Pseudomonas citronellolis
সিউডোমোনাস সিট্রোনেলোলিস একটি গ্রাম-নেগেটিভ, ব্যাসিলাস ব্যাকটেরিয়া যা পাইরুভেট কার্বক্সিলেজের প্রক্রিয়া অধ্যয়ন করতে ব্যবহৃত হয়। এটি প্রথম মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রের উত্তর ভার্জিনিয়ায় পাইন গাছের নিচে বনের মাটি থেকে বিচ্ছিন্ন করা হয়েছিল। বৈশিষ্ট্য সিউডোমোনাস সিট্রোনেলোলিস একটি গ্রাম-নেগেটিভ, ব্যাসিলাস ব্যাকটেরিয়া। এটি প্রথম মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রের উত্তর ভার্জিনিয়ায় পাইন গাছের নিচে বনের মাটি থেকে বিচ্ছিন্ন করা হয়েছিল। এটির একটি মেরু ফ্লাজেলাম রয়েছে যা এটিকে গতিশীল হতে দেয়। উদ্ভিদের সাথে সম্পর্ক আগরের উপর, পি. সিট্রোনেলোলিস গোলাকার সাদা উপনিবেশ গঠন করে যা ফ্লুরোসেন্ট সবুজ রঞ্জক তৈরি করে। এটি একটি বায়োফিল্মও তৈরি করে এবং বেশিরভাগ অ্যান্টিবায়োটিকের বিরুদ্ধে প্রতিরোধী। ব্যাকটেরিয়ার উদ্ভিদ পোষকের সাথে একটি জৈবিক সম্পর্ক রয়েছে (পাইন গাছ বা তুলসীর সাথে)। এটি এক ধরনের হরমোন উৎপাদন করে যা উদ্ভিদ কোষের বৃদ্ধি এবং বিভাজনকে প্ররোচিত করে, যার ফলে স্থানীয় উপলব্ধ পুষ্টি বৃদ্ধি পায়। বিপাকীয় সম্ভাবনা পি. সিট্রোনেলোলিসের অধ্যয়ন গুরুত্বপূর্ণ কারণ এটি গ্লুকোজ সম্পর্কিত বিপাক এবং এনজাইম ক্রিয়াকলাপ গবেষণার জন্য একটি মডেল হিসাবে ব্যবহার করা যেতে পারে। পলিইথিলিন জৈব অবক্ষয় ক্ষেত্রেও এর ব্যবহারের সম্ভাবনা রয়েছে। জিনোমের আকার ডিএনএ কোডিং 6,028,113 বিপি-র আকার সহ 6,951,444 বিপি। গড় জিসি বিষয়বস্তু হল 67.11% এবং 4,665,300 বিপি। 6169টি ভবিষ্যদ্বাণীকৃত জিনের মধ্যে 6071টি (98.41%) প্রোটিন সিডিএস ছিল যার মধ্যে 4762টি জিনের কার্যকারিতার পূর্বাভাস ছিল। 15টি আর. আর. এন. এ সহ মোট 96টি আর. এন. এ জিনের পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল। একটি টেমপ্লেটের 16এসআর সিকোয়েন্সিংয়ের জন্য সিউডোমোনাস সিট্রোনেলোলিসের ডিএনএ বিচ্ছিন্নতা 25 মাইক্রোল পাতলা জিনোমিক ডিএনএ প্রকাশ করেছে। বক্সায়ার, পুনরাবৃত্তিমূলক এক্সট্রাজেনিক প্যালিনড্রোমিক সিকোয়েন্স-ভিত্তিক পিসিআর বিশ্লেষণ (আরইপি-পিসিআর), এবং এন্টারোব্যাকটেরিয়াল পুনরাবৃত্তিমূলক আন্তঃজেনিক কনসেনসাস (ইআরআইসি) ডিএনএকে প্রশস্ত করার জন্য প্রাইমার হিসাবে ব্যবহার করা হয়েছিল। পি. সিট্রোনেলোলিসের 29টি স্ট্রেনের জন্য পিসিআর 8 থেকে 12টি পরিবর্ধিত ব্যান্ড বের করে। 9, 000 বিপি থেকে 100 বিপি পর্যন্ত মাপের সাথে এগুলি খুব আলাদা ছিল। আরইপি-পিসিআর সবচেয়ে জটিল পরিবর্ধিত ব্যান্ডিং প্যাটার্ন তৈরি করে, যা বিভিন্ন তৈলাক্ত স্লাজ-দূষিত মাটির নমুনা থেকে বিচ্ছিন্ন পি সিট্রোনেলোলিস স্ট্রেনের মধ্যে বৈচিত্র্য প্রতিফলিত করে। পি. সিট্রোনেলোলিস স্ট্রেনের রাইবোটাইপ প্যাটার্নগুলি একাধিক এম্পলিকন দেখায় যা আরআরএনএ স্পেসার অঞ্চলের পলিমরফিজমকে দৃঢ়ভাবে নির্দেশ করে। জিনোমের এই পরীক্ষায় কোনও প্লাজমিড ছিল না এবং এর অস্তিত্বের কোনও প্রমাণ পাওয়া যায়নি। 16এস আর. আর. এন. এ বিশ্লেষণের উপর ভিত্তি করে, পি. সিট্রোনেলোলিসকে পি. এরুগিনোসা গ্রুপে রাখা হয়েছে। পি. সিট্রোনেলোলিস "রৈখিক মনো-এবং ডাইকার্বক্সিলিক অ্যাসিড" থেকে পলিহাইড্রক্সিয়াল-কানোয়েটের জৈব সংশ্লেষণ করতে সক্ষম বলে পাওয়া গেছে, যা এক ধরনের ব্যাকটেরিয়া-সংশ্লেষিত পলিয়েস্টার। পি. সিট্রোনেলোলিস পি3বি5 জিনোমে এমন জিন রয়েছে যা ল্যাক্টাম অ্যান্টিবায়োটিকের বিরুদ্ধে প্রতিরোধকারী ছয়টি ভবিষ্যদ্বাণীকৃত ল্যাক্টামেসের জন্য এনকোড করে। উপরন্তু, জিনোমে এফ্লাক্স পাম্পের জন্য জিন এনকোডিং থাকে যা ট্রাইমেথোপ্রিমের মতো অন্যান্য অ্যান্টিবায়োটিককে প্রতিরোধ প্রদান করে। পি3বি5 জিনোম এমন জিনগুলিকে এনকোড করে যা এটিকে অ্যালকেনগুলিকে অবনমিত করতে সক্ষম করে। এর চাপ-স্থিতিস্থাপকতা এবং উদ্ভিদের উপর নির্ভরশীল জীবনযাত্রার সংমিশ্রণে, এই জীবটিকে উদ্ভিদ প্রতিকারের পদ্ধতির জন্য একটি আকর্ষণীয় প্রার্থী করে তোলে। বেশ কয়েকটি এবি-র প্রতিরোধ লক্ষ্য করা গেছে এবং বেশ কয়েকটি এবিআর জিন সনাক্ত করা হয়েছে, তবে এবিআর জিন সংহতির সম্ভাবনার কোনও প্রমাণ পাওয়া যায়নি। তথ্যসূত্র বাহ্যিক সংযোগ ব্যাকডাইভে সিউডোমোনাস সিট্রোনেলোলিসের প্রকারের স্ট্রেন-1960 সালে বর্ণিত ব্যাকটেরিয়াল ডাইভারসিটি মেটাডাটাবেস সিউডোমোনাডেলস ব্যাকটেরিয়া