Transmembrane protein 89
ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিন 89 (টি. এম. ই. এম. 89) হল একটি প্রোটিন যা মানুষের মধ্যে টি. এম. ই. এম. 89 জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। জিন কাঠামো টি. এম. ই. এম. 89 জিনটি ক্রোমোজোম 3 (<আই. ডি. 1>)-এর মাইনাস স্ট্র্যান্ডে <আই. ডি. 3> থেকে <আই. ডি. 2> পর্যন্ত পাওয়া যায় এবং এটি 1,011 নিউক্লিওটাইড দীর্ঘ। জিনের দুটি এক্সোন থাকে। এই দুটি এক্সন বিকল্পভাবে বিভক্ত হওয়ার পূর্বাভাস দেওয়া হয় না। জিন অভিব্যক্তি টি. এম. ই. এম. 89 জিনটি অণ্ডকোষের মধ্যে সবচেয়ে বেশি প্রকাশিত হয়। টি. এম. ই. এম. 89 অন্যান্য টিস্যু যেমন পেট, কিডনি, হৃৎপিণ্ড, ডিম্বাশয়, থাইরয়েড, কোলন, অস্থি মজ্জা এবং অ্যাড্রিনাল টিস্যুতেও নিম্ন মাত্রায় প্রকাশিত হতে দেখা যায়। এই জিনটি ভ্রূণের হৃৎপিণ্ড, পাকস্থলী, কিডনি এবং অন্ত্রের টিস্যুতেও প্রকাশিত হয়। ইমিউনোহিস্টোকেমিস্ট্রি ডেটা কোলন, ফ্যালোপিয়ান টিউব, কিডনি এবং টেস্টিস টিস্যুর কোষের ঝিল্লিতে অবস্থিত টিএমইএম89 খুঁজে পেয়েছে। টি. এম. ই. এম. 89 জিনের অভিব্যক্তি একটি মাউস সেরিবেলাম থেকে মস্তিষ্কের টিস্যুতে কম পরিমাণে পাওয়া গেছে। হিউম্যান টি. এম. ই. এম. 89 হিউম্যান প্রোটিন অ্যাটলাস এক্সপ্রেশন ক্লাস্টার 23: স্পার্মাটিডস-ফ্ল্যাজেলাম এবং গলগি সংস্থার একটি অংশ। 15টি নিকটতম অভিব্যক্তি প্রতিবেশীদের মধ্যে রয়েছে OR4M1, ANTXRL, TGIF2LX, CPXCR1, C3orf84, CXorf66, CLDN17, C11orf94, USP50, SPDYE4, MMP20, SSMEM1, C17orf98, SPACA1, এবং LYZL1। অমর এইচ. আই. পি. ও. ডি লাইন কোষের তুলনায় অ্যামনিয়োটিক তরল থেকে প্রাপ্ত এইচ. এ. কে. পি. সি-পি কোষে ডিফারেনশিয়াল জিন এক্সপ্রেশন টি. এম. ই. এম. 89 এক্সপ্রেশন অনেক বেশি। নিয়ন্ত্রণের তুলনায় ম্যাক্রোফেজ মাইগ্রেশন ইনহিবিটরি ফ্যাক্টর (এম. আই. এফ) থাকা কোষগুলিতে টি. এম. ই. এম. 89 এক্সপ্রেশন বেশি হয়। মানব ভ্রূণের স্টেম কোষ থেকে কার্ডিওমায়োসাইটের মধ্যে টি. এম. ই. এম. 89 অভিব্যক্তি সর্বনিম্ন, মানব ভ্রূণের স্টেম কোষের অভিব্যক্তি, কার্ডিওমায়োসাইটের স্পন্দন সহ ভ্রূণ দেহ এবং ভ্রূণের হৃদয় থেকে কার্ডিওমায়োসাইটের তুলনায়। ক্লিনিকাল তাৎপর্য টি. এম. ই. এম. 89-এর জিন অভিব্যক্তি উপরের ট্র্যাক্টের ইউরোথেলিয়াল কার্সিনোমাতে নিয়ন্ত্রিত হতে দেখা গেছে এবং তাই এই ধরনের কার্সিনোমার জন্য একটি সম্ভাব্য বায়োমার্কার সিক্রেটরি প্রোটিন হিসাবে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। একটি এসএনপি বিশ্লেষণে টিএমইএম89 জিনটি অটিজম স্পেকট্রাম ডিসঅর্ডারের তীব্রতার একটি সম্ভাব্য পরিবর্তনকারী হিসাবে পাওয়া গেছে। টি. এম. ই. এম. 89-এর জিন অভিব্যক্তি এমন একটি মডেলেও ব্যবহার করা হয়েছিল যা স্টেজ 1 টেস্টিকুলার জার্ম সেল টিউমারে সম্ভাব্য পুনরাবৃত্তির জন্য ঝুঁকির স্কোরের পূর্বাভাস দিয়েছিল। প্রোটিন কাঠামো প্রাথমিক মানব টি. এম. ই. এম. 89 প্রোটিন 159টি অ্যামিনো অ্যাসিড দীর্ঘ। এই প্রোটিনের আণবিক ভর ~ 17.5kDa এবং একটি আইসোইলেক্ট্রিক বিন্দু ~ 10 পিআই রয়েছে। আরও মৌলিক পি. আই সহ প্রোটিনগুলি সাধারণত মাইটোকন্ড্রিয়া বা প্লাজমা ঝিল্লির সাথে যুক্ত থাকে এবং প্রোটিনের মিথস্ক্রিয়া কম থাকে। প্রোটিন কাঠামোতে দুটি টপোলজিকাল ডোমেন (এক্সট্রাসেলুলার এবং সাইটোপ্লাজমিক) এবং একটি হেলিকাল ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন রয়েছে। মানুষের টি. এম. ই. এম. 89 প্রোটিন হিস্টিডাইন, লিউসিন এবং ট্রিপ্টোফ্যানে সমৃদ্ধ। অ্যামিনো অ্যাসিড অ্যাস্পার্টেট, অ্যাস্পারাজিন এবং ফেনিল্যালানাইন মানুষের টি. এম. ই. এম89 প্রোটিনে কম পরিমাণে উপস্থিত থাকে। মানুষের টি. এম. ই. এম. 89 প্রোটিনে ইডি-র মতো অ্যামিনো অ্যাসিডের ধরণ কম পরিমাণে উপস্থিত থাকে, যেখানে কে. আর-ইডি প্যাটার্ন বেশি পরিমাণে উপস্থিত থাকে। মানব টি. এম. ই. এম. 89 প্রোটিনের বহির্কোষীয় ক্ষেত্রের মধ্যে নিয়মিত ব্যবধান সহ 3টি সিস্টিন রয়েছে। সাইটোপ্লাজমিক ডোমেনে, অ্যামিনো অ্যাসিড 3-5 এবং 25-27 থেকে দুটি ধনাত্মক অ্যামিনো অ্যাসিড প্রবাহিত হয়। এই বিভিন্ন অ্যামিনো অ্যাসিড প্যাটার্ন এবং প্রোটিন ডোমেনগুলি ডানদিকে চিত্রগুলিতে দৃশ্যমান করা যেতে পারে। দ্বিতীয়ত, টি. এম. ই. এম. 89 প্রোটিন শুধুমাত্র α-হেলিস এবং স্ট্র্যান্ড দিয়ে তৈরি। α-হেলিসগুলি তিনটি ক্ষেত্রেই প্রোটিন জুড়ে বিতরণ করা হয়। তৃতীয় মানব টি. এম. ই. এম. 89-এর তৃতীয় কাঠামোটি আলফাফোল্ড এবং আই-টাসার সফ্টওয়্যার ব্যবহার করে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল। এই কাঠামোগুলি ডানদিকে দেখা যায়। অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তনগুলি টি. এম. ই. এম. 89 প্রোটিনের অ্যামিনো অ্যাসিড <আই. ডি. 2> থেকে একটি পূর্বাভাসকৃত এন-মাইরিস্টিলেশন সাইট, অ্যামিনো অ্যাসিড <আই. ডি. 1> থেকে একটি পূর্বাভাসকৃত এস. আর. সি হোমোলজি 3 (এস. এইচ. 3) বাইন্ডিং ডোমেন এবং অ্যামিনো অ্যাসিড এস117-এ একটি সংরক্ষিত পূর্বাভাসকৃত ফসফোরিলেশন সাইট রয়েছে। এন-মাইরিস্টিলেশন হল একটি প্রোটিন লিপিড পরিবর্তন যা প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া, কোষ সংকেত এবং এন্ডোমেম্ব্রেন এবং প্লাজমা ঝিল্লিতে প্রোটিনকে লক্ষ্য করার ক্ষেত্রে ভূমিকা রাখে। এস. এইচ. 3 বাইন্ডিং ডোমেনের প্রোটিনগুলি সাধারণত সিগন্যাল ট্রান্সডাকশন পথ, সাইটোস্কেলেটন সংগঠন, ঝিল্লি পাচার বা অর্গানেল সমাবেশে জড়িত থাকে। প্রোটিন ফসফোরিলেশন একটি গুরুত্বপূর্ণ প্রক্রিয়া যা সংকেত সঞ্চালন, প্রোটিন সংশ্লেষণ, কোষ বিভাজন, কোষের বৃদ্ধি, বিকাশ এবং বার্ধক্যের সাথে জড়িত। মিথস্ক্রিয়া মানব টি. এম. ই. এম. 89 প্রোটিন সি4এ, আর. বি. এম. 15বি, জি. ও. এল. জি. এ. 6এ, পি. এফ. কে. এফ. বি4, ডি. ও. সি. কে3, এম. এ. পি. কে. এ. পি. কে3, জেড. এন. এফ. 557 এবং জেড. বি. টি. বি. 47 প্রোটিনের সাথে মিথস্ক্রিয়া করে। হোমোলগস অর্থোলগস টি. এম. ই. এম. 89-এর অর্থোলগস শুধুমাত্র স্তন্যপায়ী প্রাণীদের মধ্যে পাওয়া যায়। একমাত্র স্তন্যপায়ী ট্যাক্সন যা একটি টি. এম. ই. এম89 অর্থোলগ ধারণ করে না তা হল মনোট্রেমস। নীচে মানব টি. এম. ই. এম. 89-এর কিছু অর্থোলগের তথ্য সহ একটি টেবিল রয়েছে। এই অর্থোলোগগুলি একাধিক ক্রম সারিবদ্ধকরণ এবং ডানদিকে এন-মিরিস্টিলেশন সাইট সারিবদ্ধকরণ করতে ব্যবহৃত হয়েছিল। সংরক্ষিত অঞ্চলগুলি মানব টি. এম. ই. এম. 89 প্রোটিনের সাইটোপ্লাজমিক এবং এক্সট্রাসেলুলার ডোমেনের মধ্যে অঞ্চলগুলি সবচেয়ে বেশি সংরক্ষিত বলে মনে হয়, যা ডানদিকের চিত্রগুলিতে দেখা যায়। এই সংরক্ষিত অ্যামিনো অ্যাসিডগুলির মধ্যে কয়েকটি সাইটোপ্লাজমিক এবং এক্সট্রাসেলুলার অঞ্চলে α-হেলিসের অংশ। রেফারেন্স মানব ক্রোমোজোম 3-এর উপর জিন