Melbourne Bioinformatics
মেলবোর্ন বায়োইনফরম্যাটিক্স (পূর্বে ভিক্টোরিয়ান লাইফ সায়েন্সেস কম্পিউটিং ইনিশিয়েটিভ, ভিএলএসসিআই) গণনামূলক জীবন বিজ্ঞানের দক্ষতার একটি কেন্দ্র। এটি স্থানীয় এবং জাতীয় গুরুত্বের বিস্তৃত প্রকল্প এবং পরিষেবাগুলিতে সমস্ত গবেষক এবং শিক্ষার্থীদের জন্য জৈব তথ্যবিজ্ঞান সহায়তা প্রদান করে। গবেষকরা মেলবোর্ন বায়োইনফরম্যাটিক্সের সাথে প্রশিক্ষণ এবং বিশেষজ্ঞদের সাথে পরামর্শের মাধ্যমে যুক্ত হতে পারেন যা মেলবোর্ন বিশ্ববিদ্যালয়ের মধ্যে একাডেমিক কর্মীদের সাথে প্রকল্প সহযোগিতার দিকে পরিচালিত করতে পারে। ভি. এল. এস. সি. আই বায়োটেকনোলজিকে সমর্থন করার জন্য ভিক্টোরিয়ান সরকারের পরিকল্পনার অংশ হিসাবে প্রতিষ্ঠিত হয়েছিল এবং ভিক্টোরিয়ান বায়োটেকনোলজি অ্যাকশন প্ল্যান 2011-এ একটি মূল পরিকাঠামো প্রকল্প হিসাবে তালিকাভুক্ত হয়েছিল। এটি মেলবোর্ন বিশ্ববিদ্যালয় এবং মেলবোর্নের আইবিএম লাইফ সায়েন্সেস রিসার্চ কোলাবোরেটরি-র সঙ্গে অংশীদারিত্বে ভিক্টোরিয়ান সরকারের 100 মিলিয়ন ডলারের উদ্যোগ ছিল। অন্যান্য প্রধান অংশীদারদের মধ্যে মূল ভিক্টোরিয়ান স্বাস্থ্য ও চিকিৎসা গবেষণা প্রতিষ্ঠান, প্রধান বিশ্ববিদ্যালয় এবং পাবলিক গবেষণা সংস্থা অন্তর্ভুক্ত ছিল। 2015 সালে ভিক্টোরিয়ান রাজ্য সরকারের কাছ থেকে আরও $6.65m পাওয়ার পর ভিএলএসসিআই একটি নতুন শাসন মডেলে রূপান্তরিত হয়। প্রথম আইবিএম রিসার্চ কোলাবোরেটরি ফর লাইফ সায়েন্সেস 5 বছরের জন্য ভিএলএসসিআই-তে সহ-অবস্থিত ছিল। আইবিএম রিসার্চ অস্ট্রেলিয়ার নিকটবর্তী অফিসগুলিতে স্থানান্তরিত হওয়ার পর থেকে, মেলবোর্ন বায়োইনফরম্যাটিক্সের নতুন নামে মেলবোর্ন বিশ্ববিদ্যালয়/আইবিএম অংশীদারিত্বের অংশ হিসাবে সহযোগী কর্মীরা বিভিন্ন প্রকল্পে কাজ চালিয়ে যাচ্ছেন। মেলবোর্নের বায়োইনফরম্যাটিক্সের পেটাস্কেল উচ্চ কার্যকারিতা গণনার সুবিধা মেলবোর্নের বিভিন্ন বিশ্ববিদ্যালয় এবং গবেষণা প্রতিষ্ঠানে কাজ করে ভিক্টোরিয়ার গবেষকদের কাছে অ্যাক্সেসযোগ্য ছিল। 2017 সালে ক্লাস্টারগুলি বিশ্বব্যাপী শীর্ষ 500-এর মধ্যে ছিল। প্রযুক্তিগত বিশেষজ্ঞরা ব্যবহারকারীর অভিজ্ঞতা সর্বাধিকতর করতে, গবেষণা দলগুলিতে দক্ষতার ফাঁকগুলি পূরণ করতে, প্রয়োজনীয় আন্তঃবিষয়ক গবেষণা সহযোগিতা তৈরি করতে এবং বিতরণ করা প্রক্রিয়াকরণ শক্তিকে দক্ষতার সাথে ব্যবহার করার জন্য প্রকল্পগুলিকে স্কেল আপ করার জন্য দক্ষতা প্রদান করতে কর্মীদের উপর ছিলেন। গণনামূলক জীববিজ্ঞান, আণবিক মডেলিং এবং জৈব তথ্যবিজ্ঞানে চলমান দক্ষতা বিকাশ ও প্রশিক্ষণ দেওয়া হয়েছিল। কম্পিউটার তার শীর্ষে, ভি. এল. এস. সি. আই-এর পিক কম্পিউটিং সুবিধা 855 টেরাফ্লপগুলিতে পরিচালিত হয়েছিল। এই ব্যবস্থাগুলির মধ্যে রয়েছে 'বারকু', একটি আইবিএম আইডেটাপ্লেক্স x86, 'মেরি', একটি আইবিএম আইডেটাপ্লেক্স x86 এবং 'অ্যাভোকা', যা আইবিএম ব্লু জিন/কিউ-এর 4টি র্যাক নিয়ে গঠিত। ভি. এল. এস. সি. আই পিক কম্পিউটিং সুবিধা (পি. সি. এফ) ভিক্টোরিয়া জুড়ে জীবন বিজ্ঞান গবেষকদের উচ্চ-কার্যকারিতা গণনার পরিকাঠামো এবং গণনামূলক দক্ষতা প্রদান করে। পিসিএফ-এর খুব দ্রুত ডিস্ক সাবসিস্টেম সহ শক্তভাবে সংযুক্ত ক্লাস্টার ছিল, যা বর্তমানে 855 টেরাফ্লপের সর্বোচ্চ ধারণক্ষমতায় কাজ করছে। গবেষকদের গণনা সময়ের সর্বাধিক ব্যবহার করতে এবং তাদের বরাদ্দকৃত সংস্থানগুলি থেকে সর্বাধিক সুবিধা পেতে সহায়তা করার জন্য, পি. সি. এফ-এর সহায়তা অনুরোধ ব্যবস্থার মাধ্যমে সিস্টেম প্রশাসক, প্রোগ্রামার এবং অ্যাপ্লিকেশন বিশেষজ্ঞদের একটি দল ছিল। ভি. এল. এস. সি. আই লাইফ সায়েন্স কম্পিউটিং সেন্টার (এল. এস. সি. সি) মেলবোর্ন বিশ্ববিদ্যালয় এবং লা ট্রোব বিশ্ববিদ্যালয়ে অবস্থিত ছিল এবং তাদের সপ্তাহের কিছু অংশের জন্য পিটার ডোহার্টি ইনস্টিটিউট ফর ইনফেকশন অ্যান্ড ইমিউনিটি (ডোহার্টি ইনস্টিটিউট) সহ বিভিন্ন গবেষণা প্রতিষ্ঠানে অনেক কর্মী কাজ করতেন। এলএসসিসি ছিল গণনামূলক জীবন বিজ্ঞান গবেষণার জন্য দক্ষতা এবং পরিকাঠামোর একটি বিতরণ পুল, যা ভিক্টোরিয়া জুড়ে জীবন বিজ্ঞান গবেষণা প্রতিষ্ঠানগুলিকে পরিষেবা প্রদান করে। এর লক্ষ্য ছিল তুলনামূলকভাবে কম সংখ্যক নির্দিষ্ট বাহ্যিক প্রকল্পে গবেষণা সহযোগিতা এবং সমর্থন বৃদ্ধি করা; জীবন বিজ্ঞান গবেষকদের সহায়তা করার জন্য সাধারণ সম্পদ, সফ্টওয়্যার প্ল্যাটফর্ম এবং দক্ষতার উৎস হিসাবে কাজ করা; ভিক্টোরিয়ান গণনামূলক জীবন বিজ্ঞান গবেষণা সম্প্রদায়ের অগ্রগতিতে সহায়তা করার জন্য জৈব তথ্যবিদ এবং গণনামূলক জীববিজ্ঞানীদের জন্য গবেষণা প্রশিক্ষণ, শিক্ষা এবং কর্মজীবনের বিকাশ প্রদান করা; এবং ভিক্টোরিয়ায় সামগ্রিকভাবে জীবন বিজ্ঞান গণনার অগ্রগতিতে সহায়তা করা। গ্যালাক্সি অস্ট্রেলিয়া মেলবোর্ন বায়োইনফরম্যাটিক্স, কিউএফএবি বায়োইনফরম্যাটিক্স, কিউসিআইএফ এবং কুইন্সল্যান্ড বিশ্ববিদ্যালয়ের রিসার্চ কম্পিউটিং সেন্টার যৌথভাবে গ্যালাক্সি অস্ট্রেলিয়া তৈরি ও পরিচালনা করে যা জিনোমিক্স ভার্চ্যুয়াল ল্যাবরেটরির একটি প্রধান বৈশিষ্ট্য। আরও দেখুন জাতীয় গণনামূলক পরিকাঠামো তথ্যসূত্র বায়োইনফরম্যাটিক্স সংস্থা মেলবোর্নের মেলবোর্ন বিজ্ঞান ও প্রযুক্তি বিশ্ববিদ্যালয়