Activity-based proteomics
ক্রিয়াকলাপ-ভিত্তিক প্রোটিওমিক্স, বা ক্রিয়াকলাপ-ভিত্তিক প্রোটিন প্রোফাইলিং (এবিপিপি) একটি কার্যকরী প্রোটিওমিক প্রযুক্তি যা রাসায়নিক প্রোব ব্যবহার করে যা যান্ত্রিকভাবে সম্পর্কিত শ্রেণীর এনজাইমগুলির সাথে প্রতিক্রিয়া করে। বিবরণ এ. বি. পি. পি-র মৌলিক একক হল তদন্ত, যা সাধারণত দুটি উপাদান নিয়ে গঠিতঃ একটি প্রতিক্রিয়াশীল গোষ্ঠী (আর. জি, যাকে কখনও কখনও "ওয়ারহেড" বলা হয়) এবং একটি ট্যাগ। উপরন্তু, কিছু প্রোবে একটি বাইন্ডিং গ্রুপ থাকতে পারে যা সিলেক্টিভিটি বাড়ায়। প্রতিক্রিয়াশীল গোষ্ঠীতে সাধারণত একটি বিশেষভাবে পরিকল্পিত ইলেক্ট্রোফাইল থাকে যা একটি সক্রিয় উৎসেচকের সক্রিয় স্থানে একটি নিউক্লিওফিলিক অবশিষ্টাংশের সাথে সমযোজীভাবে সংযুক্ত হয়ে যায়। একটি এনজাইম যা প্রতিরোধ করা হয় বা অনুবাদের পরে পরিবর্তিত হয় তা ক্রিয়াকলাপ-ভিত্তিক প্রোবের সাথে প্রতিক্রিয়া করবে না। ট্যাগটি হতে পারে ফ্লুরোফোরের মতো সাংবাদিক অথবা বায়োটিন বা অ্যালকাইন বা অ্যাজাইডের মতো অ্যাফিনিটি লেবেল যা হুইজেন 1,3-ডাইপোলার সাইক্লোঅ্যাডিশন (ক্লিক কেমিস্ট্রি নামেও পরিচিত)-এর সাথে ব্যবহার করা যেতে পারে। এ. বি. পি. পি-র একটি প্রধান সুবিধা হল প্রোটিন বা এম. আর. এন. এ প্রাচুর্যের মধ্যে সীমাবদ্ধ না থেকে সরাসরি সক্রিয় উৎসেচকের উপস্থিতি পর্যবেক্ষণ করার ক্ষমতা। সেরিন হাইড্রোলেস এবং মেটালোপ্রোটিয়েসের মতো এনজাইমের শ্রেণীগুলির সাথে যা প্রায়শই অন্তঃসত্ত্বা প্রতিরোধকগুলির সাথে যোগাযোগ করে বা নিষ্ক্রিয় জাইমোজেন হিসাবে বিদ্যমান, এই কৌশলটি প্রচলিত কৌশলগুলির তুলনায় একটি মূল্যবান সুবিধা প্রদান করে যা ক্রিয়াকলাপের পরিবর্তে প্রাচুর্যের উপর নির্ভর করে। বহুমাত্রিক প্রোটিন শনাক্তকরণ প্রযুক্তি সাম্প্রতিক বছরগুলিতে এবিপিপি-কে টেন্ডেম মাস স্পেকট্রোমেট্রি-র সঙ্গে যুক্ত করা হয়েছে যা একক নমুনা থেকে শত শত সক্রিয় এনজাইম সনাক্ত করতে সক্ষম করে। এ. বি. পি. পি-মুড. পি. আই. টি (বহুমাত্রিক প্রোটিন শনাক্তকরণ প্রযুক্তি) নামে পরিচিত এই কৌশলটি ইনহিবিটর সিলেক্টিভিটির প্রোফাইলিংয়ের জন্য বিশেষভাবে কার্যকর কারণ একটি ইনহিবিটরের শক্তি একযোগে শত শত লক্ষ্যের বিরুদ্ধে পরীক্ষা করা যেতে পারে। 1990-এর দশকে প্রোটিজ নিয়ে গবেষণায় এ. বি. পি. পি প্রথম রিপোর্ট করা হয়। আরও দেখুন মাস স্পেকট্রোমেট্রি প্রোটিওমিক্স সম্পর্কিত প্রতিরোধক এমএএফপি এবং ডিআইএফপি কেমোপ্রোটিওমিক্স রেফারেন্স প্রোটিওমিক্স জিনোমিক্স প্রোটিন পদ্ধতি মাস স্পেকট্রোমেট্রি