RNA-binding protein
আর. এন. এ-বাইন্ডিং প্রোটিনগুলি (প্রায়শই আর. বি. পি হিসাবে সংক্ষিপ্ত করা হয়) এমন প্রোটিন যা কোষে ডাবল বা একক আটকে থাকা আর. এন. এ-র সাথে আবদ্ধ হয় এবং রাইবোনিউক্লিওপ্রোটিন কমপ্লেক্স গঠনে অংশ নেয়। আর. বি. পি-তে বিভিন্ন কাঠামোগত মোটিফ থাকে, যেমন আর. এন. এ স্বীকৃতি মোটিফ (আর. আর. এম), ডি. এস. আর. এন. এ বাইন্ডিং ডোমেন, দস্তা আঙুল এবং অন্যান্য। এগুলি হল সাইটোপ্লাজমিক এবং নিউক্লিয়ার প্রোটিন। যাইহোক, যেহেতু বেশিরভাগ পরিপক্ক আর. এন. এ নিউক্লিয়াস থেকে তুলনামূলকভাবে দ্রুত রপ্তানি করা হয়, তাই নিউক্লিয়াসের বেশিরভাগ আর. বি. পি প্রোটিন এবং প্রাক-এম. আর. এন. এ কমপ্লেক্স হিসাবে বিদ্যমান যা হেটেরোজিনিয়াস রাইবোনিউক্লিওপ্রোটিন কণা (এইচ. এন. আর. এন. পি) নামে পরিচিত। বিভিন্ন সেলুলার প্রক্রিয়াতে আর. বি. পি-র গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রয়েছে যেমনঃ সেলুলার ফাংশন, পরিবহন এবং স্থানীয়করণ। এগুলি বিশেষত আর. এন. এ-র প্রতিলিপি-পরবর্তী নিয়ন্ত্রণে প্রধান ভূমিকা পালন করে, যেমনঃ স্প্লাইসিং, পলিঅ্যাডেনাইলেশন, এম. আর. এন. এ স্থিতিশীলতা, এম. আর. এন. এ স্থানীয়করণ এবং অনুবাদ। ইউক্যারিওটিক কোষগুলি অনন্য আরএনএ-বাইন্ডিং ক্রিয়াকলাপ এবং প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া সহ বিভিন্ন আর. বি. পি প্রকাশ করে। ইউক্যারিওটিক আর. বি. পি. ডাটাবেস (ই. ইউ. আর. বি. পি. ডি. বি) অনুসারে, মানুষের মধ্যে আর. বি. পি-কে এনকোডিং করা 2961টি জিন রয়েছে। বিবর্তনের সময়, ইন্ট্রনের সংখ্যা বৃদ্ধির সাথে সাথে আর. বি. পি-র বৈচিত্র্য ব্যাপকভাবে বৃদ্ধি পায়। বৈচিত্র্য ইউক্যারিওটিক কোষগুলিকে বিভিন্ন বিন্যাসে আর. এন. এ এক্সন ব্যবহার করতে সক্ষম করে, যা প্রতিটি আর. এন. এ-র জন্য একটি অনন্য আর. এন. পি (রাইবোনিউক্লিওপ্রোটিন) তৈরি করে। যদিও জিন অভিব্যক্তিতে প্রতিলিপি-পরবর্তী নিয়ন্ত্রণে আর. বি. পি-র গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রয়েছে, তবে তুলনামূলকভাবে খুব কম আর. বি. পি-র অধ্যয়ন করা হয়েছে যা এখন স্পষ্ট হয়ে গেছে যে আর. এন. এ-আর. বি. পি মিথস্ক্রিয়া জীবের মধ্যে অনেক জৈবিক প্রক্রিয়াতে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। কাঠামো অনেক আর. বি. পি-র মডুলার কাঠামো থাকে এবং মাত্র কয়েকটি নির্দিষ্ট মৌলিক ডোমেনের একাধিক পুনরাবৃত্তি নিয়ে গঠিত যার প্রায়শই সীমিত ক্রম থাকে। বিভিন্ন আর. বি. পি-তে এই ক্রমগুলি বিভিন্ন সংমিশ্রণে সাজানো থাকে। একটি নির্দিষ্ট প্রোটিনের একটি নির্দিষ্ট আর. এন. এ-র স্বীকৃতি এই কয়েকটি মৌলিক ক্ষেত্রের পুনর্বিন্যাসের মাধ্যমে বিকশিত হয়েছে। প্রতিটি মৌলিক ডোমেন আর. এন. এ-কে স্বীকৃতি দেয়, তবে এই প্রোটিনের অনেকগুলিরই কাজ করার জন্য অনেকগুলি সাধারণ ডোমেনের একটির একাধিক অনুলিপি প্রয়োজন। বৈচিত্র্য যেহেতু আর. এন. এ পলিমারেজ থেকে পারমাণবিক আর. এন. এ উদ্ভূত হয়, আর. এন. এ প্রতিলিপিগুলি অবিলম্বে আর. এন. এ-বাইন্ডিং প্রোটিন দ্বারা আচ্ছাদিত হয় যা আর. এন. এ বিপাক এবং আর. এন. এ বায়োজেনেসিস, পরিপক্কতা, পরিবহন, কোষীয় স্থানীয়করণ এবং স্থিতিশীলতা সহ কার্যকারিতার প্রতিটি দিক নিয়ন্ত্রণ করে। সমস্ত আর. বি. পি আর. এন. এ-কে আবদ্ধ করে, তবে তারা বিভিন্ন আর. এন. এ-অনুক্রম নির্দিষ্টতা এবং সাদৃশ্যের সাথে এটি করে, যা আর. বি. পি-কে তাদের লক্ষ্য এবং ক্রিয়াকলাপের মতো বৈচিত্র্যময় হতে দেয়। এই লক্ষ্যগুলির মধ্যে রয়েছে এমআরএনএ, যা প্রোটিনের জন্য কোড, পাশাপাশি বেশ কয়েকটি কার্যকরী নন-কোডিং আরএনএ। এন. সি. আর. এন. এ প্রায় সবসময়ই রাইবোনিউক্লিওপ্রোটিন কমপ্লেক্স হিসাবে কাজ করে এবং নগ্ন আর. এন. এ হিসাবে নয়। এই নন-কোডিং আর. এন. এ-গুলির মধ্যে রয়েছে মাইক্রো আর. এন. এ, ছোট হস্তক্ষেপকারী আর. এন. এ (এস. আই. আর. এন. এ), পাশাপাশি স্প্লিসোসোমাল ছোট পারমাণবিক আর. এন. এ (এস. এন. আর. এন. এ)। ফাংশন আর. এন. এ প্রক্রিয়াকরণ এবং পরিবর্তন বিকল্প বিভাজন বিকল্প বিভাজন এমন একটি প্রক্রিয়া যার মাধ্যমে একই জিন থেকে বিভিন্ন ধরনের পরিপক্ক এম. আর. এন. এ (বার্তাবাহক আর. এন. এ) তৈরি হয়। এটি একটি নিয়ন্ত্রক প্রক্রিয়া যার মাধ্যমে এম. আর. এন. এ-তে এক্সনগুলির অন্তর্ভুক্তির বৈচিত্র্য একাধিক সম্পর্কিত প্রোটিন উৎপাদনের দিকে পরিচালিত করে, এইভাবে সম্ভাব্য জিনোমিক আউটপুটগুলি প্রসারিত করে। আর. বি. পি এই প্রক্রিয়া নিয়ন্ত্রণে ব্যাপকভাবে কাজ করে। কিছু বাঁধাই প্রোটিন যেমন নিউরোনাল নির্দিষ্ট আর. এন. এ-বাঁধাই প্রোটিন, যেমন এন. ও. ভি. এ1, আর. এন. এ-তে একটি নির্দিষ্ট ক্রমকে শনাক্ত করে এবং বাঁধাই করে এইচ. এন. আর. এন. এ-র একটি উপসেটের বিকল্প বিভাজন নিয়ন্ত্রণ করে (ওয়াই. সি. এ. ওয়াই যেখানে ওয়াই পাইরিমিডিন, ইউ বা সি নির্দেশ করে)। এই প্রোটিনগুলি তারপর এই লক্ষ্যস্থলে স্প্লাইসসোমাল প্রোটিন নিয়োগ করে। এস. আর প্রোটিনগুলি এস. এন. আর. এন. পি-র নিয়োগের মাধ্যমে বিকল্প স্প্লাইসিং-এ তাদের ভূমিকার জন্যও সুপরিচিত, যা ইউ1 এস. এন. আর. এন. পি এবং ইউ2এ. এফ এস. এন. আর. এন. পি-এর মতো স্প্লাইসসম গঠন করে। যাইহোক, আর. বি. পিগুলিও স্প্লাইসসোমের অংশ। স্প্লাইসসোম হল এস. এন. আর. এন. এ এবং প্রোটিন সাবইউনিটের একটি জটিল অংশ এবং যান্ত্রিক এজেন্ট হিসাবে কাজ করে যা ইন্ট্রনগুলি সরিয়ে দেয় এবং পার্শ্ববর্তী এক্সনগুলিকে সংযুক্ত করে। কোর স্প্লাইসসোম কমপ্লেক্স ছাড়াও, আর. বি. পিগুলি সিস-অ্যাক্টিং আর. এন. এ উপাদানগুলির সাইটগুলির সাথেও আবদ্ধ হয় যা স্প্লাইসিংয়ের সময় এক্সনের অন্তর্ভুক্তি বা বর্জনকে প্রভাবিত করে। এই সাইটগুলিকে এক্সোনিক স্প্লাইসিং বর্ধনকারী (ই. এস. ই), এক্সোনিক স্প্লাইসিং সাইলেন্সার (ই. এস. এস), ইন্ট্রনিক স্প্লাইসিং বর্ধনকারী (আই. এস. ই) এবং ইন্ট্রনিক স্প্লাইসিং সাইলেন্সার (আই. এস. এস) হিসাবে উল্লেখ করা হয় এবং তাদের বাঁধাইয়ের অবস্থানের উপর নির্ভর করে, আর. বি. পিগুলি স্প্লাইসিং সাইলেন্সার বা বর্ধনকারী হিসাবে কাজ করে। আর. এন. এ সম্পাদনা আর. এন. এ সম্পাদনার সবচেয়ে ব্যাপকভাবে অধ্যয়নরত রূপটি হল এ. ডি. এ. আর প্রোটিন। এই প্রোটিন আর. এন. এ-র নিউক্লিওটাইড উপাদান পরিবর্তন করে এম. আর. এন. এ প্রতিলিপির প্রতিলিপি-পরবর্তী পরিবর্তনের মাধ্যমে কাজ করে। এটি এ. ডি. এ. আর দ্বারা অনুঘটকিত একটি উৎসেচক বিক্রিয়ায় অ্যাডেনোসিনকে ইনোসিনে রূপান্তরিত করার মাধ্যমে করা হয়। এই প্রক্রিয়াটি কার্যকরভাবে জিনোম দ্বারা এনকোড করা আরএনএ ক্রমকে পরিবর্তন করে এবং জিন পণ্যগুলির বৈচিত্র্যকে প্রসারিত করে। বেশিরভাগ আর. এন. এ সম্পাদনা আর. এন. এ-র অ-কোডিং অঞ্চলে ঘটে; যাইহোক, কিছু প্রোটিন-এনকোডিং আর. এন. এ প্রতিলিপি সম্পাদন সাপেক্ষে দেখানো হয়েছে যার ফলে তাদের প্রোটিনের অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রমের মধ্যে পার্থক্য দেখা যায়। এর একটি উদাহরণ হল গ্লুটামেট রিসেপ্টর এমআরএনএ যেখানে গ্লুটামিন আর্জিনাইনে রূপান্তরিত হয় যার ফলে প্রোটিনের কার্যকারিতা পরিবর্তিত হয়। পলিঅ্যাডেনাইলেশন হল তিনটি প্রধান অনুবাদহীন অঞ্চলের মধ্যে এ. এ. ইউ. এ. এ. এ ক্রমের প্রায় 20টি বেসের নিচের দিকে একটি আর. এন. এ প্রতিলিপিতে অ্যাডেনাইলেট অবশিষ্টাংশের একটি "লেজ" যোগ করা। এম. আর. এন. এ-র পলিঅ্যাডেনাইলেশন এর পারমাণবিক পরিবহন, অনুবাদ দক্ষতা এবং স্থিতিশীলতার উপর একটি শক্তিশালী প্রভাব ফেলে। এই সমস্তগুলির পাশাপাশি পলিঅ্যাডেনাইলেশন প্রক্রিয়া নির্দিষ্ট আর. বি. পি-র বন্ধনের উপর নির্ভর করে। কয়েকটি ব্যতিক্রম ছাড়া সমস্ত ইউক্যারিওটিক এমআরএনএ প্রায় 200 নিউক্লিওটাইডের 3 'পলি (এ) লেজ গ্রহণ করার জন্য প্রক্রিয়াজাত করা হয়। এই প্রক্রিয়ায় প্রয়োজনীয় প্রোটিন কমপ্লেক্সগুলির মধ্যে একটি হল সিপিএসএফ। সিপিএসএফ 3 'লেজ (এএইউএএএ) ক্রমের সাথে আবদ্ধ হয় এবং পলি (এ)-বাইন্ডিং প্রোটিন নামে আরেকটি প্রোটিনের সাথে মিলিত হয়, পলি (এ) পলিমারেজের ক্রিয়াকলাপকে নিয়োগ করে এবং উদ্দীপিত করে। পলি (এ) পলিমারেজ নিজেই নিষ্ক্রিয় এবং সঠিকভাবে কাজ করার জন্য এই অন্যান্য প্রোটিনগুলির বন্ধন প্রয়োজন। রপ্তানি প্রক্রিয়াকরণ সম্পূর্ণ হওয়ার পর, এম. আর. এন. এ কোষের নিউক্লিয়াস থেকে সাইটোপ্লাজমে পরিবহন করা প্রয়োজন। এটি একটি তিন-ধাপের প্রক্রিয়া যার মধ্যে নিউক্লিয়াসে একটি কার্গো-ক্যারিয়ার কমপ্লেক্স তৈরি করা হয় এবং তারপরে পারমাণবিক ছিদ্র কমপ্লেক্সের মাধ্যমে কমপ্লেক্সের স্থানান্তর এবং অবশেষে পণ্যসম্ভারকে সাইটোপ্লাজমে ছেড়ে দেওয়া হয়। পরে বাহককে পুনর্ব্যবহার করা হয়। টিএপি/এনএক্সএফ1: পি15 হেটেরোডাইমারকে এমআরএনএ রপ্তানির মূল খেলোয়াড় বলে মনে করা হয়। জেনোপাস লেভিস ব্যাঙের মধ্যে টিএপি-র অতিরিক্ত অভিব্যক্তি প্রতিলিপিগুলির রপ্তানি বাড়ায় যা অন্যথায় অকার্যকরভাবে রপ্তানি করা হয়। তবে টিএপি-র অ্যাডাপ্টার প্রোটিন প্রয়োজন কারণ এটি এমআরএনএ-র সঙ্গে সরাসরি যোগাযোগ করতে অক্ষম। অ্যালি/আরইএফ প্রোটিন এমআরএনএ নিয়োগকারী টিএপি-র সাথে মিথস্ক্রিয়া করে এবং আবদ্ধ করে। স্থানগতভাবে নিয়ন্ত্রিত প্রোটিন উৎপাদনের অনুমতি দিয়ে জিন অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণের জন্য এমআরএনএ স্থানীয়করণ গুরুত্বপূর্ণ। এম. আর. এন. এ স্থানীয়করণের মাধ্যমে প্রোটিনগুলি কোষের তাদের কাঙ্ক্ষিত লক্ষ্যস্থলে অনুবাদ করা হয়। এটি প্রাথমিক বিকাশের সময় বিশেষভাবে গুরুত্বপূর্ণ যখন দ্রুত কোষ বিভাজন বিভিন্ন কোষকে এমআরএনএর বিভিন্ন সংমিশ্রণ দেয় যা তখন মারাত্মকভাবে বিভিন্ন কোষের ভাগ্যের দিকে নিয়ে যেতে পারে। আর. বি. পিগুলি এই এম. আর. এন. এ-র স্থানীয়করণে গুরুত্বপূর্ণ যা নিশ্চিত করে যে প্রোটিনগুলি কেবল তাদের কাঙ্ক্ষিত অঞ্চলে অনুবাদ করা হয়। এই প্রোটিনগুলির মধ্যে একটি হল জেড. বি. পি1। জেড. বি. পি. 1 প্রতিলিপির জায়গায় বিটা-অ্যাক্টিন এম. আর. এন. এ-র সঙ্গে আবদ্ধ হয় এবং এম. আর. এন. এ-র সঙ্গে সাইটোপ্লাজমে চলে যায়। এরপরে এটি এই এম. আর. এন. এ-কে বেশ কয়েকটি অসম কোষের প্রকারের ল্যামেলা অঞ্চলে স্থানীয়করণ করে যেখানে এটি অনুবাদ করা যেতে পারে। 2008 সালে এটি প্রস্তাব করা হয়েছিল যে এফএমআরপি কালচারড হিপ্পোক্যাম্পাল নিউরনের নিউরোনাল ডেনড্রাইটে বেশ কয়েকটি ডেনড্রাইটিক এমআরএনএর উদ্দীপক-প্ররোচিত স্থানীয়করণে জড়িত ছিল। সিএ1 হিপ্পোক্যাম্পাল নিউরনের মাইক্রোডিসেক্টেড ডেনড্রাইটে উপস্থিত এফএমআরপি-আবদ্ধ আরএনএগুলির আরও সাম্প্রতিক গবেষণায় বন্য প্রকার বনাম এফএমআরপি-নাল মাউসের মস্তিষ্কে স্থানীয়করণে কোনও পরিবর্তন দেখা যায়নি। অনুবাদ অনুবাদ নিয়ন্ত্রণ জিন অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণের জন্য একটি দ্রুত প্রক্রিয়া প্রদান করে। প্রতিলিপি স্তরে জিন অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করার পরিবর্তে, এমআরএনএ ইতিমধ্যে প্রতিলিপি করা হয়েছে তবে রাইবোজোম নিয়োগ নিয়ন্ত্রিত হয়। এটি প্রোটিনের দ্রুত উৎপাদনের অনুমতি দেয় যখন একটি সংকেত অনুবাদ সক্রিয় করে। বি-অ্যাক্টিন এম. আর. এন. এ-র স্থানীয়করণে জেড. বি. পি1-এর ভূমিকার পাশাপাশি অনুবাদ সূচনাকে বাধা দিয়ে বিটা-অ্যাক্টিন এম. আর. এন. এ-র অনুবাদমূলক দমনেও জড়িত। রাইবোজোমকে সঠিকভাবে বাঁধতে এবং অনুবাদ শুরু করার অনুমতি দেওয়ার জন্য এমআরএনএ থেকে জেডবিপি1 অবশ্যই অপসারণ করতে হবে। প্রোটিন-আর. এন. এ মিথস্ক্রিয়া আর. এন. এ-বাইন্ডিং প্রোটিনগুলি তাদের ক্রম, কাঠামো, মোটিফ এবং আর. এন. এ পরিবর্তনগুলি সনাক্ত করে তাদের আর. এন. এ লক্ষ্যগুলির অত্যন্ত নির্দিষ্ট স্বীকৃতি প্রদর্শন করে। আর. এন. এ-বাইন্ডিং প্রোটিনের নির্দিষ্ট বন্ধন তাদের লক্ষ্যগুলি আলাদা করতে এবং আর. এন. এ প্রতিলিপির উৎপাদন, পরিপক্কতা এবং জীবনকাল নিয়ন্ত্রণের মাধ্যমে বিভিন্ন কোষীয় ক্রিয়াকলাপ নিয়ন্ত্রণ করতে সহায়তা করে। এই মিথস্ক্রিয়াটি প্রতিলিপির সময় শুরু হয় কারণ কিছু আর. বি. পি অবক্ষয় না হওয়া পর্যন্ত আর. এন. এ-র সাথে আবদ্ধ থাকে যেখানে অন্যরা কেবল আর. এন. এ স্প্লাইসিং, প্রক্রিয়াকরণ, পরিবহন এবং স্থানীয়করণ নিয়ন্ত্রণের জন্য আর. এন. এ-র সাথে ক্ষণস্থায়ীভাবে আবদ্ধ থাকে। ক্রস-লিঙ্কিং ইমিউনোপ্রিসিপিটেশন (সিএলআইপি) পদ্ধতিগুলি বিভিন্ন টিস্যু এবং জীবের মধ্যে আরএনএ-বাইন্ডিং প্রোটিনের সরাসরি আরএনএ বাইন্ডিং সাইটগুলি কঠোরভাবে সনাক্ত করতে ব্যবহৃত হয়। এই বিভাগে, সর্বাধিক বিস্তৃতভাবে অধ্যয়ন করা আরএনএ-বাইন্ডিং ডোমেনের তিনটি শ্রেণী (আরএনএ-স্বীকৃতি মোটিফ, ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড আরএনএ-বাইন্ডিং মোটিফ, দস্তা-আঙুল মোটিফ) নিয়ে আলোচনা করা হবে। আর. এন. এ-স্বীকৃতি মোটিফ (আর. আর. এম) আর. এন. এ স্বীকৃতি মোটিফ, যা সবচেয়ে সাধারণ আর. এন. এ-বাইন্ডিং মোটিফ, <আই. ডি1> অ্যামিনো অ্যাসিডের একটি ছোট প্রোটিন ডোমেন যা দুটি α-হেলিসের বিপরীতে একটি চার-স্ট্র্যান্ডেড β-শীট গঠন করে। এই স্বীকৃতি মোটিফটি অসংখ্য সেলুলার ফাংশনে তার ভূমিকা পালন করে, বিশেষ করে এমআরএনএ/আরআরএনএ প্রক্রিয়াকরণ, স্প্লাইসিং, অনুবাদ নিয়ন্ত্রণ, আরএনএ রপ্তানি এবং আরএনএ স্থিতিশীলতায়। এন. এম. আর স্পেকট্রোস্কোপি এবং এক্স-রে ক্রিস্টালোগ্রাফির মাধ্যমে একটি আর. আর. এম-এর দশটি কাঠামো চিহ্নিত করা হয়েছে। এই কাঠামোগুলি আর. আর. এম-এর প্রোটিন-আর. এন. এ স্বীকৃতির জটিলতাকে চিত্রিত করে কারণ এতে প্রোটিন-আর. এন. এ মিথস্ক্রিয়া ছাড়াও আর. এন. এ-আর. এন. এ এবং প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া জড়িত। তাদের জটিলতা সত্ত্বেও, দশটি কাঠামোরই কিছু সাধারণ বৈশিষ্ট্য রয়েছে। সমস্ত আর. আর. এম-এর প্রধান প্রোটিন পৃষ্ঠতলের চার-স্ট্র্যান্ডেড বিটা-শীট আর. এন. এ-র সাথে মিথস্ক্রিয়া করতে দেখা গেছে, যা সাধারণত একটি নির্দিষ্ট পদ্ধতিতে দুই বা তিনটি নিউক্লিওটাইডের সাথে যোগাযোগ করে। উপরন্তু, আন্তঃক্ষেত্র সংযোগকারী এবং আর. এন. এ-র মধ্যে এবং আর. আর. এম-এর মধ্যে একটি মিথস্ক্রিয়ার মাধ্যমে বৈচিত্র্যের প্রতি শক্তিশালী আর. এন. এ বাঁধাই সম্পর্ক এবং নির্দিষ্টতা অর্জন করা হয়। আর. আর. এম-এর এই নমনীয়তা ব্যাখ্যা করে যে কেন আর. আর. এম সর্বাধিক প্রাচুর্যপূর্ণ ক্ষেত্র এবং কেন এটি বিভিন্ন জৈবিক ক্রিয়ায় গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড আরএনএ-বাইন্ডিং মোটিফ ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড আরএনএ-বাইন্ডিং মোটিফ (ডিএসআরএম, ডিএসআরবিডি), একটি 70-75 অ্যামিনো-অ্যাসিড ডোমেন, আরএনএ প্রক্রিয়াকরণ, আরএনএ স্থানীয়করণ, আরএনএ হস্তক্ষেপ, আরএনএ সম্পাদনা এবং অনুবাদমূলক দমনে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। 2005 সাল পর্যন্ত সমাধান করা ডোমেনের তিনটি কাঠামোরই ঐক্যবদ্ধ বৈশিষ্ট্য রয়েছে যা ব্যাখ্যা করে যে কীভাবে ডি. এস. আর. এম শুধুমাত্র ডি. এস. ডি. এন. এ-র পরিবর্তে ডি. এস. আর. এন. এ-র সাথে আবদ্ধ হয়। ডিএসআরএমগুলি α-হেলিস এবং β1-β2 লুপ উভয়ের মাধ্যমে আরএনএ ডুপ্লেক্স বরাবর মিথস্ক্রিয়া করতে দেখা গেছে। উপরন্তু, তিনটি ডিএসআরবিএম কাঠামো প্রধান খাঁজ এবং একটি ছোট খাঁড়ির চিনি-ফসফেট মেরুদণ্ডের সাথে যোগাযোগ করে, যা আলফা হেলিক্স 2-এর এন-টার্মিনাস অঞ্চলের সাথে β1-β2 লুপ দ্বারা মধ্যস্থতা করে। এই মিথস্ক্রিয়াটি একটি আর. এন. এ ডাবল হেলিক্সের আকারের জন্য একটি অনন্য অভিযোজন কারণ এতে 2 '-হাইড্রক্সিল এবং ফসফেট অক্সিজেন জড়িত। ডি. এস. আর. বি. এম-এর মধ্যে সাধারণ কাঠামোগত বৈশিষ্ট্য থাকা সত্ত্বেও, এগুলি স্বতন্ত্র রাসায়নিক কাঠামো প্রদর্শন করে, যা স্টেম-লুপ, অভ্যন্তরীণ লুপ, বালজ বা অসামঞ্জস্যযুক্ত হেলিস সহ আর. এন. এ কাঠামোর জন্য নির্দিষ্টতার অনুমতি দেয়। জিঙ্ক ফিঙ্গার সিসিএইচএইচ-টাইপ জিঙ্ক-ফিঙ্গার ডোমেনগুলি ইউক্যারিওটিক জিনোমের মধ্যে সবচেয়ে সাধারণ ডিএনএ-বাইন্ডিং ডোমেন। ডি. এন. এ-র উচ্চ ক্রম-নির্দিষ্ট স্বীকৃতি অর্জনের জন্য, বেশ কয়েকটি দস্তা আঙুল মডুলার পদ্ধতিতে ব্যবহার করা হয়। দস্তা আঙ্গুলগুলি ββα প্রোটিন ভাঁজ প্রদর্শন করে যার মধ্যে একটি β-হেয়ারপিন এবং একটি α-হেলিক্স একটি আয়ন মাধ্যমে যুক্ত হয়। উপরন্তু, প্রধান খাঁজতে ডিএনএ ঘাঁটির সাথে α-হেলিক্সের প্রোটিন পার্শ্ব-শৃঙ্খলের মধ্যে মিথস্ক্রিয়া ডিএনএ-ক্রম-নির্দিষ্ট স্বীকৃতির অনুমতি দেয়। ডি. এন. এ-র ব্যাপক স্বীকৃতি সত্ত্বেও, সাম্প্রতিক আবিষ্কারগুলি হয়েছে যে দস্তা আঙ্গুলগুলিরও আর. এন. এ সনাক্ত করার ক্ষমতা রয়েছে। সি. সি. এইচ. এইচ দস্তা আঙ্গুল ছাড়াও, সি. সি. সি. এইচ দস্তা আঙ্গুলগুলি সম্প্রতি আন্তঃআণবিক হাইড্রোজেন বন্ধন এবং আর. এন. এ ঘাঁটির ওয়াটসন-ক্রিক প্রান্তের মধ্যে মিথস্ক্রিয়ার মাধ্যমে একক-আটকে থাকা আর. এন. এ-র ক্রম-নির্দিষ্ট স্বীকৃতি নিয়োগ করতে আবিষ্কৃত হয়েছে। সি. সি. এইচ. এইচ-ধরনের দস্তা আঙ্গুলগুলি আর. এন. এ বাঁধাইয়ের দুটি পদ্ধতি ব্যবহার করে। প্রথমত, দস্তা আঙ্গুলগুলি একটি ডাবল হেলিক্সের মেরুদণ্ডের সাথে অ-নির্দিষ্ট মিথস্ক্রিয়া প্রয়োগ করে যেখানে দ্বিতীয় মোড দস্তা আঙ্গুলগুলিকে বিশেষভাবে পৃথক ঘাঁটিগুলি সনাক্ত করতে দেয় যা বেরিয়ে আসে। সি. সি. সি. এইচ-টাইপ থেকে আলাদা, সি. সি. সি. এইচ-টাইপ দস্তা আঙুল আর. এন. এ বাঁধাইয়ের আরেকটি পদ্ধতি প্রদর্শন করে, যেখানে একক-আটকে থাকা আর. এন. এ একটি ক্রম-নির্দিষ্ট পদ্ধতিতে চিহ্নিত করা হয়। সামগ্রিকভাবে, জিঙ্ক আঙ্গুলগুলি ডি. এস. ডি. এন. এ সিকোয়েন্স এবং আর. এন. এ-র সাথে আবদ্ধ হয়ে এস. এস. আর. এন. এ সিকোয়েন্সের মাধ্যমে ডি. এন. এ-কে সরাসরি চিনতে পারে। ভ্রূণের বিকাশে ভূমিকা আর. এন. এ-বাইন্ডিং প্রোটিনের প্রতিলিপি এবং আর. এন. এ-র প্রতিলিপি-পরবর্তী নিয়ন্ত্রণের বিকাশের সময় জিন অভিব্যক্তির নিদর্শন নিয়ন্ত্রণে ভূমিকা রয়েছে। নেমাটোড সি. এলিগ্যানসের উপর ব্যাপক গবেষণা জার্মলাইন এবং প্রাথমিক ভ্রূণের বিকাশের সময় আরএনএ-বাইন্ডিং প্রোটিনকে প্রয়োজনীয় কারণ হিসাবে চিহ্নিত করেছে। তাদের নির্দিষ্ট কাজের মধ্যে রয়েছে দৈহিক টিস্যু (নিউরন, হাইপোডার্মিস, পেশী এবং নিঃসরণ কোষ) বিকাশের পাশাপাশি বিকাশমূলক ঘটনাগুলির জন্য সময় সংকেত প্রদান করা। তবুও, তাদের আর. এন. এ লক্ষ্যগুলি সনাক্ত করতে অসুবিধার কারণে বিকাশের ক্ষেত্রে আর. বি. পি-র কার্যকারিতার পিছনের প্রক্রিয়াটি আবিষ্কার করা ব্যতিক্রমীভাবে চ্যালেঞ্জিং। এর কারণ হল বেশিরভাগ আর. বি. পি-র সাধারণত একাধিক আর. এন. এ লক্ষ্য থাকে। যাইহোক, এটি অনস্বীকার্য যে আর. বি. পিগুলি সমন্বিত পদ্ধতিতে উন্নয়নমূলক পথ নিয়ন্ত্রণের ক্ষেত্রে একটি গুরুত্বপূর্ণ নিয়ন্ত্রণ প্রয়োগ করে। জার্মলিনের বিকাশ ড্রোসোফিলায় মেলানোগাস্টার, এলাভ, এসএক্সএল এবং ট্র্যা-2 হল আরএনএ-বাইন্ডিং প্রোটিন এনকোডিং জিন যা প্রাথমিক লিঙ্গ নির্ধারণ এবং দৈহিক যৌন অবস্থার রক্ষণাবেক্ষণে গুরুত্বপূর্ণ। এই জিনগুলি ড্রোসোফিলায় লিঙ্গ-নির্দিষ্ট বিভাজন নিয়ন্ত্রণ করে প্রতিলিপি-পরবর্তী স্তরে প্রভাব ফেলে। এস. এক্স. এল মহিলাদের মধ্যে একটি কার্যকরী ট্র এম. আর. এন. এ তৈরি করতে ফেমিনাইজিং জিন ট্রার ইতিবাচক নিয়ন্ত্রণ প্রয়োগ করে। সি. এলিগ্যানসে, এফওজি-1, এমওজি-1/- 4/- 5 এবং আরএনপি-4 সহ আরএনএ-বাইন্ডিং প্রোটিনগুলি জার্মলাইন এবং দৈহিক লিঙ্গ নির্ধারণ নিয়ন্ত্রণ করে। উপরন্তু, জি. এল. ডি-1, জি. এল. ডি-3, ডি. এ. জেড-1, পি. জি. এল-1 এবং ও. এম. এ-1/- 2-এর মতো বেশ কয়েকটি আর. বি. পি মায়োটিক প্রোফেজ অগ্রগতি, গ্যামেটোজেনেসিস এবং ওসাইট পরিপক্কতার সময় তাদের নিয়ন্ত্রক কাজ সম্পাদন করে। দৈহিক বিকাশ জার্মলাইন বিকাশে আর. বি. পি-র কার্যকারিতা ছাড়াও, প্রতিলিপি-পরবর্তী নিয়ন্ত্রণ শারীরিক বিকাশেও গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। জার্মলাইন এবং প্রাথমিক ভ্রূণের বিকাশের সাথে জড়িত আর. বি. পি থেকে আলাদা, শারীরিক বিকাশে কাজ করা আর. বি. পিগুলি এম. আর. এন. এ লক্ষ্যগুলির টিস্যু-নির্দিষ্ট বিকল্প স্প্লাইসিং নিয়ন্ত্রণ করে। উদাহরণস্বরূপ, এমইসি-8 এবং ইউএনসি-75 যথাক্রমে হাইপোডার্মিস এবং স্নায়ুতন্ত্রের অঞ্চলে আরআরএম ডোমেন ধারণ করে। উপরন্তু, আরেকটি আর. আর. এম-যুক্ত আর. বি. পি, ই. এক্স. সি-7, শারীরিক বিকাশের সময় ভ্রূণের বর্জ্য খাল কোষে এবং স্নায়ুতন্ত্র জুড়ে স্থানীয়করণের জন্য প্রকাশিত হয়। নিউরোনাল বিকাশ জেড. বি. পি. 1 হিপ্পোক্যাম্পাল নিউরনে ডেনড্রাইটোজেনেসিস (ডেনড্রাইট গঠন) নিয়ন্ত্রণ করতে দেখা গেছে। ডেনড্রাইট গঠনে জড়িত অন্যান্য আর. এন. এ-বাইন্ডিং প্রোটিনগুলি হল প্যুমিলিও এবং ন্যানো, এফ. এম. আর. পি, সি. পি. ই. বি এবং স্টাফেন 1 ক্যান্সার আর. বি. পি-তে ভূমিকা টিউমার বিকাশে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। শত শত আর. বি. পি মানব ক্যান্সার জুড়ে উল্লেখযোগ্যভাবে অনিয়ন্ত্রিত এবং স্বাভাবিক টিস্যু সম্পর্কিত টিউমারে প্রধানত ডাউনরেগুলেশন দেখায়। অনেক আর. বি. পি বিভিন্ন ধরনের ক্যান্সারের ক্ষেত্রে ভিন্নভাবে প্রকাশ পায়, যেমন কে. এইচ. ডি. আর. বি. এস1 (স্যাম68), ই. এল. এ. ভি. এল1 (এইচ. ইউ. আর), এফ. এক্স. আর1 এবং ইউ. এইচ. এম. কে1। কিছু আর. বি. পি-র ক্ষেত্রে, অভিব্যক্তির পরিবর্তন অনুলিপি সংখ্যার বৈচিত্র্যের (সি. এন. ভি) সঙ্গে সম্পর্কিত, উদাহরণস্বরূপ কোলোরেক্টাল ক্যান্সার কোষে বি. ওয়াই. এস. এল-এর সি. এন. ভি লাভ এবং স্তন ক্যান্সারে ই. এস. আর. পি1, সি. ই. এল. এফ3, লিভার ক্যান্সারে আর. বি. এম24, ফুসফুসের ক্যান্সারে আই. জি. এফ2. বি. পি2, আই. জি. এফ2. বি. পি3 বা ফুসফুসের ক্যান্সারে কে. এইচ. ডি. আর. বি. এস2-এর সি. এন. ভি ক্ষতি। কিছু অভিব্যক্তি পরিবর্তন এই আর. বি. পি-গুলিতে প্রোটিন প্রভাবিত করার কারণে ঘটে যেমন এন. এস. ইউ. এন 6, জেড. সি 3. এইচ 13, ই. এল. এ. সি 1, আর. বি. এম. এস 3, এবং জেড. জি. পি. এ. টি, এস. এফ 3. বি 1, এস. আর. এস. এফ 2, আর. বি. এম 10, ইউ 2. এ. এফ 1, এস. এফ 3. বি 1, পি. পি. আর. সি 1, আর. বি. এম. এক্স. এল 1, এইচ. এন. আর. এন. পি. সি. এল 1 ইত্যাদি। বেশ কয়েকটি গবেষণায় আর. বি. পি-র অভিব্যক্তির এই পরিবর্তনকে ক্যান্সারে অস্বাভাবিক বিকল্প স্প্লাইসিংয়ের সাথে সম্পর্কিত করা হয়েছে। বর্তমান গবেষণা যেহেতু আরএনএ-বাইন্ডিং প্রোটিনগুলি অসংখ্য কোষীয় ক্রিয়াকলাপের উপর উল্লেখযোগ্য নিয়ন্ত্রণ প্রয়োগ করে, তাই তারা অনেক গবেষকের জন্য তদন্তের একটি জনপ্রিয় ক্ষেত্র হয়ে উঠেছে। জৈবিক ক্ষেত্রে এর গুরুত্বের কারণে, সম্প্রতি আর. এন. এ-বাইন্ডিং প্রোটিনের সম্ভাবনা সম্পর্কিত অসংখ্য আবিষ্কার উন্মোচিত হয়েছে। আরএনএ-বাইন্ডিং প্রোটিনের পরীক্ষামূলক শনাক্তকরণের সাম্প্রতিক উন্নয়ন আরএনএ-বাইন্ডিং প্রোটিনের সংখ্যা উল্লেখযোগ্যভাবে বাড়িয়েছে আরএনএ-বাইন্ডিং প্রোটিন স্যাম 68 ডেনড্রাইটে সঠিক সিনাপটিক ফাংশন অর্জনের জন্য আরএনএ বিপাকের স্থানিক এবং সাময়িক কম্পার্টমেন্টালাইজেশন নিয়ন্ত্রণ করে। স্যাম68-এর ক্ষতির ফলে অস্বাভাবিক পোস্টট্রান্সক্রিপশনাল নিয়ন্ত্রণ ঘটে এবং শেষ পর্যন্ত ভঙ্গুর এক্স-সম্পর্কিত কম্পন/অ্যাটাক্সিয়া সিনড্রোমের মতো স্নায়বিক ব্যাধিগুলির দিকে পরিচালিত করে। স্যাম68-কে এমআরএনএ এনকোডিং β-অ্যাক্টিনের সাথে মিথস্ক্রিয়া করতে দেখা গেছে, যা তার সাইটোস্কেলিটাল উপাদানগুলির সাথে ডেনড্রাইটিক মেরুদণ্ডের সিনাপটিক গঠন নিয়ন্ত্রণ করে। অতএব, পোস্টসিনেপটিক β-অ্যাক্টিন এমআরএনএ বিপাক নিয়ন্ত্রণের মাধ্যমে সিনাপ্স সংখ্যা নিয়ন্ত্রণে স্যাম68 একটি গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। নিউরন-নির্দিষ্ট সি. ই. এল. এফ পরিবারের আর. এন. এ-বাইন্ডিং প্রোটিন ইউ. এন. সি-75 বিশেষভাবে ইউ. ইউ. জি. ইউ. জি. ইউ. ইউ. জি. ইউ এম. আর. এন. এ প্রসারিতের সাথে সি. এলিগ্যানস-এর স্নায়ুকোষীয় কোষে এক্সন 7এ নির্বাচনের জন্য তার তিনটি আর. এন. এ স্বীকৃতি মোটিফের মাধ্যমে আবদ্ধ হয়। যেহেতু অ-স্নায়বিক কোষে দুর্বল স্প্লাইস সাইটের কারণে এক্সন 7এ বাদ দেওয়া হয়, তাই ইউ. এন. সি-75 শুধুমাত্র স্নায়বিক কোষে এক্সন 7এ এবং এক্সন 8-এর মধ্যে স্প্লাইসিংকে বিশেষভাবে সক্রিয় করতে দেখা গেছে। স্বল্প তরঙ্গদৈর্ঘ্যের অতিবেগুনী আলো, হাইপোক্সিয়া এবং হাইপোথার্মিয়া সহ বিভিন্ন কোষীয় চাপের মুখোমুখি হওয়ার পরে শীতল ইন্ডুসিবল আরএনএ বাইন্ডিং প্রোটিন সি. আই. আর. বি. পি কোষীয় প্রতিক্রিয়া নিয়ন্ত্রণে ভূমিকা পালন করে। এই গবেষণা প্রদাহের সাথে রোগের অবস্থার সংযোগের জন্য সম্ভাব্য প্রভাব ফেলেছে। আরএনএ-বাইন্ডিং প্রোটিন এসএলআর1-এর সেরিন-আর্জিনিন পরিবারটি ক্যান্ডিডা অ্যালবিক্যানের মেরুকৃত বৃদ্ধিকে নিয়ন্ত্রণ করতে দেখা গেছে। ইঁদুরের মধ্যে এসএলআর1 মিউটেশনের ফলে ফিল্যামেন্টেশন হ্রাস পায় এবং এপিথেলিয়াল এবং এন্ডোথেলিয়াল কোষের ক্ষতি হ্রাস পায় যা এসএলআর1 বন্য-ধরনের স্ট্রেনের তুলনায় বর্ধিত বেঁচে থাকার হারের দিকে পরিচালিত করে। অতএব, এই গবেষণাটি প্রকাশ করে যে এসআর-এর মতো প্রোটিন এসএলআর1 সি. অ্যালবিক্যানগুলিতে হাইফাল গঠন এবং ভাইরাসকে প্ররোচিত করতে ভূমিকা পালন করে। আরও দেখুন ডি. এন. এ-বাইন্ডিং প্রোটিন আর. এন. এ-বাইন্ডিং প্রোটিন ডাটাবেস রাইবোনিউক্লিওপ্রোটিন এক্সটার্নাল লিঙ্ক স্টারবেস প্ল্যাটফর্মঃ বড় মাপের সি. এল. আই. পি-সেক (এইচ. আই. টি. এস-সি. এল. আই. পি, পি. এ. আর-সি. এল. আই. পি, আই. সি. এল. আই. পি, সি. এল. এ. এস. এইচ) ডেটাসেট থেকে আর. এন. এ বাইন্ডিং প্রোটিনের (আর. বি. পি) বাইন্ডিং সাইটগুলি ডিকোডিং করার জন্য একটি প্ল্যাটফর্ম। আর. বি. পি. ডি. বি ডাটাবেসঃ আর. এন. এ বাইন্ডিং প্রোটিনের একটি ডাটাবেস। ওআরএনএমেন্টঃ বিভিন্ন প্রজাতির কোডিং এবং নন-কোডিং আরএনএ উভয় ক্ষেত্রেই অনুমানমূলক আরবিপি বাইন্ডিং সাইট দৃষ্টান্তের একটি ডাটাবেস। এ. টি. টি. আর. এ. সি. টি ডাটাবেসঃ আর. এন. এ বাইন্ডিং প্রোটিন এবং সংশ্লিষ্ট মোটিফের একটি ডাটাবেস। স্প্লিসড এইড-এফঃ হাতে তৈরি মানব আরএনএ বাইন্ডিং প্রোটিন ডাটাবেসের একটি ডাটাবেস। আরএসআইটিডিবিঃ আরএনএ বাইন্ডিং সাইট ডাটাবেস স্পট-সেক-আরএনএঃ আরএনএ বাইন্ডিং প্রোটিন এবং তাদের জটিল কাঠামোর টেমপ্লেট-ভিত্তিক ভবিষ্যদ্বাণী। স্পট-স্ট্রাকচার-আরএনএঃ 3ডি স্ট্রাকচার থেকে আরএনএ বাইন্ডিং প্রোটিন পূর্বাভাস। এনকোড প্রকল্পঃ জিনোমিক ডেটাসেটের একটি সংগ্রহ (অর্থাৎ। আর. বি. পি-র জন্য আর. এন. এ বাইন্ড-এন-সেক, ই. সি. এল. আই. পি, আর. বি. পি লক্ষ্যযুক্ত এস. আর. এন. এ-সেক) আর. বি. পি চিত্র ডাটাবেসঃ কোষগুলিতে আর. বি. পি-র সেলুলার স্থানীয়করণ দেখানো চিত্র আর. বি. পি. স্পট সফ্টওয়্যারঃ আর. বি. পি-আর. এন. এ মিথস্ক্রিয়া সনাক্ত করার জন্য একটি গভীর-শিক্ষণ ভিত্তিক অত্যন্ত নির্ভুল সফ্টওয়্যার। এটি নতুন আর. বি. পি-আর. এন. এ মিথস্ক্রিয়া মডেল তৈরি করার জন্য একটি মডিউলও সরবরাহ করে। তথ্যসূত্র কোষ জীববিজ্ঞান