Retinylidene protein
রেটিনিলিডিন প্রোটিন বা বিস্তৃত অর্থে রোডপসিন হল এমন প্রোটিন যা আলোর অভ্যর্থনার জন্য রেটিনালকে ক্রোমোফোর হিসাবে ব্যবহার করে। এগুলি ফ্ল্যাজেলেটের ফটোট্যাক্সিস থেকে শুরু করে প্রাণীদের দৃষ্টিশক্তি পর্যন্ত বিভিন্ন আলোক-সংবেদনশীল ব্যবস্থার আণবিক ভিত্তি। রেটিনিলিডিন প্রোটিনে সব ধরনের অপসিন এবং রোডপসিন (বিস্তৃত অর্থে) থাকে। যদিও সংকীর্ণ অর্থে রোডপসিন বলতে মেরুদণ্ডী প্রাণীদের মধ্যে পাওয়া একটি ম্লান-হালকা দৃশ্যমান রঞ্জককে বোঝায়, সাধারণত রড কোষের উপর, বিস্তৃত অর্থে রোডপসিন (যেমন এখানে ব্যবহৃত হয়েছে) স্থল অবস্থায় একটি অপসিন এবং রেটিনাল ক্রোমোফোর সমন্বিত যে কোনও অণুকে বোঝায়। যখন আলো দ্বারা সক্রিয় হয়, তখন ক্রোমোফোরটি আইসোমারাইজড হয়, যে সময়ে পুরো অণুটি আর রোডপসিন নয়, তবে একটি সম্পর্কিত অণু যেমন মেটারোডপসিন। যাইহোক, এটি একটি রেটিনিলিডিন প্রোটিন হিসাবে রয়ে গেছে। ক্রোমোফোর তারপর অপসিন থেকে পৃথক হয়, যে সময়ে খালি অপসিন একটি রেটিনিলিডিন প্রোটিন। সুতরাং, অণুটি ফটোট্রান্সডাকশন চক্র জুড়ে একটি রেটিনিলিডিন প্রোটিন হিসাবে থেকে যায়। কাঠামো সমস্ত রডোপসিন দুটি বিল্ডিং ব্লক নিয়ে গঠিত, একটি প্রোটিন ভাগ এবং একটি বিপরীতভাবে সমযোজীভাবে আবদ্ধ অ-প্রোটিন কোফ্যাক্টর, রেটিনাল (রেটিনালডিহাইড)। রডপসিনের প্রোটিন কাঠামো সাতটি ট্রান্সমেম্ব্রেন হেলিসের একটি বান্ডিল নিয়ে গঠিত যা ফটোরেক্টিভ ক্রোমোফোরকে আবদ্ধ করে একটি অভ্যন্তরীণ পকেট গঠন করে। এগুলি সাতটি ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেইন ধারণকারী অন্যান্য ঝিল্লি-আবদ্ধ রিসেপ্টরগুলির সাথে একটি সুপারফ্যামিলি গঠন করে, উদাহরণস্বরূপ গন্ধ এবং কেমোকিন রিসেপ্টর। আলোর অভ্যর্থনার প্রক্রিয়া তাদের আত্মীয়দের মতো রাসায়নিক লিগ্যান্ডগুলিকে আবদ্ধ করে সক্রিয় হওয়ার পরিবর্তে, রোডপসিনে রেটিনাল থাকে যা ফটোআইসোমেরাইজেশনের মাধ্যমে আলোর প্রতিক্রিয়ায় গঠন পরিবর্তন করে এবং এইভাবে আলো দ্বারা সক্রিয় হয়। রেটিনার অণুটি বিভিন্ন সিস-ট্রান্স আইসোমেরিক রূপ নিতে পারে, যেমন অল-ট্রান্স, 11-সিস এবং 13-সিস। সিস থেকে ট্রান্স বা তদ্বিপরীত রেটিনালের ফটোআইসোমেরাইজেশন (হালকা-নির্ভর আইসোমেরাইজেশন) রিসেপ্টর প্রোটিনে একটি গঠনমূলক পরিবর্তনকে প্ররোচিত করে। এই পরিবর্তনটি কোষের মধ্যে একটি সংকেত সঞ্চালন প্রক্রিয়া সক্রিয় করতে একটি আণবিক সুইচ হিসাবে কাজ করে। রডপসিনের প্রকারের উপর নির্ভর করে, এটি হয় একটি আয়ন চ্যানেল খোলে (উদাহরণস্বরূপ ব্যাকটেরিয়ায়) বা একটি সম্পর্কিত জি প্রোটিন সক্রিয় করে এবং একটি দ্বিতীয় বার্তাবাহক ক্যাসকেডকে ট্রিগার করে (উদাহরণস্বরূপ পশুর চোখে)। ব্যাকটেরিয়া থেকে শুরু করে শেত্তলাগুলি এবং প্রাণী পর্যন্ত অনেক প্রজাতিতে রডোপ্সিনের প্রকার রেটিনিলিডিন প্রোটিন বা রডোপ্সিন বিদ্যমান। তাদের ক্রমের পাশাপাশি স্থল অবস্থায় থাকা রেটিনাল আইসোমার এবং তাদের সংকেত সঞ্চালন পদ্ধতির উপর ভিত্তি করে তাদের দুটি স্বতন্ত্র প্রকারে বিভক্ত করা যেতে পারে। মাইক্রোবিয়াল রোডপসিন প্রাণী রোডপসিনের মতো, মাইক্রোবিয়াল রোডপসিনে (প্রোক্যারিওটস এবং শেত্তলাগুলিতে পাওয়া যায়) একটি রেটিনাল ক্রোমোফোর থাকে এবং সাতটি ট্রান্সমেম্ব্রেন আলফা হেলিস থাকে; তবে, এগুলি জি প্রোটিনের সাথে যুক্ত হয় না। রেটিনাল ক্রোমোফোর প্রাণী 11-সিস ফর্ম থেকে পৃথক এবং স্থল অবস্থায় একটি সর্ব-ট্রান্স রেটিনাল আইসোমার, যা আলো সক্রিয়করণের পরে 13-সিস আইসোমারাইজ করে; ক্রোমোফোর মাইক্রোবিয়াল-টাইপ ক্রোমোফোর নামেও পরিচিত। উদাহরণস্বরূপ ব্যাকটেরিয়ার সংবেদনশীল রডোপসিন, চ্যানেলরোডোপসিন, ব্যাকটেরিয়ারহোডোপসিন, হ্যালোরহোডোপসিন, প্রোটোরহোডোপসিন, আর্কিয়ারহোডোপসিন, হেলিওরহোডোপসিন এবং ফটোট্রোফি বহন করার জন্য জ্যান্থোরহোডোপসিন। এগুলি হালকা-গেটেড আয়ন চ্যানেল হিসাবে কাজ করে এবং তারা যে ধরনের আয়ন চ্যানেল করে তার দ্বারা আরও আলাদা করা যেতে পারে। ব্যাকটেরিয়োরহোডোপসিন প্রোটন পাম্প হিসাবে কাজ করে, যেখানে হ্যালোরহোডোপসিন ক্লোরাইড পাম্প হিসাবে কাজ করে। তাদের কার্যকারিতা ব্যাকটেরিয়াল সালোকসংশ্লেষণ (ব্যাকটেরিয়ারহোডোপসিন) থেকে শুরু করে ড্রাইভিং ফটোট্যাক্সিস (ফ্ল্যাজেলেটগুলিতে চ্যানেলহোডোপসিন) পর্যন্ত বিস্তৃত। ফটোট্যাক্সিসে সিগন্যাল ট্রান্সডাকশন কোষের ঝিল্লির ডিপোলারাইজেশন জড়িত। এককোষী ফ্ল্যাগলেট শৈবালের মধ্যে চ্যানেলহোডোপসিন থাকে যা ভিন্নধর্মী সিস্টেমে প্রকাশ করা হলে হালকা-গেটেড ক্যাটায়ন চ্যানেল হিসাবে কাজ করে। অন্যান্য অনেক প্রো-এবং ইউক্যারিওটিক জীব (বিশেষত, নিউরোস্পোরার মতো ছত্রাক) রোডপসিন আয়ন পাম্প বা এখনও অজানা কার্যকারিতার সংবেদনশীল রোডপসিন প্রকাশ করে। অতি সম্প্রতি, গুয়ানিলিল সাইক্লেজ ক্রিয়াকলাপ সহ মাইক্রোবিয়াল রোডপসিন আবিষ্কৃত হয়েছে। যদিও সমস্ত মাইক্রোবিয়াল রডোপসিনের একে অপরের সাথে উল্লেখযোগ্য অনুক্রম সমরূপতা রয়েছে, তাদের জি-প্রোটিন-কাপল্ড রিসেপ্টর (জিপিসিআর) পরিবারের কোনও সনাক্তযোগ্য ক্রম সমরূপতা নেই যা প্রাণী ভিজ্যুয়াল রডোপসিনের অন্তর্গত। তবুও, মাইক্রোবিয়াল রডোপসিন এবং জিপিসিআর সম্ভবত তাদের ত্রিমাত্রিক কাঠামোর সাদৃশ্যের উপর ভিত্তি করে বিবর্তনীয়ভাবে সম্পর্কিত। অতএব, এগুলিকে স্ট্রাকচারাল ক্লাসিফিকেশন অফ প্রোটিন (এস. সি. ও. পি)-এ একই সুপারফ্যামিলিতে নিযুক্ত করা হয়েছে। জি প্রোটিন-কাপল্ড রিসেপ্টর প্রাণীজগতের রেটিনিলিডিন প্রোটিনগুলিকে অপসিন হিসাবেও উল্লেখ করা হয়। মেরুদণ্ডী প্রাণীর পাঁচটি উপপরিবার (রড) অপসিন এবং তিনটি উপপরিবার রয়েছে। অপসিনগুলি জি প্রোটিন-সংযুক্ত রিসেপ্টর শ্রেণীর অন্তর্গত এবং রেটিনালের একটি 11-সিস আইসোমারকে স্থল অবস্থায় আবদ্ধ করে যা আলোর সক্রিয়করণের পরে একটি অল-ট্রান্স রেটিনালে ফটোআইসোমেরাইজ করে। এগুলি সাধারণত আলোক-সংবেদনশীল অঙ্গগুলিতে পাওয়া যায়, উদাহরণস্বরূপ মেরুদণ্ডী রেটিনার ফোটোরিসেপ্টর কোষে যেখানে তারা দৃষ্টিশক্তিকে সহজতর করে। উভচর প্রাণীর ত্বক, টিকটিকি ও পাখির পিনিয়াল গ্রন্থি, টোডের হাইপোথ্যালামাস এবং মানুষের মস্তিষ্কেও প্রাণী অপসিন পাওয়া যায়। এগুলিকে বিভিন্ন স্বতন্ত্র শ্রেণীতে শ্রেণীবদ্ধ করা যেতে পারে যার মধ্যে রয়েছেঃ চাক্ষুষ অপসিন (ধ্রুপদী রোডোপসিন এবং আত্মীয়), মেলানোপসিন পারোপসিন নিউরোপসিন এনসেফালোপসিন চাক্ষুষ উপলব্ধি মেরুদণ্ডী রেটিনার রড কোষের "চাক্ষুষ বেগুনি" রোডোপসিন (অপসিন-2) সবুজ-নীল আলো শোষণ করে। রেটিনার শঙ্কু কোষের ফটোপসিনগুলি কয়েকটি অ্যামিনো অ্যাসিডে পৃথক হয় যার ফলে তাদের হালকা শোষণ বর্ণালী পরিবর্তিত হয়। তিনটি মানব ফটোপসিন হলুদ-সবুজ (ফটোপসিন I), সবুজ (ফটোপসিন II) এবং নীল-বেগুনি (ফটোপসিন III) আলো শোষণ করে এবং রঙিন দৃষ্টির ভিত্তি, যেখানে আরও হালকা-সংবেদনশীল "চাক্ষুষ বেগুনি" অন্ধকারে একবর্ণ দৃষ্টিশক্তির জন্য দায়ী। লাইট সিগন্যাল ট্রান্সডাকশনে জি-প্রোটিন (ট্রান্সডিউসিন), সি. জি. এম. পি ফসফডিস্টেরেস, একটি ক্যাটায়ন চ্যানেল বন্ধ করা এবং শেষ পর্যন্ত ভিজ্যুয়াল ফোটোরিসেপ্টর কোষের হাইপারপোলারাইজেশন জড়িত। আর্থ্রোপড এবং মোলাস্কের ভিজ্যুয়াল রোডোপসিনগুলি জি-প্রোটিন, ফসফোলাইপেজ সি এবং শেষ পর্যন্ত ভিজ্যুয়াল ফোটোরিসেপ্টর কোষের ডিপোলারাইজেশন জড়িত তাদের সংকেত ট্রান্সডাকশন ক্যাসকেডে মেরুদণ্ডী প্রোটিনের থেকে পৃথক। অন্যান্য মানুষের মধ্যে পাওয়া অন্যান্য অপসিনের মধ্যে রয়েছে এনসেফালোপসিন (বা প্যানোপসিন, অপসিন-3), মেলানোপসিন (অপসিন-4), নিউরোপসিন (অপসিন-5) এবং পেরোপসিন। মেলানোপসিন মেরুদণ্ডী প্রাণীর মধ্যে সার্কাডিয়ান ঘড়ির হালকা প্রবেশের সাথে জড়িত। এনসেফালোপসিন এবং নিউরোপসিন স্নায়ু কোষ এবং মস্তিষ্কের টিস্যুতে অত্যন্ত প্রকাশিত হয়, তবে এখনও পর্যন্ত তাদের কার্যকারিতা অজানা। পেরোপসিন অল-ট্রান্স রেটিনাল (মাইক্রোবিয়াল-টাইপ ক্রোমোফোর) কে আবদ্ধ করে এবং দৃশ্যমান উপলব্ধিতে প্রয়োজনীয় 11-সিস আইসোমার আকারে রেটিনালকে ফিরিয়ে আনতে ফটোআইসোমরেজ হিসাবে কাজ করতে পারে। আরও দেখুন অপসিন রোডোপসিন ভিজ্যুয়াল সাইকেল ভিজ্যুয়াল ফটোট্রান্সডাকশন মাইক্রোবিয়াল রোডোপসিন রেফারেন্স বাহ্যিক লিঙ্ক লিপিড দ্বিস্তরীয় সংবেদনশীল রিসেপ্টরগুলিতে রেটিনিলিডিন প্রোটিনের গণনা করা অবস্থান জৈবিক রঞ্জক 7টিএম রিসেপ্টর