DyP-type peroxidase family
আণবিক জীববিজ্ঞানে, ডি. আই. পি-টাইপ পারঅক্সিডেজ পরিবার হল হেম পারঅক্সিডেজ উৎসেচকের একটি পরিবার। হেম পারঅক্সিডেসগুলি মূলত দুটি সুপারফ্যামিলিতে বিভক্ত ছিল, যথা, প্রাণী পারঅক্সিডেস এবং উদ্ভিদ পারঅক্সিডেস (যা প্রথম, দ্বিতীয় এবং তৃতীয় শ্রেণীতে বিভক্ত), যার মধ্যে রয়েছে ছত্রাক (দ্বিতীয় শ্রেণী) এবং ব্যাকটেরিয়াল পারঅক্সিডেস। ডি. আই. পি (ডাই ডি-কালারাইজিং পারঅক্সিডেসের জন্য) পরিবার হেম পারঅক্সিডেসের একটি অভিনব শ্রেণী গঠন করে। যেহেতু এই উৎসেচকগুলি ছত্রাকের উৎস থেকে উদ্ভূত হয়েছিল, তাই ডি. আই. পি পরিবারটি দ্বিতীয় শ্রেণীর সিক্রেটরি ছত্রাকের পারঅক্সিডেসের সাথে কাঠামোগতভাবে সম্পর্কিত বলে মনে করা হয়েছিল। যাইহোক, ডি. আই. পি পরিবারটি এল. আই. পি এবং এম. এন. পি-এর মতো ধ্রুপদী ছত্রাক পারঅক্সিডেসের সাথে কেবল নিম্ন ক্রমের মিল প্রদর্শন করে এবং এতে সংরক্ষিত প্রক্সিমাল এবং ডিস্টাল হিস্টিডিন এবং অন্যান্য উদ্ভিদ পারঅক্সিডেজ সুপারফ্যামিলির সদস্যদের মধ্যে পাওয়া একটি প্রয়োজনীয় আর্জিনিন থাকে না। ডি. আই. পি প্রোটিনের বেশ কয়েকটি বৈশিষ্ট্য রয়েছে যা তাদের অন্যান্য সমস্ত পারঅক্সিডেস থেকে আলাদা করে, যার মধ্যে একটি বিশেষভাবে বিস্তৃত স্তরের নির্দিষ্টতা, বেশিরভাগ অন্যান্য পারঅক্সিডেসের সমতুল্যতার অভাব এবং অন্যান্য উদ্ভিদ পারঅক্সিডেসের তুলনায় অনেক কম পিএইচ অবস্থার অধীনে ভালভাবে কাজ করার ক্ষমতা রয়েছে। সাবস্ট্রেট নির্দিষ্টতার পরিপ্রেক্ষিতে, ডি. আই. পি সাধারণ পারঅক্সিডেজ সাবস্ট্রেটগুলিকে অবনমিত করে, তবে হাইড্রক্সিল-মুক্ত অ্যানথ্রাকুইনোনকেও অবনমিত করে (অনেক রঙ অ্যানথ্রাকুইনোন যৌগ থেকে উদ্ভূত হয়)। ডি. আই. পি পরিবারের সদস্যদের স্ফটিক কাঠামো দুটি ডোমেন প্রকাশ করে, প্রতিটি একটি ফেরেডক্সিনের মতো ভাঁজ গ্রহণ করে। প্রোটিনগুলি একটি এন-টার্মিনাল ডোমেন এবং একটি সি-টার্মিনাল ডোমেন নিয়ে গঠিত যা সম্ভবত একটি পূর্বপুরুষের জিনের অনুলিপি দ্বারা সম্পর্কিত হতে পারে, যেমনটি ডোমেনের সংরক্ষিত টপোলজি থেকে অনুমান করা হয়েছে। হেম আয়রন পেন্টা-সমন্বিত, প্রোটিনটি আয়রনের কেন্দ্রে একটি সংরক্ষিত হিস্টিডাইন লিগ্যান্ড অবদান রাখে। একটি সংরক্ষিত এ. এস. পি সম্ভবত একটি প্রোটন দাতা/গ্রহণকারী হিসাবে কাজ করে এবং উদ্ভিদ পারঅক্সিডেস দ্বারা ব্যবহৃত অনুঘটক হিস্টিডিনের স্থান নেয়। এই এ. এস. পি প্রতিস্থাপন ব্যাখ্যা করতে সাহায্য করে যে কেন ডি. আই. পি পরিবার কম পিএইচ-এ সক্রিয়। তথ্যসূত্র প্রোটিন পরিবার