Alphaproteobacteria
আলফাপ্রোটোব্যাকটেরিয়া হল সিউডোমোনাডোটা (পূর্বে প্রোটিওব্যাকটেরিয়া) পর্বের ব্যাকটেরিয়ার একটি শ্রেণী। ম্যাগনেটোকোকেলস এবং ম্যারিপ্রোফান্ডেলসকে আলফাপ্রোটোব্যাকটেরিয়ার বেসাল বা বোন হিসাবে বিবেচনা করা হয়। আলফাপ্রোটোব্যাকটেরিয়া অত্যন্ত বৈচিত্র্যময় এবং এর মধ্যে খুব কম মিল রয়েছে, তবে তা সত্ত্বেও একটি সাধারণ পূর্বপুরুষ রয়েছে। সমস্ত প্রোটিওব্যাকটেরিয়ার মতো, এর সদস্যগুলি গ্রাম-নেতিবাচক এবং এর কিছু আন্তঃকোষীয় পরজীবী সদস্যদের পেপটিডোগ্লাইকানের অভাব রয়েছে এবং ফলস্বরূপ গ্রাম পরিবর্তনশীল। বৈশিষ্ট্য আল্ফাপ্রোটোব্যাকটেরিয়া একটি বৈচিত্র্যময় ট্যাক্সন এবং বেশ কয়েকটি ফটোট্রফিক জেনেরা নিয়ে গঠিত, বেশ কয়েকটি জেনেরা বিপাককারী সি1-যৌগ (যেমন, মিথাইলব্যাকটেরিয়াম এসপিপি)। ), উদ্ভিদের প্রতীক (যেমন, রাইজোবিয়াম এসপিপি। ), আর্থ্রোপডের এন্ডোসিম্বিয়ন্টস (ওলবাচিয়া) এবং ইন্ট্রাসেলুলার প্যাথোজেনস (যেমন। রিকেটসিয়া)। অধিকন্তু, এই শ্রেণীটি প্রোটোমাইটোকন্ড্রিয়নের বোন, যে ব্যাকটেরিয়াটি ইউক্যারিওটিক পূর্বপুরুষ দ্বারা আক্রান্ত হয়েছিল এবং মাইটোকন্ড্রিয়ার জন্ম দিয়েছিল, যা ইউক্যারিওটিক কোষে অর্গানেলস (এন্ডোসিম্বায়োটিক তত্ত্ব দেখুন)। প্রযুক্তিগত আগ্রহের একটি প্রজাতি হল রাইজোবিয়াম রেডিওব্যাক্টর (পূর্বে অ্যাগ্রোব্যাকটেরিয়াম টিউমেফ্যাসিয়েন্স): বিজ্ঞানীরা প্রায়শই উদ্ভিদ জিনোমে বিদেশী ডিএনএ স্থানান্তর করতে এই প্রজাতিটি ব্যবহার করেন। অ্যারোবিক অ্যানোক্সিজেনিক ফটোট্রফিক ব্যাকটেরিয়া, যেমন পেলাগিব্যাক্টর ইউবিক, হল আলফাপ্রোটোব্যাকটেরিয়া যা ব্যাপকভাবে বিতরণ করা হয় এবং খোলা সমুদ্রের মাইক্রোবিয়াল সম্প্রদায়ের 10 শতাংশেরও বেশি গঠন করতে পারে। বিবর্তন এবং জিনোমিক্স ক্রমের ফাইলোজেনি নিয়ে কিছু মতবিরোধ রয়েছে, বিশেষত পেলাগিব্যাকটেরেলসের অবস্থানের ক্ষেত্রে, তবে সামগ্রিকভাবে কিছু ঐক্যমত্য রয়েছে। অসঙ্গতিটি জিনের পরিমাণের বড় পার্থক্য থেকে উদ্ভূত হয় (যেমন। পেলাগিব্যাক্টর উবিক-এ জিনোম স্ট্রিমলাইনিং) এবং বিভিন্ন অর্ডারের সদস্যদের মধ্যে জিসি-সামগ্রীর বড় পার্থক্য। বিশেষত, পেলাগিব্যাকটেরেলস, রিকেটসিয়ালস এবং হোলোস্পোরেলসে এটি-সমৃদ্ধ জিনোম সহ প্রজাতি রয়েছে। এটি যুক্তি দেওয়া হয়েছে যে এটি অভিসারী বিবর্তনের একটি ঘটনা হতে পারে যার ফলে একটি শিল্পকর্মের গুচ্ছ তৈরি হবে। তবে বেশ কিছু গবেষণা এর সঙ্গে একমত নয়। উপরন্তু, এটি পাওয়া গেছে যে রাইবোসোমাল আরএনএ (প্রোক্যারিওটসের জন্য ঐতিহ্যবাহী ফাইলোজেনেটিক মার্কার)-এর জিসি-বিষয়বস্তু জিনোমের জিসি-উপাদানকে খুব কম প্রতিফলিত করে। ফাইলোজেনির সাথে রাইবোসোমাল জিসি-বিষয়বস্তুর এই অস্বাভাবিক সজ্জার একটি উদাহরণ হল যে পেলোসিব্যাকটেরেলস এবং রিকেটসিয়ালিসের সদস্যদের তুলনায় হলোস্পোরেলসের সদস্যদের রাইবোসোমাল জিসি-উপাদান অনেক বেশি, যদিও তারা পরবর্তী দুটি ক্রমের সদস্যদের তুলনায় উচ্চ জিনোমিক জিসি-উপাদানযুক্ত প্রজাতির সাথে আরও ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত। শ্রেণী আল্ফাপ্রোটোব্যাকটেরিয়া তিনটি উপশ্রেণীতে বিভক্ত-ম্যাগনেটোকক্সিডি, রিকেটসিডি এবং ক্যালোব্যাকটেরিডি। বেসাল গ্রুপটি হল ম্যাগনেটোকক্সিডি, যা ম্যাগনেটোট্যাক্টিক ব্যাকটেরিয়ার একটি বিশাল বৈচিত্র্য দ্বারা গঠিত, তবে শুধুমাত্র একটি বর্ণনা করা হয়েছে, ম্যাগনেটোকক্কাস মারিনাস। রিকেটসিডে আন্তঃকোষীয় রিকেটসিয়ালস এবং মুক্ত-জীবিত পেলাগিব্যাকটেরেলস নিয়ে গঠিত। ক্যালোব্যাকটেরিডে হলোস্পোরালেস, রোডোস্পিরিলালেস, স্ফিঙ্গোমোনাডেলস, রোডোব্যাকটেরেলস, ক্যালোব্যাকটেরেলস, কিলোনিয়েলেলস, কর্ডিমোনাডেলস, পারভুলারকুলালেস এবং স্নেথিয়েলেলস নিয়ে গঠিত। ক্রমবর্ধমান জিনোমের তুলনামূলক বিশ্লেষণের ফলে ব্যাপকভাবে বিতরণকৃত প্রোটিন এবং পুরো প্রোটিনে (অর্থাৎ, জিনোম) অনেক সংরক্ষিত সন্নিবেশ-অপসারণ (ইনডেল) আবিষ্কৃত হয়েছে। সিগনেচার প্রোটিন) যা সমস্ত আলফাপ্রোটোব্যাকটেরিয়া বা তাদের বিভিন্ন প্রধান ক্রমের স্বতন্ত্র বৈশিষ্ট্য (যেমন। রাইজোবিয়ালিস, রোডোব্যাকটেরেলিস, রোডোস্পিরিলেলিস, রিকেটসিয়ালিস, স্ফিঙ্গোমোনাডেলিস এবং ক্যালোব্যাকটেরেলিস) এবং পরিবার (যেমন। রিকেটসিয়াসি, অ্যানাপ্লাজমাটাসি, রোডোস্পিরিলাসি, এসিটোব্যাকটেরাসি, ব্র্যাডিরিয়োজোবিয়াসি, ব্রুসেলাসি এবং বার্টোনেলেসিয়া)। এই আণবিক স্বাক্ষরগুলি এই শ্রেণীবিন্যাসগত গোষ্ঠীগুলির পরিবেষ্টনের জন্য এবং এই গোষ্ঠীগুলিতে নতুন প্রজাতি সনাক্তকরণ/বরাদ্দকরণের জন্য অভিনব উপায় প্রদান করে। প্রচুর সংখ্যক অন্যান্য প্রোটিনের ফাইলোজেনেটিক বিশ্লেষণ এবং সংরক্ষিত ইনডেলগুলি প্রমাণ দেয় যে বিটাপ্রোটোব্যাকটেরিয়া এবং গামাপ্রোটোব্যাকটেরিয়া ব্যতীত বেশিরভাগ অন্যান্য ফাইলা এবং ব্যাকটেরিয়ার শ্রেণীর তুলনায় আলফাপ্রোটোব্যাকটেরিয়া পরে শাখা বন্ধ করে দিয়েছে। আলফাপ্রোটোব্যাকটেরিয়ার ফাইলোজেনি ক্রমাগত পুনর্বিবেচনা এবং আপডেট করা হয়েছে। আলফাপ্রোটোব্যাকটেরিয়ায় ম্যাগনেটোকসিডের অন্তর্ভুক্তির বিষয়ে কিছু বিতর্ক রয়েছে। উদাহরণস্বরূপ, ম্যাগনেটোকক্সিডের জন্য একটি স্বাধীন প্রোটিওব্যাকটেরিয়াল শ্রেণীর (ইটাপ্রোটিওব্যাকটেরিয়া) প্রস্তাব করা হয়েছে। সাম্প্রতিক একটি ফাইলোজেনোমিক গবেষণায় ম্যাগনেটোকোকিডি এবং অন্যান্য সমস্ত আলফাপ্রোটিওব্যাকটেরিয়াল ট্যাক্সার মধ্যে প্রোটোমাইটোকন্ড্রিয়াল ক্লেড স্থাপনের পরামর্শ দেওয়া হয়েছে, যা ম্যাগনেটোকোকিডি ব্যতীত বাকি আলফাপ্রোটিওব্যাকটেরিয়া থেকে প্রোটোমাইটোকন্ড্রিয়াল বংশের প্রাথমিক বিচ্যুতির পরামর্শ দেয়। এই ফাইলোজেনি আরও পরামর্শ দেয় যে প্রোটোমাইটোকন্ড্রিয়াল বংশের রিকেটসিডের সাথে ঘনিষ্ঠ সম্পর্ক নেই। ইনসার্টে সেডিস নিম্নলিখিত ট্যাক্সাগুলি আলফাপ্রোটোব্যাকটেরিয়াকে বরাদ্দ করা হয়েছে, তবে এক বা একাধিক মধ্যবর্তী ট্যাক্সোনমিক পদমর্যাদার জন্য বরাদ্দ করা হয়নিঃ মিনউয়ালেস সান এট আল উপশ্রেণীর জন্য নির্ধারিত আদেশ নয়। 2018 জেনেরা একটি পরিবারের জন্য বরাদ্দ করা হয়নি "ক্যান্ডিডেটাস অ্যানোক্সিপেলাগিব্যাক্টর" রুইজ-পেরেজ এবং অন্যান্য। 2021 "বিলোফোকোকাস" মোয়েঞ্চ 1988 "ক্যারোনোমাইক্রোবিয়াম" সোটোনি এবং অন্যান্য। 2011 "ক্যান্ডিডেটাস এন্ডোলিসোক্লিনম" কোয়ান এবং অন্যান্য। 2012 "ক্যান্ডিডেটাস এন্ডোওয়াটারসিপোরা" অ্যান্ডারসন এবং হেইগুড 2007 "ক্যান্ডিডেটাস হ্যালিজোমাইক্রোবিয়াম" লেভান্তেসি এবং অন্যান্য। 2004 "ক্যান্ডিডেটাস হ্যালিওসফেরা" ক্রাগেলুন্ড এবং অন্যান্য। 2006 "ক্যান্ডিডেটাস হজকিনিয়া" ম্যাককাচিওন এবং অন্যান্য। 2009 "ক্যান্ডিডেটাস লারিস্কেলা" মাৎসুউরা এবং অন্যান্যরা। 2012 "মেরিনোসালফোনোমাস" হোমস এবং অন্যান্য। 1997 "ক্যান্ডিডেটাস মেসোপেলাগিব্যাক্টর" রুইজ-পেরেজ এবং অন্যান্যরা। 2021 "মিথাইলসলফোনোমাস" হোমস এবং অন্যান্যরা। 1997 "ক্যান্ডিডেটাস মনিলিব্যাক্টর" ক্রাগেলুন্ড এবং অন্যান্য। 2006 "ন্যানোব্যাকটেরিয়াম" সিফ্টসিওগ্লু এবং অন্যান্য। 1997 "অলিওমোনাস" কানামোরি এবং অন্যান্যরা। 2002 "ক্যান্ডিডেটাস প্যারাহোলোস্পোরা" এসচবাখ এবং অন্যান্য। 2009 "ক্যান্ডিডেটাস ফাইকোসোসিয়াস" তানাবে এবং অন্যান্যরা। 2015 "ক্যান্ডিডেটাস পুনিসিস্পিরিলাম" ওহ এট আল। 2010 "টেট্রাকোক্কাস" ব্ল্যাকল এবং অন্যান্য। 1997 "টিউবেরয়েডোব্যাক্টর" নিকিতিন 1983 প্রজাতি ভিব্রিও অভিযোজন মুইর এট আল গণের জন্য নির্ধারিত নয়। 1990 ভিব্রিও সাইক্লোসাইটস মুইর এবং অন্যান্য। 1990 ফাইলোজেনি বর্তমানে গৃহীত শ্রেণীবিন্যাসটি স্ট্যান্ডিং ইন নোমেনক্লেচার (এল. পি. এস. এন) সহ প্রোক্যারিওটিক নামগুলির তালিকা ভিত্তিক। ফাইলোজেনি সম্পূর্ণ-জিনোম বিশ্লেষণের উপর ভিত্তি করে। উপশ্রেণীর নামগুলি ফেরলা ও অন্যান্যদের উপর ভিত্তি করে তৈরি। (2013)। প্রাকৃতিক জিনগত রূপান্তর যদিও আলফাপ্রোটোব্যাকটেরিয়ায় প্রাকৃতিক জিনগত রূপান্তর সম্পর্কে মাত্র কয়েকটি গবেষণার খবর পাওয়া গেছে, এই প্রক্রিয়াটি অ্যাগ্রোব্যাকটেরিয়াম টিউমেফ্যাসিয়েন্স, মিথাইলোব্যাকটেরিয়াম অর্গানোফিলাম এবং ব্র্যাডিরাইজোবিয়াম জাপোনিকামে বর্ণনা করা হয়েছে। প্রাকৃতিক জিনগত রূপান্তর হল একটি যৌন প্রক্রিয়া যার মধ্যে মধ্যবর্তী মাধ্যমের মাধ্যমে এক ব্যাকটেরিয়া কোষ থেকে অন্য ব্যাকটেরিয়ায় ডিএনএ স্থানান্তর এবং সমজাতীয় পুনঃসংযোগের মাধ্যমে গ্রহীতার জিনোমে দাতা ক্রমের সংহতকরণ জড়িত। বিবরণ বাইরের লিঙ্ক ব্যাকটেরিয়াল (প্রোক্যারিওটিক) ফাইলোজেনি ওয়েবপৃষ্ঠাঃ আলফা প্রোটিওব্যাকটেরিয়া। ব্যাকটেরিয়ার শ্রেণীবিভাগ