Cyclodeaminase domain
আণবিক জীববিজ্ঞানে, সাইক্লোডায়ামিনেজ ডোমেইন ফাংশন ধারণকারী এনজাইমগুলি ফোলেট পুলে এক-কার্বন ইউনিট প্রেরণ করে। বেশিরভাগ ক্ষেত্রে, এই ক্ষেত্রটি একটি ফর্মিডোয়েল্টেট্রাহাইড্রোফোলেট সাইক্লোডামিনেজ হিসাবে কাজ করে, যা প্রতিক্রিয়ায় (1) দেখানো ফর্মিডোয়েল্টেট্রাহাইড্রোফোলেটের মিথেনাইল্টেট্রাহাইড্রোফোলেটে সাইক্লাইজেশনকে অনুঘটক করে। মিথাইলট্রফিক ব্যাকটেরিয়াম মিথাইলব্যাকটেরিয়াম এক্সটোরকুয়েন্সে, তবে, এটি একটি মিথেনাইলটেট্রাহাইড্রোফোলেট সাইক্লোহাইড্রোলেস হিসাবে কাজ করে, যা ফর্মাইলটেট্রাহাইড্রোফোলেট এবং মিথাইলনেট্রাহাইড্রোফোলেটের আন্তঃপরিবর্তনকে অনুঘটক করে, যেমনটি প্রতিক্রিয়ায় দেখানো হয়েছে (2)। (1) 5-ফর্মিডোয়েল্টেট্রাহাইড্রোফোলেট = 5,10-মিথেনাইল্টেট্রাহাইড্রোফোলেট + এনএইচ (3) (2) 10-ফর্মিল্টেট্রাহাইড্রোফোলেট = 5,10-মিথেনাইল্টেট্রাহাইড্রোফোলেট + এইচ (2) ও প্রোক্যারিওটসে, এই ডোমেনটি বেশিরভাগ ক্ষেত্রে নিজেরাই ঘটে, যেখানে ইউক্যারিওটসে এটি একটি গ্লুটামেট ফর্মিমিনোট্রান্সফেরেস ডোমেনের (যা পথের পূর্ববর্তী পদক্ষেপকে অনুঘটক করে) সাথে সংযুক্ত হয়ে দ্বি-কার্যকরী এনজাইম ফর্মিমিনোট্রান্সফেরেজ সাইক্লোডামিনেজ গঠন করে। ইউক্যারিওটিক এনজাইম হল হোমোডিমারের একটি বৃত্তাকার টেট্রামার, যেখানে প্রোকারিওটিক এনজাইম একটি ডাইমার। থার্মাওটোগোয়া মারিটিমা থেকে সাইক্লোডিয়ামিনেজ এনজাইমের স্ফটিক কাঠামো অধ্যয়ন করা হয়েছে। এটি একটি হোমোডিমার, যেখানে প্রতিটি মনোমার একটি নতুন ভাঁজ গঠন করে একটি উপরে এবং নিচে হেলিকাল বান্ডেলে সাজানো ছয়টি আলফা হেলিস নিয়ে গঠিত। সক্রিয় স্থানটির অবস্থান জানা যায়নি, তবে ক্রম বিন্যাসগুলি ডিমার ইন্টারফেসের মধ্যে একটি গভীর পকেটে অবস্থিত সংরক্ষিত অবশিষ্টাংশের দুটি গুচ্ছ প্রকাশ করেছে। এই পকেটটি প্রতিক্রিয়া পণ্যটি সামঞ্জস্য করার জন্য যথেষ্ট বড় ছিল এবং এটি অনুমান করা হয়েছিল যে এটি সক্রিয় সাইট। তথ্যসূত্র প্রোটিন পরিবার