CRM domain
আণবিক জীববিজ্ঞানে, সিআরএম ক্ষেত্রটি প্রায় 100-অ্যামিনো অ্যাসিড আরএনএ-বাইন্ডিং ক্ষেত্র। সিআরএম (ক্লোরোপ্লাস্ট আরএনএ স্প্লাইসিং এবং রাইবোজোম পরিপক্কতা) নামটি পরিবারের চারটি বৈশিষ্ট্যযুক্ত সদস্যের জন্য প্রতিষ্ঠিত কার্যকারিতা প্রতিফলিত করার পরামর্শ দেওয়া হয়েছেঃ জিয়া মেস (ভুট্টা) সিআরএস1, সিএএফ1 এবং সিএএফ2 প্রোটিন এবং এসচেরিচিয়া কোলাই প্রোটিন ওয়াইএইচবিওয়াই। সিআরএম ডোমেইন ধারণকারী প্রোটিনগুলি ইউব্যাকটেরিয়া, আর্কিয়া এবং উদ্ভিদে পাওয়া যায়। সিআরএম ডোমেনটি আর্কিয়া এবং ব্যাকটেরিয়ায় এবং উদ্ভিদের একক এবং বহু-ডোমেন প্রোটিনে একটি স্বতন্ত্র প্রোটিন হিসাবে প্রতিনিধিত্ব করা হয়। এটি প্রস্তাব করা হয়েছে যে প্রোক্যারিওটিক সিআরএম প্রোটিনগুলি আর্কিয়া এবং ব্যাকটেরিয়ার বিচ্যুতির আগে রাইবোজোম-সম্পর্কিত প্রোটিন হিসাবে বিদ্যমান ছিল এবং বিভিন্ন প্রোটিন প্রসঙ্গে অন্তর্ভুক্ত করে এগুলি উদ্ভিদ বংশে আরএনএ বাঁধাই মডিউল হিসাবে সহ-নির্বাচিত হয়েছিল। উদ্ভিদ সিআরএম ক্ষেত্রগুলি কেবল ক্লোরোপ্লাস্টেই নয়, মাইটোকন্ড্রিয়ন এবং নিউক্লিও/সাইটোপ্লাজমিক কম্পার্টমেন্টেও বসবাস করবে বলে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। উদ্ভিদের মধ্যে সি. আর. এম ডোমেইন পরিবারের বৈচিত্র্য আর. এন. এ লক্ষ্যগুলির একটি বৈচিত্র্যময় সেটের পরামর্শ দেয়। সিআরএম ডোমেন হল একটি কম্প্যাক্ট আলফা/বিটা ডোমেন যা একটি আলফা-বিটা-আলফা-বিটা-আলফা-বিটা-বিটা টপোলজি সহ একটি চার-স্ট্র্যান্ডেড বিটা শীট এবং তিনটি আলফা হেলিসেস নিয়ে গঠিত। বিটা শীটের মুখটি মৌলিক, আরএনএ বাঁধাইয়ের ভূমিকার সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ। মৌলিক বিটা শীটের মুখের নিকটবর্তী আরেকটি অংশ যা নিউক্লিক অ্যাসিড শনাক্তকরণে অবদান রাখতে পারে। স্ট্র্যান্ড বিটা1 এবং হেলিক্স আলফা2-এর সংযোগকারী একটি লুপ যার ছয়টি অ্যামিনো অ্যাসিড মোটিফ রয়েছে, জিএক্সএক্সজি বড় অ্যালিফ্যাটিক অবশিষ্টাংশ দ্বারা বেষ্টিত, যার মধ্যে একটি 'এক্স' সাধারণত একটি মৌলিক অবশিষ্টাংশ। এসচেরিকিয়া কোলাই ওয়াইএইচবিওয়াই প্রাক-50এস রাইবোসোমাল সাবইউনিটের সাথে যুক্ত, যা রাইবোসোম সমাবেশে একটি ফাংশন বোঝায়। জি. এফ. পি ভুট্টা থেকে নিউক্লিওলাস পর্যন্ত একটি একক-ডোমেইন সি. আর. এম প্রোটিনের সাথে সংযুক্ত হয়, যা ইঙ্গিত করে যে উদ্ভিদের মধ্যে একটি অনুরূপ ক্রিয়াকলাপ বজায় রাখা হতে পারে। উদ্ভিদ ক্লোরোপ্লাস্টে প্রোটিনযুক্ত একটি সিআরএম ডোমেন গ্রুপ I এবং II ইন্ট্রন স্প্লাইসিং-এ কাজ করে বলে দেখা গেছে। একটি বিচ্ছিন্ন ভুট্টা সি. আর. এম ডোমেনের সাথে ইন ভিট্রো পরীক্ষায় দেখা গেছে যে এটির আর. এন. এ বাঁধাই কার্যকলাপ রয়েছে। এই এবং অন্যান্য ফলাফলগুলি থেকে জানা যায় যে, সি. আর. এম. ক্ষেত্রটি আর্কিয়া এবং ব্যাকটেরিয়ার বিচ্যুতির আগে রাইবোজোম ক্রিয়াকলাপের প্রেক্ষাপটে বিবর্তিত হয়েছিল, যে এই কার্যকারিতাটি বিদ্যমান প্রোক্যারিওটগুলিতে বজায় রাখা হয়েছে এবং উদ্ভিদ জিনোমের বিবর্তনের সময় একটি আর. এন. এ বাঁধাই মডিউল হিসাবে কাজ করার জন্য এই ক্ষেত্রটি নিয়োগ করা হয়েছিল। YhbY-এর একটি ভাঁজ ট্রান্সলেশন ইনিশিয়েশন ফ্যাক্টর 3 (IF3C)-এর সি-টার্মিনাল ডোমেনের অনুরূপ, যা 30S রাইবোসোমে 16S rRNA-এর সাথে আবদ্ধ হয়। তথ্যসূত্র প্রোটিন ক্ষেত্র