TMEM50A
ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিন 50এ হল একটি প্রোটিন যা মানুষের মধ্যে টি. এম. ই. এম. 50এ জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। এই জিনটি আর. এইচ. ডি এবং আর. এইচ. সি. ই জিনের মধ্যে আর. এইচ জিন লোকাসে অবস্থিত। এর প্রোটিন পণ্যের কার্যকারিতা অজানা; তবে, এর ক্রমের সম্ভাব্য ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন রয়েছে যা পরামর্শ দেয় যে এটি একটি অবিচ্ছেদ্য ঝিল্লি প্রোটিন হতে পারে। আর. এইচ জিনের মধ্যে এর অবস্থান থেকে বোঝা যায় যে এই জিনের পলিমরফিজমগুলি আর. এইচ হ্যাপ্লোটাইপের সাথে শক্তভাবে যুক্ত হতে পারে এবং নির্দিষ্ট আর. এইচ হ্যাপ্লোটাইপের পক্ষে বা বিরুদ্ধে নির্বাচিত চাপে অবদান রাখতে পারে। টি. এম. ই. এম. 50এ জিনটি মানব (হোমো স্যাপিয়েন্স) জিনোমের ক্রোমোজোম 1 <আই. ডি. 1>-এ অবস্থিত। এর এমআরএনএ ক্রমের দৈর্ঘ্য 2284 বেস জোড়া এবং এতে সাতটি এক্সন রয়েছে। কোডিং ক্রমটি বেস জোড়া 151 থেকে 624 পর্যন্ত হয়। প্রোটিন টি. এম. ই. এম. 50এ প্রোটিন দৈর্ঘ্যে 157টি অ্যামিনো অ্যাসিড। কোষীয় অবস্থান পি. এস. ও. আর. টি II ভবিষ্যদ্বাণী করে যে টি. এম. ই. এম. 50এ সম্ভবত কোষের প্লাজমা ঝিল্লি বা এন্ডোপ্লাজমিক রেটিকুলামে পাওয়া যায়। বায়োইনফরম্যাটিক বিশ্লেষণের মাধ্যমে TMEM50A-এর বেশ কয়েকটি প্রোটিন বৈশিষ্ট্যের পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল। আণবিক ওজনঃ 17.4 কে. ডি. এল. আইসোইলেক্ট্রিক পয়েন্টঃ <আই. ডি. 1> অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তনঃ অনুবাদ-পরবর্তী বেশ কয়েকটি পরিবর্তনের পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছেঃ অ্যামিনো অ্যাসিড 82 এবং 84 অবশিষ্টাংশে পাওয়া দুটি সেরিন ফসফোরিলেশন সাইট একটি সম্ভাব্য এন-লিঙ্কযুক্ত গ্লাইকোসিলেশন সাইট অ্যামিনো অ্যাসিডে অবস্থিত 74 একটি সম্ভাব্য টাইরোসিন ফসফোরিলেশন সাইট কাঠামো টি. এম. ই. এম. 50এ-এর সঠিক কাঠামো অজানা তবে বেশ কয়েকটি ভবিষ্যদ্বাণী প্রোগ্রাম ব্যবহারের মাধ্যমে এর কিছু সম্ভাব্য কাঠামোগত উপাদান অনুমান করা যেতে পারে। টি. এম. এইচ. এম. এম দেখায় যে টি. এম. ই. এম. 50এ-এর চারটি ট্রান্সমেম্ব্রেন অঞ্চল রয়েছে। টি. এম. ই. এম. 50এ অর্থোলগে পাওয়া অনুরূপ ফলাফল এবং বায়োলজি ওয়ার্কবেঞ্চে এস. এ. পি. এস প্রোগ্রাম ব্যবহার করে এই অঞ্চলগুলিতে পাওয়া নিরপেক্ষ চার্জ দ্বারা এটি আরও নিশ্চিত করা হয়েছে। পরিচিত প্রোটিন কাঠামোর ফলাফলের তুলনা করার পাশাপাশি বায়োলজি ওয়ার্কবেঞ্চে পি. ই. এল. ই প্রোগ্রাম ব্যবহার করে, এটি ভবিষ্যদ্বাণী করা যেতে পারে যে টি. এম. ই. এম. 50এ-তে রয়েছেঃ দুটি আলফা হেলিক্স কাঠামো পাঁচটি বিটা শীট স্প্লাইস সাইট বিকল্প স্প্লাইস সাইটগুলি ইউ. সি. এস. সি জিনোম ব্রাউজারে বি. এল. এ. টি দ্বারা পাওয়া গেছে। টি. এম. ই. এম. 50এ-এর বেশ কয়েকটি বিকল্প স্প্লাইস রয়েছে যার মধ্যে রয়েছেঃ এক্সোন 2 অপসারণ এক্সোন 2,3 অপসারণ এবং 5 এক্সোন 3 অপসারণ এক্সোন 5 অপসারণ এই বিকল্প স্প্লাইস সাইটগুলি এক্সনকে প্রভাবিত করে না। অভিব্যক্তি টি. এম. ই. এম. 50এ প্রায় সমস্ত মানব টিস্যুতে প্রকাশিত হয়, তবে এন. সি. বি. আই-এর মাধ্যমে ই. এস. টি প্রোফাইল থেকে প্রাপ্ত প্রমাণ থেকে জানা যায় যে প্যারাথাইরয়েড টিস্যু এবং মস্তিষ্কের টিস্যুতে এর অভিব্যক্তি কিছুটা বেশি হতে পারে। এটি নবজাতক এবং কিশোর বিকাশের পর্যায়েও বেশি প্রকাশ পায় বলে মনে হয়। মিথস্ক্রিয়াশীল প্রোটিন একটি ভবিষ্যদ্বাণীকৃত প্রোটিন রয়েছে যা TMEM50A, C7orf43-এর সাথে মিথস্ক্রিয়া করে। এই প্রোটিন জিনটি ক্রোমোজোম 7 ওপেন রিডিং ফ্রেম 43-এ অবস্থিত। এর কার্যকারিতাও অজানা। বেশ কয়েকটি জি. ই. ও প্রোফাইলের ফিউচার মেডিকেল অ্যাপ্লিকেশন তদন্তে দেখা গেছে যে টি. এম. ই. এম. 50এ সার্ভিকাল ক্যান্সারের শেষ পর্যায়ে অত্যন্ত নিয়ন্ত্রিত। এর থেকে বোঝা যায় যে টি. এম. ই. এম. 50এ-এর এমন কিছু কার্যকারিতা রয়েছে যা সার্ভিকাল ক্যান্সারের কারণ হতে পারে বা সরাসরি হতে পারে। যদিও এই ধারণাটি নিশ্চিত করার জন্য খুব কম গবেষণা পাওয়া যায়, তবে আরও গবেষণা এমন পরামর্শ দিতে পারে যা সার্ভিকাল ক্যান্সারের পরবর্তী পর্যায়ের চিকিৎসার জন্য টি. এম. ই. এম. 50এ ব্যবহার করে। তথ্যসূত্র আরও পড়া