HITS-CLIP
ক্রসলিঙ্কিং ইমিউনোপ্রিসিপিটেশন (এইচআইটিএস-সিএলআইপি) দ্বারা বিচ্ছিন্ন আরএনএ-র উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং হল জিনোম-ওয়াইড ম্যাপিং প্রোটিন-আরএনএ বাইন্ডিং সাইট বা ভিভোতে আরএনএ সংশোধন সাইটগুলির জন্য সিএলআইপি-এর একটি রূপ। এইচআইটিএস-সিএলআইপি মূলত নিউরন-নির্দিষ্ট আরএনএ-বাইন্ডিং প্রোটিন এবং স্প্লাইসিং ফ্যাক্টর নোভা1 এবং নোভা2-এর জন্য জিনোম-ওয়াইড প্রোটিন-আরএনএ মিথস্ক্রিয়া মানচিত্র তৈরি করতে ব্যবহৃত হয়েছিল; তারপর থেকে পিটিবি, আরবিফক্স2, এসএফআরএস1, এইচএনআরএনপি সি, এবং এমনকি এন6-মিথাইল্যাডেনোসিন (এম6এ) এমআরএনএ পরিবর্তনের জন্য অন্যান্য স্প্লাইসিং ফ্যাক্টর মানচিত্র তৈরি করা হয়েছে। মাউসের মস্তিষ্কে মাইক্রোআরএনএ-এমআরএনএ এবং প্রোটিন-আরএনএ মিথস্ক্রিয়া মানচিত্রগুলি ডিকোড করে এবং পরবর্তীকালে ক্যানোরহ্যাবডাইটিস এলিগ্যানস, ভ্রূণের স্টেম সেল এবং টিস্যু কালচার কোষে মাইক্রোআরএনএ লক্ষ্যগুলি সনাক্ত করার জন্য আরএনএ-বাইন্ডিং প্রোটিন আরগোনাউটের এইচআইটিএস-সিএলআইপি সঞ্চালিত হয়েছে। এইচআইটিএস-সিএলআইপি-এর একটি অভিনব পরিবর্তন হিসাবে, লক্ষ্য আরএনএ-তে ইউভি-ক্রসলিংকিং এম6এ অ্যান্টিবডি দ্বারা এমআরএনএ-তে এন6-মিথাইল্যাডেনোসিন (এম6এ) অবস্থানগুলি সঠিকভাবে ম্যাপ করার জন্য এম6এ-সিএলআইপি তৈরি করা হয়েছিল। সম্প্রতি, আর্গোনাউট এইচআইটিএস-সিএলআইপি-তে প্রয়োগ করা উন্নত জৈব তথ্যবিজ্ঞান একক নিউক্লিওটাইড রেজোলিউশনের সাথে বাঁধাই সাইটগুলি সনাক্ত করতে সক্ষম করে। টিস্যু কালচার কোষে সেলুলার আর. এন. এ-বাইন্ডিং প্রোটিন (আর. বি. পি) এবং মাইক্রো আর. এন. এ-যুক্ত রাইবোনিউক্লিওপ্রোটিন কমপ্লেক্স (এম. আই. আর. এন. পি)-এর বাইন্ডিং সাইটগুলি সনাক্ত করার জন্য অনুরূপ পদ্ধতি পি. এ. আর-সি. এল. আই. পি। আইসিএলআইপি, সিডিএনএ গ্রন্থাগারের পুঙ্খানুপুঙ্খ সম্প্রসারণের জন্য, কাটা সিডিএনএ সহ, এইভাবে ক্রসলিঙ্ক সাইটগুলি সনাক্ত করার জন্য একটি অতিরিক্ত উপায় সক্ষম করে। রেফারেন্স এক্সটার্নাল লিঙ্ক ক্লিপসিম-এম. সিঃ ক্লিপসিম-এম. সি এমন একটি টুল যা মন্টে-কার্লো-ভিত্তিক পদ্ধতি ব্যবহার করে এম. আই. আর. এন. এ/এম. আর. ই জুটির সন্ধান করতে ক্লিপ-সেক ডেটা ব্যবহার করে। স্টারবেস ডাটাবেসঃ মাইআরএনএ-এমআরএনএ, মাইআরএনএ-এলএনসিআরএনএ, মাইআরএনএ-এসএনসিআরএনএ, মাইআরএনএ-সার্কআরএনএ, মাইআরএনএ-সিউডোজেন, প্রোটিন-এলএনসিআরএনএ, প্রোটিন-আরএনএ ইন্টারঅ্যাকশন এবং এইচআইটিএস-সিএলআইপি (সিএলআইপি-সেক, পিএআর-সিএলআইপি, আইসিএলআইপি, ক্লাশ) ডেটা এবং টার্গেটস্ক্যান, পিকটার, আরএনএ22, মাইরান্ডা এবং পিআইটিএ মাইক্রোআরএনএ টার্গেট সাইটগুলি থেকে সিইআরএনএ নেটওয়ার্কগুলি অন্বেষণ করার জন্য একটি ডাটাবেস। ক্লিপজঃ এইচ. আই. টি. এস-সি. এল. আই. পি পরীক্ষা-নিরীক্ষা থেকে সংক্ষিপ্ত আর. এন. এ বিশ্লেষণ করার জন্য একটি পাইপলাইন। ডি. সি. এল. আই. পিঃ ডি. সি. এল. আই. পি হল দুটি তুলনামূলক সি. এল. আই. পি-সেক (এইচ. আই. টি. এস-সি. এল. আই. পি, পি. এ. আর-সি. এল. আই. পি বা আই. সি. এল. আই. পি) পরীক্ষায় ডিফারেনশিয়াল বাইন্ডিং অঞ্চল আবিষ্কারের জন্য একটি পার্ল প্রোগ্রাম। আর. এন. এ আণবিক জেনেটিক্স মাইক্রো আর. এন. এ