Apratoxin A
অ্যাপ্রাটক্সিন এ-একটি সায়ানোব্যাকটেরিয়াল গৌণ বিপাক, যা একটি শক্তিশালী সাইটোটক্সিক সামুদ্রিক প্রাকৃতিক পণ্য হিসাবে পরিচিত। এটি সাইটোটক্সিন পরিবারের অ্যাপ্রাটক্সিন থেকে উদ্ভূত। মিশ্র পেপটাইড-পলিকেটাইড প্রাকৃতিক পণ্য একটি পলিকেটাইড সিন্থেস/নন-রাইবোসোমাল পেপটাইড সিন্থেস পাথওয়ে (পিকেএস/এনআরপিএস) থেকে আসে। এই সাইটোটক্সিন জি1-পর্যায়ের কোষ চক্র আটক এবং অ্যাপোপটোসিস প্ররোচিত করার জন্য পরিচিত। এই প্রাকৃতিক পণ্যের ক্রিয়াকলাপ এটিকে অ্যান্টিক্যান্সার ডেরিভেটিভস বিকাশের জন্য একটি জনপ্রিয় লক্ষ্যবস্তুতে পরিণত করেছে। কাঠামোগত বৈশিষ্ট্য এবং নির্ধারণ এপ্রাটক্সিন এ একটি মিশ্র পেপটাইড-পলিকেটাইড চক্রাকার কাঠামো, যা উপরে দেখানো হয়েছে। এটির একটি থায়াজোলিন বলয় রয়েছে যা পলিকেটাইড অংশ দ্বারা বেষ্টিত, যার মধ্যে একটির একটি অস্বাভাবিক মিথাইলেশন প্যাটার্ন রয়েছে। বেশ কয়েকটি 2ডি এন. এম. আর কৌশল সহ বর্ণালী বিশ্লেষণের মাধ্যমে কাঠামোটি ব্যাখ্যা করা হয়েছে। কাইরাল এইচ. পি. এল. সি বিশ্লেষণ দ্বারা অ্যামিনো অ্যাসিড অংশগুলির পরম বিন্যাস নির্ধারণ করা হয়েছিল। জৈবসংশ্লেষণ অ্যাপ্রাটক্সিন এ অ্যাপ্রাটক্সিন জৈবসংশ্লেষক পথ থেকে আসে। চিত্র 1-এ অ্যাপ্রাটক্সিন-এর একটি প্রস্তাবিত জৈব সংশ্লেষিত পথ বর্ণনা করা হয়েছে। অ্যাপ্রাটক্সিন জৈব সংশ্লেষিত পথ হল প্রথম প্রকারের মডুলার মিশ্র পলিকেটাইড সিন্থেস/নন-রাইবোসোমাল পেপটাইড সিন্থেস (পিকেএস/এনআরপিএস)-এর একটি সংগঠন। জিনগতভাবে, 58কেবি বায়োসিন্থেটিক জিন ক্লাস্টারটি 12টি ওপেন রিডিং ফ্রেম (ওআরএফ) নিয়ে গঠিত, যা চিত্র 1-এ দেখানো হয়েছে। মডিউল এবং ডোমেন প্রতিটি টাইপ I পলিকেটাইড-সিন্থেস মডিউল নির্দিষ্ট ফাংশন সহ বেশ কয়েকটি ডোমেন নিয়ে গঠিত, যা সংক্ষিপ্ত স্পেসার অঞ্চল দ্বারা পৃথক করা হয়। নন-রাইবোসোমাল পেপটাইডগুলি একাধিক বিশেষায়িত এন. আর. পি. এস এনজাইম দ্বারা সংশ্লেষিত হয়। পলিকেটাইড এবং অ-রাইবোসোমাল জৈব সংশ্লেষণের মধ্যে কাঠামোগত এবং যান্ত্রিক সাদৃশ্যের কারণে, অ্যাপ্রাটক্সিন এ উভয় জৈব সংশ্লেষণ পথ থেকে মডিউলগুলিকে অন্তর্ভুক্ত করেছে। অ্যাপ্র্যাটক্সিন এ জৈব সংশ্লেষণের জন্য নিম্নলিখিত ক্ষেত্রগুলি প্রস্তাব করা হয়েছেঃ এআর-অ্যাডাপ্টার অঞ্চল জিএনএটি-জিসিএন3 অ্যাসাইল ট্রান্সফারেজ জিএনএমটি-গ্লাইসিন-এন-মিথাইল ট্রান্সফারেজ এমটি-মিথাইল ট্রান্সফারেজ কেএস-কেটো সিনথেস এটি-অ্যাসাইল ট্রান্সফারেজ কেআর-কেটো রিডাক্টেস ইআর-এনয়েল রিডাক্টেস এসিপি-অ্যাসাইল ক্যারিয়ার প্রোটিন এইচসিএস-এইচএমজি-কোএ সিন্থেস ইসিএইচ-এনয়েল-কোএ হাইড্রেটেজ সি-ঘনীভবন এ-অ্যাডেনাইলেশন পিসিপি-পেপটাইডিল ক্যারিয়ার প্রোটিন সিওয়াই-সাইক্লেস পর্যায়গুলি চিত্র 1-এ দেখানো ক্রমবর্ধমান চেইন হস্তান্তর করা হয়েছে। একটি টার্ট-বিউটাইল থাইয়েস্টার এসিপিতে লোড করা হয়। প্রথম কার্বনিল সেগমেন্টে এই অংশটি কেআর দিয়ে প্রসারিত এবং চিকিত্সা করা হয়। আরেকটি অ্যাসিটাইল-এস. সি. ও. এ এক্সটেনশন ঘটে এবং এ. সি. পি পলিকেটাইড অংশকে বিটা-হাইড্রক্সিল অবস্থানে পরিবর্তিত করার জন্য স্থানান্তর করে, যা থাইয়েস্টারের সাথে প্রাসঙ্গিক, একটি মিথাইল-কার্বক্সিলিক অ্যাসিডে। একটি ডিহাইড্রেশন এবং ডিকার্বক্সিলেশন রয়েছে। অবশেষে, পথ-পরবর্তী পরিবর্তন বিটা-হাইড্রক্সি অবস্থানকে মিথাইলেট করে, অন্য মিথাইল (একটি মিথাইল-ম্যালোনিল কোএ বিভাগ থেকে) এবং অন্যান্য দুটি হাইড্রক্সিলের জন্য স্টেরিওসেন্টার স্থাপন করে। পলিকেটাইড বিভাগটি এন. আর. পি. এস-এর জন্য পরবর্তী মডিউলে রূপান্তরিত করা হয়েছে। এন. আর. পি. এস-এর সময়, যে কোনও পেপটাইড অংশ লোড করার আগে থায়াজোলিন গঠিত হয়। চূড়ান্ত কাঠামোটি একটি সংযোজন-অপসারণ ধরনের প্রক্রিয়া দ্বারা সাইক্লাইজ করা হয়। পেপটাইড বিভাগের স্টেরিওকেমিস্ট্রি প্রতিটি এনজাইম্যাটিক ধাপে সাবস্ট্রেট অ্যাক্টিভ-সাইট দ্বারা সংজ্ঞায়িত করা হয়। ফার্মাকোলজিক্যাল প্রাসঙ্গিকতা সায়ানোব্যাকটেরিয়াল মেটাবোলাইটগুলি সাধারণত ক্যান্সারের চিকিৎসায় কার্যকর বলে মনে করা হয়। বিশেষ করে, অ্যাপার্টক্সিন এ একটি শক্তিশালী ক্যান্সার কোষ সাইটোটক্সিন হিসাবে পাওয়া গেছে। এটি ইন ভিট্রো এবং ইন ভিভো উভয় গবেষণায় উল্লেখযোগ্যভাবে সাইটোটক্সিক হিসাবে পাওয়া গেছে। অ্যাপার্টক্সিন এ-কে জি1-পর্যায়ের কোষ চক্র আটক এবং অ্যাপোপটোসিসকে প্ররোচিত করতে দেখা গেছে। যদিও এই সাইটোটক্সিনের কার্যপ্রণালী বোঝার জন্য অনেক কাজ করা হয়েছে, তবে কীভাবে অ্যাপ্রাটক্সিন এ কোষে টিউমার বিরোধী ক্রিয়াকলাপকে মধ্যস্থতা করে তার জন্য কোনও নির্দিষ্ট বোঝাপড়া নেই। এছাড়াও, অ্যাপ্রাটক্সিন এ-তে সম্ভাব্য অ্যান্টি-টিউমার এজেন্ট হওয়ার জন্য প্রয়োজনীয় নির্বাচনের অভাব রয়েছে যদিও অসংখ্য প্রতিবেদনে 60 টি টিউমার কোষের লাইনে ডিফারেনশিয়াল সাইটোটক্সিসিটি দেখানো হয়েছে। রেফারেন্স বাহ্যিক লিঙ্ক অ্যাপ্রাটক্সিন একটি কাঠামোগত তথ্য-ই. এম. বি. এল-ই. বি. আই সায়ানোটক্সিন টার্ট-বিউটাইল যৌগ চক্রাকার পেপটাইড পলিকেটাইড