Carlos Simmerling
কার্লোস সিমার্লিং স্টনি ব্রুকের স্টেট ইউনিভার্সিটি অফ নিউইয়র্কের রসায়নের একজন পূর্ণ অধ্যাপক। তিনি লুই এবং বিট্রিস লাউফার সেন্টার ফর ফিজিক্যাল অ্যান্ড কোয়ান্টিটেটিভ বায়োলজির সহযোগী পরিচালক। সিমার্লিং 1991 সালে শিকাগোর ইলিনয় বিশ্ববিদ্যালয় থেকে ব্যাচেলর অফ আর্টস এবং 1994 সালে একই প্রতিষ্ঠান থেকে ডক্টরেট ডিগ্রি লাভ করেন। পিটার কোলম্যানের নির্দেশনায় সান ফ্রান্সিসকোর ইউনিভার্সিটি অফ ক্যালিফোর্নিয়ায় তাঁর পোস্টডক্টরাল কাজ সম্পন্ন হয়। তাঁর আগ্রহের প্রাথমিক ক্ষেত্র হল গণনামূলক কাঠামোগত জীববিজ্ঞান যা গঠনমূলক নমুনা সংগ্রহ এবং প্রোটিন কাঠামোর পূর্বাভাসের পদ্ধতির উপর দৃষ্টি নিবদ্ধ করে। তিনি অ্যাম্বার উন্নয়ন দলের সদস্য। রিসার্চ সিমার্লিং অত্যাধুনিক কম্পিউটার ব্যবহার করে বড় জৈব আণবিক ব্যবস্থার সঠিক এবং দক্ষ অনুকরণের জন্য নতুন অ্যালগরিদম এবং প্রোগ্রামের বিকাশে গবেষকদের একটি দলকে নেতৃত্ব দিচ্ছে। গণনামূলক রসায়ন এবং কাঠামোগত জীববিজ্ঞানের ক্ষেত্রে তাদের যুগান্তকারী মৌলিক কাজ ইতিমধ্যেই জৈবপ্রযুক্তি, ঔষধি রসায়ন এবং ওষুধের নকশায় অসাধারণ প্রভাব ফেলছে। 2002 সালে কম্পিউটার সিমুলেশন ব্যবহার করে দলটি সঠিকভাবে ভবিষ্যদ্বাণী করেছিল যে কীভাবে একটি প্রোটিন সম্পূর্ণরূপে তার জেনেটিক কোড থেকে তার চূড়ান্ত আকারে ভাঁজ হয়। জীবনের এই অণুগুলি তাদের জিন ক্রম থেকে দেখতে কেমন হবে তা পূর্বাভাস দিয়ে, দলটি পোস্ট-জিনোমিক জীববিজ্ঞানের অন্যতম গুরুত্বপূর্ণ চ্যালেঞ্জ সমাধানের জন্য বিশ্বব্যাপী দৃষ্টি আকর্ষণ করেছে। সিমার্লিংয়ের আবিষ্কারের তাৎপর্য প্রোটিনের আকৃতির উপর নির্ভর করে, যা তার কার্যকারিতা নির্ধারণ করে। একটি প্রোটিন অণু তার আকৃতি অর্জন করে যখন তার দীর্ঘ অ্যামিনো-অ্যাসিড চেইন একটি কম্প্যাক্ট, ত্রিমাত্রিক ব্লবে ভাঁজ হয়। যদিও প্রতিটি ধরনের প্রোটিন আলাদা আলাদা ভাঁজ গ্রহণ করে, জিনোম তালিকা গবেষকদের ভাঁজ করা গঠনের কাঠামো প্রদান করে না। বর্তমানে গবেষকরা প্রোটিনে প্রতিটি পরমাণুর অবস্থান প্রকাশ করতে শ্রমসাধ্য পরীক্ষামূলক কৌশল ব্যবহার করেন এবং পরিচিত প্রোটিনের একটি ছোট অংশের জন্য কাঠামো নির্ধারণ করা হয়েছে। এই তথ্য গবেষকদের প্রোটিনের কার্যকারিতা বুঝতে সাহায্য করে, জিনোমের বৈচিত্র্যের ফলে কেন রোগ হতে পারে তা নির্ধারণ করে এবং প্রোটিনের কার্যকারিতা পরিবর্তনকারী ওষুধের নকশার ভিত্তি হিসাবে কাজ করে। গবেষকরা দীর্ঘদিন ধরে ভেবেছেন যে চেইনগুলি কীভাবে ভাঁজ হয় তা অনুকরণ করার জন্য কম্পিউটার ব্যবহার করে একটি প্রোটিনের কাঠামোর পূর্বাভাস দেওয়া সম্ভব, এটি জেনে যে অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি কীভাবে একে অপরকে আকর্ষণ করে বা প্রতিহত করে। যেহেতু ভাঁজ প্রক্রিয়াটি অত্যন্ত জটিল, তাই কোনও গবেষক জিনগত তথ্য থেকে সফলভাবে একটি প্রোটিন কাঠামোর পূর্বাভাস দিতে সক্ষম হননি। এটি ছিল সিমার্লিংয়ের সমাধানের আগে-তিনি 100 টিরও বেশি পিসি ব্যবহার করে একটি কাস্টম কম্পিউটার সিস্টেম তৈরি করেছিলেন এবং সর্বোত্তম ভাঁজ অনুসন্ধানের সময় প্রোটিন যে পরিবর্তনগুলির মধ্য দিয়ে যায় তা সরাসরি অনুকরণ করার জন্য সফ্টওয়্যার তৈরি করেছিলেন। রেফারেন্স এক্সটার্নাল লিঙ্কস কার্লোস সিমারলিং-এর ফ্যাকাল্টি পেজ স্টনি ব্রুক সিমারলিং ল্যাব হোম পেজ একবিংশ শতাব্দীর আমেরিকান রসায়নবিদ স্টনি ব্রুক বিশ্ববিদ্যালয় ফ্যাকাল্টি লিভিং পিপল কম্পিউট্যাশনাল রসায়নবিদ জন্মের বছর নিখোঁজ (জীবিত মানুষ)