Miniature Inverted-repeat Transposable Elements
ক্ষুদ্রাকার ইনভার্টেড-রিপিট ট্রান্সপোজেবল এলিমেন্টস (মাইটস) হল অ-স্বায়ত্তশাসিত দ্বিতীয় শ্রেণীর ট্রান্সপোজেবল উপাদানগুলির (ডিএনএ সিকোয়েন্স) একটি গ্রুপ। অ-স্বায়ত্তশাসিত হওয়ায়, এম. আই. টি. ই তাদের নিজস্ব ট্রান্সপোজেসের জন্য কোড করতে পারে না। এগুলি প্রাণী, উদ্ভিদ, ছত্রাক, ব্যাকটেরিয়া এবং এমনকি ভাইরাসের জিনোমের মধ্যে বিদ্যমান। মাইটে সাধারণত ছোট (50 থেকে 500 বিপি) উপাদান থাকে যার টার্মিনাল ইনভার্টেড রিপিট (টিআইআর; 10-15 বিপি) এবং দুটি ফ্ল্যাঙ্কিং টার্গেট সাইট ডুপ্লিকেশন (টিএসডি) থাকে। অন্যান্য ট্রান্সপোসনের মতো, মাইটিগুলি প্রধানত জিন সমৃদ্ধ অঞ্চলে ঢোকানো হয় এবং এটি একটি কারণ হতে পারে যে তারা জিন অভিব্যক্তিকে প্রভাবিত করে এবং ইউক্যারিওটিক বিবর্তনকে ত্বরান্বিত করতে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। ছোট আকারের হওয়া সত্ত্বেও তাদের উচ্চ অনুলিপি সংখ্যা আগ্রহের বিষয় হয়ে দাঁড়িয়েছে। মাইটের উৎপত্তি মাইটের একটি বিশদ গবেষণা প্রকাশ করে যে মাইটের উপপরিবারগুলি একটি একক জিনোম থেকে সম্পর্কিত স্বায়ত্তশাসিত উপাদান থেকে উদ্ভূত হয়েছে এবং এই উপপরিবারগুলি মাইটের পরিবার গঠন করে। এক ধরনের স্বায়ত্তশাসিত উপাদান এক বা একাধিক মাইট পরিবারের জন্ম দিতে পারে। পরিচিত টিই সুপারফ্যামিলির সাথে টিআইআর-এর ক্রম অনুসারে তাদের সম্পর্কের উপর ভিত্তি করে, মাইটগুলিকে নির্দিষ্ট পরিবারে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়েছে। উদাহরণস্বরূপ, ডাব্লু ট্যুরিস্ট, অ্যাক্রোব্যাট, হার্টহিলার হল মাইট পরিবার, কিছু উদ্ভিদ প্রজাতি টিই সুপারফ্যামিলি পিআইএফ/হার্বিঞ্জারের অধীনে রয়েছে। টি. সি. 1/মেরিনার টি. ই সুপারফ্যামিলির সাথে সম্পর্কিত টি. এস. ডি টি. এ সহ স্টোভওয়ে হল পিসাম স্যাটিভাম এল-এর একটি মাইট পরিবার। পিগিব্যাক সুপারফ্যামিলির সাথে সম্পর্কিত সিএমআইটিইএস নামে পরিচিত মাইটের একটি গোষ্ঠী নির্দিষ্ট প্রবাল প্রজাতিতে পাওয়া গেছে। যদিও বেশিরভাগ মাইটি গোষ্ঠীভুক্ত, তাদের মধ্যে কয়েকটিকে এখনও তাদের টিই সুপারফ্যামিলি বরাদ্দ করা হয়নি। এই ধরনের পরিবারগুলির মধ্যে রয়েছে আরাবিডোপসিস থালিয়ানায় অ্যাটাট এবং এডিস এজিপ্টিতে পাওয়া এটন পরিবার। এছাড়াও, আরও অনেক মাইট পরিবার আবিষ্কৃত হওয়ার সম্ভাবনা রয়েছে। উদ্ভিদ জিনোমে মাইট প্রথম উদ্ভিদে আবিষ্কৃত হয়েছিল। সিএসিটিএ, এইচএটি, মিউটেটর, পিআইএফ এবং টিসি1/মেরিনার সুপারফ্যামিলির উপাদানগুলি বর্ণনা করা হয়েছে। তাদের টার্মিনাল ইনভার্টেড রিপিট এবং টার্গেট সাইট ডুপ্লিকেশনগুলির সাদৃশ্যের উপর নির্ভর করে, উদ্ভিদ জিনোমের বেশিরভাগ মাইট দুটি প্রধান গোষ্ঠীতে বিভক্তঃ পর্যটকের মতো মাইট (পিআইএফ থেকে উদ্ভূত) এবং স্টোওয়ে-এর মতো মাইট (টিসি 1/মেরিনার থেকে উদ্ভূত)। স্টোওয়ে এবং পর্যটক উপাদানগুলি তাদের ক্রমে উল্লেখযোগ্যভাবে পৃথক। তবুও, তাদের মধ্যে উল্লেখযোগ্য কাঠামোগত মিল পাওয়া গেছে। স্টোওয়ে উপাদানগুলির লক্ষ্যস্থলের নির্দিষ্টতা রয়েছে, ছোট আকারের এবং সংরক্ষিত টার্মিনাল উল্টানো পুনরাবৃত্তি রয়েছে। এম. আই. টি. ই-এর মতো পর্যটকদের ক্ষেত্রেও তাই নির্ধারিত হয়। তারা স্থিতিশীল ডিএনএ গৌণ কাঠামো তৈরি করতে পারে যা তাদের সনাক্ত করতে খুব কার্যকর হতে পারে। কয়েকটি স্টোওয়ে উপাদানের মধ্যে সিআইএস-অ্যাক্টিং নিয়ন্ত্রক ক্ষেত্রও রয়েছে। অন্যান্য মাইট সুপারফ্যামিলিকেও উদ্ভিদে বর্ণনা করা হয়েছে, যেমন কলায় এইচএটি-টাইপ মাইট এবং নাইটশেড। ভুট্টার জিনোমে মাইট পরিবারের হার্টব্রেকার (এইচ. বি. আর)-এর উপস্থিতি বা অনুপস্থিতির উপর ভিত্তি করে একটি আণবিক চিহ্নিতকারী তৈরি করা হয়েছিল। এই এইচ. বি. আর চিহ্নিতকারীগুলি স্থিতিশীল বলে প্রমাণিত হয়েছে, যা ভুট্টার জিনোমে সমানভাবে বিতরণ করা হয়েছে। কাসা এট আল-এর একটি গবেষণা। দেখিয়েছেন যে এইচ. বি. আর মার্কারগুলি অন্যান্য আণবিক মার্কারগুলির সাথে সম্পর্কিত ভুট্টা ইনব্রেড লাইনের জিনোটাইপ অধ্যয়ন করতে ব্যবহার করা যেতে পারে। এফ. আই. এন. ডি. এম. আই. টি-এর মতো গণনামূলক সহায়তা সফ্টওয়্যার মাইটে পরিবারগুলি সনাক্ত করতে কিছু গড় আকারের বিপি-র ক্রম এন্ট্রি ব্যবহার করে। ডিটেক্টমাইট নামে একটি ম্যাটল্যাব-ভিত্তিক প্রোগ্রাম জিনোম বিস্তৃত স্কেলে মাইট সনাক্ত করতে পারে এবং চালের জিনোমে পরীক্ষা করা হয়েছিল। অন্যান্য সরঞ্জাম যেমন মস্ট এবং মাইট-হান্টারও একই উদ্দেশ্যে ব্যবহার করা হয়। মাইটে পরিবারগুলিকে চিহ্নিত করার জন্য ইয়াং এবং হল মাইটে অ্যানালাইসিস কিট ম্যাক নামে একটি টুলকিট তৈরি করেছেন। রেফারেন্স জেনেটিক ম্যাপিং জিনোমিক্স