DREAM Challenges
ড্রিম চ্যালেঞ্জস (ডায়ালগ ফর রিভার্স ইঞ্জিনিয়ারিং অ্যাসেসমেন্ট অ্যান্ড মেথডস) হল একটি অলাভজনক উদ্যোগ যা ভিড়-উৎস প্রতিযোগিতার মাধ্যমে বায়োমেডিকাল এবং সিস্টেম বায়োলজি গবেষণার অগ্রগতির জন্য। 2006 সালে শুরু হওয়া ড্রিম চ্যালেঞ্জগুলি সিনাপ্স প্ল্যাটফর্মে পরিচালিত প্রতিযোগিতার জন্য একটি প্ল্যাটফর্ম সরবরাহ করতে সেজ বায়নেটওয়ার্কসের সাথে সহযোগিতা করে। 15 বছরেরও বেশি সময় ধরে 60টিরও বেশি ড্রিম চ্যালেঞ্জ পরিচালনা করা হয়েছে। ড্রিম চ্যালেঞ্জ 2006 সালে আইবিএম রিসার্চের গুস্তাভো স্টোলোভিজকি এবং কলম্বিয়া বিশ্ববিদ্যালয়ের আন্দ্রেয়া ক্যালিফানো দ্বারা প্রতিষ্ঠিত হয়েছিল। ড্রিম সংস্থার বর্তমান সভাপতি হলেন ক্যালিফোর্নিয়া বিশ্ববিদ্যালয়ের পল বুট্রোস। আরও সংস্থায় এমেরিটাস চেয়ার জাস্টিন গিনি এবং গুস্তাভো স্টোলোভিজকি এবং একাধিক ড্রিম পরিচালক রয়েছেন। স্বতন্ত্র চ্যালেঞ্জগুলি একটি নির্দিষ্ট বায়োমেডিকাল গবেষণা প্রশ্ন মোকাবেলা করার দিকে মনোনিবেশ করে, যা সাধারণত একটি নির্দিষ্ট রোগে সংকুচিত হয়। স্তন ক্যান্সার, তীব্র মায়েলয়েড লিউকেমিয়া এবং প্রোস্টেট ক্যান্সার বা অনুরূপ রোগের উপর দৃষ্টি নিবদ্ধ করে একাধিক অতীত চ্যালেঞ্জ সহ অনকোলজির উপর একটি বিশিষ্ট রোগের ফোকাস রয়েছে। একটি পৃথক চ্যালেঞ্জের সাথে জড়িত তথ্য রোগের প্রেক্ষাপটকে প্রতিফলিত করে; যদিও ক্যান্সার সাধারণত মানব জিনোমে মিউটেশন, জিন এক্সপ্রেশন এবং ট্রান্সক্রিপ্টোমিক্সের জিন নেটওয়ার্ক এবং বড় আকারের প্রোটিওমিক্সের মতো তথ্য জড়িত করে, নতুন চ্যালেঞ্জগুলি একক কোষ সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তির পাশাপাশি উদীয়মান অন্ত্রের মাইক্রোবায়োম সম্পর্কিত গবেষণা প্রশ্নের দিকে স্থানান্তরিত হয়েছে, এইভাবে বৃহত্তর গবেষণা সম্প্রদায়ের প্রবণতা প্রতিফলিত করে। ড্রিম চ্যালেঞ্জগুলির জন্য অনুপ্রেরণা হ 'ল প্রতিযোগিতার মাধ্যমে বৃহত্তর দর্শকদের কাছে ক্রাউড-সোর্সিং ডেটার মাধ্যমে, একটি একক সত্তা দ্বারা বিশ্লেষণ পরিচালিত হওয়ার চেয়ে আরও ভাল মডেল এবং অন্তর্দৃষ্টি অর্জন করা হয়। নেচার পোর্টফোলিও এবং পিএলওএস প্রকাশনা গোষ্ঠীর ফ্ল্যাগশিপ জার্নালের মতো বৈজ্ঞানিক স্থানগুলিতে অতীতের প্রতিযোগিতা প্রকাশিত হয়েছে। ড্রিম চ্যালেঞ্জের ফলাফলগুলি ওয়েব প্ল্যাটফর্মের মাধ্যমে ঘোষণা করা হয় এবং শীর্ষস্থানীয় অংশগ্রহণকারীদের আই. এস. সি. বি দ্বারা আয়োজিত আর. এস. জি/ড্রিমের সাথে বার্ষিক আর. ই. সি. ও. এম. বি/আই. এস. সি. বি সম্মেলনে তাদের ফলাফল উপস্থাপন করার জন্য আমন্ত্রণ জানানো হয়। যদিও ড্রিম চ্যালেঞ্জগুলি উন্মুক্ত বিজ্ঞান এবং তথ্যের উপর জোর দিয়েছে, রোগীর গোষ্ঠীতে জিনোমিক্সের মতো অত্যন্ত সংবেদনশীল তথ্য থেকে উদ্ভূত সমস্যাগুলি প্রশমিত করার জন্য, "মডেল থেকে ডেটা" পদ্ধতি গ্রহণ করা হয়েছে। এই ধরনের চ্যালেঞ্জগুলিতে অংশগ্রহণকারীরা ডকার বা সিঙ্গুলারিটির মতো আধারের মাধ্যমে তাদের মডেল জমা দেয়। এটি মূল তথ্যের গোপনীয়তা বজায় রাখার অনুমতি দেয় কারণ এই ধারকগুলি তখন গোপনীয় তথ্যের উপর আয়োজকদের দ্বারা পরিচালিত হয়। এটি আরও ঐতিহ্যবাহী উন্মুক্ত তথ্য মডেলের থেকে আলাদা, যেখানে অংশগ্রহণকারীরা প্রদত্ত উন্মুক্ত তথ্যের উপর ভিত্তি করে সরাসরি ভবিষ্যদ্বাণী জমা দেয়। চ্যালেঞ্জ অর্গানাইজেশন ড্রিম চ্যালেঞ্জ একটি মূল ড্রিম/সেজ বায়নেটওয়ার্কস অর্গানাইজেশন গ্রুপের পাশাপাশি একটি বর্ধিত বৈজ্ঞানিক বিশেষজ্ঞ গোষ্ঠী নিয়ে গঠিত, যারা চ্যালেঞ্জের সৃষ্টি এবং ধারণায় বা মূল তথ্য সরবরাহ করে অবদান রাখতে পারে। উপরন্তু, বৃহত্তর গবেষণা সম্প্রদায় নতুন ড্রিম চ্যালেঞ্জের প্রস্তাব দিতে পারে। ফার্মাসিউটিক্যাল কোম্পানি বা অন্যান্য বেসরকারী সংস্থাগুলিও ড্রিম চ্যালেঞ্জের সাথে জড়িত থাকতে পারে, উদাহরণস্বরূপ তথ্য সরবরাহের ক্ষেত্রে। চ্যালেঞ্জ কাঠামো মূল পর্যায়গুলির জন্য সময়সীমা (যেমন পরিচিতি ওয়েবিনার, মডেল জমা দেওয়ার সময়সীমা এবং অংশগ্রহণের চূড়ান্ত সময়সীমা) আগে থেকে সরবরাহ করা হয়। বিজয়ীদের ঘোষণা করার পরে, আয়োজকরা প্রতিযোগিতার মূল ফলাফলগুলি বর্ণনা করে একটি প্রকাশনার জন্য পোস্ট হক বিশ্লেষণ পরিচালনা করতে শীর্ষস্থানীয় পারফর্মিং অংশগ্রহণকারীদের সাথে সহযোগিতা শুরু করে। চ্যালেঞ্জগুলি উপ-চ্যালেঞ্জে বিভক্ত হতে পারে, প্রতিটি গবেষণা প্রশ্নের মধ্যে একটি ভিন্ন উপ-বিষয়কে সম্বোধন করে। উদাহরণস্বরূপ, ক্যান্সার চিকিত্সার কার্যকারিতার পূর্বাভাসের ক্ষেত্রে, এগুলি অগ্রগতি-মুক্ত বেঁচে থাকা, সামগ্রিক বেঁচে থাকা, RECIST অনুসারে সর্বোত্তম সামগ্রিক প্রতিক্রিয়া বা ঘটনা (অগ্রগতি বা মৃত্যু) পর্যন্ত সঠিক সময়ের জন্য পৃথক ভবিষ্যদ্বাণী হতে পারে। অংশগ্রহণ ড্রিম চ্যালেঞ্জের সময়, অংশগ্রহণকারীরা সাধারণত প্রদত্ত তথ্যের উপর মডেল তৈরি করে এবং ভবিষ্যদ্বাণী বা মডেল জমা দেয় যা তারপর আয়োজকদের দ্বারা সংরক্ষিত তথ্যের উপর বৈধ হয়। যদিও ড্রিম চ্যালেঞ্জগুলি অংশগ্রহণকারীদের কাছে বৈধতা তথ্য ফাঁস করা এড়িয়ে চলে, তবে অংশগ্রহণকারীদের একটি উপ-নমুনা বা স্ক্র্যাম্বলড ডেটাসেটে তাদের কর্মক্ষমতা মূল্যায়নে সহায়তা করার জন্য সাধারণত মধ্য-চ্যালেঞ্জ জমা দেওয়ার লিডারবোর্ড উপলব্ধ থাকে। ড্রিম চ্যালেঞ্জ অংশগ্রহণকারীদের জন্য বিনামূল্যে। উন্মুক্ত পর্যায়ে যে কেউ এককভাবে বা একটি দল হিসাবে অংশগ্রহণের জন্য সিনাপ্সের মাধ্যমে নিবন্ধন করতে পারে। একজন ব্যক্তি কেবল একবারই নিবন্ধন করতে পারেন এবং কোনও উপনাম ব্যবহার করতে পারেন না। কিছু ব্যতিক্রম রয়েছে, যা একজন ব্যক্তিকে অংশগ্রহণ থেকে অযোগ্য ঘোষণা করে, উদাহরণস্বরূপঃ ব্যক্তির নির্দিষ্ট চ্যালেঞ্জের জন্য তথ্যের বিশেষ প্রবেশাধিকার রয়েছে, এইভাবে তাদের একটি অন্যায্য সুবিধা প্রদান করে। ব্যক্তি ধরা পড়েছে বা প্রতারণা বা পূর্ববর্তী ড্রিম চ্যালেঞ্জগুলির অপব্যবহারের সন্দেহে রয়েছে। ব্যক্তিটি নাবালক (18 বছরের কম বয়সী বা বসবাসের এখতিয়ারে সংখ্যাগরিষ্ঠ বয়স)। পিতামাতার সম্মতির মাধ্যমে এটি হ্রাস করা যেতে পারে। আরও দেখুন ক্রাউডসোর্সিং প্রকল্পগুলির তালিকা ক্রিটিক্যাল অ্যাসেসমেন্ট অফ ফাংশন অ্যানোটেশন (সিএএফএ) ক্রিটিক্যাল অ্যাসেসমেন্ট অফ জিনোম ইন্টারপ্রিটেশন (সিএজিআই) ক্রিটিক্যাল অ্যাসেসমেন্ট অফ প্রেডিকশন অফ ইন্টারেকশন (সিএপিআরআই) ক্রিটিক্যাল অ্যাসেসমেন্ট অফ প্রোটিন স্ট্রাকচার প্রেডিকশন (সিএএসপি) ক্যাগল রেফারেন্স অ্যাপ্লায়েড মেশিন লার্নিং বায়োইনফরম্যাটিক্স কম্পিউটার বিজ্ঞান প্রতিযোগিতা ক্রাউডসোর্সিং পূর্বাভাস প্রতিযোগিতা আণবিক মডেলিং প্রোগ্রামিং প্রতিযোগিতা