাইকে প্ররোচিত করে, যা একটি এম-ট্রপিক এইচআইভি-1 স্ট্রেন দ্বারা মনোসাইটের সংক্রমণকে বাধা দেয়। পদ্ধতিটি পি. ই. জি-ভিত্তিক কেমম্যাট্রিক্স রজন এবং সিউডোপ্রোলিন ডিপেপটাইডের সুবিধাগুলিকে একত্রিত করে। সিউডোপ্রোলাইন মনোমারের সাথে সরাসরি সংযোগ স্থাপন। সেনকো এবং তাঁর সহকর্মীরা প্রথম পলিপেপটাইড সংশ্লেষণে পৃথক, একক অবশিষ্টাংশের সিউডোপ্রোলিন ডেরিভেটিভের কার্যকারিতা নিশ্চিত করেন। সাহিত্য অনুসারে, সের (েডিবিপ্রো)-এর রূপান্তর চমৎকার ছিল, তবে থ্রে (েডিবিপ্রো) বিস্তৃত পরিসরে বৈচিত্র্যময় ছিল। সিউডোপ্রোলিন মনোমারের অ্যাসাইলেশন অ্যাসাইলেটিং অবশিষ্টাংশের রাসায়নিক প্রকৃতির উপরও নির্ভর করত। মান্নে এবং তাঁর সহকর্মীরা সফলভাবে একটি হিউম্যান গ্রোথ হরমোন (এইচজিএইচ)-থেকে উদ্ভূত পলিপেপটাইড সংশ্লেষিত করেছিলেন যা আগে সার্ (ম্বাপ্রো) ব্যবহার করে অ্যাক্সেস করা চ্যালেঞ্জিং ছিল, যেখানে জেআর 10 থ্র (ম্বাপ্রো) ব্যবহার করেছিল। সেঙ্কো ও অন্যান্যদের উপর ভিত্তি করে। Szaniszló এবং সহকর্মীরা সম্প্রতি Thr (েডিবিপ্রো) এর অ্যাসাইলেটিং দক্ষতা উন্নত করেছেন এবং এটিকে তাদের অবিচ্ছিন্ন প্রবাহ পেপটাইড সংশ্লেষকে অন্তর্ভুক্ত করেছেন। আরও দেখুন প্রোলাইন পেপটিডোমিমেটিক্স (যেমন পেপটয়েড এবং β-পেপটাইড) পেপটাইড সম্পর্কিত অণু, তবে বিভিন্ন বৈশিষ্ট্যযুক্ত। পেপটাইড সংশ্লেষণ অনুবাদ রাইবোজোম রেফারেন্স চক্রাকার অ্যামিনো অ্যাসিড পেপটাইড