Kazal domain
কাজাল ডোমেন হল একটি বিবর্তনীয় সংরক্ষিত প্রোটিন ডোমেন যা সাধারণত সেরিন প্রোটিজ ইনহিবিটারের ইঙ্গিত দেয়। যাইহোক, কাজালের মতো ক্ষেত্রগুলি অ্যাগ্রিনের বহির্মুখী অংশেও দেখা যায়, যা প্রোটিজ প্রতিরোধক হিসাবে পরিচিত নয়। প্রাণীদের মধ্যে, সেরিন প্রোটিজ ইনহিবিটারগুলি যা তাদের কাজাল ডোমেনের মাধ্যমে কাজ করে সেগুলি এমইআরওপিএস ইনহিবিটর পরিবার আই1, ক্ল্যান আইএ-এর অধীনে গোষ্ঠীভুক্ত করা হয়। কাজাল 1 কাজাল ডোমেনগুলি প্রায়শই ট্যান্ডেম অ্যারেতে ঘটে। তিনটি ডাইসালফাইড বন্ধনযুক্ত ছোট আলফা + বিটা ভাঁজ। সংরেখার মধ্যে ও. এ. টি. পি/পি. জি. টি পরিবারের পরিবাহকদের একটি একক ডোমেনও অন্তর্ভুক্ত রয়েছে। পেপটাইড প্রোটিনেজ ইনহিবিটারগুলি একক ডোমেন প্রোটিন হিসাবে বা প্রোটিনের মধ্যে একক বা একাধিক ডোমেন হিসাবে পাওয়া যেতে পারে; এগুলিকে যথাক্রমে সহজ বা যৌগিক প্রতিরোধক হিসাবে উল্লেখ করা হয়। অনেক ক্ষেত্রে এগুলি একটি বৃহত্তর অগ্রদূত প্রোটিনের অংশ হিসাবে সংশ্লেষিত হয়, হয় একটি প্রিপ্রোপেপটাইড হিসাবে বা একটি নিষ্ক্রিয় পেপটিডেজ বা জিমোজেনের সাথে যুক্ত একটি এন-টার্মিনাল ডোমেন হিসাবে। এই ডোমেনটি সক্রিয় সাইটে স্তরটির প্রবেশাধিকারকে বাধা দেয়। দ্বিতীয় পেপটিডেজের সাথে মিথস্ক্রিয়া বা অটোক্যাটালাইটিক ক্লিভেজ দ্বারা এন-টার্মিনাল ইনহিবিটর ডোমেনের অপসারণ জিমোজেনকে সক্রিয় করে। অন্যান্য প্রতিরোধকগুলি একটি সাধারণ অ-সমযোজী লক এবং কী প্রক্রিয়া ব্যবহার করে প্রোটিনেসের সাথে সরাসরি যোগাযোগ করে; আবার অন্যরা একটি গঠনমূলক পরিবর্তন-ভিত্তিক ট্র্যাপিং প্রক্রিয়া ব্যবহার করে যা তাদের কাঠামোগত এবং তাপগতিবিদ্যার বৈশিষ্ট্যের উপর নির্ভর করে। কাজাল ইনহিবিটারের এই পরিবারটি, এম. ই. আর. ও. পি. এস ইনহিবিটর পরিবার আই1, গোষ্ঠী আই. এ-এর অন্তর্গত। এগুলি এস1 পরিবারের সেরিন পেপটিডেজকে (ইন্টারপ্রো) প্রতিরোধ করে। সদস্যরা প্রাথমিকভাবে মেটাজোয়ান, তবে অ্যালভিওলাটা (এপিকম্প্লেক্স), স্ট্র্যামেনোপাইল, উচ্চতর উদ্ভিদ এবং ব্যাকটেরিয়ার ব্যতিক্রম রয়েছে। কাজাল ইনহিবিটার, যা বেশ কয়েকটি সেরিন প্রোটিজেস (যেমন ট্রিপসিন এবং ইলাস্টেস) প্রতিরোধ করে, প্রোটিনের পরিবারের অন্তর্গত যার মধ্যে রয়েছে প্যানক্রিয়াটিক সিক্রেটরি ট্রিপসিন ইনহিবিটর; এভিয়ান ওভোমুকয়েড; অ্যাক্রোসিন ইনহিবিটর; এবং ইলাস্টেস ইনহিবিটর। এই প্রোটিনগুলিতে 1 থেকে 7টি কাজাল-টাইপ ইনহিবিটর পুনরাবৃত্তি থাকে। কাজাল পুনরাবৃত্তির কাঠামোর মধ্যে রয়েছে প্রচুর পরিমাণে বর্ধিত চেইন, 2টি ছোট আলফা-হেলিস এবং একটি 3-স্ট্র্যান্ডেড অ্যান্টি-প্যারালাল বিটা শীট। প্রতিরোধকটি তার এনজাইম স্তরের সাথে 11টি যোগাযোগ তৈরি করেঃ অস্বাভাবিকভাবে, এই গুরুত্বপূর্ণ অবশিষ্টাংশগুলির মধ্যে 8টি হাইপারভ্যারিয়েবল। এনজাইম-যোগাযোগের অবশিষ্টাংশ এবং বিশেষত সক্রিয় সাইট বন্ডের পরিবর্তন, নির্দিষ্ট সেরিন প্রোটিজের জন্য প্রতিরোধকের শক্তি এবং নির্দিষ্টতাকে প্রভাবিত করে। এই পি. এফ. এ. এম ডোমেনের উপস্থিতি সাধারণত সেরিন প্রোটিজ ইনহিবিটারগুলির ইঙ্গিত দেয়, তবে কাজালের মতো ডোমেনগুলি অ্যাগ্রিনের এক্সট্রাসেলুলার অংশেও দেখা যায় যা প্রোটিনেজ ইনহিবিটার হিসাবে পরিচিত নয়। কাজাল 1 ডোমেইন সহ মানব প্রোটিনঃ এ. জি. আর. আই. এন, সি. পি. এ. এম. ডি. 8 এফ. এস. টি, এফ. এস. টি. এল. 3, এফ. এস. টি. এল. 4, এফ. এস. টি. এল. 5 আই. জি. এফ. বি. পি. এল. 1 এস. এম. ও. সি. 1, এস. পি. এ. আর. সি., এস. পি. এ. আর. সি. এল. 1, এস. পি. আই. এন. কে 1, এস. পি. আই. এন. কে 2, এস. পি. আই. এন. কে 4, এস. পি. আই. এন. কে 5, এস. পি. আই. এন. কে 5 এল 2, এস. পি. আই. এন. কে 5 এল 3, এস. পি. আই. এন. কে 6, এস. পি. আই. যাইহোক, কাজালের মতো ক্ষেত্রগুলি অ্যাগ্রিনের বহির্মুখী অংশেও দেখা যায়, যা প্রোটিজ প্রতিরোধক হিসাবে পরিচিত নয়। কাজাল ডোমেনগুলি প্রায়শই টেন্ডেম অ্যারেতে ঘটে এবং একটি কেন্দ্রীয় আলফা-হেলিক্স, একটি ছোট দুই-স্ট্র্যান্ডেড অ্যান্টিপ্যারেলাল বিটা-শীট এবং বেশ কয়েকটি ডাইসালফাইড বন্ড থাকে। এই ডোমেনের অ্যামিনো টার্মিনাল সেগমেন্টটি তার টার্গেট প্রোটিজের সক্রিয় সাইটের সাথে আবদ্ধ হয়, এইভাবে তাদের কার্যকারিতা বাধা দেয়। কাজাল 2 ডোমেন সহ মানব প্রোটিনঃ সি6, সিএফআই এফএসটিএল1, এফএসটিএল3 এইচটিআরএ1, এইচটিআরএ3, এইচটিআরএ4 আইজিএফবিপি7, কাজাল্ড1, এলএসটি3, আরইসিকে এসএলসি21এ8, এসএলসিও1এ2, এসএলসিও1বি1, এসএলসিও1সি1, এসএলসিও2এ1, এসএলসিও3এ1, এসএলসিও4এ1, এসএলসিও4সি1, এসএলসিও4সি1, এসএলসিও5এ1, এসএলসিও6এ1, এসএমওসি2, স্পিংক5, স্পোক1, স্পোক2, স্পোক3 ডব্লিউএফআইকেএন1