Histone fold
হিস্টোন ভাঁজ একটি কাঠামোগতভাবে সংরক্ষিত মোটিফ যা সি-টার্মিনাসের কাছে প্রতিটি মূল হিস্টোন সিকোয়েন্সে একটি হিস্টোন অক্টেমারের মধ্যে পাওয়া যায় যা হিস্টোনগুলিকে হেটেরোডাইমারের মধ্যে আবদ্ধ করার জন্য দায়ী। হিস্টোন ভাঁজ গড় প্রায় 70 টি অ্যামিনো অ্যাসিড এবং দুটি ছোট, কাঠামোগত লুপ দ্বারা সংযুক্ত তিনটি আলফা হেলিস নিয়ে গঠিত। ডি. এন. এ-র উপস্থিতিতে না থাকলে, মূল হিস্টোনগুলি হেড-টু-টেইল ইন্টারমিডিয়েটে একত্রিত হয় (এইচ3 এবং এইচ4 প্রথমে হেটেরোডাইমারগুলিতে একত্রিত হয় তারপর দুটি হেটেরোডাইমারকে একটি টেট্রামার গঠনের জন্য ফিউজ করে, যেখানে এইচ2এ এবং এইচ2বি হেটেরোডাইমার গঠন করে) একটি "হ্যান্ডশেক মোটিফ"-এ প্রতিটি হিস্টোন ভাঁজ ডোমেনের মধ্যে বিস্তৃত হাইড্রোফোবিক মিথস্ক্রিয়ার মাধ্যমে। এছাড়াও হিস্টোন ভাঁজ প্রথম পাওয়া যায় টাটা বক্স-বাইন্ডিং প্রোটিন-সম্পর্কিত কারণগুলিতে, যা প্রতিলিপির একটি প্রধান উপাদান। হিস্টোন ভাঁজটির বিবর্তন পেপটাইডের পূর্বপুরুষের সেটগুলির বিভিন্ন সংমিশ্রণ দ্বারা পাওয়া যায় যা হেলিক্স-স্ট্র্যান্ড-হেলিক্স মোটিফ তৈরি করে যা পূর্বপুরুষের টুকরোগুলি থেকে তিনটি ভাঁজ থেকে আসে। এই পেপটাইড শৃঙ্খলগুলি আর্কিয়াল হিস্টোনের মধ্যে পাওয়া যায়, যা ইউক্যারিওটিক এইচ3-এইচ4 টেট্রামার থেকে আসতে পারে। আর্কিয়াল সিঙ্গেল-চেইন হিস্টোনগুলি অ্যাকুইফেক্স এইওলিকাস ব্যাকটেরিয়াতেও পাওয়া যায়। যা ইউক্যারিওটস এবং আর্কিয়ার পূর্বপুরুষ থেকে আসা বৈচিত্র্যময় ব্যাকটেরিয়াকে ব্যাকটেরিয়ায় পৌঁছানোর জন্য পার্শ্বীয় জিন স্থানান্তরের সাথে সহায়তা করে। এগুলি ডিএনএ সংকোচনের জন্য অক্টেমার আর্টিকুলেটেড প্রোটিন এন্ডোস্কেলিটনে নিয়ে যায়। এই এন্ডোস্কেলিটন থেকে এটির একটি কেন্দ্রীয় অংশ রয়েছে যা হিস্টোন ডাইমেরাইজেশনের জন্য ভাঁজ করে। এরপরে এটি ডাইমার-ডাইমার পরিচিতিগুলির বৈশিষ্ট্য তৈরি করতে ভাঁজটির শেষ অংশে নিয়ে যায় যা অক্টেমারে প্রোটিন সুপার হেলিক্সকেও আবৃত করে। একটি প্রজাতি যা দেখেছে তা হল ড্রোসোফিলা, এবং ড্রোসোফিলা ট্রান্সক্রিপশন ইনিশিয়েশন ফ্যাক্টরের সাবইউনিটে নির্দিষ্ট অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্স রয়েছে যার হিস্টোন ভাঁজগুলির বিভিন্ন বৈশিষ্ট্য রয়েছে যা দুটি প্রোটিন তৈরি করে সাবইউনিট তৈরি করে। ড্রোসোফিলায় হিস্টোন ভাঁজ মোটিফের দিকে তাকালে প্রোটিন-প্রোটিন এবং মূল হিস্টোন প্রোটিনের প্রোটিন ডিএনএ মিথস্ক্রিয়া অ-হিস্টোন প্রোটিনের দিকে তাকিয়ে পাওয়া যায়। এরপরে এটি "ড্রোসোফিলা থেকে টিএএফআইআই42/টিএএফআইআই62 কমপ্লেক্স এবং মিথেনোকোকাস ফিউভিডাস থেকে এইচএমএফবি-র কাঠামোগত গবেষণায় ব্যবহার করা যেতে পারে, পূর্বোক্ত অনুসন্ধানগুলিতে হিস্টোন ভাঁজ ধারণকারী হিসাবে চিহ্নিত প্রোটিনগুলি নিশ্চিত করেছে যে এই প্রোটিনগুলিতে একটি হিস্টোনের মতো সাবস্ট্রাকচার বিদ্যমান, পৃথক প্রোটিনগুলি ক্যানোনিকাল হিস্টোন ভাঁজ মোটিফের মধ্যে ভাঁজ করে।" হিস্টোন ভাঁজ প্রোটিনের হিস্টোন প্রোটিন-প্রোটিন এবং ডিএনএ-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়ার বিবর্তনীয় কাঠামো এবং পরিসীমা বিবর্তনীয় বৈশিষ্ট্যগুলির একটি খুব বিস্তৃত পরিসর রয়েছে যা কাঠামো এবং অন্যান্য প্রোটিন গঠন করে। ইন্টারফেস পৃষ্ঠগুলি দেখার সময় হিস্টোন মিথস্ক্রিয়া সংরক্ষণ করে নিউক্লিওসোমাল কোর কণার মধ্যে হিস্টোন ভাঁজগুলি একটি ভূমিকা পালন করে। এগুলিতে একাধিক হিস্টোন ভাঁজ থাকে। নিউক্লিওসোম মূল কণার কাঠামোর দুটি মোড রয়েছে যার সাথে H3-H4 এবং H2A-H2B হেটেরোটাইপিক ডাইমার মিথস্ক্রিয়া গোষ্ঠীতে সবচেয়ে বড় মিথস্ক্রিয়া পৃষ্ঠ রয়েছে। H2A-H2A কাঠামোর দিকে তাকালে এটির ইন্টারফেসে লুপের একটি পরিবর্তন রয়েছে যা এটিকে অন্যান্য কাঠামোর একই ইন্টারফেসের সাথে ক্লাস্টারিং থেকে বাদ দেয়। যা প্রতিলিপি সক্রিয়করণে এটির একটি ভিন্ন ফাংশন তৈরি করে। এছাড়াও দীর্ঘতম হেলিক্স চেইন থাকার কারণে দুটি মোড আলাদা। এগুলি দুটি হিস্টোন ভাঁজগুলির মধ্যে হ্যান্ডশেক মিথস্ক্রিয়া ব্যবহার করে, যখন তারা বাকি মোডগুলির তুলনায় নিজেদের অনন্য করতেও এটি ব্যবহার করে। একইভাবে মূল নিউক্লিওসোম কণার মোড 5 এবং 7 দুই ধরনের হিস্টোন ভাঁজ ডাইমার ব্যবহার করে যা দেখায় যে সমস্ত হিস্টোন ডোমেন একে অপরের সাথে যোগাযোগ করতে এবং বিভিন্ন উপায়ে যোগাযোগ করতে সক্ষম হওয়ার জন্য একটি অনুরূপ কাঠামোগত মোটিফ ভাগ করে। হিস্টোনের কাঠামো কতটা নমনীয় এবং অভিযোজিত তা দেখানো হচ্ছে। এইচ4 এবং এইচ2এ একটি ইন্টার্নুক্লিওসোমাল পরিচিতি তৈরি করতে পারে যা দুটি পেপটাইডের মধ্যে আয়নিক মিথস্ক্রিয়া সম্পাদন করতে সক্ষম হওয়ার জন্য অ্যাসিটিলেট করা যেতে পারে, যা পার্শ্ববর্তী ইন্টার্নুক্লিওসোমাল পরিচিতিগুলিকে পরিবর্তন করতে পারে যা ক্রোমাটিন খোলার একটি উপায় তৈরি করতে পারে। তথ্যসূত্র প্রোটিন ভাঁজ আণবিক জীববিজ্ঞান