Iodoacetamide
2-আয়োডোঅ্যাসিটামাইড (আই. এ. এ) একটি অ্যালকাইলেটিং এজেন্ট যা পেপটাইড ম্যাপিংয়ের উদ্দেশ্যে ব্যবহৃত হয়। এর ক্রিয়া আয়োডোঅ্যাসিটেটের অনুরূপ। এটি সাধারণত সিস্টিনের থায়োল গ্রুপের সাথে সমযোজীভাবে বাঁধতে ব্যবহৃত হয় যাতে প্রোটিন ডাইসালফাইড বন্ধন তৈরি করতে না পারে। এটি ডিউবিকুইটিনেজ এনজাইম (ডিইউবি)-এর প্রতিরোধক হিসাবে ইউবিকুইটিন গবেষণায়ও ব্যবহৃত হয় কারণ এটি ডিইউবি সক্রিয় স্থানে সিস্টিনের অবশিষ্টাংশকে অ্যালকাইলেট করে। পেপ্টিডেজ ইনহিবিটর আয়োডোঅ্যাসিটামাইড হল সমস্ত সিস্টিন পেপ্টিডেজের একটি অপরিবর্তনীয় প্রতিরোধক, যা অনুঘটক সিস্টিন অবশিষ্টাংশের অ্যালকাইলেশন থেকে প্রতিরোধের প্রক্রিয়া ঘটায় (স্কিমেটিক দেখুন)। তার অ্যাসিড ডেরিভেটিভের তুলনায়, আয়োডোঅ্যাসিটেট, আয়োডোঅ্যাসিটামাইড যথেষ্ট দ্রুত প্রতিক্রিয়া দেখায়। এই পর্যবেক্ষণটি আদর্শ রাসায়নিক প্রতিক্রিয়াশীলতার সাথে সাংঘর্ষিক বলে মনে হয়, তবে অনুঘটক হিস্টিডিনের ধনাত্মক ইমিডাজোলিয়াম আয়ন এবং আয়োডোঅ্যাসিটেটের ঋণাত্মক চার্জযুক্ত কার্বক্সিল-গ্রুপের মধ্যে একটি অনুকূল মিথস্ক্রিয়ার উপস্থিতি আয়োডোঅ্যাসিটামাইডের আপেক্ষিক ক্রিয়াকলাপ বৃদ্ধির কারণ। প্রোটিন মাস স্পেকট্রোমেট্রি এটি সাধারণত প্রোটিন মাস স্পেকট্রোমেট্রি সহ ডি নোভো (পেপটাইড) সিকোয়েন্সিংয়ের জন্য নমুনা প্রস্তুতির সময় ব্যবহৃত হয়, তবে সাম্প্রতিক সমালোচকরা এর ব্যবহার এড়ানোর পরামর্শ দিয়েছেন।