UBALD1
ইউ. বি. এ. এল. ডি. 1 (ইউবিকুইটিন-সম্পর্কিত 1 যুক্ত ডোমেন) হল ইউ. বি. এ. এল. ডি. 1 জিন দ্বারা এনকোড করা একটি প্রোটিন, যা মানুষের মধ্যে ক্রোমোজোম 16-এ অবস্থিত। ইউবিএএলডি1-এর উচ্চ সর্বব্যাপী টিস্যু অভিব্যক্তি রয়েছে এবং নিউক্লিয়াস এবং সাইটোপ্লাজমে স্থানীয়করণ করে। ইউবিএএলডি1 অমেরুদণ্ডী প্রাণী সহ প্রাণীদের মধ্যে সংরক্ষিত রয়েছে। UBALD1-এর একটি উপনাম হল FAM100A। জিন মানব ইউবিএএলডি1 জিন ক্রোমোজোম 16-এর মাইনাস স্ট্র্যান্ডে সাইটোজেনেটিক অবস্থান 16p13.3-এ অবস্থিত। জিনের মোট দৈর্ঘ্য 6,145 বেস জোড়া সহ তিনটি এক্সন এবং দুটি ইন্ট্রন রয়েছে। ট্রান্সক্রিপ্ট মানুষের মধ্যে ইউবিএএলডি1-এর তিনটি আইসোফর্ম রয়েছে, যার সবকটিতেই তিনটি এক্সোন রয়েছে। ইউ. বি. এ. এল. ডি. 1 আইসোফর্ম 1-এ 1,374টি নিউক্লিওটাইডের এম. আর. এন. এ ক্রম রয়েছে এবং দীর্ঘতম প্রোটিনকে এনকোড করে। আইসোফর্ম 2 এক্সন 3-এর শুরুতে 75টি নিউক্লিওটাইড বাদ দিয়ে পৃথক হয় এবং আইসোফর্ম 3 এক্সন 1-এর শেষে 185টি নিউক্লিওটাইড সন্নিবেশের সাথে পৃথক হয়। প্রোটিন আইসোফর্ম ইউবিএএলডি1 আইসোফর্ম 1 দীর্ঘতম প্রোটিনকে এনকোড করে যা 177 টি অ্যামিনো অ্যাসিড নিয়ে গঠিত। আইসোফর্ম 2 থেকে প্রোটিনের ক্রম 85.9% আইসোফর্ম 1-এর অনুরূপ। আইসোফর্ম 2-এ এক্সন 3-এ 25টি অ্যামিনো অ্যাসিড রয়েছে এবং পিএইচএ03247 ডোমেনের অভাব রয়েছে। আইসোফর্ম 3 আইসোফর্ম 1 এবং 2 থেকে ব্যাপকভাবে পৃথক, 35.6% আইসোফর্ম 1 এর অনুরূপ। আইসোফর্ম 3-এ 122টি অ্যামিনো অ্যাসিড এবং এক্সন 1-এ একটি অন্তর্ভুক্তি রয়েছে, যার ফলে কোডনগুলির একটি ফ্রেমশিফ্ট এবং এর আগে স্টপ কোডন ঘটে। আইসোফর্ম 3-এ পিএইচএ03247 ডোমেনেরও অভাব রয়েছে। প্রোপাইট এবং ডোমেন ইউবিএএলডি1 আইসোফর্ম 1 দ্বারা এনকোড করা প্রোটিনের একটি পূর্বাভাসকৃত আইসোইলেক্ট্রিক পয়েন্ট 6.13 এবং একটি আণবিক ওজন 19.0 কেডিএ রয়েছে। ইউবিএএলডি1 গঠন অ্যালানাইন এবং প্রোলিন সমৃদ্ধ, এবং এই অবশিষ্টাংশগুলির একাধিক ডুপলেট/তিনগুণ রয়েছে। প্রোলাইন অবশিষ্টাংশ এবং একাধিক অত্যন্ত সংরক্ষিত, বিশেষ করে পিএইচএ03247 ডোমেনের মধ্যে। প্রোটিনে একটি ডোমেন থাকে, পিএইচএ03247, বা বড় টেগুমেন্ট প্রোটিন ইউএল36 ডোমেন। টেগুমেন্ট প্রোটিন ইউএল36 হল হারপিস সিম্প্লেক্স ভাইরাস 1-এ পাওয়া সবচেয়ে বড় টেগুমেন্ট প্রোটিন, এবং এতে ডিউবিক্ভিটিনেটিং ক্রিয়াকলাপ রয়েছে। কাঠামো UBALD1 প্রোটিন গৌণ কাঠামো বেশিরভাগ কয়েল এবং চারটি ছোট আলফা হেলিকাল অঞ্চল (অবস্থান 5-22,25-46,76-83, এবং 170-173) নিয়ে গঠিত। এর তৃতীয় কাঠামো পরবর্তীকালে কুণ্ডলীযুক্ত এবং গোলাকার। রেগুলেশন জিন লেভেল এক্সপ্রেশন ইউবিএএলডি1 একটি অত্যন্ত প্রকাশিত জিন, যা গড় জিনের তুলনায় 1.4 গুণ বেশি প্রকাশিত হয়। ইউবিএএলডি1-এর সর্বব্যাপী অভিব্যক্তি রয়েছে, যার সর্বোচ্চ মাত্রা রয়েছে প্ল্যাসেন্টা, কঙ্কাল পেশী, লিভার এবং মস্তিষ্কে। মস্তিষ্কের মধ্যে, ইউবিএএলডি1 অভিব্যক্তি হিপোক্যাম্পাল গঠনে সর্বোচ্চ এবং ঘ্রাণ অঞ্চলে প্রোটিন স্তর নিয়ন্ত্রণ ইউবিএএলডি1 প্রোটিন নিউক্লিয়াস এবং সাইটোপ্লাজমে স্থানীয়করণের পূর্বাভাস দেওয়া হয়। একটি পারমাণবিক রপ্তানি সংকেত মাঝারিভাবে 79-85 অবস্থানে এবং দৃঢ়ভাবে 174-177 অবস্থানে অবস্থিত। ইউবিএএলডি1-এর এস88, এস90, এস93 এবং এস96-এ পরিচিত ফসফরিলেশন সাইট সহ অনেক ভবিষ্যদ্বাণীকৃত ফসফরিলেশন এবং গ্লাইকোসিলেশন সাইট রয়েছে। বিবর্তনীয় ইতিহাস অর্থোলগস ইউ. বি. এ. এল. ডি1-এর অর্থোলগ স্থানটি বড়, এর সবচেয়ে দূরবর্তী অর্থোলগগুলি 694 মিলিয়ন বছর আগে অমেরুদণ্ডী প্রাণীদের মধ্যে বিচ্ছিন্ন হয়ে যায়। অর্থোলগের মধ্যে রয়েছে বেশিরভাগ মেরুদণ্ডী প্রাণী, যেমন স্তন্যপায়ী প্রাণী, পাখি, সরীসৃপ, উভচর প্রাণী, মাছ, পাশাপাশি কিছু অমেরুদণ্ডী প্রাণী, যেমন আর্থ্রোপড, সিনিডারিয়া, মোলাস্ক, ইচিনোডার্ম এবং নেমাটোড। ছত্রাক, উদ্ভিদ বা ব্যাকটেরিয়ায় কোনও অর্থোলগ নেই। স্তন্যপায়ী প্রাণী, পাখি এবং সরীসৃপ সহ ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত অর্থোলগগুলি 67-92% ক্রমের সাদৃশ্যের পরিসীমা। উভচর এবং মাছ সহ মাঝারিভাবে সম্পর্কিত অর্থোলগগুলি 55-75% সাদৃশ্যের পরিসীমা। অমেরুদণ্ডী প্রাণী সহ দূরবর্তী সম্পর্কিত অর্থোলগগুলি 29-50% ক্রমের সাদৃশ্যের মধ্যে থাকে। প্যারালগ মানব ইউবিএএলডি1 প্রোটিনের একটি প্যারালগ রয়েছে, ইউবিএএলডি2, যা মেরুদণ্ডী প্রাণীর মধ্যে উপস্থিত থাকে কিন্তু অমেরুদণ্ডী প্রাণীর মধ্যে উপস্থিত থাকে না। একটি 63.1% সেকিউনস পরিচয় এবং 70.9% সেকিউনস সাদৃশ্য সহ এগুলি একই রকম। ইউবিএএলডি2 প্রোটিনের দৈর্ঘ্য 164 অ্যামিনো অ্যাসিড, পূর্বাভাসকৃত আইসোইলেক্ট্রিক পয়েন্ট 6.78 এবং আণবিক ওজন 17.7 কেডিএ। ইউ. বি. এ. এল. ডি1-এর ইউ. এল. 36 টেগুমেন্ট প্রোটিন ডোমেনটি আংশিকভাবে ইউ. বি. এ. এল. ডি2 প্যারালগে সংরক্ষিত। ইউবিএএলডি1-এর এক-সমান্তরাল অভিব্যক্তি রয়েছে, যেখানে ইউবিএএলডি2-এর দ্বি-সমান্তরাল অভিব্যক্তি রয়েছে। কনজারভেশন এক্সন 1 এবং এক্সন 3-এর শুরু (অবস্থান 64-79), কঠোর এবং দূরবর্তী অর্থোলগের মধ্যে অত্যন্ত সংরক্ষিত। বিশেষত, এক্সন 3 (পি65, পি69, পি72, পি73, পি76)-এর প্রোলাইন অবশিষ্টাংশগুলি দৃঢ়ভাবে সংরক্ষিত। আন্তঃক্রিয়াশীল প্রোটিন ইউবিএএলডি1-এর নিউক্লিয়াসে পাওয়া প্রোটিন এমইডি8 এবং সাইটোপ্লাজমে পাওয়া আরপিএল9-এর সঙ্গে শারীরিক সম্পর্ক রয়েছে। ইউ. বি. এ. এল. ডি. 1 ই. পি. আর. এস এবং ই. ই. এফ1ই1-এর সাথেও যুক্ত, যা উভয়ই অ্যামিনোসিল-টি. আর. এন. এ সিন্থেটেজ মাল্টিএনজাইম কমপ্লেক্সের সাথে মিথস্ক্রিয়া এবং জড়িত বলে পরিচিত। ক্লিনিকাল তাৎপর্য ইউ. বি. এ. এল. ডি. 1 বিভিন্ন ধরনের ক্যান্সারের সাথে যুক্ত হয়েছে এবং লিম্ফোমা রোগীদের মধ্যে উল্লেখযোগ্যভাবে উন্নত অটো অ্যান্টিবডি হিসাবে চিহ্নিত করা হয়েছিল। ইউবিএএলডি1 প্রবর্তক অঞ্চলের হাইপোমেথাইলেশন কোষ-কোষ সংলগ্নতা, বি কোষ সক্রিয়করণ এবং লিম্ফোসাইট সক্রিয়করণের সাথে যুক্ত ছিল, যা প্ল্যাটিনাম-ভিত্তিক কেমোথেরাপিউটিক্সের প্রাথমিক প্রতিরোধের পূর্বাভাস দেওয়ার জন্য একটি সম্ভাব্য বায়োমার্কার। ইউবিএএলডি1 হাইপোমেথাইলেশন লিঙ্গ অসঙ্গতির সঙ্গেও যুক্ত। জন্মের সময় পুরুষ নিযুক্ত সিআইএস পুরুষদের তুলনায় লিঙ্গ-নিশ্চিতকারী হরমোন থেরাপি গ্রহণের আগে জন্মের সময় পুরুষ নিযুক্ত ট্রান্স মহিলাদের মধ্যে ইউবিএএলডি1-এর উল্লেখযোগ্য সিপিজি হাইপোমেথাইলেশন রয়েছে। রেফারেন্স মানব ক্রোমোজোমের উপর জিন 16