EteRNA
ইটার্না একটি ব্রাউজার-ভিত্তিক "একটি উদ্দেশ্য সহ খেলা", যা কার্নেগি মেলন বিশ্ববিদ্যালয় এবং স্ট্যানফোর্ড বিশ্ববিদ্যালয়ের বিজ্ঞানীরা তৈরি করেছেন, যা ব্যবহারকারীদের আরএনএ অণুগুলির ভাঁজ সম্পর্কিত ধাঁধা সমাধান করতে নিযুক্ত করে। এই প্রকল্পটি বিল অ্যান্ড মেলিন্ডা গেটস ফাউন্ডেশন, স্ট্যানফোর্ড বিশ্ববিদ্যালয় এবং ন্যাশনাল ইনস্টিটিউট অফ হেলথ দ্বারা সমর্থিত। পূর্ববর্তী তহবিলদাতাদের মধ্যে রয়েছে ন্যাশনাল সায়েন্স ফাউন্ডেশন। ফোল্ডিটের মতো-ইটার্না তৈরি করা একই গবেষকদের দ্বারা তৈরি-ধাঁধা বর্তমান কম্পিউটার মডেলের জন্য গণনামূলকভাবে শ্রমসাধ্য ধাঁধা সমাধানের জন্য মানুষের সমস্যা সমাধানের ক্ষমতার সুবিধা নেয়। গবেষকরা আর. এন. এ ভাঁজ করার যান্ত্রিকতা সম্পর্কে মৌলিক প্রশ্নের উত্তর দেওয়ার জন্য "ক্রাউডসোর্সিং" এবং ইটার্না খেলোয়াড়দের সম্মিলিত বুদ্ধিমত্তাকে পুঁজি করার আশা করছেন। শীর্ষ ভোট দেওয়া নকশাগুলি স্ট্যানফোর্ড বায়োকেমিস্ট্রি ল্যাবে সংশ্লেষিত করা হয় যাতে আরএনএ অণুগুলির ভাঁজ প্যাটার্নগুলি কম্পিউটারের ভবিষ্যদ্বাণীগুলির সাথে সরাসরি তুলনা করা যায়, যা শেষ পর্যন্ত কম্পিউটার মডেলগুলিকে উন্নত করে। শেষ পর্যন্ত, ইটার্না গবেষকরা একটি "সম্পূর্ণ এবং পুনরাবৃত্তিযোগ্য নিয়মের সেট" নির্ধারণ করার আশা করছেন যাতে আরএনএ সংশ্লেষণের অনুমতি দেওয়া যায় যা ধারাবাহিকভাবে প্রত্যাশিত আকারে ভাঁজ হয়। ইটার্না প্রকল্পের নেতারা আশা করেন যে এই মৌলিক নীতিগুলি নির্ধারণ করা আরএনএ-ভিত্তিক ন্যানো মেশিন এবং সুইচগুলির নকশাকে সহজতর করতে পারে। ইটার্নার নির্মাতারা ইটার্নার খেলোয়াড়দের সমাধান দেখে আনন্দের সাথে বিস্মিত হয়েছেন, বিশেষত অ-গবেষকদের যাদের "সৃজনশীলতা একটি সঠিক উত্তর দেখতে কেমন হওয়া উচিত বলে তারা মনে করেন তার দ্বারা সীমাবদ্ধ নয়"। 2016 সালের হিসাবে, ইটার্নার প্রায় 2,50,000 নিবন্ধিত খেলোয়াড় রয়েছে। গেমপ্লে খেলোয়াড়দের একটি নির্দিষ্ট লক্ষ্য আকৃতির সাথে উপস্থাপন করা হয় যার মধ্যে একটি আরএনএ স্ট্র্যান্ড অবশ্যই ভাঁজ করতে হবে। খেলোয়াড় চারটি আরএনএ নিউক্লিওটাইডের (অ্যাডেনিন, সাইটোসিন, গুয়ানোসিন এবং ইউরাসিল) যে কোনও একটি বিভিন্ন অবস্থানে রেখে ক্রম পরিবর্তন করতে পারে; এটি সিস্টেমের মুক্ত শক্তিকে পরিবর্তন করতে পারে এবং আরএনএ স্ট্র্যান্ডের ভাঁজ গতিশীলতাকে নাটকীয়ভাবে প্রভাবিত করতে পারে। ইটার্নায়, বিভিন্ন বিধিনিষেধ, যেমন নির্দিষ্ট ঘাঁটির সংখ্যা এবং তিনটি বেস পেয়ার প্রকারের সংখ্যা, পাশাপাশি লক করা ঘাঁটিগুলি কখনও কখনও আরোপ করা হয়। একটি অণুও মাঝে মাঝে অন্তর্ভুক্ত করা হয়, যা আর. এন. এ-র সাথে আবদ্ধ হয় এবং সিস্টেমের মুক্ত শক্তির উপর সমালোচনামূলক প্রভাব ফেলে। আরও কিছু উন্নত পাজলে, খেলোয়াড়দের একই সময়ে দুটি বা তিনটি ভিন্ন লক্ষ্য আকারের সাথে উপস্থাপন করা যেতে পারে; খেলোয়াড় যে একক ক্রম তৈরি করে তা অবশ্যই বিভিন্ন পরিস্থিতিতে (একটি বাঁধাই অণুর উপস্থিতি বা অনুপস্থিতি) সংশ্লিষ্ট আকারে ভাঁজ করতে হবে। ইটার্না পাজলগুলি মোটামুটিভাবে তিন ভাগে বিভক্তঃ চ্যালেঞ্জ, প্লেয়ার পাজল এবং ক্লাউড ল্যাব। চ্যালেঞ্জগুলি হল গেম-নির্মাতাদের দ্বারা প্রস্তুত ধাঁধা যা খেলোয়াড়দের ইটার্নার কাজকর্মের সাথে পরিচয় করিয়ে দেওয়ার পাশাপাশি খেলোয়াড়দের চেষ্টা করার জন্য পূর্বনির্ধারিত ধাঁধার সিরিজ সরবরাহ করে। খেলোয়াড়দের ধাঁধা খেলোয়াড়দের দ্বারা তৈরি হয় এবং ক্লাউড ল্যাব হল যেখানে সক্রিয়, প্রস্তাবিত এবং সংরক্ষণাগারভুক্ত পরীক্ষাগার প্রকল্পগুলি খেলোয়াড়দের পর্যালোচনা, ভোট বা চেষ্টা করার জন্য উপস্থাপন করা হয়। নতুন খেলোয়াড়দের একটি প্রাথমিক ধাঁধা অগ্রগতির মাধ্যমে পরিচালিত করা হয় যা আরএনএ কাঠামো এবং ভাঁজ করার মৌলিক ধারণাগুলি প্রবর্তন করে। খেলোয়াড়রা যখন ক্রমবর্ধমান জটিলতার ধাঁধার মধ্য দিয়ে এগিয়ে যায়, তখন বিভিন্ন গেম ইন্টারফেস উপাদানগুলি বর্ণনা করা হয়। 30টি ধাঁধা সম্পূর্ণ করার পর এবং পাঁচটি ইটার্না এসেনশিয়াল ব্যাজ অর্জনের পর, খেলোয়াড়রা ক্লাউড ল্যাবে প্রবেশ করতে পারে যেখানে তারা পরীক্ষাগার গবেষণায় অংশ নিতে পারে। একবার খেলোয়াড়রা পর্যাপ্ত সংখ্যক আর. এন. এ পাজল সম্পন্ন করলে, তারা অন্যান্য খেলোয়াড়দের জন্য পাজল তৈরি করার সুযোগ উন্মুক্ত করে দেয়। বায়োমেডিক্যাল চ্যালেঞ্জ 2016 সালে, ইটার্না ওপেনটিবি নামে তার প্রথম বায়োমেডিক্যাল চ্যালেঞ্জ চালু করে, যা যক্ষ্মার জন্য একটি নতুন ডায়াগনস্টিক ডিভাইস বিকাশের উদ্যোগ। প্রকল্পটি জনসাধারণের তথ্য ব্যবহার করে স্ট্যানফোর্ড গবেষকদের দ্বারা আবিষ্কৃত একটি জিন অভিব্যক্তি "স্বাক্ষর" ব্যবহার করে এবং একটি মুক্ত উৎস, কাগজ-ভিত্তিক ডায়াগনস্টিক কিট তৈরি করার লক্ষ্য রাখে যা সহজেই বিশ্বজুড়ে ক্লিনিকগুলিতে স্থাপন করা যেতে পারে। এম. আই. টি-র লিটল ডিভাইস ল্যাবের সহযোগিতায় এই ওপেন সোর্স কিট তৈরি করা হয়েছে। খেলোয়াড়রা চ্যালেঞ্জের দ্বিতীয় রাউন্ডের মধ্যে জিন স্বাক্ষর সনাক্ত করার জন্য সফলভাবে আর. এন. এ ডিজাইন করেছে এবং ফেব্রুয়ারী 2018 পর্যন্ত প্রকৃত রোগীর নমুনাগুলির সাথে পরীক্ষা অব্যাহত রয়েছে। ওপেনটিবির সাফল্যের পরে, ইটার্না 2017 সালের আগস্টে ওপেনক্রিস্পার চালু করে, যা খেলোয়াড়দের সি. আর. আই. এস. পি. আর জিন সম্পাদনায় ব্যবহৃত একক গাইড আর. এন. এ (এস. জি. আর. এন. এ) ডিজাইন করার জন্য চ্যালেঞ্জ জানায়। প্রকল্পের লক্ষ্য হল এস. জি. আর. এন. এ-র একটি নতুন শ্রেণী তৈরি করা যা অন্য একটি ছোট অণু (যেমন থিওফিলিন) দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হতে পারে, যার ফলে শরীরে জিন সম্পাদনা প্রয়োজন অনুযায়ী চালু বা বন্ধ করা যায়। 2017 সালের নভেম্বরে প্রথম রাউন্ডের শেষে, খেলোয়াড়রা সংশ্লেষণের জন্য 90,000-এরও বেশি আর. এন. এ নকশা জমা দিয়েছিলেন, যা এখন পর্যন্ত জমা দেওয়ার বৃহত্তম সেট। সার্স-কোভ-2 মহামারীর প্রতিক্রিয়ায়, ইটার্না ওপেনভ্যাক্সিন সহযোগিতায় যোগ দেয় এমআরএনএ অণুগুলিকে স্থিতিশীল করার পদ্ধতি বিকাশের জন্য যা গভীর হিমায়িত করার প্রয়োজন ছাড়াই সংরক্ষণ এবং প্রেরণ করা যেতে পারে। খেলোয়াড়রা নিউক্লিওটাইড স্তরে ছোট আরএনএ অণুর স্থায়িত্ব পরীক্ষা করার জন্য 6000 টি নকশা জমা দিয়েছিল এবং ফলাফলগুলি কাঠামোগত ন্যানোলুসিফেরেজ ডিজাইন করতে ব্যবহার করেছিল যা ভিট্রোতে অবক্ষয় এবং ভিভোতে প্রোটিন অভিব্যক্তির জন্য পরীক্ষা করা হয়েছিল। ওপেনভ্যাক্সিন গবেষণার ফলে স্থিতিশীল এমআরএনএ থেরাপিউটিক্স ডিজাইনের জন্য নতুন পদ্ধতি এবং নীতি তৈরি হয়েছে, যার মধ্যে বর্তমান বালুচর জীবনের সম্ভাব্য তিনগুণ টিকা রয়েছে। 2019 সালে, ইটার্না আই. এস. এ. টি কোষ-মুক্ত রাইবোজোম নির্মাণ প্ল্যাটফর্মে পরিবর্তিত এসচেরিচিয়া কোলাই রাইবোজোমের ভাঁজ বাড়ানোর জন্য নর্থওয়েস্টার্ন বিশ্ববিদ্যালয়ের জুয়েট ল্যাবের সহযোগিতায় রাইবোজোম ইঞ্জিনিয়ারিং প্রকল্প ওপেন রাইবোজোম চালু করে। খেলোয়াড়দের দ্বারা পরিকল্পিত কুড়িটি 16এস এবং কুড়িটি 23এস ক্রমের প্রোটিন উৎপাদন চারটি প্রতিক্রিয়া-ভিত্তিক পুনরাবৃত্তির একটি সিরিজে মূল্যায়ন করা হচ্ছে। রাইবোজোমগুলিকে অনন্য পলিমার সংশ্লেষণে সক্ষম আণবিক যন্ত্র হিসাবে পুনর্বিন্যাস করা হচ্ছে। সাফল্য 2011 সালের আগস্টের মধ্যে, প্রায় 26,000 খেলোয়াড় আর. এন. এ সিকোয়েন্স ডিজাইনের অবদান রেখেছিলেন এবং ইন ভিট্রো পরীক্ষার জন্য 305 টিরও বেশি ডিজাইন সংশ্লেষিত করা হয়েছে। 2014 সালের জানুয়ারিতে, ইটার্নার ফলাফল পিএনএএস জার্নালে প্রকাশিত হয়েছে, যেখানে "ইটার্নার অংশগ্রহণকারীরা" গবেষণাপত্রে সহ-লেখক হিসাবে তালিকাভুক্ত হয়েছে। ইটার্না গেমাররা 100টি আরএনএ সেকেন্ডারি স্ট্রাকচার ডিজাইনের চ্যালেঞ্জ সমাধানে সুপার কম্পিউটার-চালিত অ্যালগরিদমকে পরাজিত করে, যেখানে ব্যবহৃত ছয়টি অ্যালগরিদমের মধ্যে সেরা স্কোর হল 54। আর. এন. এ-র রাসায়নিক ক্রমগুলি পরিচালনা করে খেলোয়াড়রা কাঙ্ক্ষিত আকারের স্থিতিশীল রূপ তৈরি করে। খেলোয়াড়দের দ্বারা পরিকল্পিত কৌশলগুলি নির্দিষ্ট কাঠামোগত বৈশিষ্ট্যগুলি চিহ্নিত করে যা বিপরীত আরএনএ ভাঁজ করা কঠিন করে তোলে। ইটার্নার গবেষকরা আশা করেন যে তাদের কৌশলগুলিকে অ্যালগরিদমের সাথে একীভূত করে, স্বয়ংক্রিয় আরএনএ গৌণ কাঠামোর নকশায় উন্নতি অর্জন করা যেতে পারে। চ্যালেঞ্জগুলির ফলাফল 2016 সালের ফেব্রুয়ারিতে জার্নাল অফ মলিকুলার বায়োলজিতে প্রকাশিত হয়েছিল। ভিডিও গেমের মাধ্যমে নিয়োগপ্রাপ্ত অ-বিশেষজ্ঞ নাগরিক বিজ্ঞানীদের প্রভাবশালী লেখার অবদান এবং সহ-প্রধান লেখকত্বের উপর ভিত্তি করে এটি প্রথম গবেষণাপত্র ছিল। ইটার্না নাগরিক বিজ্ঞানীরা 7 + অ্যাডেনোসিনের স্ট্রিং পড়ার সময় SHAPE এবং DMS রাসায়নিক অনুসন্ধানে একটি অসঙ্গতি আবিষ্কার করেন এবং পরবর্তীকালে তাদের অনুসন্ধানগুলি বায়োকেমিস্ট্রিতে প্রকাশ করেন। এটি নাগরিক বিজ্ঞানীদের দ্বারা একচেটিয়াভাবে লিখিত প্রথম গবেষণাপত্র যা পিয়ার-রিভিউ জার্নালে প্রকাশিত হয়েছে। আরও দেখুন সিটিজেন সায়েন্স ফোল্ডিট গেম উইথ এ পারপাস ক্রাউডসোর্সিং প্রজেক্টের তালিকা সিরিয়াস গেম রেফারেন্স এক্সটার্নাল লিঙ্ক ইটার্না উইকি সিটিজেন সায়েন্স 2010 ভিডিও গেম ব্রাউজার গেমস হিউম্যান-বেসড কম্পিউটশন গেমস পাজল ভিডিও গেমস আরএনএ কার্নেগি মেলন ইউনিভার্সিটি স্ট্যানফোর্ড ইউনিভার্সিটি ভিডিও গেমস মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রে ডেভেলপ করা হয়েছে।