Citrate synthase family
আণবিক জীববিজ্ঞানে, প্রোটিনের সাইট্রেট সিন্থেস পরিবারের মধ্যে রয়েছে এনজাইম সাইট্রেট সিন্থেস, এবং সম্পর্কিত এনজাইম 2-মিথাইলসিট্রেট সিন্থেস এবং এটিপি সাইট্রেট লাইজ। সাইট্রেট সিনথেজ এনজাইমের একটি ছোট পরিবারের সদস্য যা ধাতব আয়ন কোফ্যাক্টরের উপস্থিতি ছাড়াই সরাসরি কার্বন-কার্বন বন্ধন তৈরি করতে পারে। এটি ক্রেবস চক্রের প্রথম বিক্রিয়াকে অনুঘটক করে, যথা অক্সালোএসিটেট এবং অ্যাসিটিল-কোএনজাইম এ-কে সাইট্রেট এবং কোএনজাইম এ-তে রূপান্তরিত করে। এই বিক্রিয়া শক্তি উৎপাদন এবং কার্বন আত্তীকরণের জন্য গুরুত্বপূর্ণ। বিক্রিয়াটি 2-ধাপের প্রক্রিয়ায় একটি অ-সমযোজী আবদ্ধ সাইট্রিল-কোএনজাইম এ মধ্যবর্তী প্রক্রিয়ার মাধ্যমে অগ্রসর হয় (অ্যালডল-ক্লেইসেন ঘনীভবন এবং তারপরে সাইট্রিল-কোএ-এর হাইড্রোলাইসিস)। সাইট্রেট সিন্থেস এনজাইম দুটি স্বতন্ত্র কাঠামোগত প্রকারে পাওয়া যায়ঃ টাইপ I এনজাইম (ইউক্যারিওটস, গ্রাম-পজিটিভ ব্যাকটেরিয়া এবং আর্কিয়ায় পাওয়া যায়) হোমোডিমার গঠন করে এবং টাইপ II এনজাইমের তুলনায় ছোট ক্রম থাকে, যা গ্রাম-নেগেটিভ ব্যাকটেরিয়ায় পাওয়া যায় এবং কাঠামোতে হেক্সামেরিক। উভয় প্রকারেই, মনোমার দুটি ডোমেন নিয়ে গঠিতঃ দুটি কাঠামোগত পুনরাবৃত্তি নিয়ে গঠিত একটি বড় আলফা-হেলিকাল ডোমেন, যেখানে দ্বিতীয় পুনরাবৃত্তি একটি ছোট আলফা-হেলিকাল ডোমেন দ্বারা বিঘ্নিত হয়। এই ক্ষেত্রগুলির মধ্যে ফাটল সক্রিয় স্থান গঠন করে, যেখানে সাইট্রেট এবং অ্যাসিটিল-কোএনজাইম এ উভয়ই আবদ্ধ হয়। অক্সালোএসিটেট লিগ্যান্ডের বাঁধনের পরে এনজাইমটি একটি গঠনমূলক পরিবর্তনের মধ্য দিয়ে যায়, যার মাধ্যমে সক্রিয় সাইট ফাটলটি বন্ধ হয়ে যায় যাতে অ্যাসিটিল-কোএ বাঁধাই সাইট তৈরি হয়। ডোমেন ক্লোজারের জন্য প্রয়োজনীয় শক্তি আসে স্তরটির সাথে এনজাইমের মিথস্ক্রিয়া থেকে। টাইপ II এনজাইমগুলির একটি অতিরিক্ত এন-টার্মিনাল বিটা-শীট ডোমেন থাকে এবং কিছু টাইপ II এনজাইম এনএডিএইচ দ্বারা অ্যালোস্টেরিকভাবে প্রতিরোধ করা হয়। 2-মিথাইলসিট্রেট সিনথেজ অক্সালোএসিটেট এবং প্রোপ্যানয়েল-কোএ-কে (2আর, 3এস)-2-হাইড্রক্সিবিউটেন-1,2,3-ট্রাইকার্বক্সিলেট এবং কোএনজাইম এ-তে রূপান্তরিত করে। এই উৎসেচকটি প্রোপিওনেটের উপর ব্যাকটেরিয়ার বৃদ্ধির সময় প্ররোচিত হয়, যেখানে টাইপ II হেক্সামেরিক সাইট্রেট সিনথেজ গঠনমূলক। এটিপি সাইট্রেট লাইয়েজ Mg.ATP-dependent, সিওএ-নির্ভর সাইট্রেটের বিভাজনকে অক্সালোসেটেট এবং অ্যাসিটাইল-কোএ-তে অনুঘটক করে, যা কার্বন ডাই অক্সাইড ঠিক করার জন্য বিভিন্ন অটোট্রফিক ব্যাকটেরিয়া এবং আর্কিয়া দ্বারা ব্যবহৃত সিও2 আত্তীকরণের রিডাক্টিভ ট্রাইকার্বক্সিলিক অ্যাসিড পথের একটি মূল পদক্ষেপ। এটিপি সাইট্রেট লাইয়েজ দুটি স্বতন্ত্র উপ-একক নিয়ে গঠিত। ইউক্যারিওটসে, এটিপি সাইট্রেট লাইয়েজ একটি একক বড় পলিপেপটাইডের একটি হোমোটেট্রামার, এবং মাইটোকন্ড্রিয়াল উত্পাদিত সাইট্রেট থেকে সাইটোসোলিক অ্যাসিটাইল-কোএ তৈরি করতে ব্যবহৃত হয়। তথ্যসূত্র প্রোটিন ক্ষেত্র