Scaffold/matrix attachment region
এস/এমএআর (স্ক্যাফোল্ড/ম্যাট্রিক্স সংযুক্তি অঞ্চল) শব্দটি, অন্যথায় এসএআর (স্ক্যাফোল্ড-সংযুক্তি অঞ্চল) বা এমএআর (ম্যাট্রিক্স-সম্পর্কিত অঞ্চল) নামে পরিচিত, ইউক্যারিওটিক ক্রোমোজোমের ডিএনএর ক্রম যেখানে পারমাণবিক ম্যাট্রিক্স সংযুক্ত হয়। স্থাপত্যগত ডিএনএ উপাদান হিসাবে যা কোষের নিউক্লিয়াসের মধ্যে ইউক্যারিওটের জিনোমকে কার্যকরী ইউনিটে সংগঠিত করে, এস/এমএআরগুলি নিউক্লিয়াসের মধ্যে ক্রোমাটিনের কাঠামোগত সংগঠনের মধ্যস্থতা করে। এই উপাদানগুলি ক্রোমাটিন স্ক্যাফোল্ডের জন্য ডিএনএর নোঙ্গর পয়েন্ট গঠন করে এবং ক্রোমাটিনকে কাঠামোগত ডোমেনে সংগঠিত করতে কাজ করে। পৃথক জিনের উপর গবেষণা এই সিদ্ধান্তে পৌঁছেছে যে এস/এমএআর উপাদানগুলির মধ্যস্থতায় ক্রোমাটিনের গতিশীল এবং জটিল সংগঠন জিন অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। এটি বহু বছর ধরে জানা গেছে যে একটি পলিমার মেশওয়ার্ক, একটি তথাকথিত "পারমাণবিক ম্যাট্রিক্স" বা "পারমাণবিক-স্ক্যাফোল্ড" ইউক্যারিওটিক নিউক্লিয়াসের একটি অপরিহার্য উপাদান। এই পারমাণবিক কঙ্কাল জেনেটিক তথ্যের বিস্তার সম্পর্কিত অনেক বিশেষ ঘটনার জন্য একটি গতিশীল সমর্থন হিসাবে কাজ করে (নীচে দেখুন)। এস/এম. এ. আর জিনোমের অ-এলোমেলো অবস্থানের মানচিত্র তৈরি করে। এগুলি প্রতিলিপি করা অঞ্চলের পার্শ্বে, 5 '-ইন্ট্রোনে এবং জিন ব্রেকপয়েন্ট ক্লাস্টার অঞ্চলে (বিসিআর) ঘটে। সাধারণ নিউক্লিয়ার স্ট্রাকচারাল প্রোটিনের জন্য অ্যাসোসিয়েশন পয়েন্ট হওয়া এস/এমএআরগুলি খাঁটি এবং দক্ষ ক্রোমোসোমাল প্রতিলিপি এবং প্রতিলিপির জন্য, পুনর্মিলন এবং ক্রোমোজোম ঘনীভবনের জন্য প্রয়োজন। এস/এমএআর-এর কোনও সুস্পষ্ট ঐকমত্যের ক্রম নেই। যদিও প্রোটোটাইপ উপাদানগুলি এটি-সমৃদ্ধ অঞ্চলগুলির দৈর্ঘ্যে কয়েকশ বেস জোড়া নিয়ে গঠিত, সামগ্রিক বেস গঠন অবশ্যই তাদের ক্রিয়াকলাপের প্রাথমিক নির্ধারক নয়। পরিবর্তে, তাদের কার্যকারিতার জন্য "এটি-প্যাচ"-এর একটি প্যাটার্ন প্রয়োজন যা টর্সোনাল স্ট্রেনের অধীনে স্থানীয় স্ট্র্যান্ড আনপেয়ারিংয়ের প্রবণতা প্রদান করে। বায়োইনফরমেটিক্সের দৃষ্টিভঙ্গি এই ধারণাকে সমর্থন করে যে, এই বৈশিষ্ট্যগুলির দ্বারা, এস/এমএআরগুলি কেবল একটি প্রদত্ত প্রতিলিপি একককে (ক্রোমাটিন ডোমেন) তার প্রতিবেশীদের থেকে পৃথক করে না, বরং একটি প্রদত্ত ডোমেনের মধ্যে প্রতিলিপি সংক্রান্ত ঘটনাগুলিকে সক্ষম করার জন্য উপাদানগুলির সমাবেশের জন্য প্ল্যাটফর্মও সরবরাহ করে। ডিএনএ স্ট্র্যান্ডগুলি পৃথক করার একটি বর্ধিত প্রবণতা (তথাকথিত 'স্ট্রেস ইনডিউসড ডুপ্লেক্স অস্থিতিশীলতা' সম্ভাব্যতা, এসআইডিডি) ক্রুসিফর্ম বা স্লিপেজ কাঠামোর মতো গৌণ কাঠামো গঠনের কাজ করতে পারে, যা বেশ কয়েকটি এনজাইমের (ডিএনএ, টোপোআইসোমেরেস, পলি (এডিপি-রাইবোসিল) পলিমেরেস এবং হিস্টোন-অ্যাসিটাইলেশন এবং ডিএনএ-মিথাইলেশন যন্ত্রের এনজাইম) স্বীকৃত বৈশিষ্ট্য। এস/এমএআরগুলিকে তাদের গতিশীল বৈশিষ্ট্যের উপর নির্ভর করে গঠনমূলক (সমস্ত ধরনের কোষে স্থায়ী ক্ষেত্রের সীমানা হিসাবে কাজ করা) বা অনুষদগত (কোষের ধরন-এবং ক্রিয়াকলাপ-সম্পর্কিত) হিসাবে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়েছে। যদিও মানব জিনোমে এস/এম. এ. আর-এর সংখ্যা 64,000 (ক্রোমাটিন ক্ষেত্র) এবং অতিরিক্ত 10,000 (প্রতিলিপি কেন্দ্র)-এর কাছাকাছি বলে অনুমান করা হয়েছে, 2007 সালে এখনও শুধুমাত্র একটি ছোট ভগ্নাংশ (সমস্ত ইউক্যারিওটের জন্য 559) এস/এম. এ. আর. টি ডাটাবেসে একটি টীকা দেওয়ার জন্য মানক মানদণ্ড পূরণ করেছে। প্রসঙ্গ-নির্ভর বৈশিষ্ট্য পারমাণবিক ম্যাট্রিক্সের বর্তমান দৃষ্টিভঙ্গি এটিকে একটি গতিশীল সত্তা হিসাবে কল্পনা করে, যা কোষের নিউক্লিয়াসের প্রয়োজনীয়তার সাথে তার বৈশিষ্ট্যগুলি পরিবর্তন করে-অনেকটা সাইটোস্কেলিটনের মতো তার কাঠামো এবং কার্যকারিতা বাহ্যিক সংকেতের সাথে খাপ খায়। পূর্ববর্তী পর্যবেক্ষণে এটি লক্ষণীয় যে এস/এমএআর-এর আবিষ্কারের দুটি প্রধান পথ রয়েছেঃ লেমলি এবং সহকর্মীদের দ্বারা স্ক্যাফোল্ড-সংযুক্তি উপাদানগুলির (এসএআর) বিবরণ, যা একটি প্রদত্ত ক্রোমাটিন ডোমেনের সীমানা চিহ্নিত করার কথা ভাবা হয়েছিল ম্যাট্রিক্স-সম্পর্কিত অঞ্চলগুলির (এমএআর) বৈশিষ্ট্যকরণ যার প্রথম উদাহরণগুলি ইমিউনোগ্লোবুলিন ক্যাপ-চেইন বর্ধককে প্রতিলিপি উপাদানগুলির সাথে তার দখল অনুসারে সমর্থন করেছিল পরবর্তী কাজটি প্রসঙ্গের উপর নির্ভর করে উপাদানগুলির গঠনমূলক (এসএআর-এর মতো) এবং অনুষদগত (এমএআর-এর মতো) উভয় কার্যকারিতা প্রদর্শন করেছিল। যেখানে গঠনমূলক এস/এমএআরগুলি 'সমস্ত' কোষের প্রকারের একটি ডিএনএজ আই হাইপারসেন্সিটিভ সাইটের সাথে যুক্ত বলে দেখা গেছে (আবদ্ধ ডোমেনটি প্রতিলিপি করা হোক বা না হোক), অনুষদগত প্রকারের ডিএনএজ আই হাইপারসেন্সিটিভিটি প্রতিলিপিগত অবস্থার উপর নির্ভর করে। এই দুটি কার্যকরী ধরনের এস/এম. এ. আর-এর মধ্যে প্রধান পার্থক্য হল তাদের আকারঃ গঠনমূলক উপাদানগুলি কয়েক কিলোবেসেপেয়ারে প্রসারিত হতে পারে, যেখানে অনুষদগুলি প্রায় 300 বেস পেয়ারে কম আকারের সীমাতে থাকে। এই চিত্রটি এই বৈশিষ্ট্যগুলি সম্পর্কে আমাদের বর্তমান বোধগম্যতা দেখায় এবং এটি নিম্নলিখিত ফলাফলগুলিকে অন্তর্ভুক্ত করেঃ হ্যালোফিশ তদন্ত দ্বারা উদ্ভূত এস/এম. এ. আর-স্ক্যাফোল্ড পরিচিতিগুলির গতিশীল বৈশিষ্ট্যগুলি এই সত্য যে প্রতিলিপির সময় ডি. এন. এ আর. এন. এ-পলিমরেজের মাধ্যমে রিল করা হয় যা নিজেই পারমাণবিক ম্যাট্রিক্সের একটি নির্দিষ্ট উপাদান যে নির্দিষ্ট ডোমেন-অভ্যন্তরীণ এস/এম. এ. আর সক্রিয় হওয়ার জন্য একটি সংলগ্ন প্রতিলিপি ফ্যাক্টরের সমর্থন প্রয়োজন। জিন থেরাপিতে ব্যবহার ভাইরাল ভেক্টরের বিকল্প হিসাবে, যা রোগীর শরীরে অবাঞ্ছিত প্রভাব ফেলতে পারে, জিন থেরাপির অ-ভাইরাল পদ্ধতিগুলি অধ্যয়ন করা হচ্ছে। এই ধরনের একটি পদ্ধতিতে বিশেষ বৈশিষ্ট্যযুক্ত প্লাজমিড ব্যবহার করা হয়-তথাকথিত এপিসোম। মাইটোসিসের সময় পর্বগুলির বাকি ইউক্যারিওটিক জিনোমের সাথে একসাথে বিভক্ত হওয়ার ক্ষমতা রয়েছে। স্ট্যান্ডার্ড প্লাজমিডগুলির তুলনায় এগুলি নিউক্লিয়াসের মধ্যে এপিজেনেটিকভাবে নীরব থাকে না এবং এনজাইমগতভাবে ধ্বংস হয় না। পর্বগুলি তাদের গঠনের মধ্যে এস/এম. এ. আর ক্রমের উপস্থিতির মাধ্যমে এই ক্ষমতা অর্জন করে। অতিরিক্ত তথ্য সম্প্রতি, টেটকো আরাবিডোপসিস থালিয়ানায় জিনের স্প্যাটিওটেম্পোরাল এক্সপ্রেশনের সাথে ইন্ট্রাজেনিক এস/এমএআর-এর একটি শক্তিশালী সম্পর্ক খুঁজে পেয়েছে। জিনোম স্কেলে, এস/এমএআর-যুক্ত জিনের স্পষ্ট টিস্যু-এবং অঙ্গ-নির্দিষ্ট এবং বিকাশমূলক অভিব্যক্তি নিদর্শন সনাক্ত করা হয়েছে। উল্লেখযোগ্যভাবে, ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর জিনগুলিতে এস/এমএআর-এর একটি উল্লেখযোগ্য উচ্চতর অংশ থাকে। এস/এমএআর-যুক্ত জিনের অভিব্যক্তি বৈশিষ্ট্যের স্পষ্ট পার্থক্য তাদের কার্যকরী গুরুত্ব এবং উদ্ভিদের পাশাপাশি অন্যান্য ইউক্যারিওটের মধ্যে জিন নিয়ন্ত্রণের জন্য কাঠামোগত ক্রোমোজোমাল বৈশিষ্ট্যের গুরুত্বের উপর জোর দেয়। তথ্যসূত্র আণবিক জেনেটিক্স