SCRN3
সেকারনিন-3 (এস. সি. আর. এন. 3) হল একটি প্রোটিন যা মানব এস. সি. আর. এন. 3 জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। এস. সি. আর. এন. 3 পেপটিডেজ সি69 পরিবার এবং সেকারনিন উপপরিবারের অন্তর্গত। এই পরিবারের একটি অংশ হিসাবে, প্রোটিনটি সিস্টিন-টাইপ এক্সোপেপ্টিডেজ ক্রিয়াকলাপ এবং ডিপেপ্টিডেজ ক্রিয়াকলাপকে সক্ষম করার পাশাপাশি প্রোটিওলাইসিসের সাথে জড়িত হওয়ার পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। এটি মস্তিষ্ক, থাইরয়েড এবং অন্যান্য 25টি টিস্যুতে সর্বব্যাপী প্রকাশিত হয়। উপরন্তু, স্তন্যপায়ী প্রাণী, পাখি, মাছ, উভচর প্রাণী এবং অমেরুদণ্ডী প্রাণী সহ বিভিন্ন প্রজাতিতে এস. সি. আর. এন. 3 সংরক্ষিত রয়েছে। এস. সি. আর. এন. 3 সাইটোপ্লাজমের একটি অবিচ্ছেদ্য উপাদান বলে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। জিন এস. সি. আর. এন3 সাধারণত এফ. এল. জে. 23142 এবং এস. ই. এস. 3 নামেও পরিচিত। লোকাস হোমো স্যাপিয়েন্স সেকারনিন-3 (এস. সি. আর. এন. 3) একটি প্রোটিন-কোডিং জিন। এটি ক্রোমোজোম 2-এ পাওয়া যায়, যার নির্দিষ্ট অবস্থান 2q31.1, '+' স্ট্র্যান্ডে। জিনটি 33,846 বেস জোড়া দীর্ঘ এবং এতে 8টি এক্সোন রয়েছে। এস. সি. আর. এন. 3 প্রোটিন-কোডিং জিনের সবচেয়ে সাধারণ প্রতিলিপি হল প্রতিলিপি বৈকল্পিক 1, যা 3052 বেস জোড়া দীর্ঘ। এস. সি. আর. এন. 3 একটি উচ্চ স্তরে প্রকাশ করা হয়, যা এই রিলিজের গড় জিনের 2.4 গুণ। মানব এস. সি. আর. এন. 3-এর 8টি ভিন্ন আইসোফর্ম রয়েছে। অভিব্যক্তি এস. সি. আর. এন. 3-এর এম. আর. এন. এ মানুষের মধ্যে মাঝারি বলে পাওয়া গেছে। এস. সি. আর. এন. 3 বেশিরভাগ প্রধান টিস্যুতে প্রকাশিত হয়। এম. আর. এন. এ অন্যান্য টিস্যুর তুলনায় মস্তিষ্ক, থাইরয়েড, হৃৎপিণ্ড এবং প্রস্টেটের সামান্য উঁচু স্তরে প্রকাশিত হয়, যদিও অন্তর্নিহিত প্রবণতা বিভিন্ন টিস্যুর মধ্যে তুলনামূলকভাবে সামঞ্জস্যপূর্ণ সর্বব্যাপী অভিব্যক্তি ছিল। ইঁদুরের মস্তিষ্ক এবং ভ্রূণ উভয়েরই সিটু সংকরণের ক্ষেত্রে এস. সি. আর. এন. 3-এর একটি বিশ্লেষণে, শক্তিশালী অভিব্যক্তির কোনও নির্দিষ্ট ক্ষেত্র পাওয়া যায়নি, পরিবর্তে একটি মাঝারি অভিব্যক্তি দেখানো হয়েছে, যা নিশ্চিত করে যে এস. সি. আর. এন. 3-এর সম্ভবত বেশিরভাগ টিস্যুতে সর্বব্যাপী অভিব্যক্তি রয়েছে। ইমিউনোহিস্টোকেমিস্ট্রি ডেটা আরও ইঙ্গিত দেয় যে মানব এস. সি. আর. এন 3-এর নিম্ন টিস্যু, একক কোষ, ইমিউন কোষ এবং মস্তিষ্ক অঞ্চলের নির্দিষ্টতা রয়েছে, যা আবারও সর্বব্যাপী অভিব্যক্তির প্রমাণ যোগ করে। এস. সি. আর. এন. 3 জিনের প্রোটিন ট্রান্সক্রিপ্ট বৈকল্পিক 1 সবচেয়ে সাধারণ প্রোটিন আইসোফর্ম, সেকারনিন-3 আইসোফর্ম 1 কে এনকোড করে, যা 424 অ্যামিনো অ্যাসিড দীর্ঘ। অপরিবর্তিত এস. সি. আর. এন3 প্রোটিনের আণবিক ওজন প্রায় <আই. ডি1> কে. ডি. এ এবং এস. সি. আর. এন3-এর তাত্ত্বিক আইসোইলেক্ট্রিক বিন্দু (পি. আই) হল 5.38। তাত্ত্বিক আইসোইলেক্ট্রিক বিন্দু, প্রোটিনের গঠনে অ্যাসিডিক অ্যামিনো অ্যাসিডের প্রাধান্যের সাথে মিলিত হয়ে পরামর্শ দেয় যে এস. সি. আর. এন 3 একটি তুলনামূলকভাবে অ্যাসিডিক প্রোটিন। উপরন্তু, মানুষের মধ্যে এস. সি. আর. এন 3-এর আপেক্ষিক প্রোটিনের প্রাচুর্য অন্যান্য মানুষের প্রোটিনের তুলনায় 6.13 পিপিএম-এ মাঝারিভাবে বেশি পাওয়া গেছে। এস. সি. আর. এন. 3 ডোমেনের একটি একক উল্লেখযোগ্য ডোমেন রয়েছে, যা পেপটিডেজ _ সি69 ডোমেন বা সংক্ষেপে পেপডি ডোমেন হিসাবে চিহ্নিত। এই ক্ষেত্রটি প্রোটিনের অ্যামিনো অ্যাসিডের অবস্থান 5 থেকে 226 পর্যন্ত বিস্তৃত। এই ডোমেনের মধ্যে পাওয়া ক্রমগুলি পেপটিডেজ সি69 পরিবারের বৈশিষ্ট্য, এবং আরও নির্দিষ্টভাবে সেকারনিন উপপরিবার, যা মূলত ডিপেপটিডেস হিসাবে পরিচিত। এই পরিবারের মধ্যে, তুলনামূলক ক্রম এবং কাঠামোগত বিশ্লেষণে অনুঘটক নিউক্লিওফাইল হিসাবে একটি সিস্টিন প্রকাশিত হয়েছিল, যা সেকারনিন-3-এ পাওয়া যায়। কাঠামো এস. সি. আর. এন 3-এর ভবিষ্যদ্বাণীকৃত তৃতীয় কাঠামোর মধ্যে, সর্বাধিক সংরক্ষিত অ্যামিনো অ্যাসিড প্রধানত প্রোটিনের অভ্যন্তরীণ অংশে পাওয়া যায়। এর থেকে বোঝা যায় যে, সবচেয়ে বেশি সংরক্ষিত অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি প্রোটিনের কাঠামো সরবরাহের পাশাপাশি অভ্যন্তরীণ কার্যকারিতা প্রদানের জন্য গুরুত্বপূর্ণ। কোষের মধ্যে স্থানীয়করণ, এস. সি. আর. এন. 3 প্রাথমিকভাবে সাইটোপ্লাজমে প্রকাশিত হবে বলে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। সাইটোপ্লাজমিক স্থানীয়করণের ভবিষ্যদ্বাণী 5টি অতিরিক্ত অর্থোলগের (মাউরেমিস রিভেসি, গ্যালাস গ্যালাস, মাইক্রোসেসিলিয়া ইউনিকলর, ডানিও রেরিও এবং অ্যানোফিলিস গ্যাম্বিয়া) মধ্যে সামঞ্জস্যপূর্ণ ছিল, যা মানব এস. সি. আর. এন 3-এর ভবিষ্যদ্বাণীকৃত সাইটোপ্লাজমিক উপকোষীয় স্থানীয়করণকে নিশ্চিত করে। অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তনগুলি এস. সি. আর. এন. 3 অন্যান্যগুলির মধ্যে ফসফোরাইলেশন, সর্বব্যাপীকরণ, সুময়লেশন, লাইসিন অ্যাসিটাইলেশন এবং ও-বিটা-জি. এল. সি. এন. এ. সি সংযুক্তি সাইটগুলি সহ বেশ কয়েকটি ভবিষ্যদ্বাণীকৃত অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তন সাপেক্ষে। উপরন্তু, সেকারনিন-3 বিপরীত-মেরু ক্রিয়াকলাপ-ভিত্তিক প্রোটিন প্রোফাইলিং (আরপি-এবিপিপি) ব্যবহারের মাধ্যমে প্রাকৃতিকভাবে ঘটে যাওয়া এন-টার্মিনাল গ্লাইঅক্সাইলিল (গ্লক্স) ইলেক্ট্রোফাইলের প্রথম উদাহরণ প্রদান করে। হাইড্রাজিন প্রোব ব্যবহার করে, এটি নিশ্চিত করা হয়েছিল যে সিস্টিন (সিস) অবশিষ্টাংশটি অনুবাদের পরে গ্লক্সে রূপান্তরিত হয়েছিল। এটি সেকারনিন-3-এ প্রথমবারের জন্য একটি ইলেক্ট্রোফিলিক এন-টার্মিনাল গ্লাইঅক্সিলিল গ্রুপকে চিহ্নিত করেছে, যদিও কোফ্যাক্টর হিসাবে প্রোটিন এবং গ্লক্স উভয়ের কার্যকারিতা এখনও পরীক্ষামূলকভাবে বৈধ করা হয়নি। হোমোলজি/ইভোলিউশন প্যারালগ এস. সি. আর. এন 3-এর দুটি পরিচিত প্যারালগ রয়েছে, এস. সি. আর. এন 2 এবং এস. সি. আর. এন 1, যা যথাক্রমে এস. সি. আর. এন 3 প্রোটিন সিকোয়েন্সের সাথে একটি <আই. ডি 1> এবং <আই. ডি 2> মিল ভাগ করে। উভয় প্যারালগই এস. সি. আর. এন 3-এর সঙ্গে মাঝারিভাবে সম্পর্কিত। এস. সি. আর. এন. 3-এর মতো একই প্রজাতি গোষ্ঠীর মধ্যে এস. সি. আর. এন. 2 পাওয়া গেছে। এস. সি. আর. এন. 1 স্তন্যপায়ী প্রাণী, পাখি, সরীসৃপ, উভচর এবং কার্টিলাজিনস মাছ সহ কম প্রজাতির গোষ্ঠীতে সংরক্ষিত ছিল, তবে অন্যান্য মাছ বা অমেরুদণ্ডী প্রাণীর মধ্যে নয়। মানব জিন এস. সি. আর. এন. 3-এর জন্য 100টিরও বেশি অর্থোলগ রয়েছে। পরিচিত অর্থোলোগগুলি মেরুদণ্ডী এবং অমেরুদণ্ডী প্রাণীদের মধ্যে বিদ্যমান ছিল, তবে উদ্ভিদ, ব্যাকটেরিয়া বা ছত্রাকের মধ্যে নয়। পাওয়া 20টি অর্থোলগের বিচ্যুতির তারিখকে হোমো স্যাপিয়েন্সের সাথে তুলনা করা হয়েছে। অমেরুদণ্ডী প্রাণীরা মানুষের এস. সি. আর. এন 3-এর সাথে সবচেয়ে দূরবর্তীভাবে সম্পর্কিত অর্থোলগ, এই অর্থোলগের সেট থেকে বিচ্যুতির সর্বাধিক মধ্যমা তারিখ 694 মিলিয়ন বছর আগে। বিবর্তন এস. সি. আর. এন 3-এর আণবিক বিবর্তনের আপেক্ষিক হার মাঝারি ছিল, যা ফাইব্রিনোজেন আলফার বিবর্তনের হারের তুলনায় সামান্য কম ছিল এবং সাইটোক্রোম সি. এস. সি. আর. এন 3-এর বিবর্তনের হারের চেয়ে দ্রুত ছিল। আন্তঃক্রিয়াশীল প্রোটিন পি. এস. সি. কিউ. ইউ. আই. সি-এর অনুসন্ধানে 5টি প্রোটিন চিহ্নিত করা হয়েছে যা মানুষের এস. সি. আর. এন3 প্রোটিনের সাথে মিথস্ক্রিয়া করে। তথ্যসূত্র মানুষের ক্রোমোজোম 2-এ জিনগত প্রোটিন