PTPRT
রিসেপ্টর-টাইপ টাইরোসিন-প্রোটিন ফসফেটেজ টি হল একটি উৎসেচক যা মানুষের মধ্যে পিটিপিআরটি জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। পিটিপিআরটি পিটিপিআরহো, পিটিপিআরও এবং হিউম্যান এক্সিলারেটেড অঞ্চল 9 নামেও পরিচিত। মানব ত্বরান্বিত অঞ্চলগুলি মানব জিনোমের 49 টি অঞ্চল যা মেরুদণ্ডী প্রাণীর মধ্যে সংরক্ষিত, তবে মানুষের মধ্যে অন্যান্য মেরুদণ্ডী প্রাণীর থেকে উল্লেখযোগ্য পার্থক্য দেখায়। অতএব, এই অঞ্চলটি বানর থেকে মানুষকে আলাদা করার ক্ষেত্রে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করতে পারে। ফাংশন এই জিন দ্বারা এনকোড করা প্রোটিন প্রোটিন টাইরোসিন ফসফেটেজ (পিটিপি) পরিবারের সদস্য। পি. টি. পি সংকেতকারী অণু হিসাবে পরিচিত যা কোষের বৃদ্ধি, পৃথকীকরণ, মাইটোটিক চক্র এবং অনকোজেনিক রূপান্তর সহ বিভিন্ন কোষীয় প্রক্রিয়া নিয়ন্ত্রণ করে। পি. টি. পি. রো স্নায়ুতন্ত্রের বিকাশের সময় এবং ক্যান্সারে টিউমার দমনকারী হিসাবে কাজ করার প্রস্তাব দেওয়া হয়েছে। কাঠামো এই পি. টি. পি-তে একটি বহির্কোষীয় অঞ্চল, একটি একক ট্রান্সমেম্ব্রেন অঞ্চল এবং দুটি ট্যান্ডেম আন্তঃকোষীয় অনুঘটক ক্ষেত্র রয়েছে এবং এইভাবে এটি একটি রিসেপ্টর-টাইপ পি. টি. পি (আর. পি. টি. পি)-কে উপস্থাপন করে। বহির্মুখী অঞ্চলে একটি মেপ্রিন-এ5 অ্যান্টিজেন-পিটিপিমু (এমএএম) ডোমেন, একটি আইজি-সদৃশ ডোমেন এবং চারটি ফাইব্রোনেক্টিন টাইপ III-সদৃশ পুনরাবৃত্তি রয়েছে। পিটিপিআরহো আরপিটিপি-র টাইপ আর2বি উপপরিবারের সদস্য, যার মধ্যে রয়েছে আরপিটিপি-র পিটিপিমু (পিটিপিআরএম), পিটিপিকাপ্পা (পিটিপিআরকে) এবং পিসিপি-2 (পিটিপিআরইউ)। আর2বি সিডিএনএ সিকোয়েন্সের তুলনা সনাক্ত করে যে পিটিপিএমইউ পিটিপিআরহোর সাথে সবচেয়ে ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত। পি. টি. পি. রো বিকল্পভাবে বিভক্ত করা হয়। পি. টি. পি. রো (পি. টি. পি. আর. টি)-এর জন্য 14,16 এবং 22এ এক্সনের বিকল্প বিভাজন বর্ণনা করা হয়েছে। এই জিনের দুটি বিকল্পভাবে বিভক্ত প্রতিলিপি রূপ, যা স্বতন্ত্র প্রোটিনগুলিকে এনকোড করে, রিপোর্ট করা হয়েছে। প্রথম আইসোফর্মটি প্রোটিনের বৃহত্তর সংস্করণকে এনকোড করে। দ্বিতীয় রূপটিতে চতুর্থ এফএনআইআই ডোমেইন এবং ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেইনের মধ্যে এবং জক্সটামেম্ব্রেন ডোমেইনের মধ্যে এক্সট্রাসেলুলার ডোমেইনের একটি অঞ্চলের অভাব রয়েছে। হোমোফিলিক বন্ধন পি. টি. পি. রো প্রোটিন হোমোফিলিক কোষ-কোষ সংলগ্নতার মধ্যস্থতা করে, যার অর্থ হল যখন এটি একটি সংলগ্ন কোষে অনুরূপ অণুর সাথে মিথস্ক্রিয়া করে তখন এটি কোষগুলিকে একে অপরের সাথে আবদ্ধ বা আঁকড়ে থাকতে প্ররোচিত করে। অন্যান্য ধরনের আর2বি উপপরিবারের সদস্যদের মতো কোষ-কোষ সমষ্টির মধ্যস্থতা করার জন্য পিটিপিআরহো অন্যান্য উপপরিবারের সদস্যদের সাথে আবদ্ধ হয় না। কোষ-কোষ একত্রীকরণের জন্য এমএএম ডোমেইন, আইজি ডোমেইন এবং পিটিপিআরহোর চারটি ফাইব্রোনেক্টিন তৃতীয় ডোমেইনের প্রয়োজন। কোলন, ফুসফুস, ত্বক এবং পাকস্থলীর ক্যান্সারে পি. টি. পি. রো হল সবচেয়ে ঘন ঘন পরিবর্তিত আর. পি. টি. পি। ক্যান্সারে পর্যবেক্ষণ করা অনেকগুলি মিউটেশন পিটিপিরোর এক্সট্রাসেলুলার ডোমেনে ঘটে, যা পরামর্শ দেয় যে ত্রুটিযুক্ত কোষ-কোষের সমষ্টি এই মিউটেশনের টিউমারজেনিসিটিতে অবদান রাখতে পারে। যখন পি. টি. পি. রো প্রোটিনগুলি ক্যান্সারে পর্যবেক্ষণ করা বিভিন্ন পয়েন্ট মিউটেশনের সাথে ইঞ্জিনিয়ার করা হয় এবং তারপরে অ-অনুসারী এস. এফ 9 কোষে প্রকাশিত হয়, তখন এই কোষগুলি বন্য-ধরনের পি. টি. পি. রো-র সাথে কোষ-কোষের সমষ্টির তুলনামূলক মাত্রার মধ্যস্থতা করে না, যা প্রমাণ করে যে ক্যান্সারে পর্যবেক্ষণ করা মিউটেশনগুলি কার্যকারিতা মিউটেশনের ক্ষতি। টাইরোসিন ফসফেটেজ ক্রিয়াকলাপ টাইপ আর2বি আরপিটিপি-র প্রথম অনুঘটক ক্ষেত্রটিকে সক্রিয় ফসফেটেজ ক্ষেত্র হিসাবে বিবেচনা করা হয়, যেখানে দ্বিতীয় ফসফেটেজ ক্ষেত্রটিকে নিষ্ক্রিয় বলে মনে করা হয়। যাইহোক, পি. টি. পি. রো-র দ্বিতীয় ফসফেটেজ ডোমেনে রূপান্তরের ফলে পি. টি. পি. রো-র ফসফেটেজ ক্রিয়াকলাপ হ্রাস পায়। কোলোরেক্টাল ক্যান্সার কোষে দ্বিতীয় টাইরোসিন ফসফেটেজ ডোমেনটি মুছে ফেলা পিটিপিআরহো অনুঘটক ক্রিয়াকলাপকেও হ্রাস করে, আবার প্রমাণ করে যে পিটিপিআরহোর দ্বিতীয় ফসফেটেজ ডোমেনটি প্রত্যক্ষ বা পরোক্ষভাবে অনুঘটক ক্রিয়াকলাপ নিয়ন্ত্রণ করে। পি. টি. পি. রো-র অনুঘটক ক্রিয়াকলাপ টাইরোসিন কাইনেজ দ্বারা টাইরোসিন 912-এ প্রথম টাইরোসিন ফসফেটেজ ডোমেনের ওয়েজ ডোমেনের টাইরোসিন ফসফোরিলেশন দ্বারাও নিয়ন্ত্রিত হতে পারে। Y912-এর টাইরোসিন ফসফোরিলেশনের ফলে অন্যান্য PTPrho অণুর সাথে সম্ভবত CIS-এ PTPrho-এর মাল্টিমেরাইজেশন বৃদ্ধি পায়। স্ফটিক কাঠামো বিশ্লেষণ এবং মডেলিংয়ের উপর ভিত্তি করে, ফসফরিলেটেড ওয়েজ ডোমেনটি প্রতিবেশী পিটিপিআরহো অণুর অনুঘটক ডোমেনে ঢোকানোর জন্য অনুমান করা হয়, এইভাবে এটি নিষ্ক্রিয় করে। আরপিটিপালফার অনুঘটক ক্রিয়াকলাপ নিয়ন্ত্রণের জন্যও এই প্রক্রিয়াটি প্রস্তাব করা হয়েছে। পি. টি. পি. এম. ইউ এবং এল. এ. আর-এর স্ফটিক কাঠামো তাদের অনুঘটক ক্রিয়াকলাপ নিয়ন্ত্রণের জন্য একটি ভিন্ন পদ্ধতির পরামর্শ দেয়, কারণ এই আর. পি. টি. পিগুলি ডাইমারাইজ করার সময় একটি উন্মুক্ত এবং সক্রিয় গঠনে থাকে। জিন অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ পিটিপিআরহো (পিটিপিআরটি) সিডিএনএ-র 5 'অ-অনুবাদিত অঞ্চলের মূল্যায়ন এপি-2, সি-মাইব, এনএফ-1, সোক্স-5, এবং এসপি-1, অক্টোবর-1, সিডিএক্সএ, সি/ইবিপি, এন-1, জিএটিএ-1, জিএটিএ-2, জিকেএলএফ, হোক্সএ 3, আইকে-2, এমএসএক্স-1, প্যাক্স-4 এবং এসআরওয়াই সহ বেশ কয়েকটি ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর বাইন্ডিং সাইট ঐক্যমত্য ক্রম নির্দেশ করে। (আরই1-সাইলেন্সিং ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর) (আরইএসটি) একটি ট্রান্সক্রিপশন রিপ্রেসার যা 5 'ইউটিআর-এ আরইএসটি ডিএনএ স্বীকৃতি উপাদানের (আরই-1) সাথে আবদ্ধ হয়। ডি. এন. এ সিকোয়েন্সের আর. ই. এস. টি বাঁধাই অঞ্চলের মধ্যে একক নিউক্লিওটাইড পলিমরফিক জেনেটিক পরিবর্তনের একটি পর্দা পি. টি. পি. রো (পি. টি. পি. আর. টি)-এর আর. ই-1-এ একটি পলিমরফিজম প্রকাশ করে। এই এস. এন. পি-র ফলে আর. ই. এস. টি দমনকারী ক্রিয়াকলাপ কম হবে, যা এই এস. এন. পি-কে আশ্রয় দেওয়া কোষে পি. টি. পি. রো (পি. টি. পি. আর. টি)-এর অভিব্যক্তি বাড়িয়ে তুলতে পারে। কোলন, ফুসফুস, ত্বক এবং পাকস্থলীর ক্যান্সারে সবচেয়ে ঘন ঘন পরিবর্তিত আর. পি. টি. পি হল পি. টি. পি. রো ক্যান্সারের প্রকাশ এবং কার্যকারিতা। ক্যান্সারে পি. টি. পি. রো-তে পর্যবেক্ষণ করা সাইটোপ্লাজমিক মিউটেশনের মূল্যায়ন দেখায় যে এগুলি সমস্ত অনুঘটক ক্রিয়াকলাপকে হ্রাস করে, এমনকি দ্বিতীয় অনুঘটক ডোমেনে অবস্থিত মিউটেশনগুলিও। ক্যান্সারে পিটিপিআরহোর সাইটোপ্লাজমিক টাইরোসিন ফসফেটেজ ডোমেনে মিউটেশনের ফ্রিকোয়েন্সি বিতর্কিত হয়েছে। পি. টি. পি. রো (পি. টি. পি. আর. টি) প্রবর্তককে নিয়ন্ত্রণের তুলনায় কোলোরেক্টাল ক্যান্সারে হাইপারমেথাইলেটেড হিসাবে দেখা গেছে, যা আরেকটি পদ্ধতির পরামর্শ দেয় যার মাধ্যমে ক্যান্সারে পি. টি. পি. রো ফাংশন হ্রাস করা যেতে পারে, এই ক্ষেত্রে এপিজেনেটিক সাইলেন্সিং দ্বারা। এস্ট্রোজেন রিসেপ্টর আলফা পজিটিভ স্তন টিউমারের নমুনা বনাম এস্ট্রোজেন রিসেপ্টর আলফা নেগেটিভ টিউমারের নমুনায়ও পিটিপিআরহো নিয়ন্ত্রিত হয়। লেখকরা ইস্ট্রোজেন রিসেপ্টর আলফা পজিটিভ টিস্যুতে রিয়েল-টাইম কোয়ান্টিটেটিভ রিভার্স ট্রান্সক্রিপশন-পলিমারেজ চেইন রিঅ্যাকশন (আরটি-পিসিআর) দ্বারা 560টি নির্বাচিত জিনের মূল্যায়ন করেছেন এবং এটিকে ইস্ট্রোজেন রিসেপ্টর আলফা নেগেটিভ টিস্যুর সাথে তুলনা করেছেন এবং দেখেছেন যে পি. টি. পি. রো (পি. টি. পি. আর. টি) ইস্ট্রোজেন রিসেপ্টর আলফা টিস্যুতে নিয়ন্ত্রিত ছিল, যা পি. টি. পি. রো-র জন্য একটি অ-টিউমার দমনকারী ভূমিকার পরামর্শ দেয়। উন্নয়নশীল স্নায়ুতন্ত্রে অভিব্যক্তি এবং কার্যকারিতা পি. টি. পি. রো (পি. টি. পি. আর. টি) এম. আর. এন. এ বিকাশমান স্নায়ুতন্ত্রে প্রকাশিত হয়। এর অভিব্যক্তি প্রথম দেখা যায় 25তম পর্যায়ে জেনোপাস ভ্রূণের উন্নয়নশীল অপটিক ভেসিকেলে এবং মেরুদণ্ডের নেসেন্ট মোটর এবং ইন্টারনিউরনগুলিতে। পর্যায় 35/36-এ, পি. টি. পি. রো (পি. টি. পি. আর. টি) অভিব্যক্তি বাইরের পারমাণবিক, বা ফোটোরিসেপ্টর, স্তরে এবং নিউরাল রেটিনার অভ্যন্তরীণ পারমাণবিক স্তরে (আই. এন. এল) পাওয়া যায়। পি. টি. পি. রো (পি. টি. পি. আর. টি) প্রতিলিপির মাত্রা ফোটোরিসেপ্টরগুলিতে হ্রাস পায় এবং আই. এন. এল-এ বৃদ্ধি পায়, এবং পর্যায় 41 দ্বারা, শুধুমাত্র আই. এন. এল-এর মধ্যে সীমাবদ্ধ থাকে। উন্নয়নশীল কর্টেক্স এবং ঘ্রাণকারী বাল্বগুলিতেও পি. টি. পি. রো (পি. টি. পি. আর. টি) প্রতিলিপি দেখা গেছে। পি. টি. পি. রো (পি. টি. পি. আর. টি) প্রসবোত্তর সেরিবেলার কর্টেক্স, গ্রানুল কোষ স্তরের নিউরনের একটি খুব নির্দিষ্ট উপসেটে প্রকাশিত হয়। বিশেষত, পি. টি. পি. রো (পি. টি. পি. আর. টি) সেরিবেলামের 1 থেকে 6 টি লোবিউলের অভিবাসন পরবর্তী গ্রানুল কোষে প্রকাশ করা হয়েছিল। প্রাপ্তবয়স্কদের মধ্যে, পিটিপিআরহো প্রোটিন একচেটিয়াভাবে কেন্দ্রীয় স্নায়ুতন্ত্রে প্রকাশিত হয় এবং নিউরনের মধ্যে সিনাপসে স্থানীয়করণ করে। পি. টি. পি. আর. হো-র বন্য-ধরনের এবং অনুঘটকগতভাবে নিষ্ক্রিয় মিউট্যান্ট ফর্মগুলির অত্যধিক প্রকাশের ফলে ভিট্রোতে কালচারড নিউরনে উত্তেজক এবং প্রতিরোধমূলক সিনাপ্সের সংখ্যা বৃদ্ধি পায়। পিটিপিআরহো এক্সপ্রেশনের নক-ডাউন কালচারড নিউরনে সিনাপ্সের সংখ্যা হ্রাস করে। পি. টি. পি. রো সিনাপ্সে নিউরোলিজিন এবং নিউরেক্সিন-এর এক্সট্রাসেলুলার ডোমেনের সাথে সিস-এ মিথস্ক্রিয়া করে। পি. টি. পি. রো ফাইনো টাইরোসিন কাইনেজ দ্বারা তার প্রথম অনুঘটক ডোমেনের ওয়েজ অঞ্চলে টাইরোসিন 912-এ ফসফোরিলেটেড হয়। এই স্থানে ফসফোরিলেশন কালচারড নিউরনে সিনাপ্স গঠনকে হ্রাস করে। যখন পি. টি. পি. আরহো ফাইনের দ্বারা ফসফোরিলেটেড হয়, তখন পি. টি. পি. আরহো হোমোফিলিক মাল্টিমেরাইজেশন গঠন করে বলে মনে হয়, সম্ভবত সিস-এ, যা নিউরোলিগিন এবং নিউরেক্সিনগুলির সাথে পি. টি. পি. আরহো সংযোগ হ্রাস করে বলে মনে হয়। নিউরোলিজিন এবং নিউরেক্সনের সাথে সিস মিথস্ক্রিয়া হ্রাসের ফলে শেষ পর্যন্ত সিনাপ্স গঠন হ্রাস পায় বলে অনুমান করা হয়। নিউরোনাল ডেনড্রাইটের বিকাশের জন্য পি. টি. পি. রো কার্যকলাপও প্রয়োজনীয় বলে প্রমাণিত হয়েছে। এটি ব্রেকপয়েন্ট ক্লাস্টার অঞ্চল প্রোটিনের (বিসিআর) ডিফসফোরিলেটিং টাইরোসিন 177 দ্বারা ডেনড্রাইটিক আর্বোরাইজেশন নিয়ন্ত্রণ করতে দেখা গেছে। মস্তিষ্কের হোমোজিনেট ব্যবহার করে জিএসটি-ফিউশন প্রোটিন পুল-ডাউন অ্যাসেস দ্বারা প্রদর্শিত হিসাবে সাবস্ট্রেটস পিটিপিআরহো কোষের আঠালো অণুর ক্যাডেরিন এবং ক্যাটেনিন পরিবারের সদস্যদের সাথে যুক্ত হয়। এই কৌশলটি ব্যবহার করে, লেখকরা চিহ্নিত করেছেন যে পিটিপিআরহো আলফা-অ্যাক্টিনিন, আলফা-ক্যাটেনিন, বিটা-ক্যাটেনিন, গামা-ক্যাটেনিন/প্লাকোগ্লোবিন, পি120 ক্যাটেনিন, ডেসমোগলিন, ই-ক্যাডেরিন, এন-ক্যাডেরিন এবং ভিই-ক্যাডেরিন-এর সাথে মিথস্ক্রিয়া করে। বিশুদ্ধ বন্য-ধরনের পিটিপিআরহো জিএসটি ফিউশন প্রোটিন অগ্ন্যাশয়ের বিটা সেল লাইন, এমআইএন 6-এম 9 থেকে ই-ক্যাডেরিন এবং পি120ক্যাটেনিন সহ-ইমিউনোপ্রিসিপিটেডকে ডিফসফোরিলেট করতে সক্ষম হয়েছিল। এর থেকে বোঝা যায় যে এই প্রোটিনগুলি হল পি. টি. পি. রো সাবস্ট্রেট। পি. টি. পি. রো বি. সি. আর প্রোটিনকে ডিফসফোরিলেট করে। নিউরোনাল ডেনড্রাইটিক আর্বোরাইজেশনের স্বাভাবিক বিকাশের জন্য পি. টি. পি. রো থেকে ডিফসফোরিলেট বি. সি. আর-এর কার্যকরী পরিণতি দেখা গেছে। পি. টি. পি. রো ডিফসফোরিলেটস স্ট্যাট3, সিগন্যাল ট্রান্সডিউসার এবং ট্রান্সক্রিপশন 3-এর অ্যাক্টিভেটর, টাইরোসিন 705-এ, একটি অবশিষ্টাংশ যা স্ট্যাট3-এর সক্রিয়করণের জন্য গুরুত্বপূর্ণ। কোলোরেক্টাল ক্যান্সার কোষে পি. টি. পি. রো দ্বারা ডিফসফোরাইলেশন এর ফলে বি. সি. এল-এক্স. এল এবং এস. ও. সি. এস 3-এর এস. টি. এ. টি 3 লক্ষ্য জিনের প্রতিলিপির মোট মাত্রা হ্রাস পায়। একইভাবে, বন্য-ধরনের পি. টি. পি. রো-র অভিব্যক্তি নিউক্লিয়াসে স্থানান্তরিত হওয়ার জন্য এস. টি. এ. টি 3-এর ক্ষমতা হ্রাস করে, যেখানে এটি একটি প্রতিলিপি ফ্যাক্টর হিসাবে কাজ করার জন্য স্থানীয়করণ করা প্রয়োজন। পি. টি. পি. রো টাইরোসিন 88-এ প্যাক্সিলিনকে ডিফসফোরিলেট করে। কোলন ক্যান্সারে প্যাক্সিলিনের উচ্চ মাত্রার টাইরোসিন 88 ফসফোরাইলেশন লক্ষ্য করা যায়। যখন কোলন ক্যান্সার কোষগুলি প্যাক্সিলিনের একটি মিউট্যান্ট ফর্ম প্রকাশ করার জন্য ইঞ্জিনিয়ার করা হয় যা টাইরোসিন ফসফোরিলেটেড হতে অক্ষম, প্যাক্সিলিন Y88F মিউট্যান্ট, এই কোষগুলি টিউমারিজেনিসিটি হ্রাস করে। এর থেকে বোঝা যায় যে প্যাক্সিলিন ফসফোরিলেশন নিয়ন্ত্রণ করে পি. টি. পি. রো টিউমার দমনকারী প্রোটিন হিসাবে কাজ করতে পারে। আন্তঃক্রিয়াশীল প্রোটিন পি. টি. পি. আর. এইচ. ও-র সাথে মিথস্ক্রিয়া দেখানো হয়েছেঃ আলফা-অ্যাক্টিনিন আলফা-ক্যাটেনিন বিটা-ক্যাটেনিন ব্রেকপয়েন্ট ক্লাস্টার অঞ্চল প্রোটিন (বি. সি. আর) ডেসমোগলিন ই-ক্যাডেরিন ফিন এন-ক্যাডেরিন গামা-ক্যাটেনিন পি120-ক্যাটেনিন প্যাক্সিলিন নিউরোলিগিন নিউরেক্সিন স্ট্যাট3 ভি. ই-ক্যাডেরিন/ক্যাডেরিন-5 আরও পড়ুন