Thalassiosira pseudonana
থালাসিওসিরা সিউডোনানা হল সামুদ্রিক কেন্দ্রিক ডায়াটমের একটি প্রজাতি। পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিংয়ের জন্য এটি প্রথম ইউক্যারিওটিক সামুদ্রিক ফাইটোপ্ল্যাঙ্কটন হিসাবে নির্বাচিত হয়েছিল। টি. সিউডোনানা এই গবেষণার জন্য নির্বাচিত হয়েছিল কারণ এটি ডায়াটম ফিজিওলজি অধ্যয়নের জন্য একটি মডেল, বিশ্বের মহাসাগরগুলিতে ব্যাপকভাবে বিতরণ করা একটি বংশের অন্তর্গত এবং 34 মেগা বেস জোড়ায় তুলনামূলকভাবে ছোট জিনোম রয়েছে। বিজ্ঞানীরা থালাসিওসিরার সামুদ্রিক ডায়াটম ব্যবহার করে ডায়াটম আলোর শোষণ নিয়ে গবেষণা করছেন। ডায়াটমের সি4 বিপাক ব্যবহার করার জন্য যথেষ্ট পরিমাণে সিও2-এর উচ্চ ঘনত্বের প্রয়োজন হয় (ক্লিমেন্ট এট আল। 2015)। টি. সিউডোনানার ক্লোন যা সিকোয়েন্স করা হয়েছিল তা হল সিসিএমপি 1335 এবং এটি বিগেলো ল্যাবরেটরি ফর ওশান সায়েন্সেসের ন্যাশনাল সেন্টার ফর মেরিন অ্যালগি অ্যান্ড মাইক্রোবায়োটায় পাওয়া যায়। এই ক্লোনটি মূলত 1958 সালে মরিচেস বে (লং আইল্যান্ড, নিউ ইয়র্ক) থেকে সংগ্রহ করা হয়েছিল এবং সংস্কৃতিতে ক্রমাগত বজায় রাখা হয়েছে। অঙ্গসংস্থান তালাসিওসিরা সিউডোনানার একটি রেডিয়াল প্রতিসাম্য রয়েছে। এর বায়োসিলিকা কোষ প্রাচীর দুটি ভাগে বিভক্ত, যা গার্ডল ব্যান্ড দ্বারা একত্রিত হয়, যা তাদের একটি নলাকার আকৃতি দেয় বা পেট্রি থালা হিসাবে দেখায়। তাদের ভালভের ব্যাস 2 থেকে 9 মাইক্রোমিটার পর্যন্ত হয়। ভালভটি সিলিকা পাঁজর দিয়ে তৈরি যা কেন্দ্র থেকে তাদের মধ্যে অনেকগুলি 18 এনএম ব্যাসের ন্যানোপোর সহ বিকিরণ করে। ভালভের মুখে 0-1 কেন্দ্রীয় ফুলটোপোর্টুলা এবং ফুলটোপোর্টুলার একটি প্রান্তিক বলয় (6-12) রয়েছে। কেন্দ্রীয় ফুল্টোপর্টুলার বাহ্যিক খোলাগুলি রিমযুক্ত গর্ত হিসাবে প্রদর্শিত হয়, যেখানে প্রান্তিক ফুল্টোপর্টুলারগুলি ছোট রিমযুক্ত টিউব হিসাবে প্রদর্শিত হয়, যা কখনও কখনও খোলার সময় তির্যকভাবে বিভক্ত হয়। ভালভের অভ্যন্তরীণ অংশে, দুটি উপগ্রহ ছিদ্র কেন্দ্রীয় ফুলটোপোর্টুলাকে ঘিরে রাখে, অন্যদিকে প্রান্তিক ফুলটোপোর্টুলা তিনটি উপগ্রহ ছিদ্র দ্বারা বেষ্টিত থাকে। রিমোপোর্টুলা হল ভালভের মুখে অবস্থিত একটি রিমযুক্ত ছিদ্র, যার আকার ফুল্টোপোর্টুলার মতো এবং দুটি ফুল্টোপোর্টুলার মধ্যে অবস্থিত। টি. সিউডোনানার পারভালভার অক্ষটি ভালভের ব্যাসের চেয়ে ছোট বা সমান হতে পারে। তাদের কোষের দেওয়ালে বেশিরভাগ সিলিসিফিকেশন কম থাকে বলে জানা গেছে; তবে, তাদের রিম এবং পাঁজর অত্যন্ত সিলিসিফাইড। এটি সম্ভবত হালকা এবং অর্থনৈতিকভাবে সিলিকা ব্যবহার করার সময় তাদের উচ্চ শক্তি অর্জন করতে সক্ষম করে। বায়োমিনেরালাইজেশন টি. সিউডোনানার স্বতন্ত্র ন্যানো থেকে মাইক্রো-স্কেল কাঠামো গঠনের একটি নির্দিষ্ট প্রক্রিয়া অনুসরণ করে। এটি একটি পাতলা বেস স্তর গঠনের সাথে শুরু হয় যা ভালভের রূপরেখা তৈরি করে। এরপরে, সিলিকা পাঁজরের বিকিরণ এবং রিমগুলির গঠন হয়, যখন পোর্টুলা বিকশিত হয়। রেডিয়াল কাঠামোর গঠন একটি কেন্দ্রীয় অবস্থান থেকে শুরু হয় এবং x এবং y অক্ষ সমতলে ছড়িয়ে পড়ে। পরিপক্কতার সময়, ভালভের পৃষ্ঠটি ক্রমবর্ধমান সিলিসিফাইড হয়ে যায় এবং রিমটি বিকাশ অব্যাহত রাখে, যখন ভালভের কেন্দ্রীয় অংশটি আরও অনমনীয় হয়ে ওঠে। প্রাথমিকভাবে, ভালভ ন্যানোপোরগুলির আকার অনিয়মিত, তবে পরিপক্কতার সময় এগুলি বৃত্তাকার হয়ে যায়। টি. সিউডোনানার ন্যানোস্কেল কাঠামো জিনগতভাবে মধ্যস্থতা করা হয়। সিলিসিফিকেশন প্রক্রিয়ায় অণুগুলির তিনটি বিভাগ রয়েছেঃ সিলফিন, যা অত্যন্ত অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তিত ফসফোপ্রোটিন; লং চেইন পলিঅ্যামাইন (এলসিপিএ); এবং সিলাসিডিন, যা অ্যাসিডিক প্রোটিন। ভালভ সংশ্লেষণের সময়, সিলাফিন 3-এর জন্য এম. আর. এন. এ মাত্রা বৃদ্ধি পায় এবং মূল স্তর গঠনের দিকে পরিচালিত করে। সিল্যাফিন 3-এর কম ঘনত্বের উপস্থিতি বা সিল্যাফিন 1 এবং 2-এর হালকা রূপ গোলাকার সিলিকা কাঠামো তৈরির দিকে পরিচালিত করে, যা শৈলশিরায় গোলাকার সিলিকা গঠনের সাথে জড়িত সম্ভাব্য প্রক্রিয়াগুলিকে নির্দেশ করে। টি. সিউডোনানার সিলিকন বায়োমিনারালাইজেশনে 150টিরও বেশি জিন ভূমিকা পালন করছে বলে চিহ্নিত করা হয়েছে। 75টি জিনের একটি সেট শুধুমাত্র সিলিকন সীমাবদ্ধতার সময় নিয়ন্ত্রিত হয়েছিল, যেখানে 84টি জিন সিলিকন এবং লোহা উভয় সীমাবদ্ধতার দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয়েছিল, যা তাদের লোহা এবং সিলিকন পথের মধ্যে একটি যোগসূত্র নির্দেশ করে। টি. সিউডোনানায় চিটিন-ভিত্তিক স্ক্যাফোল্ডও রয়েছে যা তাদের জৈবসিলিকা কাঠামো গঠনে গুরুত্বপূর্ণ। সিম্বায়োসিস থ্যালাসিওসিরা সিউডোনানা এবং হেটেরোট্রফিক আলফাপ্রোটিওব্যাকটেরিয়াম রুয়েজেরিয়া পোমেরয়ি নারকেল চাষে একটি রাসায়নিক সিম্বায়োসিস গঠন করে। ব্যাকটেরিয়া ডায়াটমগুলিতে ভিটামিন বি12 সরবরাহ করে, যা বিনিময়ে ব্যাকটেরিয়াকে জৈব পুষ্টি সরবরাহ করে। ডায়াটমের উপস্থিতিতে, ব্যাকটেরিয়া ডাইহাইড্রোক্সিপ্রোপেনসালফোনেট (ডিএইচপিএস)-এর জন্য একটি পরিবাহক তৈরি করতে শুরু করে, যা ব্যাকটেরিয়ার জন্য ডায়াটম দ্বারা উত্পাদিত একটি পুষ্টি। ডাইনোরোসোব্যাক্টর শিবা এবং টি. সিউডোনানা ব্যাকটেরিয়ার মধ্যে সংযোগের একটি বিপাকীয় সমীক্ষায় দেখা গেছে যে টি. সিউডোনানার বৃদ্ধিতে ব্যাকটেরিয়ার ন্যূনতম প্রভাব রয়েছে, তবে এটি ডায়াটমের ইন্ট্রাসেলুলার অ্যামিনো অ্যাসিড এবং অ্যামিনো অ্যাসিড ডেরিভেটিভসকে নিয়ন্ত্রণ করে বিপাকীয় পরিবর্তন ঘটায়। এটি প্রদর্শিত হয়েছে যে পরিবেশগত অস্থিতিশীলতা এবং চরম উষ্ণায়নের পরিস্থিতিতে, বায়োফিল্ম গঠন টি. সিউডোনানার বিবর্তনীয় প্রতিক্রিয়াকে ত্বরান্বিত করতে পারে। তথ্যসূত্র আরও পড়া থালাসিওসিরালেস মডেল জীব প্রজাতি 1873 সালে বর্ণিত