TMEM269
ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিন 269 (টি. এম. ই. এম. 269) হল একটি প্রোটিন যা মানুষের মধ্যে টি. এম. ই. এম. 269 জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। জিনটি 1p34.2 এর একটি সাইটোজেনেটিক অবস্থান সহ প্লাস স্ট্র্যান্ডে অবস্থিত এবং এর অ্যাক্সেশন নম্বর A0A1B0GVZ9.1 রয়েছে। এই জিনের দৈর্ঘ্য প্রায় 160,000 বেস জোড়া। এর একটি ভিন্ন প্রতিলিপি রয়েছে যা টি. এম. ই. এম. 269-এর বিপরীত দিকে ঋণাত্মক স্ট্র্যান্ডে প্রকাশ করা হয়েছে। ট্রান্সক্রিপ্ট আর. এন. এ-সেকিউ তথ্য মানুষের টিস্যুর ধরন অনুযায়ী আর. এন. এ-সেকিউ তথ্যের একটি গবেষণায় দেখা গেছে যে টি. এম. ই. এম. 269-এর অভিব্যক্তি টেস্টিস, মস্তিষ্ক, এন্ডোমেট্রিয়াম এবং কিডনিতে সর্বোচ্চ। তথ্য ইঙ্গিত করে যে টি. এম. ই. এম. 269 মোটামুটি কম হারে টিস্যু প্রকার জুড়ে সর্বব্যাপী প্রতিলিপি করা হয়, যেখানে কোনও টিস্যু প্রকার নেই এবং প্রতি মিলিয়ন রিডে প্রতি কিলোবেসে 0.40 রিডের বেশি প্রতিলিপি লেখা হয়। টিস্যু প্রকার জুড়ে আর. এন. এ-সেকিউ তথ্যের একটি পৃথক গবেষণায় মস্তিষ্কে টি. এম. ই. এম. 269, অ্যাড্রিনাল গ্রন্থি এবং টেস্টিস রেগুলেশন অফ ট্রান্সলেশন-এর জন্য সর্বোচ্চ অভিব্যক্তি নির্দেশ করা হয়েছে মাউস মডেলগুলিতে ডায়াবেটিক কিডনি রোগের (ডি. কে. ডি) একটি গবেষণায় নির্ধারণ করা হয়েছে যে এম. আই. আর. এন. এ-181বি-5বি, একটি এম. আই. আর. এন. এ যা ডি. কে. ডি ইঁদুরের মধ্যে নাটকীয়ভাবে ডাউন-রেগুলেটেড, নাটকীয়ভাবে টি. এম. ই. এম. 269 (-4.52 ভাঁজ পার্থক্য বা <আই. ডি. 1>% মোট মূল অভিব্যক্তি, পি-মান <0.01)-এর অভিব্যক্তি হ্রাস করেছে। মূল গবেষণা থেকে টেবিল IIIa-এর একটি উপবিভাগ নীচে TMEM269-এর সাথে প্রাসঙ্গিক মান সহ অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছে। টি. এম. ই. এম. 269 হল 27টি জিনের মধ্যে একটি যা উল্লেখযোগ্যভাবে (4 গুণ পার্থক্য) পরীক্ষিত জিনের অভিব্যক্তি হ্রাস করেছিল; এই জিনের মধ্যে সবচেয়ে শক্তিশালী প্রভাবের জন্য এটি 18তম স্থানে রয়েছে। টি. এম. ই. এম. 269 পরীক্ষামূলকভাবে উচ্চ ফসফোলিপিড মাইক্রোডাইয়েটস (হাই-পি. এল)-এর তুলনায় পেলাজিক সোল লার্ভা-তে নিম্ন ফসফোলিপিড মাইক্রোডাইয়েটস (লো-পি. এল) দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হতে নির্ধারিত হয়েছিল। লো-পিএল ডায়েটরি এক্সপোজার অনুসারে চিহ্নিত 15টি ভিন্নভাবে প্রকাশিত প্রতিলিপির মধ্যে টি. এম. ই. এম. 269 একটি ছিল (12টি গোষ্ঠীর মধ্যে যা ডাউন-রেগুলেটেড ছিল)। প্রোটিন টি. এম. ই. এম. 269-এর দুটি আইসোফর্ম রয়েছে, যার মধ্যে সবচেয়ে সাধারণ রূপটি হল 245 অ্যামিনো অ্যাসিড। প্রোটিনের দৈর্ঘ্য জুড়ে এটির 5টি ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন রয়েছে এবং ফসফ্যাটিডিলসেরিন সিনথেসের ক্রমের সাথে একটি বড় অঞ্চলের মিল রয়েছে। টি. এম. ই. এম. 269-এর দুটি আইসোফর্মের অনুরূপ ক্রম রয়েছে, দ্বিতীয়টি ছাড়া, কম প্রচলিত, আইসোফর্মের প্রথম আইসোফর্মের ক্রমে পাওয়া প্রথম 42টি অ্যামিনো অ্যাসিড মুছে ফেলা হয়েছে। অন্যান্য মানুষের প্রোটিনের তুলনায়, টি. এম. ই. এম. 269 মেথিওনিন, সেরিন, ফেনিল্যালানিন এবং লিউসিন সমৃদ্ধ, যেখানে এতে গ্লুটামিক অ্যাসিড, গ্লুটামিন এবং আর্জিনাইনের শতাংশ কম। টি. এম. ই. এম. 269-এর পূর্বাভাসিত আণবিক ওজন 26.9 কে. ডি. এ এবং পূর্বাভাসকৃত আইসোইলেক্ট্রিক বিন্দু 6.7। অনুবাদ পরবর্তী পরিবর্তনগুলি টি. এম. ই. এম. 269-এর জন্য এন-মিরিস্টোলিয়েশনের চারটি পূর্বাভাসকৃত স্থান রয়েছে (অ্যামিনো অ্যাসিড অবস্থানে <আই. ডি. 2>, <আই. ডি. 4>, <আই. ডি. 3>, <আই. ডি. 1>)। এন-মিরিস্টয়লেশন সংকেত সঞ্চালন, প্রোটিন স্থায়িত্ব এবং ঝিল্লিতে প্রোটিন পাচারের সাথে জড়িত হতে পারে। এই এন-মিরিস্টোলিয়েশন সাইটগুলি ইঁদুর, মুরগি এবং জেব্রাফিশ সহ মানুষ ছাড়াও বিভিন্ন মডেল জীবের মধ্যে পূর্বাভাস দেওয়া হয়। টি. এম. ই. এম. 269 প্রোটিনে ও-লিঙ্কযুক্ত গ্লাইকোসাইলেশনের দুটি পূর্বাভাস সাইট রয়েছে; এই ধরনের পরিবর্তন প্রোটিন গঠন, স্থিতিশীলতা এবং মাল্টিমেরিক প্রোটিন সমাবেশ নিয়ন্ত্রণ করতে পারে। এই ভবিষ্যদ্বাণীগুলি একটি ইয়িনোইয়াং পোস্ট ট্রান্সলেশনাল মোডিফিকেশন প্রেডিকশন অ্যালগরিদমের 0.5 নেটফস সীমা অতিক্রমকারী সাইটগুলির উপর ভিত্তি করে এই সাইটগুলি প্রোটিনের অ্যামিনো অ্যাসিড অবস্থান 35 এবং 125-এ অবস্থিত। উপকোষীয় স্থানীয়করণ উপকোষীয় স্থানীয়করণ ভবিষ্যদ্বাণীগুলি নির্দেশ করে যে টি. এম. ই. এম. 269-এর এন্ডোপ্লাজমিক রেটিকুলাম এবং প্লাজমা ঝিল্লিতে অবস্থিত হওয়ার সবচেয়ে শক্তিশালী সম্ভাবনা রয়েছে। সাইটপ্লাজমিক/নিউক্লিয়ার বৈষম্যের জন্য রেইনহার্ড্টের পদ্ধতিটি মানব টি. এম. ই. এম. 269 প্রোটিনকে 94.1 মিথস্ক্রিয়া নির্ভরযোগ্যতার স্কোর সহ সাইটোপ্লাজমিক হওয়ার পূর্বাভাস দেয় একটি গবেষণায় টি. এম. ই. এম. 269-কে ইস্ট টু-হাইব্রিড স্ক্রিনিংয়ের মাধ্যমে এফ. এ. এম. 183বি প্রোটিনের সাথে অ-সংক্রামক মিথস্ক্রিয়ার জন্য প্রার্থী হিসাবে নির্ধারণ করা হয়েছে। Fam183b-কে জেনোপাস-এ গতিশীল সিলিয়ার জন্য প্রয়োজনীয় হিসাবে চিহ্নিত করা হয়েছে তবে Fam183b-এর কার্যকারিতা হ্রাসের গবেষণায় ইঁদুর ব্যবহার করে পরীক্ষায় কোনও ত্রুটি (সিলিয়া বা অন্যথায়) পাওয়া যায়নি। টি. এম. ই. এম. 269 দুটি প্রোটিনের মধ্যে একটি যা এই প্রোটিনের সাথে সম্ভাব্য মিথস্ক্রিয়া হিসাবে চিহ্নিত করা হয়েছিল। বিবর্তন টি. এম. ই. এম. 269 সমস্ত চোয়ালযুক্ত মেরুদণ্ডী প্রাণীর মধ্যে সংরক্ষিত রয়েছে তবে সাইক্লোস্টোমি, অমেরুদণ্ডী প্রাণী বা অ-প্রাণী জীবের মধ্যে অর্থোলগ নেই। কন্ড্রিচিথিয়াস বা কার্টিলাজিনস মাছ হল এমন জীবের গোষ্ঠী যা মানুষের সাথে সবচেয়ে দূরবর্তীভাবে সম্পর্কিত যার এখনও একটি টি. এম. ই. এম. 269 অর্থোলগ রয়েছে। বেশিরভাগ কার্টিলাজিনস মাছের জন্য হোমো স্যাপিয়েন্স থেকে বিচ্যুতির আনুমানিক বিবর্তনীয় তারিখ 4 কোটি 64 লক্ষ বছর আগে বলে অনুমান করা হয়। অর্থোলোগগুলির ক্রম থেকে প্রাপ্ত তথ্যের উপর ভিত্তি করে, প্রোটিনের মানব সংস্করণটি মাছের সবচেয়ে দূরবর্তী অর্থোলোগগুলির সাথে প্রায় 50-60% এর একটি অ্যামিনো অ্যাসিড পরিচয় ভাগ করে এবং স্তন্যপায়ী প্রাণীদের মধ্যে কাছাকাছি অর্থোলোগগুলির জন্য 70 থেকে 98 শতাংশ (প্রাইমেটের মতো আরও ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত গোষ্ঠীর জন্য উচ্চতর শতাংশ)। টি. এম. ই. এম. 269-এর কোনও স্পষ্টভাবে শনাক্তযোগ্য প্যারালগ নেই। বিবর্তনের হার বোঝার একটি পরিমাপ হল অন্যান্য প্রোটিনের তুলনায় ক্রমটি কত দ্রুত বিচ্ছিন্ন হচ্ছে তা নির্ধারণ করা। দ্রুত-বিচ্যুত প্রোটিন ফাইব্রিনোজেন আলফা চেইন এবং ধীরে-ধীরে বিচ্যুত প্রোটিন সাইটোক্রোম সি-এর তুলনায় টি. এম. ই. এম. 269 মাঝারি হারে অর্থোলগগুলির মধ্যে বিচ্যুত হচ্ছে।