IGSF6
আই. জি. এস. এফ 6 হল একটি প্রোটিন যা মানুষের মধ্যে আই. জি. এস. এফ 6 জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। মানুষের মধ্যে, ইমিউনোগ্লোবুলিন সুপারফ্যামিলি সদস্য 6 (আইজিএসএফ 6) জিন ওরফে ডিওআরএ সিডি 8 প্রোটিন আইজিএসএফ 6 (24 কেডিএ) কে স্তন্যপায়ী প্রাণী, পাখি, সরীসৃপ এবং হাড়ের মাছের অর্থোলগের সাথে এনকোড করে। আই. জি. এস. এফ. 6 ক্রোমোজোম 16 (<আই. ডি. 1>)-এর পরিপূরক স্ট্র্যান্ডে অবস্থিত যা 13059 বেস জোড়ায় বিস্তৃত এবং সম্পূর্ণরূপে এম. ই. টি. টি. এল 9 জিনের একটি ইন্ট্রনের মধ্যে অবস্থিত। আই. জি. এস. এফ. 6 প্লাজমা ঝিল্লির একটি অবিচ্ছেদ্য উপাদান হতে পারে বলে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে এবং রোগ প্রতিরোধের প্রতিক্রিয়ায় অবদান রাখে। এটি কোষ পৃষ্ঠ রিসেপ্টর সিগন্যালিংয়ে জড়িত এবং ট্রান্সমেম্ব্রেন সিগন্যালিং রিসেপ্টর ক্রিয়াকলাপ সক্ষম করার পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। আই. জি. এস. এফ. 6 জিনটি প্রদাহজনক অন্ত্রের রোগের (আই. বি. ডি) সঙ্গে যুক্ত একটি লোকাসে স্থানীয়করণ করা হয়েছিল। তবে, এই রোগে আক্রান্ত রোগীদের মধ্যে একক নিউক্লিওটাইড পলিমরফিজম (এসএনপি) এবং আইবিডি-র সঙ্গে কোনও সম্পর্ক ছিল না। আই. জি. এস. এফ 6-এর জন্য একটি সাধারণ উপনাম জিন অ্যাক্টিভেশন (ডি. ও. আর. এ) দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয়। সাইটোজেনিক অবস্থানটি ক্রোমোজোম 16 (16p12.2)-এ রয়েছে। আইজিএসএফ6-এর মোট 6টি এক্সোন রয়েছে। জিনের স্প্যান হল 13059 বেস জোড়া। প্রোটিন আইজিএসএফ6 প্রোটিনের তাত্ত্বিক আইসোইলেক্ট্রিক পয়েন্ট (পিআই) এবং আণবিক ওজন (এমডব্লিউ) যে কোনও পরিবর্তনের আগে যথাক্রমে 8.9 এবং 27 কেডিএ হয়। প্রোটিনের পি. আই সর্বত্র সামঞ্জস্যপূর্ণ নয়, কারণ এন-টার্মিনাল অর্ধেকের পি. আই সি-টার্মিনাল অর্ধেকের তুলনায় কম। আই. জি. এস. এফ. 6 8.93-এ নিরপেক্ষ এবং 7-এর কাছাকাছি ঋণাত্মক হবে। প্রোটিন মোটিফ খুঁজে বের করতে ইউক্যারিওটিক লিনিয়ার মোটিফ (ই. এল. এম) ব্যবহার করা হয়েছিল। গ্লোবুলার ডোমেন ফিল্টারিং, স্ট্রাকচারাল ফিল্টারিং এবং প্রসঙ্গ ফিল্টারিংয়ের পরে ই. এল. এম-এর তালিকা দেওয়া হয়েছিল। দেখানো চারটি মোটিফ সম্ভাব্যতা দ্বারা সংগঠিত এবং স্তন্যপায়ী অর্থোলগে সংরক্ষিত। কাঠামো আইজিএসএফ6-এর গৌণ কাঠামোতে কয়েল, স্ট্র্যান্ড এবং আলফা হেলিসের অঞ্চল থাকবে বলে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। সবচেয়ে স্পষ্ট হেলিক্স অঞ্চলগুলি অ্যামিনো অ্যাসিড 149-178 এবং অ্যামিনো অ্যাসিড 197-218 থেকে ঘটে। আইজিএসএফ6-এ অ্যামিনো অ্যাসিড 154 থেকে 176 পর্যন্ত একটি ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন রয়েছে। পূর্বাভাস দেওয়া ডাইসালফাইড বন্ধনগুলি ডায়ানা ব্যবহার করে পাওয়া গেছে। জিন স্তর নিয়ন্ত্রণ অভিব্যক্তি প্যাটার্ন আই. জি. এস. এফ 6 শ্বেত রক্তকণিকা এবং লিম্ফ নোড এবং প্লীহা সহ গৌণ লিম্ফয়েড অঙ্গগুলিতে অত্যন্ত প্রকাশিত হয়। মানুষের 20টি টিস্যুতে এম. আর. এন. এ-র প্রাচুর্য কম। মাইক্রো-অ্যারে মূল্যায়ন করা টিস্যু এক্সপ্রেশন প্যাটার্নগুলি গ্যাংলিয়া, মনোসাইট এবং মায়েলয়েড টিস্যুতে উচ্চ অভিব্যক্তি দেখায়। সিটু হাইব্রিডাইজেশনে দেখা গেছে যে আই. জি. এস. এফ 6-এর নিয়ন্ত্রণ কম ছিল এবং ইঁদুরের মস্তিষ্কে সর্বব্যাপী প্রকাশিত হয়েছিল। প্রোটিনগুলি মানুষের অণ্ডকোষ এবং থাইরয়েডে অবস্থান করে। প্রোমোটার এবং ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর প্রোমোটার অঞ্চল এবং ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলি প্রোমোটার রেখাচিত্রে দেখানো হয়েছে। দেখানো প্রতিলিপি উপাদানগুলি আই. জি. এস. এফ 6-এর প্রাণী অর্থোলগে অত্যন্ত সংরক্ষিত ছিল। প্রোটিন স্তর নিয়ন্ত্রণ আই. জি. এস. এফ 6 প্রোটিন প্লাজমা ঝিল্লিতে থাকার পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। আইজিএসএফ6-এ অ্যামিনো অ্যাসিড 17 থেকে 32 পর্যন্ত একটি সংকেত পেপটাইড রয়েছে। আই. জি. এস. এফ. 6-এ ফসফোরিলেশন সাইট এবং লাইসিন অ্যাসিটিলেশন সাইট সহ অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তন রয়েছে। অ্যামিনো অ্যাসিডের অবস্থান 3,5,91,193,198,222 এবং 236-এ ফসফোরাইলেশন সাইটগুলি এবং এই সাইটগুলি এনজাইম্যাটিক ফাংশনে গুরুত্বপূর্ণ। লাইসিন অ্যাসিটিলেশন সাইটগুলি অ্যামিনো অ্যাসিড 187,195,196,213 এবং 224 এ রয়েছে এবং এগুলি জিন অভিব্যক্তি, প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া এবং প্রোটিন প্রক্রিয়াকরণ এবং অবক্ষয়ের ক্ষেত্রে গুরুত্বপূর্ণ। আই. জি. এস. এফ6-এর অ্যামিনো অ্যাসিড 190-এ একটি সুমাইলেশন সাইট রয়েছে। হোমোলজি অ্যান্ড ইভোলিউশন প্যারালগস আইজিএসএফ6-এর একমাত্র প্যারালগ হল টি সেল রিসেপ্টর বিটা ভেরিয়েবল 28 (টিসিআরবিভি28)। পাখি হল সবচেয়ে দূরবর্তী জীব যার মধ্যে টিআরবিভি28 পাওয়া যায়, তাই প্যারালগ তৈরি করার জন্য জিন প্রতিলিপি প্রায় 320 মিলিয়ন বছর আগে ঘটেছিল। টিআরবিভি28 একটি দ্রুত বিবর্তিত জিন, কারণ এটি ফাইব্রিনোজেন আলফার মতো একইভাবে বিকশিত হয়। অর্থোলগস আই. জি. এস. এফ. 6-এর অর্থোলগস এন. সি. বি. আই প্রোটিনের মাধ্যমে পাওয়া যায় এবং মানব প্রোটিনের সাথে বিচ্যুতি এবং ক্রম পরিচয়ের মধ্যবর্তী তারিখ দ্বারা সাজানো হয়। আই. জি. এস. এফ 6 প্রোটিন শুধুমাত্র মেরুদণ্ডী প্রাণীদের মধ্যে পাওয়া যায় এবং এইচ. স্যাপিয়েন্স আই. জি. এস. এফ 6 প্রোটিন মাছ আই. জি. এস. এফ 6 প্রোটিনের সাথে সবচেয়ে দূরবর্তীভাবে সম্পর্কিত। মানুষের আইজিএসএফ6 প্রোটিন অন্যান্য স্তন্যপায়ী প্রাণীর আইজিএসএফ6 প্রোটিনের সাথে সবচেয়ে ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত। এভিস, সরীসৃপ, উভচর প্রাণী এবং মাছের প্রোটিনের গড় ক্রম মানুষের প্রোটিনের সাথে যথাক্রমে 52 শতাংশ, 50 শতাংশ, 50 শতাংশ এবং 45 শতাংশ মিল রয়েছে। আইজিএসএফ6 একটি দ্রুত বিকশিত জিন কারণ এটি ফাইব্রিনোজেন আলফার মতো একইভাবে বিবর্তিত হয়। মিথাইলট্রান্সফেরেজ-সদৃশ প্রোটিন 9 (এম. ই. টি. টি. এল. 9) হল আই. জি. এস. এফ. 6-এর সঙ্গে মিথস্ক্রিয়া করার সবচেয়ে সম্ভাব্য প্রোটিন কারণ আই. জি. এস. এফ. 6 এম. ই. টি. টি. এল. 9-এর একটি ইন্ট্রোনে রয়েছে। আই. জি. এস. এফ. 6 যে প্রোটিনগুলির সঙ্গে মিথস্ক্রিয়া করে তার বেশিরভাগেরই ইমিউনোলজিক্যাল ফাংশন রয়েছে। ক্লিনিকাল তাৎপর্য আইজিএসএফ6 ইমিউনোলজিকাল প্রতিক্রিয়ায় জড়িত থাকার পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। শ্বেত রক্তকণিকা এবং গৌণ লিম্ফয়েড অঙ্গগুলিতে এর উচ্চ অভিব্যক্তি এটিকে সমর্থন করে। আই. জি. এস. এফ. 6 বিভিন্ন রোগ ও অবস্থার সঙ্গে যুক্ত। প্রদাহজনক অন্ত্রের রোগ মানব আই. জি. এস. এফ 6 জিন প্রদাহজনক অন্ত্রের রোগের সাথে যুক্ত একটি লোকাসে স্থানীয়করণ করা হয়েছিল। আইজিএসএফ6-কে প্রদাহজনক অন্ত্রের রোগের (আইবিডি) সংবেদনশীলতার সম্ভাব্য সূচক হিসাবে গবেষণা করা হয়েছে। তবে, এই রোগে আক্রান্ত রোগীদের মধ্যে একক নিউক্লিওটাইড পলিমরফিজম (এসএনপি) এবং আইবিডি-র সঙ্গে কোনও সম্পর্ক ছিল না। ইসোফেজিয়াল স্কোয়ামাস সেল কার্সিনোমা আইজিএসএফ6 এবং অন্যান্য নয়টি জিনের সম্মিলিত অভিব্যক্তি ইসোফেজিয়াল স্কোয়ামাস সেল কার্সিনোমা রোগীদের সামগ্রিক এবং রোগমুক্ত বেঁচে থাকার সাথে উল্লেখযোগ্যভাবে সম্পর্কিত ছিল। মাল্টিপল স্ক্লেরোসিস আইজিএসএফ6 কেন্দ্রীয় স্নায়ুতন্ত্রের দীর্ঘস্থায়ী অটোইমিউন ডিমাইলিনেটিং রোগ মাল্টিপল স্ক্লেরোসিসের রোগীদের মধ্যে মায়েলয়েড কোষের কার্যকারিতার পথে নিয়ন্ত্রিত হতে দেখা গেছে। রেফারেন্স মানব ক্রোমোজোমের উপর জিন 16