Chromosome 4 open reading frame 50
ক্রোমোজোম 4 ওপেন রিডিং ফ্রেম 50 হল একটি প্রোটিন যা মানুষের মধ্যে C4orf50 জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। প্রোটিন নিউক্লিয়াসে অবস্থান করে। C4orf50-এর মেরুদণ্ডী প্রাণীদের মধ্যে অর্থোলগ রয়েছে তবে অমেরুদণ্ডী প্রাণীদের মধ্যে নয় জিন C4orf50 জিন ক্রোমোজোম 4-এ অবস্থান 4p16.2-এ রয়েছে এবং মাইনাস স্ট্র্যান্ডে অবস্থিত। জিনের দীর্ঘতম আইসোফর্মটি 11টি এক্সন, 6370টি নিউক্লিওটাইডের একটি কোডিং ক্রম এবং একটি আপস্ট্রিম ইন-ফ্রেম স্টপ কোডন নিয়ে গঠিত। জিন আশেপাশের অন্যান্য জিনের মধ্যে রয়েছেঃ সিআরএমপি1 এবং জেএকেএমআইপি1 প্রোটিন সি4ওআরএফ50 1508 অ্যামিনো অ্যাসিড দীর্ঘ এবং এর আণবিক ওজন 30 কেডিএ। আইসোইলেক্ট্রিক বিন্দুটির পিএইচ প্রায় 5.6। উপরন্তু, প্রোটিনে গ্লুটামিক অ্যাসিড এবং আর্জিনাইনের স্বাভাবিক পরিমাণের চেয়ে বেশি এবং ফেনাইল্যালানাইন এবং টাইরোসিনের স্বাভাবিক পরিমাণের চেয়ে কম থাকে। তৃতীয় কাঠামো আই-টিএএসএসইআর এবং ফাইয়ার 2 পূর্বাভাস দেয় যে সি4ওআরএফ50-এর একটি তৃতীয় কাঠামো রয়েছে যা এন-টার্মিনাস এবং সি-টার্মিনাসের কাছাকাছি কেন্দ্রীভূত আলফা হেলিসেস সমৃদ্ধ। জিন স্তর নিয়ন্ত্রণ অভিব্যক্তি C4orf50 RNA বেশিরভাগ টিস্যু ধরনের মধ্যে নিচু এবং সর্বব্যাপীভাবে প্রকাশ করা হয়। C4orf50 মস্তিষ্ক, অণ্ডকোষ, অ্যাড্রিনাল এবং প্রস্টেটের অনেক উচ্চ স্তরে প্রকাশিত হয়। হিপোক্যাম্পাস এবং স্ট্রিয়াটাম সহ মস্তিষ্কের নির্দিষ্ট অংশে C4orf50 প্রকাশ করা হয়েছিল। মাঝারি অভিব্যক্তি সহ অন্যান্য টিস্যুগুলির মধ্যে রয়েছে ফ্রন্টাল লোব, প্যারিয়েটাল লোব এবং অ্যামিগডালা। সমস্ত উপলব্ধ আরএনএ-সিকোয়েন্সিং তথ্য দেখায় যে C4orf50 মস্তিষ্কে পাওয়া যায়। প্রোটিন স্তর নিয়ন্ত্রণ পরিবর্তন এটি পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে যে C4orf50-এ 21টি ফসফরিলেশন সাইট, একটি সালফোনেশন সাইট, একটি এন-গ্লাইকোসিলেশন সাইট এবং বেশ কয়েকটি ও-গ্লাইকোসিলেশন সাইট রয়েছে। উপকোষীয় স্থানীয়করণ প্রাথমিক উপকোষীয় অবস্থান হল নিউক্লিয়াস। C4orf50 অ্যান্টিবডিগুলির ইমিউনোফ্লোরেসেন্ট দাগ দেখায় যে C4orf50 নিউক্লিয়াসে উপস্থিত রয়েছে, তবে কারণটি অজানা রয়ে গেছে। C4orf50 মানুষের বেশিরভাগ প্রোটিনের তুলনায় কম প্রাচুর্যযুক্ত হোমো স্যাপিয়েন্সের বিবর্তন অর্থোলগস C4orf50 দুর্বলভাবে সংরক্ষিত। এটি মেরুদণ্ডী প্রাণীদের মধ্যে পাওয়া যায় কিন্তু অমেরুদণ্ডী প্রাণীদের মধ্যে পাওয়া যায় না এবং স্তন্যপায়ী প্রাণী, সরীসৃপ, পাখি, উভচর প্রাণী এবং মাছ সহ অনেক অর্থোলগ রয়েছে। নীচের সারণি 1-এ স্তন্যপায়ী প্রাণী, সরীসৃপ, পাখি, উভচর প্রাণী এবং মাছের মধ্যে C4orf50-এর অর্থোলগ দেখানো হয়েছে। সাইটোক্রোম সি এবং ফাইব্রিনোজেন আলফার রেফারেন্স সিকোয়েন্সের তুলনায় সি4ওআরএফ50 যথেষ্ট দ্রুত বিকশিত হচ্ছে। C4orf50, সাইটোক্রোম C এবং ফাইব্রিনোজেন আলফার বিচ্যুতির হারের তুলনা করার সময় এটি ডানদিকে দেখানো হয়। * এমওয়াইএ = মিলিয়ন বছর আগে রেফারেন্স মানব ক্রোমোজোমের উপর জিন 4