C13orf42
C13orf42 হল একটি প্রোটিন যা মানুষের মধ্যে জিন ক্রোমোজোম 13 ওপেন রিডিং ফ্রেম 42 (C13orf42) দ্বারা এনকোড করা হয়। আরএনএ সিকোয়েন্সিং ডেটা বিভিন্ন টিস্যুতে সি13ওআরএফ42 জিনের কম অভিব্যক্তি দেখায়। C13orf42 প্রোটিন মাইটোকন্ড্রিয়া, নিউক্লিয়াস এবং সাইটোসোলে স্থানীয় হওয়ার পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। C13orf42-এর জন্য তৃতীয় কাঠামোর পূর্বাভাস একাধিক আলফা হেলিস নির্দেশ করে। জিন সারসংক্ষেপ C13orf42 হল একটি প্রোটিন এনকোডিং জিন যার 4টি এক্সন রয়েছে। সি13ওআরএফ42 এলআইএনসি00371 এবং এলআইএনসি00372 নামেও পরিচিত। আর. এন. এ সিকোয়েন্সিং বিভিন্ন টিস্যুতে নিম্ন স্তরে জিনের অভিব্যক্তি দেখায়। অবস্থান C13orf42 মানুষের মধ্যে 13q14.3-এ ক্রোমোজোম 13-এর বিয়োগ স্ট্র্যান্ডে অবস্থিত। C13orf42 ক্রোমোজোম 13-এ 51.08 Mb থেকে 51.20 Mb পর্যন্ত অবস্থিত এবং 118 কিলোবেসে বিস্তৃত। আশেপাশের এলাকা সি13ওআরএফ42-এর জিনোমিক পাড়ায় রাইবোনিউক্লিয়াস এইচ2 সাবইউনিট বি (আরএনএএসইএইচ2বি), বৈশিষ্ট্যহীন এলওসি107984554 এবং 124 সদস্যের এ (এফএএম124এ)-এর সাথে সাদৃশ্যপূর্ণ পরিবার সহ বেশ কয়েকটি সিউডোজিন রয়েছে। এক্সোনস সি13ওআরএফ42 জিনে 4টি এক্সোন থাকে। সি13ওআরএফ42-এর এক্সপ্রেশন আরএনএ সিকোয়েন্সিং প্লীহা, কিডনি, হৃদয়, মস্তিষ্ক, অণ্ডকোষ, ত্বক, অন্ননালী, কোলন, ছোট অন্ত্র, পাকস্থলী, ফুসফুস, প্ল্যাসেন্টা, লালা গ্রন্থি, থাইমাস এবং অ্যাডিপোজ সহ বিভিন্ন টিস্যুতে অভিব্যক্তি দেখায়। মানব ভ্রূণের টিস্যুর আরএনএ সিকোয়েন্সিং দেখায় যে C13orf42 অভিব্যক্তি অন্ত্রে 20 সপ্তাহ, কিডনিতে 16 সপ্তাহ, ফুসফুসে 10 সপ্তাহ থেকে শুরু হয় এবং পেটে অভিব্যক্তি 16 সপ্তাহে দেখা যায় তবে 10,18 বা 20 সপ্তাহে নয়। রেকর্ড করা আরএনএ এক্সপ্রেশন খুব কম, সমস্ত ফলাফল প্রতি মিলিয়ন রিড ম্যাপ (আরপিকেএম)-এর প্রতিলিপির প্রতি কিলোবেসে 0.5 রিডের চেয়ে কম। এনসিবিআই জিও (জিডিএস425) থেকে প্রাপ্ত মাইক্রো অ্যারে তথ্য অস্থি মজ্জা, যকৃত, কঙ্কাল পেশী, মেরুদণ্ড এবং অগ্ন্যাশয় সহ অতিরিক্ত টিস্যুতে অভিব্যক্তি দেখায়। ট্রান্সক্রিপ্ট ভ্যারিয়েন্ট C13orf42 চারটি পরিচিত ট্রান্সক্রিপ্ট ভ্যারিয়েন্ট তৈরি করে, ভ্যারিয়েন্ট 1, ভ্যারিয়েন্ট 2, ভ্যারিয়েন্ট 3 এবং ভ্যারিয়েন্ট X1। প্রতিলিপি বৈকল্পিক 3 (সংযোজন সংখ্যাঃ NM_001351589.3) হল 3075 নিউক্লিওটাইডে দীর্ঘতম উচ্চ-মানের এমআরএনএ। প্রতিলিপি বৈকল্পিক 3-এ 4টি এক্সোন রয়েছে এবং একটি 325 অ্যামিনো অ্যাসিড প্রোটিনকে এনকোড করে। প্রতিলিপি বৈকল্পিক 1,2,3 এবং এক্স 1-এর মধ্যে প্রথম এক্সনের অভাব রয়েছে তবে প্রতিলিপি বৈকল্পিক 3-এর এক্সনের 2,3 এবং 4-এর সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ। ভ্যারিয়েন্ট 1 এবং 2 প্রোটিন এনকোডিং নয়, অন্যদিকে ভ্যারিয়েন্ট 3 এবং এক্স 1 প্রোটিন কোডিং। ভ্যারিয়েন্ট এক্স1 2717 নিউক্লিওটাইড দীর্ঘ এবং একটি 189 অ্যামিনো অ্যাসিড প্রোটিনকে এনকোড করে যা ট্রান্সক্রিপ্ট ভ্যারিয়েন্ট 3 দ্বারা এনকোড করা দীর্ঘ প্রোটিনের শেষ 187 অ্যামিনো অ্যাসিডের সাথে সারিবদ্ধ হয় এবং এর প্রথম দুটি অ্যামিনো অ্যাসিডের মধ্যে পার্থক্য রয়েছে। প্রোটিন আইসোফর্ম C13orf42-এর আইসোফর্ম দ্বারা এনকোড করা দুটি পরিচিত প্রোটিন রয়েছে। প্রতিলিপি বৈকল্পিক 3 দীর্ঘতম প্রোটিনকে 325 অ্যামিনো অ্যাসিডে এনকোড করে। প্রতিলিপি বৈকল্পিক এক্স1 একটি 189 অ্যামিনো অ্যাসিড দীর্ঘ প্রোটিনকে এনকোড করে। এই প্রোটিনটি 325 অ্যামিনো অ্যাসিড প্রোটিনের 2,3 এবং 4 এক্সনের সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ, তবে এক্সন 1 অনুপস্থিত। প্রোটিন গঠন সি13ওআরএফ42-এর একটি পূর্বাভাসকৃত আইসোইলেক্ট্রিক বিন্দু 9.3 এবং একটি পূর্বাভাসিত আণবিক ওজন 37.4 কেডিএ রয়েছে। হিউম্যান সি13ওআরএফ42 একটি সেরিন সমৃদ্ধ এবং পজিটিভ চার্জড অ্যামিনো অ্যাসিড (লাইসিন এবং আর্জিনিন) সমৃদ্ধ প্রোটিন। এই রচনাটি আংশিকভাবে অর্থোলগে সংরক্ষিত। তৃতীয় কাঠামো আই-টাসার দ্বারা পূর্বাভাস দেওয়া সর্বোচ্চ আত্মবিশ্বাসের C13orf42 তৃতীয় কাঠামোতে অনেকগুলি আলফা হেলিস রয়েছে বলে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। নীচের কাঠামোতে, উচ্চ পরিমাণে (সেরিন, লাইসিন এবং আর্জিনিন) C13orf42-এ উপস্থিত থাকার জন্য নির্দেশিত অবশিষ্টাংশগুলি উল্লেখ করা হয়েছে। C13orf42-এর জন্য একটি স্পেস ফিলিং মডেল এবং একটি চার্জ মডেলও দেখানো হয়েছে। সাবসেলুলার স্থানীয়করণ হিউম্যান সি13ওআরএফ42 মাইটোকন্ড্রিয়া, নিউক্লিয়াস, সাইটোসল এবং এন্ডোপ্লাজমিক রেটিকুলামে স্থানীয়করণের পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে এবং ইআর কম শতাংশে (<5 শতাংশ) পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। অর্থোলগগুলি মাইটোকন্ড্রিয়া, নিউক্লিয়াস এবং সাইটোসল শীর্ষ পূর্বাভাসের অবস্থানগুলির সাথে অনুরূপ পূর্বাভাসযুক্ত উপকোষীয় স্থানীয়করণ দেখায়, তবে, পূর্বাভাস শতাংশগুলি পরিবর্তিত হয়। ইমিউনোহিস্টোকেমিস্ট্রি সি13ওআরএফ42 অ্যান্টিবডি বি-4 (ক্যাটালগ নম্বরঃ এসসি-376095) সেমিনিফেরাস নালী এবং টেস্টিস টিস্যুর লাইডিগ কোষে সাইটোপ্লাজমিক এবং পারমাণবিক দাগ দেখায়। সি13ওআরএফ42 অ্যান্টিবডি ই-3 (ক্যাটালগ নম্বরঃ এস. সি-374567) সেমিনীফেরাস নালী এবং টেস্টিস টিস্যুর লাইডিগ কোষে সাইটোপ্লাজমিক দাগ এবং হেলা কোষে সাইটোপ্লাজমিক এবং নিউক্লিওলার স্থানীয়করণ দেখায়। পোস্ট ট্রান্সলেশনাল মডিফিকেশনস সি13ওআরএফ42-এ 10টি অত্যন্ত সংরক্ষিত (নীচের টেবিল থেকে বিশ্লেষণ করা অর্থোলগের 70 শতাংশেরও বেশি) ফসফোরিলেশন সাইট রয়েছে বলে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। ফসফোরিলেশন সাইটগুলির মধ্যে একটি সিকে2 ফসফোরিলেশন, একটি টিওয়াইআর ফসফোরিলেশন, দুটি সিএএমপি ফসফোরিলেশন সাইট এবং ছয়টি পিকেসি ফসফোরিলেশন সাইট রয়েছে। C13orf42-এ তিনটি পূর্বাভাসকৃত O-β-GlcNAc সাইট এবং দুটি পূর্বাভাসকৃত ইয়িন-ইয়াং সাইট রয়েছে যা অর্থোলগে সম্পূর্ণরূপে সংরক্ষিত। একটি ইয়িন-ইয়াং সাইট ঘটে যখন একই সাইটের জন্য ও-বিটা-জিএলসিএনএসি এবং ফসফোরিলেশনের পূর্বাভাস দেওয়া হয়। সি13ওআরএফ42-এ মাইরিস্টিলেশন সাইট থাকার পূর্বাভাস দেওয়া হয়নি কারণ এতে এন-টার্মিনাল গ্লাইসিন থাকে না। C13orf42 ডোমেনের অর্থোলগে উচ্চ আস্থা বা সংরক্ষণ সহ কোনও চিহ্নিত ডোমেন নেই। হোমোলজি এবং বিবর্তন অর্থোলগ সি13ওআরএফ42-এ স্তন্যপায়ী প্রাণী, পাখি, সরীসৃপ, উভচর, হাড়ের মাছ এবং কার্টিলাজিনস মাছের অর্থোলগ রয়েছে যা নীচের অর্থোলগ টেবিলে দেখানো হয়েছে। চোয়ালবিহীন মাছ, অমেরুদণ্ডী প্রাণী, উদ্ভিদ, ছত্রাক, ভাইরাস বা ব্যাকটেরিয়ায় কোনও অর্থোলগ পাওয়া যায়নি। সমস্ত স্তন্যপায়ী প্রাণীর মধ্যে মানব সি13ওআরএফ42 প্রোটিনের মতো একই 4টি এক্সন থাকে এবং অ-স্তন্যপায়ী প্রাণীর মধ্যে এক্সন 4 অনুপস্থিত থাকে। স্তন্যপায়ী অর্থোলগের মানব সি13ওআরএফ42-এর উচ্চ শতাংশ পরিচয় রয়েছে, যার প্রত্যেকটির 62 শতাংশেরও বেশি পরিচয় রয়েছে। সবচেয়ে দূরবর্তী অর্থোলগগুলির (কার্টিলাজিনিয়াস মাছ) প্রায় 33 শতাংশ অনুক্রম পরিচয় রয়েছে। হিউম্যান সি13ওআরএফ42-এর কোনও প্যারালগ নেই। অর্থোলগ টেবিল ফাইলোজেনি একটি ফাইলোজেনেটিক গাছ দেখায় যে মানব সি13ওআরএফ42 তার স্তন্যপায়ী অর্থোলগগুলির সাথে সবচেয়ে বেশি সম্পর্কিত এবং কার্টিলাজিনস মাছের অর্থোলগের সাথে সবচেয়ে দূরবর্তীভাবে সম্পর্কিত। ফাংশন ক্লিনিকাল তাৎপর্য কানাগল-শামান্না ইত্যাদি। দীর্ঘস্থায়ী লিম্ফোসাইটিক লিউকেমিয়ায় আক্রান্ত এক রোগীর মধ্যে সি13ওআরএফ42-এর সঙ্গে একটি এটিএম ফিউশন চিহ্নিত করা হয়েছে যা এটিএম নিষ্ক্রিয়করণের দিকে পরিচালিত করে। জিয়ং এবং অন্যান্য। আল এসএনপি আরএস 7325564-কে মানুষের মধ্যে ন্যাশন এবং প্রোনাসেল মুখের আকৃতির সাথে উল্লেখযোগ্যভাবে যুক্ত বলে ইঙ্গিত করেছেন। তথ্যসূত্র