C17orf75
ক্রোমোজোম 17 ওপেন রিডিং ফ্রেম 75 হল একটি প্রোটিন যা মানুষের মধ্যে C17orf75 জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। C17orf75 SRI2 নামেও পরিচিত (রিসিন কমপ্লেক্স সাবইউনিট 2-এর প্রতি সংবেদনশীলতা) এবং এটি একটি মানব প্রোটিন এনকোডিং জিন যা পরিপূরক স্ট্র্যান্ডে 17q11.2 এ অবস্থিত। এই জিন যে প্রোটিনকে এনকোড করে তা এনজেএমইউ-আর1 নামেও পরিচিত। C17orf75 জিন সর্বব্যাপী সারা শরীর জুড়ে মাঝারি-নিম্ন স্তরে এবং মস্তিষ্ক এবং অণ্ডকোষের সামান্য উচ্চতর স্তরে প্রকাশিত হয়। এই প্রোটিনটি গলগিন-মধ্যস্থ ভেসিকল ক্যাপচারের সাথে যুক্ত একটি জটিল অংশ বলে মনে করা হয়। C17orf75 জিনটি অবস্থান 32,328,441 থেকে অবস্থান 32,342,173 পর্যন্ত বিস্তৃত এবং এর দৈর্ঘ্য 13,733 নিউক্লিওটাইড। ইন্ট্রন উত্তোলনের পর দৈর্ঘ্য 4,547 নিউক্লিওটাইড, এবং কোডিং ক্রম দৈর্ঘ্যে 1,191 নিউক্লিওটাইড। C17orf75-এর 10টি এক্সোন রয়েছে। RNA C17orf75-এর 4টি প্রতিলিপি আইসোফর্ম রয়েছেঃ C17orf75 এবং 3টি পূর্বাভাসকৃত আইসোফর্ম যা হল C17orf75 প্রতিলিপি বৈকল্পিক X1 (দৈর্ঘ্যে 4,568 নিউক্লিওটাইড), C17orf75 প্রতিলিপি বৈকল্পিক X2 (দৈর্ঘ্যে 4,449 নিউক্লিওটাইড), এবং C17orf75 প্রতিলিপি বৈকল্পিক X3 (দৈর্ঘ্যে 4,464 নিউক্লিওটাইড)। প্রোটিন কাঠামো এন. জে. এম. ইউ-আর1 প্রোটিনের প্রাথমিক আইসোফর্ম হল 396 অ্যামিনো অ্যাসিড দীর্ঘ। এন. জে. এম. ইউ-আর1 প্রোটিনের তাত্ত্বিক আইসোইলেক্ট্রিক বিন্দু প্রায় 5, এবং এর আনুমানিক আণবিক ওজন প্রায় 44 কে. ডি। এই প্রোটিনের একটি লিউসিন জিপার রয়েছে যা প্রোটিনের ভাঁজ করা কাঠামোতে একটি কুণ্ডলী কুণ্ডলীতে অবদান রাখার পূর্বাভাস দেওয়া হয়। প্রোটিনের গৌণ কাঠামো কিছু বিটা শীট সহ হেলিস দ্বারা প্রভাবিত হওয়ার পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। সিস্টিনের অবশিষ্টাংশের মাধ্যমে 3টি সম্ভাব্য ডাইসালফাইড ব্রিজ সাইট প্রোটিনে পূর্বাভাস দেওয়া হয়। অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তন এনজেএমইউ-আর1 প্রোটিনের এন-টার্মিনাসের কাছে দুটি পরীক্ষামূলকভাবে নির্ধারিত সেরিন ফসফোরিলেশন সাইট রয়েছে। প্রত্যাশিত অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তনগুলির মধ্যে রয়েছে টাইরোসিন সালফেশন, ও-লিঙ্কযুক্ত গ্লাইকোসাইলেশন এবং জিপিআই অ্যাঙ্কর সংযুক্তি। টিস্যু স্থানীয়করণ ইমিউনোহিস্টোকেমিস্ট্রি দাগযুক্ত চিত্রগুলি ইঁদুরের মস্তিষ্কের টিস্যু জুড়ে মাঝারি প্রোটিন মাত্রা দেখায়, তবে সেরিবেলামের পারকিনজে স্তরটি বিশেষত পার্শ্ববর্তী দানাদার স্তরের তুলনায় প্রোটিনের ঘনত্বের একটি স্পষ্টভাবে উচ্চ স্তর দেখায়। ইঁদুরের মস্তিষ্কের বৃত্তাকার অঙ্গগুলিতেও প্রোটিনের উচ্চ ঘনত্ব রয়েছে। কোষীয় স্থানীয়করণ কোষের মধ্যে, চিত্রগুলি দেখায় যে প্রোটিনটি সাইটোসোলে এবং গলগি যন্ত্রের কাছাকাছি গুচ্ছবদ্ধ। পি. এস. ও. আর. টি. আই সরঞ্জামটি আরও ভবিষ্যদ্বাণী করে যে এই প্রোটিনটি সাইটোসোলের সাথে স্থানীয়কৃত। এক্সপ্রেশন ডেটা আরএনএ সিকোয়েন্সিং ডেটা দেখায় যে সি17ওআরএফ75 অণ্ডকোষ, মস্তিষ্ক এবং কিডনি ও থাইরয়েডে মাঝারিভাবে উচ্চতর স্তরে অত্যন্ত প্রকাশ পায়। মাইক্রো অ্যারে ডেটা দেখায় যে এই জিনটি বেশিরভাগ টিস্যুতে সর্বব্যাপী প্রকাশিত হয়, মস্তিষ্কে মাঝারি থেকে উচ্চ অভিব্যক্তি এবং অন্যান্য সমস্ত টিস্যুতে টেস্টিস এবং মাঝারি থেকে নিম্ন অভিব্যক্তি সহ। কোলোরেক্টাল এবং অন্যান্য ক্যান্সারে C17orf75-এর এক্সপ্রেশন মাত্রা বেশি দেখা যায়, যা পরামর্শ দেয় যে C17orf75 একটি প্রোটোনকোজিন হতে পারে বা জিনের নিয়ন্ত্রণের আরেকটি উপাদান রয়েছে যা এই উচ্চতর মাত্রা সৃষ্টি করছে। হোমোলজি C17orf75 জিনের অর্থোলগগুলি অ্যামিবা এবং স্লাইম ছাঁচের মতো দূরবর্তীভাবে সম্পর্কিত যা প্রায় 1,092,000,000 বছর পুরানো। এটি তখন থেকে বিচ্ছিন্ন হওয়া বেশিরভাগ প্রাণীর মধ্যে দেখা যায়, যেমন পোকামাকড়, যদিও, উল্লেখযোগ্যভাবে, ড্রোসোফিলা নয়, সামুদ্রিক মেরুদণ্ডী প্রাণী, সামুদ্রিক অমেরুদণ্ডী প্রাণী, 14 টি উভচর (শুধুমাত্র ব্যাঙ/টোড এবং সিসিলিয়ান), সরীসৃপ, পাখি এবং স্তন্যপায়ী প্রাণী। প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া গবেষণার ফলাফলগুলি দেখায় যে এনজেএমইউ-আর1 একটি ট্রিমারের অংশ হতে পারে বলে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে (এফএএম91এ1 [ফেমিলি উইথ সিকোয়েন্স সিমিলারিটি 91 মেম্বার এ1] এবং এসআরআই1 সহ), যা ইমিউনোপ্রিসিপিটেশন, ফ্র্যাকশনেশন এবং মাস স্পেকট্রোমেট্রি-র মাধ্যমে পাওয়া যায়। এই ট্রিমারটি প্রস্তাব করা হয়েছে গলগির ভেসিকলগুলি, বিশেষত এবি টক্সিন, রিসিন-এর সাথে জড়িত ভেসিকলগুলি ধরার জন্য, কারণ সি17ওআরএফ75-এর নকআউটগুলি রিসিন-এর প্রতি উচ্চতর কোষের সংবেদনশীলতার দিকে পরিচালিত করে। তথ্যসূত্র জেনেটিক্স প্রোটিন শ্রেণীবিভাগ বায়োইনফরম্যাটিক্স কোষ জীববিজ্ঞান মানব প্রোটিন