Alan Christoffels
অ্যালান ক্রিস্টোফেলস একজন বায়োইনফরমেটিক্স বিজ্ঞানী, একাডেমিক এবং একজন লেখক। তিনি বায়োইনফরম্যাটিক্সের অধ্যাপক এবং ওয়েস্টার্ন কেপ বিশ্ববিদ্যালয়ের সাউথ আফ্রিকান ন্যাশনাল বায়োইনফরম্যাটিক্স ইনস্টিটিউটের পরিচালক। তিনি আফ্রিকা সেন্টারস ফর ডিজিজ কন্ট্রোল অ্যান্ড প্রিভেনশন প্যাথোজেন জিনোমিক্স অ্যান্ড পার্টনারশিপ এবং ডিএসআই/এনআরএফ রিসার্চ চেয়ার ইন বায়োইনফরম্যাটিক্স অ্যান্ড পাবলিক হেলথ জিনোমিক্সের সিনিয়র উপদেষ্টা হিসাবে দায়িত্ব পালন করেছেন। হোস্ট-প্যাথোজেন মিথস্ক্রিয়া, জিনোম বিবর্তন, প্যাথোজেন জিনোমিক্স এবং বায়োব্যাঙ্ক এল. আই. এম. এস-এর ক্ষেত্রে ক্রিস্টোফেলসের প্রাথমিক অবদান এবং গবেষণা কাজ রয়েছে। ক্রিস্টোফেলস গ্লোবাল ইমার্জিং প্যাথোজেনস কনসোর্টিয়ামের প্রতিষ্ঠাতা সদস্য, দক্ষিণ আফ্রিকার বিজ্ঞান একাডেমির নির্বাচিত সদস্য এবং 2020 থেকে 2022 সাল পর্যন্ত আফ্রিকান সোসাইটি ফর বায়োইনফরম্যাটিক্স অ্যান্ড কম্পিউটশনাল বায়োলজির সভাপতি। 2022 সালে তিনি দক্ষিণ আফ্রিকার রয়্যাল সোসাইটির ফেলো নির্বাচিত হন। শিক্ষা ক্রিস্টোফেলস বি. এসসি নিয়ে স্নাতক হন। 1992 সালে মাইক্রোবায়োলজি এবং বায়োকেমিস্ট্রিতে এবং বি. এসসি (অনার্স)। 1993 সালে কেপ টাউন বিশ্ববিদ্যালয় থেকে ফার্মাকোলজিতে। 1995 থেকে 1997 সালের মধ্যে তিনি এম. এসসি করার জন্য স্টেলেনবশ বিশ্ববিদ্যালয়ে ভর্তি হন। জেনেটিক্সে। তাঁর গবেষণা স্থানীয়ভাবে প্রচলিত হৃদরোগের (পি. এফ. এইচ. বি1) সূক্ষ্ম মানচিত্রে অভিনব চিহ্নিতকারী সনাক্তকরণের উপর কেন্দ্রীভূত ছিল। তিনি ওয়েস্টার্ন কেপ-এর সাউথ আফ্রিকান ন্যাশনাল বায়োইনফরম্যাটিক্স ইনস্টিটিউট ইউনিভার্সিটিতে বায়োইনফরম্যাটিক্সে পিএইচডি করেন। তাঁর থিসিসের শিরোনাম ছিল, "জেনারেশন অফ এ হিউম্যান জিন ইনডেক্স অ্যান্ড ইটস অ্যাপ্লিকেশন টু ডিজিজ প্রার্থীতা"। ক্রিস্টোফেলস 1994 সালে স্টেলেনবশ বিশ্ববিদ্যালয়ে মেডিকেল বায়োকেমিস্ট্রিতে জেনেটিক্স টেকনিশিয়ান হিসাবে তাঁর একাডেমিক কর্মজীবন শুরু করেন। 2001 থেকে 2004 সালের মধ্যে তিনি সিঙ্গাপুরের ইনস্টিটিউট অফ মলিকুলার অ্যান্ড সেল বায়োলজিতে পোস্টডক্টরাল ফেলোশিপ লাভ করেন। এই নিয়োগের পর তিনি সিঙ্গাপুর ভিত্তিক নানয়াং টেকনোলজিক্যাল ইউনিভার্সিটিতে সহকারী অধ্যাপক হিসেবে দায়িত্ব পালন করেন। পরে, তিনি 2007 থেকে 2012 সাল পর্যন্ত ওয়েস্টার্ন কেপ বিশ্ববিদ্যালয়ের সাউথ আফ্রিকান ন্যাশনাল বায়োইনফরম্যাটিক্স ইনস্টিটিউটে সহযোগী অধ্যাপকের পদে নিযুক্ত হন। 2013 সালে তিনি অধ্যাপক পদে উন্নীত হন এবং বর্তমানে এই পদে অধিষ্ঠিত। 2009 সাল থেকে ক্রিস্টোফেলস ওয়েস্টার্ন কেপ বিশ্ববিদ্যালয়ের সাউথ আফ্রিকান ন্যাশনাল বায়োইনফরম্যাটিক্স ইনস্টিটিউটের পরিচালক হিসেবে দায়িত্ব পালন করছেন। পরবর্তী পাঁচ বছর তিনি ইন্টারন্যাশনাল সোসাইটি ফর কম্পিউটশনাল বায়োলজি (আই. এস. সি. বি)-র পরিচালনা পর্ষদে দায়িত্ব পালন করেন। তিনি 2012 সাল থেকে বায়োইনফরম্যাটিক্স ক্যাপাসিটি ডেভেলপমেন্ট ইউনিটে এসএ মেডিকেল রিসার্চ কাউন্সিল ইউনিট ডিরেক্টর পদে নিযুক্ত রয়েছেন। পরে, তিনি সাউথ আফ্রিকান সোসাইটি ফর বায়োইনফরম্যাটিক্সের সহ-সভাপতি হিসাবে একটি সংক্ষিপ্ত নিয়োগ পেয়েছিলেন। তিনি 2020 সালে দুই বছরের মেয়াদে আফ্রিকান সোসাইটি অফ বায়োইনফরম্যাটিক্স অ্যান্ড কম্পিউটশনাল বায়োলজির সভাপতি হিসাবে নিযুক্ত হন। বিল অ্যান্ড মেলিন্ডা গেটস ফাউন্ডেশন কর্তৃক আহূত অংশীদারদের বৈঠকের পরে, ক্রিস্টোফেলস এবং তাঁর আন্তর্জাতিক অংশীদাররা 2019 সালের অক্টোবরে ইথিওপিয়ায় গ্র্যান্ড চ্যালেঞ্জ সভায় জিনোমিক এপিডেমিওলজির জন্য জনস্বাস্থ্য জোট নামে একটি বিশ্বব্যাপী উদ্যোগ শুরু করেছিলেন। তিনি এই উদ্যোগের প্রধান তদন্তকারী হিসাবে কাজ করেন। গবেষণাগারে উৎপাদিত গবেষণা প্রোটোটাইপগুলি জোটের মধ্যে ওয়ার্কিং গ্রুপগুলিতে সংহত করা হয়। রিসার্চ ক্রিস্টোফেলসের নামে 400টিরও বেশি প্রকাশনা রয়েছে। তাঁর গবেষণা হোস্ট-প্যাথোজেন মিথস্ক্রিয়া, প্যাথোজেন জিনোমিক্স, জিনোম বিবর্তন এবং জিনোম অ্যানোটেশন এবং সিকোয়েন্স ডেটা বিশ্লেষণের উপর বিশেষ দৃষ্টি নিবদ্ধ করে। জনস্বাস্থ্য বায়োইনফরম্যাটিক্স ক্রিস্টোফেলস এবং দক্ষিণ আফ্রিকার ন্যাশনাল বায়োইনফরম্যাটিক্স ইনস্টিটিউটে অবস্থিত তাঁর গবেষণাগারের বিজ্ঞানীদের একটি দল দক্ষিণ আফ্রিকায় পাওয়া সার্স-কোভ-2-এর প্রথম জিনোম সিকোয়েন্স উপস্থাপন করেছেন, যে ভাইরাসটি কোভিড-19 সৃষ্টি করে। তাঁর সাম্প্রতিক কাজের বৈশিষ্ট্য হল আফ্রিকা মহাদেশে রোগ নজরদারি ব্যবস্থা বাড়ানোর বিষয়ে গবেষণা পরিচালনা করা। ক্রিস্টোফেলস জনস্বাস্থ্যে বায়োইনফরমেটিক্স প্রয়োগের জন্য প্রযুক্তি তৈরি করেছেন। তিনি টিউবারকিউলোসিস সিকোয়েন্সিং ডেটার জন্য কমব্যাট-টিবি নামে একটি বিশ্লেষণ প্ল্যাটফর্ম তৈরি করেছেন। এই সরঞ্জামটি সম্পদ সীমিত সেটিংসে স্থাপন করা যেতে পারে। একদল গবেষকের সঙ্গে ক্রিস্টোফেলস সাউথ আফ্রিকান ন্যাশনাল বায়োইনফরম্যাটিক্স ইনস্টিটিউটে বায়োব্যাঙ্কিং, ল্যাবরেটরি ইনফরমেশন ম্যানেজমেন্ট সিস্টেম (এলআইএমএস)-এর জন্য একটি পরিচালন ব্যবস্থা তৈরি করেন। পরিচালন ব্যবস্থার উদ্দেশ্য হল জৈব নমুনাগুলি যথাযথভাবে সংগ্রহ করা, সংরক্ষণ করা, প্রক্রিয়া করা এবং পরিচালনা করা। এই মানব জৈব ব্যাঙ্কিং ব্যবস্থা প্লোন ওয়েব-কন্টেন্ট ম্যানেজমেন্ট কাঠামোর উপর ভিত্তি করে তৈরি। রোগ ভেক্টর ক্রিস্টোফেলস তাঁর জিনোমিক্স গবেষণাকে রোগের ভেক্টরের উপর কেন্দ্রীভূত করেছেন। 2016 সালে, তিনি অ্যানোফিলিস ফুনেস্টাসে নন-কোডিং আর. এন. এ (এম. আই. আর. এন. এ) এবং রক্ত-চুষতে সক্ষম মশার দ্বারা পরজীবী নিয়ন্ত্রণ বোঝার ক্ষেত্রে এই ছোট জিনের ভূমিকা বর্ণনা করেন। তিনি 2008 থেকে 2014 সালের মধ্যে একটি টিসেটসে ফ্লাই জিনোম প্রকল্পের সহ-নেতৃত্ব দিয়েছিলেন যেখানে তিনি এবং তাঁর ছাত্ররা একটি মাছি কীভাবে তার নিজস্ব প্রতিরোধ ব্যবস্থা নিয়ন্ত্রণ করে এবং লোহার বিষাক্ততা থেকে নিজেকে রক্ষা করে তা অধ্যয়ন করেছিলেন। পরবর্তীকালে তিনি ব্ল্যাক সোলজার ফ্লাইতে নন-কোডিং আরএনএ নিয়ন্ত্রণ বর্ণনা করতে তাঁর বিশ্লেষণাত্মক পদ্ধতি ব্যবহার করেছেন। জিনোম সিকোয়েন্সিং এবং অ্যানোটেশন প্রকল্প (2004-2016) ক্রিস্টোফেলসের পূর্ববর্তী গবেষণা জিনোমের সিকোয়েন্সিং, অ্যানোটেটিং এবং বিশ্লেষণের উপর দৃষ্টি নিবদ্ধ করে। তিনি ফুগু রুব্রিপের জিনোম সমাবেশ এবং টীকা বিশ্লেষণ করেছেন। 95 শতাংশেরও বেশি ক্রমযুক্ত কভারেজ সহ, এটি নির্দেশিত হয় যে সমাবেশের 80 শতাংশ মাল্টিজিন-আকারের স্ক্যাফোল্ডে রয়েছে। গবেষণায় বলা হয়েছে যে জিনোমে পুনরাবৃত্তিমূলক ডিএনএ অনুক্রমের এক-ষষ্ঠাংশেরও কম দখল করে, যেখানে জিন লোকাই জিনোমের প্রায় এক-তৃতীয়াংশ দখল করে। এটি আরও তুলে ধরেছে যে 450 মিলিয়ন বছর ধরে প্রোটিনের বিবর্তন, যদিও মানব প্রোটিনের তিন-চতুর্থাংশ হয় পাফারফিশ হোমোলগ থেকে বিচ্ছিন্ন হয়েছিল বা ছিল না। একটি উল্লেখযোগ্য জিন অর্ডার স্ক্র্যাম্বলিংয়ের পরিপ্রেক্ষিতে, ফুগু রুব্রিপস এবং মানুষের মধ্যে সংরক্ষিত সংযোগগুলি সাধারণ মেরুদণ্ডী পূর্বপুরুষের সাথে যুক্ত ক্রোমোজোমের অংশগুলির সংরক্ষণ দেখায়। ফুগুতে প্যারালগাস ক্রোমোসোমাল অঞ্চলগুলি সনাক্ত করার জন্য ফুগু এবং মানুষের খসড়া জিনোম ক্রমের মধ্যে একটি পদ্ধতিগত তুলনা করা হয়েছিল। ফুগু, মানব এবং অমেরুদণ্ডী অনুক্রমের ফাইলোজেনেটিক বিশ্লেষণ ব্যবহার করার পরে ফুগুতে ডুপ্লিকেট জিনগুলি নির্দেশিত হয়েছিল। বিশ্লেষণে ফুগুতে 425টি মাছ-নির্দিষ্ট নকল জিনের প্রমাণ নির্ধারণ করা হয়েছে এবং ইঙ্গিত দেওয়া হয়েছে যে জিনোমের কমপক্ষে 6.6% মাছ-নির্দিষ্ট প্যারালগন দ্বারা প্রতিনিধিত্ব করা হয়। গবেষণাটি রে-ফিনড মাছের বিবর্তনের সময় একটি সম্পূর্ণ-জিনোম প্রতিলিপিরও দৃঢ়ভাবে পরামর্শ দেয়, যা টেলিস্টের উৎপত্তির আগেও ঘটতে পারে। 2013 সালে, ক্রিস্টোফেলস আফ্রিকান কোলাক্যান্থ জিনোমের বিশ্লেষণের কথা জানান। জিনোম সিকোয়েন্স জেনেটিক পরিবর্তন প্রদান করে যা জলজ পরিবেশ থেকে ভূমিতে অভিযোজনকে সম্বোধন করে। টেট্রাপড বিবর্তন সম্পর্কে অন্তর্দৃষ্টি পাওয়ার জন্য এই গবেষণাটি পরিচালিত হয়েছিল। ফাইলোজেনোমিক বিশ্লেষণে কোলাক্যান্থের পরিবর্তে টেট্রাপডের সাথে ফুসফুসের মাছের নিকটতম জীবিত সম্পর্ককে তুলে ধরা হয়েছে। কোয়েলাক্যান্থের প্রোটিন-কোডিং জিনগুলিও টেট্রাপডের তুলনায় একটি ধীর বিবর্তন প্রকাশ করেছে। 2013 সালে, ক্রিস্টোফেলস তার গবেষণাগারে কোলাক্যান্থ জিনোমের টীকা সম্পন্ন করেন। পরে, কোয়েলাক্যান্থের স্বাদ এবং গন্ধযুক্ত রিসেপ্টরগুলির উপর বিশ্লেষণ করা হয় এবং এটি প্রদর্শিত হয় যে কোয়েলাক্যান্থের জিপিসিআর কেমোসেন্সরি রিসেপ্টরগুলির (সিআর) সংগ্রহস্থল তার মধ্যস্থতাকারী অবস্থানকে সমর্থন করে। সেৎসে প্রকল্পটি প্রায় 10 বছর ধরে চলেছিল। ক্রিস্টোফেলস সেই কার্যনির্বাহী দলের অংশ ছিলেন যিনি জিনোম প্রকল্পটি পরিচালনা করেছিলেন এবং পিএইচডি-র তত্ত্বাবধান করে বৈজ্ঞানিক বিশ্লেষণের নেতৃত্ব দিয়েছিলেন। শিক্ষার্থীরা জিনোমের বিভিন্ন অঞ্চল বিস্তারিতভাবে বিশ্লেষণ করেছিলেন কারণ এটি প্যাথোজেন (ট্রাইপানোসোম), ট্রাইপানোসোম্যাটিড এসএনএআরই-এর তুলনা, একটি হোস্ট খুঁজে বের করার জন্য রাসায়নিক সংকেত এবং সেটসে প্রবর্তক স্থাপত্যের বিরুদ্ধে সহজাত সুরক্ষার সাথে সম্পর্কিত। কোয়েলাক্যান্থ এবং সেটসে জিনোমে তাঁর সিকোয়েন্সিং প্রকল্পগুলি অনুসরণ করে, ক্রিস্টোফেলস 2014 সালে এশিয়ান সীবাসের জিনোম সমাবেশ এবং টীকায় সহ-নেতৃত্ব দেন। দলটি সেই সময়ে একটি অ-মডেল ইউক্যারিওটিক জিনোম একত্রিত করার জন্য প্রথমবারের জন্য দীর্ঘ রিডস (প্যাকবিও) এবং শর্ট রিডস (ইলুমিনা) সিকোয়েন্সিং ডেটা একত্রিত করে। তিনি দক্ষিণ আফ্রিকা এবং সিঙ্গাপুরে জিনোম সমাবেশ এবং টীকা দলের নেতৃত্বও দিয়েছিলেন। তিনি অ-মডেল জীবের জন্যও মাপকাঠি নির্ধারণ করেছিলেন। তিনি 'হাউ টু বি এ হেলথ অ্যাক্টিভিস্টঃ টিচার্স গাইড ",' হাউ টু বি এ হেলথ অ্যাক্টিভিস্টঃ এ লাইফ ওরিয়েন্টেশন ওয়ার্কবুক" এবং 'হাউ টু বি এ হেলথ অ্যাক্টিভিস্টঃ এ লাইফ স্কিলস ওয়ার্কবুক ফর গ্রেড 7-9 লার্নারস "শীর্ষক তিনটি বই লিখেছেন। তাঁর গবেষণা কর্মজীবন জুড়ে, ক্রিস্টোফেলস তাঁর কাজে একটি সম্প্রদায়ের সম্পৃক্ততার মাত্রা যুক্ত করেছেন। তিনি প্রাথমিকভাবে বিদ্যালয়ের পাঠ্যক্রমের ক্রিয়াকলাপে যক্ষ্মা সম্পর্কে সচেতনতা সংহত করার মাধ্যমে এটি অর্জন করেছেন। পরে তিনি একাধিক ভাষায় বায়োব্যাঙ্কের মূল্য যোগাযোগের জন্য অডিও বই তৈরি করেন। 2014-দক্ষিণ আফ্রিকান মেডিকেল রিসার্চ কাউন্সিল সিলভার অ্যাওয়ার্ড 2015-হ্যামিল্টন নাকি অ্যাওয়ার্ড, ন্যাশনাল রিসার্চ ফাউন্ডেশন 2016-ফুলব্রাইট ভিজিটিং স্কলার অ্যাওয়ার্ড 2017-আউটস্ট্যান্ডিং অ্যালামনাস অ্যাওয়ার্ড, ইউনিভার্সিটি অফ দ্য ওয়েস্টার্ন কেপ বিবলিওগ্রাফি বুকস হাউ টু বি এ হেলথ অ্যাক্টিভিস্টঃ টিচার্স গাইড (2013) আইএসবিএন 978-0-86808-745-0 হাউ টু বি এ হেলথ অ্যাক্টিভিস্টঃ এ লাইফ ওরিয়েন্টেশন ওয়ার্কবুক (2014) আইএসবিএন 978-0-86808-748-1 হাউ টু বি এ হেলথ অ্যাক্টিভিস্টঃ এ লাইফ স্কিলস ওয়ার্কবুক ফর গ্রেড 7-9 লার্নারস (2014) আইএসবিএন 978-0-620-51650-1 নির্বাচিত নিবন্ধগুলি অ্যাপারিসিও, এস, চ্যাপম্যান, জে, স্টুপ পুরো-জিনোম শটগান সমাবেশ এবং ফুগু রুব্রিপের জিনোমের বিশ্লেষণ। বিজ্ঞান, 297 (5585), 1301-1310। ক্রিস্টোফেলস, এ., কোহ, ই. জি., চিয়া, জে. এম., ব্রেনার, এস., অপারিসিও, এস., এবং ভেঙ্কটেশ, বি। (2004)। ফুগু জিনোম বিশ্লেষণ রশ্মি-যুক্ত মাছের বিবর্তনের সময় একটি সম্পূর্ণ-জিনোম প্রতিলিপির প্রমাণ প্রদান করে। আণবিক জীববিজ্ঞান এবং বিবর্তন, 21 (6), 1146-1151। আমেমিয়া, সি. টি., আলফোল্ডি, জে., লি, এ. পি., ফ্যান, এস., ফিলিপ, এইচ., ম্যাককালাম, আই., এবং লিন্ডব্লাড-তোহ, কে. (2013)। আফ্রিকান কোলাক্যান্থ জিনোম টেট্রাপড বিবর্তনের অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে। প্রকৃতি, 496 (7445), 311-316। ভিজ, এস., কুল, এইচ., কুজনেত্সোভা, আই. এস., কোমিসারভ, এ., ইউরচেঙ্কো, এ. এ., ভ্যান হিউসডেন, পি., এবং অরবান, এল. (2016)। দীর্ঘ ক্রম রিড এবং বহু-স্তরযুক্ত স্ক্যাফোল্ডিং ব্যবহার করে এশীয় সামুদ্রিক জিনোমের ক্রোমোসোমাল-স্তরের সমাবেশ। পিএলওএস জেনেটিক্স, 12 (4), ই1005954। আল্লাম, এম., স্পিলিংস, বি. এল., আবদাল্লা, এইচ., মাপিয়ে, ডি., কোয়েকেমোয়ার, এল. এল., এবং ক্রিস্টোফেলস, এ। (2016)। উচ্চ থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং ব্যবহার করে আফ্রিকান ম্যালেরিয়া ভেক্টর অ্যানোফিলিস ফুনেস্টাসের জীবন পর্যায়ে প্রকাশিত মাইক্রোআরএনএগুলির সনাক্তকরণ এবং বৈশিষ্ট্যকরণ। ম্যালেরিয়া জার্নাল, 15 (1), 1-15। চৌধুরী, এ., রামসে, এম., হ্যাজেলহার্স্ট, এস., অ্যারন, এস., বার্ডিয়েন, এস., বোথা, জি., এবং মরিচ, এম. এস. (2017)। দক্ষিণ আফ্রিকানদের মধ্যে জিনগত বৈচিত্র্যের একটি বর্ধিত বোঝার জন্য পুরো-জিনোম সিকোয়েন্সিং। প্রকৃতি যোগাযোগ, 8 (1), 1-12। লুস, টি., ভ্যান হিউসডেন, পি., এবং ক্রিস্টোফেলস, এ। (2020)। কমব্যাট-টিবি-নিওডিবিঃ গ্রাফ ডাটাবেস প্রযুক্তি ব্যবহার করে সমন্বিত বিশ্লেষণের মাধ্যমে যক্ষ্মা গবেষণাকে উৎসাহিত করা। বায়োইনফরমেটিক্স, 36 (3), 982-983। ভ্যান হিউসডেন, পি., মাশোলোগু, জেড., লস, টি., ওয়ারেন, আর., এবং ক্রিস্টোফেলস, এ। (2022)। কমব্যাট-টিবি ওয়ার্কবেঞ্চঃ শক্তিশালী মাইকোব্যাকটেরিয়াম টিউবারকিউলোসিস বায়োইনফরম্যাটিক্সকে সহজলভ্য করে তোলা। এম. এস. ফেয়ার, 7 (1), ই 00991-21। কেপ টাউন বিশ্ববিদ্যালয়ের প্রাক্তন ছাত্র স্টেলেনবোশ বিশ্ববিদ্যালয়ের প্রাক্তন ছাত্র কেপ টাউন থেকে ওয়েস্টার্ন কেপ বিশ্ববিদ্যালয়ের একাডেমিক কর্মী জন্মের বছর নিখোঁজ (জীবিত মানুষ) দক্ষিণ আফ্রিকার জৈব তথ্যবিদ