Microbiome-wide association study
একটি মাইক্রোবায়োম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডি (এম. ডব্লিউ. এ. এস), অন্যথায় একটি মেটাজেনম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডি (এম. জি. ডব্লিউ. এ. এস) নামে পরিচিত, একটি পরিসংখ্যানগত পদ্ধতি যা বিভিন্ন জীবের মধ্যে একটি সংজ্ঞায়িত মাইক্রোবায়োমের সম্পূর্ণ মেটাজেনম পরীক্ষা করতে ব্যবহৃত হয় যাতে নির্ধারণ করা যায় যে মাইক্রোবায়োমের কিছু বৈশিষ্ট্য (উদাহরণস্বরূপ, জিন বা প্রজাতি) একটি হোস্ট বৈশিষ্ট্যের সাথে যুক্ত কিনা। ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডি (জি. ডব্লিউ. এ. এস) থেকে মেটাজেনমিক্সের ক্ষেত্রে এম. ডব্লিউ. এ. এস গ্রহণ করা হয়েছে। যদিও এম. ডব্লিউ. এ. এস ধ্বনিগতভাবে এবং ধারণাগতভাবে জি. ডব্লিউ. এ. এস-এর সঙ্গে যুক্ত, সেখানে বেশ কয়েকটি মূল পার্থক্য রয়েছেঃ মানব জিনোমের তুলনায় মাইক্রোবায়োমের মধ্যে প্রায় 150 গুণ বেশি জিন রয়েছে। একটি জি. ডব্লিউ. এ. এস-কে অবশ্যই প্রজাতির ক্রোমোজোমের পূর্বনির্ধারিত সংখ্যা বরাবর উল্লেখযোগ্যভাবে সম্পর্কিত জিন খুঁজে বের করতে হবে। অন্যদিকে, এম. ডব্লিউ. এ. এস-কে অবশ্যই বিশ্লেষণ করতে হবে যদিও অনেকগুলি বৈশিষ্ট্য অনির্ধারিত সংখ্যক অণুজীবের মধ্যে রয়েছে। ফলস্বরূপ, একাধিক পরীক্ষার সমস্যায় পড়ার সম্ভাবনা অনেক বেশি। হোস্ট জনসংখ্যায় জিনোমে জিনের তুলনামূলকভাবে অনুরূপ সংগ্রহ থাকলেও, যে কোনও মাইক্রোবায়োমের জিনগত বৈচিত্র্য বিভিন্ন হোস্ট এবং পরিবেশের মধ্যে উল্লেখযোগ্যভাবে পরিবর্তিত হতে পারে। মাইক্রোবায়োমের জিনোম একটি প্রদত্ত পোষকের মধ্যে সাময়িকভাবে পরিবর্তিত হতে পারে যখন একটি জি. ডব্লিউ. এ. এস-এ পোষকের জিনোম তাদের জীবনকাল জুড়ে স্থির থাকে। উপলব্ধি করা মাইক্রোবায়োম ডেটাসেটগুলি সহজাতভাবে গঠনমূলক এবং মিথস্ক্রিয়াশীল। একটি ইউক্লিডীয় স্থানে জিনগুলির অস্তিত্বের ধারণাটি গঠনমূলক তথ্যের অ-রৈখিক প্রকৃতির দ্বারা লঙ্ঘন করা হয়। এম. ডব্লিউ. এ. এস-এ মাইক্রোবায়োমের কোন বৈশিষ্ট্যটি ব্যবহার করা হবে তা শ্রেণীবদ্ধ করার বিভিন্ন উপায় রয়েছে। এম. ডব্লিউ. এ. এস-কে একটি নির্দিষ্ট শ্রেণীবিন্যাস স্তর (প্রজাতি, গণ, ফাইলা ইত্যাদি) ব্যবহার করে মূল্যায়ন করা যেতে পারে। ), অপারেশনাল ট্যাক্সোনমিক ইউনিট (ওটিইউ) বা এম্পলিকন সিকোয়েন্স ভ্যারিয়েন্ট (এএসভি), ট্রান্সক্রিপ্টোম, প্রোটিওম এবং আরও অনেক কিছু। ব্যবহৃত পদ্ধতিটি গবেষণা অনুমানের উপর নির্ভর করে কারণ প্রতিটি পদ্ধতি প্রায়শই ভিন্ন ফলাফল দেয়। প্রায়শই, একটি ট্যাক্সোনমিক স্তর বা ওটিইউ/এএসভি ভিত্তিক পদ্ধতি নির্দিষ্ট মাইক্রোবায়োম বৈশিষ্ট্য এবং পছন্দসই ফেনোটাইপের মধ্যে সম্পর্ক নির্ধারণ করতে ব্যবহৃত হয়। বেশ কয়েকটি পদ্ধতি ব্যবহার করা যেতে পারে, যেমন এলোমেলো বন এবং গভীর শিক্ষার মতো মেশিন লার্নিং পদ্ধতি। ডি. ই. এস. ই. কিউ2 এবং এ. এন. সি. ও. এম-এর মতো প্রোগ্রামগুলির সঙ্গেও ফিচার অ্যাসোসিয়েশন স্থাপন করা যেতে পারে। যাইহোক, উপলব্ধ সরঞ্জামগুলির বিস্তৃত বিন্যাস দ্বারা প্রতিষ্ঠিত পারস্পরিক সম্পর্কগুলি সর্বদা কার্যকারিতায় রূপান্তরিত নাও হতে পারে। গবেষকরা ক্রমানুসারে পরীক্ষার মাধ্যমে কার্যকারণ নির্ধারণ করেন। তথ্যসূত্র মেটাজেনমিক্স